http___www.irb.hr_Istrazivanja_Zavodi-i-centri_Zavod-za-molekularnu-biologiju_1.xml
1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 7.1 8.1 9.1 10.1 11.1 12.1 13.1 14.1 16.1 17.1
Laboratory for Molecular and Cellular Biology The Laboratory for Molecular and Cellular Biology has two research groups that are active at different areas of eukaryotic molecular and cell biology. Model systems are yeast and mammalian cells. The scientific aims of our lab include mechanisms of cell growth control and gene activity. Group Ivica Rubelj: Our main research interest is telomere structure and function and their role in control of normal and immortal cell growth. Telomeres are repetitive sequences at the ends of eukaryotic chromosomes and they play a crucial role in protection of genome integrity, cell growth control and immortalization. Through interactions with several proteins they shape chromosome ends into so called telomere loops (t-loop) in order to prevent possible modifications by DNA repair mechanisms. In normal cells they continuously shorten with each division which ultimately leads to cell senescence. Besides gradual telomere shortening there is also abrupt telomere shortening which we proposed as a mechanism that underlies the sudden and stochastic appearance of senescent cells in culture. Group Mary Sopta: Regulation of gene expression at the level of transcription is a fundamentally important process in the differentiation of different cell types and the development of organisms. Gene transcription by RNA polymerase II in eukaryotes involves a plethora of auxiliary protein factors which are required for the processes of transcription initiation, elongation and termination, each of which represents a potential regulatory point. Our group is interested in various aspects of transcriptional regulation in yeast as well as the role of transcription factors, in processes such as DNA repair. We are currently studying the role of Cdk8 in Gal4 dependent transcription as well as the role of the TFIIF small subunit (Tfg3) in transcription and DNA repair. Andrea Ćukušić Kalajžić PhD Josipa Nemet dr.sc. Ivica Rubelj Marija-Mary Sopta Dr.sc. Nikolina Škrobot Vidaček Grupa Ivica Rubelj.more » Grupa Mary Sopta.more »
1.1 2.1 3.1 4.1 4.2 5.1 6.1 8.1 9.1 10.1 11.1 12.1 12.2 13.1 13.2 13.3 13.4 13.5 14.1 14.2 14.3 14.4 14.5 14.6 15.1 16.1 17.1 17.2 17.3 17.4 18.1 19.1 19.2 20.1 20.2 21.1 22.1 23.1 24.1 25.1 26.1 27.1 28.1 29.1 30.1 31.1 32.1 33.1 34.1 35.1 36.1 37.1 38.1 39.1 40.1 41.1 42.1 43.1 44.1 45.1 46.1 47.1 48.1 49.1 50.1 51.1 52.1 53.1 54.1 55.1 56.1 57.1 58.1 59.1 60.1 61.1 62.1 63.1 64.1 65.1 66.1 67.1 68.1 69.1 70.1 71.1 72.1 73.1 74.1 75.1 76.1 77.1 78.1 79.1 80.1 81.1 82.1 83.1 84.1 85.1 86.1 87.1 88.1 89.1 90.1 91.1 92.1 93.1 94.1 95.1 96.1 97.1 98.1 99.1 100.1 101.1 102.1 103.1 104.1 105.1 106.1 107.1 108.1 109.1 110.1 111.1 112.1 113.1 114.1 115.1 116.1 117.1 118.1 119.1 120.1 121.1 122.1 123.1 124.1 125.1 126.1 127.1 128.1 129.1 130.1 131.1 132.1 133.1 134.1 135.1 136.1 137.1 138.1 139.1 140.1 141.1 142.1 143.1 144.1 145.1 146.1 147.1 148.1 149.1 150.1 151.1 152.1 153.1 154.1 155.1 155.2 156.1 157.1 158.1 159.1 160.1 161.1 162.1 163.1 164.1 165.1 166.1 167.1 168.1 169.1 170.1 171.1 172.1 173.1 174.1 175.1 176.1 177.1 178.1 179.1 180.1 181.1 182.1 183.1 184.1 185.1 186.1 187.1 188.1 189.1 190.1
Zavod za molekularnu biologiju U Zavodu za molekularnu biologiju bavimo se proučavanjem molekularnih osnova i funkcije bazičnih bioloških struktura i procesa. Predstojnik Prof. dr. sc. Igor Weber Tajništvo Marija Kober email: mkober@irb.hr Istraživanja u Zavodu za molekularnu biologiju zasnovana su na suvremenim metodama molekularne biologije, biokemije, stanične biologije, genetike, biofotonike i bioinformatike i provode se na različitim modelnim organizmima: bakterijama, kvascima, diktiostelidima, beskralježnjacima, biljkama, laboratorijskim životinjama i stanicama sisavaca u kulturi. Područja istraživanja mogu se sažeti u nekoliko širih tema: replikacija, rekombinacija i popravak DNA, odnosno procesi vezani uz održavanje genetičkog materijala, genetičku varijabilnost i stvaranje novih vrsta; organizacija genoma i repetitivne sekvence DNA; transkripcija i translacija genetičke poruke, odnosno procesi vezani uz ekspresiju genetičke poruke; molekularni procesi vezani uz regulaciju stanične diobe, diferencijacije, rasta i starenja; molekularni procesi uključeni u stanični odgovor na citostatike i antibiotike, kao i na nastanak rezistencije; genetička pozadina i regulatorni mehanizmi neurotransmisije; molekularni regulatori fotosinteze; fiziologija, biokemija i strukturna biologija biljnih hormona; dinamički procesi u citoskeletu; evolucija gena i genoma kao trajni proces u živom svijetu. Osnovni cilj ovih istraživanja predstavlja temeljitije razumijevanje bioloških procesa na molekularnoj razini i rasvjetljavanje osnovnih zakonitosti života, kao i osposobljavanje mladih stručnjaka za profesionalni rad u molekularnim bioznanostima, uključujući biomedicinu i biotehnologiju. U središtu naših istraživanja su procesi gibanja citoskeleta kod socijalne amebe Dictyostelium discoideum, razvoj i diferencijacija somatskih matičnih stanica (hematopoetske matične stanice); transkripcijski faktori iz obitelji Ikaros te uloga serotonina u staničnoj diferencijaciji. Također istražujemo biokemijske procese pretvorbe energije u fotosintetskim organelima biljka i njihovim prokariotskim predcima cijanobakterijama.više » LEG se sastoji od tri neovisne istraživačke grupe koje iz različitih aspekata prilaze problemima u evolucijskoj genetici. (Grupa dr. Ugarković, Grupa dr. Brčić-Kostić i Grupa dr. Domazet-Lošo)više » Mlad i dinamičan laboratorij, jedan od najvećih laboratorija u Zavodu za molekularnu biologiju, sastoji se od dvije istraživačke skupine koje rade na različitim temama s djelomičnim preklapanjem. Surađujemo s nekoliko znanstvenih skupina unutar Instituta, i više istraživačkih skupina u inozemstvu (u Njemačkoj i Francuskoj). Koristimo ''state-of-the-art'' tehnike stanične biologije, molekularne biologije i biokemije. Dva smjera našeg istraživanja su: 1. Stanični odgovor na genotoksične tvari i mehanizmi uključeni u staničnu otpornost i 2. Adenovirusi kao vektori za prijenos gena.više » Laboratorij za kemijsku biologiju (LKB), primjenjujući interdisciplinarni pristup, bavi se istraživanjima biljnog rasta i razvitka, molekularne regulacije navedenih fiziološki procesa te sekundarnog biljnog metabolizma.više » Kombinirajući genetički i biokemijski pristup u razjašnjavanjima strukture i funkcije gena/genoma, kao i funkcije njihovih produkata – proteina i RNA istražujemo osnovne molekularne procese koristeći dva modelna organizma: spužve i streptomicete.više » Laboratorij se bavi istraživanjima molekularne i stanične biologije eukariota. Modelni sistemi su stanice kvasca i sisavaca. Istraživanja obuhvaćaju mehanizme kontrole staničnog rasta i aktivnosti gena. Laboratorij sačinjavaju dvije istraživačke grupe.više » Istražujemo molekularne mehanizme genetičke rekombinacije i rekombinacijskog popravka DNA kod prokariota.više » Veći dio istraživanja fokusiran je na funkciju i regulaciju središnjeg i perifernog serotoninskog sustava, a područje znanstvenog interesa kreće se od regulacije gena, preko stanične i međustanične signalizacije do ponašanja životinje. Drugi smjer istraživanja obuhvaća patofiziologiju cerebrospinalnog likvora na eksperimentalnoj i kliničkoj razini.više » Naša istraživanja su usredotočena na satelitne DNA i druge ponovljene sekvence DNA kako bi se razumijela njihova struktura, evolucijski mehanizmi, funkcionalnost te utjecaj na genomsku dinamiku i plastičnost. Sadašnja istraživanja provode se na različitim modelnim organizmima beskralješnjaka i to oblićima korijenovih kvržica, školjkašima i kukcima kornjašima.više » Andreja Ambriović Ristov dr. sc. Mariastefania Antica Prof Vlatka Antolović dipl.ing. biotehnologije Robert Bakarić dipl. ing. Helena Bilandžija dipl. ing. Josip Brajković dr. sc. Krunoslav Brčić-Kostić dr.sc. Anamaria Brozović dr. sc. Branka Bruvo Mađarić dr. sc. Maja Buljubašić dr. sc. Helena Ćetković dr. sc. Andrea Ćukušić Kalajžić dr. sc. Svjetlana Cvjetan dr.sc. Lipa Čičin-Šain dr.sc. Tihana De Zan dipl. ing. Tomislav Domazet-Lošo Dr. rer. nat. Vedran Dunjko dipl. ing. Damir Đermić dr. sc. Želimira Filić prof.biol. Vedrana Filić Mileta dr.sc. Hrvoje Fulgosi Prof. dr. sc. Mirna Imešek Snježana Jurić dr. sc. Katarina Karlo Maja Kesić dipl.ing. Marija Kober Dragomira Majhen dr.sc. Maja Marinović dipl.ing. Nevenka Meštrović Radan dr.sc Snježana Mihaljević dr. sc. Andreja Mikoč dr.sc. Gordana Mokrović dr.sc. Brankica Mravinac dr.sc. Josipa Nemet dr.sc. Darko Orešković dr. sc. Maja Osmak dr.sc. Tina Paradžik dr.sc. Martina Pavlek dipl. inž. biol. Iva Pavlović mag. ing. biotech. Željka Pezer Sakač dr. sc. Jasenka Piljac Žegarac Dr.sc. Bruna Pleše dr. sc. Miroslav Plohl prof. dr. sc. Sanjica Rak dr.sc. Jelena Repar Ivica Rubelj dr. sc. Branka Salopek Sondi dr.sc. Ana Smolko dipl. ing. bio. Marija-Mary Sopta Dr.sc. Nikolina Stojanović dr.sc. Dunja Šamec dr.sc. Eva Šatović dr.sc. Martin Sebastijan Šestak dr. sc. Ana Šimatović dipl. inž. Nikolina Škrobot Vidaček dr.sc. Marko Šoštar Jasminka Štefulj dr.sc. Iva Tolić Dr. sc. Ana Tomašić Paić dr. sc. Petar Tomev Mitrikeski dr. sc. Ana Tupek ing.medicinsko-laboratorijske dijagnostike Đurđica Ugarković prof. dr. sc. Ignacija Vlašić dr.sc. Lea Vojta dr. sc. Tanja Vojvoda Zeljko dipl. inž. Dušica Vujaklija dr.sc. Igor Weber Prof. dr. sc. Davor Zahradka dr. sc. Ksenija Zahradka dr. sc. ADP-ribozilacija proteina u modelnom prokariotu Streptomyces coelicolor i čovjeku Posttranslacijska modifikacija proteina ima važnu ulogu u regulaciji funkcije proteina i interakciji proteina s drugim molekulama. ADP-ribozilacija proteina je posttranslacijska modifikacija kojom se skupina ADP-riboze iz NAD+ prenosi na ciljne proteine.više » Biophotonics approach to regulation of the actin cytoskeleton dynamics by small GTPase proteins Deciphering entry pathway of NGR-retargeted adenovirus vectors by confocal microscopy Evolucija i funkcija brzo evoluirajućeg dijela eukariotskog genoma Evolucija, osobitosti i funkcionalne interakcije sekvenci satelitnih DNA Gene expression mediated by satellite DNA (RegSat) Satellite DNAs are major building elements of pericentromeric and centromeric heterochromatin in many eukaryotes.više » Geni i genomi: struktura, funkcija i evolucija Hidrodinamika cerebrospinalnog fluida Identification of bioactive metabolites in medical plants and there In vitro propagation Istraživanje i iskorištavanje bakterijske raznolikosti u priobalnom području zapadne Istre s naglaskom na aktinomicete Konstrukcija, razvoj, primjena ciljnih vektora Kontrola biljnog rasta i starenja energetskim statusom kloroplasta Localization and regulation of Rha GTPase activities in adult primary neurons in vitro Molekularna regulacija biljnog razvitka Molekularne interakcije u diferencijaciji limfocita Molekularni mehanizmi rekombinacije i popravka DNA Phylostratigraphic analysis of disease genes expression in the context of life cycle Povećanje transdukcije adenovirusnih vektora i otpornost stanica na citostatike Razvijanje DNA biljega za praćenje gospodarski značajnog školjkaša Ruditapes decussatus u Jadranu Regeneracija oštećenja hrskavice koljenskog zgloba Regulacija dinamike citoskeleta u kretanju i diobi stanica Regulacija transkripcije kod eukariota Regulatorni mehanizmi fotosinteze i diferencijacija plastida Serotonergična neurotransmisija: geni, proteini i ponašanje Serotonergični mehanizmi alkoholizmu Stanični odgovor na citotoksične spojeve i razvoj otpornosti Structural and functional analysis of noncoding heterochromatic DNA in insect Tribolium castaneum - NONCODDNA Struktura i funkcija telomera u kontroli staničnog rasta Temeljna molekularno-biološka istraživanja streptomiceta Uloga rekombinacije u popravku DNA i evoluciji genoma Usporedba djelovanja ZD0473 i cisplatine Analitika telomera U Laboratoriju za molekularnu i staničnu biologiju dostupna je usluga određivanja i analize duljine telomera čovjeka.više » Sekvenciranje DNA Usluga određivanja slijeda nukleotida u molekuli DNA Sangerovom metodom.više »