http___www.irb.hr_Istrazivanja_Zavodi_Zavod-za-molekularnu-biologiju_4.xml
1.1 2.1 3.1 4.1 5.1 6.1 8.1 9.1 9.2 10.1 11.1 12.1 12.2 12.3 13.1 14.1 15.1 16.1 16.2 17.1 17.2 18.1 19.1 20.1 20.2 20.3 20.4 20.5 21.1 22.1 23.1 24.1 25.1 26.1 26.2 26.3 27.1 28.1 29.1 30.1 31.1 33.1 34.1 35.1 36.1 37.1 38.1 40.1 41.1 42.1 43.1 44.1 46.1 47.1 49.1 50.1 52.1 53.1 54.1 55.1 56.1 58.1 59.1 60.1 61.1 62.1 63.1 64.1 65.1 66.1 67.1 69.1 70.1 71.1 72.1 73.1 74.1 75.1 76.1 77.1 78.1 79.1 80.1 81.1 82.1 83.1 84.1 85.1 86.1 87.1 88.1 89.1 90.1 91.1 92.1 93.1 94.1 96.1 97.1 98.1 99.1 100.1 101.1 102.1 103.1 104.1 105.1 106.1 107.1 108.1 109.1 110.1 111.1 112.1 114.1 115.1 117.1 118.1 119.1 120.1 121.1 122.1 123.1 125.1 126.1 127.1 129.1 130.1 132.1 133.1 134.1 135.1 136.1 137.1 138.1 139.1 141.1 142.1 143.1 144.1 145.1 146.1 148.1 149.1 150.1 151.1 151.2 152.1 153.1 154.1 155.1 156.1 157.1 159.1 160.1 161.1 162.1 163.1 164.1 165.1 166.1 167.1 168.1 169.1 170.1
Division of Molecular Biology At the Division of Molecular Biology, we investigate the molecular basis and functional roles of fundamental biological structures and processes. Head Ph.D. Andreja Ambriović Ristov Administration Marija Kober email: mkober@irb.hr Research in the Division of Molecular Biology is based on the methods of modern molecular biology, biochemistry, cell biology, genetics, biophotonics and bioinformatics. The model organisms used in these studies include bacteria, yeasts, cellular slime molds, several invertebrates, plants, lab animals and mammalian cells in culture. The projects in the Division broadly involve the following fields of study: the maintenance of genome integrity and regulation of genome variation (DNA replication, recombination and repair); genome organization and repetitive DNA sequences; expression of genomic information (transcription and translation); signal transduction in the molecular regulation of cell division, growth, differentiation and senescence; cellular responses to toxic agents and resistance to cytostatics and antibiotics; the genetic background and regulatory mechanisms of neurotransmission; the regulatory mechanisms of photosynthesis; the physiology, biochemistry and structural biology of plant hormones; dynamical processes in the cytoskeleton; and the evolution of genes and genomes. The primary purpose of these research projects is the general broadening of our knowledge of biological processes at the molecular level and the underlying principles of life, as well as the training of young scientists for professional work in the molecular biosciences, including biomedicine and biotechnology. Laboratory for cell biology and signalling (LCBS) explores biological processes in human tumour cells triggered by antitumor drugs or newly synthesised compounds with the aim to improve the tumour therapy. In addition, we investigate biology of adenovirus vectors, as a gene transfer tools for further use in tumour gene therapy and vaccination. We utilise the methods of cell and molecular biology, biochemistry and advanced light microscopy.more » Laboratory for Chemical Biology (LCB) is oriented to interdisciplinary research in the field of plant growth and development and its molecular regulation, as well as secondary metabolism.more » The main goal of our research is to get new insights into molecular mechanisms of DNA recombination and repair in prokaryotesmore » At the center of our research are processes of photosynthesis, the most important autotrophic biochemical process on the plant Earth.more » Research in the Laboratory is focused to the function and regulation of central and peripheral serotonin systems, with areas of research interest ranging from the gene regulation, through cellular and extracellular signalling to animal behaviour. Another research focus is pathophysiology of the cerebrospinal fluid at the experimental and clinical level.more » Our research is focused on satellite DNAs and other repetitive DNA sequences with the goal to understand their structure, evolutionary mechanisms, functionality and impact on genome dynamics and plasticity. Current research is done on different invertebrate model organisms, namely, root-knot nematodes, bivalve mollusks and insects (tenebrionid beetles).more » Laboratory of cell biophysics In the Laboratory of cell biophysics we primarily investigate the structure, dynamics and function of the cytoskeleton.more » LEG embraces three independent research groups that approach questions in evolutionary genetics from different angles. (Grupa dr. Ugarković, Grupa dr. Brčić-Kostić i Grupa dr. Domazet-Lošo)more » Alen Kovačević MSc Ana Dekanić Ana Hlevnjak Ana Smolko mag. mol. bio. Ana Šimatović PhD Anamaria Brozović PhD Andreja Ambriović Ristov Andreja Mikoč Dr. sc. Anja Rac Antonio Sermek Barbara Kuzmić Branka Bruvo-Mađarić Branka Salopek Sondi Dr.sc. Brankica Mravinac PhD Bruna Pleše Bruno Polak Damir Đermić Davor Nestić Davor Zahradka Dragomira Majhen dr.sc. Dunja Šamec PhD Dušica Vujaklija Đurđica Ugarković Eva Šatović dr.sc. Evelin Despot-Slade Gerard Anthony Quinn Gordana Mokrović PhD Helena Bilandžija BSc Helena Ćetković Hrvoje Fulgosi Prof. dr. Igor Weber PhD Iva Pavlović MS Iva Tolić Prof. dr. sc. Ivana Šarić dipl.ing. Ivica Rubelj Jasminka Štefulj dr.sc. Jasna Lalić Jelena Martinčić Josipa Nemet dr.sc. Juraj Simunić dr.sc. Jure Skejić PhD Katarina Karlo Kruno Vukušić MSc, Master in Molecular Biology Krunoslav Brčić-Kostić Ksenija Zahradka Lea Vojta PhD Lipa Čičin-Šain Dr. sc. Lucia Nanić Lucija Horvat Maja Kesić dr.sc. Maja Marinović PhD Mariastefania Antica Prof.dr.sc. Marija Kober Marija-Mary Sopta Dr.sc. Marko Šoštar Martin Sebastijan Šestak Martina Pavlek Matija Harcet Mirna Halasz dr.sc. Miroslav Plohl Professor dr. sc. Mladen Paradžik Dr.sc. Nevenka Meštrović Radan Nikolina Stojanović PhD Nikolina Škrobot Vidaček Nikolina Vidan Petar Tomev Mitrikeski Petra Baković Sanda Ravlić Degree in biology - Molecular biology Sanjica Rak PhD Senka Džidić dr Snježana Mihaljević Sonja Lesjak PhD Tanja Vojvoda Zeljko PhD Tena Gržan Tihana De Zan Tina Paradžik PhD Tomislav Domazet-Lošo Dr. rer. nat. Vedrana Filić Mileta PhD Vlatka Antolović PhD Želimira Filić Željka Pezer Comparative phosphoproteome analysis of S. rimosus oxytetracycline producers strains The aim of this project is to determine the role of protein phosphorylation in antibiotic production from industrially important bacterium.more » Deciphering entry pathway of NGR-retargeted adenovirus vectors by confocal microscopy Evaluating Metabolic Diversity to Understand Plant Adaptations to a Changing Environment (PlantMS) Functional characterization of the fungal specific protein Taf14 in S.cerevisiae and C. albicans Invasive fungal infections have become an important cause of mortality in immunocompromised and severely ill patients, in both the developing world and western countries.more » Fundamental molecular studies of Streptomyces biology Genes and genomes: structure, function and evolution Identification of bioactive metabolites in medicinal plants and their In vitro propagation INSILCELL – Molecular mechanisms of chemosensitisation of human breast carcinoma and melanoma cell lines by silencing of integrins Invertebrate centromere genomics (CENGEN) The main goal of this project is to identify CenH3 and CenH3-associated DNA sequences as well as their non-functional counterparts in order to explore genomics of differently organized centromeres: satellite DNA-rich, satellite DNA-poor and dispersed on holocentric chromosomes.more »
1.1 2.1 3.1 4.1 4.2 5.1 6.1 8.1 9.1 10.1 11.1 12.1 13.1 13.2 13.3 13.4 13.5 14.1 15.1 16.1 17.1 17.2 17.3 17.4 18.1 19.1 19.2 20.1 20.2 20.3 21.1 21.2 22.1 23.1 24.1 25.1 26.1 27.1 28.1 29.1 30.1 31.1 32.1 33.1 34.1 35.1 36.1 37.1 38.1 39.1 40.1 41.1 42.1 43.1 44.1 45.1 46.1 47.1 48.1 49.1 50.1 51.1 52.1 53.1 54.1 55.1 56.1 57.1 58.1 59.1 60.1 61.1 62.1 63.1 64.1 65.1 66.1 67.1 68.1 69.1 70.1 71.1 72.1 73.1 74.1 75.1 76.1 77.1 78.1 79.1 80.1 81.1 82.1 83.1 84.1 85.1 86.1 87.1 88.1 89.1 90.1 91.1 92.1 93.1 94.1 95.1 96.1 97.1 98.1 99.1 100.1 101.1 102.1 103.1 104.1 105.1 106.1 107.1 108.1 109.1 110.1 111.1 112.1 113.1 114.1 115.1 116.1 117.1 118.1 119.1 120.1 121.1 122.1 123.1 124.1 125.1 126.1 127.1 128.1 129.1 130.1 131.1 132.1 133.1 134.1 135.1 136.1 137.1 138.1 139.1 140.1 141.1 142.1 143.1 144.1 145.1 146.1 147.1 148.1 149.1 150.1 151.1 152.1 153.1 154.1 155.1 156.1 157.1 158.1 159.1 160.1 161.1 162.1 163.1 164.1 165.1 165.2 166.1 167.1 168.1 169.1 170.1 171.1 172.1 173.1 174.1 175.1 176.1 177.1 178.1 179.1 180.1 181.1 182.1 183.1 184.1 185.1 186.1 187.1 188.1 189.1 190.1 191.1 192.1 192.2 193.1 194.1 195.1 196.1 197.1 198.1 199.1 200.1 201.1 202.1 203.1 204.1 205.1 206.1 206.2 207.1 208.1 209.1 210.1 211.1 212.1 213.1 214.1 215.1 216.1 217.1
Zavod za molekularnu biologiju U Zavodu za molekularnu biologiju bavimo se proučavanjem molekularnih osnova i funkcije bazičnih bioloških struktura i procesa. Predstojnik dr. sc. Andreja Ambriović Ristov Tajništvo Marija Kober email: mkober@irb.hr Istraživanja u Zavodu za molekularnu biologiju zasnovana su na suvremenim metodama molekularne biologije, biokemije, stanične biologije, genetike, biofotonike i bioinformatike i provode se na različitim modelnim organizmima: bakterijama, kvascima, diktiostelidima, beskralježnjacima, biljkama, laboratorijskim životinjama i stanicama sisavaca u kulturi. Područja istraživanja mogu se sažeti u nekoliko širih tema: replikacija, rekombinacija i popravak DNA, odnosno procesi vezani uz održavanje genetičkog materijala, genetičku varijabilnost i stvaranje novih vrsta; organizacija genoma i repetitivne sekvence DNA; transkripcija i translacija genetičke poruke, odnosno procesi vezani uz ekspresiju genetičke poruke; molekularni procesi vezani uz regulaciju stanične diobe, diferencijacije, rasta i starenja; molekularni procesi uključeni u stanični odgovor na citostatike i antibiotike, kao i na nastanak rezistencije; genetička pozadina i regulatorni mehanizmi neurotransmisije; molekularni regulatori fotosinteze; fiziologija, biokemija i strukturna biologija biljnih hormona; dinamički procesi u citoskeletu; evolucija gena i genoma kao trajni proces u živom svijetu. Osnovni cilj ovih istraživanja predstavlja temeljitije razumijevanje bioloških procesa na molekularnoj razini i rasvjetljavanje osnovnih zakonitosti života, kao i osposobljavanje mladih stručnjaka za profesionalni rad u molekularnim bioznanostima, uključujući biomedicinu i biotehnologiju. Laboratorij za biofiziku stanice bavi se prvenstveno istraživanjima strukture, dinamike i funkcije staničnog skeleta.više » LEG se sastoji od tri neovisne istraživačke grupe koje iz različitih aspekata prilaze problemima u evolucijskoj genetici. (Grupa dr. Ugarković, Grupa dr. Brčić-Kostić i Grupa dr. Domazet-Lošo)više » Laboratorij za kemijsku biologiju (LKB), primjenjujući interdisciplinarni pristup, bavi se istraživanjima biljnog rasta i razvitka, molekularne regulacije navedenih fiziološki procesa te sekundarnog biljnog metabolizma.više » U središtu naših istraživanja su procesi fotosinteze, najvažnijeg autotrofnog biokemijskog procesa na Zemlji.više » Kombinirajući genetički i biokemijski pristup u razjašnjavanjima strukture i funkcije gena/genoma, kao i funkcije njihovih produkata – proteina i RNA istražujemo osnovne molekularne procese koristeći dva modelna organizma: spužve i streptomicete.više » Laboratorij se bavi istraživanjima molekularne i stanične biologije eukariota. Modelni sistemi su stanice kvasca i sisavaca. Istraživanja obuhvaćaju mehanizme kontrole staničnog rasta i aktivnosti gena. Laboratorij sačinjavaju dvije istraživačke grupe.više » Istražujemo molekularne mehanizme genetičke rekombinacije i rekombinacijskog popravka DNA kod prokariota.više » Veći dio istraživanja fokusiran je na funkciju i regulaciju središnjeg i perifernog serotoninskog sustava, a područje znanstvenog interesa kreće se od regulacije gena, preko stanične i međustanične signalizacije do ponašanja životinje. Drugi smjer istraživanja obuhvaća patofiziologiju cerebrospinalnog likvora na eksperimentalnoj i kliničkoj razini.više » Laboratorij za staničnu biologiju i prijenos signala (LSBPS) bavi se istraživanjem bioloških procesa u stanicama tumora čovjeka nakon izlaganja protutumorskim lijekovima i novosintetiziranim spojevima u cilju poboljšanja terapije tumora. Osim toga istražujemo biologiju adenovirusnih vektora za prijenos gena s mogućom upotrebom u genskoj terapiji tumora i vakcinaciji. U istraživanjima koristimo metode stanične i molekularne biologije, biokemije i moderne svjetlosne mikroskopije.više » Naša istraživanja su usredotočena na satelitne DNA i druge ponovljene sekvence DNA kako bi se razumijela njihova struktura, evolucijski mehanizmi, funkcionalnost te utjecaj na genomsku dinamiku i plastičnost. Sadašnja istraživanja provode se na različitim modelnim organizmima beskralješnjaka i to oblićima korijenovih kvržica, školjkašima i kukcima kornjašima.više » Ana Dekanić mag.biol.mol. Ana Smolko dipl. ing. bio. Ana Šimatović dr.sc. Anamaria Brozović dr. sc. Andreja Ambriović Ristov dr. sc. Andreja Mikoč dr.sc. Anja Rac Antonio Sermek mag. chem. Barbara Kuzmić mag. chem. Branka Bruvo Mađarić dr. sc. Branka Salopek Sondi dr.sc. Brankica Mravinac dr.sc. Bruna Pleše dr. sc. Bruno Polak mag. biol. mol Damir Đermić dr. sc. Davor Nestić mag. ing. mol. biotechn. Davor Zahradka dr. sc. Dragomira Majhen dr.sc. Dunja Šamec dr.sc Dušica Vujaklija dr.sc. Đurđica Ugarković prof. dr. sc. Eva Šatović dr.sc. Evelin Despot-Slade Helena Bilandžija dipl. ing. Helena Ćetković dr. sc. Hrvoje Fulgosi Prof. dr. sc. Ida Linić mag.ing.mol.biotech. Igor Weber Prof. dr. sc. Iva Pavlović Dr. sc. Iva Tolić Prof. dr. sc. Ivana Šarić dipl.ing. Ivica Rubelj dr. sc. Jasminka Štefulj dr.sc. Jelena Martinčić mag. biol. mol. Josipa Nemet dr.sc. Juraj Simunić dr.sc. Jure Skejić Dr Katarina Karlo Kruno Vukušić mag. biol. mol. Krunoslav Brčić-Kostić dr.sc. Ksenija Zahradka dr. sc. Lea Vojta dr. sc. Lucia Nanić Lucija Horvat Maja Kesić dr.sc. Maja Marinović dr.sc. Mariastefania Antica Prof. dr. sc. Marija Kober Marija-Mary Sopta Dr.sc. Marko Šoštar Martina Pavlek dr. sc. Matija Harcet dr. sc. Mihaela Jagrić mag. biol. mol. Mirna Halasz dr.sc. Miroslav Plohl prof. dr. sc. Mladen Paradžik dr.sc. Momir Futo Dr. rer. nat. Monika Tunjić Nevenka Meštrović Radan dr.sc Nikolina Stojanović dr.sc. Nikolina Vidan Patrik Risteski mag. biol. mol. Petar Tomev Mitrikeski dr. sc. Petra Baković Petra Mikolčević dr.sc. Sara Koska Snježana Mihaljević dr. sc. Sonja Lesjak dr.sc. Tanja Vojvoda Zeljko dr.sc. Tena Gržan Tihana De Zan dipl. ing. Tina Paradžik dr.sc. Tomislav Domazet-Lošo Izv. prof. dr. rer. nat. Vedrana Filić Mileta dr. sc. Vlatka Godinić Mikulčić dr. sc. Želimira Filić prof.biol. Željka Pezer Sakač dr. sc. ADP-ribozilacija proteina u modelnom prokariotu Streptomyces coelicolor i čovjeku Posttranslacijska modifikacija proteina ima važnu ulogu u regulaciji funkcije proteina i interakciji proteina s drugim molekulama. ADP-ribozilacija proteina je posttranslacijska modifikacija kojom se skupina ADP-riboze iz NAD+ prenosi na ciljne proteine.više » Comparative phosphoproteome analysis of S. rimosus oxytetracycline producers strains The aim of this project is to determine the role of protein phosphorylation in antibiotic production from industrially important bacterium.više » DEvOuT-Određivanje ključnih molekula epitelno-mezenhimalne tranzicije kao mogućih ciljeva za terapiju raka jajnika Evaluating Metabolic Diversity to Understand Plant Adaptations to a Changing Environment (PlantMS) Evolucija i funkcija brzo evoluirajućeg dijela eukariotskog genoma Evolucija, osobitosti i funkcionalne interakcije sekvenci satelitnih DNA Fitohormoni u abiotskom stresu kupusnjača: mehanizam tolerancije i primjena Functional characterization of the fungal specific protein Taf14 in S.cerevisiae and C. albicans Invasive fungal infections have become an important cause of mortality in immunocompromised and severely ill patients, in both the developing world and western countries.više » Geni i genomi: struktura, funkcija i evolucija Hidrodinamika cerebrospinalnog fluida Identification of bioactive metabolites in medical plants and there In vitro propagation INSILCELL – Molekularni mehanizmi povećanja osjetljivosti na protutumorske lijekove stanica karcinoma dojke i melanoma utišavanjem integrina Invertebrate centromere genomics (CENGEN) The main goal of this project is to identify CenH3 and CenH3-associated DNA sequences as well as their non-functional counterparts in order to explore genomics of differently organized centromeres: satellite DNA-rich, satellite DNA-poor and dispersed on holocentric chromosomes.više » Istraživanje i iskorištavanje bakterijske raznolikosti u priobalnom području zapadne Istre s naglaskom na aktinomicete Istraživanje uloge proteinske modifikacije ADP-ribozilacije kod bakterija Kad stari lijekovi dobiju novi oblik: cisplatina i statin Konstrukcija, razvoj, primjena ciljnih vektora Molekularna regulacija biljnog razvitka Molekularni mehanizmi rekombinacije i popravka DNA Novosintetizirani organometalni spojevi - potencijalni antitumorski lijekovi Određivanje biokompatibilnosti molidbenovih i volframovih nanočestica: mjerenje citotoksičnosti i upalnog odgovora u in vitro kulturi stanica čo... Određivanje ključne(ih) miRNA u svrhu reguliranja lijekom potaknute epitelno-mezenhimalne tranzicije Određivanje puta ulaska NGR preusmjerenih adenovirusa u stanicu korištenjem konfokalne mikroskopije PhotoSynth: Molekularni mehanizmi alternativne raspodjele elektrona u fotosintezi Cilj projekta je istražiti mehanizme alternativne raspodjele elektrona u temeljnom autotrofnom procesu fotosintetske pretvorbe energije kod vaskularnih biljaka. Posebice se istražuju mehanizmi dinamičke interakcije proteina feredoksin:NADP+ oksidoreduktaze (FNR) i proteina thylakoid rhodanase like (TROL)više » PhyLoss HRZZ Istraživački projekti: Filostratigrafija nastanka i gubitka gena Broj projekta: IP-2016-06-5924 Znanstveno područje: Prirodne znanosti Znanstveno polje: Biologija Trajanje projekta (u mjesecima): 48 Phylostratigraphic analysis of disease genes expression in the context of life cycle Povećanje osjetljivosti stanica melanoma i glioma na alkilirajuće lijekove utišavanjem integrina avB3, avB5, a3B1 i a4B1 Povećanje transdukcije adenovirusnih vektora i otpornost stanica na citostatike Razumijevanje puta ulaska Adenovirusa tipa 26 u stanicu: način poboljšanja vektora za vakcinaciju RecNewPath – Rekombinacija, popravak DNA i očuvanje integriteta genoma: novi putevi Regulacija transkripcije kod eukariota Satellite DNA in gene regulation and environmental adaptation (SatGenReg) Repetitive elements can be a source of regulatory sequences and could act to distribute regulatory elements throughout the genome. In particular, mobile transposable elements are known to be a source of noncoding material that influences evolution of gene regulatory networks.više » Serotonergic modulation of obesity: cross-talk between regulatory molecules and pathways Serotonergična modulacija pretilosti: međuovisnost regulatornih molekula i puteva Serotonergična neurotransmisija: geni, proteini i ponašanje Serotonergični mehanizmi alkoholizmu Structural and functional analysis of noncoding heterochromatic DNA in insect Tribolium castaneum - NONCODDNA Struktura i funkcija telomera u kontroli staničnog rasta Temeljna molekularno-biološka istraživanja streptomiceta Uloga rekombinacije u popravku DNA i evoluciji genoma VirusHunter - otkrivanje novih potencijalno patogenih virusa Sekvenciranje DNA Usluga određivanja slijeda nukleotida u molekuli DNA Sangerovom metodom.više »