http___www.irb.hr_Istrazivanja_Zavodi_Zavod-za-molekularnu-biologiju_1.xml
1.1 2.1 3.1 4.1 5.1 6.1 7.1 8.1 9.1 10.1 11.1 12.1 14.1 16.1 17.1 18.1 20.1 22.1 23.1 24.1 25.1 26.1 27.1 28.1 29.1 30.1
Laboratory for Molecular Genetics Combining biochemical and genetic approaches in order to elucidate the structure and evolution of genes/ genomes, as well as the function of their products – proteins and RNAs, we investigate basic molecular processes using two model organisms: sponges and streptomycetes. Laboratory for Molecular Genetics (LMG) was founded in 1991 and investigates basic molecular processes in living organisms, using the combination of biochemical and genetic approaches in order to elucidate the structure and evolution of genes/ genomes, as well as the function of their products – proteins and RNAs. Two groups in Laboratory are involved in studying specific and evolutionary conserved aspects of the biology of the complex bacteria Streptomyces and of the sponges – simple ancient animals with complex genomes. Main research areas within the Laboratory are: - the role of Ser/Thr/Tyr phosphorylation, its importance for DNA metabolism, particularly for SSB protein in streptomycetes - characterization of proteins involved in poly(ADP-ribose) metabolism in streptomycetes - studying sponge genes and proteins whose homologs are involved in human diseases or in transition to multicellularity in the animal lineage - biodiversity of Croatian sponges and other endemic taxa using molecular genetics methods Andreja Mikoč Dr. sc. Bruna Pleše Dušica Vujaklija Helena Bilandžija BSc Helena Ćetković Matija Harcet Mirna Halasz dr.sc. Petra Mikolčević Tina Paradžik PhD Vlatka Godinić Mikulčić Želimira Filić Comparative phosphoproteome analysis of S. rimosus oxytetracycline producers strains The aim of this project is to determine the role of protein phosphorylation in antibiotic production from industrially important bacterium.more »
1.1 2.1 3.1 4.1 4.2 5.1 6.1 8.1 9.1 10.1 11.1 12.1 13.1 13.2 13.3 13.4 13.5 14.1 15.1 16.1 17.1 17.2 17.3 17.4 18.1 19.1 19.2 20.1 20.2 20.3 21.1 21.2 22.1 23.1 24.1 25.1 26.1 27.1 28.1 29.1 30.1 31.1 32.1 33.1 34.1 35.1 36.1 37.1 38.1 39.1 40.1 41.1 42.1 43.1 44.1 45.1 46.1 47.1 48.1 49.1 50.1 51.1 52.1 53.1 54.1 55.1 56.1 57.1 58.1 59.1 60.1 61.1 62.1 63.1 64.1 65.1 66.1 67.1 68.1 69.1 70.1 71.1 72.1 73.1 74.1 75.1 76.1 77.1 78.1 79.1 80.1 81.1 82.1 83.1 84.1 85.1 86.1 87.1 88.1 89.1 90.1 91.1 92.1 93.1 94.1 95.1 96.1 97.1 98.1 99.1 100.1 101.1 102.1 103.1 104.1 105.1 106.1 107.1 108.1 109.1 110.1 111.1 112.1 113.1 114.1 115.1 116.1 117.1 118.1 119.1 120.1 121.1 122.1 123.1 124.1 125.1 126.1 127.1 128.1 129.1 130.1 131.1 132.1 133.1 134.1 135.1 136.1 137.1 138.1 139.1 140.1 141.1 142.1 143.1 144.1 145.1 146.1 147.1 148.1 149.1 150.1 151.1 152.1 153.1 154.1 155.1 156.1 157.1 158.1 159.1 160.1 161.1 162.1 163.1 164.1 165.1 166.1 167.1 168.1 169.1 170.1 171.1 172.1 173.1 174.1 175.1 176.1 177.1 178.1 179.1 180.1 181.1 182.1 182.2 183.1 184.1 185.1 186.1 187.1 188.1 189.1 190.1 191.1 192.1 193.1 194.1 195.1 196.1 197.1 198.1 199.1 200.1 201.1 202.1 203.1 204.1 205.1 206.1 207.1 208.1 209.1 210.1 211.1 212.1 213.1 214.1 215.1 216.1 217.1 218.1 219.1
Zavod za molekularnu biologiju U Zavodu za molekularnu biologiju bavimo se proučavanjem molekularnih osnova i funkcije bazičnih bioloških struktura i procesa. Predstojnik dr. sc. Andreja Ambriović Ristov Tajništvo Marija Kober email: mkober@irb.hr Istraživanja u Zavodu za molekularnu biologiju zasnovana su na suvremenim metodama molekularne biologije, biokemije, stanične biologije, genetike, biofotonike i bioinformatike i provode se na različitim modelnim organizmima: bakterijama, kvascima, diktiostelidima, beskralježnjacima, biljkama, laboratorijskim životinjama i stanicama sisavaca u kulturi. Područja istraživanja mogu se sažeti u nekoliko širih tema: replikacija, rekombinacija i popravak DNA, odnosno procesi vezani uz održavanje genetičkog materijala, genetičku varijabilnost i stvaranje novih vrsta; organizacija genoma i repetitivne sekvence DNA; transkripcija i translacija genetičke poruke, odnosno procesi vezani uz ekspresiju genetičke poruke; molekularni procesi vezani uz regulaciju stanične diobe, diferencijacije, rasta i starenja; molekularni procesi uključeni u stanični odgovor na citostatike i antibiotike, kao i na nastanak rezistencije; genetička pozadina i regulatorni mehanizmi neurotransmisije; molekularni regulatori fotosinteze; fiziologija, biokemija i strukturna biologija biljnih hormona; dinamički procesi u citoskeletu; evolucija gena i genoma kao trajni proces u živom svijetu. Osnovni cilj ovih istraživanja predstavlja temeljitije razumijevanje bioloških procesa na molekularnoj razini i rasvjetljavanje osnovnih zakonitosti života, kao i osposobljavanje mladih stručnjaka za profesionalni rad u molekularnim bioznanostima, uključujući biomedicinu i biotehnologiju. Laboratorij za biofiziku stanice bavi se prvenstveno istraživanjima strukture, dinamike i funkcije staničnog skeleta.više » LEG se sastoji od tri neovisne istraživačke grupe koje iz različitih aspekata prilaze problemima u evolucijskoj genetici. (Grupa dr. Ugarković, Grupa dr. Brčić-Kostić i Grupa dr. Domazet-Lošo)više » Laboratorij za kemijsku biologiju (LKB), primjenjujući interdisciplinarni pristup, bavi se istraživanjima biljnog rasta i razvitka, molekularne regulacije navedenih fiziološki procesa te sekundarnog biljnog metabolizma.više » U središtu naših istraživanja su procesi fotosinteze, najvažnijeg autotrofnog biokemijskog procesa na Zemlji.više » Kombinirajući genetički i biokemijski pristup u razjašnjavanjima strukture i funkcije gena/genoma, kao i funkcije njihovih produkata – proteina i RNA istražujemo osnovne molekularne procese koristeći dva modelna organizma: spužve i streptomicete.više » Laboratorij se bavi istraživanjima molekularne i stanične biologije eukariota. Modelni sistemi su stanice kvasca i sisavaca. Istraživanja obuhvaćaju mehanizme kontrole staničnog rasta i aktivnosti gena. Laboratorij sačinjavaju dvije istraživačke grupe.više » Istražujemo molekularne mehanizme genetičke rekombinacije i rekombinacijskog popravka DNA kod prokariota.više » Veći dio istraživanja fokusiran je na funkciju i regulaciju središnjeg i perifernog serotoninskog sustava, a područje znanstvenog interesa kreće se od regulacije gena, preko stanične i međustanične signalizacije do ponašanja životinje. Drugi smjer istraživanja obuhvaća patofiziologiju cerebrospinalnog likvora na eksperimentalnoj i kliničkoj razini.više » Laboratorij za staničnu biologiju i prijenos signala (LSBPS) bavi se istraživanjem bioloških procesa u stanicama tumora čovjeka nakon izlaganja protutumorskim lijekovima i novosintetiziranim spojevima u cilju poboljšanja terapije tumora. Osim toga istražujemo biologiju adenovirusnih vektora za prijenos gena s mogućom upotrebom u genskoj terapiji tumora i vakcinaciji. U istraživanjima koristimo metode stanične i molekularne biologije, biokemije i moderne svjetlosne mikroskopije.više » Naša istraživanja su usredotočena na satelitne DNA i druge ponovljene sekvence DNA kako bi se razumijela njihova struktura, evolucijski mehanizmi, funkcionalnost te utjecaj na genomsku dinamiku i plastičnost. Sadašnja istraživanja provode se na različitim modelnim organizmima beskralješnjaka i to oblićima korijenovih kvržica, školjkašima i kukcima kornjašima.više » Alen Kovačević mag. biol. mol. Ana Dekanić mag.biol.mol. Ana Hlevnjak Ana Smolko dipl. ing. bio. Ana Šimatović dr.sc. Anamaria Brozović dr. sc. Andreja Ambriović Ristov dr. sc. Andreja Mikoč dr.sc. Anja Rac Antonio Sermek mag. chem. Barbara Kuzmić mag. chem. Branka Bruvo Mađarić dr. sc. Branka Salopek Sondi dr.sc. Brankica Mravinac dr.sc. Bruna Pleše dr. sc. Bruno Polak mag. biol. mol Damir Đermić dr. sc. Darko Orešković dr. sc. Davor Nestić Davor Zahradka dr. sc. Dragomira Majhen dr.sc. Dunja Šamec dr.sc Dušica Vujaklija dr.sc. Đurđica Ugarković prof. dr. sc. Eva Šatović dr.sc. Evelin Despot-Slade Gerard Anthony Quinn Gordana Mokrović dr.sc. Helena Bilandžija dipl. ing. Helena Ćetković dr. sc. Hrvoje Fulgosi Prof. dr. sc. Ida Linić mag.ing.mol.biotech. Igor Weber Prof. dr. sc. Iva Pavlović mag. ing. biotech. Iva Tolić Prof. dr. sc. Ivana Šarić dipl.ing. Ivica Rubelj dr. sc. Jasminka Štefulj dr.sc. Jasna Lalić Jelena Martinčić mag. biol. mol. Josipa Nemet dr.sc. Juraj Simunić dr.sc. Jure Skejić PhD Katarina Karlo Kruno Vukušić mag. biol. mol. Krunoslav Brčić-Kostić dr.sc. Ksenija Zahradka dr. sc. Lea Vojta dr. sc. Lipa Čičin-Šain dr.sc. Lucia Nanić Lucija Horvat Maja Kesić dr.sc. Maja Marinović dr.sc. Mariastefania Antica Prof Marija Kober Marija-Mary Sopta Dr.sc. Marko Šoštar Martin Sebastijan Šestak dr. sc. Martina Pavlek dr. sc. Matija Harcet dr. sc. Mihaela Jagrić mag. biol. mol. Mirna Halasz dr.sc. Miroslav Plohl prof. dr. sc. Mladen Paradžik dr.sc. Nevenka Meštrović Radan dr.sc Nikolina Stojanović dr.sc. Nikolina Škrobot Vidaček dr.sc. Nikolina Vidan Petar Tomev Mitrikeski dr. sc. Sanda Ravlić dipl.ing. biologije - molekularna biologija Sanjica Rak dr.sc. Senka Džidić dr Snježana Jurić dr. sc. Snježana Mihaljević dr. sc. Sonja Lesjak dr.sc. Svjetlana Cvjetan dr.sc. Tanja Vojvoda Zeljko dr.sc. Tena Gržan Tihana De Zan dipl. ing. Tina Paradžik dr.sc. Tomislav Domazet-Lošo Dr. rer. nat. Vedran Dunjko dipl. ing. Vedrana Filić Mileta dr.sc. Vlatka Antolović dr. sc. Želimira Filić prof.biol. Željka Pezer Sakač dr. sc. ADP-ribozilacija proteina u modelnom prokariotu Streptomyces coelicolor i čovjeku Posttranslacijska modifikacija proteina ima važnu ulogu u regulaciji funkcije proteina i interakciji proteina s drugim molekulama. ADP-ribozilacija proteina je posttranslacijska modifikacija kojom se skupina ADP-riboze iz NAD+ prenosi na ciljne proteine.više » Centromerna genomika beskralješnjaka (CENGEN) Glavni cilj ovog projekta je identificirati proteine CenH3 i njima pridružene sekvence DNA, kao i njihove nefunkcionalne varijante kako bi se istražila genomika različito organiziranih centromera: bogatim u satelitnim DNA, oskudnim u satelitnim DNA te raspršenim na holocentričnim kromosomima.više » Comparative phosphoproteome analysis of S. rimosus oxytetracycline producers strains The aim of this project is to determine the role of protein phosphorylation in antibiotic production from industrially important bacterium.više » Evaluating Metabolic Diversity to Understand Plant Adaptations to a Changing Environment (PlantMS) Evolucija i funkcija brzo evoluirajućeg dijela eukariotskog genoma Evolucija, osobitosti i funkcionalne interakcije sekvenci satelitnih DNA Fitohormoni u abiotskom stresu kupusnjača: mehanizam tolerancije i primjena Functional characterization of the fungal specific protein Taf14 in S.cerevisiae and C. albicans Invasive fungal infections have become an important cause of mortality in immunocompromised and severely ill patients, in both the developing world and western countries.više » Geni i genomi: struktura, funkcija i evolucija Hidrodinamika cerebrospinalnog fluida Identification of bioactive metabolites in medical plants and there In vitro propagation INSILCELL – Molekularni mehanizmi povećanja osjetljivosti na protutumorske lijekove stanica karcinoma dojke i melanoma utišavanjem integrina Istraživanje i iskorištavanje bakterijske raznolikosti u priobalnom području zapadne Istre s naglaskom na aktinomicete Konstrukcija, razvoj, primjena ciljnih vektora Molekularna regulacija biljnog razvitka Molekularni mehanizmi rekombinacije i popravka DNA Novosintetizirani organometalni spojevi - potencijalni antitumorski lijekovi Određivanje puta ulaska NGR preusmjerenih adenovirusa u stanicu korištenjem konfokalne mikroskopije Phylostratigraphic analysis of disease genes expression in the context of life cycle Povećanje osjetljivosti stanica melanoma i glioma na alkilirajuće lijekove utišavanjem integrina avB3, avB5, a3B1 i a4B1 Povećanje transdukcije adenovirusnih vektora i otpornost stanica na citostatike Razumijevanje puta ulaska Adenovirusa tipa 26 u stanicu: način poboljšanja vektora za vakcinaciju RecNewPath – Rekombinacija, popravak DNA i očuvanje integriteta genoma: novi putevi Regulacija transkripcije kod eukariota Serotonergic modulation of obesity: cross-talk between regulatory molecules and pathways Serotonergična modulacija pretilosti: međuovisnost regulatornih molekula i puteva Serotonergična neurotransmisija: geni, proteini i ponašanje Serotonergični mehanizmi alkoholizmu Structural and functional analysis of noncoding heterochromatic DNA in insect Tribolium castaneum - NONCODDNA Struktura i funkcija telomera u kontroli staničnog rasta Temeljna molekularno-biološka istraživanja streptomiceta Uloga rekombinacije u popravku DNA i evoluciji genoma VirusHunter - otkrivanje novih potencijalno patogenih virusa Sekvenciranje DNA Usluga određivanja slijeda nukleotida u molekuli DNA Sangerovom metodom.više »