I november 2005 bebudede EU en delvis suspension af partnerskabs- og samarbejdsaftalen med alle underudvalg og samarbejdsudvalget suspenderet på ubestemt tid. Der er også indført en våbenembargo, mens 12 usbekiske embedsmænd i årevis har fået et visumforbud, som menes at have spillet en rolle i undertrykkelsen af Andijan-demonstrationerne.
EU nægter delvist kommissionskandidater.