Ich interpretiere den Satz so, dass die "wenigen Bücher" bei der Zusammenlegung aus der Sammlung entfernt wurden. Im Abschnitt Integration der Bücher Zwinglis in die Bibliothek des Grossmünsters gewinne ich den Eindruck, dass dieses Herauslösen bei der Übertragung ins Grossmünster geschah. Daher schlage ich vor: