Wissenschaftliche Arbeiten "im Auftrag" gibt es reichlich - frag dich mal, wieviele Studien in der Pharmazie ohne Auftrag gemacht werden, von Grundlagenforschung teilweise abgesehen (und es gibt sogar Studien darüber, wie weit solche Aufträge die Ergebnisse beeinflussen). Und es gibt das auch bei Religionswissenschaftlern, wenn auch weniger offensichtlich: Scientology und die Moonies können da wesentlich mehr Geld lockermachen als irgendeine Sektenberatungsstelle, Kirche oder staatliche Stelle - da gibt es Spenden an entsprechende Universitätsinstitute, gut bezahlte Expertisen, bezahlte Kongresse oder Reisen - sicher, das kann alles harmlos sein, aber ich sehe es auch nicht als unproblematisch an - sogar als gefährlicher für die Neutralität als ein offizieller Auftrag einer staatlichen Stelle, der offen deklariert (und sicher nicht überbezahlt) ist.