Wann und durch wen diese Bezeichnungen geprägt wurden, konnte ich leider auf die Schnelle nicht ermitteln. Da müsste man die Quellen intensiver durchforsten. Ich vermute aber mal, dass die Bezeichnung α-Quarz für den (Tief)Quarz geschichtliche Gründe hat. Er ist die unter Normalbedingungen (tiefen Temperaturen) auf der Erdoberfläche stabile Modifikation und entsprechend auch die erste bekannte Modifikation. Als man später die bei höheren Temperaturen stabile Modifikation entdeckte, ist man einfach dem griechischen Alphabet gefolgt (α für die erste, β für die zweite Modifikation).