Fürs Gesamtsystem muss man deine 3 Punkte + den Stoffwechsel berücksichtigen. Und zusätzlich die Energie, die durch interne Reibung in Wärme umgewandelt wird. Um den Wirkungsgrad fürs Gesamtsystem zu messen, bestimmt man am Besten den Mehrbedarf an Nahrung im Vergleich zur Ruhe. Um den chemischen Energiegehalt der Nahrung zu bestimmen, kann man ein Bombenkalorimeter verwenden. Besser aber man verwendet Lebensmittel, wo der Physiologische Brennwert bekannt ist, weil da ist bekannt, wie viel chemische Energie wirklich frei wird (es gibt eventuell eine unvollständige Verbrennung).