Es stellt sich die Frage, ob Tunnel überhaupt "offizielle" Namen (so wie Straßen) haben. Ich befürchte dem ist nicht so. Also würde ich mich bei der Lemmafindung an der Fachliteratur und den Fachorganen orientieren. Hier scheint Nord-Süd-Fernbahntunnel (alternativ auch mit einem Bindestrich mehr) zu überwiegen. Ein paar Belege: