Nach den Reformierungsverfahren wird das Synthesegas weiter aufgearbeitet. Es folgt in einem nächsten Schritt die CO-Konvertierung mittels der Wassergas-Shift-Reaktion. Gegebenenfalls ist noch eine CO-Feinreinigung mittels preferentieller Oxidation erforderlich oder eine chemische Umsetzung mit Selektiver Methanisierung. Es werden auch physikalische Verfahren angewendet: Mit Druckwechseladsorption oder durch Abtrennung mittels einer wasserstoffpermeablen Membran oder einer Palladium-Silber-Legierung (PdAg). Großtechnisch besteht auch die Möglichkeit, CO2 mit flüssigem Methan auszuwaschen.