Seit 2004 ist Gärtner zusätzlich Prodekanin der Philosophischen Fakultät, Mitglied des Promotionsausschusses der Philosophischen Fakultät, Mitglied des engeren Fakultätsrates der Philosophischen Fakultät, stellvertretende Vorsitzende der Kommission für Entwicklung und Planung, stellvertretende Vorsitzende der Kommission für Forschung und wissenschaftlichen Nachwuchs sowie seit 2005 Vorstandsmitglied der Mommsen-Gesellschaft und zweite Vorsitzende des Landesverbandes Brandenburg des Deutschen Altphilologenverbandes.