Ich fürchte, du verwechselst hier zwei unterschiedliche Begriffe von "harmonisch". Wenn man ein unharmonisches Tongemisch (also eines, deren Teiltöne nicht in einem ganzzahligen Verhältnis zueinander stehen) per Fourier analysiert, bekommt man natürlich harmonische Komponenten (also Sinustöne), die in einem unharmonischen Verhältnis zueinander stehen.