 پایگاه مرکز اسناد انقلاب اسلامی؛ یکی از اتفاقات مهمی که در جریان انتخابات مجلس اول شورای اسلامی رخ داد حضور مسعود رجوی و حمایت مهدی بازرگان از وی بود. مهدی بازرگان در اطلاعیه‌ای که در شماره 58 نشریه مجاهد چاپ شد اظهار امیدواری كرده بود كه مسعود رجوی در انتخابات رای بیاورد. در این اعلامیه که روز 16 اسفند 59 صادر شد آمده بود: «خواهران و برادران همشهری تهران و حومه، در این موقع که ملت شرافتمند و قهرمان عزیز برای دور دوم انتخابات به پای صندوق‌ها می‌روند برای تامین وحدت و حقوق گروه‌های اقلیت امیدواریم آقای "مسعود رجوی" که معرف جناح پرشوری از جوانان با ایمان می‌باشد نیز به مجلس راه یافته، موفق به همکاری صادقانه با گروه‌های با حسن نیت و در خدمت به خدا و خلق بشود.»

منبع :مرکز اسناد انقلاب اسلامی
در جریان انتخابات اولین دوره مجلس شورای اسلامی، مهدی بازرگان با صدور اعلامیه از مسعود رجوی، سرکرده گروهک منافقین حمایت کرد و گفت: «برای تامین وحدت و حقوق گروه‌های اقلیت امیدواریم آقای "مسعود رجوی" که معرف جناح پرشوری از جوانان با ایمان می‌باشد نیز به مجلس راه یافته، موفق به همکاری صادقانه با گروه‌های با حسن نیت و در خدمت به خدا و خلق بشود.» اما حمایت‌ مهدی بازرگان هم باعث جذب آرای مردم به نفع مسعود رجوی نشد و وی در انتخابات رای نیاورد.