Having decided to specialise in paediatrics, Aynsley-Green took her clinical training within the hospitals in Oxfordshire, and then moved to the University Children’s Hospital of Zürich to take specialised training as a paediatric endocrinologist.
Tras decidirse a especializarse en pediatría, Aynsley-Green siguió su formación clínica en los hospitales de Oxfordshire y luego se trasladó al Hospital Universitario Infantil de Zúrich para seguir una formación especializada como endocrinóloga pediátrica.