사이버방어는 사이버위협이 아닌 군사적 차원의 '적'을 대상으로 하는 작전적 활동이라는 점에서 정보통신환경의 안전성 및 보안성 유지에 중점을 두는 사이버방호와 차이가 있다.
이와 같은 사이버방어 개념은 사이버위협･공격의 예방, 탐지･차단, 대응 및 복구 등 사이버방호에서 정의한 활동이 포함될 수 있어 중복성이 있다. 하지만, 이러한 활동이 일반적인 사이버위협이 아니라 군사적 차원의 ‘적’을 대상으로 하는 활동이라는 측면에서 차이가 있다. 사이버방호가 정보통신기술을 중심으로 정보통신환경의 안전성, 보안성 유지에 중점을 둔다면, 사이버방어는 여기에 더해 적의 위협으로부터 아군의 사이버활동을 보장하고 필요시 대응하기 위한 작전적 활동을 의미한다. 사이버방어는 ‘일련의 작전수행체계(절차)’로서 사이버작전 요소의 하나인 방어적사이버작전 활동에 해당한다.