2013년 3차 조사부터 신뢰도가 낮고 저항이 심한 학부모 설문을 제외 하는 대신 학생 및 교사 설문조사에 연구에 필요한 내용을 포함 시켰다.
2차 조사까지는 학부모 설문이 학생, 교사 설문과 함께 진행되었으나 2013년도 3차 조사부터는 학부모 설문이 진행되지 않았다. 이는 학부모 조사 결과의 신뢰도가 낮고 조사에 대한 강한 저항으로 그러한 문제점을 보완하는 것이 용이하지 않았기 때문이라 지적되고 있다(강구섭 외, 2014: 31). 학부모 대상 설문조사를 하지 않는 대신 연구에 반드시 필요한 조사 항목을 학생 및 교사 설문조사 내용에 포함시켜 학생 설문에는 부모의 교육수준, 북한에서의 부모 직업, 현재의 부모 직업, 가구소득 등이 추가되었고, 교사 설문에는 부모의 기초생활수급자 여부가 추가되었다(강구섭 외, 2014: 31).