수량할인 방식의 수수료율 체계와 소규모 배출업체들의 MRV 비용을 완화하고, 거래비용을 낮추기 위해 제동적 장치가 개발될 필요가 있고, 이와 더불어 우리나라 배출권 시장은 소규모 발전사들의 지배력 행사가 우려된다.
따라서 수량할인 방식의 수수료율 체계, 소규모 배출업체들의 MRV 비용부담을 완화하는 인적?물적 능력배양 지원 그리고 시장조성자 제도 등 거래비용을 낮추기 위한 제도적 장치가 보완될 필요가 있다. 아울러 우리나라 배출권 시장은 일부 발전사업자들의 시장지배력 행사가 우려된다. 간접배출을포함함으로써 경기변동에 매우 취약한 높은 가격 변동성을 보이는 시장이 될가능성이 높다. 이에 대한 대안으로서 발전부문은 원단위 목표관리 방식의 규제로 전환하고 이를 산업부문 배출권거래제와 ‘일방향 게이트웨이’ 방식으로연계하는 방안을 고려해볼만 하다. ‘일방향 게이트웨이 방식’은 감축목표 달성에 지장을 주지 않으면서 배출권 시장의 가격위험과 시장지배력을 낮추는데도움이 될 수 있다. 상쇄제도를 유연하게 운영하는 것도 시장지배력을 완화하는데 도움을 줄 수 있을 것이다.