지나치게 적은 수의 핵심 평가항목을 활용할 경우 결과의 모순이 발생할 수 있으므로, 대학의 전체적인 상황을 검증할 수 있도록 적정 규모의 평가항목을 활용해야 한다.
둘째, 정부 재정지원사업 간 평가결과의 일관성이 확보되어야 한다. 정부에서는 재정지원사업 평가와 동시에 재정지원을 제한하는 평가도 실시하고 있다. 대표적으로 정부재정지원제한대학평가, 학자금대출제한대학평가, 부실대학평가 등 구조개혁을 목적으로 하는 평가도 재정지원을 제한하는 평가인데 일부 재정지원 수혜 대학 중에는 재정지원제한대학으로 지정된 사례도 포함되어 있다. 부실대학에 국고가 지원되는 상충되는 평가 결과는 정부의 고등교육 정책은 물론 정부가 주관하는 평가의 공신력이 저하되는 결과를 초래한다. 지나치게 적은 수의 핵심 평가항목을 활용할 경우 결과의 모순이 발생할 수 있으므로, 대학의 전체적인 상황을 검증할 수 있도록 적정 규모의 평가항목을 활용해야 한다.