감사원 감사 포함 현행 감사제도에서는 보충성과 효율성 면에서 자체감사 우선 실시가 원칙이다. 공공부문 규모의 지속적 확대로 감사수요도 증가하나 감사원과 자체감사기구 간 교류 협력 등 미비로 비효율적이 되고 있다. 결국 자체감사 목적의 ｢공감법｣ 마련을 계기로 해당 기관의 자체감사를 우선함으로써 효율성 제고가 필요하다.
이러한 관점의 연장선상에서, 감사원 감사를 포함하는 현행 감사제도 전반에 있어서는 보충성의 원칙에 따라 자체감사가 우선적으로 실시되는 것이 원칙이 되어야 한다. 이는 행정의 실제에서 감사 전반의 효율성이라는 측면에서도 요구되는 것이다. 그동안 공공부문은 지속적으로 확대(공공부문 예산: 1970년 33조 ⇨ 2008년 800조 원, 인력: 49만 ⇨ 124만 명)되었고, 이에 따라 감사수요도 증가하여, 예컨대 감사원 인력 1인당 감사대상이 예산 8600억원, 인력 1,550명에 달하고 있다. 그러나 감사원과 자체감사기구 간 역할분담 및 교류와 협력, 자체감사에 대한 감사원의 지원체계 등이 미비하여 공공감사 전반의 비효율이 발생하고 있다. 이는 현재의 감사원 조직과 인력으로는 종래의 감사원 감사 역할을 수행하는 데 한계가 있음을 의미하는 것으로 결국은 감사원 감사 실시와 자체감사와의 역할분담 등을 통하여 공공감사의 효율성을 높일 필요가 있음을 보여주는 것이다(감사원, 2010: 44). 이러한 측면에서 보더라도, 자체감사를 위한 ｢공감법｣이 마련된 이상, 감사에 있어 해당 기관의 자체감사가 우선 되도록 함으로써 감사 전반의 비효율적 요소들을 줄일 필요가 있다.