'이중경제론'은 북한경제 계획과 시장의 공존을 설명하기에 유용한 분석틀의 기능을 했다. 하지만 이중경제론으로 설명 불가능한 현상이 나타나며 그 한계가 나타났다.
시장과 계획의 관계를 해석하기 위해 그동안 여러가지 이론적 분석틀이 제공되면서 활발한 논의가 전개되어 왔다. 그중에서도 '이중경제론’은 2002년 7⋅1 조치 이후 북한경제의 계획과 시장의 공존을 설명하는 데 유용한 분석틀(framework)로서의 기능을했다. 하지만 당, 군, 최고 지도자 등 특수한 경제주체들이 시장에 직⋅간접적으로 참여하기 시작하면서 이중경제론으로 설명할 수 없는 현상들이 많이 나타났다. 특히 공식과 비공식, 계획과 시장의 경계가 모호한 부분에서 시장참여자들의 의사결정구조와 이로 인한 경제적 결과를 설명하는 데 한계를 보였다.