형사조정은 형사조정위원회에서 담당하다, 피해자지원기관에서 진행함에 지적이 있자 찰청으로 변경하였다. 범죄피해자보호법의 개정되며 형사조정제도는 법적인 근거를 갖게 되었다.   
우리나라에서는 검찰의 내부지침에 따라 2006년 4월부터 대전지방검찰청, 인천 지방검찰청 부천지청, 같은 해 5월부터 서울남부지방검찰청에서 시범실시 한 후, 2007년 8월부터 전국 검찰청에 확대 시행되었다. 형사조정은 처음에는 범죄피해자 지원센터 안에 설치된 형사조정위원회에서 담당하였으나, 피해자지원기관에서 형사조정을 하면 공정성에 의문이 있다는 등의 지적에 따라 2009년 11월 10일부터는 형사조정위원회의 소속을 해당 검찰청으로 변경되었다. 이후 2010년 4월 21일 범죄피해자보호법의 개정으로 형사조정제도는 비로소 법적인 근거를 가진 제도로 자리매김하였다(범죄피해자보호법 제6장에 규정).