잠재성장모형은 크게 두 단계로 분석이 되며 단계별로 변수 설정에 따라 OECD ESP 연구결과에 큰 영향을 끼칠 수 있으며 신뢰도에 큰 문제를 불러올 수 있다. 
집단 또는 개인에 대한 변화량 분석에 적합한 잠재성장모형은 크게 2단계에 걸쳐 분석이 이루어진다(Preacher, Wichman, MacCallum, & Briggs, 2008). 1단계는 비조건 모형(unconditional model)으로 반복 측정된 변수의 변화를 분석하는 것이다. 반면 2단계에서는 시간의 변화에 영향을 미치는 변수들을 포함하여 초기값, 기울기에 영향을 미치는 변수를 찾아내는 것이다(Kline, 1998). 종속변수에 영향을 미치는 설명변수는 정서, 불안, 행복감 등 시간에 따라 변하는 변수(time-varying variable)과 성별과 같이 시간에 따라 변하지 않는 변수(no time-varying variable)의 특성을 고려하여 결과해석을 유념해야 한다. 또한 초기값과 측정의 시점이 연구모형에 영향을 미치는 것을 고려하여 신중히 접근할 필요성이 있다. 특히 OECD의 여러 나라와 다른 학교제도를 운영하고 있는 우리나라의 실정을 고려할 때 측정의 시점은 OECD ESP 연구결과에 중요한 영향을 미칠 수 있다. 즉, OECD ESP 측정시점을 어떻게 실시하는지에 따라 측정시점이 학년 초 또는 학년 말이될 수 있어 OECD ESP 연구결과에 대한 신뢰성에 큰 문제를 야기할 수 있다.