온라인수업 운영 시스템은 융통적인 방식으로 학기 단위의 운영과 방학 중 운영이 병행되어야 하며 특정 학생에게 일부 콘텐츠를 제공하는 형식으로 수업결손 해소에 힘쓰고 모바일 기기를 통해 학생의 학습권 보장을 위해 노력해야 한다.
우선 온라인수업 운영 시스템은 현재와 같은 학기 단위의 운영과 더불어, 필요에 따라 방학 중 운영도 가능해야 하며 일부 수업결손 해소를 위한 온라인수업 운영을 위해서는 해당 교과 전체가 아닌 일부 콘텐츠만을 특정 학생에게 배정하여 수강할 수 있도록 해야 한다. 선행 연구에서도 확인할 수 있듯이 세부적으로는 다양한 온라인수업 운영 모형이 적용될 필요가 있는데, 이러한 요구에 대해 각기 다른 운영 절차와 방식을 통해 해결하기보다는 학교 현장의 필요에 따라 융통적으로 대응할 수 있는 시스템을 구축함으로써 향후 보다 다양해 질 수 있는 운영 모형에 대한 요구에 대응할 수 있을 것이다. 마지막으로 온라인수업이 궁극적으로 학생의 학습권 제고를 위한 제도로 볼 수 있으므로, 최근 활용이 확대되고 있는 다양한 모바일 기기를 통한 온라인수업 접근이 가능하도록 해야 한다.