투입물에 초점을 두어 산출물수준을 고정시키고 투입물을 조정하여 효율성 100%를 만드는 투입기준모형과, 이와는 반대로 산출물에 초점을 두어 투입물수준을 고정시키고 효율성 100%를 만드는 산출기준모형이 있다. 실증분석을 진행함에 있어 직관에 따라 적절함을 판단하여 두 모형 중 하나를 결정하면 된다.
이 두 모형은 투입요소에 초점을 두는가, 산출물에 초점을 두는가에 따라 다시 투입기준 모형(input oriented)과 산출기준 모형(output oriented)으로 구분된다. 투입기준모형은 산출물수준을 고정시킨 상태에서 투입물을 얼마나 감소시켜야 효율성이 100%가 될 것인지를 나타낸다. 산출기준모형은 투입물 수준을 고정시킨 상태에서 산출물을 얼마나 증가시켜야 효율성이 100%가 될 것인가를 보여주게 된다. 실증분석을 수행할 때 투입기준 모형과 산출기준 모형 중에서 선택해야 하는 경우에는 응용대상의 생산과정이 가진 특성과 효율성 개선 방향에 대한 직관에 따라 결정하면 된다. 예를 들어 응용대상관측치들이 산출을 조정하는 것이 사실상 불가능하고 단지 투입을 줄임으로써 효율성을 개선할 수 있다면 투입기준 모형을 활용해야 한다. 반면 산출을 높이고 효율성을 개선하는 것이 목적이라면 산출기준 모형을 활용해야 한다. 우리의 분석 대상인 전문대학의 경우 교육의 질 개선을 통한 산출 향상이 당면 과제이므로 투입기준 모형보다는 산출기준 모형을 사용하는 것이 더 적절할 것으로 판단된다. 본 연구에서는 산출기준 CCR 모형과 산출기준 BCC 모형을 활용하여 분석을 진행한다.