재난의 수습을 총괄하기 위해 자치단체장은 지역재난안전대책본부를 두어야 한다. 이러한 본부의 본부장은 해당 자치단체장이며 재난이 발생하면 통합지원 본부를 설치하고 실무반을 편성, 운영할 수 있다.
이 법의 제16조는 지역재난안전대책본부에 관한 사항을 규정하고 있다. 즉, 해당 관할 구역에서 재난의 수습 등에 관한 사항을 총괄･조정하고 필요한 조치를 하기 위하여 시･도지사는 시･도재난안전대책본부를 두고, 시장･군수･구청장은 시･군･구재난안전대책본부를 두도록 규정하고 있다. 이러한 지역대책본부의 본부장은 시･도지사 또는 시장･군수･구청장이 되며, 지역대책본부장은 지역대책본부의 업무를 총괄하고 필요하다고 인정하면 대통령령으로 정하는 바에 따라 지역재난안전대책본부회의를 소집할 수 있다. 이 법에 의하여 시･군･구대책본부의 장은 재난현장의 총괄･조정 및 지원을 위하여 재난현장 통합지원본부를 설치･운영할 수 있고, 통합지원본부의 장은 관할 시･군･구의 부단체장이 되며, 실무반을 편성하여 운영할 수 있다.