캐릭터가 보호받는 것은 어려움이 있다. 등록비용이 높고, 절차가 까다롭고, 지정상품이 제한되는 데다 3년후에는 상표권이 자동 취소돼 보호받기 힘들다.
다만, 상표는 등록절차가 까다롭고, 몇 가지 지정상품에 한하여 보호된다는 단점도 있다. 가령 캐릭터를 식품 등에만 등록받았다고 할 경우, 식품이 아닌 화장품이나 운동화 등에 동일한 캐릭터가 사용되었다고 하더라도 상표침해가 아닌 것으로 결론이 난다. 물론 모든 상품에 대해 등록한다면 철저한 침해예방이 될 수도 있겠지만, 이 경우 엄청난 등록비용은 예외로 하더라도 모든 상품을 직접 생산하거나, 실시권 계약을 하지 않는 경우3년 뒤에 그 상표는 취소가 될 가능성이 높다. 따라서 캐릭터의 경우, 꼭 필요한 경우를 제외하고는 상표로서 보호받는 것에 한계가 명백히 있다.