제주해군기지 건설갈등은 정책참여자들 간의 정보불균형으로 인한 것이므로, 대립중인 이해당사자들이 참여하는 공동조사형태로서의 다양한 측면에 대한 사실조사가 필요하며, 시민참여, 분석 이해를 돕는 프로그램운영 등이 필요하다.
많은 공공갈등에서처럼 제주해군기지 건설갈등의 경우도 정책참여자들 간의 정보불균형이 불신과 갈등을 가져오는 주요요인이 되었다. 군기지 등 군사시설이나 특히 비선호시설 입지가 이루어지는 경우 입지지역의 생태환경적 변화, 지역사회의 공동체 변화, 인근 마을지역의 삶의 방식 변화, 문화재 훼손가능성, 지역발전정도, 주변국가간의 역학관계 등 다양한 측면에 대한 사실조사가 이루어져야 할 것이다. 사실조사는 객관성과 중립성을 확보하기 위한 합리적 절차를 통해서 심각한 대립을 하고 있는 이해당사자들이 참여하는 공동사실조사(joint fact-finding) 형태를 가질 필요가 있다. 환경영향평가나 갈등영향분석 과정에서도 대표성을 가진 시민참여가 중요하며, 이들이 전문적 평가나 분석과정을 이해할 수 있도록 하는 프로그램운영도 필요한 것으로 보인다.