개인투자자의 참여 부진은 시장 진입장벽을 높게 지은 것이 원인이다. 영국 AIM과 달리 코넥스는 직접투자를 전문투자자로 제한했다. 최근에는 개인투자자의 참여확대 방안을 논의하고 있다. 또한 예탁금 기준을 하향 조정하자는 주장도 있으나 역효과가 클 수 있다는 반론이 있다.
이와 같은 개인투자자의 코넥스시장에 대한 참여 부진은 시장구조 설계시개인의 시장 진입장벽을 높게 구축한 데 주로 기인하는 것으로 보인다.코넥스시장은 상장기업이 창업초반의 중소기업이고 공시의무가 크게 완화됨에 따라 개인투자자가 코넥스시장에 참여하려면 3억원 이상을 예탁하도록 하는 등 직접투자를 전문투자자로 제한하였다. 코넥스시장에 반해 영국 AIM의 경우 기관투자자 중심으로 형성되어 있기는 하지만 투자자에 대해서는 특별한 제한을 두고 있지는 않고 있다.최근에는 일일 거래량 및 유동성 증대의 방법으로 개인투자자의 참여확대 방안을 논의하고 있으며 이를 위해 정기적 정보제공 및 공시활성화 방안을 모색중이다. 한편 코넥스시장의 개인투자자 확대 방안과 관련하여 거래에 활력을 주기위해서는 예탁금 기준을 하향 조정해야 한다는 주장도 제기되고 있으나 비전문 개인투자자의 부문별한 투자확대에 따른 코넥스시장의 투기화,투자자 보호를 위한 상장기업의 공시부담 가중 등 시장 활성화보다는 역효과가 클 수 있다는 반론도 나오고 있다.