북한의 주체사상, 선군사상, 대한민국의 사유재산제, 시장경제질서처럼 서로 인정할 수 없는 헌법핵이 존재하므로 통일헌법 구성을 위해 적어도 일방은 법체계 초월적인 헌법 변경 방법이 필요하다.
남북한 헌법상 명백히 서로 인정할 수 없는 ‘헌법핵’이 존재하는데, 북한 헌법에서의 주체사상이나 선군사상 등이 그것이고, 대한민국 헌법에선 사유재산제나 시장경제질서가 그것이 될 수 있다. 이런 남북한 헌법이 가진 내용상의 차이 때문에 적어도 일방이 헌법 본래의 ‘헌법핵’을 변경하지 않고서는 통일헌법의 구성이 불가능하다. 따라서 법체계 초월적인 헌법 변경 방법이 필요하다. 동독이나 서독과 같이 법체계 초월적인 헌법 변경 방법을 헌법상 명문화해둔 경우도 생각할 수 있다. 그러나 헌법에 헌법 초월적인 변경이 가능함을 명시한다고 하여도 실질적 내용에 있어서는 헌법 초월적 변경임은 변하지 않으므로 이 부분에서 포괄적으로 논하도록 하겠다.