한국교육개발원의 인성교육 실태 분석 연구 결과에 따르면 인성교육의 정의와 전략 방법의 부재, 성적향상을 지나치게 강조하는 분위기, 인성교육을 위한 연수 시간의 부족 등이 인성교육의 효율적 운영을 방해한다. 또한 인성교육이 형식적이거나 교사 재량에 의존하여 운영되고 있다.
사실상 기존의 거의 모든 인성교육 실태 연구가 초등학교만을 대상으로 하고 있지 않고, 연역적 추론과정을 통하여 학교 인성교육과 관련된다고 판단되는 요인들로 구성된 설문에 대하여 교사, 학부모 등 관련 행위자들의 반응을 평면적으로 분석하는 연구 방식을 취하고 있기 때문에 이들 연구 결과를 직접적으로 비교하는 데는 한계가 있으나, 동 연구의 결과가 이러한 연구들의 결과와 많은 부분에서 일치하고 있음을 확인할 수 있다. 그 중 중학교를 대상으로 하고는 있으나 조사 지역과 대상이 비교적 포괄적인 한국교육개발원(현주 외, 2009)의 인성교육 실태 분석 연구 결과로 제시되는 내용들은 동 연구의 결과와 많은 부분에서 일치되고 있다. 이 연구는 중요한 실태적 상황으로서, 교육청 수준에서 인성교육의 정의와 전략 방법의 부재, 학력 신장을 지나치게 강조하는 학교와 사회 분위기, 인성교육을 위한 독자적인 연수 시간의 부족 등이 인성교육의 효율적 운영을 방해하고 있는 한편, 실질적으로 행사성 사업형태로 형식적으로 운영되거나, 개인의 열의와 성의 등 교사 재량에 의존하여 운영되고 있음을 확인하였다.