일부 언론이 ‘혁명적 개편’이라고 표현했던 정부개편안은 극비리에 진행되었다. 개편대상이 된 부처의 장관들은 무척 당황했지만 공직사회의 동요를 막고 줄어드는 인력에 대한 처리를 해야 했다.
일부 언론은 이를 두고 ‘혁명적 개편’이라고 표현했다. 이런 개편안은 당시 청와대 박관용 비서실장과 관계 수석비서관, 그리고 개편안을 성안한 총무처 황영하 장관 등 극소수만 알고 있었다. 총무처 차관도 사전에 개편안을 몰랐다. 이날 오후 2시 정부종합청사 국무회의실에서 긴급 국무회의가 열렸다. 이영덕 국무총리가 무거운 표정으로 말문을 열었다. “오늘 청와대 고위 당정회의에서 정부조직을 대폭 개편하기로 했습니다.” 황영하 총무처 장관이 다시 10여 분간 조직 개편 내용과 경위를 설명했다. 미처 유인물을 준비하지 못해 한 부를 가지고 두 사람이 보기도 했다. 그만큼 총무처는 급박하게 돌아갔다. 개편 대상부처 장관들은 망연자실한 표정을 감추지 못했다. 일부는 얼굴이 하얗게 변했다. 일부 국무위원은 ‘이런 엄청난 조직 개편이라면 사전에 귀띔이라도 해야 하는 것 아니냐’며 항의성 발언도 했다. 하지만 이미 되돌릴 수 없는 일이었다. 통폐합하는 부처 장관들은 ‘통합하는 부처 직원들의 신분은 어떻게 되느냐ʼ고 물었다. 자신들은 그만둬도 공직사회의 동요를 막고 줄어드는 인력에 대한 처리문제가 장관들에게는 발등의 불이었다.