소방방재청은 행정･소방･기술직이 모여 있는 형태였는데, 소방공무원들은 방재를 제외한 ‘소방청’으로의 독립을 주장해왔다. 이는 2014년 국가안전처 설립 당시 ‘소방청’ 별도 설치에 대한 공식 요청으로 이어졌고 결국 소방방재청은 국민안전처 산하의 중앙소방본부로 전환되었다. 그러나 지금도 소방공무원에 대한 배려 부족과 행정직 위주의 조직 구성에 대한 비판이 제기되고 있다.
국민안전처 설립 이전, 소방과 해양경찰은 각각 독립기관으로 격상할 수 있도록 조직 내외에서 많은 노력을 기울이고 있는 상태였고, 조직구성원들도 이를 원하는 것으로 여러 차례 밝혀진 바 있다. 소방방재청은 ‘112만 국민서명’이 국회에 제출되어 설립된 대한민국 최초 국가기관이었지만, 행정･소방･기술직이 모여 있는 형태였기 때문에 많은 소방공무원들은 방재를 제외한 ‘소방청’으로 독립하자는 의견을 오랫동안 주장해왔다. 10여 년 전 ‘국가재난관리체제 실태와 개선방안’ 여론조사에 따르면 소방공무원의 64%가 소방방재청의 문제점으로 ‘일반직 중심으로 구성되어 전문성이 부족하다는 점’을 들었고, 91.3%가 소방청 독립을 찬성하는 것으로 나타나 조직 내 일반직과 소방직간의 갈등이 있음을 암시하였다. 실제로 2014년 6월 2일 국가안전처 설립 시, ‘소방청’을 별도 설치해줄 것을 공식 요청하고, 중앙과 지방의 소방조직 지휘체계 확립을 위해 ‘소방청(본부)-지방소방청-소방서’ 체계를 구축하는 방안이 바람직하다는 입장도 전달한 바 있다. 결국 소방방재청은 국민안전처 내 중앙소방본부로 전환되었고, 해양경비안전본부와 중앙소방본부가 인사와 예산의 독립성･독자성을 유지하는 형태로 원래의 기능과 조직이 상당 부분 유지되었다. 그러나 소방방재청 시절, 육상 재난의 대응 조직인 소방 조직이 국가와 지방으로 이원화되어있다는 문제와 함께 지금도 대표적인 재난안전공무원인 소방공무원에 대한 배려가 적고, 행정직 위주의 조직으로 구성되어 있다는 비판을 제기하고 있다.