본 분석은 몇 가지 한계가 있다. 유의미한 결론을 위해 사업체와 함께 공장 등을 고려할 필요가 있다. 또한 거래액 속성의 신뢰성에 대한 검토가 요구된다.
본 시범활용의 분석은 여러 가지 정책적 시사점을 제시하였으나, 자료특성상 몇 가지 한계가 있다. 먼저, 기업간 판매거래 데이터에서 개별 기업의 위치를 사업체 중심으로 추출하였기 때문에, 분석결과에서 기업본사들이 많이 위치한 서울·수도권 지역과의 거래가 두드러진 경향이 나타났다. 보다 정책적으로 유의미한 결론을 도출하기 위해서는 사업체와 함께 공장 등을 함께 고려할 필요가 있다. 다음으로, 기업간 연계의 강도를 나타내는 거래액 속성이 신용평가를 의뢰한 기업들이 자발적으로 보고한 수치이기 때문에 이의 신뢰성에 대한 추가적 검토가 요구된다.