혁신체계의 진화과정·원인이 모든 국가에 적용되진 않는다. Cooke et al는 혁신체제의 개념에 대해 단일모형의 생각을 버리고 유연성·지역적 차별성을 반영해야 한다고 주장한다. 2차 세계대전 이후와 세계화·글로벌 가치 사슬로 전 세계가 묶인 현재의 혁신체계는 다르다. 각 시점의 선택은 해당 국가의 맥락에 의존한다. 
중요한 것은 혁신체계의 진화과정이나 원인이 하나의 모델과 같이 모든 국가에게 적용될 수 있는 특성은 아니라는 점이다. 지역혁신체계를 주장한 Cooke et al(1997)은 혁신체제의 개념이 단일모형의 형태(one-size-fits-all)로 제안되어야 한다는 생각을 버리고 유연성과 지역적 차별성을 반영해야 한다고 주장한다. 즉 각 국가의 혁신체계 혹은 혁신체계의 제도적 배열은 선형적인 발전단계의 특성을 지니지 않는다. 국가마다 갖고 있는 부존자원과 경쟁우위의 형태가 다르고, 외부환경 또한 시시때때로 변화하기 때문이다. 2차 세계대전 이후의 혁신체계의 형태와 정보통신기술의 발달에 따른 세계화와 글로벌 가치 사슬(global value chain)로 전 세계가 묶인 지금의 혁신체계의 형태는 동일하다고 볼 수 없다. 개발도상국의 혁신체계의 수용에 관한 Szogs et al(2011)의 설명은 교육수준이 부족하여 지식의 교류와 흡수역량이 떨어지는 곳에서중개조직의 역할의 중요성을 강조하였지만, 실제로 중개조직이 충분히 역할을 다하는 곳은 이전에 나름의 제도적 배열과 산업구성이 존재한다. 각 시점에서 어떤 선택을 하느냐는 해당 국가가 처한 맥락(context)에 크게 의존한다.