현행 특수형태근로 종사자 특례제도는 근로자로 인정되어야 할 종사자를 특수형태근로 종사자로 고착화시킬 수 있고, 특례제도 이후에 생겨난 비전속적인 특수형태근로 종사자를 포섭하는 데 한계가 있으며, 시행령에 열거된 직종만을 보호대상으로 삼고 있는 한계가 있다.
이에 대하여는 산업재해보상 보험법상의 적용범위를 근로자 이외로도 확대하였다는 원칙적 의미를 부여할 수 있으나, 현행 특수형태근로 종사자에 대한 특례제도가 가지고 있는 한계도 적지 않다. 첫째, 학설에서는 특수형태근로 종사자가 도리어 근로자로 인정되어야 할 종사자집단을 특수형태근로 종사자로 고착화시킬 수 있다고 우려한다. 둘째, 현행 산업재해보상보험법상의 특수형태근로 종사자에 대한 특례는 이에 해당하기 위한 요건으로 전속성을 요구하고 있는데, 특수형태근로 종사자에 대한 특례제도 도입 당시에 존재하고 있었거나 특례제도 이후에 생겨난 비전속적인 형태로 업무에 종사하는 특수형태근로 종사자를 포섭하는 데 한계가 있다는 점이다. 끝으로, 현행 산업재해보상보험법의 특수형태근로 종사자에 대한 특례는 시행령으로 적용직종을 정하는 방식을 취하고 있기 때문에 특수형태근로 종사자 전반을 보호하는 것이 아닌 시행령에 열거된 직종만을 보호대상으로 삼고 있어 그 적용범위가 제한적이라는 문제가 지적되고 있다.