한국감정원 지수와 반복매매지수의 추정 방법은 동일하나 차이점은 동일한 아파트로 간주 시 평활화가 많이 이루어져 이를 극복하기 위하여 본 논문에서는 반복매매지수를 한국감정원지수보다 엄격한 조건 적용 후 같은 층만 동일한 아파트로 간주하였다.
실거래가를 이용하고 있는 한국감정원지수의 경우, 그 변동성이 다른 지수보다는 상당히 작다는 것을 알 수 있다. 반면에 헤도닉 가격지수와 McMillen 지수의 경우, 그 변동성이 다른 지수보다 상당히 크다는 사실도 알 수 있다. 반복매매지수의 경우에는 그 변동성이 많이 줄어드는데, 그 이유는 한국감정원지수처럼 그루핑을 통하여 매매가격을 어느 정도 평활화하기 때문일 것으로 판단된다. 한국감정원지수와 반복매매지수는 그 추정 방법이 동일하지만, 차이점은 동일한 아파트로 간주할 때에 나타난다. 한국감정원지수의 경우에는 최저층, 최고층, 그 외  나머지는 모두 같은 층으로 분류하여 그룹마다 평균 가격을 이용하기 때문에 이 단계에서 평활화가 많이 이루어진다. 이러한 문제를 극복하기 위하여 본 논문에서 사용한 반복매매지수의 경우에는 한국감정원지수보다는 엄격한 조건을 적용하여 같은 층일 때만 동일한 아파트로 간주하였다.