성과감사제도의 운영방법을 분석한 결과 연구업무와 행정지원업무 집단 간의 인식 차와, 기초기술 소속 출연(연) 종사자와 산업기술 소속 출연(연) 간 차가 컸다.
본 연구는 성과감사제도의 합리적 운용을 통해 정부출연(연)의 효율적 운영과 연구개발사업의 성과가 제고되는 선진화 사업이 지속가능하고 자율적으로 추진될 수 있는 기반을 구축하는 촉진기제로서의 성과감사 운영방법을 분석하였다. 실증적 조사연구를 위하여 23개 정부출연(연) 종사자를 대상으로 구조화된 조사지를 활용하였다. 분석결과를 요약하면, 대부분 각 문항에서 집단 간의 차이가 극명하게 드러났으며, 연구업무집단과 행정지원업무 집단 간의 인식 차가 크고, 기초기술연구회 소속 출연(연) 종사자와 산업기술연구회 소속 출연(연) 간에도 분명한 차이가 발견되었다.