돌봄교실이나 자유수강권 지원과 농어촌 방과후 프로그램지원비 등은 특정대상자에 한해 지원되지만 유치원은 원아들 모두가 대상자로 방과후 과정 참여시 모두에게 특성화활동비를 지원하는 차이가 있다.
셋째, 초등 방과후학교의 경우 돌봄이 필요한 학생 중심으로 운영하고 있으며, 저소득층 학생은 자유수강권을 지원하고, 농어촌 대상으로는 방과후학교 프로그램 운영비 지원 등을 통해 교육격차를 완화하고 있다. 일반 학생의 경우 방과후학교 수강료는 수익자 부담으로 한다. 이외 방과후학교 우수사례 발굴 및 홍보, 방과후학교 운영 교실의 안전을 위해 CCTV나 방화 차단막 활용, 학교 인근 경찰 지구대 및 유관기관과 협조체제 구축, 보조 인력의 업무 지원 내용 명시 등이 특징이다. 현재 유치원에서는 방과후 과정의 참여 대상에 제한이 없고, 방과후 과정을 이용하는 모든 아이들을 대상으로 방과후 과정 지원비내에서 특성화활동비를 사용 가능하도록 하는 것과 차이가 있다.