공공갈등을 거래비용 관점에서 보면 기존 갈등해결기제 하에서는 갈등으로 인한 거래비용이 급증한다. 또한 갈등이 극단적으로 대립되면 정책수용성이 낮아지고 공동체 와해 및 사회통합을 저해한다.
또한 우리사회 공공갈등은 정책과정의 참여 제한, 갈등당사자의 효용 극대화추구 등으로 가치 또는 목표의 양립 가능성이 매우 낮다. 이를 거래비용 관점에서 보면, 갈등당사자 간의 대화, 협상, 조정, 중재 등의 방식을 적용한 기존 갈등해결기제 하에서는 갈등으로 인한 거래비용이 급증하는 문제가 존재한다(박재근 외, 2014:239). 갈등으로 인한 사회･경제적 비용의 증가는 개인의 문제를 넘어 국가적 차원의 경쟁력 손실과 직결된다. 또한 이를 통해 갈등이 극단적으로 대립되는 양상을 보일 경우, 정책 당사자들이 자발적으로 정책에 순응하고자 하는 정책수용성은 현저히 낮아지며, 궁극적으로는 공동체 와해 및 사회통합을 저해하는 결과를 초래한다.