일본의 에너지 및 기후변화대응 관련 부처는 자원에너지청 산하기관, 환경성, 문부과학성, 구토교통성, 외무성 및 내각부 등이 있다. 총괄 부서인 자원에너지청이 유관기관과의 협조과정을 통해 관련 정책을 추진하고 있다.
일본에서는 앞서 살펴본 바와 같이 경제산업성 산하 자원에너지청에서 기본적으로 에너지정책 업무를 담당하고 있다. 일본의 에너지 및 기후변화대응 관련 부처는 자원에너지청 산하기관을 비롯하여 환경성, 문부과학성, 국토교통성, 외무성 및 내각부 등이 있다. 환경성은 에너지와 관련된 환경정책과 기후변화대응 관련 정책을 담당하고 있으며, 문부과학성은 핵융합 및 기초연구개발과 밀접한 관련을 맺고 있고 있다. 국토교통성은 교통 및 운송정책과 에너지효율을 위한 연비 및 건축물 기준을 담당하고 있고, 외무성은 에너지부문 국제협력을 통한 에너지안보와 밀접한 연관을 맺고 있다. 즉, 자원에너지청이 일본의 에너지정책을 총괄하지만 유관기관과의 긴밀한 협조과정을 통해 에너지 및 기후변화대응 관련 정책을 추진하고 있는 것으로 파악되고 있다(이종영, 2010: 46).