현재의 사업평가관리가 연구성과지표에 의존하고 있고. 사업종료 후의 평가도 제대로 이루어 지지 않으므로, 목적의 달성을 중심으로 한 평가제도로 나아가야 한다.
마지막으로 현재의 사업평가관리는 사전에 설정한 연구성과지표를 중심으로 관리되고 있다. 질적인 평가관리도 계량화를 통해 관리하고 있어 여전히 양적 평가의의 문제가 노정되고 있다. 사업 종료된 후 당초에 설정한 사업목적 달성정도에 대한 사업평가도 적절히 이루어지지 못하고 있다. 올해부터 종료사업의 경우 종료사업 평가제도가 도입되어 시범평가가 실시되었다. 그러나 여전히 자체평가의 적절성에 초점을 맞추고 있으며 성과에 대한 계량적 분석에 의존하고 있다. 따라서문제해결을 중심으로 한 과정 평가관리 및 사업 종료 시 실제적인 문제해결 성과즉, 목적의 달성을 중심으로 평가로 제도개선이 필요하다.