민주공화당의 당 조직은 이후 전두환 체제에서 민주정의당의 당 조직은 물론, 당시 야당이었던 신민당에도 상당한 영향을 미쳤다. 특히 창당의 조건을 지구당을 중심으로 규정하면서 우리 정당에서 최초로 대중동원형 정당 조직을 구축했다.
당 사무국이 인사, 재정, 공천 등을 모두 책임지는 강력한 사무국 중심체제의 정당조직을 만들었다 (김용호 2013: 9-10).당 의장, 정책위원회의장, 사무총장 등 당 지도부와 원내총무, 당 소속 국회부의장, 무임소 장관 등으로 구성되는 당무회의를 상설적 심의의결 기구로 삼았다. 그리고 당무회의는 의장인 당 총재의 뜻이 반영되도록 했다. 1963년 선거 이후에는 지역구의 읍면동 단위에서부터 통, 반에 이르는 당 기간 조직을 마련했는데, 당 기간 조직은 관리장, 투표구관리차장, 활동장, 연락장의 단계로 구성되었다. 민주공화당은 1965년 이래 지속적으로 이들 당 기간 조직에 대한 교육을 실시했다 (김용욱 1996: 130-135). 이러한 민주공화당의 당 조직은 이후 전두환 체제에서 민주정의당의 당 조직에는 물론이고, 당시 야당이던 신민당에도 상당한 영향을 미쳤다. 특히 뒤에서 살펴보겠지만, 창당의 조건을 지구당을 중심으로 규정하면서 우리 정당에서 최초로 대중동원형 정당 조직을 구축해 냈다.