대통령은 행정책임자로서 국내 주요 행정문제에도 책임져야 한다. 국내 경제발전 및 치안 등의 문제에 대한 행정력에 집중해야 하며 국무총리는 특정 부처의 업무라고 규정하기 어려운 여러 업무를 관할해야 한다.
이 방안에 따르면 대통령은 통일과 관련된 사안뿐만 아니라 행정책임자로서 국내 주요 행정문제도 책임져야 한다. 통일시대라 할지라도 국내 경제발전 및 금융안전, 국민의 복지와 안전 등은 주요한 이슈로서 대통령이 책임지고 수행하여야 할 업무 분야이다. 또한 통일시대에는 국내의 치안과 안전에 대한 문제가 제기될 가능성이 높기 때문에 대통령을 중심으로 한 정부는 이에 행정력을 집중할 필요가 있다. 반면 국무총리의 담당 업무는 대통령의 의중과 국정운영 철학에 따라 달라질 수 있으나 현재와 크게 차이가 나지 않을 것이다. 현재와 같이 대통령을 보좌하거나 대리하며 특정 부처의 업무라고 규정하기 어려운 규제개혁, 정책평가 등의 업무를 관할할 수 있을 것이다. 기타 대통령이 위임한 업무도 수행할 수 있을 것이다.