기업별노조가 지배적인 환경에서 복수노조 허용은 노동조합 수를 늘리기는 하지만, 조합원 수를 늘리는 데는 한계가 있다. 이미 노동조합이 조직된 사업장에 또 다른 노조가 조직되는 것이기 때문이다. 이는 노동자의 권리 실현에 방해가 되며 노동시장의 안정성까지 교란한다.
기업별노조가 지배적인 환경에서 복수노조 허용은 노동조합 수를 늘리기는 하지만, 조합원 수를 늘리는 데는 한계를 보여주고 있다. 노동조합 수 증가는 새로운 사업장을 조직해서라기보다는 이미 노동조합이 조직된 사업장에 또 다른 노조가 조직되기 때문인 것으로 보이며, 이러한 사정은 ‘결사의 자유’가 기업별노조주의로 인해 뒤틀리면서 ‘분열의 자유’로 왜곡되는 것이라 이해할 수 있다. 한마디로, 아시아에 고착된 기업별 노동조합 형태와 결합된 복수노조 허용은 노동시장 전반에 걸쳐 결사의 자유, 즉 단결권과 단체교섭권을 촉진하기보다 특정 기업에 속한 근로자들(employees) 간의 경쟁을 심화시킴으로써 노동자의 단결권과 단체교섭권에 실천적 장애가 되고 있으며 나아가 노동시장의 안정성을 교란하는 부정적 영향을 끼치는 것으로 보인다. 상급단체의 인력과 자원이 부족하고 단위노조에 대한 조정 역량과 지도 능력이 빈약한 인도네시아와 필리핀의 경우, 이러한 문제점은 증폭되면서 노동조합 운동의 지속가능성을 약화시키고 있다.