초국가적안보위협세력이란 개별국가를 초월한 문제이거나 국제조직, 단체, 개인에 의한 문제를 일컫는다. 알카에다가 대표적으로 국제 테러조직의 등장은 개별국가의 국가안보 목표에 큰 변화를 야기시켰다.
냉전시대의 군사안보 문제처럼 특정국가에 의한 안보위협이 아니라 국제테러, 국제마약, 환경파괴, 불법이민, 인신매매, 국제조직범죄 문제 같은 개별단위 국가를 초월한 문제이거나 국가가 아닌(stateless) 국제조직이나 단체, 개인에 의한 문제를 초국가적안보위협세력이라고 말한다.  2001년 9/11 테러를 자행한 알카에다는 특정한 영토와 인구가 없는 네트워크 조직으로 대표적인 초국가적안보위협세력이다. 파키스탄 현지시간 2011년 5월 2일 알카에다 조직을 이끌었던 오사마 빈라덴이 사살된 이후에 등장한 이슬람 국가(ISIS)는 전쟁형태의 테러를 전 세계 곳곳에서 자행한다. 극단적 국제테러조직의 등장 은 개별국가의 국가안보의 목표에 상당한 변화를 초래했다.