현행 수입부과금 환급제도는 매매형태를 나누고 체결가격이 기준가격보다 낮은 경우를 대상으로 한다. 환급 시 시설종류, 매매형태에 따라 우선순위를 부여하고 연 환급총량 또한 유종 별로 다르며 기업별 총량의 50%로 제한한다.
<표 Ⅳ-1>에서 볼 수 있듯이, 수입부과금 환급제도는 2012년 전자상거래제도가 도입된 이후 6회에 걸쳐 환급액의 변경, 경쟁매매와 협의매매의 구분, 환급 총량의 설정, 기업별 환급 한도 등에 있어서 조금씩 변해왔다.  현행의 환급제도는 한국거래소 에서의 체결가격이 기준가격(오피넷의 정유사 평균 주간공급가격)보다 낮은 경우를 대상으로 하며 경쟁매매인 경우와 협의매매인 경우로 나누어 리터당 4원 및 2원으로 차등적으로 적용하고 있다. 수입부과금 환급 시 주유소와 경쟁매매에 대하여 우선순위를 부여하여 주유소- 경쟁매매, 주유소- 협의매매, 주유소외 - 경쟁매매 및 주유소 외 - 협의매매의 1-4순위로 차등화하고 있다. 그리고 석유제품별 연간 환급총량은 휘발유는 750만 배럴, 경유는 1,550만 배럴이며 기업별 환급총량의 50%로 제한하고 있다.