LNG 프로젝트 회사에 투자한 참여자들의 다양한 이해충돌 문제로 인하여 프로젝트의 확장 과정에서, 협상이 지연되거나 별도의 프로젝트가 추진되는 결과가 일어나기도 한다.
반면에, LNG 프로젝트 회사에 지분 투자한 참여자들 중 일부는 원료 가스로 매입하는 상류부문 자산을 직접 소유한 경우가 있을 수 있는데,이 경우 원료가스 매입을 위해 지불한 이전가격(transfer price) 결정 수준에 따라 참여자들 간 이익이 이전되는 효과가 발생할 수 있어서 상류부문의 자산을 보유한 지분 참여자와 그렇지 않은 참여자들 간에 이해가 상충할 수 있다. 그리고 액화프로젝트 회사는 일정 개수의 액화트레인을 소유하고 이에 원료가스를 공급하게 되는데 이러한 이해 상충 때문에 최초 LNG 프로젝트를 구상할 시점에서는 미래에 있을 설비확대를 미리 예상하여 이에 대비하기가 어려운 단점이 있다. 따라서 당초 프로젝트 규모보다 확장이 필요하게 되었을 때 이를 위한 이해 당사자간 협상과정에 상당히 오랜 시간이 걸리기도 하며, 결국에는 새로운 프로젝트를 별도로 추진하는 방식으로 귀결되기도 한다.