셋째, 중앙과 지방행정기관은 법령 제․개정안 등에 대한 영향평가를 직접 수행하고 그 결과를 정책에 반영해야 한다. 이 때 중앙과 지방행정기관, 공무원의 적극적인 참여를 이끌어내야 한다. 이 삼자간의 관계 설정 및 운영주체 간 운영 기능을 종합하면 다음  <그림 Ⅳ-1>과 같다.
셋째, 중앙행정기관 및 지방자치단체는 법령 제․개정안, 3년 이상의 중장기 계획, 주요정책에 대한 아동․청소년 영향평가를 직접 수행하고 그 결과를 정책에 반영하는 역할을 담당하여야 한다. 각 기관에는 기관의 아동․청소년 영향평가를 총괄 관리하는 평가책임관(또는 기관담당부서)을 지정해야 하며, 법령이나 계획, 그리고 사업 등 영역에서 아동․청소년 영향평가 대상과제 업무담당자 를 지정하여 참여하도록 한다. 여기서 사업 평가는 대상과제를 각 행정기관이 직접 자율적으로 선정하도록 지침을 주어야 한다. 그런데 이 과정에서 공무원의 참여를 설득하는 데 상당한 어려움이 있을 것이 예상된다. 왜냐하면 또 하나의 과중한 업무가 발생하기 때문이다. 따라서 중앙과 지방의 행정기관이 모두 적극적인 참여를 견인할 수 있는 장치를 마련해야 하는 과제가 남아 있다. 정부합동 평가지표에 이 평가의 사용 여부를 반영하는 것도 한 방안이 될 수는 있을 것이다. 이 삼자간의 관계 설정 및 운영주체 간 운영 기능을 종합하면 다음 <그림 Ⅳ-1>과 같다.