체제통합 단계의 정치는 법·제도적으로 통일된 체계 구축과 민주국가 건설을 추진한다. 통합 선거, 통일의회, 통일헌법 등을 구축한다. 행정부문은 통일행정부를 구성, 국가완성을 위한 절차와 과거청산 정책을 시행한다.
둘째, 체제통합 단계의 정치분야는 법·제도적으로 남북이 통일된 체계를 구축하고 민주국가의 건설을 추진하게 된다. 정치부문에서 통합 선거를 실시하고 통일의회를 구성하며 통일헌법을 제정하는 등 법·제도적 통일체계를 구축하게 된다. 정치부문의 효과로 민주화 이행과 함께 남북갈등 해소로 인한 효과를 기대할 수 있다. 행정부문에서는 분단해소 단계에서 진행된 통일협상 등을 통해 통일행정부를 구성하고 향후 국가완성을 위한 조치들이 시행된다. 그리고 체제통합 단계에서는 분단해소 단계에서 시행되지 못한 과거청산에 대한 정책이 시행되고 이에 대한 비용과 편익이 발생하게 된다. 즉, 과거청산 정책은 분단해소 단계에서 실시하지 않고 통일선언이 이뤄진 이후인 체제통합 단계에서부터 과거청산을 위한 위원회 설립 및 조사 등을 통해 이뤄질 것으로 상정한다.