국가연구개발사업 및 정책에 대한 성과감사는 중장기적 측면에서 자체 상급기관에 의한 감사에도 도입해야 한다. 성과감사기법으로 경제적 효율성을 달성하면 실질적 선진화가 된 것으로 볼 수 있다.
현재 국가연구개발사업 및 정책에 대한 성과감사는 감사원 감사를 중심으로 이루어지고 있지만 중장기적 측면에서는 자체․상급기관에 의한 감사에서도 도입․운용되어야 할 감사기법이다. 성과감사기법이 보편화되어 정부출연(연)의 국책연구사업 및 정책은 물론 기관 차원에서의 경제적 효율성을 달성하였다면 실질적 선진화가 이루어졌다고 보아야 할 것이다. 정부출연(연)의 선진화는 본질적으로 민간부문이 수행 불가능한 연구개발사업의 핵심적 실현 주체이기 때문에 민영화를 통한 선진화는 비현실적이기 때문이다. 즉 출연(연)의 경영 효율화를 통하여 생산성이 높은 조직이나 기관으로 거듭난다면 선진화 목표는 이미 달성된 것으로 보아도 무방하기 때문이다.