SANBI는 남아프리카의 생물 보존과 잠재력을 위해 환경 관리와 각종 프로그램을 시행하고, 남아프리카공화국 환경관광부로부터 경제적 지원을 받아 운영된다. 
SANBI는 공공 연구기관으로 그 어느 지역보다도 풍부한 남아프리카의 생물다양성을 모두를 위해 지속가능한 방식으로 이용, 보전 및 즐기기 위해 설립되었다. 또한 토착식물의 경제적 사용과 잠재력을 도모하는 것도 SANBI의 설립 목적이다. 그 중에서도 남아프리카의 다양한 식물원과 식물 표본을 관리하고 환경 교육 및 원조 프로그램을 진행하고, 생태지역 프로그램, 정책 및 계획을 개발하고, 생물시스템을 연구하고 생물다양성을 수집하며, 생태계를 복원하고, 남아프리카 식물군에 대한 데이터베이스를 구축한다. 운영자금의 대부분은 남아프리카공화국 환경관광부(DEAT: Department of Environmental Affairs and Tourism)가 무상 지원하는 9,500만 자르(ZAR, Rand)로 충당되는데, 이 자금으로 연구소 직원들의 월급 및 기본 운영비를 충당한다(SANBI, 2007).