소방청 신설시 조직 설계 개편을 위해 중앙행정기관으로써의 효과적 기능수행 및 소방 정책, 화재 및 재난의 대비, 예방과 장비지원의 체계를 확대 개편하였다. 하지만 관계 부처와의 실무 협의 과정에서 많은 문제가 드러나 결국 1관 2국 14과 189명으로 개편되었다.
소방청 신설시 조직 설계 기본 방향을 육상재난 대응의 분야별 기구 및인력 재 편성 및 소방 정책·제도 개선 등 기능 수행을 위한 개편을 추진했다. 중앙행정기관으로서의 효율적 기능수행이 가능하도록 공통 부서를 개편하고, 소방 정책, 화재 예방, 재난 대비·대응, 장비 지원의 체계화를 구축하기 위해 당시의 2국 8과 141명에서 2관 4국 27과 305명으로 확대 개편하여 160여 명을 증원하는 조직안을 초기에 설계했다. 하지만 행정안전부, 기획재정부 등 관계 부처와의 사전 실무 협의 과정에서 현 중앙-지방의 이원화된 체계 안에서의 조직 구성 논리, 정부조직법 개정과 후속 직제 시행규칙 개정을 위한 촉박한 일정 등 복합적인 문제가 드러났다. 결국 여타 중앙부처의 인력 증원 규모, 법령상에 규정된 국가공무원 총 정원 등이 고려되어 1관 2국 14과 189명으로 최종 확정되었다. 이로써 「정부조직법」 개정 시기에 맞춰 「소방청과 그 소속기관 직제」, 「소방청과 그 소속기관 직제시행규칙」이 마련되었다.