사업체 조사에서 기재된 해당 사업체의 실 근로시간, 초과근로시간이 직무및 위험상이 상이한 개별 근로자의 다른 실근로시간을 반영하기 어렵고 설문 또한 통제변수로 사용하지 못했다. 다만 이를 위해 탄력적 근로시간제 운영여부를 통제하였고 경영 상황이 좋지 못한 경우 해당 사업체의 유형자산액을 회귀방정식에 포함하는 등으로 통제한다.
산업재해와 정(+)의 관계를 갖는 가동률을 일정 부분 통제하기 위해 산업을 중분류 수준에서, 지역을 광역시도 수준에서 각각 더미 변수의 형태로 고려하는 상황에서 해당 사업체의 매출액을 에 포함한다. 사실 매출액보다 나은 가동률의 대용치(proxy)는 근로시간이다. 하지만 사업체 조사에 기재되는 해당 사업체의 (평균 개념의) 실근로시간이나 초과 근로시간이 직무 및 위험성이 상이한 개별 근로자의 각기 다른 실근로시간을 반영하기 쉽지 않고, 심지어 사업체의 평균 실근로시간과 초과 근로시간에 대한 설문이 2015년 조사부터 누락되어 통제변수로 사용하지 못하였다. 다만 이에 대한 보완으로 탄력적 근로시간제 운영 여부, 교대제 시행 여부를 통제한다. 한편 경영 상황이 좋지 못한 경우 산업안전에 대한 투자가 감소하거나 산업재해에 더욱 소홀하게 될 가능성을 고려하여 해당 사업체의 영업이익을, 해당사업체의 규모를 통제하기 위해 해당 사업체의 유형자산액을 회귀방정식에 포함한다. 이 외에도 업력, 하도급 거래여부 및 유형(위탁거래, 수 · 위탁거래 구분, 수탁거래 중심), 다수의 사업장 보유 여부, 조사 대상 사업체의 본사 여부, 사업체의 조직유형(개인사업장, 회사법인, 학교법인 또는 의료법인, 회사이외의 법인), 주력사업의 해외 진출 여부, 정규직 인원 감축 또는 경영상의 이유로 인한 해고(정리해고, 명예퇴직)시행 여부, 성과배분제 운영 여부 등 산업안전에 대한 투자 혹은 선호가 상이할 수 있는 각종 사업체 속성을 추가적으로 통제한다.