이집트는 대통령 선거로 이슬람형제단이 지지하는 무르시가 대통령으로 당선되었으나 친무르시 시위대와 반 무르시 시위대가 서로 충돌하게 되면서 이집트 군부는 무르시를 대통력직에서 박탈하고 과도정부를 선포, 결국 이집트 전역은 유혈사태에 이르는 등 불안한 정국이 계속되고 있다.
무바라크가 퇴진하면서 이집트군 최고위원회가 권력을 이양받아 시위그룹이 요구한대로 의회를 해산시키고 국민투표를 통해 헌법을 개정하였으며, 대통령선거를 통하여 이슬람형제단이 지지하는 무르시가 대통령에 당선되었다. 그러나 무르시 대통령이 정치의 이슬람화를 추진하려고 하자 친무르시 시위대와 반무르시 시위대가 충돌하게 되면서 수백 명의 사상자가 발생하는 사태가 발생하였으며, 2013년 6월에는 무르시 취임 1주년을 맞아 100만 명이 참가한 대규모 반무르시 시위가 열렸다. 이렇게 이집트 정국이 혼란해지자 7월 3일 이집트군은 무르시로부터 대통령직을 박탈하였고 이슬람주의 새 헌법을 정지시켰으며, 8월 3일에는 군부가 과도정부를 선포하고 무슬림형제단을 비롯한 이슬람세력을 적극적으로 탄압하기 시작하였다. 이로 인해 이집트 전역에서는 과도정부에 반대하는 시위가 벌어졌고 이집트군은 이를 무력으로 진압하는 과정에서 유혈사태가 발생하였다. 이집트 군부 과도정부는 군부의 권한을 확대하고 이슬람의 영향을 축소하는 새 헌법 초안에 대한 국민투표를 실시하여 통과시켰으나 이슬람세력의 반발로 정국불안은 계속되고 있다.