특수 전문대학은 하노버, 위벡, 드레스덴·에어푸르트·막데부르그의 의과대학을 들 수 있는바, 슈파이어 행정전문대학은 석·박사학위도 수여하는데, 특수전문대학은 주로 공무원과 외국의 교수들이 재학하고 있다.
특수 전문대학은 하노버에 있는 의학/수의학 전문대학(Medizinische und die Tieraerztliche Hochschule in Hannover)이나 뤼벡에 있는 의과대학(Medizinische Universitaet in Luebeck), 그리고 드레스덴과 에어푸르트, 막데부르그에 있는 의과대학(Medizinische Akademie) 등을 들 수 있다. 슈파이어에 있는 행정전문대학(Hochschulefuer Verwaltungswissenschaften in Speyer)의 경우는 석사와 박사학위도 수여한다. 특수 전문대학은 한국의 대학원과 같이 이미 법학, 경제학, 사회학으로 학업을 마친 사람들이 진학하는 곳으로 주로 공무원과 외국의 교수들이 재학하고 있다.