초등돌봄교실은 취약계층 아동뿐만 아니라, 방과 후 돌봄이 필요한 모든 아동을 대상으로 하여 일반적인 방과 후 프로그램을 운영해야 한다. 아동에 따라 적절한 서비스를 제공하는 기관으로 연계하는 등의 분담도 필요하다.
한편, 초등돌봄교실은 현재 드러나고 있는 이용자의 특성 차이를 좀 더 살려 특성화를 꾀할 필요가 있다. 즉, 저소득층이나 취약계층 아동을 대상으로 하는 것이 아니라 실제 방과 후 돌봄이 필요한 아동을 대상으로 하여 일반적으로 방과 후에 아동들에게 제공할 수 있는 프로그램 위주로 역할을 정립할 필요가 있다. 따라서, 초등돌봄교실 이용 아동 중 지역아동센터나 방과후아카데미에서 제공하는 서비스가 더 적절할 것으로 판단되는 아동에 대해서는 해당 기관으로 연계하는 등 적극적인 분담 노력도 이루어져야 할 것이다. 국회예산정책처의 연구용역을 통하여 실시된 인터뷰와 현장방문조사에서도 학교에 적응하기 어려워하는 아동 ․ 청소년은 지역돌봄기관인 지역아동센터나 방과후아카데미에서 전문적인 서비스를 제공받는 것이 효과적이라는 의견이 다수 제시되었다.