GHQ는 검찰권한의 제한을 위해 경찰에게 수사권을 부여하고 검찰과 사법경찰을 상호협력적 관계로 규정했다. 1948년 형사소송법 개정에서 검찰과 사법경찰의 협조관계를 원칙으로 하되 예외조항을 두었다. GHQ는 경찰에게 독자적 수사권을 부여하면서 검찰관의 지시 및 지휘권을 인정하게 되었다. 이는 검찰의 수사 부담을 덜고 경찰의 지방분권화를 위해서이다.
GHQ는 강력한 검찰권한을 제한하기 위하여, 경찰에게 1차적 수사권을 부여하고, 검사와 사법경찰과의 관계를 상호협력관계로 규정하도록 하였다. 舊형사소송법에서는 사법경찰관리는 ‘검사의 보좌로 그 지휘를 받아’ 수사하는 자로 되어 있기 때문에 검사는 사법경찰관리의 직무상 상관이었다. 그런데 1948년 형사소송법에서는 그 관계를 개정하여 검찰관과 사법경찰직원과는 원칙적으로 협조적인 관계에 있는 것으로 하고, 예외적으로 검찰관의 사법경찰직원에 대한 지휘, 지시권을 인정하였다. GHQ는 국가권력의 중앙집권화가 위험하다고 보고, 이에 검찰권 강화를 막고, 경찰 권력의 힘의 분산을 위해, 검찰과 경찰의 관계를 상호협력관계로 규정하고, 경찰에게 독자적 수사권을 부여하면서 검찰관의 지시 및 지휘권을 인정하게 되었다. 이러한 형사소송법의 변화는 과거보다 검찰관의 공소관으로서의 직무가 중요해졌기 때문으로도 볼 수 있다. 과거와는 달리, 공판이 당사자의 공격과 방어에 의하여 이루어지는 방식을 취하기 때문에 검찰관의 공판정에서의 활동이 종래와 비교하여 중요해진 것이다. 따라서 검찰관의 수사 부담을 덜어줄 필요가 있었다. 두 번째 이유는 미군정은 중앙집권적 권력을 와해시키고 경찰의 지방 분권화를 시도하였는데, 검사동일체 원칙에 따른 검찰관이 경찰을 일괄 지휘하게 되면 경찰의 지방분권화 정책에 반하게 되고, 검찰의 권력집중을 막을 수 없었기 때문이다.