과학과의 핵심 성취기준 정의와 관련하여 교육과정을 재구성할 때 핵심적인 성취기준만 가르치는 것이 아니라 성취기준 중에서 어디에 초점을 두어야 할지 교사들에게 정보를 알려주는 것에 목적이 있다. 
총론의 정의와는 달리 과학과의 핵심 성취기준 정의에는 ‘교수 학습에 좀 더 많은 시간과 노력이 필요한 성취기준’이라는 내용이 추가되어 있다. 과학과의 핵심 성취기준에 대한 정의에 특별히 이 내용을 포함한 이유는 핵심 성취기준을 선정할 때 단순히 핵심적인 내용인지 아닌지만 준거로 삼은 것이 아니라 교수 학습에 필요한 시간과 노력이 어느 정도인지도 준거로 삼았음을 분명히 하기 위해서이다. 과학과에서는 핵심 성취기준 선정의 중요한 이유가 교사들의 교육과정 재구성을 돕는 데 있다고 보았으므로 교수 학습 운영 측면이 교육내용의 중요성과 함께 고려될 필요가 있다고 판단하였다. 즉 과학과에서는 핵심 성취기준의 중요 목적이 교육과정을 재구성할 때 기 개발 성취기준들 중에서 강약을 두어야 할 부분이 무엇인지에 대한 정보를 교사들에게 제공하는 데 있다고 보았다. 과학과의 핵심 성취기준 정의에 두 번째를 포함한 또 다른 이유는 교사들이 핵심 성취기준만을 가르치면 된다고 오해하는 것을 방지하기 위해서이다. 즉 핵심 성취기준을 선정한 이유는 탄력적인 교육과정재구성 시 어디에 중점을 두어야 할지에 대한 정보를 제공하는 것이지, 핵심 성취기준만 가르치면 된다는 의미가 아님을 분명히 하기 위해서이다.