체육전담교사는 전문성이 필수인데, 스포츠 및 운동에 대한 지도역량을 단기간에 갖추기는 어렵다. 따라서 초등영어전담교사처럼 자격을 갖추기 위한 연수 시간을 대폭 늘리는 방안이 필요하다.
앞서 제시한 혜택과 함께 체육전담교사는 반드시 역할에 상응하는 전문성을 갖추어야할 의무가 있다. 물론 체육전담교사가 전문성을 갖추어야 한다는 점에는 대부분 동의하겠지만 일부 여론은 현재의 초등학교 담임교사가 체육전담교사 역할을 수행하기 위해 체육전문성을 길러야 한다는 점에 회의적인 시각도 존재한다. 왜냐하면 초등학교 교사로 임용된 이후 어느 정도의 연수 과정을 통해 전문성을 확보할 수 있을지, 그러한 연수 등의 교육 제도가 실효성 있게 운영될 가능성이 있을지 등 제도의 시행에서 나타날 수 있는 난제가 많이 있기 때문이다. 체육교과는 다양한 스포츠 및 운동에 대한 실기 능력과 지도방법을 체득해야하기 때문에 단기간에 이러한 지도역량을 함양하기는 사실 쉽지 않다. 이런 차원에서 초등영어전담교사처럼 자격을 갖추기 위한 연수 시간을 대폭 늘리는 방안도 모색되어야 할 것이다.