중소기업 구분 기준을 근로자수와 자산 등 투입요소의 분류에서 매출액 기준으로 변경되면 중소기업 산업연관표 작성 기본 방향 설정과 작성과정에 변화를 줄 것으로 예상된다.  기준 변경으로 발생가능한 문제점을 예상하고 대처해야 할 것이다.
셋째, 현재 중소기업을 구분하는 기준은 근로자수와 자산 등 투입요소를 분류의 기초로 정하고 있다. 현재의 기준이 2015년 이후 매출액 기준으로 변경될 예정이며 이러한 기준의 변경은 대ㆍ중소기업 산업연관표 작성의 기본 방향 설정과 작성과정에 변화를 줄 것으로 예상된다. 정기적으로 발표되는 산업연관표의 경우 분류 기준 변경에 따른 변화는 발표된 자료의 시계열적 안정성 측면에서 다소 부담으로 작용할 가능성이 높으며, 사용자 측면에서도 다소 혼동으로 작용할 가능성이 높다. 따라서 새로이 제시되는 기준의 적절성뿐만 아니라 기존 기준에 의한 분류체계의 일관성 역시 중요하다. 향후 대ㆍ중소기업 산업연관표 작성과정에서 기준 변경으로 인해 발생가능한 문제점을 충분히 예상하고 대처해야 할 것이다. 또한 대 중소기업 산업연관표는 구조분석을 위한 것으로 매년 변동의 가능성이 높은 매출액을 기준으로 반영하는 것은 본래의 작성목적에 부합하지 않을 가능성도 높을 것으로 파악된다.