정원규제와 정원 자율화의 효과에 대한 논의는 수도권의 정원규제와 비수도권의 정원 자율화에 적용 가능하다. 정원규제와 정원 자율화에 대한 논의에 의하면 수도권 정원규제는 현실상 수도권 대학의 전반적인 교육수준을 낮추고 있을 가능성을 포함한다.
이상의 정원규제와 정원 자율화의 효과에 관한 논의는 수도권의 정원규제와 비수도권의 정원 자율화에 적용해 볼 수 있다. 한국 수도권의 경우에는 비수도권에 대비해 입지 프리미엄이라는 특수성이 있다. 학생들은 수도권으로 진학하고 싶어 하기 때문에 수도권 대학들의 경쟁률은 비수도권 대학들에 비해 현저히 높다. 뿐만 아니라 입학시험의 성적순에 따른 대학 랭킹도 수도권 대학들이 높다. 따라서 수도권 대학들은 비수도권 대학들에 비해 훨씬 높은 수준의 학생들을 받을 수 있음에 이견이 없을 것이다. 하지만 앞선 정원규제와 정원 자율화에 대한 논의에 따르면 수도권 정원규제의 현실은 수도권 대학의 교육수준을 전반적으로 낮추고 있을 가능성을 함의한다. 수도권의 입지 프리미엄으로 인한 높은 학생 수준에도 불구하고 정원규제의 효과가 비수도권 대학에 비해 수도권 대학의 낮은 성과로 이어질지는 매우 흥미로운 실증의 문제가 된다.