학교전담경찰관이 지역사회 상담, 유관기관과 협력하기 위해 상설협의체나 상호협력 프로토콜을 마련해야 한다. 상설협의체는 관서별 운영을 명시하고, 협의회 개최와 지방별 운영사항, 지역실정에 맞는 운영을 통해 실효성을 높이고 있다.
학교전담경찰관이 지역사회의 전문상담기관 유관기관과 원활한 협력관계를 이루기 위해서는 상설협의체 구성이나 상호협력을 규약으로 담은 프로토콜 마련의 필요성이 있다. 상설협의체 구성 과 관련해서 최근 학교전담경찰관 매뉴얼에서는 관서별 상설협의체 운영을 명시하고 있다. 경찰청과 교육부는 학교폭력 근절을 위한 시기･대상별 중점 추진전략 및 중･장기 발전방안 논의를 위하여 반기 1회 협의회를 개최하고, 지방경찰청과 교육청은 지역 실정을 반영한 세부 운영사항 마련을 위해서, 경찰서와 교육지원청은 현장 활동 및 학교폭력 사안에 대한 공동대응을 위해서 각각 분기 1회씩 협의를 개최하되, 개최시기･협의회 형태･참석대상 등은 관서별로 지역실정에 맞게 운영하도 록 하고 있다. 이러한 상설협의체 구성은 협력대상기관들의 연계협력의 실효성을 높일 수 있는 현실적 방안이다.