전교조 압수수색에 대한 준항고 사건의 판례는 관련 정보를 선별하기 불가능 하거나 현저히 곤란한 사정이 인정되는 예외적 경우에도 저장매체 자체의 점유 이전만을 인정하는 문제가 있다.
그러나 전교조 압수수색에 대한 준항고 사건의 판례는 집행현장 사정상 관련 있는 정보를 선별하기가 불가능하거나 현저히 곤란한 사정이 인정되는 예외적인 경우에도 저장매체 자체에 대한 압수 또는 하드카피 내지 이미징 형태의 압수를 인정하는 것이 아니라 혐의사실과 관련된 증거의 선별을 위하여 해당 저장매체의 점유 이전만을 인정하는 문제가 있다. 즉 이는 예외적으로 저장매체 자체에 대한 압수를 인정하는 형사소송법 제106조 제3항의 규정에 배치된다. 그리고 점유이전과 선별과정을 포함하여 압수수색영장 집행의 일환으로 보게 되면 압수의 본질적 내용이 목적물에 대한 점유 이전임에도 불구하고 점유이전에 따른 압수를 인정하지 아니하고, 관련성 있는 정보를 선별할 때까지 영장의 집행과정을 무한하게 확장할 위험이 있으며, 영장의 집행종료시점을 확정하지 못하고, 실무상 관련성 있는 정보를 찾을 때까지 피압수수색당사자의 참여권 등을 무한하게 보장하여야 하는 문제가 있다.