주택임대사업자를 등록하면 세제혜택이 다양한 조세 감면의 형태로 제공되고 주택거래단계에 따라 발생하는 조세가 근거법에 따라 상이하므로 감면효과와 기준이 모두 다르게 적용된다.
한편 <표 Ⅱ-3>와 같이 주택임대사업자를 등록할 경우 세제혜택은 대상 세제에 따라 수혜기준이 매우 다양하다. 이는 임대사업자 대상 세제혜택이 국세 지방세, 그리고 건강보험료 감면 등 다양한 조세 감면의 형태로 제공되고 있기 때문이며, 주택거래 단계에 따라 발생하는 조세가 상이하기 때문이다. 예를 들어, 지방세 중 경우 ‘취득’이라는 거래 단계에서 발생하는 세금이며, 재산세, 종합부동산세, 임대소득세 등은 ‘보유’ 또는 ‘임대’라는 주택 거래 단계에서 발생하며 마지막으로 양도소득세는 ‘양도’라는 행위에 대한 세금을 의미한다. 즉, 주택의 거래 단계(취득, 보유, 양도)에 따라 부과되는 세금의 근거 법 등이 모두 상이하기에 등록 임대사업자를 대상 세제혜택의 경우 감면요건과 기준 등이 모두 다르게 적용되고 있다.