정권이 교체되어도 직업관료는 여전히 자신들을 조직의 주인으로 여길 수 있으므로 정치권력은 이들을 통제하기 위해 여러 방법을 쓴다. 정치권력은 기존 정책의 틀을 흔들고 관료들 충성을 요구하며, 이 때 다른 의견을 가지는건 저항으로 여긴다.
그렇다면 정권교체 상황에서 직업관료의 정치적 중립 행태는 어떻게 나타날 것인가. 교체된 집권정부는 관료의 복종과 충성을 요구하며 정치적 압력을 행사한다. 신분･고용 상의 안정을 보장받는 직업관료는 정치관료의 주기적 교체를 겪으면서 그들을 지나가는 ‘손님’, ‘정치적 철새’로 여기고 자신들을 조직의 주인으로 인식할 수 있기 때문에 정치권력은 집권 초기부터 관료제의 정치적 통제를 위한 여러 방식을 동원한다(박천오･주재현, 2007). 정치적 지배세력의 변화에 따라서 기존 정책의 틀이 크게 변화하면서(안병영, 2001), 변화된 정책에 대한 재빠른 충성을 확보하기 위한 관료제 통제는 더욱 요구된다. 정권교체에 따른 특정분야의 정책이 실제로 크게 변화하는가에 관한 이견은 존재하지만(이병량･황설화, 2012), 집권한 정치권력이 요구하는 정책변화에 대한 관료제의 ‘묻지마 충성’은 당연시되고 있으며. 관료제가 다른 선호･의견을 가지는 것을 정치적 저항이며 통제해야 할 문제로 인식되는 것이다.