직업 능력 개발 훈련은 여러 문제점이 드러났는데, 물량 배정 방식에 문제가 있었으며 2008년부터 직업능력개발계좌제를 단계적으로 도입하여 현재는 신규 및 전직 실업자 훈련뿐만 아니라 재직자훈련에도 적용하고 있다.
그러나 그동안 직업능력개발훈련은 공급자 중심의 전달체계, 대기업 및 정규직 위주의 재정 지원 등으로 낮은 훈련 참여율과 참여 기회의 양극화, 현장과의 괴리 등의 문제점이 노정되었다(고용노동부 한국직업능력개발원, 2011). 이는 그동안 훈련기관에 기관별 과정별로 사전 승인된 훈련인원(훈련물량)을 배분하는 방식인 물량배정방식의 문제점이라고 볼 수 있다. 특히 훈련기관 평가등급과 직종별 승인비율에 따라 기관별로 훈련물량을 배정하는 물량배정방식은 특정 훈련기관이 훈련실시능력이 있음에도 불구하고 정부에서 배정한 훈련물량만 실시하는 모순이 있었다. 이에 2008년부터는 물량배정방식의 단점을 해소하는 차원에서 직업능력개발계좌제를 단계적으로 도입하였다. 현재에는 신규 및 전직 실업자훈련은 물론 비정규직근로자, 중소기업근로자 등 재직자훈련에도 적용하고 있다.