신선식품, 낙농품, 화훼·채소, 과일, 곡물·곡분, 수산물에는 완전생산기준 등은 엄격한 기준을 적용하고 가공식품, 소시지, 초콜릿, 인스턴트 커피, 과채류 조제품, 조제·가공 수산물에는 기준을 완화했다.
그리고 우리나라의 취약부문인 농수산물은 신선농산물(1~14류)은 국내생산 보호를 위해 엄격한 기준설정, 가공식품(15~24류)은 수출 가능성을 고려하여 완화된 기준으로 합의되었다. 낙농품, 화훼·채소류, 과일, 곡물·곡분 등은 국산 재료를 이용하는 경우에만 특혜관세를 적용 받도록 가장 강화된 원산지기준인 완전생산기준(WO)으로 설정하였다. 반면 소시지, 초콜릿, 인스턴트 커피, 과채류 조제품 등은 수입산 재료를 사용할 수 있도록 원산지 기준을 완화하여 가공산업의 수출 경쟁력을 제고토록 하였다. 수산물의 경우 어류·갑각류·연체동물 등 연근해 어획 수산물에는 가장 보수적인 완전생산 기준을 적용하여 우회수입을 방지하는 한편 마찬가지로 우리의 수출가능성이 있는 조제·가공 수산물에 대해서는 보다 완화된 원산지 규정을 적용하고 있다.