OECS는 채점자 수와 아이디를 입력하면 문항별로 각 채점자가 채점할 PDF 파일을 생성된다. 채점자에게 제공된 PDF 파일 중 하나의 PDF 파일에는 한 문항에 대한 여러 답안이 있어 채점은 문항 단위로 이루어졌다.
OECS는 채점자 수와 아이디를 입력하면 문항별로 각 채점자가 채점할 PDF 파일을 생성하는데, 이때 하나의 PDF 파일에는 한 문항에 대한 여러 학생의 답안이 순서대로 포함되어있다. 채점 당일에 채점 기획위원은 채점자에게 채점할 PDF 파일들을 제공했는데, 과학채점자는 96개, 읽기 채점자 42개, 수학 채점자 18개의 PDF 파일을 채점하였다. 채점은 별도의 프로그램 설치 없이도 PDF 파일에 직접 채점 코드를 입력할 수 있으며, 각 문항별로 PDF 파일이 한 개씩 생성되었기 때문에 채점 연수도 문항 단위로 이루어졌다. 컴퓨터 기반평가 채점은 <표 Ⅲ-1-8>의 지필평가 일정을 고려하여 <표 Ⅲ-1-14>에서와 같이 과학은 채점 1∼6일차에 6일간, 읽기는 1∼3일차에 3일간, 수학은 3∼5일차에 3일간 채점하였다.