개별 단백질은 아미노산 서열에 의해 결정되는 고유의 입체구조를 가지고 특정한 기능을 갖게 되므로 아미노선 서열 하나만 달라도 단백질 기능에 영향을 준다. 따라서 단백질 및 유전자 유사체가 상동성을 가지고 있어 동일한 기능을 갖는다는 구체적 근거가 발명의 설명에 제시되어야 한다. 그러나, 위 단백질 유사체들이 기본 서열의 단백질과 동일한 기능을 보유한다는 근거가 출원발명 명세서에 기재되어 있지 않다.
개별 단백질은 아미노산 서열에 의하여 결정되는 고유의 입체구조를 가지고 있고 그 입체구조에 의하여 특정한 기능을 갖게 되므로, 아미노산 서열이 하나만 달라져도 그 아미노산이 단백질 입체구조 중 기능부위에 해당하면 단백질의 기능에 영향을 주게 된다. 따라서 일차원적인 서열정보만으로 단백질의 기능을 예측할 수 없고, 공지된 단백질의 아미노산 서열에 대하여 상동성을 가지는 단백질이라 하더라도 단백질의 상이한 입체구조로 인하여 전혀 다른 생체 내 활성을 보일 수 있으며 유사한 서열 상동성을 가진 유전자군이 서로 다른 기능을 가질 수도 있으므로, TFP2, TFP4 단백질 및 유전자 유사체가 서열의 상동성이 높다는 것만으로 기본서열의 단백질 및 유전자와 동일한 기능을 갖는 것으로 볼 수 없다. 그렇다면, TFP2, TFP4 단백질 및 유전자 유사체에 대하여 단순히 서열번호 3, 7과 90~99.99%의 상동성을 갖는다고 청구항에 기재하는 것만으로는 부족하고, 유사체들의 서열이 기본서열과 위와 같은 정도의 상동성을 가지고 있으면 기본서열의 단백질과 동일한 기능을 갖게 된다는 점에 대한 구체적 근거가 발명의 상세한 설명에 제시되어야 한다. 그런데, 앞서 본 바와 같이 TFP2, TFP4 단백질 및 유전자 유사체에 대하여 발명의 상세한 설명에 구체적 실시예가 제시되어 있지 않고, 달리 이 사건 출원발명의 명세서 중 발명의 상세한 설명에 위 단백질 유사체들이 기본서열의 단백질과 동일한 기능을 보유한다는 구체적 근거도 기재되어 있지 않다.