기존의 이주노동자 문제는 응급의료와 관련된 권리, 예방 차원의 지원 등 비교적 쉬운 문제를 가지고 있었으나, 현대의 이주노동자 문제는 더욱 복잡한 양상을 띄고 있다. 예를들어 외국인 근로자에 대한 건강보험과 고용허가에 대한 문제와 이에따른 의료사각지대문제 등이 새로운 이슈로 떠오르고 있다.
예전의 이주노동자 의료문제는 다수의 미등록 이주노동자가 의료사각지대에 있는 것을 해결하기 위해 응급의료에 관한 권리 보장, 예방 차원의 지원 및 민간의 의료공제회를 통한 지원 등 비교적 단순했었다면 현재는 조금 더 복잡한 양상을 보이고 있다. 먼저 국민건강보험과 관련 현 외국인근로자 고용허가제에 따르면 “「출입국관리법」에 따라 외국인 등록을 한 비전문취업(E-9) 또는 방문취업(H-2) 체류자격을 가진 외국인근로자는 「국민건강보험법」의 적용을 받는 직장가입자입니다(「국민건강보험법」 제109조제2항, 「국민건강보험법 시행령」 제76조제1항 및 「외국인근로자의 고용 등에 관한 법률」 제14조). 따라서 사용자는 해당 외국인근로자를 고용한 날부터 14일 이내에 해당 외국인근로자의 직장가입자 자격 취득 사실을 국민건강보험공단에 신고해야 합니다(「국민건강보험법」 제8조제2항)”라고 규정하고 있다. 그러나 이는 당연적용일 뿐 강제 의무사항이 아니라서 사업주의 건강보험 가입의무 불이행에 대한 제재나 처벌은 없다. 합법체류자격을 가진 이주노동자들에게 사업주가 건강보험 가입을 통한 건강관리의 책임을 방기하는 것은 사전 예방이 가능한 질병들을 방치하는 것과 마찬가지일 것이다. 또한 직장 가입대상자가 아닌 지역보험가입 대상자의 경우 입국 후 90일 경과 규정 때문에 보험에 가입하고 싶어도 할 수 없고 그 사이 의료문제가 발생하면 결국 민간단체에 도움을 호소하는 경우가 많아 새로운 의료사각지대로 나타나고 있다.