연구소별 과학자문회의는 기관장에게 기관의 활동에 관한 전망이나 조언을 하고, 각 연구분과는 연구활동을 평가하고 채용/연구현황/미래전망 분석도 관여한다. 또한 다학제 연구관리위원회가 연구관리 업무를 수행하는 인력들의 평가를 담당한다.
CoNRS의 과학자문회의(CS)는 자문기구와 협력하여 CNRS의 정책의 일관성을지키는 역할을 수행한다. 또한 CNRS의 과학정책 지침, 연구 품질 및 연구자의 활동을 평가하는 원칙, 연구소 프로그램 개설과 종료, 연구소 예산과 인력, 프로그램분배 방법, 전략계획 및 프랑스 정부와 CNRS 간의 다년도 계약과 관련한 내용을 다룬다. 또한 연구소별 과학자문회의(CSI)는 기관장에게 기관의 과제나 활동에 관련한 전망이나 조언을 제시하는 등의 역할을 수행한다. 각 연구분과(Section)는 연구 활동과 가장 밀접한 관련을 맺고 있으며 연구자들의 연구 활동을 평가하고 연구자의 커리어에 대한 조언을 하는 역할을 하고 채용관련 업무, 연구현황과 미래 전망분석 등에도 관여한다. 다학제위원회(CID)는 Section과 유사한 역할을 수행하는 위원회가 있으며, 또한 다학제 연구관리위원회가 연구관리 업무를 수행하는 인력들의 평가를 담당한다.