자유학기제의 전면 확대이후 성공적 정착을 위한 중장기 과제들은 차기 정부로까지 지속되기 위해 담보되어야 할 것이다.
다음으로 자유학기제의 전면 확대이후 성공적 정착을 위한 중장기(2016~ ) 주요 과제로는 1) 자유학기제에 맞는 대학입시제도 개혁, 2) 자유학기제 체험활동 지원체제 구축, 3) 학력 위주의 사회적 분위기 개선 캠페인, 4) 체험중심 수업을 위한 학급당 학생 수 감축, 5) 지필고사를 대체할 대안적 평가방식 개발 등을 들 수 있다. 이들은 자유학기제 정책이 차기 정부로까지 지속되기 위해 담보되어야 할 과제들이라고 할 수 있다. 아직까지도 교육계 일부에 존재하는 자유학기제 정책의 지속성 우려를 불식시키기 위해서라도 장기적 과제에 대한 구체적 대안을 마련해 나가야 할 것이다.