방과후돌봄서비스에 대한 관리감독의 책임이 있는 지자체가, 명확한 규정의 부재로 인해 적절한 조치를 취하지 못해 많은 아동과 부모가 피해를 받고 있다.
반면, 명확한 규정이 존재하지 않음으로 인해 지자체는 관리의 책임이 없다고 인지 하는 경우도 발생한다. 종일반 서비스는 저녁 7시까지 이용할 수 있도록 되어 있지만, 오후 5시에 아동을 데리고 가도록 압력을 행사하는 ‘무늬만 종일반’으로 운영하고 있 는 경우나 부모가 지자체에 호소해도 지자체가 이를 해결할 수 없는 경우가 많다(한겨 레 2016/7/3). 보다 특수한 욕구를 가지고 있는 경우에는 문제가 더 심각해진다. 예 컨대, 중증장애아동의 경우, 현재 정원에 여유가 있다하더라도 국공립 장애아동시설 에서조차 거부당하는 경우가 나타난다. 언론에 보도된 거동이 어려운 한 장애아동의 경우, 10여 차례 장애아동어린이집 입소를 거부당한 끝에 부모가 개인비용을 들여 별 도로 활동보조인을 쓰는 조건으로 병설유치원에 보낼 수 있었다. 이 경우, 관리감독 책임이 있는 지자체가 나서서 문제를 해결했어야 했지만, “법적 근거가 없다. 지도 점 검이 전부”라는 답변을 전했다고 보도되고 있다(한겨레 2014/12/8).