과세는 공급 주체에 따라 세목이 달라지지만, 부가가치세는 형태가 달라지지 않는다. 공급받는 자가 개인인  B2C, C2C거래는 세원파악이 어려워 과세되지 않을 가능성이 높아 대리납부 및 효율적 과세방법 파악에 포함되어야한다.
과세되는 경우에 공급주체가 법인이냐(B2C), 개인이냐(C2C)에 따라 과세되는 세목이 달라진다. 즉 법인이 되는 경우에는 법인세가 과세되고, 개인이 되는 경우에는 소득세가 과세된다. 부가가치세는 수입하여 과세될 경우 공급자나 공급받는 자가법인이냐, 또는 개인이냐에 따라 과세형태가 달라지지는 않는다. 실물상품을 수입하는 경우 세관장이 거래징수하면 되고, 용역수입이나 디지털 상품의 수입은 대리납부방법으로 공급받는 자가 거래징수하면 된다. 그러나 실무적으로 공급받는 자가 개인이 되는 B2C거래나 C2C거래의 경우에는 세원파악이 어렵기 때문에 과세되지 않을 가능성이 높아질 뿐이다. 따라서, 과세주체별 과세문제는 거래형태별 과세문제 중 고정사업장의 결정과 부가가치세 징수를 위한 대리납부 및 효율적인 과세방법의 파악에 포함되어 다루어질 수 있는 부분이다.