아카데미 협력 프로그램은 개발협력사업을 연구기관으로 협력 주체를 확대하여  추진하고 있다. 이 프로그램은 개발도상국의 개발기획역량 및 고등교육 역량 강화를 목적으로 한다.
이 중에서 국제개발협력 이해증진사업은 KOICA의 ODA 교육원에서 담당하며, 나머지 5개 사업은 민관협력실에서 총괄하고 있다. 특히 아카데미 협력 프로그램(Academy Partnership Program, APP)은 2013년까지 실시하였던 대학과의 파트너십을 통한 개발협력사업을 대학 외에도 연구기관을 협력 주체로 확대하여 2014년부터 새롭게 추진하고 있다(정유아, 2014). 이 프로그램은 민관협력 사업 중 교육분야에 한정하여 지원하는 사업으로 국내 대학의 고등교육 역량과 연구기관의 국제개발 전문성을 활용하여 개발도상국의 개발기획역량 및 고등교육 역량 강화를 목적으로 한다.