불교부단체일수록 자체노력이 부진할 수 있으나 현 제도에서는 개선 방법이 없다. 자치구의 경우도 보통교부세 대상이 아니므로 유사한 문제가 발생할 수 있다. 
둘째, 앞에서의 당연한 결과로 불교부단체일수록 상대적으로 자체노력(특히 세입자체노력)을 게을리 하는 경향이 있으나, 현 제도 하에서는 이를 개선할 방법이 별로 없다. 자치구의 경우도 보통교부세 교부대상이 아니므로 동일한 문제가 발생할 수 있다. 자치구의 경우 조정교부금 배분 시 인센티브 제도를 적극적으로 도입하면 되지만 이는 특ㆍ광역시의 조례를 개정해야 하는 사항이기 때문에 중앙정부가 이를 권장할 수는 있겠지만 그 이상 개입하는 데에는 무리가 있을 것으로 생각된다. 교부 단체인 시에 대해 부동산교부세 배분 시 인센티브만큼 조정 배분하는 방안도 생각해 볼 수 있으나 기존의 교부단체들에게 돌아갈 금액 합계가 줄어들기 때문에(인센티브가 지급될 경우) 이에 반대할 가능성이 크다.