거래비용 이론을 공공갈등 측면에서 고려해 보면 고도화된 사회에 따른 거래비용 증가로 이해할 수 있고, 이러한 맥락에서 정부와 주민 간의 거래비용 이론 적용이 가능할 것으로 생각된다.
거래비용 이론을 공공갈등의 측면에서 고려해본다면, 최근 갈등의 해소가 어려워지고 장기화되는 이유에 대해 고도화된 사회에 따른 거래비용의 증가로 이해할 수 있다. 이러한 맥락에서 정부와 주민 간 발생한 공공갈등에서 거래비용 이론에 대한 적용이 가능할 것으로 생각된다. 본 연구의 대상이라 할 수 있는 비선호시설의 입지는 정부와 주민을 중심으로 한 이해당사자들이 협상을 통해 정책을 수용하느냐 또는 반대하느냐에 대한 협상의 문제로 치환하여 이해할 수 있기 때문이다. 즉, 정부와 주민 간의 공공갈등은 정부가 추진하는 정책에 대한 주민의 정책수용성으로 이해할 수 있으며, 이러한 정책수용성의 문제는 결국 정책을 성공적으로 집행하기 위한 갈등당사자간 거래비용을 줄이는 것이 중요한 문제가 되기 때문이다.