항공정보포털시스템은 항공 관련 정형 데이터는 잘 관리되는 반면 비정형의 경우 마땅한 기준도 없고 분석도 어려운 한계가 있다. 따라서 데이터 정리 기준을 마련해야 한다.
현재 항공정보포털시스템에서는 항공 수송 실적(여객, 화물), 국내 및 국제선 노선별 실적, 공항별 결항 및 지연 데이터, 매 월 항공 교통량 데이터 등 다양한 통계 데이터가 존재한다. 그러나 항공 관련 정형 데이터가 기준별로 누적되어 관리되고 있는 반면 비정형 텍스트 데이터인 항공사고조사보고서, 항공안전장애보고 사례 데이터는 뚜렷한 기준이 정립되어 있지 않아 분석에 적용하기 어려운 한계점이 있다. 따라서 향후 지속적인 데이터 분석과 관리를 위해서는 데이터 축적을 위한 체계적인 분류 기준을 정립하고 그에 맞춰 일관적인 데이터 관리를 하는 것이 필요하다.