남한에서 상업화, 재배중인 유전자 변형작물은 없으며, 연구개발 중인 유전자변형생물체 중 벼의 비중이 높다. 농촌진흥청 등에서 개발한 작물은 많으나 산업화 이전 단계에 머물러 있고, 어류, 나무, 곤충 분야 역시 연구 중이다. 현재 생산이 활발한 유전자변형동물은 실험용 쥐다.
현재 남한에서 상업화에 성공했거나 재배되고 있는 유전자 변형작물은 없다. 2013년 말까지 승인된 남한의 유전자변형생물체 연구개발은 총 993건이다. 이 중 벼의 연구가 비중이 높다. 농촌진흥청이 2012년 현재 17작물 133종의 유전자 변형작물을 개발하는 등 연구기관, 대학, 바이오기업 등이 개발한 유전자 변형작물은 많이 있지만 상업화를 위해서는 많은 자본과 설비가 필요하므로 아직까지는 개발 단계에 멈춰있다. 그 밖에 유전자 변형 어류나 유전자 변형 나무 등도 조금씩 연구 중이다. 유전자 변형 곤충 분야에서는 2009년부터 농촌진흥청 잠사양봉소재과가 독자적인 누에 형질전환 원천기술을 개발하였는데, 녹색 형광실크를 생산하게 하여 고부가가치 상품을 생산하는 것이 목표이다. 국내에서 생산이 활발한 유전자변형생물체는 유전자 변형동물 중 실험용 쥐의 개발이다. 1987년 사람의 성장호르몬이 함유된 유전자 변형 생쥐가 한국생명공학연구원의 이경광 박사팀에 의해 개발된 이래 여러 연구기관들과 대학교 등에서 생산되고 있다.