시간선택제 교사는 전일제 교사와 업무는 동일하되 담임업무만 맡지 않을 뿐으로 교사의 모든 업무를 수행할 권한과 책임을 인정 해야 하나 실제 업무 분장은 개별 학교의 몫이다.
시간선택제 교사제도에 관한 정부의 시안을 보면, 시간선택제 교사라 할지라도 전일제 교사가 담당하는 것과 같은 업무를 동일하게 담당하는 것으로 계획되어 있다. 다만, 담임업무를 시간선택제 교사에게 맡기지 않는다는 점을 추후에 보완한 것이 다를 뿐, 수업과 학생지도와 상담 및 행정 업무 등을 모두 담당하게 되어 있다는 점에서 전일제 교사와 다른 점이 없다. 시간선택제 교사도 교사인 이상 교사가 담당할 수 있는 업무는 무엇이든 수행할 수 있는 권한과 책임이 있다고 인정해야 할 것이다. 그러나 교사들에 대한 업무의 분장을 어떻게 할 것인지를 실제로 정하는 것은 개별 학교의 몫이다.