비R&D 성격이 명확한 학부  인력 양성, 교육 시설 인프라 구축 등은 보편적 교육 환경 개선 및 대학 특성화 등을 중심으로 평가하도록 설정하고, R&D 사업의 경우 수월성, 질적 평가 위주로 선정하는 등 R&D와 HRD 사업의 성격 및 수행 주체를 구별하는 기준 마련이 필요하다.
대학R&D 사업으로 분류되는 R&D사업과 HRD 중심의 비R&D사업 간의 유사중복 기준의 마련이 필요하다. 대학 및 학과 특성화를 유도하는 사업은 비R&D성이 강하므로 일부 R&D 활동이 포함된다 하더라도 그 내용은 대학의 고유 기능의 범위에서 이루어지는 것으로 볼 수 있다. 따라서 논문, 특허 등의 연구 성과물이 본 사업의 직접적인 성과물로 보기 힘들며, 본 사업이 아니어도 대학의 고유 기능을 수행하며 상당 부분 창출되었으리라 예상되는 성과이다. 고등교육재정지원사업은 순수 인력양성 기능만 부여하여 비R&D 사업으로서의 성격을 더욱 명확히 할 수 있다. 학부 인력 양성 (인턴십, 산업체 맞춤형 교육), 교육 시설 및 인프라 구축 등은 HRD 중심의비R&D 성격이 명확하며, 특히 이에 해당하는 사업은 R&D사업의 선정 과정에서 이루어지는 연구의 수월성보다는 보편적인 교육 환경의 개선 및 대학 특성화 등을 중심으로 선정평가가 이루어지게 설정할 수 있다. 연구개발사업은 연구중심대학, 고등교육재정지원사업은 산학협력 및 교육중심대학을 집중 지원하는 등의 형태로 R&D와 HRD 사업의 성격 및 수행 주체를 구별하는 방법을 강구할 필요가 있는데, 연구개발사업의 선정평가에서 연구자의 우수성, 대학원생 및 연구장비 등 연구인프라 구축현황 등 수월성, 질적 평가 위주의 선정을 통해 R&D 사업의 특징을 부각시켜야 한다.