천연가스에서 수소 추출방식은 미세 먼지 배출은 적지만 이산화탄소를 배출할 수밖에 없는 방식이다. 이에 이 방식으로 통한 수소생산 확대는 이산화탄소 배출문제를 선행적으로 해결해야만 한다.
물론 천연가스 추출방식의 이산화탄소 배출량 자체가 석탄 등 다른 탄화수소를 활용하는 수소 추출방식에 비해서 문제가 되는 것은 아니다. 사실 천연가스 추출방식에서 이산화탄소 배출은 불가항력적으로 발생되지만, 미세먼지나 미세먼지 전구물질 배출 문제는 상대적으로 적은 것으로 알려져 있다(김재경, 2019a). 그럼에도 불구하고 수소 생산방식 중 유독 천연가스(메탄) 수소 추출방식이 이산화탄소 배출 문제의 중심에 있는 이유는 수소경제 활성화 로드맵 과 같이 천연가스추출방식으로 수소생산을 단기적으로 확대하는 정책을 추진하기 때문이라 할 수 있다. 결국 이러한 정책 추진을 위해서는 선행적으로 이러한 이산화탄소 배출문제도 함께 해결될 필요가 있다고 사료된다.