스마트워크를 추진하는 데에 있어 문제점으로 접근 용이성 저하, 조직구조의 유연성 부족, 참여의향이 없는 공무원 적합 직무에 대한 분석 및 정의 미흡, 구체적인 실행 가이드라인 및 관리지침 정비 미흡, 수직적/대면 중심 조직 문화가 선택되었다.
스마트워크를 추진하기 위한 정보시스템, 조직구조 및 운영체계, 법제도, 조직문화에서 인식하고 있는 문제점을 분석하였다. 스마트워크 추진과정에서 정보시스템 문제점으로 시스템 접근권 제한으로 인해 접근이 용이성 저하가 스마트워크 참여의사가 있는 공무원과 참여할 의사가 있는 공무원이 장애요인으로 선택한 비율이 높게 나타났다. 조직 구조 및 운영체계 항목에서 참여의사가 있는 공무원은 조직구조의 유연성 부족(33.3%)을 문제로 선택한 비율이 가장 높았으며 스마트워크 참여의향이 없는 공무원 적합 직무에 대한 분석 및 정의 미흡(30.9%)을 문제제기 하였다. 법제도 분야에서 구체적인 실행 가이드라인 및 관리지침 정비 미흡(조직 및 인사관리 규정 필요)을 스마트워크 참여 의향 여부와 관계없이 가장 높은 비율로 나타났다. 조직문화와 관계하여 스마트워크 참여 의향이 없는 공무원 25%가 수직적이며 관리 통제적인 조직 문화 존재를 장애요소로 선택했으며 스마트워크 참여의사가 있는 공무원은 대면 중심의 문화 존재(37.8%)를 선택하였다.