성별영향분석평가위원회는 성인지 관점과 제도에 대한 이해를 두루 갖추고 있는 전문가를 중심으로 구성되어 있으며, 대상과제를 선정하고 특정성별영향분석 평가를 심의하여 결과를 논의하는 역할을 한다. 대구광역시가 이를 설치해 운영한 적이 있다.
마지막으로 성별영향분석평가위원회에서 최종적으로 대상과제를 선정한다. 대구광역시는 2012년부터 성별영향분석평가위원회를 설치해 운영하고 있는데, 이 위원회는 전문가(컨설턴트)를 중심으로 구성되어 있다. 이처럼 전문가 중심으로 위원회를 운영하는 이유는 성인지 관점뿐 아니라 성별영향분석평가제도에 대한 이해가 있어야 대상과제를 심의하는 역할을 실제로 할 수 있기 때문이다. 현재 성별영향분석평가위원회에서 컨설턴트로 활동하고 있는 위원은 6명이고, 성인지 전문가를 포함하고 있다. 2012년에 는 성별영향분석평가위원회의 위원들을 개별적으로 섭외해서 위촉했지만, 2년의 임기가 끝난 후인 2015년에는 공개모집을 통해 위원을 선정하였다. 성별영향분석평가위원회의 역할은 대상과제를 선정하고 특정성별영향분석 평가를 심의하여 결과를 논의하는 것이다. 대구광역시는 2016년 처음으로 ‘여성친화생활권 공원 조성을 위한 특정성별영향분석평가’를 실시했으며, 과제 공모를 통해 성별영향분석평가위원회에서 특정성별영향분석평가 과제를 선정하였다.