종합,특정감사와 달리 복무감사는 직원 개인의 복무규율 위반, 비위에 중점을 둔다. 수시점검은 사전통보 없이 불시점검으로 이루어지며, 복무감사는 특별감찰을 실시한다.
복무감사는 자체감사 대상기관에 속한 사람의 복무 위반, 비위 사실, 근무실태 점검 등을 목적으로 실시하는 감사로, 종합감사․특정감사 등이 주로 업무 처리의 적정성과 타당성을 규명하는 데 비하여 복무감사는 업무와 관련되거나 해당 기관 직원 신분으로서의 품위손상 등 직원 개인의 복무규율 위반이나 비위에 중점을 두고 감사하는 데 그 특성이 있다. 복무감사형태 중 수시점검은 감사계획을 사전에 통보하는 정기점검과 달리 감사의 실효성 확보를 위해 불시점검 형식으로 이루어짐에 따라 감사대상 기관에 대한 사전감사계획의 통보를 생략할 수 있다. 복무감사는 근무시간 준수, 보안 유지 점검 등의 유지태세를 확인하고, 관행적 부조리 실태를 확인, 공직기강을 확립하고, 비위 사실을 사전에 예방하기 위한 예방 활동으로 특별감찰을 실시한다(감사원, 2012b).