기관의 R&D사업 평가에서 평가단은 외부 전문가로 구성되므로 내부직원들의 전문성은 어떤 외부 전문가로 평가단을 구성하는가 여부에만 반영될 뿐이다. 따라서 내부 직원의 분야별 전문성을 어떻게 키울지에 대한 기본 계획이 필요하다.
두 번째 세부지표인 체계적인 인적자원 프로그램 개발/운영은 내부 직원들을 대상으로 한 직무교육 및 전문성 교육과 관련된 내용이다. 모든 조직은 일반적으로 내부 직원에 대한 재교육을 위해서 다양한 노력을 한다. 따라서 내부 직원에 대한 재교육의 초점을 어디에 둘지 여부가 중요한 이슈이다. 기관의 업무본질상 정부의 R&D 자원을 배분하는 입장에서 전문성, 투명성, 공정성 등이 요구된다. 그런데 기관의 경우 R&D사업 평가과정에서 외부 전문가로 구성된 평가단을 구성하므로 실질적인 대부분의 전문성을 외부 조달(outsourcing)하는 형태를 취하고 있다. 즉 평가단 구성에 있어서 기관의 내부직원은 직접적으로 평가단에 포함되지 않고 기관 내부직원들은 직간접적 보조적(supporting) 역할을 하는 것이 일반적이다. 따라서 기관의 내부직원들의 전문성은 평가단을 구성할 때 어떠한 외부 전문가 풀(pool)을 구성하는가 여부에만 반영될 뿐이다. 내부 직원의 재교육에 있어서 어떠한 수준의 전문성을 목표로 하여 내부 교육 프로그램 개발 또는 외부 전문 교육기관에 위탁 교육 여부 등 내부 직원의 분야별 전문성을 어떻게 배양해야 할지에 대한 마스터 플랜이 필요할 것으로 판단된다.