초등돌봄교실은 오후 돌봄과 저녁 돌봄으로 운영되는데, 오후 돌봄에 대해 학부모는 개인 활동 시간을 만족스러워했으며, 단체 프로그램은 1개 정도면 된다는 의견이 많았으나 확대를 원하는 경우도 있었다. 교육부는 초등돌봄교실을 더욱 알차게 운영하고자 노력하고 있다.
초등돌봄교실은 오후 돌봄과 저녁 돌봄으로 운영하고 있으며, 오후 돌봄에서는 단체활동 프로그램(예체능, 놀이·체험학습, 교과학습 등)과 개인활동(숙제하기, 독서, EBS 시청 등) 및 간식 등이 제공된다. 저녁 돌봄에서는 간단한 운동과 휴식활동, 개인활동, 저녁식사 등으로 운영된다. 특히 오후 돌봄에서는 매일 1개 이상의 단체 프로그램을 운영함으로써 학생들이 즐겁게 돌봄교실에서 활동할 수 있도록 하고 있다. 현장 의견수렴 시 나타난 학부모의 의견은 돌봄교실에서 학생들이 가정과 같이 편안한 휴식과 더불어 숙제와 독서 등을 할 수 있는 개인 활동에 만족감을 나타냈으며, 1개 정도의 단체 프로그램 운영이 적정하다는 의견이 많았으나 수익자 부담을 통해서라도 프로그램을 확대해 달라는 요구도 있었다. 교육부는 초등돌봄교실에 대한 수요 충족과 더불어 만족도 높은 돌봄 서비스를 제공하기 위해 초등돌봄교실의 운영 여건을 개선하고 각기 특색있게 운영되는 지역 돌봄 서비스 기관 간의 연계 협력을 강화하기 위해 노력하고 있다. 앞으로도 돌봄이 필요한 학생들에게 질 높고 안전한 초등 방과후 돌봄 서비스 제공을 위해 다음과 같이 노력할 계획이다.