교과교실제가 확산되려면 교육시설환경 등을 마련하고 실정에 맞게 탄력적으로 적용하여 성과 등을 높여야 한다. 이를 위해 현장의 운영 능력 제고와 정책의 변화가 필요하다.
셋째, 교과교실제 운영 모형을 재정비하고, 현장 중심의 탄력적 운영 가능성을 타진할 필요가 있다. 즉, 교과교실제가 지속되고 확산 가능하기 위해서는 학교급별 및 학교 특성에 적합한 다양한 교육시설환경, 교육과정 및 교수·학습방법, 학교운영 모형 등을 마련하고 시·도교육청과 단위학교에서 여건과 실정에 맞게 탄력적으로 적용함으로써 교육현장의 성과와 만족도를 제고할 수 있도록 할 필요가 있다. 특히, 현장 중심의 탄력적 운영이 성공적으로 이루어지고, 자율성이 보다 확대되기 위해서는 시·도교육청과 단위학교의 교과교실제 운영 능력 및 책무성이 제고되고, 교육현장 주도 정책으로 변화해 나가야 할 것이다.