정부혁신의 이론적 논의는 추상적이라는 한계로 정책 분야별, 단위별로 구체화되어 논의중이기 때문에 정부 간 혁신의 차이가 크다. 하지만 공공감사제도의 경우 정부혁신의 틀 안에서 이루어진 것이기 때문에 정부혁신의 변화와 관련이 있으므로 정부혁신과 공공감사제도의 연계 분석을 하고자 한다.
초기 정부혁신과 관련한 논의들은 미국의 신공공관리론(NPM), 신거버넌스(New governance)이론 등에서 착안하여 시작되었다. 그러나 정부혁신에 대한 정의를 다룬 이론적 추세는 추상적인 개념으로, 정부혁신에 대한 방향성을 논의하는 데 초점을 둘 뿐, 정부혁신에 대한 구체적인 측정이나 평가를 위한 세부적인 내용을 규정하는 데 한계가 있었다. 이에 따라서 정부 혁신은 정책 분야별, 대상 단위별로 분권화, 투명성, 책임성, 경쟁, 성과, 고객지향, 참여, 효율성 등으로 구체화되어 다양하게 논의되고 있다. 따라서 정부(정권) 간 혁신의 내용과 의미는 상당한 차이가 있다. 물론 본 연구에서 초점을 두고 있는 공공감사제도의 변화는 정부혁신의 변화와는 다소 분석 범주(수준)에서 차이가 있다. 그럼에도 불구하고, 각 정권마다 공공감사제도가 정부혁신의 큰 틀 안에서 이루어져 왔기 때문에, 간접적으로 정부혁신의 큰 방향과 틀은 공공감사제도의 변화와 맥락적으로 많은 관련성이 있다. 따라서 이러한 점을 고려하여 본고에서는 정부혁신은 각 정권별로 국정운영의 개혁 및 변화내용의 방향에 초점을 두고 공공감사제도와 연계하여 분석하고자 한다.