오바마 정부는 생물무기금지협약의 검증 의정서 제정에 대한 논의가 재개된다 하더라도 의정서가 국제 안보에 도움이 될 수 있을지 알 수 없으며 협약의 투명성을 높이기 위해 여러 국가들의 신뢰를 높여야 한다고 주장했다. 또한 미국은 협약에 대한 내용을 추가 제시했다.
지금의 오바마 정부 역시 생물무기금지협약의 검증 의정서 제정을 위한 논의가 재개되지 않기를 바라고 있다. 지난 2009년 12월 군축 및 국제안보 차관보 엘렌 타우셔(Ellen Tauscher)에 따르면, 검증 의정서 제정이 빠르게 발전하는 생물무기 위협에 효과적으로 대응할 수 없다는 점을 언급하였다. 그리고 비록 법적 구속력이 있는 검증 의정서라 할지라도 검증 의정서 제정이 국제안보에 기여할 수 있을지 의문스럽다고 말한 바 있다. 미국의 이와 같은 회의적 입장은 2011년 클린턴 전 국무장관이 제 7차 평가회의에 참석하여 다시 한 번 언급한 바 있다. 또한 그는 검증 의정서 제정보다 본 협약의 투명성 제고를 위해 당사국 양자 간 혹은 다자 간 신뢰구축 조치를 활성화해야 한다고 주장했다. 당시 미국은 이러한 측면에서 1) 협약 가입의 보편화(universality), 2) 협의(consultation)를 통한 투명성 제고 및 당사국 협약준수 강화, 3) 회기 간 절차(intersessional process) 강화 및 활성화, 4) 자연발생적 질병 발생을 포함한 전염병 감시 및 대응에 대한 국가 역량 강화, 5) 생물테러리즘에 대응하기 위한 국내적 차원의 조치 및 수단 강화를 제시했다.