부처는 재정사업 활동 종료 후 성과보고서를 작성한 후 국회에 제출해야한다. 성과보고서는 성과계획서의 목표 및 비전 등은 동일하게 작성하되, 성과달성률이나 미달성원인 등은 분석하여 결과를 제시하여야 한다.
또한 부처는 재정사업의 활동을 종료한 후 성과보고서를 작성한 후 ｢국가회계법｣ 제14조와 제15조에 따라 결산 첨부서류로 국회에 제출하여야 한다. 성과보고서란 성과계획서에서 목표한 바를 어느 정도 달성하였는지를 계획 대비 실적의 형식으로 점검하는 결과보고서를 말한다. 성과보고서의 경우 ｢국가회계법｣ 제15조에서 성과계획서 작성 시 설정된 성과목표와 그에 대한 실적을 대비하여 작성하도록 하고 있는 바, 성과계획서에 제시된 임무, 비전, 전략목표, 프로그램목표 및 그 주요 내용들에 대해서는 성과계획서와 동일하게 작성해야 한다. 그리고 추가적으로 성과지표에 대한 실적 및 성과달성률을 산정하도록 되어 있으며, 목표달성 기여도와 목표달성 과정 및 성과 미달성 원인 분석과 향후 성과이행 방안 등을 제시하도록 하고 있다.