NCS 학습모듈의 호용성 평가와 관련해 NCS에서 기인하는 문제점은 학습모듈에도 영향을 미치지만 NCS에 대한 평가보다는 NCS의 수행준거에 해당하는 학습모듈의 학습목표의 적절성에 대해서만 평가하기로 한다.
NCS 학습모듈의 개념, 특징, 활용 현황과 효용성 평가의 의미에 대한 분석을 토대로 NCS 학습모듈의 효용성 평가와 관련하여 다음과 같은 쟁점들을 도출하였다. 그리고 평가지표 개발을 위한 연구진 회의와 전문가 자문회의를 통해 쟁점사항들에 대한 방안을 도출하였다. 첫째, NCS 학습모듈 효용성 평가에 NCS에 대한 평가를 포함할 것인가? 학습모듈은 NCS와 정합성을 갖고 개발되기 때문에 NCS에서 기인하는 문제점은 학습모듈에도 영항을 미치게 된다. 그렇지만 NCS에 대한 평가는 본 연구의 범위를 넘어서는 것으로 판단하였다. 따라서 NCS의 수행준거에 해당하는 학습모듈의 학습목표의 적절성에 대해서만 평가하기로 하였다. 그리고 평가문항 중에서 NCS의 영향을 직접적으로 받을 수 있는 문항은 점수화하지 않기로 하였다.