교육개발협력 연구 및 사업의 협업은 모든 주체가 참가하여 포괄적 공조관계를 만들어야 한다. 교육개발협력 연구 및 사업의 연결체계는 허브 역할을 담당하는 기관이 다르기에 유기적 연계가 힘든 상황이다. 따라서 수행 경험이 적은 기관은 비슷한 기관과 협업을 하고 경험이 많은 기관은 타 분야의 연계를 지원하는 방식을 추진할 필요가 있다. 
교육개발협력 연구･사업의 협업은 국내의 모든 주체들이 참여하여 지식 생산의 허브 역할을 수행할 수 있는 포괄적인 공조관계 구축을 지향해야 한다. 앞에서 살펴보았듯이, 교육개발협력 연구･사업의 연결망은 지식의 생산과 활용에 있어서 중심적인 역할을 담당하는 기관이 다르며, 이로 인해 연구와 사업의 유기적인 연계가 어려운 실정이다. 또한 정책연구의 연결망 구조는 이종연횡형 내에 유유상종형의 하위집단이 공존하는 형태를 보인다. 특히 교육 관련 기관과 국제개발협력 관련 기관이 각각 유유상종형의 공동연구를 수행했다. 이처럼 교육개발협력 분야는 간학문적인 특성을 갖고 있음에도 불구하고, 교육계와 개발협력계의 협업이 어려운 구조적인 한계가 존재한다. 따라서 이러한 한계를 극복하기 위해서는 유유상종형의 공동연구에서 탈피하여 다른 분야의 연구자들과 협업할 필요가 있다. 그러나 유유상종형은 기관간의 유대관계도 강하고 연구의 수행이 원활하다는 장점이 있다는 점도 고려해야 한다. 그러므로 교육개발협력 연구･사업의 수행 경험이 부족한 기관은 비슷한 기관과의 협업을 강화하고, 경험이 풍부한 기관은 다른 분야와의 연계를 지원하는 형태로 협업을 추진한다. 이 과정에서 각 기관의 서로 다른 전문 영역을 유기적으로 연계시킬 수 있는 조정자의 역할이 중요하기 때문에, 교육개발협력의 연구전문성이 높은 기관에게 이러한 역할을 부여할 필요가 있다.