마을교육 협의회는 마을교육공동체를 확산하는데 목표를 두는 초기 과정을 거쳐 궁극적으로 지역의 교육력과 거버넌스 체제 향상을 목표로 활동하게 된다. 이를 위해 교육 주민자치와 지역교육 인프라를 정착시켜야 한다.
기존의 혁신교육협의회나 마을교육협의회 운영 사례를 보면 이들의 논의와 활동이 점차 진화하고 있음을 발견하게 된다. 초기 단계에서 마을교육 협의회는 마을교육공동체를 구축하고 확산하는데 그 목적을 두고 운영되는 경우가 대부분이다. 이를 위해 각 참여 주체들의 네트워크와 협력의 기반을 다지고, 사업 초기의 발전 방향과 방안을 제안하는 역할을 수행하게 된다. 또한 관련 사업을 유지하기 위한 재원과 행정적 지원을 체계화하는 데 중점을 둔다. 이러한 초기적 과정을 거쳐서 궁극적으로 마을교육 협의회는 지역사회 교육공동체의 지속가능성을 확보하고 지역의 교육력과 거버넌스 체제 향상을 목적으로 활동하게 된다. 이를 위해서는 지역사회의 참여와 책임을 강화한 교육 주민자치를 뿌리내리고 지역교육을 위한 인프라와 네트워크를 안착시켜야 한다.