제2차 여성정책기본계획에서는 성별영향분석평가를 실시하기 위해 핵심 과제 및 주요 과제, 그에 따른 세부 과제를 확립해 그 도입필요성을 중장기계획으로 포함, 성별영향분석평가는 추진력을 갖게 되었다.
둘째, 제2차 여성정책기본계획(‘03~‘07)에도 성별영향분석평가를 실시하기 위한 근거를 마련 하였다. 이 계획에서는 10대 핵심과제의 첫 번째 과제로 ‘정책에 양성평등 관점 통합’을 설정하고, 이를 위한 주요 과제로서‘여성정책 추진기구의 확대와 성 인지적 예산 수립’, ‘정책의 성별분석을 위한 기반조성’으로 하였다. 특히 후자의 세부 과제로서 ‘여성정책평가 및 정책의 성별분석제도 구축’, ‘성 인지적 통계 생산 및 보급’, ‘공무원의 성 인지적 정책형성 교육 훈련 활성화’ 등을 포함하였다(김양희 외, 2004b: 16-17). 이러한 세부 과제는 성별영향분석평가가 내실 있게 운영되기 위해서 반드시 필요한 요소이다. 성별영향분석평가의 도입필요성을 국가차원의 중장기계획에 과제로 포함함으로써 추진력을 갖게 되었다는 데 의미가 크다 하겠다.