도도부현 경찰에 있는 동경도 경시청과 도부현 경찰본부는 국가 공안위원회가 경시총감과 경찰본부장을 임면한다. 도도부현 지사는 경찰운영에 직접적인 지휘와 감독권한은 가지고 있지 않으며 경시총감 또는 경찰본부장이 경찰의 운영과 지휘권을 행사한다. 도부현 경찰은 경시청과 유사한 조직구도를 가지며 도도부현 경찰은 타경찰 관내라도 일정정도의 권한행사가 가능하고 공조수사를 위해 경찰청에 광역수사지도관과 관구경찰국에 광역조정부를 두고 있으며 광역수사를 위한 광역수사대가 있다.
도도부현 경찰에는 동경도 경시청과 도부현 경찰본부가 있다. 경시청에는 경시총감을 두되, 예외적으로 국가공안위원회가 동경도공안위원회의 동의를 얻어 내각총리대신의 승인을 받아 임면하고(제49조), 도부현 경찰본부에는 경찰본부장을 두되 경찰부부장은 공안위원회가 도부현 공안위원회의 동의를 얻어 임면한다(제50조). 도도부현 지사는 공 안위원회를 소할하에 두고 있을 뿐이므로, 경찰의 운영에 관하여 위원회를 직접지휘· 감독할 권한을 가지고 있지 않으나, 위원회의 위원 임면에 관한 권한(제39조 제1항)과,도도부현 경찰에 관한 조례안 및 예산안의 의회제출권 및 예산집행권(제149조), 경찰서 설치권(제156조 제1항)을 통해 관여할 수 있다. 도도부현 경찰의 장인 경시총감 또는 경찰본부장은 경찰의 운영 및 집행에 대해 지휘권을 행사하며, 경시이하 경찰관에 대한 임면권을 가지는데 다만, 이 경우 도도부현 공안위원회의 의견을 청취하여야 한다.(제 55조 제3항) 동경경시청에는 총무부, 경무부, 교통부, 경비부, 지역부, 공안부, 형사부, 생활안전부, 조직범죄대책부 등 9개의 부로 구성되었으며, 경시청 산하에는 경찰서 101 개소, 교번 941개소, 주재소가 251개소가 있으며, 약 42,000명의 경찰관이 근무 중이 다. 도부현 경찰은 지역의 특성에 따라, 부 및 지정현 경찰본부, 미지정현 경찰본부, 북 해도 경찰본부 등으로 구분되어 설치되며, 경시청과 유사한 조직구조를 가진다. 도도부 현 경찰간의 협력과 관련하여, 타경찰의 원조요구가 가능하며(제60조), 타경찰 관내라고 할지라도 일정정도까지는 권한행사가 가능하며(제60조의 2), 공조수사체제의 구축을 위 해, 경찰청에 광역수사지도관과 관구경찰국에 광역조정부를 두고 있으며, 인접한 도도부 현 경찰간 광역수사를 위해 광역수사대가 편성되어 있다.