원전 관련 기관, 정책 등에 대한 불신은 원전에 대한 수용성에 부정적인 영향을 미친다. 원전을 신뢰하지 않는 한 어떠한 과학적 분석도 큰 역할을 하지 못할 것이며 일방적 정책 진행은 국민 불신을 초래해 사회적 수용성이 감소할 것이다.
최근의 원전 기술이나 그 시설을 운영하는 기관 및 구성원, 그리고 정부정책에 대한 신뢰 부족은 원전에 대한 부정적 인식을 강화하며, 실제로 중앙정부는 물론 지방정부, 원전 사업자에 대한 국민들의 신뢰 수준은 원전 수용성에 부정적인 영향을 미치게 된다. 현재 우리 사회에서 보이는 원전에 대한 대중의 두려움과 반대는 ‘신뢰의 위기(crisis of confidence)’라고 표현할 수 있으며, 원전을 신뢰하지 않는 한 원전위험에 대한 어떤 과학적 접근이나 분석도 국민들의 두려움을 감소하는 데 큰 역할을 하지 못할 것이다. 더욱이 원전에 대한 정책과 그 정책을 실천하기 위한 원전 후보지의 선정 및 원전에 대한 운영 등의 여러 방안이 일방적이고 폐쇄적으로 진행된다면, 원전과 관련한 전반적인 정책에 대한 국민의 불신은 증대되고, 국민적 저항으로도 이어져 원전에 대한 사회적 수용성은 낮아질 것이다.