기초학력미달은 특정교과목을 포기하기에 할 수 있어 이를 개선하는 방안으로 개별화된  교육  프로그램 제공과 점검체계가 요구된다. 이 프로그램에는 원인과 학업목표 설정이 포함되고, 교수목표와 평가기준이 제시될 수 있다.
국어의 경우 기초학력미달 학생은 2007년 3.3%, 2010년 3.8%, 2013년 5.9%이고, 수학의 경우 2007년 8.3%, 2010년 8.9%, 2013년 10.2%이며, 영어의 경우 2007년 8.8%, 2010년 8.6%, 2013년 11.8%로 모든 교과에서 전체적으로 증가하는 경향이다. 기초학력 미달 효과는 학년이 올라갈수록 누적적으로 발생하여 어느 시기에 이르면 학생 스스로 특 정 교과목을 포기하는 선택에 이르게 한다. 기초학력에 미달하게 된 이유는 가벼운 학습 문제를 포함해 주의결핍과잉행동 등과 같은 학습장애까지 광범위할 수 있다. 따라서 기초 학력에  미달한  학생의  학력을  신장하기  위해  개별화된  교육  프로그램(individual education program)을 제공하고 이를 점검할 수 있는 체계가 요구된다(신종호 외, 2006 : 226). 이러한 프로그램에는 학생이 기초학력에 미달하게 된 원인과 현재의 학업수준에 기초해 학업목표를 설정하고, 이에 따라 교수목표 및 평가기준을 제시할 수 있다. 또한 기초학력미달의 원인과 교수목표에 따라 제공되어야 할 교육 서비스의 기간 및 책임자 등을 명문화하는 것도 포함될 수 있다.