누락된 기업의 비관 측 속성에 따라 상보적인 두 제도의 통계적 유의성이 떨어질 수 있다. 물론 이때 비관 측 속성이 단순히 누락된 것일 수도 있다. 어쨌든 패널 자료에서 기업의 비관 측 속성을 통제하고도 두 제도 사이에 상보성이 있다면 가장 바람직하다. 다만 상보성이 장기적일 경우, 상보성이 존재하지 않다고 말할 수 있다.
다만 누락 변수가 개별 기업의 비관 측 속성인 경우, 이를 통제하게 되면 오히려 상보적인 두 제도의 통계적 유의성을 떨어뜨릴 수 있다. 분석 대상이 기업인 경우 상보적이라고 기대되는 제도들이 결국 경영적 판단에 의해 동시에 결정되는 것이고, 경영적 판단 또는 CEO의 경영 스타일은 개별 기업의 비관 측 속성에 따라 대리되는 것이라면, 누락된 비관 측 속성에 따라 나머지 두 제도가 영향을 받더라도 이는 두 제도가 상보적이라고 말할 수 있는 것이다. 만약 패널 분석을 통해 개별 기업의 비관 측 속성이 통제될 경우 두 제도 간의 상보성 추정 계수 및 통계적 유의성은 상당히 떨어지게 될 것이다. 물론 개별 기업의 비관 측 속성이 상보적인 제도에 영향을 미치는 경영적 판단만을 대리하는 것이 아니고, 앞에서 언급한 단순히 누락된 제3의 요인일 수도 있다. 따라서 패널 자료의 경우 개별 기업의 비관 측 속성을 통제하고도 상보성이 관찰된다면 가장 바람직한 결과가 될 것이다. 다만, 패널 분석의 또 다른 문제로 시 불편(time invariant)의 개별 기업 비관 측 속성이 통제되므로 제도 간 상보성이 장기적으로 나타날 경우 상보성이 존재하지 않는 것으로 추정될 가능성 역시 있다.