혁신성 기반의 벤처기업은 외부의 자금조달에 있어 중소기업과 인식의 차이가 있지만, 여전히 어려운 것은 사실이다. 일례로 혁신역량이 뛰어난 벤처기업도 사업화 이후 시장 수요의 불확실성이 높다. 또한 자금 조달의 담보가 무형 자산이므로 프로젝트 실패시 투자자금의 회수가 어렵다.
물론 벤처기업과 중소기업 모두 외부로부터 자금을 조달함에 있어 정보의 비대칭성이 높은 영역인 것은 사실이다. 하지만 기술력 등 혁신성에 기반을 둔 벤처기업의 경우 사업의 성공 가능성, 필요한 자금의 규모 그리고 지출의 필요성 등에 대해 자금 공급을 담당하는 금융기관과 자금 수요처인 기업간 인식의 차이가 일반적인 중소기업에 비해 보다 크게 나타난다. 일례로 혁신역량이 뛰어난 벤처기업의 경우에도 기술을 개발하고 상품화를 통해 시장에 판매하는 일련의 과정 속에서 금융 시장이 평가하고 관리할 수 없는 수많은 불확실한 요소들이 산재해 있기 때문에 불확실성이 매우 높다. 즉 혁신성에 기반을 둔 벤처기업일지라도 기술 개발 및 사업화 단계 뿐만 아니라 사업화 이후에도 시장 수요의 불확실성이 높다는 특징이 있다. 이러한 사업 추진상의 위험 요인 뿐만 아니라 외부 자금 조달에 있어서도 기술, 특허 등 무형 자산에 기초할 수밖에 없는 경우가 빈번하기 때문에 유형 자산을 담보로 자금 공급이 이루어지는 경우와 달리 프로젝트가 실패하는 경우 투자자금의 회수가 매우 어려운 것이 특징이다.