어항 DB로 구축하려는 정보는 자료를 통합하거나 추가 정보를 생성할 경우 자료 간 시점이나 요약 수준 불일치 등의 문제가 발생할 수 있어 이를 미리 검토하여 보완해야 한다.
어항 DB로 구축하고자 하는 정보 유형들의 생성방식이나 관리체계의 차이는 개별적 자료 활용의 경우에는 사용상의 제약이 크지 않지만, 유형별 자료를 통합하여 분석하거나 이차적인 정보를 생성할 경우 자료의 요약 수준이나 내용상의 기간이 불일치할 경우에 문제가 될 가능성이 크다. 예를 들어 어항기초정보와 어업정보를 연계하여 서로의 상관관계를 파악하고자 할 경우, 연결 자료의 시점차이로 인하여 시계열적 분석 정보의 가치가 반감될 개연성이 크다. 따라서 자료 간 시점 혹은 요약 수준 불일치 등을 사전에 검토하여 DB 활용의 관점에서 필요할 경우 자료제공기관과 협의하여 보완해 나가야 한다.