NCS 학습모듈 전권에 대한 평가는 어떤 평가지표를 선택하는가에 따라 비용이 달라진다. 개발기관에 사전 공지하고 평가 이후 공표하는 절차가 필요하며 보안 유지가 중요하다.
현재까지 개발된 NCS 학습모듈 전권에 대한 평가를 실시하는 데에는 평가방식에 따라 대략 20억에서 33억원 가량이 소요될 것으로 예상하였다. 전체 예산은 평가지표를 간략버전과 상세버전 중에서 무엇을 선택하는가 그리고 평가방법을 오프라인 집체평가와 온라인평가 중에서 무엇을 선택하는가에 따라 달라진다. 이에 대한 선택은 평가를 실행하게 되는 시점에서의 상황에 적합한 결정을 내릴 수 있을 것이다. 학습모듈 효용성의 평가에 대해 개발기관에 사전에 공지하고 평가 이후에 이를 공표하며 이의제기와 이를 해결하는 절차도 필요하다. 마지막으로 평가과정 전반에 보안을 유지하는 것이 중요하다.