의료기기의 사용 위험성은 질환의 중증도를 기준으로 해야하는데 의료기기로 뇌파계를 잘못 측정하거나 판독할 경우 환자에게 감당할 수 없는 악영향이 초래되기 때문이다. 단순히 의료인의 측정결과의 판독만이 남았다고 하여 의료기기가 안전하다고 할 수 없다.
그러나 의료기기 사용의 위험성은 뇌파계의 위해도 등급이나 측정결과의 추출 과정, 의료기기 사용에 있어서 법적인 제한이 없다는 것을 기준으로 판단하여야 하는 것이 아니라, 의료기기를 사용하여 진단하게 되는 질환의 중증도를 기준 하여야 한다. 뇌질환의 경우 앞서 언급한 바와 같이 적절한 치료시기를 놓칠 경우 생명과 신체에 미치는 영향이 적지 않다는 점을 감안하여야 한다는 점을 감안할 때, 만약 한의사가 뇌파계의 측정결과에 대한 임상적 의미를 잘못 판독할 경우 발생하게 되는 환자에게는 감당할 수 없는 악결과를 야기할 수 있다. 이는 뇌파계가 뇌질환의 보조적 진단의 단서로 사용되든지 또는 주된 진단의 단서로 사용되든지 마찬가지라고 할 수 있는 바, 단순히 의료인의 측정결과의 판독만이 남아 있다고 하여 의료기기가 안전하다고 단언할 수 없는 것이다. 특히 한의사의 경우 의사와 달리 뇌질환을 진단함에 있어서 단독으로 MRI기기 등을 사용할 수 없는 등 다양한 의료기기를 사용할 수 없다는 한계가 있음을 감안한다면, 더더욱 그러하다.