후쿠시마 원전 사고 이후 원자력 행정의 일원화와 원자력 안전 확보를 위해 일본의 원자력 행정은 환경성 산하 원자력규제위원회가 맡고 있으며 원자력안전기반기구, 원자력연구개발기구를 담당하고 있다.
후쿠시마원전사고 이전 일본의 원자력 행정은 자원에너지청의 특별기관인 ‘원자력안전･보안원’과 내각부의 원자력안전위원회, 문부과학성의 원자력안전과 등에서 담당하였다. 그러나 후쿠시마 원전사고 이후 원자력 행정을 일원화하고 원자력 안전을 확보하기 위해 2012년 환경성 산하에 원자력규제위원회를 설치하고, 사무국으로 원자력규제청을 두고 있다. 원자력규제위원회가 담당하는 독립행정법인은 다음과 같다. 먼저 원자력안전기반기구(JNES)는 원자로 등 원자력 관련시설 검사, 원자로의 안전성 해석 및 평가, 원자력 재해 예방 등을 담당하는 법인이다. 원자력연구개발기구(JAEA)는 원자력 기초 및 응용연구, 핵연료주기 기술개발 등을 종합적으로 담당하는 독립행정법인으로, 2005년 일본원자력연구소(JAERI)와 핵연료주기개발기구(JNC)를 통합하여 설립되었다(이종영, 2010: 47).