친환경차 감세 및 보조금 지원 정책은 소비자 가격을 인위적으로 높게 유지하여 자동차산업의 생선성을 저해할 우려가 있다.
그러나 친환경차 지원은 자동차 시장의 가격구조를 왜곡하여 생산성을 저하하는 구조적인 문제점이 존재한다. 친환경차 지원 정책은 친환경차의 소비자 가격을 인위적으로 높게 유지하는 감세 및 보조금 정책이 그 주종을 이룬다. 따라서 장기적으로 친환경차 지원이 지속되면 생산성이 낮은 기업이 친환경차 시장에서 잔존하게 되어 자동차산업의 생산성을 저해시킬 우려가 있다. 또한 친환경차 지원 정책은 국내에서만 가격 지지 효과가 있으므로, 제도가 지속될 경우 친환경차 생산 기업들이 국제시장에 진출하여 시장을 확대하기보다 국내시장에 안주할 위험이 있다.