학교 전담 경찰관 도입을 위해서는 우선 학교 당국과 학교 전담 경찰관의 협약이 체결되어야 하며, 이에 관한 협의는 양자간의 협력위원회를 통해서 이루어져야 한다. 여기에서는 양자간의 활동 범위와 의무에 관한 상호 합의안을 마련해야 한다. 특히 공권력에 의한 교권과 학생 인권 침해 여지를 불식시키 위하여, 엄격한 보호 장치와 구체적인 매뉴얼도 필요하다.
학교당국과 학교전담경찰간의 협의된 사항을 명문화하고, 이를 실행하기 위해서는 협약이 체결되어야 한다. 협약체결을 위한 학교당국과 학교전담경찰과의 협의는 협력위원회를 통해서 이루어져야 한다. 양자간의 협의는 최초의 협약체결을 위한 학교전담경찰과 학교간의 협력위원회가 먼저 구성되어야 한다. 협약체결을 위한 협력위원회에서는 학교전담경찰관의 활동범위, 임무 등을 결정하고, 학교전담경찰의 활동에 대한 학교당국의 적극적 협력의 의무, 그리고 학생의 인권보호, 교사의 권한 보호 등에 대해서 상호 합의안을 마련해야 한다. 교권침해에 대한 갈등을 해결하기 위한 전제로서 학교전담경찰관과 학교간의 합의에 기초한 협약서를 작성하도록 의무화해야 한다. 학교전담경찰관과 학교간의 협약서에 학교전담경찰관의 활동범위, 임무 등을 명시함으로서 교사의 권한을 보호받도록 하는 것이 필요하다. 또한 협약서의 이행사항에 대해서 학교와 학교전담경찰이 엄격히 준수하도록 함으로서 교권침해의 여지를 없애야 한다. 한편, 학생에 대한 인권침해를 방지하기 위해서는 범죄적발 및 처리에 대한 절차를 명확히 하고, 이를 학생들에게 충분히 공지하여 이해하도록 함으로서 인권침해의 논란을 불식시켜나가야 한다. 범죄적발 및 처리에 대한 매뉴얼을 작성하여 이를 학생들에게 교육하여 이해를 도모하고, 학교전담경찰관도 이를 철저히 준수하도록 해야 한다.