남북한 제도통합기의 목표는 주거 취약계층을 안정적으로 지원하고 남북한 주거급여제도를 실질적으로 통합하기 위해 시스템 연동을 준비하는 단계이다.
셋째, 남북한 제도통합기(통일 이후 5~10년)의 주거급여 적용 목표는 ‘주거취약계층 에 대한 안정적 지원 및 남북한 주거급여제도의 실질적 통합 준비’이다. 이 시기는 남북 한 주거급여 시스템 연동을 위한 준비단계이다. 주거급여 전용계좌를 활용하여 집행되 는 이 시스템은 남북의 급여수준을 달리 설정하나, 북한 지역에 대해서도 소득통계를 바탕으로 한 중위소득 기준을 적용하도록 한다. 또한 남한 이주 북한 주민에 대해서는 기존에 적용되던 주거급여 특례 조항을 폐지하는 한편 주거급여 대상자 규모를 지속적 으로 축소하기 위한 노력도 계속되어야 한다. 덧붙여 이 시기부터는 남북간의 주택매매를 허용하도록 한다.