단순히 현행 정부조직체계를 북한지역으로 확장하는 행정통합이 이루어지면 안되는 데, 이는 여러 문제가 존재하기 때문이다.
그러나 행정통합이 단순히 현행 정부조직체계를 북한지역으로 확장하는 것에 그쳐서는 안 된다. 남한의 현 행정체제 또는 정부조직체계가 ‘완성된’, 혹은 ‘무결점’의 체계라고는 말할 수 없다. 오히려 남한에서는 새로운 행정부가 수립될 때마다 저마다의 방식으로 정부조직 개편을 단행하였으며, 그로 인해 행정의 연속성이 약해졌다는 지적도 받아왔다. 더구나 잦은 조직편성 변경으로 인해 장기적 관점에서의 정책 집행에 어려움이 따른 것 역시 사실이다. 또한 현재에도 크고 작은 수준에서의 정부조직 개편 필요성이 제기되고 있는 실정이다. 이는 모두 현재 한국의 행정체제 또는 정부조직체계에 크고 작은 문제가 있다는 증거이다.