과밀억제권역 중 기타 지역 안에 있는 벤처기업 집적시설에 첨단업종 공장이 아닌 공장을 설치할 수 있는지에 대해 규정하고 있지 않아 해석상 논란이 되고 있다.
「벤처기업 육성에 관한 특별 조치법」제21조제3항에서는 벤처기업 집적시설에 입주한 자는 다른 법률의 용도지역에 따른 건축제한에도 불구하고 구조안전에 지장이 없는 범위에서 도시형 공장을 설치할 수 있다고 규정하였으나, 「산업 집적활성화 및 공장 설립에 관한 법률」제20조제1항에서는 「수도권정비계획법」상 과밀억제권역·성장관리권역 및 자연보전권역에서는 공장건축면적 500제곱 미터 이상의 공장을 신설·증설 또는 이전하거나 업종을 변경하는 행위를 하지 못하도록 하고 있어, 과밀억제권역 중 기타 지역 안에 있는 벤처기업 집적시설에 첨단업종 공장이 아닌 공장을 설치할 수 있는지에 대해 규정하고 있지 않아 해석상 논란이 되고 있다.