일반적인 청년 대상 임금보조금은 기업지원으로 저소득빈곤층이 대상이며, 청년공제는 구직자 및 재직자 청년 개인지원으로 인력부족을 해결하기 위한 방안이다.
일반적으로 청년을 대상으로 하는 임금보조금은 주로 기업지원 방식으로 운영되는데, 간혹 개인지원 방식으로 도입된다 하더라도 그것의 지원대상은 근로장려세제(EITC)와 같이 저소득빈곤층이 되는 경우가 많다. 반면 개인지원 방식의 청년공제는 지원대상이 저소득빈곤층이 아닌 구직자 및 재직자 청년 일반으로 지원대상이 설정되었는데, 이는 국내에서 유독 높게 나타나는 대학진학률과 이에 따른 고학력자의 실업문제, 그리고 대-중견/중소기업 간 이중적 노동시장구조와 이에 따른 중견/중소기업의 인력부족을 해결하기 위한 방안으로 청년공제가 도입되었기 때문이다.