투입기능적 연계 측면에서 민간전문가를 중심으로 협상이 이루어져 청와대, 외교부의 가시적 역할을 찾아보기 힘들다. 그러나 외규장각 도서 반환문제는 외교적 협상력과 정치력이 필요했다. 의궤끼리의 맞교환 합의에 대한 비판이 거세다. 
둘째, 투입기능적 연계 측면에서 이해관계자는 청와대, 외교부를 들 수 있지만, 민간전문가 대표를 중심으로 협상이 이루어졌기 때문에 이들의 가시적인 역할은 찾아보기 힘들다. 다만, 정부가 협상 대표를 선정하는 과정에서 고려했어야 할 사항으로, 민간전문가 협상이라 하더라도 외규장각 도서 반환 문제는 외교적 협상력이 많이 요구된다는 점이다. 프랑스 국내법의 한계를 넘어서기 위해 필요한 것은 자질, 능력보다는 오히려 결정적인 순간의 정치력이었다(유복렬, 2013). 협상결과에 대해 이전의 정부 간 협상에서의 성과를 파악하지 못한 채 프랑스에게 유리한 의궤 끼리의 맞교환 방안에 합의했다는 점에서 비판이 많았다(이상찬, 2003). 정부는 프랑스의 협상방식 전환 제의에 대하여 이 문제를 정치적, 외교적, 국제주의적으로 해결하려는 의도가 있었음을 간파했어야 했다.