1990년대 후 사회적 변화로 공공갈등의 증가, 갈등양상의 복잡화, 지속기간의 장기화가 나타났다. 갈등의 장기화는 경제적 비용 외에도 다양한 문제가 포함된 사회적 비용을 증가기키며, 주변상황의 변화로 해소가 어려운 악순환이 발생한다. 이 문제는 비선호시설과 관련된 님비 현상의 사례에서 찾을 수 있다.
1990년대 이후 정치･경제의 민주화가 이루어지고 문화의 다양성이 확산되면서 다양한 이슈와 이해관계자가 등장하게 되었다. 이는 공공갈등의 증가는 물론, 갈등양상의 복잡화와 지속기간의 장기화라는 결과로 이어졌다. 갈등이 장기화 된다는 것은 비단 해결이 어렵다는 것뿐만아니라, 사회적 비용을 증가시킨다는 점에서 문제의 심각성이 있는데, 이 사회적 비용에는 경제적 비용 외에도 정부와 주민 간 소통의 단절로 인한 정부 신뢰 하락, 사회적 위기감 확산, 주민 간 반목으로 인한 지역 공동체 해체 등의 문제가 포함된다. 그리고 갈등이 오랜 기간 지속됨에 따라 주변 상황이 변화되어, 갈등이 확대･복잡해져 갈등 해소가 더욱 어렵게 되는 악순환이 발생할 수 있다. 이러한 공공갈등의 장기화 문제는 비선호시설과 관련된 갈등사례에서 쉽게 찾아볼 수 있다. 밀양 송전탑 설치(2002∼2013), 평택 미군기지 이전 (1990∼2007), 보령 복합화력발전소(1996∼2012), 서울 제2시립 화장장(2001∼2009) 등 님비(NIMBY)현상과 관련된 유형의 갈등들이 오랜 기간 지속되면서 국가적으로 많은 비용이 소모되었다.