아동청소년 사무와 학교 지원 업무에 있어 지역사회 자원을 연계하는 시스템이 필요해지고 있으나, 이를 종합적으로 수행할 구조가 미비한 상태이다. 지역사회 내에 통합적인 시스템을 만들어 마을교육공동체 사업을 추진하여야 한다.
기초자치단체에서 아동청소년 사무와 교육지원청의 학교 지원 업무 중에서 지역사회 자원을 연계해야 하는 업무가 계속 늘어나고 있다. 그러나 지자체와 협력하여 학교밖의 교육지원을 종합적으로 할 수 있는 구조가 불비한 것이 사실이다. 마을과 협력사업을 한다고 해도 명시적인 조직이 없는 것이 현실이라, 지역별로 행복교육지원센터(시흥시-교육지원청), 방과후교육지원센터(도봉구청), 자기주도학습지원센터(노원구청, 마을이 학교다), 교육통합지원센터(완주군 중간지원조직), 창의인재육성재단(오산시 재단) 등으로 다양한 명칭과 성격을 가지고 운영되고 있다. 이를 통합하여 지역에 하나의 <지역사회교육지원센터(가칭)>를 만들어 그 조직을 하나의 통일된 시스템으로 구축하고 관련 전담 인력들이 함께 공동 기획과 역할 분담을 해서 지역의 다양한 교육문제를 해결할 수 있도록 해야 할 것이다. 지역사회교육지원센터(마을교육공동체지원센터) 안에는 마을교육지원 외에도 주민·학부모교육 지원, 아동·청소년 방과후 활동지원의 업무가 이루어진다. 이는 지속가능한 마을교육공동체 조성을 위하여 주민과 학부모를 대상으로 한 교육이 우선되어야 하기 때문이다. 이 지원체계는 다음과 같은 과제를 가지고 통합적인 마을교육공동체 사업을 추진하게 된다.