실제로 과학실험을 하고 관찰을 하기엔 무리가 있는 부분을 초등학교 디지털교과서 과학 3, 4는 디지털교과서를 이용하여 실제 실험과 가깝게 탐구활동을 할 수 있게 되었다.
우수 사례의 그 첫 번째로, 초등학교 디지털교과서 과학 3, 4에서는 실험으로 구성되어 있는 탐구활동을 현장에서 모두 실행할 수 없는 현실적 어려움을 고려하여 디지털교과서 안에서 학생들이 조작을 통하여 간단한 실험과 관찰을 할 수 있는 기능을 구현하였다. 예를 들어, 아래 [그림 Ⅲ-26]과 같이 초등학교 디지털교과서 과학 4 27쪽에서는 개수가 다른 바나나를 저울 위에 올려놓는 활동을 통해 저울의 눈금의 변화를 알아볼 수 있도록 하였다. 그리고 같은 단원 29쪽에서는 추를 걸 때 나타나는 용수철을 구현하여 실제 실험과 유사하게 탐구활동을 실시할 수 있도록 하였다.