국민통합지표는 대분류, 중분류, 소분류로 나누고 경제 및 제도 영역과의 교점을 포함하는 방식으로 그 체계를 구성하였다. 경제와 사회의 교차영역을 ‘사회포용’이라 칭하고, 사회와 제도의 교점은 ‘제도기반’이라 칭한다.
이 연구에서 국민통합지표는 바람직한 지표 체계 구성을 위한 방법으로 스티글리츠 위원회가 제언한 바에 따라 국민통합을 대분류, 중분류, 소분류로 나누었다. 그러나 대분류 영역을 구성함에 있어서 완전히 분리된 형태가 아닌 상호 교차하는 형태로 설계하였다. 즉 국민통합이라는 주제의 특성상 사회영역을 중심으로 구성하되 경제 및 제도 영역과의 교점을 포함하는 방식으로 그 체계를 구성하였다. 경제와 사회의 교차영역은 포괄적 성장 모델(Inclusive growth model)에 입각하여 ‘사회포용’이라 칭했으며, 사회영역은 ‘사회자본’ 개념을 중심으로 파악하였고 사회와 제도와의 교점은 ‘제도기반’으로 크게 분류하였다. 이러한 대분류를 시작으로 결과적으로 이 연구의 국민통합 지표는 3개의 대분류, 11개의 중 분류, 28개의 소분류로 구성되어 있다.