정부연구개발은 지식의 탐색을 통해 새로운 지식을 생산하는 방식과 그렇게 생산된 지식을 실제 경제사회적 문제에 활용하는 방식이 상호보환성에 바탕을 두고 진행되어야 한다.
Mode1 방식과 Mode2 방식이 각각의 차별화된 특성을 가지고 전략을 추진하지만 연구 개발을 통해 궁극적으로 창출하고자 하는 문제해결성과는 이 두 가지 방식의 상호보완성이 효과적으로 작동될 때 가능하다. 따라서 지식의 탐색활동을 통한 새로운 과학적 발견 및 이의 기술적 응용을 통해 새로운 기술적 가능성을 발견하는 활동 그리고 기술을 활용하여 경제사회적 문제를 해결하고자 하는 활동은 상호보완적 관계로 접근되어야 한다. 즉, 새로운 지식의 탐색 관점에서의 접근과 경제사회적 문제해결적 관점이 각각의 지식의 창출방식에 영향을 미치는 상호보완적 관계를 형성하게 된다. Mode1에서 생산된 지식이 Mode2에서 활용가능하고 Mode2에서 생산된 현장 문제와 니드는 Mode1로 피드백되어 획기적인 돌파적 신지식을 창출하도록 피드백될 수 있다. 따라서 정부연구 개발은 지식 탐색적 접근과 지식활용적 접근이 상호 보완적 관계 하에서 균형적 발전이 이루어져야 한다.