사업을 기간내에 성공적으로 완료하기 위해서는 수행조직을 합리적이고도 유기적으로 만들어 효율적으로 운영하도록 총괄, 제도개선, 시가 조사, 전산 관리 등을 업무별로 조직 구성했다. 
사업 기간 내 과업의 성공적 완수를 위해 합리적·유기적인 수행조직을 구축하여 효율적으로 운영하기 위해 총괄, 제도개선, 시가 조사, 전산 관리 등 업무별로 조직을 구성하였다. 총괄관리는 지방세 과표, 감정평가, 공시업무 등 조사·평가 및 정책지원 업무 수행이 풍부한 인력으로, 제도개선은 지방세 제도개선, 과표 및 기타물건 관련 연구 경험이 한국지방세연구원에서 수행하였고, 시가 조사 부문은 조사대상 물건에 대한 전문지식과 조사·평가 경력자로, 전산 관리는 DB 구축 및 관리 전문인력으로 구성하였으며, 전문가 위원회는 지방세 공무원, 감정평가, 세무, 통계 등 관련 분야 전문가로 구성하여 가격검증 및 자문 활동을 실시하였다.