해양 수산부는 고가품종에 집중된 발전을 이루고 있어, 관광자원 연계 개발에만 그쳐 그 한계가 있다. 따라서 지차체 협력을 통해 양식단지를 시범사업으로, 2개소 추진 중에 있다.
해양수산부는 내수면 양식산업이 지역별, 품종별로 편중되어 고가품종 위주로 발전하고 있어 시･군 단위 계획으로 주요 수계에 산재해 있는 내수면의 관광자원을 연계 개발하는데 한계가 있어 지자체 협력을 통해 거점별･유형별 내수면특화품종별 양식단지를 시범사업으로 2개소 추진 중에 있다. 내수면 양식단지는 생산지형･소비지형･거점유통형 등으로 거점별･유형화 전략으로 특화된 품종별 양식단지로 추진된다. 내수면 양식단지는 지역별, 품종별 양식업체를 조직화 및 규모화하고, 기본양식단지의 생산성을 향상시켜 6차산업화를 추진한다. 또한, 내수면 양식단지와 지역별 내수면연구소 연계를 통해 종자, 사료개발, 가공기술 등 내수면 양식 클러스터를 추구한다.