2012년에 개정된 법률에서 ‘공인전자문서센터’란 “타인을 위하여 전자문서 관련 업무를 하는 자로서 과학기술정보통신부장관으로부터 지정받은 자”를 말한다.
전자문서법상 ‘공인전자문서센터’란 “타인을 위하여 전자문서의 보관 또는 증명, 그 밖에 전자문서 관련 업무를 하는 자로서 과학기술정보통신부장관으로부터 지정받은 자”를 말한다(제2조 제9호, 제31조의2 제 1항). 공인전자문서센터 개념은 2005년에 신설된 ‘공인전자문서보관소’의 명칭을 변경한 것이다. 종전의 법률은 ‘공인전자문서보관소’를 “제31조의2 제1항의 규정에 의하여 지정을 받아 타인을 위하여 전자문서를 보관 또는 증명하거나 그 밖에 전자문서와 관련된 업무(이하 “전자문서보관등”이라 한다)를 수행하는 법인”으로 규정하였다. 그러나 2012년 개정 법률은 전자문서의 보관 외에 전자문서의 증명기능을 확대하고자 ‘공인전자문서보관소’를 ‘공인전자문서센터’로 명칭을 변경하였지만 실제적인 내용의 차이는 없다.