차고스 제도는 모리셔스의 영토였으나 1968년 영국령으로 편입되었다. 모리셔스는 영국과의 독립 조건 협상 당시, 영국이 요구한 차고스 제도를 포기하더라도 독립을 우선시했기 때문이다. 이후 영국은 차고스 제도의 원주민을 추방하고, 미국의 군사기지 건설을 허용하였다.
모리셔스는 1715년부터 프랑스의 식민 지배를 받았고, 1814년에 영국에게 할양되어 영국의 식민지로 있다가 1968년 3월 12일 독립하였다. 원래 차고스 제도는 모리셔스의 영토에 속하였으나 1968년 모리셔스가 영국으로부터 독립하기 전에 모리셔스에서 분리되어 영국령으로 편입되었다. 1965년 모리셔스의 독립 조건을 협상하는 과정에서 영국은 차고스 제도를 분리하여 영국령으로 잔존시킬 것을 요구하였고, 모리셔스 식민지 대표단은 차고스 제도를 포기하더라도 독립의 달성을 우선적 목표로 생각했기 때문에 영국의 제안을 수락할 수밖에 없었다. 영국은 1965년에 차고스 제도를 인도양 영국령(British Indian Ocean Territory)으로 편입하였고, 모리셔스는 1968년 3월 12일 차고스 제도가 분리된 상태에서 독립을 달성하였다. 그 후 영국은 차고스 제도에 살고 있던 원주민들을 추방하고, 미국이 차고스 제도에 군사기지를 건설하고 이용하도록 조차(lease)하는 협정을 체결하였다.