자격을 위해 능력 단위를 기반으로한 모듈화 방식이 진행되어야 한다. 이를 위해, 자격과 직무의 범위를 동일시하고 자격 종목을 개발할 때에는 다른 분야의 능력을 이용해야 한다. 이러한 요건이 갖춰질 때, 자격제도가 유연적이고 업무의 중복을 방지할 수 있다. 
자격의 구성은 기존의 교과목 방식에서 벗어나 능력 단위(요소)를 기준으로 모듈화 방식을 추진해야 한다. 즉, 개발된 NCS의 능력 단위 또는 능력 단위요소를 중심으로 자격 종목을 재편하는 것이다. 이는 향후 자격제도를 개편할 때 유연성과 탄력성을 주고 많은 비용을 들이지 않고 효율적으로 개편할 수 있게 해 준다. 이를 위하여 자격과 직무의 범위를 일치시키는 작업이 필요하다. 화학 분야의 경우 자격의 직무 정의가 지나치게 넓어 자격 간 업무의 중복이 나타나고, 누락된 직무영역이 다수 존재하였다. 숙박 분야도 동일한 문제점을 나타내고 있다. 능력 단위의 중복은 없지만 능력 단위의 크기가 일정하지 않다. 또 해당 분야에서 개발된 능력 단위(요소)만으로 자격을 구성하기에는 어려움이 있는 경우도 있다. 음식 서비스 등은 숙박업의 주요 업무인데 NCS 개발에 포함되어 있지 않다. 자격 종목 개발 시 다른 분야에서 차용해야 한다. 따라서 두 분야 모두 필수능력 단위와 선택 능력 단위를 구분하여 자격을 구성하여야 한다.