항만물동량과 선박 입출항 횟수 증가에 따라 먼지와 소음, 교통체증이 발생하고 사회적 비용 지출이 증가하고 있다. 해외 주요 항만들에 비해 한국의 항만들은 환경 관리에 취약한 모습이다.
이와 더불어 항만물동량과 선박의 입출항 증가에 따른 먼지, 소음, 교통체증 등으로 인한 민원증가로 불필요한 사회적 비용 지출이 증가하고 있다. 해외 주요 항만들도 항만의 환경오염에 대한 관리강화를 통해 항만과 관련하여 발생하는 민원을 줄이고 청정한 항만으로 관리하고 있다. 반면, 우리나라는 아직까지 항만구역에서 발생하는 각종 환경오염에 대한 체계적인 관리 미흡으로 민원에 대한 적극적인 대응능력이 부족하고, 이로 인해 주요 핵심 사업의 추진이 지연되고 있기도 하다. 또한, 민원의 해결을 위해 불필요한 시설 투자가 강요되는 사례도 발생하여 불필요한 예산이 투자 되는 경우도 발생하고 있다. 따라서 향후 항만구역에서 발생하는 환경오염에 대한 체계적인 관리가 향후 주요 이슈가 될 것으로 예상된다.