에너지  및 자원사업 특별회계는 에너지 관련 부과금, 과징금 등등이 주요 세입원이고, 교통에너지특별세 수입의 3%가 일반회계에서 전입되고 있다. 
에너지 및 자원사업 특별회계는 “에너지의 수급(需給) 및 가격 안정과 에너지 및 자원 관련 사업의 효과적인 추진”8)을 위하여 설립된 특별회계이다. 동 특별회계는 투자계정과 융자계정으로 구분할 수 있다(동법 제4조). 동 특별회계는 각종 에너지 관련 부과금, 과징금, 가산금, 납입금과 일반회계 및 특별회계 전입금과 융자사업에 따른 이자수입 등을 주요 세입원으로 하고 있다. 에너지 관련 부과금으로는 석유 수입 부과금, 석유 판매 부과금, 가스안전 관리 부담금, 광해방지 부담금 등이 있다. 이외에도 교통에너지특별세 수입의 3%를 일반회계에서 전입하고 있다.