우리나라 행정 구조상 국가 반부패 시스템이 행정과 함께 중앙에 집중되었다 보니, 기존 자체감사기구뿐만 아니라 독립적인 반부패 외부감시기구가 지방 내 부정부패 해결에 필요하다. 공공감사체계 관리 내용의 부족으로 공공부문 부정/비리/비효율 대응이 어려워지자, 최근 공공감사 관련 법 제정에서 위 자체감사기구의 필요성을 요구했다. 이런 독립적, 전문적, 효율적인 자체감사기구가 마련되면 공공부문의 내부통제 내실화와 책임 재고를 기대해 볼 수 있다.
우리나라의 행정이 아직도 중앙정부로 많이 집중되어 있고 따라서 국가 반부패 시스템도 중앙으로 집중되고 있는 실정이다. 이로 인하여 지방 차원에서 발생하고 있는 부정부패가 제대로 통제되지 못하고 있는 실정으로 그러한 이유 등으로 중앙 공무원에 비하여 지방 공무원의 부패가 많은 하나의 원인이 되고 있다. 지방의 구조적인 부패구조를 치유하기 위하여 자체감사기구는 물론 필요하다면 외부감시기구를 포함하여 독립성 있는 반부패 감시기구를 설치하는 것이 필요하다. 독립성과 전문성 결여는 지자체장 등 집행기관에 대한 견제부실로 이어져 비리와 연결되기 쉽다. 따라서 이를 강화시키면 그에 상응한 견제와 균형, 내부통제를 유지할 수 있어 공정성을 확보할 수 있다. 이에 대하여는 감사원이 최근 공공감사에 관한 법률(2010년 3월 제정)을 제정하여 지방자치단체 등 공공부문의 자체감사기구 조직과 활동, 감사책임자의 임면 등에 있어 자체감사기구의 독립성과 전문성 제고 및 효율적인 운영을 할 수 있는 필요한 사항을 정하였는데 그 제정 배경에는 지금까지 공공감사체계 전반을 규율하는 일반법이 없었고 그러다 보니 공공부문의 부정․비리와 비효율에 대한 체계적․효율적 대응에 한계(자체감사기구는 독립성․전문성 부족과 설치 및 감사활동에 대한 법적근거도 부족하여 내실 있는 감사활동이 곤란, 또한 감사원과 자체감사기구 간 지원․협력과 역할분담 규정 등이 미비하여 국가 감사체계 전반의 효율성이 저하되고 있음)에 직면한 데 따른 것이다. 이처럼 자체감사기구의 독립성과 전문성 제고 등 공공감사 체계를 개선하기 위해 필요한 법적 체계를 구비하게 되면 공공부문에 대한 내부통제 내실화와 함께 책임성이 제고될 것으로 기대된다.