정신건강토탈케어 서비스는 바우처 방식을 써서, 기초자치단체는 제공기관의 등록 등을 담당하고 이용자는 바우처 결재를 하고 서비스 제공기관은 비용을 지원받는다. 이것은 이용자의 역량을 강화하고 그에 대한 재정지원의 효과를 가진다.
지역사회서비스투자사업으로 각 지역에서 실시하는 정신건강토탈케어 서비스는 바우처 방식의 재정지원을 활용하기 때문에, 정부→ 광역 지자체→ 기초지자체 → 사회보장정보원으로 서비스 재원의 이전이 이루어진다. 기초자치단체는 서비스 제공기관의 등록 및 관리, 이용자 신청접수·욕구사정·서비스결정을 담당한다. 이용자는 제공기관과 계약에 의한 서비스를 이용한 후 바우처 결재를 하고, 자부담 비용은 서비스기관에 직접 납부한다. 서비스 제공기관은 사회보장정보원에 서비스 제공비용을 정산·신청하여 서비스 제공에 따른 비용을 지원받는다(보건복지부, 2011). 바우처 방식을 사용하는 정신건강토탈케어서비스는 이용자가 서비스 제공자를 선택할 수 있으며 서비스를 제공받은 후 바우처 비용을 직접 결재하기 때문에, 이용자의 역량을 강화하고 이용자에 대한 직접적인 재정지원의 효과를 갖는다.