실제 파급효과가 발생한 크기를 근거로 그려진 클러스터 지도는 구성요소간 비교가 용이하나, 그 범위를 명확히 하거나, 개도국의 경우 관련 데이터를 확보하기가 어렵다.
클러스터 지도는 기존의 투입산출분석 등과는 달리 지역적 파급효과가 전달되는 구체적인 경로를 분석하는 것이 아니라, 실제로 발생한 파급효과의 크기(즉, 조달과 판매가 실제로 이루어진 규모와 거래관계)를 중심으로 분석을 한다는 특징을 가지고 있다. 클러스터 지도가 클러스터 간 그리고 클러스터 내에서 발생한 실제 연계관계를 근거로 작성되기 때문에 산업간, 지역간 비교가 임의적으로 이루어지지 않는다는 장점을 가지고 있다. 그러나 클러스터의 정의와 범위를 명확하게 설정하는 것이 쉽지 않고, 개도국의 경우 관련 데이터를 확보하는 것이 상당히 어렵다는 단점이 있다.