1990년대 이후 추진된 중학교 교육개혁은 주니어하이스쿨과 미들스쿨 모두를 대상으로 하였다.  중학교 교육 전반의 재조직화를 추구, 청소년 전기 아동을 위한 교육 개선이라는 목적 하에 '중학교 교육'이라는 용어가 채택됐다.
1990년대 이후 추진된 중학교 교육개혁의 특징을 정리해보면 다음과 같다. 첫째, 새로운 중학교 개혁은 직접적으로는 미들스쿨 운동의 ‘실패’에 대한 비판과 반성을 계기로 추진되었으나, 주니어하이스쿨과 미들스쿨 모두를 대상으로 하였다는 점이다. 1960년대 미들스쿨 운동은 주니어하이스쿨에 대한 비판과 반성에서 제기되었다면, 1990년대 제 2의 중학교 개혁은 주니어하이스쿨과 미들스쿨 모두를 비판하고 중학교 교육 전반의 재조직화를 추구하였다. 또한 1980년대까지 미들스쿨과 주니어하이스쿨은 상호 경쟁, 대립하였다면, 1990년대 이후 중학교 교육개혁에서 두 기관의 옹호자, 실천가들은 청소년 전기 아동을 위한 교육 개선이라는 목적 하에 ‘중학교 교육(middle level education)’이라는 용어를 채택하고 상호 협력, 연합하였다.