많은 진보적 북한 NGO들은 관계 개선과 대북지원에 치중해오다, 보수적 NGO들의 지속적 문제 제기로, 2000년대 후반부터 북한 인권 활동에 나섰다. 그러나 정치적 자유권보다는, 생존권 및 사회권에 초점을 두고 있다.
많은 진보적 북한 관련 NGO 들은 2000년대 후반까지 북한의 인권 문제보다는 김대중 정권 및 노무현 정권의 전향적인 대북정책에 발맞추어 북한과의 관계 개선 및 대북지원 활동에 치중해왔다. 계속적으로 북한 인권 문제에 대해 문제를 제기해 온 보수 NGO와의 정치적 견해 차이 때문에 진보적 NGO 들은 북한 인권에 대한 문제제기를 액면 그대로 받아들이기 보다는 햇볕정책에 대한 우회적 공격으로 치부하는 경향이 있었다. 그러나 결국 계속된 문제제기를 무시할 수 없었던 이들 단체는 2000년대 후반을 기점으로 본격적으로 북한 인권 개선 활동에 나서기 시작한다. 그러나 보수적 NGO 들이 북한 주민들의 정치적 자유권을 강조하는 반면, 북한에 대한 지원에서 출발한 진보적 NGO들의 인권 개선 활동은 북한의 생존권 및 사회권에 초점을 두고 있다.