제2차 물류시설개발 종합계획은 국가경쟁력을 제고하고 국부를 창출하는 지속 가능한 물류시설체계의 구축을 목표로 한다. 이를 위해 물류 수요 발생원과 연계된 수요 창출형 공동물류시설의 개발을 유도하며, 도시권 지역 내의 물류수요도 고려한 도시형 물류시설, 지역 친화적 물류시설로의 전환, 기존 시설의 운영 효율성 제고, 국내외 연계형 복합물류시설의 확보 등을 내용으로 하고 있다.
제2차 물류시설개발 종합계획(2013~2017)은 비전을 국가경쟁력을 제고하고 국부창출에 기여하는 지속 가능한 물류시설체계 구축에 두고 있다. 계획의 목표 및 추진방향은 산업과 지역의 경쟁력 강화를 지원하는 고효율·고품질 물류시설 구축, 저탄소 녹색성장을 지원하는 지속가능한 물류시설 구축, 새로운 경제가치 창출 기반을 제공하는 고부가가치의 융합형 물류시설 구축으로 설정하고 있다. 추진전략은 5개 부문을 제시하고 있으며, 주요 키워드는 공동물류시설, 도시형 물류시설, 미래형 물류시설, 기존 시설 운영효율화, 복합물류시설로 정리할 수 있다. 첫 번째로, 독자적 공동물류시설과 관련해서는 물류시설다는 생산 제조, 유통, 소비 등 물류수요 발생원과 연계한 수요 창출형 공동물류시설 개발의 유도를 강조하고 있다. 두 번째로, 도시형 물류시설과 관련해서는 광역권 지역간 중심에서 벗어나 도시권 지역 내 물류수요까지 고려하는것을 그 내용으로 하고 있다. 세 번째로, 미래형 물류시설과 관련해서는 연계교통 근린생활기능과의 결합, 친환경 안전 보안기능 및 정보화 역량 강화를통해 지역 친화적 물류시설로 전환을 유도하는 것이다. 네 번째로, 기존 시설 운영효율화는 확장 중심의 시설개발보다는 기존 시설의 운영 효율성 제고를 전제로 추가 공급계획을 제시하고 있다. 마지막으로, 복합물류시설과 관련해서는 FTA 확대, 동북아협력 및 통일시대에 대비한 국제 국내 연계형 복합물류시설을 지속적으로 확보해야 한다는 것이다.