교원양성에 목표를 둔 교육전문대학원 신설되면 교육대학원의 교원양성 기능은 폐지되어야 하지만, 기존 교육대학원의 교원 현직교육 및 재교육 기능은 더욱 강화될 필요가 있다. 
교육전문대학원이 설치가 되면 기존 교육대학원에서의 교원양성 기능은 폐지될 필요가 있다. 교원양성 기능이 중복되기 때문이다. 다만 기존 교육대학원에서 교원양성 기능만 폐지되지만 기존 교육대학원 자체가 페지되는 것은 아니다. 오히려 기존 교육대학원에서는 교원양성 기능은 폐지되지만 교원 현직교육, 재교육 기능은 더욱 강화되어야 한다. 교육전문대학원은 교원양성에 목표를 둔 기관이지 교원현직교육 기능을 하는 기관은 아니다. 따라서 기존 교육대학원의 교원 현직교육 기능은 계속 살려야 하고 더욱 중요해졌다고도 할 수 있다. 교원양성 기능은 교육전문대학원에서 교원 현직교육 기능은 교육대학원에서 각각 특화시킬 필요가 있다.