경제적 원인에 근거한 공공갈등은 편익과 비용의 형평성 문제에서 비롯되며 공간, 시간, 집단에 따라 문제가 다르게 형성된다. 비선호 시설이 입지하는 지역은 비용을 전담하지만 편익은 타지역과 공유한다. 그리고 세대 간 비용 부담 측면 혹은 이익을 두고 집단 사이에 형평성 문제가 발생하게 된다. 이 경우에 대개 경제적 유인 제공을 수단으로 선택하며 이는 주민 반대를 단순히 이익관계로 파악한다 점에서 주의할 필요가 있다.
경제적인 것을 원인으로 다룬 연구들은 공공갈등이 정책을 통해 유발되는 편익과 비용의 형평성 문제에서 비롯된다고 언급하고 있다(권영규, 2006; 정지범, 2010). 편익은 모든 지역에 고르게 분포되지만, 비용은 시설 입지 주변에 집중되기 때문이다. 그리고 이러한 편익과 비용의 형평성을 좀 더 세밀히 살펴보면, 해당 지역 내에서도 공간, 시간, 집단에 따라 상이하게 형성되고 있음을 알 수 있다. 예를 들어, 비선호 공공시설과 관련된 국책사업의 경우 시설이 입지하는 지역은 전적으로 비용을 전담하고, 타 지역은 비용은 부담하지 않지만 편익을 함께 공유한다. 그리고 시설의 입지를 결정한 현재 세대와 미래 세대간에는 동일 지역이라고 하더라도 비용 부담 측면에서 형평성의 문제가 발생한다. 환경 가치가 반영되어 있는 공공갈등의 경우 특히 현재세대는 상대적으로 비용을 미래세대에 전가하고 있는 것으로 볼 수 있을 것이다. 또한 해당 지역내에서 시설 입지로 인해 일자리를 얻는 사람들이나 매출이 증가하는 상인들의 경우 이익을 얻지만, 반대로 불이익만 얻는 집단도 존재하기 때문에, 다양한 측면에서 편익과 비용에서 형평성의 문제가 발생하고, 이것이 곧 갈등의 원인으로 작용하게 된다. 이러한 경제적인 원인에 근거한 공공갈등은 해결 과정에서 주로 경제적 유인을 제공하는 식의 수단을 선택한다. 그러나 이러한 시각은 때로 어떤 정책에 대한 주민의 반대를 단순히 경제적 이익관계의 오해로 파악하여 갈등을 제거해야 할 어떤 것으로 간주하는 태도로 변하기 쉽다는 점에 주의를 기울일 필요가 있다(권영규, 2006).