특허 박스 제도는 지식 재산 축적도 향상과 지식 재산 혁신성의 사회적 효익 증가 장려를 위한 것이다. 상표는 보호 대상이 되기 어렵고, 디자인은 그 제한 대상이 될 수 있다.
특허 박스 제도는 지식 재산의 축적도를 높이면서 동시에 시장의 긍정적인 평가를 받는 지식 재산의 혁신성이 사회적인 효익을 증가시키는 것을 장려하기 위함이다. 따라서 이러한 점에 놓고 본다면, 기본적으로 상표는 소비자의 인식과 신뢰에 대한 보호에서 출발한 지식 재산이고, 지속적인 갱신이 가능한 지식 재산권이기 때문에 보호의 대상이 되기 어려운 점이 있다. 또한 디자인의 경우에도 그 제한 대상이 될 수 있는데, 일정 부분에 있어서는 디자인이 혁신성을 상징하는 부분이 되기도 하지만 과도한 보호로 인하여 혁신성에 대한 제한이 되는 부분도 존재하는 논란의 대표적인 부분에 해당되기 때문이다.