사업성 기금 중 일부는 여유자금과 중기가용자산의 규모가 지나치게 크다는 평가를 받았으므로 공공자금관리기금 예탁 등의 적극적인 여유자금 활용 방법을 찾아야 한다. 
기금 여유자금 규모의 적정성을 평가한 결과, 일부 사업성 기금은 여유자금 규모가 과도하여 상당한 기회비용을 유발하고 있는 것으로 분석되었다. 영화발전기금(문화체육관광부), 석면피해구제기금(환경부), 임금채권보장기금, 장애인고용촉진 및 직업재활기금(이상 고용노동부)은 평가 결과 타 사업성 기금에 비하여 주요 지출규모 대비 여유자금 비중이 상대적으로 높은 것으로 분석되었다. 동 기금들은 정부의 기금 존치평가에서도 중기가용자산 규모가 과다하다는 지적을 받은 바 있다. 따라서 공공자금관리기금 예탁 등 보다 적극적인 여유자금 활용방안을 마련할 필요가 있다.