학교에서는 <양성평등기본법>에 따라 ‘성희롱 방지조치 지침 표준안’을 바탕으로 성희롱예방지침을 운영하고 있다. 성희롱 예방지침에는 성희롱 관련 상담 및 고충 처리 운영 방안, 절차 및 매뉴얼, 행위자에 대한 제재조치, 피해자에 대한 조치, 재발 방지 방안 등의 사항들이 포함 되어야 한다.
<양성평등기본법>에 따라 각급 학교는 성희롱예방지침을 마련, 시행하여야 한다. 성희롱 예방지침에는 성희롱 관련 상담 및 고충 처리를 위한 공식 창구 운영에 관한 사항, 성희롱 고충 처리 절차 및 매뉴얼에 관한 사항, 성희롱 행위자에 대한 징계 등 제재조치에 관한 사항, 성희롱과 관련된 피해자에 대한 불이익조치 금지에 관한 사항, 성희롱 관련 상담 및 고충 처리와 관련된 비밀보장에 관한 사항, 성희롱 사건 발생 시 피해자 치료지원, 가해자에 대한 인사 조치 등을 통한 피해자의 근로권 학습권 등을 보호하기 위한 조치에 관한 사항, 성희롱 관련 상담 및 고충 처리 업무 종사자에 대한 교육 훈련 지원에 관한 사항, 기타 성희롱 예방 및 재발 방지를 위하여 필요한 사항을 포함하여야 한다. 이에 따라 대부분의 학교에서는 자체 성희롱예방지침을 마련하여 운영하고 있다. 대학교를 포함한 각급 학교의 성희롱 예방지침 제정률은 93.1%(2013년)로, 점검 대상 기관 중입법부(100.0%)를 제외하고 가장 높은 수준이다. 자체 지침은 학교별로 차이가 있으나 여성가족부의 ‘성희롱 방지조치 지침 표준안’을 주요 골격으로 한다.