공기업과 반대로, 준정부기관은 정부정책사업수행이나 요금규제보다는 일인당 복리후생비와 같은 경영비효율이 부채비율과 증가율을 높이는 것으로 나타났다. 정부는 이런 연구결과를 토대로 공기업과 준정부기관에 다른 부채관리정책을 처방해야 한다.
이와  반대로  공기업에  비하여  준정부기관은  정부정책사업수행이나  요금규제보다는  일인당 복리후생비와 같은 경영비효율이 부채비율과 증가율을 높이는 것으로 나타났다. 이는 준정부기관의 부채증가의 주요한 원인은 공기업과는 달리 경영비효율에 있었음을 보여주고 있다. 수익지표가 비교적 명확한 공기업과는 달리 정부의 출연금에 의존하는 준정부기관의 경영비효율이 더 심각하고 최근 정부가 발표한 대표적인 방만경영 사례가 준정부기관에서 나왔기 때문이다. 정부는 이러한 연구결과를 토대로 공기업과 준정부기관별로 다른 부채관리정책을 사용할 필요가 있다. 예를 들어, 공공기관 정상화 대책에서 강조하고 있는 방만경영 해소와 같은 대책은 비효율성이 비교적 높은 준정부기관의 부채관리대책에 적용하고 공기업의 경우, 전술한 바와 같이 정부정책사업수행과 요금통제를 제한할 수 있는 구분회계나 공공요금 자율화 같은 제도적 장치를 마련해야 할 필요가 있다.