국가전략목표의 실질적 달성을 위해선 예산배분단계에서 정책문제가 제대로 정의되고 해결될 수 있는 환경과 적절하게 문제를 구조화할 수 있는 합리적 체계의 구성이 요구된다.
국가전략목표의 실질적인 달성은 해당 전략목표와 관련된 정책과제 및 문제들이 실질적으로 해결되어야 하므로 이를 위해 정책과제에 예산이 배분되는 단계에서 정책문제해결을 위한 적정한 예산구조 및 환경을 조성해 주는 것이 대단히 중요하다. 즉, 예산배분단계에서 정부는 단순히 투자방향을 고려한 예산규모 확대에서 그치는 것이 아니라 정책문제가 제대로 정의되고 해결될 수 있는 환경과 적절하게 문제를 구조화할 수 있는 체계를 만들어주어야 한다. 예를 들면 정부연구 개발예산이 프로그램 구조를 중심으로 배분이 이루어진다면 프로그램 단위로 정책적으로 해결해야 할 과제의 구성과 문제해결에 소요되는 자원 규모가 설정될 것이고, 세부사업기준으로 예산배분이 이루어진다면 세부사업 수준의 문제의 구성과 소요자원 편성이 이루어질 것이다. 이는 곧 예산구조가 정책문제 해결을 위한 사업기획의 범위를지배하는 것을 말하며 예산구조의 합리적 구조화가 정책목표 달성 및 정책문제해결의 가이드라인 역할을 하는 중요한 수단임을 의미한다.