분석 결과 디지털교과서에 대한 이해와 활용능력이 부족, 학습 속도 차이, 관리 및 통제의 어려움, 수업 지원 체계 미비로 교사나 학생 모두 어려움을 겪고 있다.
분석 결과를 종합하면, 디지털교과서와 관련해서 교사나 학생 모두 아직까지는 디지털교과서에 대한 이해나 활용 능력이 부족하며, 기초적인 ICT 활용 능력의 부족함에서 기인하는 학습 속도 차이, 관리 및 통제의 어려움, 수업 지원 체계의 미비로 인한 어려움을 겪고 있었다. 이러한 어려움은 디지털교과서를 활용한 수업이나 학습 효과에 대한 불안함으로 이어지는 경향이 있었다. 디지털교과서는 서책과 차별화된 콘텐츠나 자료가 부족하고 여러 가지 기능의 개선이 필요한 상태로 적용되고 있으며, 이로 인해 구동이 불안한 측면이 있었다. 학교는 디지털교과서 활용을 위한 환경 구축이나 예산, 지원 인력 등이 부족하고 미비한 환경 속에서 연구학교를 운영하는 어려움이 있었고, 연구학교가 끝날 경우 이 환경을 어떻게 유지하며 활용할지에 대한 불안함이 있었다.