유아교육에 대한 재정지원의 문제점으로는 유아교육지원이 국고보조금으로 이루어져 재정안정성이 떨어지고 예산이 OECD국가 중 최하위 수준이고 유아교육의 확대를 위한 재원이 마련되지 않았고 사립유치원의 열악한 재정과 법체계가 이원화되어 재정지원 주체가 다르다는 점이다.
취학전교육 재정지원의 쟁점과 방향(김병주, 2011)에서는 취학전교육 재정지원 관련 쟁점과 방향을 분석하기 위하여 취학전교육 재정지원의 현황과 문제를 살펴보았다. 2011년 예산안에 따르면 유치원에 해당하는 예산은 초중등교육예산 전체의 2.5퍼센트에 불과하다(대한민국정부, 2011). 2011년도 보육사업 예산은 2조 4,784억원으로, 2010년(2조1,275억원) 대비 16.5퍼센트 증가했다(보건복지부, 2012). 영유아 지원 예산은 전액 지방교육재정교부금으로 이루어진다. 유아교육에 대한 재정지원에는 다음과 같은 문제가 있다. 첫째, 국가차원의 유아교육지원이 국고보조금으로 이루어져 재정안정성이 떨어진다. 둘째, 유아교육 예산이 OECD 국가 중 최하위 수준이다. 셋째, 유아교육의 확대를 위한 재원이 마련되지 않았다. 넷째, 사립유치원이 공립유치원보다 많지만 재정은 공립보다 열악하다. 다섯째, 영유아에 대한 재정지원이 유아교육법과 영유아보육법으로 이원화되어 있어 동일한 유아에 대한 재정지원 주체가 다르다.