국제적 노하우 라이센스 계약에도 국제적 특허라이센스 내용이 적용되는 문제점 해결 등을 위해 공정취인위원회는 ‘특허/노하우라이센스 계약에 있어서의 불공정한 거래방법의 규제에 관한 운용기준’을 공표했다. 이는 특허라이센스와 노하우라이센스 계약의 제한사항을 따로 열거하며 인정기준은 2분법을, 운용기준은 3분법을 사용한 것, 기술공여계약에도 적용되는 점, 적용범위가 국내 기술거래 제약까지 확대된 점 등의 특징이 있다. 한편 독점금지법상 문제 우려가 인정되면 당사자 간 개선을 유도하고 있다.
 당시는 국제적 특허라이센스 계약이 대부분이었기 때문에 국제적 노하우 라이센스 계약에 있어서도 국제적 특허라이센스 계약의 내용이 준용되어 왔다. 이와 같은 문제점을 보완하고 국제 경제 환경의 변화를 반영하기 위하여 1989년 2월 공정취인위원회는 ‘특허/노하우라이센스 계약에 있어서의 불공정한 거래방법의 규제에 관한 운용기준’을 공표하기에 이르렀다. 이 운용기준은 불공정한 거래방법에 해당될 우려가 있는 제한사항을 열거하고 있는 것은 마찬가지이지만, 첫째, 특허라이센스 계약에 관한 제한사항과 노하우라이센스 계약에 관한 제한사항을 따로 열거하고 있고, 둘째, 인정기준에는 불공정한 거래방법에 해당될 우려가 있는 제한사항과 정당한 권리의 행사로 인정되는 사항의 2분법이 채택된 반면, 운용기준은 3분법을 택하여 (1) 원칙적으로 불공정한 거래방법에 해당되지 않는 것으로 인정되는 사항, (2) 불공정한 거래방법에 해당할 우려가 있는 사항, (3) 불공정한 거래방법에 해당하거나 해당될 우려가 많은 사항으로 나누고 있고, 셋째, 기술도입계약 뿐만 아니라 기술공여계약에도 적용되고(단, 일본시장에 영향을 미치지 않는 경우는 적용되지 않음), 넷째, 국제적 기술거래계약 뿐만 아니라 국내의 기술거래 계약에도 적용되어 그 적용범위가 확대되었다는 특징을 가지고 있다. 한편, 국제계약신고제도에 의한 심사의 결과 독점금지법상 문제가 우려되는 것으로 인정되면, 앞에서와 같이 행정실무상 바로 법적조치를 취하는 것은 피하고 먼저 신고사업자로 하여금 당사자 간에 자주적으로 개선하도록 하고 있다. 이와 같은 지도는 통상 신고 후 2, 3개월 이내에 행하여진다. 단, 법적으로는 계약체결 후 경쟁제한이 현저히 나타나는 경우에는 공정취인위원회는 언제라도 법적조치를 취할 수 있고, 신고 후 지도가 없었다고 해서 독점금지법을 위반하지 않았다는 증명이 되지는 않는다.