조사단은 조사연구 운영본부, 자문위원, 지역별 조사팀으로 구성되었다. 특히 지역별 조사팀은 대규모 인원으로 해당 지역에서 연구를 지속적으로 해 온 대학교수 및 연구원으로 구성되었다.
1차 년도는 한국건축역사학회와 대한건축학회 주최로 진행되었고, 2·3차년도는 한국건축역사학회에서 맡아 했다. 조사단은 크게 조사연구 운영본부와 자문위원, 그리고 지역별 조사팀으로 구성되었는데, 운영본부는 조사기획과 조사사업 대상 선정을 위한 검토, 조사결과보고서 작성 등 사업을 총괄하였으며 자문위원은 조사대상의 등급을 평가하는 역할을 하였다. 지역별 조사팀은 해당 지역 조사경험이 풍부한 연구원이 지역별 책임자가 되어 년차별로 지역에 따라 책임자가 선정되었다. 특히 지역별 책임자는 그동안 해당 지역에서 건조물 조사와 연구를 지속해서 진행해왔으며, 관련 자료를 축적해 두었을 뿐만 아니라 연구 실적이 많은 대학교수 및 연구원으로 구성되었다. 1차년도에는 약 150여 명, 2차년도에는 약 120여 명, 3차년도에는 약 100여 명의 전문조사원이 참여하였다.