지속가능한 개발 및 환경친화적 건축을 유도하는 녹색건축인증제는 한국감정원 녹색건축센터에서 운영하고 있다. 토지이용 및 교통, 유지관리 등 약 40여개의 항목을 평가하여 4개 등급으로 구분하며 공공건축물이나 기준 연면적 이상에 인증 취득을 의무화하고 있다. 건축물 에너지효율등급 인증제와 달리 1차 에너지소요량 외 다른 요인도 고려하여 건축물의 성능을 평가한다.
녹색건축 인증제는 기존의 ‘친환경건축물 인증제’와 ‘주택성능등급인정제’를 통합하여 2013년부터 시행해온 제도이다. 제도 목적은 지속가능한 개발 및 환경 친화적인 건축을 유도하는 것이다. 녹색건축 인증제는 건축물이 환경에 영향을 미치는 요인들을 종합적으로 평가하여, 점수가 우수한 건축물에 대해서는 녹색건축 인증(G-SEED: Green Standardfor Energy and Environmental Design)을 부여한다. 인증제 심사를 위해 토지이용 및 교통, 에너지 및 환경오염, 재료 및 자원, 물순환 관리, 유지관리, 생태환경, 실내환경에 대한 약 40개의 평가항목을 평가한다. 녹색건축 인증등급은 최우수(그린1등급), 우수(그린2등급), 우량(그린 3등급), 일반(그린4등급)으로 구분된다. 인증대상은 모든 건축물(신축 및 기존)이며, 연면적 3,000m2이상 건물의 신축 및 증축 시 인증취득이 의무화된다. 공공건축물에 대해서는 우수등급(그린 2등급) 이상 취득을 의무화하고 있다. 건축물 에너지효율등급 인증제는 건축물의 단위면적당 1차에너지소요량에만 근거해 건물의 에너지성능을 평가하는 반면, 녹색건축 인증제는 1차 에너지소요량 외에도 다른 요인들을 종합적으로 고려해서 건축물의 전체적인 성능을 평가한다는 점이 차별적이다. 현재녹색건축 인증을 운영하는 기관은 한국감정원 녹색건축센터이다.