한,미는 방위비분담금의 운용방식 개선을 위해 제8차 SMA에서 군사건설비를 현물지원 체제로 전환해 투명성을 제고했으며 제9차 SMA에서는 방위비분담금 집행 관련 5개 분야 제도 개선에 합의했다.
한편, 동맹국 간 신뢰 강화 차원에서 방위비분담의 운용방식 또한 중요하게 다뤄야 할 문제이다. 방위비분담금의 운용방식 개선은 제8차 SMA에서 본격 화되었다. 동 협정을 통해 양국은 군사건설비를 현금지원에서 현물지원 체제 로 전환하여 방위비분담금 집행의 투명성을 제고했을 뿐만 아니라 향후 실 소요 지원체제로 전환하기 위한 틀을 마련하였다. 제9차 SMA에서 양국은 방위비분담금 집행에 있어 5개 분야 제도 개선에 합의하고, 별도의 교환각서 를 채택하였다. 2017년 1월 미국의 신정부가 출범하고, 2018년 2월 한국의 신정부가 출범한 이후 치러질 제10차 SMA 협상에서 방위비분담 규모와 운 용 방식 개선은 또 다시 쟁점이 될 것으로 보인다.