건강보험과 달리 산재보험은 의료자원의 최대 투입으로 최선의 서비스를 제공하는 것을 목표로 한다. 그러나 다수의 산재지정 의료기관은 전문적 재활서비를 제공할 역량을 갖추지 못했다고 지적되기도 한다.
산재의료의 질에 관한 것으로 산재근로자에게 최선의 치료가 제공되었느냐에 대한 문제를 살펴보면, 건강보험과는 다르게 산재보험은 의료자원을 최대한으로 투입하여 최선의 서비스를 제공하는 것을 추구한다. 만일 이 원칙이 지켜져 산재의료의 질이 건강보험에서 제공하는 의료의 질보다 더 우수했다면, 동일 중증도를 가진 산재근로자가 건강보험을 통해 치료를 받는 것보다 산재보험을 통해 치료를 받을 때 결과가 더 좋았을 것이다. 일부 산재지정 의료기관에서는 수준 높은 산재의료를 제공하고 있지만 상당수의 산재지정 의료기관은 직업 복귀에 필수적인 작업치료와 같은 재활서비스를 전문적으로 제공할 역량이 되지 않아 단순 물리치료나 통증관리만을 하고 있다고 지적되기도 한다.