정부의 R&D사업 실적을 보면 현행 운영 방식으로는 연구개발사업을 통한 벤처·창업 기업에 대한 지원이 어려우므로 재원 확보를 통해 신생 기업이 정부 연구개발 사업에 더 많이 참여할 수 있게 개선해야 한다.  
정부는 벤처 · 창업 지원 활성화를 위해 기업의 성장단계별 맞춤형 지원체계 구축을 통해 창업 2~3년차에 발생하는 R&D 수요에 대한 지원을 확대하겠다고 밝히고 있으나, 현재의 정부R&D사업 구조로는 이를 실현하기 어렵다. 창업기업 전용 R&D사업은 “창업성장기술개발사업”이 유일하며, 중소기업 지원 비중이 높은 R&D사업의 경우에도 업력 3년 또는 5년 미만의 창업초기기업 지원 비중은 매우 낮게 나타나고 있다. 따라서 정부는 “창업성장기술개발사업”과 같은 창업기업 전용R&D사업을 확대하고, 중소기업 지원비중이 높은 주요 R&D사업의 경우에는, 세부사업내에 창업초기기업을 위한 별도의 내역사업 재원을 편성하는 등 창업초기기업의 R&D과제 참여를 확대할 수 있는 사업운영 개선을 검토할 필요가 있다.