원칙적인 공동위원회의 재정 부담과는 달리 산림협력은  우리 정부가 북한 산림을 복원을 위해 지원하는 것으로 우리가 부담할 수 있을 것이다.
제4조에서는 공동위원회의 운영 방식과 재정에 대하여 구체적으로 규정하였다. 제1항 제4호에서는 “화상회의· 전화회의· 전자메일 및 문서교환” 등을 통한 회의방법을 규정하였는데, 이는 정보통신기술의 발전을 감안하여 전자적 수단을 통한 연락도 가능하도록 배려한 것이다. 공동위원회의 재정에 대해서는 원칙적으로 상호주의 원칙에 따라 공동비용은 쌍방이 균등부담하고, 나머지는 각기 부담한다고 규정하였다. 그러나 산림협력이 대부분 북한산림에 대한 남한의 지원이라는 성격이 강하므로 실제의 운영에서는 상호주의를 완화하여 남한이 부담할 수 있을 것이다.