기획재정부는 각 부처의 정책 우선순위를 활용해 예산안을 편성할 때 부처별 지출한도를 포함할 수 있다. 이러면서 부처 각각의 특성이 고려된 사업의 조정이 가능해질 수 있으나, 예산실의 업무 부담이 커질수 있다는 우려가 있다. 
기획재정부는 각 부처의 중기재정계획과 재정성과관리제도의 성과정보, 국정과제를 활용한 정책의 우선순위를 활용하여, 예산안 편성 지침 작성 시에 부처별 지출한도를 포함시킬 수 있다. 이 과정에서 민간이나 학계의 전문가들이 작업반을 구성하여 심도 있는 논의를 진행할 수도 있다. 예산실과 부처의 예산 심의는 상당한 정치적 과정이기 때문에, 대통령이 임명한 외부 전문가, 기획재정부, 정부부처가 공동으로 지출 검토를 실시해야 결과에 대한 수용성이 높아질 수 있다. 이렇게 각 부처별 지출한도가 결정되고, 부처별 상향식 예산 조정을 기초로 시작되므로 어느 정도 부처별 특성이 고려된 사업 조정이 가능하다. 다만, 지출 검토의 도입으로 특히, 예산실의 업무 부담이 커질 수 있다. 결국 부처별 예산을 공정하게 그리고 합리적으로 조정할 수 있는 조직 규모나 역량이 예산실에 있는가가 중요하다. 앞서 서술한 바와 같이 지출 검토의 과정에서 추가적인 성과정보의 생산을 위해 사업을 평가하는 과정을 추가하는 것보다는 기존의 재정성과관리제도의 결과와 다양한 관련 연구원 및 학계의 논문과 연구 보고서, 그리고 국회의 예･결산 심의 과정에서 생산되는 연구결과 등을 활용하는 것이 필요할 것이다.