생식건강 영역은 모성 사망률과 청소년 출산율로 구성되어 있는데, 이는 산모의 사망 위험이나 청소년 출산 여성의 기회 제한 등 여남 격차에 큰 영향을 미친다는 인식을 기반으로 한다.
각 영역별 지표 구성을 보면 첫째, 생식건강 영역은 모성 사망률과 청소년 출산율로 구성되어 있다. 다른 영역의 지표들이 남녀를 비교하는데 비해, 이 영역의 지표는 여성 특화 지표로 구성되어 있다. 두 지표의 선정 근거는 여성 특화 지표임에도 불구하고, 출산과 관련된 여성의 건강이 남녀의 격차에 크게 영향을 미친다는 인식에 기반한다. 출산과 관련한 산모의 사망 위험은 기초교육, 적절한 영양, 피임에 대한 접근성, 의료 서비스, 숙련된 출산 조력자를 통해 감소될 수 있다. 이러한 서비스들이 대부분 큰 비용을 수반하지 않음에도, 상당수의 여성들은 이러한 서비스를 받지 못해 사망에 이르고 있어 여성의 건강 유지에 커다란 위협이 되고 있다. 청소년 출산율로 측정되는 조기 출산은 건강에 대한 문제와 아울러 산모의 미래의 인간개발 기회의 제한이라는 관점에서 지표로 선정되었다. 청소년 출산은 산모와 아기 건강에 대한 높은 위험과 관련이 있고, 출산 여성의 교육 중단과 그로 인한 저 숙련 일자리 취업의 가능성이 높다.