도, 소매업 연간조사를 활용한 현행 방식은 세부적 업종의 특성을 제대로 반영하지 못하는 한계를 가지고 있다.
도․소매업 연간조사를 활용한 가중치 변동을 적용하는 방식에서 첫 번째 방식으로 현행 방식인 산업 연관표 부문분류 중 도소매 부문전체를 하나의 부가가치율(0.603)로 산출하는 것은 매출액 구성비로 산출하는 것과 같다. 즉, 도․소매업(G) 모든 세세분류부터 대분류에 이르기까지 똑같은 부가가치율을 적용하게 됨으로써 세부적인 업종 특성을제대로 살리지 못하는 한계점을 갖고 있다. 두 번째 방식은 연간조사의 세부업종별 매출액, 매출원가를 이용하여 부가가치율을 산출하여 산업 연관표 부문분류 체계의 부가가치율을 적용하는 대신 산업분류 체계의 부가가치율을 적용하는 방식이다. 세부적인 자료는 <부록 3> 도매 및 소매업(G) 2008년 세부업종별 부가가치와 가중치에 수록하였다.