또한 제5차 회담에서는 '한반도 비핵화 공동선언'를 합의하여 제6차 회담에서 정식 발효되었다. 제7차 회담에서는 '남북연락사무소 설치/운영에 관한 합의서' 발효와 남북화해공동위원회 구성/운영 등을 합의했다.
제5차 회담에서 남과 북은 한반도 핵문제를 협의하기 위한 대표접촉을 12월 안에 개최하기로 하는 등 3개 항의 공동발표문도 채택했다. 이 합의에 따라 남과 북은 1991년 12월 26일부터 31일까지 판문점에서 세 차례 대표접촉을 거쳐 '한반도 비핵화 공동선언'(부록3)에 합의하였고, 이를 채택(1992.1.20.)하였다. '남북기본합의서'와 '한반도 비핵화 공동선언'은 1992년 2월 19일 제6차 남북고위급회담에서 정식 발효되었다.
제7차 회담(1992.5.5~8., 서울)에서는 '남북연락사무소 설치/운영에 관한 합의서'와 '남북군사공동위원회 구성/운영에 관한 합의서', '남북 교류협력공동위원회 구성/운영에 관한 합의서'를 발효시키고, 남북화해공동위원회를 구성/운영하기로 합의했다.