미래창조과학부로부터 고유임무를 부여받고 적절성을 검토 받아야 하며 필요 시 정관의 개정도 검토되어야 한다. 임무수행 전략방향 및 유형의 적절성을 평가받고, 교통물류기술의 중점 추진 및 축소 사업을 선정하여 지속적으로 수행하며 정기적으로 점검받아야 한다.  R&D 전담기관을 출연 중 한 기관에 지정하는 대안은 정관변경 등 기본 요건의 충족이 어려울 것으로 판단된다.
따라서 한 가지 대안으로 국가교통물류기술 R&D 전담기관을 국가과학기술 연구회 산하에 구성하는 방안을 고려할 수 있다. 이 경우 국가교통물류기술 전담기관은 다음과 같은 기본적인 요건을 갖추고 있어야 한다. 즉, 국가교통물류기술 R&D 수행을 위해 미래창조과학부로부터 고유임무를 부여받고 그 유형에 대한 적절성을 검토 받아야 한다. 또한, 전담기관의 정관 상 설립목적에 따른 고유임무가 부정합할 경우 필요 시 정관의 개정도 검토되어야 한다. 고유임무 지정 후 전담기관의 임무수행 전략방향 및 유형의 적절성을 평가받고 연구개발사업 포트폴리오 및 관리방안에 대한 점검도 병행되어야 한다. 국가교통물류기술 R&D 전담기관에서는 교통물류기술의 중 장기계획 및 기술 로드맵에서 제시하는 사업 중 중점 추진 및 축소 사업을 선정하고 이에 대한 투자계획 변경과 성과지표의 보완을 지속적으로 수행하여 국가과학기술연구회를 통해 정기적으로 점검받아야 한다. 미래창조과학부가 국가과학기술연구회를 통해 과학기술 분야 별 고유임무를 지정하기 위해 각 출연(연)의 전담기관에 요구하고 있는 기본 요건은 위에서 명시한 것처럼 매우 구체적으로 제시하고있다. 따라서 국가교통물류기술 R&D 전담기관을 현 국가과학기술연구회 산하 출연(연) 중 한 기관에 지정하는 대안은 해당 출연(연)의 정관변경 등 기본 요건의 충족이 제도적으로나 현실적으로 어려울 것으로 판단된다.