미래성장동력 종합실천계획 사업일지라도 재정소요의 감소나 성과 부진 등의 이유로 예산이 감액될 수 있다. 그러나 경험지식기반체험형 가상훈련기술 개발이나 스마트바이오 생산시스템 개발 등 사업 초기 단계에서 예산이 감소한 경우도 있었다.
｢미래성장동력 종합실천계획｣의 사업일지라도 중기재정 계획이나 사업 추진단계에 따른 재정소요의 감소, 성과 부진 등의 이유로 예산이 감액 조정될 수 있다. 그러나 예산감소 사업 중에는 2015년에 착수하여 사업 초기 단계임에도 불구하고 예산이 감소한 경우도 있었다. 예를 들어 가상훈련시스템 분야의 ｢경험지식기반체험형 가상훈련기술 개발｣사업은 2015년 신규 사업이지만 2017년 예산안에 전년대비 5억원(13.2%) 감소한 33억원이 편성되었다. 또한 스마트바이오생산시스템 분야의 ｢스마트바이오 생산시스템 개발｣사업도 2015년 신규 사업임에도 불구하고, 2017년 예산안은 전년대비 1억 7,500만원(4.6%)감소한 36억 2,500만원이 편성된 것으로 나타났다. 양 사업은 2016년 예산안 편성 당시 중기재정 계획에 따른 2017년 예산을 각각 39억원으로 계획하고 있었다.