승하 직전 인조에게 잘못 침을 놓은 이형익을 ‘안율정죄’, 즉 사형시키자고 사헌부가 주장했다. 승정원은 사헌부의 건의와 국왕 명령의 전달 과정에서 임의로 '안율'을 빼버렸는데 '정죄'는 꼭 사형을 의미하지 않았다. 이처럼 승정원이 공정성을 잃으면 심각한 문제가 야기될 수 있었다.
왕명 출납에 오류가 있을 경우에는 사람을 살리기도 혹은 죽이기도 할 수 있었다. 1649년(효종 즉위년) 6월 사헌부와 승정원 사이에서 논란이 있었는데, 인조 승하 직전 치료를 담당했던 의관 이형익에 대한 처벌과 관련된 것이다. 인조 승하 직전 이형익이 인조에게 침을 놓았는데 혈을 잘못 짚어 문제가 되자, 사헌부에서는 이형익을 ‘안율정죄(按律定罪)’하자고 주장했는데, 다름 아닌 사형에 처하자는 것이었다. 그런데 승정원에서 사헌부의 건의와 국왕 명령을 전달하는 과정에 ‘안율’이라는 두 글자를 임의로 빼버림으로써 단지 ‘정죄’라는 표현만이 전달되었다. 정죄란 꼭 사형을 의미하는 것은 아니다. 결과적으로 효종에 의해 안율정죄로 다시 결정되기는 하였으나 이 과정에서 표현이 바뀌게 된 책임을 지고 해당 승지 정유성이 파직된 것이었다. 당시 사헌부에서는 승정원의처사로 인해 법을 집행하는 의리가 추락했다며 승정원을 신랄하게 공격하였는데, 죄인의 처벌 문제이지만 이는 형량의 경중과 관련되므로 승정원 역할의 중요성을 새삼 느끼게 한다. 이처럼 국왕의 목구멍인 승정원이 공정성을 잃게 되면 심각한 문제가 야기될 수 있었다.