농어촌지역은 별도의 기관 설치 운영과 지원으로 보육 수요가 있는 곳에 어린이집을 설치해 보육서비스를 제고한다. 2015년 보육사업에 3인이상 20인이하 시설로 운영비 100%가 지원된다.
농어촌 지역은 지역적 특성상 서비스 접근성을 보장하는 데 어려움이 있으므로 별도의 기관 설치 운영관리와 지원이 이루어진다. 농어촌 지역의 소규모 어린이집은 이용할 어린이집이 없으나 보육 수요가 존재하는 농어촌 지역에 어린이집을 설치하여 보육서비스 접근성을 제고하고자 한다. 2015년 보육사업안내에 의하면, 해당 시설은 농어촌 지역에 국가와 지방자치단체가 설치 운영하는 국공립어린이집 중 3인 이상 20인 이하를 보육하는 시설로정의된다. 동 기관에는 국비 70%와 지방비 30%의 시설비가 지원되며, 운영비가 100% 지원된다. 2015년 기준으로 설치비는 개소당 152백만원, 운영비는 개소당 최대 13,700천원이 지원된다.