협정에 의무준수 사항 있지만 볼은 협약을 위반했을 때 남아공이 자책만 할 것을 알고 있었다. SANBI-볼 협약은 법적 공방까지 갈 수 있으나 비용이 들기에 재정에 영향을 줄 수 있다. 볼과 SANBI의 관계자는 남아공에서 외부지역으로 반출된 물질을 검사하는 것이 어렵다고 토로한다. 이는 보다 큰 규모의 국제기귄 내에서 협의를 통해 해결해야 한다. 
협정에 의무준수 사항조항이 마련되어 있지만 볼은 협약 위반사항이 발생했을 경우 “자책”하는 것 이외에 남아공이 할 수 있는 일이 거의 없다는 사실을 인식하고 있다. 그럼에도 불구하고 SANBI-볼 협약은 법적 구속력이 있으며 필요하다면 법정공방까지 갈 수 있다. 하지만 이렇게 되면 비용이 많이 들기 때문에 SANBI와 같이 공공연구기관의 경우 재정에 심각한 영향을 줄 수 있다(M.Wolfson, SANBI, pers. comm., 2008). SANBI와 볼 모두 모니터링과 추적조사 또한 문제의 소지가 있다는 사실을 알고 있다. 볼의 최고 경영진은 “일단 종자가 외부로 반출되고 나면 의무준수와 관련해서 할 수 있는 것이 거의 전무하다”라고 밝힌다. SANBI의 한 관계자도 “협약에 참여한 우리 파트너들이 어느 정도는 도덕적으로 행동할 것이라고 믿어야 한다”라고 밝히며 남아공에서 외부지역으로 반출된 물질을 모니터링하는 것의 어려움을 토로한다(M.Wolfson, SANBI, pers. comm., 2008). 일부 국가들이 협약사항을 준수하고 신념을 바탕으로 행동을 하겠지만 그렇지 않은 국가들도 잇다. 이는 “생물자원은 반드시 자원제공국이 규정한 조건 하에서만 사용한다”는 등의 협약내용을 위반할 경우 국제레짐(International Regime), 세계무역기구(WTO: World Trade Organization), 또는 다른 국제기관 내에서 다자간의 협의를 통해 해결한다는 믿음에 힘을 실어준다.