왓슨의 결정내용과 맞지 않는 진단명과 치료법을 의료인이 환자에게 권하여 문제가 발생하였을 때 의료인의 과실이 인정되어야 하는가가 문제된다.
위와 반대로 왓슨을 사용하지 않거나 왓슨의 결정내용과 맞지 않는 진단명과 치료법을 의료인이 환자에게 적극 권하여 이에 따랐으나 환자의 건강이 악화되는 등의 결과가 나왔을 때 의료인의 과실이 인정되어야 하는지가 문제된다. 현재 왓슨은 미국의 증례를 기초로 하여 설계된 것이라 국내 환자와는 정확히 맞지 않는 면이 있고, 설치된 병원이 국내에 3군데에 불과한 정도이기에 환자들뿐만 아니라 의료인에게 있어서도 제한적인 접근만이 가능한 상태이나, 왓슨의 사용이 지금보다 훨씬 보편화되거나 환자들의 접근이 용이해졌을 때에 더욱 문제가 될 수 있다.