자유학기제 시행으로 능동적 수업으로 전환되었고, 진로체험의 포함으로 경험학습의 요소가 강화되었다. 지필 시험이 없어지면서 시행 초기 학력저하 우려가 있기도 했다.
자유학기제 시행에 따른 학교 교육과정의 가장 큰 변화를 하나 꼽는다면, 교사가 설명 하고 학생이 받아 적는 강의식 수업에서 학생이 참여하는 능동적 수업으로의 전환을 예로 들 수 있다. 자유학기제에서 운영되는 다양한 능동적 교육과정이 있지만, 이 중 진로교육 방법의 하나로 진로체험이 교육과정에 다수 포함되면서 가만히 앉아 듣던 학생들이 학교 밖으로 나가 사회를 몸소 체험하여 익히는 경험학습의 요소가 강화되었다. 또, 지필 시험을 보지 않고 자유롭게 성장하는 과정을 진단하는 방식으로 평가방법이 전환됨에 따라, 시행 초기에는 중학생의 학력 저하에 대한 우려가 공존하였다.