Top-down 예산제도의 장점으로 첫째 예산편성 및 심사단계에서 전체예산 편성기관과 개별부문 이해 부처간의 협의를 협조적 게임으로의 전환을 유도 할 수 있고, 둘째 각 단계별 권한 분권화의 장점을 극대화 하며, 셋째 의사결정의 책임소재가 분명해져 국가 전체 이익을 반영한 합리적 안을 도출하도록 유도할 수 있고, 넷째 행정부의 권한이 강할 경우 예산 편성에 대한 효과적 견제가 가능하다는 것이다.
이러한 Top-down 예산제도는 제도적 장점은 아래와 같다. 첫째, Top-down 예산제도는 예산편성 및 예산심사 단계에서 예산전체에 대한 책임이 있는 행위자(중앙예산기관 또는 예산위원회)와 개별 부문 및 프로그램에 이해관계가 있는 행위자(각 부처 및 상임위원회) 간의 상호작용의 게임을 비협조적 게임(non-cooperative game)에서 협조적 게임(cooperative game)으로 전환되는데 기여한다. 과거 Bottom-up 예산제도에서는 예산요구 행위자 또는 개별부문의 예산을 심사하는 행위자와 예산을 편성하거나 전체 예산안을 심사하고 조율하는 행위자 간에 정보의 비대칭성으로 인하여 과다 요구와 불충분한 심사와 일률적 삭감이라는 형태의 비협조적인 예산편성 및 심사가 지속되었다. Top-down 예산제도는 부분 예산편성의 지침 하에서 자율적으로 예산을 편성함으로써 두 행위자 간의 속임수가 현저하게 줄어들었다. 둘째, 전체 예산편성에 대한 책임은 집권화된 기구가 담당하지만 개별 부분에 대한 예산편성은 전문성 있는 관련자들이 수행함으로써 분권화와 전문화의 장점을 극대화할 수 있다. 셋째, 예산 총액을 결정하는 단계에서 이 결정을 내리는 의사결정의 책임소재가 분명하며 국가전체의 이익을 반영한 의사결정을 내리도록 통제하는 유인체계를 설정하는 것이 보다 용이하며 이에 따라 재정건전성과 거시적이고 장기적인 시계에서의 합리적인 의사결정을 내릴 수 있다는 장점이 있다. 이에 예산증가를 억제할 수 있고 궁극적으로 재정규율을 확보하는 도구로 활용할 수 있다. 넷째, Top-down예산심사 시 행정부의 예산편성에 대하여 효과적인 견제가 가능할 수 있다. 중앙예산기관의 역할이 강하고 예산과정에서 행정부의 권한이 강할 경우 의회 내에 이에 대해 대표성 있는 조직으로서 이를 심사, 통제할 기구의 역할이 긴요하다고 할 수 있다. 행정부의 중앙예산기관에 대한 통제를 위한 의회의 Top-down예산심사가 활용될 수 있다.