지역거점 준공영 전문대학은 성과나 계약을 통해 재정지원을 해야한다. 국가와 대학은 상호 합의하에 목표를 설정하고 이 목표가 달성되지 못할 경우 지원금의 일부 회수하는 등 조치한다. 목표 설정 시에는 국가에서 우선시하는 6개의 전략적 지표와 대학이 운영되는 지역 상황 등을 반영한다.
지역거점 준공영 전문대학에 대해서는 기본적으로 성과 협약이나 계약을 통해 재정지원이 이루어질 수 있도록 한다. 국가와 개별준공영 전문대학간에 국가와 해당 지역, 해당 전문대학의 필요에 가장 잘 부합하는 주요 성과 목표와 이러한 성과를 잘 보여줄 수 있는 간명한 성과 지표를 상호 협의와 합의하에 설정하도록 하고, 이 목표가 달성되지 못할 경우 지원금의 일부 회수 조치가 가능하도록 해서 성과 달성에 노력할 수 있도록 하는 기제를 확보할 필요가 있다. 전문대학별로 특정 미션에 맞춘 목표 설정이 필요한 것은 고등교육기관의 다양성을 확보하고 특성화가 가능하도록 유도하기 위해서이다. 또한 성과 지표를 간명하게 설정하도록 하는 것은 계약 준수를 평가하는 행정역량의 낭비를 최소화하고 관료적 절차를 회피하기 위함이다. 계약을 매년 새롭게 체결하기보다는 다년간의 계약이 가능하도록 함으로써 보다 장기적 관점에서의 의사결정과 투자가 가능하도록 하는 것도 바람직해 보인다. 참고로 스코틀랜드의 경우 14개 지역별로 매년 새롭게 갱신되는 3개년의 성과 협약(Outcome greements)을 통해 전문대학에 대한 재정지원이 이루어진다. 성과 협약 시에는 국가에서 우선시하는 6개의 전략적 지표(효율적 지역 구조 확보, 양질의 효율적 학습 보장, 고등교육에 대한 접근성 제고, 적정한 장소에서의 적정한 학습 보장, 숙련된 노동력 확보, 기관의 지속성 확보)가 고려되며, 전문대학이 운영되는 지역 상황 등도 반영된다.