2015년 기획재정부의 보조사업평가 운영방식이 전수조사로 바뀌어 업무부담이 예상되자, 보조사업별 평가위원을 1명으로 감축하고 평가 단위도 세부사업 기준으로 바꾸었다.       
기획재정부는 매년 3월경 보조금관리위원회를 개최하여 보조사업평가단 구성 등을 포함한 당해 연도의 보조사업 평가 운영방안을 확정하는데, 2012년부터 2014년까지는 전체 보조사업(세목 기준)의 1/3씩을 순차적으로 평가하면서 각 보조사업별로 2명의 평가위원을 두어 교차평가·합의하는 방식으로 운영하였으나 2015년에는 전체 보조사업을 대상으로 평가(2014년 422개 평가→2015년 1,422개 전수 평가)를 실시함에 따라 평가단의 규모가 커지고 평가위원별 담당 사업 수도 증가하는 등 평가업무 부담이 예상되자 각 보조사업별 평가위원을 1명으로 줄이고, 평가 단위도 세목 기준에서 세부사업 기준으로 변경하였다.