제2차 교육과정기는 체계적인 교과서 편찬을 위해 노력한 시기로 ‘교과용 도서 형식 사열 기준’과 ‘편수 자료 3’을 통해 교과서 본문 배열 ‘제호의 표시’로 바꾸었다. 제3차 교육과정기의 ‘집필상의 유의점’은 교과서 편찬 체제 형식이 됐다. 그 외에도 한자 학습에 따른 내적 체제의 변화 등이 있다.
제2차 교육과정기는 체계적인 교과서 편찬을 위해 본격적인 노력을 기울인 시기로 볼 수 있다. 이때에는 무엇보다도 편차10) 형식면에서 새로운 모색이 나타났다. 1956년의 ‘교과용 도서 형식 사열 기준’과 1960년의 ‘편수 자료 3’을 통해 ‘제호의 표시’라는 명칭으로 교과서 내용의 본문 배열을 “Ⅰ(로마 숫자) → 1(로만체 숫자) → (1) → 가 → ㄱ → (ㄱ) 또는 1(고딕 숫자) → 1(로만체 숫자) → A → a → (a)”로 배열하도록 하였다. 이 제호의 표시는 제3차 교육과정기에 약간 수정된 형태로 ‘집필상의 유의점’에 포함되어 제시되었다. 이후 이 ‘집필상의 유의점’은 이후 교과서 편찬 체제의 틀을 안내하는 형식이 되었을 뿐만 아니라 “국시에 관한 문제로부터 삽화의 안배에 이르기까지 내적 체제를 형성하는 모든 요소와 요건을 통제하는 문건”(이종국, 2008b: 245)으로 존재했다. 그 밖에 이 시기에 교과서 내적 체제 형성에 영향을 미친 요인으로 한자 학습에 따른 내적 체제의 변화, 사회과 인명, 지명 표기 통일, 학교교육 문법 통일, 국사 내용 통일 노력, 국민교육헌장 전문 게재 결정(1970년) 등을 들 수 있다.