국민은 기관이 데이터 제공을 거부 및 중단했을 시 분쟁 조정신청을 할 수 있으며, 분쟁 조정 위원회는 합의를 이끌거나 조정안을 내놓아야 한다. 이에 서명을 마친 조정서는 재판상 화해와 동일하게 간주된다.
분쟁대상은 ①기관에서 제공하지 않는 데이터에 대해 제공 신청을 했으나 기관이 제공을 거부한 경우, ②기관에서 특정 데이터 제공을 중단한 경우에 한한다. 국민은 기관의 공공데이터제공거부 및 제공 중단 처분이 있은 날부터 60일 이내에 분쟁 조정 위원회에 분쟁 조정신청을 할 수 있다. 조정신청을 받은 분쟁 조정 위원회는 당사자 간 협의를 통한 합의를 권고하거나, 분쟁 조정신청을 받은 날부터 30일 이내에 조정안을 제공한다. 당사자는 조정안 수령 후 15일 이내에 수락 여부를 알려야 하며, 알리지 않으면 조정을 거부한 것으로 간주한다. 당사자가 조정안을 수락한 경우 분쟁 조정 위원회는 조정서를 작성하고, 당사자가 서명함으로써 조정 완료함으로써 재판상 화해와 동일한 효력을 가진다.