운영학교와 더불어 정부 차원에서도 안정적 교원 확보 방안을 비롯한 다양한 지원 노력이 필요하다. 특히 대입전형에서의 불리함이 없는 실제적 방안을 마련해야 한다.
운영학교는 물론 정부 차원의 다양한 지원 노력이 요구되고 있다. 즉 개설 과목의 다양화와 수강 기회 확대를 위한 인적·물적지원 방안, 안정적 예산 운영 방안(단위학교 예산 운영권 확대 포함), 참여 학생의 이동에 따른 안전 및 생활지도 문제 대응 방안, 순환교사제 등 안정적 교원 확보 방안, 운영교 간의 학사 일정 조정 방안(학기 초 운영 학교 간 긴밀한 협의 과정 등) 등이 모색되어야 할 것이다. 특히 대학입시에서 학생의 교육과정 이수 현황을 전형요소로 반영하는 등 대입전형에 불리함이 없도록 실제적인 방안을 구체적으로 모색할 필요가 있다.