전자조달시스템의 시행 목적은 누구나 입찰사항을 알 수 있도록 정해진 곳에 전자공시함으로써 그간에 나타난 잘못된 관행을 바로잡고자 함이다.
2002년 7월 30일 「국가계약법 시행령」 제33조(입찰공고)에 공공입찰에서 획기적인 내용이 들어갔다. 모든 입찰공고는 반드시 전자조달시스템을 통해야 한다는 내용이다. 그동안 입찰공고는 신문이나 관보 공보를 원칙으로 했다. 이를 악용한 사례도 빈발했다. 일부만 보는 게시판에 입찰공고를 잠시 붙여 사진을 찍어 증빙자료를 만든 뒤 공고를 떼어내어 일부 특정업체에 입찰 내용을 은밀히 알려 주는 일이 잦았다. 사실상 특혜 계약이었다. 이런 잘못된 입찰 행태를 근절하기 위해 모든 입찰정보를 한 곳에서 전자적으로 모든 국민이 볼 수 있게 하는 것이 전자조달시스템 구축의 목표였다.