학습모듈은 특성화고와 전문대학에서 주로 활용되는데 대다수의 특성화고,전문대학 교원들은 실무 경험이 없으며 NCS 기반 교육과정은 다수의 교수자들에게 익숙하지 않은 방법이다.
각 교육기관과 훈련기관에서의 활용 현황을 종합했을 때 학습모듈은 특성화고와 전문대학에서 주로 활용되고 있는 것으로 파악된다. 그리고 교육·훈련기관에서 학습모듈을 활용하는 데에는 다음과 같은 어려움이 있는 것으로 예상된다. 특성화고 전문교과 교원과 전문대학 교수들 중 다수는 대학을 졸업하고 임용시험에 합격하거나 지식과 이론을 주로 탐구하여 산업현장의 실무 경험이 없다. 또한 NCS 기반 교육과정에서는 주어지는 교육과정을 활용하는 것이 아니라 학교와 기관의 목표에 따라 능력단위와 능력단위요소를 자율적으로 설계할 수 있도록 되어 있는데 이러한 방법은 다수의 교수자들에게 익숙하지 않은 전제이다.