K-MOOC의 효율적 운영을 위해 정부, 민간기업, 대학의 유기적 협력체제를 구축해야 한다. 미국 노스캐롤라이나주는 협력체제를 구축하여 주에 알맞은 MOOC에 대한 논의로 고등교육과 비즈니스를 연계하고, 좀 더 많은 사람들에게 고등교육을 제공하기 위해 노력한다.
우선 K-MOOC 운영의 효율화를 위해 정부, 민간기업, 대학의 유기적인 협력체제 구축이 요구된다. MOOC를 비판적인 관점에서 보는 이들은 이 사업이 지나치게 상업화 경향으로 흐르는 것을 경계해야 함을 지적하고 있다. 장차 MOOC 강의를 통해 인증된 실적이 기업에서 인재를 채용하기 위한 증빙 자료로 이용될 경우 대학교육의 무용론까지 연결될 우려가 있음을 지적하기도 한다. 그러나 이러한 문제는 대학과 정부 그리고 기업의 협력을 통하여, 무엇을 강좌로 제공할 것인가 그리고 어떠한 인재를 육성할 것인가 등에 대한 삼자의 심층 논의를 통하여 해결할 수 있는 문제이기도 하다. 미국 노스캐롤라이나주의 경우 주 고등교육위원회, 기업들, 주내 19개 대학 총장협의회 등이 협력체제를 구축하여 주에 적합한 MOOC가 무엇인지에 대하여 논의하고 있다. 이를 통하여 고등교육과 비즈니스의 연계를 도모하고, 보다 많은 사람들이 접근 가능한 고등 교육을 제공하기 위해 노력하고 있다.