전수 평가로의 전환 이후, 2008년부터 2013년까지 시행의 안정성과 표준화 및 평가 전반의 신뢰성과 타당성을 제고하기 위하여 평가 체제를 지속적으로 보완하여 왔다.
전수 평가로의 전환 이후, 시행의 안정성과 표준화 및 평가 전반의 신뢰성과 타당성을 제고하기 위하여 학업성취도 평가 연구에서는 평가 체제를 지속적으로 보완하여 왔다. 2008년과 2009년에는 시행의 안정화를 확보하고자 노력하였으며, 2010년과 2011년에는 평가 시기, 평가 시간, 고등학교 대상 학년, 평가 교과를 조정하였다. 이러한 학업성취도 평가의 변화는 시행 설계뿐 아니라 측정학적 설계의 변화를 수반하게 되었다. 2010년에는 학업 성취 추이 파악을 위한 기준 연도를 재설정하고, 동등화 방법 및 자료 수집 설계 등을 개선하였으며, 척도점수를 개선하여 점수 체제를 재정비하였다. 2011년부터 지속적으로 동등화 과정의 측정학적 개선을 위해 점수 산출 방법을 탐색하고 관련된 모의실험 연구를 진행하였다. 특히 2013년에는 최적의 동등화 오차 산출 알고리듬을 탐색하는 등 측정학적 신뢰성을 제고하기 위한 연구를 수행하였다. 또한 문항 반응 이론에 기반한 척도화 방법의 적용 및 기존 점수 체제와의 결과 비교를 통해 척도화 및 동등화의 측정 이론 간 일관성을 확보하고자 하였다.