그동안 법령해석심의위원회 운영은 충분한 토론을 거쳐 연령이 낮은 위원부터 의견표명을 하여 최종적으로 위원장이 의견을 제시하고 최종표결하는 방식으로 공정성을 확보해 왔다.
또한 법령해석심의위원회의 운영에서 있어 가장 중요한 것 중 하나가 회의에서의 자율적 토론의 보장과 결론 도출의 공정성이라 할 수 있다. 그동안의 위원회 운영과정을 보면 위원들에게 충분한 토론의 기회를 제공하고 있고 결론도출에 있어서도 공정하게 진행되어 왔다고 평가할 수 있다. 특히 표결에서의 의견표명은 통상적인 합의제 위원회에서와 같이 생년월일을 기준으로 하여 연령이 낮은 위원부터 각각 의견을 밝히도록 함과 동시에 지명위원인 법령해석정보국장이 일반 위원 중에서는 마지막으로 의견표명을 하고 위원장이 마지막 의견을 제시함으로써 표결결과를 확인하는 방식을 채택하고 있다.