CD공동망의 대고객수수료는 예전에는 전산위원회에서 참가기관이 책정했는데 '94년 5월부터는 금융기관이 결정한다. 현금인출은 금융결제원과 계좌개설은행의 승낙 절차에 따라 거래된다. 자금결제는 BOK-Wire를 통해 당좌예금계정에서 차액 결제된다. 
다. 수수료
  종전에는 CD공동망의 대고객수수료를 금융결제원 전산위원회에서 참가기관 공동으로 책정하였으나, '94년 5월부터는 은행공동망 이용서비스 수수료자율화조치에 따라 각 금융기관이 이를 자율적으로 책정하고 있다. 한편 현금인출 및 계좌이체업무에 있어서의 은행 간 수수료는 자율화이전의 수수료 배분비율에 따른 금액을 정액화하여 수수하고 있다.

라. 이용방법 및 자금결제
 현금인출의 경우 고객이 CD기의 화면지시에 따라 해당정보를 입력하면 이에 따른 거래전문이 처리센터인 금융결제원을 경유하여 계좌개설은행 앞으로 송신된다. 개설은행은 금융결제원으로부터 수신한 취급은행 지급요청내용의 정당성 여부를 검증한 후 금융결제원을 통하여 취급은행 앞으로 지급승낙 메시지를 통보하고 이에 따라 취급은행이 CD기를 통해 현금을 지급함으로써 거래가 완료된다.
 CD공동망 업무취급에 따른 은행 간 자금결제는 거래 익영업일 오전 11시 30분에 BOK-Wire를 통해 한국은행에 설치된 각행 당좌예금계정에서 차액 결제되며, 동 차액결제에 필요한 자료는 금융결제원이 일괄 작성하여 한국은행과 각 참가은행 앞으로 온라인 전송하고 있다. 한편 CD공동망 거래에 따른 취급은행과 개설은행간 자금수급상의 불균형을 보정하기 위하여 CD거래차액에 대해 자금조정을 실시하고 있다. 