정보공유시스템 구축을 위해 부처 간 협업은 필수다. 개별부처는 개인정보 보호, 상이한 이해관계 등의 이유로 정보 공유를 제한하는데 이런 상황에서 부처공유시스템 구축은 어렵기 때문이다.
정보공유시스템 구축은 부처 간 협력형 모델이 0.670로 매우 높게 나타났다. 다음으로 민관협력형 모델 0.243, 부처 조정형 모델 0.088순으로 나타났다. 정보공유시스템 구축은 가장 부처 간 협업이 요구된다. 개별부처는 개인정보 보호, 보안 등을 이유로 정보 공유를 제한하는 다양한 기제를 갖고 있다. 통상정책에 있어서도 부처별 이해관계가 다르다는 이유로 정보공유가 이뤄지지 못하고 있다. 이러한 상황에서 부처 공유시스템 구축은 매우 어렵다. 그러나 이를 강제하기도 쉽지 않다. 부처 이해관계의 충돌이 자칫 이해단체 간의 충돌로 이어져 더 큰 사회갈등을 야기할 수 있기 때문이다. 따라서 부처 간 서로 공유할 수 있는 시스템부터 구축하는 것이 필요하다.