외국인 사회통합프로그램 추진을 위한 지역협의체의 내실화방안 마련의 일환으로 행정자치부와 법무부 산하기관 간의 서로 다른 출입국 집행절차 및 예산안 처리를 통일하고 협조체계를 확보해야한다.
현재 실행단계에 있는 외국인 사회통합프로그램 추진체계의 분권화 절충형모델로의 전환과정에서 가장 현실적인 이슈는 지역협의체의 내실화방안의 마련이다. 지역협의체의 내실을 확보하기 위해서는 현재 출입국관리소와 지자체 및 경찰청과 관련 민간기관으로써 구성하기로 되어 있는 기본방향을 좀 더 구체화할 필요가 있다. 다시 말해, 입국 후 전국으로 흩어진 외국인들에 대해 빠짐없이 조기적응과 사회통합을 이끌어내기 위해서는, 지방자치단체 및 경찰청에 대한 직·간접적인 지배력을 갖는 행정자치부와 출입국관리사무소를 장악한 법무부 간에 서로 다른 집행절차 및 예산의 처리를 둘러싸고 발생할 수 있는 복잡한 업무관계를 원만하게 해소할 수 있는 견고한 협조체계를 어떻게 확보할 것인가를 고민하여야 하는 것이다.