국가환경종합계획은 환경보전계획에 대한 방향을 제시한다. 현재 정부는 제4차국가환경종합계획을 수립하였다. 기존 10년 계획이 20년으로 연장되었는데, 관련국가계획과의 연계 강화를 위해 변경된 것이다.
‘국가환경종합계획’은 「환경정책기본법」 제14조에 법적근거를 두는 환경분야의 범정부 최상위 계획으로 29개 환경법률에 따른 분야별 환경계획, 관계 중앙행정기관의 환경관련 정책, 시·도 환경보전계획 및 시·군·구 환경보전계획에 대한 기본원칙 및 방향을 제시하는 계획이다. 현재 정부는 자연과의 인간의 조화, 환경위험으로부터 자유로운 안전한 사회, 국격에 걸맞는 지속가능한 환경이라는 3가지 목표를 토대로 ‘제4차국가환경종합계획(2016-2035년)’을 수립하였다. 제4차 국가환경종합계획의 경우 기존에 10년으로 수립되던 계획기간이 20년으로 연장되었는데, 이는 국토종합계획 등 관련국가계획과의 연계 강화를 위한 목적으로 변경된 것이다. 이처럼 국가환경종합계획 및 하위 지자체의 환경보전계획은 관련 계획간의 연계와 조화를 강조하여 수립지침에도 하나의 항목으로 제시하고 있다.