클러스터를 선정하기 위해 후보 지역의 분석과 전략, 정책 등이 필요하다. 가결된 경우 2~5년의 기간에 걸쳐 시행되며 지속적인 모니터링과 평가가 필요하고, 관리업무가 이양되어야 한다.
클러스터 기획(CI)을 시작할지 여부(즉, 클러스터 선정)는 통상적으로 4개월 정도의 시간이 소요된다. 이 기간에는 클러스터 지도 작성, 후보지역의 경쟁력 분석과 벤치마킹, 정부관계자 및 학계와의 논의, 가장 관심을 보이는 지역에 대한 초기 진단, 전략과 정책 발표 등이 이루어진다. 이 과정을 거쳐 클러스터 기획(CI) 추진 여부를 결정한다. 추진이 부결된 경우 다른 지역을 검토하는 작업이 다시 시작되고, 가결될 경우 2-5년 정도의 기간에 걸쳐 클러스터 기획이 시행된다. 그 과정에서 모니터링과 평가는 지속적으로 이루어져야 하고, 사업 종료 이후에도 클러스터가 지속될 수 있도록 관리업무를 이양하는 작업이 이루어져야 한다.