청년내일채움공제사업은 신입직원에게 추가 급여가 지원되어 신입직원이 임금을 더 받는 형평성 문제가 나타났다. 그래서 근무하던 정규직을 퇴사시켜 다시 채용하는 편법도 나타났다.
청년내일채움공제사업에 참여한 기업들은 사업 참여를 하면서 채용한 청년 근로자에게는 사실상 월 40만 원의 추가 급여가 지원되는 거나 마찬가지인데, 이 경우 사업 혜택을 받지 못하는 기존 직원들보다 신입 직원이 임금을 더 많이 받는 문제가 발생해서 회사 인사관리에서 형평성이 문제가 되는 현상이 나타나고 있다고 말하고 있다. 그래서 일부 위탁 기관에서는 기존에 근무하던 정규직 청년을 퇴사시켰다가 다시 채용하는 방식으로 해서 청년내일채움공제에 가입시키라고 조언을 하는 경우도 있다고 한다. 그러면 자기들 실적을 올리는 데도 도움이 되니까 편법을 사용하는 사례가 나타나는 것이다.