2015년 환경부 소관 예산수입 및 기금수입은 작년보다 약 4% 증가하였다. 자체수입이 전년보다 감소했음에도 불구하고 총 수입이 증가한 것은 전입금 및 여유자금 회수가 증가했기 때문이다.
2015년 환경부 소관 예산수입 및 기금수입의 총계는 60,661억 원으로 2014년 (본예산) 수입 58,189억 원 보다 4.3% 증가하였다. 자체수입이 2015년 21,175억 원으로 2014년 자체수입 22,175억 원보다 4.5% 감소하였음에도 불구하고 환경부 총 수입(=환경부 소관 예산수입+기금수입)이 이와 같이 증가한 것은 전입금 (4,966억 원) 및 여유자금회수(274억 원)가 증가했기 때문이다. 자체수입에서 각종 부담금 수입이 차지하는 비중은 82.8%로 작년(82.4%)보다 다소 증가하였다. 그러나 자체수입은 총수입의 34.9%만을 충당하고 있으며, 나머지 지출은 일반회계로부터의 전입금으로 충당하고 있다.