1998년 조사물량 배분 기준은 없었고 제2004-8호에서 물량배분 기준으로 축차적 할당을 함을 정했는데 제2007-11호는 가격을 제2008-7호에서는 가격 제외를, 제2008-20호에는 품질점수와 전년도 실적을, 제2014-7호는 기관별 가중치를 기준으로 정해 10년간 잦은 변동으로 조사물량의 예상이 어려워졌다.
1998년 제정된 “선행기술조사기관 지정에 관한 운영 요령”에는 조사물량의 배분 기준은 존재하지 않았고, 2004년의 특허청 고시 제2004-8호에서 물량배분 기준으로, 품질과 사업추진의 안정성을 기초로 이른바 ‘축차적’ 할당을 함을 최초로 규정되었는데, 그후 2007년의 제2007-11호에서는 ‘가격’을 평가에 고려함을 명시하였고, 2008년의 제2008-7호에서는 ‘가격요소’를 다시 배제하는 방식으로 평가하고, 2008년 제2008-20호에서는 ‘품질점수’와 ‘전년도 실적’을 물량배분의 기준으로 삼고, 2009년-2013년의 개정시에는 물량배분의 기준에는 변동이 없다가, 2014년의 제 2014-7호에서는, 기관별 조사물량은 각 기관별로 ‘(전년도)품질평가점수’와 ‘(당해년도)조사 가능물량’에 의하여 구해지는 ‘기관별 가중치(기관별 배분비율)’에 따라서 특허청에서 발주되는 전체 조사물량을 배분받는 것으로 개정되어, 결국 10여년 동안에 4회의 개정이 있어 조사물량 배분 기준이 지나치게 변동이 되어 조사물량의 예상이 매우 곤란하게 되는 우려가 있고, 특히 20%의 물량에 대해서는 전체 사업의 효율성 및 타당성을 고려하여 별도 배분할 수 있다(고시 제24조 제8항)고 규정하여 선행기술조사기관에서의 향후 조사물량의 예상이 극히 곤란하게 될 것으로 예상됨