성별영향평가제도는 실질적인 성평등의 실현, 효율적인 정책추진체계 확립, 국민의 정책만족도 제고의 목적을 가졌는데, 이것을 아동청소년 정책의 수립과 시행에도 적용해야 한다.
성별영향평가제도는 다음과 같은 세 가지 목적을 가지고 있다. 그것은 첫째, 정부가 추진하는 다양한 정책이 성별에 미치는 영향을 분석․평가하여 실질적인 성평등을 실현하려는 것, 둘째, 정부정책의 성차별적 원인을 분석․평가하여 합리적으로 개선함으로써 효율적인 정책추진체계를 확립하려는 것, 셋째, 정책수요자의 성별 특성에 근거한 정책을 시행함으로써 국민의 정책만족도를 제고하려는 것 등이다. 따라서 여성가족부가 아동․청소년 영향평가제도를 도입․시행함으로써 성별영향평가제도가 목적 하는 그 내용을 아동․청소년 정책의 수립과 시행에도 적용하여 똑같은 소기의 목적을 달성할 수 있게 될 것이다.