WTO 판정이 효과적으로 이행되지 않는 것은 제도적, 구조적 문제이다. 이 사실은 우리나라가 WTO 분쟁에 대처해 나갈 때 유의해야 할 부분이다.
지금까지 WTO 분쟁패소국의 불이행요인과 이를 개선할 제안들을 이론적, 제도적, 실무적인 측면에서 살펴보았다. 효율적 계약위반 이론에 따르면, 현행 DSU의 제도적 흠결은 회원국들의 위반을 유도하고, 이러한 위반과정을 통하여 동 협정은 보다 효율적인 방향으로 발전한다. 그러나 분쟁해결절차의 제도적 흠결을 개선할 DSU 개정협상이 난항을 겪으면서 현 상태로는 효율적 계약위반 이론이 적절히 적용되지 못하는 것으로 보인다. 특히, 보복과 평판 이론에 기초하여 효과적 이행을 제고하려는 개도국들의 집단보복, 교차보복, 행정 제재 등의 제안은 DSU 개정협상에서 선진국들과의 갈등만 증폭시킴으로써 WTO 판정의 효과적 이행을 위한 협정 개정 노력은 답보상태를 면치 못하고 있다. 이처럼 WTO 판정의 효과적 이행이 구조적인 흠결로 인하여 제대로 작동하고 있지 못하다는 사실은 WTO 회원국으로서, 그리고 분쟁해결절차의 주요 일원으로서 우리나라가 향후 WTO 분쟁에 대응해 나가는 데 있어 시사하는 바가 적지 않다.