의원입법안은 사전에 담당부처와 관계 기관간의 의견협의 절차가 없습니다. 의원입법안이 제출되면 담당부처와 관계 기관에 그 사실을 알리고, 법적인 문제가 있는 경우에는 법제처의 의견도 담당부처에 제시해주고 있습니다.
이러한 의원입법안은 정부입법안처럼 사전에 담당부처와 관계 기관간의 의견협의 절차가 없습니다. 정부의 입장에서는 예산이 지나치게 많이 필요한 법률이나 관계 기관의 이익에 반하는 내용이 있는 의원입법안이 제출된 경우에는 국회심의 과정에서 정부의 의견을 제출해서 사전에 내용을 조정하는 과정이 필요합니다. 법제처는 의원입법안에 대한 정부의 의견 제시 등 이러한 과정이 잘 이루어지도록 도와주는 일을 합니다. 의원입법안이 제출되면 담당부처와 관계 기관에 그 사실을 알리고, 법적인 문제가 있는 경우에는 법제처의 의견도 담당부처에 제시해주고 있습니다. 또한, 의원입법안에 대해 담당부처와 관계 기관 간에 의견이 통일되지 않고 다툼이 생긴다면 법제처에서는 다툼을 조정하기 위해 ‘정부입법정책협의회’를 열어서 의견 조정을 하기도 합니다.