특성화고와 마이스터교는 직업전문교육기관이라는 공통정이 있고 재학생의 구성, 교장임용, 학생선발등 운영은 다르다. 마이스터고는 취업과 적성을 고려하여 진학한 반면 특성화고는 대학진학과 성적을 우선 순위에 두었다. 이런 특성을 생각한 진로교육이 필요하다.
일반계 고등학교가 대학진학과 밀접한 연관을 갖는 것에 비해 두 유형의 학교는 우리나라 고등학교 단계의 직업교육기관의 두 축을 담당한다는 점에서 공통점이 있다. 따라서 두 학교 유형에서 진행되는 취업 및 진로 관련 교육 활동은 학교의 교육목적을 비추어 보았을 때, 그 의미가 상당히 크다. 그러나 특성화고와 마이스터고는 학교 운영상의 특징이나 학교의 인적 구성 등에서 차이가 있다. 두 학교 유형 모두 직업전문교육기관이라는 공통점을 갖지만, 재학생의 인적 구성, 교장임용, 학생선발, 교육과정 등의 학교 운영상의 특성 역시 상이한 것으로 나타나고 있다(배상훈, 2012). 또한 맹희주(2014)의 연구에서는 마이스터고에 재학 중인 학생들은 취업이나 적성을 우선적으로 고려하여 마이스터고에 진학한 것에 비해, 특성화고에 재학 중인 학생들은 대학진학, 성적을 우선적으로 고려하는 것으로 나타났다. 이처럼 두 학교 유형의 인적 구성과 학교 특성은 서로 상이하기 때문에 이러한 특성을 반영한 진로교육활동이 면밀하게 수립되어야 함을 추론해 볼 수 있다.