본 제도는 환급 절차 및 예측에 불편한 점이 있어 정유사들은 수입부과금 환급을 예상해 혜택을 먼저 가져갈 가능성이 크다.
정유사들이 합리적인 최적화 행위자(rational optimizer)로 행동한다면, 법인세 세액 공제보다는 수입부과금 환급을 먼저 예상하여 혜택을 가져간 뒤, 본 제도의 혜택인 세액공제를 사후적이고 보완적으로 가져갈 가능성이 크다. 석유제품 수입부과금 환급은 혜택 규모가 확실하고,  예측이 가능하며, 환급절차가 상대적으로 신속하다. 그에 비해서 본 제도를 통해 얻을 수 있는 혜택의 규모는 국내외 영업 조건 변화에 따른 정유사 대리점 주유소의 영업이익 규모에 의존하기 때문에 혜택에 대한 예측이 사전적으로 어렵고,  법인세 세무 행정 절차에 따라 혜택을 받는데 상당한 시차가 발생한다.