일학습병행제에 참여하는 중소기업은 교육프로그램 추가개발에 어려움을 느낀다. 특히 공동훈련센터형 기업들에게는 적극적인 지원이 요구되며 이는 개별 회사보다는 업종별 프로그램 개발이 필요함을 보여준다.
둘째, 사업체에서 가장 애로 사항으로 느끼는 것은 교육 프로그램을 추가 적으로 개발하는 것이었다. 현재 일학습병행제에 참여하는 사업체들이 중소기업이며, 100인 이하 업체의 비중이 크기 때문에 중소기업이 가지는 어려움이 클 수 있다. 특히 공동훈련센터형의 기업들은 현업의 수행과 더불어 근로자들을 위한 교육 프로그램의 개발에 부담을 가질 수 있다. 자체적으로 교육 프로그램 개발이 어렵기 때문에 SC의 주도적인 참여나 정부의 지원과 같은 적극적인 지원이 요구된다. 이는 사업체가 필요한 인력을 직접 훈련시킨다는 사업의 취지는 좋으나 해당하는 직무의 몇 명의 근로자를 위하여 별도의 교육 훈련 프로그램 개발보다는 유사업종 및 직종의 공동 프로그램 개발 및 보급이 필요함을 보여주는 결과이다.