셋째, VAT 효율적 징수방안으로 용역의 수입부분 문제이다. B2B거래에 있어 등록방식 및 정보처리기술 방식을 현실적 징수방법으로 판단했지만, 우리나라는 거래유형 구분 없이 전부 대리납부방법에 의해 과세하여 징수방법을 달리 규정하지 않았다.
셋째, VAT의 효율적 징수방안 문제이다. 전자상거래 관련 VAT 징수에 대해 문제가 되는 부분은 용역의 수입부분이다. OECD 조세위원회의 징수방법 검토에 따르면, B2B거래에 있어서는 대리납부방식, B2C거래에는 등록방식 및 정보처리기술에 기초한 방식이 현실적인 징수방법이라고 판단하였다. 등록방식이란 거래가 행해지는 각국의 사업자들에게 등록을 실시하도록 하는 방식이다. 우리나라의 경우에는 수입되는 거래유형에 따라 C2B거래, B2B거래와 C2C거래, B2C거래로 구분하여 징수방법을 달리 규정하고 있지 아니하다. 즉 거래유형에 따른 구분 없이 모두 대리납부방법에 의해 외국법인 또는 비거주자의 용역에 대한 소비지국 과세를 실현해왔다. 이는 그동안 B2C거래의 비중이 크지 아니하였기 때문으로 판단되며, 전부 대리납부방식의 테두리에서 과세하였기 보다는 이 부분에 대한 과세는 포기하여 왔다고 판단된다.