한국여성정책연구원이 성인이지예산제도를 운영을 위해 노력함에도 불구하고 제도 개선이 이뤄지지 않는 까닭은 제도에 대한 중장기 계획이 부재하기 때문이다. 성인지예산제도가 사회와 국가재정제도로 정착하기 위해 구체적인 실행방안이 모색되어야 한다.
제도 개선을 위해 매년 한국여성정책연구원 등의 주최로 ‘성인지예산포럼’을 운영하고 관계자들의 의견을 수렴하기 위해 노력하고 있음에도 불구하고 제도 개선으로 이행되지 않는 것은 단순히 지지와 이해도의 문제로만 분석할 수는 없을 것이다. 조선주 외(2012;49-84)의 연구에 따르면 제도에 대한 중장기 계획이 존재하지 않는 것이 가장 큰 문제점인 것으로 지적되었다. 특히, 성인지예산제도가 실행된지 6년째 접어들고 있으나 성인지예산제도 운영을 위한 중장기 계획에 대한 연구는 2010년 여성가족부의 연구용역이 유일하다고 할 수 있다. 또한 2011년 「성별영향분석평가법」이 제정되었고, 2014년에는 「여성발전기본법」이 10여년의 논의 끝에 「양성평등기본법」의 제정으로 전면 개편되는 등 정책 환경이 변화하고 있다. 이러한 맥락에서 성인지예산제도가 사회에 광범위하게 수용되고 성 주류화 조치의 강력한 수단으로 고유의 가치를 정립하고 동시에 국가재정제도로서 정착하기 위해서는 앞으로 나아갈 방향과 이를 위한 세분화되고 구체적인 실행방안을 모색해야 할 것이다.