고용 기간 2년이 지나면 무기 계약으로 전환될 수 있지만  “정부의 복지정책․실업대책 등에 따라 일자리를 제공하는 경우”는 제외하는 예외조항 때문에 공공 근로자들이 공공 근로자들은 법적인 구제를 받지 못하는 사례가 나오고 있다.
첫째, 고용기간이 2년을 초과할 경우 무기계약으로 전환되는 기간제 근로 보호조치에는 예외조치가 존재한다. 기간제법은 2년을 초과하여 기간제 근로자를 사용할 수 있는 적용제외 영역을 설정하고 있는데(법 제4조제1항), 이 중 “정부의 복지정책․실업대책 등에 따라 일자리를 제공하는 경우”가 포함되어 있다(법 제4조제1항제5호). 정부가 모범 사용자로서 질 좋은 일자리를 제공하는 주체가 되기보다 비정규직을 양산하는 주체가 될 수 있다. 실제로 계약기간을 1년으로 설정하여 매년 기간제 재계약으로 근로하던 공공도서관의 근로자가 3년 후 근로계약 해지 통보를 받은 경우 위 예외조항을 근거로 소송에서 패소하거나, 공공부문 비정규직 종합대책에서 무기계약직 전환의 예외로 규정된 영어회화 전문강사는 헌법소원의 본안심사조차 가지 못하는 사례4)들이 현실의 곳곳에서 발생한다.