현행 대체복무는 보수와 경력 여부 등에서 현역복무와 전환복무와는 차이가 있다. 양심적 병역거부 대체복무는 전환복무와 유사하지만 군사교육훈련을 거부하기 때문에 복무 기간으로 형평성을 맞추는 새로운 제도가 필요하다.
현행 대체복무는 대체로 출퇴근 근무를 한다는 점, 민간인 신분으로서 채용조건에 따른 보수를 받는다는 점, 취업활동이어서 경력단절이 없다는 점, 취업이 아니더라도 전문자격을 활용하여 경력을 쌓는다는 점 등이 현역복무 또는 전환복무와 차이가 있다. 이상을 종합해 보면 양심적 병역거부 대체복무는 전환복무와 가장 유사하고, 다만 군사교육훈련을 거부한다는 점에서 차이가 있다고 볼 수 있다. 따라서 양심적 병역거부 대체복무제도는 기존의 전환복무를 포함한 대체복무와는 다른 새로운 성격의 제도를 설계할 필요가 있다. 군사교육훈련 등 전투훈련과의 형평성은 대체복무의 난이도가 아니라 복무기간으로 맞추면 될 것이다. 예컨대 정부법률안의 교정시설 복무의 난이도를 군사훈련을 포함하는 현역복무의 난이도와 비교하여 평가하는 것은 쉽지 않다.