둘째, 등기특별회계의 평가기준 설계 시 고려해야 할 점은 개별사업과 특별회계의 존치여부를 구분하는 것이다. 이에 본 이 연구에서는 개별사업과 특별회계의 평가를 각각 구분하여 접근한다.
둘째, 등기특별회계에 대한 평가기준을 설계하면서 고려하여야 하는 것 중에 하나는 개별사업에 대한 존치여부 판단과 특별회계 자체에 대한 존치여부 판단으로 구분하여야 한다는 것이다. 즉, 특별회계에 대한 존치가 결정되었다고 하더라도 특별회계로 추진하는 사업 중에는 폐지되어야 하는 사업이 존재할 수 있다는 것이다. 이러한 점을 고려하여 이 연구에서는 특별회계로 추진하는 개별사업에 대한 평가와 특별회계 자체에 대한 평가로 구분하여 접근한다. 개별사업에 대한 평가는 개별사업에 대한 평가를 통하여 그 존치여부를 판단하는 것이고, 특별회계 자체에 대한 존치여부에 대한 평가는 등기특별회계 자체에 대한 존치여부를 판단하는 것이다.