동 법률은 <공익신고자 보호법안>과 <공익제보자 보호에 관한 법률안>을 통합 조정한 것이며, 입법 목적은 공익침해 행위 신고자를 보호하여 국민 생활의 안정과 깨끗한 사회풍토 확립을 위함이다.
이러한 입법목적은 동 법률안의 제안목적을 보면 더욱 더 상세히 알 수 있다. 동법은 2009년 10월 29일 정부가 제출한 ｢공익신고자 보호법안｣과 2009년 12월 1일 우윤근 의원이 대표발의한 ｢공익제보자 보호에 관한 법률안｣의 내용을 통합･조정하여 ‘정무위원회 대안’으로 마련된 것이다. 정부가 제출한(2009.10) 공익신고자 보호법안 제안이유에는 “국민의 건강과 안전 및 환경 등을 침해하는 행위로 막대한 사회적 손실이 발생하고 있는 점을 감안하여 공익침해행위를 신고하는 자 등을 보호함으로써 국민 생활의 안정과 깨끗한 사회풍토의 확립”이라고 되어있고, 우윤근 의원이 대표발의한(2009.12.1.) 공익제보자 보호에 관한 법률안 제안이유에는 “근로자의 인권 및 환경과 소비자권리 등 시민적 자각을 바탕으로 기업에 대한 내부고발의 필요성이 현실적으로 논의되고 있는 실정…”이라고 되어 있다.