1990년대 중반 이후 NPO가 본격적인 활동을 시작했다. 지자체와 국제교류협회에서는 출산과 육아, 가정 내 커뮤니케이션, 교육 등의 문제를 NPO와 연계하여 해결하며 이러한 NPO와의 제휴는 더욱 늘어날 것이다.
NPO가 본격적인 활동을 시작한 것은 1990년대 중반 이후이다. 다문화공생 센터 또는 한신 대지진을 계기로 발족한 NPO와, 일본계 남미인이 집중 거주하는 동해 지방을 중심으로 하여 모국어 교육 등 외국인 아동·학생의 지원을 실시하는 비영리단체가 등장하였다. 단신으로 일본에 취업하거나 배우자로서의 생활을 시작했을 때 발생하지 않았던 문제가 시간이 지남에 따라 증가된다. 출산과 육아, 가정 내에서의 커뮤니케이션, 어린이의 교육 문제 등이 불거졌다. 지자체와 국제교류협회에서는 이러한 분야의 NPO와 연계하여 문제 해결을 도모하려는 움직임이 생겼다. 예를 들어 아이치현은 「다문화공생 파일럿사업」으로서 외국인 주민 지원을 위한 시책을 NPO에서 모집하여 현의 사업으로서 위탁 사업 공모 형시책을 실시하고 있다. 공익 법인 개혁과 행정개혁, 재정 개혁의 흐름에서 이러한 NPO와의 제휴에 의한 사업 전개는 향후 더욱 늘어날 것으로 예상된다.