군남홍수조절지는 임진강 홍수조절능력 확보·불규칙한 물흐름 개선의 효과가 있는데 임진강 자연환경의 영향과 남북한 접경지역의 지리적 요건으로 각종 동식물이 서식한다. 
휴전선에서 불과 6㎞ 떨어진 접경지역에 위치한 군남홍수조절지는 댐 유역의 97%가 북한땅으로, 임진강 본류의 홍수조절능력 확보 및 북측 황강댐에 의한 불규칙한 물흐름을 개선하는 효과가 있다. 이 지역은 우리나라 대표적인 겨울철새인 두루미(천연기념물 202호), 재두루미(천연기념물 203호), 흑두루미(천연기념물 28호)가 매년 겨울 최대 20마리 이상 월동하는 대표적인 곳으로, 남북한 접경지역이라는 지리적 여건과 임진강 자연환경이 만들어 낸 특수성으로 인해 수달, 고라니, 두루미, 어름치 등 각종 동식물이 서식하는 천혜의 자연생태지역이다.