현재 시행중인 사회통합 프로그램 중 외국인만을 대상으로 하는 프로그램은 외국인 사회통합기금 사업에 적합하다. 그러나 내국인이 포함된 다문화가족지원사업은 논란의 여지가 있으며, 수익자부담원칙을 적용하면 외국인을 대상으로 하는 사업에 한정해야 한다.
그러나 현재 우리나라에서 실시하고 있는 사회통합 프로그램은 외국인과 내국인 모두를 대상으로 실시하는 프로그램도 있고 외국인만을 대상으로 실시하는 프로그램도 있다. 외국인만을 대상으로 실시하는 프로그램의 경우 신설을 추진 중에 있는 외국인 사회통합기금 사업으로 적합하다고 볼 수 있다. 그러나 내국인이 포함된 사회통합프로그램의 경우 외국인 사회통합기금 사업에 포함되는가에 대해서는 논란이 있을 수 있다. 아마도 여성가족부에서 추진하고 있는 다문화가족지원사업의 일정부분이 여기에 해당될 것이다. 여성가족부에서 추진하는 사업의 경우 결혼이주여성과 가족이 동시에 교육을 받는 프로그램도 있다. 외국인 사회통합기금의 경우 수익자부담원칙을 천명하였기 때문에 이 원칙을 엄격하게 적용하면 여성가족부의 다문화가족지원사업처럼 외국인과 내국인을 대상으로 하는 프로그램에 기금이 지출되기 어려울 수 있다. 수익자부담원칙을 엄격하게 적용하면 외국인 사회통합기금 사업은 외국인을 대상으로 하는 사업에 한정하는 것을 원칙으로 하여야 한다.