선박법에 따라 등록된 레저선박은 지방항만청에서, 수상레저안전법상 등록된 레저선박은 지자체에서 관리한다. 이에 전체 레저선박의 실태를 파악하기 어려우므로 종합시스템을 만들어야 한다. 이는 등록 기능뿐 아니라 정보를 제공하는 기능도 해야 한다.
국내 레저선박 중 선박법에 따라 등록한 레저선박은 지방항만청에서 관리하며 수상레저안전법상 수상레저기구로 등록한 레저선박은 지자체에서 관리한다. 한편 이들 선박에 대한 검사, 등록은 각각 다른 기관에서 담당하고 있으며, 선박의 등록과 말소 또한 각각 다른 정보망을 통해 관리되고 있어 전체 레저선박의 실태를 파악하는 것은 구조적으로 매우 복잡하다. 이와 같은 복잡한 시스템을 레저선박 활동자가 쉽게 이용할 수 있도록 레저선박의 등록과 검사를 기록하는 종합시스템의 마련이 필요하다. 한편, 이러한 종합시스템은 단순히 등록 기능만을 가지는 것에서 나아가 이용자에게 레저선박의 등록과 관련된 모든 정보를 제공해주는 기능을 함께 구축하는 것이 필요하다. 일례로 해양레저 선진국인 호주의 레저선박 등록안내 시스템은 이용자가 자신의 보트형태와 크기를 선택하면 등록비용과 등록절차, 보험 가입 과정까지 안내하고 있다.