 2000년 KIEP와 아지껜은 한/일 FTA체결시 한/일간 기술격차가 축소될 것으로 가정하였다. 시뮬레이션한 결과, 한국경제는 동태적 이익을 기대할 것으로 전망하였으나 FTA체결로 외국인투자, 추가 유입규모 등 구체적 근거를 제시하지 못했다. 이 연구들은 한/일간 FTA의 경제적 효과를 단순히 관세철폐 뿐만아니라 동태적 측면에서 고려할 것을 새로이 조명하였다. 
 한/일 FTA와 관련하여, 일본기업의 대한국 투자 여부, 한국산업의 기반 약화, 대일본 무역수지 악화, 일본의 비관세장벽 완화 가능성, 대일본 의존도 심화 등 많은 이슈들이 제기되었다.
 2000년에 발표된 KIEP와 아지껜의 연구에서는 양국간 FTA체결시 한국과 일본간 기술격차가 축소될 것으로 가정하였고, 이를 시뮬레이션에 반영하여 추정한 결과, 한국경제는 무역자유화의 손실을 능가하는 동태적 이익을 기대할 수 있을 것으로 전망되었다. 특히 일본 연구진은 경쟁촉진효과 및 외국인직접투자 유입 등으로 한국의 제조업 생산성이 업종에 따라 최고 30% 증가하는 것으로 가정하였고, KIEP 연구진은 외국인직접투자가 추가로 유입되는 규모를 연간 25-35억 달러로 추정하였다. 여기서 문제는 양국 연구진은 FTA체결로 외국인투자가 어느 부문에 과연 얼마만큼 추가로 유입될 것인가에 대해서는 구체적으로 근거를 제시하지 못했다. 그럼에도 불구하고, 이들 연구들은 한/일간 FTA의 경제적 효과를 단순히 관세철폐 면에서만 볼 것이 아니라 투자유입, 규모의 경제 등 동태적 요인 측면에서 고려되어야 한다는 점을 새롭게 조명하였다. FTA는 영업환경을 개선하고 역내시장이 확대됨으로써 외국인직접투자를 유인하는 효과가 있다. 다만 투자 그 자체가 다른 여러 통상환경과 경제변수에 의해 결정되기 때문에 그 크기를 사전적으로 추정하는 것은 용이하지 않다.