합리적인 자율평가 제도가 시행되기 위해서는 지방자치단체와 민간보조사업자가 협력하여 합리적인 성과관리가 시행되어야 한다고 주장하였다.
박주형 외(2017)은 지방자치단체의 재정사업 자율평가가 미치는 영향을 분석하기 위해 경상북도 재정사업 자율평가 결과를 바탕으로 실증분석을 실시하였다. 그 결과 다수 사업들의 평가등급은 보통 등급의 수준으로 나타났으며 성과계획의 미수립, 합리적이지 않은 목표 설정 등의 비중이 크게 나타나 성과관리의 질은 미흡한 수준으로 나타났다. 또한 성과 지표 설정, 사업평가, 환류 관련 요인 등은 성과평가에 통계적으로 유의미한 영향을 미치고 있으나 비평가 요인은 통계적으로 유의미하지 않은 결과가 나타났다. 해당 연구에서는 경상북도의 경우 자율평가 제도의 도입 기간은 1년 미만으로 성과관리의 체계가 미흡한 상태이며 자율평가 제도는 지방자치단체의 특성을 반영한 평가 제도의 수정이 필요함을 언급하였다. 또한 합리적인 자율평가 제도가 시행되기 위해서는 지방자치단체와 민간보조사업자가 협력하여 합리적인 성과관리가 시행되어야 한다고 주장하였다.