규제개혁에서 포지티브의 네거티브화는 규제내용의 변화만으로 완결성을 갖는 것이 아니다. 이에 따른 부작용이 발생할 수 있는데 이는 다양한 사회문제로 야기되므로 이를 신중히 고려해야 한다.
여기에 네거티브 규제체계에서 중요한 것은 규제개혁에서 포지티브의 네거티브화라는 것이 단순히 규제내용의 변화만으로 완결성을 갖는 것이 아니라는 점이다. 과거 포지티브의 규제로 사전에 특정한 행위만을 가능하게 한 것은 그 발생확률과는 무관하게 그 외의 행위를 인정할 경우 발생할 수 있는 부작용이 기대되기 때문이다. 그리고 이런 부작용은 발생할 경우 매우 심각한 사회적 문제를 야기할 수도 있다. 안전에 대한 우려, 사회적 위해의 발생, 환경문제의 대비 등이 그것이다. 따라서 이런 포지티브 방식의 네거티브 규제체계로 전환하기 위해서는 이런 부작용에 어떻게 대응할 것인지가 고려되어야 한다. 앞서 포지티브 규제를 네거티브 규제체계로 전환하기 위해서는 그것이 작동되기 위한 거버넌스 설계도 필요하다고 주장한 것은 이런 이유 때문이다.