국가물류정책위원회의 핵심은 정책거버넌스의 특징을 보이고 있으며 위원장은 국토교통부장관으로 공무원과 전문가를 중심으로 위원을 뽑는다. 그 외 위원장이 전문가 10명 이내 위원을 위촉해 구성한다.
국가물류정책위원회의 조직 구성과 운영은 정책거버넌스의 전형적인 특징을 나타내고 있다. 국가물류정책위원회의 위원장은 국토교통부장관이 되고, 이 밖에 관계부처의 공무원, 물류부문 전문가 등을 중심으로 22인 이내의 위원을 포함하여 위원회를 구성함으로써 주무부처-연관부처-민간으로연결되어 협력하는 구조다. 위원의 구성을 상세히 살펴보면, 기획재정부, 교육부, 미래창조과학부, 외교부, 농림축산식품부, 산업통상자원부, 고용노동부, 국토교통부, 해양수산부의 9개 중앙부처와 국가정보원, 관세청, 중소기업청의 3개 중앙정부기관의 고위공무원단에 속하는 공무원(부처별 1인)으로 전체 12인의 위원을 위촉하게 된다. 이들은 각 기관의 장의 지명에 의해 위촉된다. 그리고 이 밖에 물류관련 분야에 관한 전문지식과 경험이 풍부한 전문가 중에 위원장인 국토교통부장관이 10명 이내로 위원을 위촉하여 전체 위원회를 구성한다. 이 밖에 물류정책에 관한 중요사항을 조사하거나 연구해야 하는 경우에 5명 이내의 비상근 전문위원을 둘 수 있도록 정하고 있다.