근로기간이 2년이 넘은 파견근로자와 사용사업주는 직접고용 관계가 된다. 이렇게 법으로 정한 까닭은 근로자 파견의 상용화․장기화를 막고, 파견근로자의 고용안정을 꾀하기 위함이다. 또한 사용사업주의 귀책사유로 인한 임금 미지급은 사용사업주가 파견사업주와 연대하여 책임을 지도록 한다.
파견근로자가 사용사업주의 사업장에서 근로한 기간이 2년이 경과하게 되면 사용사업주와 파견근로자는 더 이상 묵시적 근로계약관계가 아니라 직접고용 관계가 된다. 일정한 경우에 사용사업주를 근로기준법 또는 산업안전보건법상의 사용자로 간주하도록 규정하고 있다(법 제34조제1항). 제6조제3항 본문에서 “사용사업주가 2년을 초과하여 계속적으로 파견근로자를 사용하는 경우에는 2년의 기간이 만료된 날의 다음날부터 파견근로자를 고용한 것으로 본다.”고 규정(이하 ‘직접고용간주 규정’이라고 한다)하고, 이후 법 개정을 통해 사용사업주로 하여금 해당 파견근로자를 즉시 고용하도록 하는 의무를 부과하고 있다(법 제6조의2). 직접고용간주 규정은 사용사업주가 파견기간에 관한 제한 규정을 위반하여 계속적으로 파견근로자를 사용하는 행위에 대하여, 행정적 감독이나 형사 처벌과는 별도로 사용사업주와 파견근로자 사이의 사법(私法)관계에서도 직접고용관계 성립을 의제함으로써 근로자 파견의 상용화․장기화를 방지 하고 그에 따른 파견근로자의 고용안정을 도모하는 데에 그 입법 취지가 있다(대법원 2007두22320). 또한 파견사업주가 사용사업주의 귀책사유로 인하여 근로자의 임금을 지급하지 못한 때에는 사용사업주는 당해 파견사업주와 연대하여 책임을 진다(법 제34조제2항)(헌재 2011헌바395 : 939～940).