임금의 결정에 이르는 제도적 절차의 공정한 운영도 입금 공정성에 영향을 미친다. 공정성은 과정과 결과의 통제로 나눠지고 똑같은 결과의 산출도 과정의 통제에 어느 정도 주도권이 부여되는지에 따라 공정성이 달라진다.
분배공정성이나 형평성이 임금의 공정성에 미치는 영향을 넘어서 임금의 결정에 이르는 제도적 절차의 공정한 운영도 임금공정성에 영향을 미친다는 연구결과들도 도출되고 있다. 절차공정성에 대한 이슈를 최초로 주장한 학자는 Thibaut and Walker(1975)이다. 이들은 공정성은 과정의 통제와 결과의 통제로 나눠지고 똑같은 결과를 산출하더라도 과정의 통제에 어느 정도 주도권을 부여하는지에 따라서 공정성이 달라질 수 있다고 주장한다. 즉 판사가 똑같은 판결을 내렸다 하더라도 판사가 피고와 원고에 얼마나 공정한 변론시간을 허용했는지에 따라서 판결에 대한 공정성 지각이 달라진다고 주장했다. 이들의 주장을 임금공정성에 적용한 연구자들은 Folger와 그 동료 연구자들이다(Konovsky, Folger, & Cropanzano, 1987; Folger and Konovsky, 1989). 이들은 분배공정성을 통제했을 때 절차공정성이 임금공정성에 어떤 영향을 미치는지를 연구했다. Leventhal(1980)은 절차적 공정성을 평가하는 구체적 가이드라인을 제시했다. 즉 임금에 대한 평가를 정하는 규칙에서도 일관성(consistency), 편견없음(bias suppression), 정확성(accuracy), 시정가능성(correctability), 대표성(representativeness), 윤리성(ethicality)이 극대화된다면 임금에 대한 절차공정성은 향상될 수 있다고 주장하고 있다.