나가누마 미사일기지 사건은 일본 내의 전국민적 관심과 기대를 한 번에 저버리며 결국 나가누마에는 항공자위대의 나이키 미사일 기지가 설치되고 말았다.
평화적 생존권을 명시적으로 언급하여 일본 사회의 큰 반향을 일으켰던 나가누마 미사일기지 사건은 2심에서 뒤집혔다. 특히 고등법원은 자위대 설치와 같은 정치적 성격을 갖는 고도의 국가적 행위에 대하여 위헌무효라고 명백히 확신할 수 없는 경우에는 이를 사법심사의 대상으로 삼아서는 안된다고 판결(1976년 8월 5일)하였다. 헌법에서는 이를 ‘통치행위론’이라고 하는데 이러한 논리로 평화적 생존권에 대한 일본 내에서의 전국민적 관심과 기대를 한 번에 뒤집은 것이다. 그 후 최고재판소가 상고를 기각(1982년 9월)하였고,14년에 걸친 긴 세월의 재판은 종결되었다. 그리고 나가누마에는 항공자위대의 나이키 미사일 기지가 설치되고 말았다.