보수적 북한 인권 NGO는 인권의 불가분성 등에 입각해 보편•포괄적 관점에서 북한 인권 문제에 접근하나 진보NGO는 정치적 상황과 결부시켜 접근해, 해결에 차이가 있다. 보수NGO는 북한의 체제변화가 필요하다는 입장인 반면, 진보NGO는 인권의 열악함을 인정하면서도 개선은 남북현안과 함께 해결해야한다는 입장이다.
보수적 북한 인권 NGO들과 진보적 NGO들은 북한 인권에 대한 기본적 접근 방식에 있어서도 차이를 보인다. 보수적 단체들이 비엔나 인권선언에 천명된 인권의 불가분성과 보편성, 상호의존성에 입각하여 보편적이고 포괄적인 관점에서 북한 인권 문제에 접근하려는 데 비해 진보적 단체들은 평화체제, 남북관계의 장기적 발전 등 정치적 상황과 결부시켜 북한 인권을 상대적 관점으로 접근하고 있다. 이러한 인권에 대한 관점의 차이는 인권 문제 해결에 대한 방안의 차이로 귀결되는 데, 보수 NGO들이 북한인권 문제 해결을 위해선 결과적으로 북한의 체제 변화가 필요하다는 입장인 반면, 진보 NGO들은 북한의 열악한 인권 상황에 대해선 인정하면서도 이 인권 문제 개선은 전반적인 남북관계 발전 및 남북한 평화체제 구축 등의 현안과 함께 해결되어야 할 문제라고 보는 차이점이 있다. 결과적으로 북한 관련 진보적 NGO 들은 북한에 대한 경제적지원을 확대하는 것이 궁극적으로 북한 인권 개선을 이룰 수 있는 방안이라고 주장하는 반면, 보수적 NGO 들은 북한 인권 개선 문제 해결이 우선이며 이를 위해선 국제적 협력강화를 통해 북한 체제의 변화를 유도해내는 일이 필수적이라고 주장하고 있다.