탈북청소년 교육 종단 연구 자료는 다양한 민감 자료들이 포함되어 있으므로 엄격한 관리와 보안이 보장될 수 있는 형식의 데이터 관리 매뉴얼을 개발하였고, 또한 탈북청소년 교육 종단 연구 자료 활용에 대한 구체적인 권한과 책임 소재를 분명히 할 데이터 활용 지침도 개발하였다.
탈북청소년 교육 종단연구 자료는 다양한 민감 자료들을 포함하고 있다. 이에 이러한 정보의 엄격한 관리와 보안이 보장될 수 있는 형식으로의 데이터 공개를 통해 탈북청소년 교육 관련 연구를 활성화하고 후속연구를 지원하기 위해 데이터 관리 매뉴얼을 개발하였다. 이 매뉴얼에는 데이터 관리 규정 및 절차, 데이터 열람 시스템, 데이터 단계별 보안, 데이터 활용 방식 등의 내용을 포함하고 있다. 이와 함께 탈북청소년 교육 종단 연구 자료 활용에 대한 구체적인 권한과 책임 소재를 분명히 하기 위해 총칙(목적, 조사 자료의 정의, 조사 자료 공개 업무 담당 부서), 조사 자료 공개(자료 공개 절차, 제한 공개, 공개 수준), 조사 자료 신청 및 제공(조사 자료의 신청 및 제공 절차, 조사 자료 사용자의 의무), 심의위원회 구성 및 운영(심의위원회의 구성, 심의위원회의 역할과 임기) 등의 내용을 담은 데이터 활용 지침을 개발하였다. 이러한 매뉴얼과 지침들은 이후 탈북청소년 교육 종단연구 자료 활용에 있어 가이드라인이 될 것이라 예상된다. 개발된 매뉴얼과 지침은 부록에 제시하였다.