평가 인증의 서류 확인 비중이 높아 이로 인해 보육교사들이 활동에 소홀하게 되는 경우가 있다. 이 과정에서 보육교사는 동료나 학부모와 갈등을 경험하기도 한다.
또한 평가 인증에서 서류 확인에 대한 비중이 높아 이를 준비하기 위해 많은 시간과 노력이 투입되고 이로 인해 주 업무인 보육 활동에 소홀하게 된다는 점 이 자주 지적되고 있다(이연승·강민정·박선미, 2013; 정재은·정은정, 2012). 평가를 준비하며 과중한 업무에 시달리다 보니, 보육 교사들은 평가 인증 준비 과정에서 일에 대한 협력이 미흡하거나 비협조적인 동료에 대한 불평 등이 생겨 갈등적 관계가 되거나, 원장이 준비 과정에서의 과도한 근무를 요구하거나 또는 부모와 의 관계에서 인식의 차이로 인한 갈등을 경험한다고 보고되기도 한다(차영숙·유희정·강민정, 2012