디지털 교과서 연구 학교는 환경 구축 및 인프라를 갖추는데 첫 해를 거의 다 소모한다. 또한 사용 방법 안내와 숙달, 학사일정과 작업에 소모되는 시간이 있어 현행 2년은 너무 짧기에 3년으로 확대해야 한다고 생각된다. 이 이상은 학교에 부담이 될 수 있고 다른 학교에 대한 역차별이 될 수 있다. 일부 학교는 이미 3년을 기간으로 삼은 경우가 있으며 길어진 만큼 공립 학교의 교사 발령 기간을 고려해 담당자가 자주 변하지 않게 해야한다.
연구학교의 안정적 운영을 위해서 연구학교의 지정 연수를 확대할 필요가 있다. 현재는 2년 단위로 운영되는데, 디지털교과서 연구학교는 그 특성상 첫해는 네트워크 환경을 구축하고, 장비를 구입하는 등 디지털교과서 활용을 위한 인프라를 갖추는 데 대부분의 시간이 소요되고, 두 번째 해부터 교사 연수 등의 준비를 통해 사용이 가능해진다. 학년 초에는 학생들에게 디지털교과서에 가입시키고 사용 방법을 안내해야 하고, 시험 등의 학사일정이 있으며, 연구학교 보고서 작성 및 제출 일정 등을 고려하면 다양한 시도를 하면서 디지털교과서를 활용해 볼 충분한 시간적 여유가 부족한 셈이다. 디지털교과서는 교사와 학생 모두 익숙해지기까지 일정 정도의 시간이 필요하다는 점도 고려되어야 한다. 따라서 본 연구에서는 디지털교과서 연구학교는 그 특성을 감안하여 연구학교 지정 연수를 3년으로 확대하는 방안을 제안한다. 그 이상 의무적으로 연구학교를 운영하게 하는 것은 교사나 학교에 부담이 될 수 있고, 연구학교 지정을 희망하는 다른 학교에 대한 역차별이 될 수도 있기 때문에 한 해를 연장한 3년이 적절한 기간으로 보인다. 디지털교과서 연구학교 업무 담당자나 학교장, 시도교육청 업무 담당자 등도 면담 과정에서 3년이라는 기간의 적절성에 대해서 공감한 바 있다. 교육부에서 운영하는 연구학교 중에서도 창의경영학교 등 일부 연구학교는 3년을 운영 기간으로 삼는 경우가 있다. 그리고 공립학교는 5년 단위로 교사가 이동하기 때문에 연구학교 지정 시 가급적 연구학교 운영 기간 동안 해당 학교에 근무할 수 있는 교사를 업무 담당자로 지정할 것을 권고함으로써, 업무 담당자의 잦은 변경으로 인한 인수인계 및 노하우 축적의 어려움을 예방할 필요가 있다.