이병박 정부는 5･24조치로 인한 남한 기업들의 피해를 최소화하기 위해 ‘남북교역 애로상담센터’를 개설하여 상담과 안내를 실시하고 3차례 실태조사를 했다. 2010년 5･24조치 이전에 북한과 체결한 계약에는 유예조치를 실시하였고, 기업들의 자금난 경감을 위해 금융지원을 실시하였다.
한편, 이명박 정부는 5･24조치로 인한 남한 기업들의 피해를 최소화하기 위한 대책을 강구하였다. 2010년 5월 25일부터 기업들의 어려움에 대한 실태 파악 및 안내 등을 위해 상시적 애로상담체계인 ‘남북교역 애로상담센터’를 개설하여 2010년 11월 말까지 운영하였다. 동 센터에서는 개설 초기부터 일일 50건 이상의 상담･안내를 실시하였고, 2010년 5월 시점을 기준으로 교역 및 경협에 참여했던 모든 업체들을 대상으로 3차례 실태조사를 한 바 있다. 또한 5･24조치 이전에북한과 체결하여 대금을 지불한 건에 대해서는 물품의 반출입을 한시적으로 허용하였다. 2010년 5월 24일 이전에 농수산물･광산물 교역관련 선급금을 지급했거나 위탁가공용 원부자재를 반출했던 경우에 대해서는 반입･반출금지 유예 조치를 실시하였다. 일반교역의 선급금 지급분 반입금지 유예 조치는 2010년 6월 초부터 10월 말까지 허용하였다. 특히 사업 중단으로 인한 기업들의 자금난 경감을 위해 금융지원을 실시하였다. 두 차례에 걸쳐 ‘남북협력기금 특별대출’을 실시하였고, 남북협력기금에 ‘특별 경제교류 협력자금 대출제도’를 신설하여 연이율 2%의 저리정책자금을 대출하였다.