2001년 개최된 공청회 결과에 따라 교육정보시스템을 학교단위가 아닌 시도교육청 단위로 구축하는 것으로 교육행정정보시스템 구축 계획이 확정되었고, 개발이 진행되었으며, 사업 추진을 위한 조직체계가 마련되었다.
2001년 6월 26일, 전자정부특별위원회, 교육청, 한국전산원, 각 학교 교원 등 40여 명이 참석한 가운데 공청회가 개최되었다. 그 결과 교육 정보시스템을 학교 단위로 구축하는 것(14.3%)보다 시·도교육청 단위로 구축하는 것(64.3%)이 더 바람직하다는 참석자들의 의견에 따라 2001년 7월 10일 교육 행정정보시스템 구축계획이 확정되고 2001년 10월부터 2002년 10월까지 시스템 분석, 설계, 개발이 순차적으로 진행되었다. 2001년 5월부터 2002년 10월까지 진행된 시스템 개발과정에 교원, 교육 행정공무원 등 이해당사자가 참여했고 교육청, 학교 등 관련 기관의 방문 및 협의가 있었다. 한편 사업을 체계적으로 추진하기 위해 교육부총리를 총괄책임자로 하고 시도교육감협의회를 자문기구로 하여, 교육부 차관이 추진사업단장을 맡고 그 아래 실·국장과 부교육감을 단원으로 하는 조직체계를 마련하였다.