육아휴직규정으로 사업주와 근로여성간 분쟁 발생시 근로여성은 사업주에 대한 고소를 할 수 있다. 단, 우리나라는 노동법원이 없어 소송시 시간의 부담, 조정의 법적 구속력이 없는 등의 문제가 있다.
그러므로 육아휴직규정에 관하여 근로자와 사업주간에 분쟁이 발생하였을 경우, 이러한 절차를 거치지 않고 근로여성은 근로감독관이나 검찰에 진정, 고소, 고발하여 사업주를 형사처벌 할 것을 요구하거나, 민사소송을 법원에 제기할 수 있고, 노동위원회에 부당해고구제신청도 낼 수 있다. 그러나 현재 우리나라에는 노동문제를 전담처리하는 노동법원이 없어 근로자가 소송을 통해 권리를 실현하는 데에는 시간과 비용의 부담이 상당하며, 고용문제조정위원회에 의한 조정도 위원회가 서울과 직할시에만 설치되어 있고, 조정의 신청을 근로자가 직접할 수 없고 각 지방노동사무소의 장의 조정의뢰가 있어야 조정이 개시되며, 조정에 법적 구속력에 없는 등의 문제를 안고 있다.