우리나라는 고품질 표준특허 심사 인프라와 투명성 제고를 위한 시스템의 미비로 로열티 비용에 관한 손실을 입고 있으며 표준특허 사용 국내기업에 대한 로열티 협상 지원의 부재 또한 한계점에 달해 있다. 
아울러, 표준특허 심사 인프라 미비로 추가적인 로열티 손실의 위험이 존재한다. 우리나라는 표준문헌 DB, 전문심사관 등 고품질 표준특허 심사 기반이 미흡하여 고품질 표준특허 심사가 이루어지지 않는 경우 해외기업이 로열티 지불을 요구하는 표준특허의 규모가 커질 수 있다. 또한 표준특허 투명성 제고를 위한 시스템 부재로 로열티 비용이 증가하였다. 일례로 기업들이 표준화 기구에 선언(신고)한 ‘선언 표준특허’ 중 표준규격에 부합하는 ‘실제 표준특허’ 비율은 낮은 수준임에도, 우리기업은 해외기업이 가진 ‘실제 표준특허’의 규모를 정확히 알기 어려워 ‘선언 표준특허’ 건수 기준으로 로열티를 부담하고 있다. 이밖에도 라이선싱 조건 및 협상에 관한 정보 제공, 맞춤형 분쟁지원 등 표준특허 사용 국내기업에 대한 로열티 협상 지원이 미비한 점이 한계로 작용하고 있다.