수사 단계의 형사 합의 과정에서, 피의자에게는 합의 여부를, 피해자에게는 합의 여부 및 처벌 의사를 확인한다. 고소 사건도 마찬가지로 피해자에게 처벌 의사를 재차 물어본다.
수사단계에서 피해자와 가해자 간의 형사합의 과정을 살펴보면, 우선 수사단계에서 작성되는 피의자 신문조서와 피해자 진술조서의 양식에는 친고죄 여부에 관계없이 형사합의 여부와 피해자의 처벌의사에 대해 확인하도록 되어 있다. 예컨대, 경찰수사단계에서 경찰은 피의자에게 신문조서 작성시 피해지와의 합의여부와 합의의사 유무를 물어보고, 피해자에게는 진술조서 작성시 마지막에 피의자 처벌 의사 유무에 대해 확인한다. 고소사건의 경우, 피해자의 고소가 곧 가해자에 대한 처벌을 희망한다는 의사표시이기는 하지만 고소장 접수 후에 진행되는 피해자 진술과정에서 이러한 처벌희망의 의사는 다시 확인되고 있다.