일본은 항만 위험물 관련 사고에 대비해 매년 1회 이상 유관기관 참여 훈련을 실시하고, 사고 발생에 특화된 시나리오 및 대응 매뉴얼을 갖추고 있다.
일본은 항만 위험물 관련 사고에 대비하여 국토교통성을 중심으로 지방정비국, 항만관리자, 해안관리자, 하천관리자, 경찰, 소방, 자위대, 해상보안청 관계 기관과의 유기적인 대응체계를 구축하고 시나리오에 따라 매년 1회 이상 관련 유관기관이 참여하는 훈련을 실시하고 있다. 또한, 2차 재해 발생 이후 시설 및 인명 피해 정도에 따른 복구 매뉴얼에 따라 피해 상황 파악, 대안 항로 개척, 가설 등의 응급복구를 실행하여 항만기능 확보 및 안벽에 대한 응급복구, 방재기지 활용 등의 항만 내 위험물 사고 발생에 특화된 시나리오 및 대응 매뉴얼을 갖추고 있다.