여러 이유로 정부의 산업구조조정은 그 대상 산업 내의 몇 주도기업의 구조조정을 필연적으로 수반한다.  상황변화에 관련 업계가 적절히 대응하지 못하여 공급과잉으로 인한 적자의 경우를 예로 들 수 있다.
특히 여러 이유로 산업이 독과점화되어 있는 경우 정부의 산업구조조정은 그 대상 산업 내의 몇 주도기업의 구조조정을 필연적으로 수반한다. 예를 들면, 최근에 문제가 불거진 조선업이나 해운업의 경우 상황변화에 관련 업계가 적절히 대응하지 못하여 공급과잉으로 인한 적자가 천문학적으로 늘어나 이 두 산업에 대한 구조조정이 우리 경제의 심각한 선결문제가 되었다. 조선업의 경우 현대중공업, 대우조선해양, 삼성중공업 3사가 우리나라 조선시장의 대부분을 차지하고 있어 정부의 조선산업 구조조정은 이 3개사의 기업구조조정을 필연적으로 포함한다. 해운업의 경우도 현대상선과 한진해운이 100대 해운사 매출액의 반 이상을 차지하고 있어 해운업 구조조정은 실제 이 두 기업에 대한 기업구조조정의 성격을 띨수밖에 없다.