제조업 특허출원건수의 상승세는 2006년에 하락세로 전환했다. 2012년 제조업의 유효특허건수는 전체 산업에서 약 41%를 차지했고, 출원인당 유효건수는 감소했다. 
제조업에서의 특허출원건수는 급격한 상승세에서 2006년~2009년에 하락하는 추세로 대기업의 연도별 추이와 비슷한 경향을 보이고 있다. 2005년에는 특허출원건수가 72,506건으로 가장 많은 출원성과를 기록하였으며, 2006년에는 특허등록건수가 58,561건으로 가장 많은 등록성과를 기록하고 있다. 2012년 말 기준으로 제조업에서의 유효특허건수는 285,415건으로 전체 산업 대비 41.2%를 점유하고 있다. 이는 특허활동이 활성화된 산업이 제조업이라는 것을 의미한다. 2012년의 출원인당 유효건수는 2000년 대비 70.6% 감소한 13.8건으로 조사되었다.