정부는  '투명경영이행 약정' 체결, 기업의 평가를 위한 적정지표 개발, 사후 관리시스템 마련 등을 통해 연대보증 폐지로 인한 문제들을 보완해 갈 예정이다.
또 보증지원 시 법인대표자와 공공기관 간 ‘투명경영이행 약정’을 체결해 성실·투명경영을 유인하고 투명경영과 도덕적해이 관련 정보 축적을 통해 경영의 책임성·투명성, 기업의 재무성과 등을 반영할 수 있는 적정 지표도 개발할 예정이다. 끝으로 기업이 대출·보증자금을 용도에 따라 사용하고 있는지를 사후적으로 점검할 수 있는 관리 시스템을 마련, 전용 계좌를 통해 보증부대출을 실시하고 보증기관은 기업의 자금 사용내역을 사후적으로 확인해 이상거래 징후 등을 파악하게 된다. 이를 위해 정부는 정책금융기관의 자금 공급 규모를 지난해 24조 3,000억 원에서 올해 25조 2,000억 원으로 늘려 연대보증 폐지로 인한 여러 가지 문제들을 꾸준히 보완해 나갈 계획이다.