국가승인통계는 여성가족부가 분석 제안하면 통계청이 생산기관에 전달해 기관의 개선안 수용 여부를 여성가족부에 통보하는 절차로 개선되어 왔는데 구조적으로 개선안 수용도는 높지만 반영은 적은 문제점이 있었다. 따라서 통계청이 미반영 기관에게 개선을 촉구할 수 있게 협력체계를 바꿔야 한다.
국가승인통계는 이처럼 여성가족부, 통계청, 한국여성정책연구원, 통계생산기관과의 점검체계가 개선되어 왔다. 점검체계에서 승인통계의 개선은 여성가족부가 분석 제안하고 통계청이 생산기관에 전달하여 기관의 개선안 수용 여부를 여성가족부에 통보하는 절차로 이루어진다. 현재 통계청의 역할은 매년 2회(상반기, 하반기) 승인통계를 수집하여 여성가족부와 통계생산기관에게 전달하는데 국한된다. 즉, 각 기관이 수용했던 승인통계의 개선안 점검에 대한 통계청의 역할이 상대적으로 적다. 이로 인해 여성가족부가 제안한 개선안에 대한 통계생산기관의 수용도는 높은 편이나, 실제 반영비율은 매우 낮은 결과를 가져왔다. 이 문제를 해결하기 위해 한국여성정책연구원과 여성가족부가 개선안을 작성하고, 여성가족부와 통계청이 정기적 회의를 통해 함께 점검을 추진하는 체계를 갖출 필요가 있다. 여성가족부가 반영 여부를 매년 점검하고 이를 통계청과 논의하면, 통계청이 개선 제안을 받아들이고도 미반영하고 있는 기관에게 개선을 촉구하는 방법으로 협력체계가 구축되어야 할 것이다.