네거티브 규제에서 거버넌스 체계가 대두된다. 첫 번째는 시장 감시비용으로, 새로운 방식이 도입되지 않는다면 많은 인원과 예산이 필요하다. 두 번째는 효과이다. 비용을 생각하면 정부의 직접적인 관리가 우선되나, 장기적으로는 시장기제를 활용하여 모니터링하는 것을 고려할 필요가 있다.
네거티브 규제의 운영이라는 관점에서 규제 모니터링 등 사후관리를 포함한 거버넌스 체계는 이와 같은 필요성에 의해 대두된다. 사후 관리가 중점이 되는 거버넌스 체계는 두 가지 관점에서 고려해 볼 필요가 있다. 그 첫 번째는 비용이다. 여기서 언급하는 비용은 사회 총비용의 관점이 아니다. 여기서는 정부가 부담해야 하는 매우 좁은 범위의 구체적인 시장 감시비용을 의미한다. 사전 규제가 상대적으로 적은 비용으로 안전성의 입증과 의도하는 정책 목표 달성을 위해 직무를 수행하고 있었다면, 시장 규모가 커질 것으로 예상되는 네거티브 체제의 도입은 사후적인 시장 모니터링을 위해 완전히 새로운 방식의 관리체계가 도입되지 않는다면 단기적으로 보다 많은 인원과 예산이 필요할 것으로 짐작해 볼 수 있다. 두 번째는 효과측면의 고려이다. 비용 고려 측면에서는 단기적으로 현재 관리체계의 전환을 통한 정부의 직접 관리 방식을 우선적인 대안으로 생각하게 되는 것이 자연스럽다. 그러나 장기적인 효과를 고려해 본다면, 시장기제를 활용한 모니터링 방식의 도입을 고려해 볼 필요가 있다.