맞춤형보육의 도입에도 불구하고 종일반 어린이집을 이용하는 부모는 눈치를 보고 아이를 맡기고, 장기간 보육 이용 아동은 20%였다. 취업모의 경우 어린이집 이용 희망시간보다 실제 이용시간은 적었고, 종일반 자격 증빙이 어렵다는 문제 등이 제기됐다.
맞춤형보육이 도입되었지만, 여전히 종일반으로 어린이집을 이용하며 늦은 시간까지 아이를 어린이집에 맡겨야 했던 부모들은 아이들에 대한 걱정을 안고 어린이집으로 향해야 했다. “우리 아이만 매일 늦게 남아서 방치되는 것은 아닌지”, “우리 아이 때문에 선생님이 늦게 퇴근하는 것은 아닌지” 걱정하며, 지친 선생님의 모습을 보며 미안해해야 했다. 아이를 늦게 데려가야 하는 경우 여전히 눈치를 봐야만 한다고 부모님들은 이야기한다. 종일반 자격을 보유한 0-2세반 아동이 70%였지만, 실제 17시 이후의 장시간 보육을 이용하는 아동은 20%에 불과하였다. 장시간 보육이 실제로 필요하지 않지만 자격을 받아놓은 아동이 많은 면도 있었고, 실제 필요한 만큼 이용하지 못하는 면도 있었다. 어머니가 취업한 취업모의 경우 어린이집 이용 희망시간이 9시간 7분인데 반해 실제 이용시간은 7시간 48분이었다. 또한 비정기적이거나 단시간 근로를 하는 경우, 취업을 준비하거나 학업 중인 경우, 자격 증빙이 어렵거나 자기기술서 서술을 해야 하는 경우 종일반 자격 증빙이 어렵다는 문제도 제기되었다.