제주도에서는 도지사의 의중이 제주도정 등에 영향을 미치는 이유로 제주에너지공사 설립 준비과정이 관주도로 추진되었다는 평가가 있다. 시민사회도 일부 의견을 반영했지만, ‘녹색개발주의’로 변질되고 있는 것은 아닌가라는 의견도 있다. 이렇게 된 이유는 공사가 풍력개발에 있어 권한과 역할이 미미하기 때문이다. 그런데도 공사는 외부와 적극적으로 소통하려 하고 있다.
도지사의 권한이 막강한 제주도의 정치적 행정적 특성상 도지사의 의중이 제주도정과 도의회에 행사하는 영향력은 매우 강한 편이다. 그리하여 제주에너지공사 설립 준비과정이 관주도로 일방적으로 추진되었다는 평가가 있다. 제주환경운동연합 등 시민사회도 특별법 제정과 관련 조례 제정 개정 과정에서 의견을 제출하여 일부 반영되기도 했지만, ‘녹색개발주의’로 변질되고 있는 것은 아닌가라는 부정적 견해도 있다. 이것은 바람자원의 ‘공풍화’ 취지가 희박해지고 있으며, 제주에너지공사가 풍력을 담당하는 또 하나의 공기업과 같다는 지적으로 이어진다. 이렇게된 원인의 하나는 제주에너지공사의 권한과 역할이 제주개발공사가 지역 독점적으로 행사하는 지하수의 개발 판매 권한과 역할에 미치지 못하기 때문이다. 제주에너지공사는 풍력발전 지구지정에 관한 어떤 권한도 없고, 민간기업, 한전 발전자회사와 풍력발전사업에서 경쟁관계에 놓여 있어, 제주도 풍력발전사업 전반을 관장하는 컨트롤 타워로서 기능할 수 없다. 그럼에도 불구하고, 제주에너지공사가 외부와 소통이 불가능할 정도로 폐쇄적이지는 않으며, 적극적인 노력을 보이고 있다. 예컨대, 중장기 비전과 발전전략을 설정하면서 내부 직원, 도청, 전력거래소, 협력업체, 제주도민과 시민사회에 다양한 의사소통 채널(회의, 인터뷰, 간담회, 설명회, 설문조사, 토론회 등)을 열어 두고 이 이해관계자들의 요구사항을 취합 반영하는 활동을 하고 있다.