민사 몰수의 경우 물건의 권리자가 스스로 무죄임을 입증하기 전까지 유죄로 추정되므로 무죄 추정의 원칙에 반한다. 그러므로 무고한 소유자가 국가를 상대로 막대한 소송 부담을 안게 된다.
둘째, 무죄 추정의 원칙에 반한다는 점이다. 모든 국민은 유죄로 확정되기 전에는 무죄가 추정되어야 한다. 그러나 민사 몰수는 스스로 무죄임을 입증하기 전까지는 유죄로 추정되는 바, 민사 몰수의 경우 법원이나 행정기관은 완화된 정도의 입증으로 족하고, 오히려 물건의 권리자가 범죄와 연관성이 없음을 입증하여야 하기 때문이다. 이는 무고한 소유자에게 국가를 상대로 막대한 비용의 소송을 제기하여 기 몰수 된 재산을 반환 받아야 하는 부담을 가하기도 한다. 그러나 현재 미국의 경우 여섯 개의 주 만이 민사 몰수에 있어서 소유자가 무죄로 추정되고, 주가 유죄를 입증해야만 하며, 그 외의 주 들은 소유자에게 무죄 추정의 원칙을 적용하지 않는다.