가계동향조사가 이루어졌지만 가계수지 파악불능가구, 자영업주, 무직자 등은 표본에서 제외되었기때문에 소득 불평등의 정도를 과소평가하는 결과를 초래할 것이다. 이런 면에서 조사 결과는 결정적인 한계를 갖고 있다.
가계동향조사는 2002년까지 ‘도시가계조사’라는 이름으로 전국 72개 도시지역에 거주하는 2인 이상 임금근로자가구(약 5,500 가구)를 대상으로 하였다. 2003년부터는 비도시(읍면)를 포함한 전국에 거주하는 2인 이상 일반가구(약 7,300 가구)를 대상으로 하였고, 2006년부터는 1인 가구까지 포함하여 전국에 거주하는 일반가구(약 8,700 가구)로 대상을 확대하였다. 단, 가계동향조사에서는 농가, 어가, 외국인가구, 비혈연자취가구, 가계수지 파악불능가구는 제외되었다.15) 따라서 가령 2003년 이전까지는 신동균(2007, p. 515)에서도 지적하였듯이 자영업주, 무직자, 및 1인가구를 표본에서 제외하게 되어 소득불평등의 정도를 과소평가하는 방향으로 작용하게 될 것이다. 무엇보다도, 가계동향조사는 지역별 코딩자료를 공개하지 않는다는 결정적인 한계를 갖는다.