정산 계수는 산정 절차와 방법이 복잡하여 다양한 요인에 의해 오류가 발생할 우려가 높고 잘못 산정된 계수로 인해 사후에 정정할 수 없는 경우도 발생한다.
한편, ｢운영규칙｣ 제2.2.1.4조 등에 따르면 정산 계수는 [그림 8] 및 [표36]과 같이 전력거래소 담당 부서가 매년 발전사업자 또는 발전기별 각 계수를 산정한 후 비용평가실무협의회를 거쳐 비용평가위원회 부의안건으로 상정하면 이를 비용평가위원회가 심의한 후 최종 결정하도록 되어 있는데, ｢운영규칙｣ 및 ｢비용규정｣에 따른 산정 절차 및 방법이 복잡하고 산입되는 자료의 종류 및 양이 많아 산정과정에서 다양한 요인에 의해 오류가 발생할 우려가 높을 뿐만 아니라, 잘못 산정된 계수에 따라 실시간 급전지시 및 발전이 이루어지면 발전기별로 이미 생산된 전력량을 사후에 정정할 수 없는 경우도 발생한다.