일본은 2008년 5월 생물다양성 기본법을 제정해 생물다양성협약을 일본 국내적으로 수용하겠다는 의지를 표명했다. 
일본은 2008년 5월 생물다양성에 관한 기본법(生物多様性基本法)을 제정하였다. 동법은 일본이 생물다양성협약을 국내적으로 수용할 의사를 가지고 있다는 의지를 표명하고, 향후 상황변화에 따라 추가적인 시행계획을 세우기 위한 기초적인 법률작업이라는 것이 일본 경제산업성(経済産業省)의 입장이다. 유전자원의 접근 및 이익공유에 관한 법률을 별도로 제정하지는 않았으며, 해외 유전자원에 대한 접근을 위하여 본 가이드라인을 기초로 2005년 유전자원에의 접근 가이드라인(遺伝資源へのアクセス手引, 2005)을 제정, 2012년 제2판을 발표하였다.