이러한 한계는 대부분 성과관리 시스템의 부재 혹은 미흡에 기인하고 있다.
향후 대학들은 대학경영에 성과관리 시스템을 보다 고도화하기 위한 노력을 기울여야 하고 특히 정부의 재정지원을 수주하기 위한 평가항목의 고도 관리가 필요하다. 대학은 지식과 가치 중심의 경영이 필요한 집단이며 대학 간 경쟁의 심화로 대학교육 및 경영환경 변화에 누구보다 신속하고 정확하게 적응해야 한다. 그 동안 이루어졌던 대학평가 결과들을 분석해 보면 개별 대학들이 단기적 성과에 치중하고, 전략, 고객, 경쟁자, 내부역량 등에 대한 이해 부족과 정보의 한계를 드러내고 있다. 이러한 한계는 대부분 성과관리 시스템의 부재 혹은 미흡에 기인하고 있다.