진행단계에서 가장 핵심 쟁점은 이해관계자들과의 2차례 면담으로 도움이 되는 사안들을 파악하는 것이다. 분석자료를 토대로 해결방안을 도출하는 것이 갈등영향 분석 진행 단계의 마무리이다.
진행 단계에서 가장 핵심이 되는 쟁점 분석의 경우 이해관계자들과의 2차에 걸친 면담을 통하여 객관적으로 드러나는 갈등의 원인과 배경에 대한 사항 이외에 실질적인 문제와 향후 해결 방안 마련을 위한 협의체 설계에 도움이 될 수 있는 사안들을 파악해야 할 것이다. 이해관계자들의 의견 수렴에 대한 내용은 다음의 의견 수렴 방법에서 좀 더 자세히 논의하게 될 것이다. 마지막으로 갈등 해결에 가교역할을 하는 협의체 구성 및 합의 설계를 위해 갈등 협상 방법 및 과정에 대한 사항과 해결 방안 도출을 위해 필요한 내용들을 이전의 원인 진단 및 쟁점 분석을 통해 얻은 자료들을 토대로 도출해 내는 것으로 갈등영향 분석 진행 단계가 마무리 될 수 있을 것이다.