경제적 효율성이 높은 협업 체계를 만들기 위해서는 구성기관 간의 공동 목표를 설정하고 MOU를 통해 공식화하는 방법이 우선적으로 실시할 수 있는 방법이다.
법적으로 협업의 의무를 구체적으로 마련하는 것은 장기적으로 고려할 수 있는 대안이기 때문에 협업 활성화를 위해 우선적으로 실시할 수 있는 방안은 협업 구성기관 간 MOU 체결을 권고하는 것이다. 현재 협업 체계의 경제적 효율성이 낮은 것은 실제로 예산절감 및 인력 부족의 문제를 완화하기 위한 목표를 설정하고 그에 따라 협업 구성기관 간 역할 분담 및 자원 공유 방안을 논의하는 수준의 협업에 이르지 못하기 때문이다. 수산물 안전 관리 협업 체계의 경제적 효율성 향상을 위해서는 우선 협업 기관 간 그러한 목표를 공동으로 설정하고 이를 MOU를 통해 공식화할 필요가 있다.