사업철수로 재일상공인과 남한의 기업인들은 투자자산을 모두 몰수당하였으며, 사업철수 시 이로 인한 피해는 더욱 컸다. 북한은 재일상공인의 재산을 몰수했다. 남한 또한 회수가 불가능했다. 일본 기업을 재외한 재일상공인 역시 피해가 컸다. 북한에 투자한 남한 기업인들 지원받지 못했다.
사업철수가 어떠한 원인에 의해 이루어졌든 재일상공인과 남한의 기업인들은 투자자산을 모두 몰수당하였다. 단순교역에 참여한 기업인들은 물품을 인도받지 못하고 선급금도 회수하지 못하는 손해를 입었다. 그러나 합영사업이나 위탁가공교역의 경우 투자자가 생산에 필요한 설비, 기계 등 고정자산과 원부자재, 완성품, 심지어 선급금 등 유동자산까지 모두 부담했기 때문에 사업철수 시 재산몰수로 인한 피해는 더욱 클 수밖에 없었다. 북한은 투자설비, 원부자재, 그리고 완제품을 회수하기 위해 입국하려는 재일상공인에게 비자를 발급하지 않는 방법으로 재산을 몰수하였다(B1, C4). 남한의 경우도 5·24조치 이전 북한에 투자한 기업인과 금강산관광 및 개성공단 입주기업에서 보듯이, 투자자산의 회수는 사실상 불가능하였다. 더군다나 북일무역에 참여했던 일본기업은 통산성의 보험제도를 통해 일정부분 손해를 만회할 수 있었으나, 재일상공인의 경우 보험혜택을 전혀 받지 못해 피해가 컸다. 개성공단 입주업체를 제외한 북한에 투자한 남한 기업인들 역시 북한으로부터 대위변제각서를 받아야만 하는 경협보험 제도의 문제로 남북교역 중단에 따른 피해를 지원받지 못하였다.