형사조정제도의 현황과 실효성의 측면에서 형사조정위원회의 업무와 역할을 해당 형사조정제도의 목적에 맞게 쳬계화시키는 것이 효율적일 것이다. 형사 조정은 형사사법기관 외부로 권한을 위임하는 것을 주목적으로 하므로, 이러한 형사조정이 형벌권을 피해자, 가해자, 지역사회에 위임하는 조치로 이해하는 것은 형사사법기관의 불신에서 비롯된 오해이다. 
그러나 현재의 형사조정제도의 운용현황과 실효성의 측면을 고려해 볼 때 현재의 형사조정위원회를 활용하는 것이 효율적일 것으로 생각된다. 예컨대, 동일한 조정업무를 수행하는 기관을 각 형사사법기관별로 설치할 경우 필요한 예산 확보와 전문성을 갖춘 인력의 확보에 어려움이 있고 또한 통일된 조정기준 마련과 조정자의 교육 및 훈련 및 관리에 어려움이 있을 것으로 생각된다. 따라서 현재의 형사 조정위원회의 업무와 역할을 형사조정제도의 다양한 목적에 맞게 구체화시키고 체계화시키는 등 현 조직의 업무와 역할을 격상할 필요가 있는데, 예컨대 법무행정을 총괄하는 법무부에 형사조정국(가칭) 등을 설치하여 형사조정 관련 업무를 총괄/기획하게 하고 현재와 같이 각급 지방검찰청 및 지청 단위로 형사조정센터(가칭)를 설치하여 형사조정제도의 다양한 목표를 수행할 수 있는 조직으로 개편하는 방안을 고려해볼 필요가 있다. 이러한 방안에 대해서는 형사조정은 조정을 주도적으로 담당하는 기관의 권한확대를 가져온다는 비판을 받을 수 있다. 그러나 형사조정은 형사사법기관의 권한확대가 아니라 형사사법기관 외부에로 권한을 위임하는 것을 핵심 내용으로 하는 것으로 범죄에 대한 대응으로서 형벌권을 독점하여온 국가로부터 범죄의 직접적인 이해관계자인 피해자나 가해자 또는 지역사회에 권한을 위임하는 것으로 이해한다면, 이러한 우려는 기존의 형사사법기관에 대한 불신에서 비롯된 오해에서 기인한다고 볼 수 있다.