자유학기제 교실은 학생 중심 수업 과정을 통해 수업 내 평가, 지속적 피드백 등 과정중심 평가로 바꿨다. 인지적 영역 평가 외 정의적 영역 평가, 교과별 역량 평가 등 모든 관점에서 평가하려 노력한다.
자유학기제 교실에서는 수업의 변화에 따라 결과 중심, 점수 중심의 평가로부터 학생 중심 수업 과정을 통해 나타난 학생 개개인의 성장과 발달에 초점을 두어 평가하고 기록해나가는 과정 중심 평가로의 전환이 이루어지고 있다. 즉, 평가는 수업 후에 이루어지는 별도의 과정이 아니라 교육과정 및 수업과 연계하여 실천하며 수업에 녹아드는 평가여야 하며, 학생의 성장과 발달을 촉진하기 위해 교사의 지속적인 피드백과 적절한 처방은 매우 중요해진 것이다. 또한 기존에는 인지적 영역을 중심으로 학생의 학업 성취도를 평가했지만 자유학기의 과정 중심 평가에서는 인지적 영역에 대한 평가 이외에 참여 및 배려, 공감, 협력 등의 정의적 영역에 대한 평가와 교과별 역량에 대한 평가를 아우르는 전인적이고 종합적인 관점에서 평가를 진행하기 위해 노력하고 있음을 알 수 있었다.