외국환엔결제시스템은 엔자금 결제를 위하여 도입한 거액결제시스템이다. 초기에 일본은행 승인이 필요했지만 국제 거래가 대폭 증가하면서 효율인 업무처리를 위해 동경은행협회는 일본은행에 외국환엔결제업무의 처리를 위임하였다. 또한 미결제잔액을 감축하기 위해 상대순신용한도, 손실분담제도를 도입하였다.
외국환엔결제시스템(FEYCS; Foreign Exchange Yen Clearing Sysetem)은 동경은행협회가 금융기관의 외국환 매매와 유로엔 거래 등에 따른 엔자금 결제를 위하여 80년 도입한 거액결제시스템으로 동경은행협회는 외국환엔결제시스템과 관련하여 참가기준, 신규가입 및 탈퇴절차, 결제절차 등을 포함하는 규정을 제정하여 운용하고 있으며 규정 개정시기에는 일본은행의 승인을 받도록 하고 있다. 동시스템의 가동이후 엔화의 국제화 등으로 거래가 대폭적으로 증가함에 따라 효율적인 업무처리를 위하여 동경은행협회는 일본은행에 외국환엔결제업무의 처리를 위임하였고 이에 따라 일본은행은 89년 3월부터 BOJ-NET의 일부로서 외국환결제시스템을 운영하여 지급지시를 전자방식으로 처리하고 차액산출 및 은행간 결제를 직접 실시하고 있다. 외국환엔결제시스템에서의 미결제잔액을 감축하기 위하여 참가기관이 각 상대기관별 이체한도를 정하는 상대순신용한도(bilateral net credit limit 제도가 도입(한도초과 자금이체지시는 오류처리)되었고 결제종료성 확보를 위하여 결제불능액을 참가기관이 공동분담하는 손실분담제도(loss-sharingrule)가 도입되었다.