Top-Down 예산제도는 각 행정부처가 책임감을 가지고 정책사업을 추진하는 자율성 증진을 우선순위에 둔다. 부처별 전략을 재정당국이 공유, 긴 호흡으로 공공서비스 공급과 재정 경기조절기능향상의 장점을 가진다.
Top-Down 예산제도 하에서는 기존의 Bottom-up 예산제도가 가지고 있는 과장된 예산요구안의 동기를 감소시키고 증세의 압력을 증가시키는 지출의 성장세를 어느 정도 조절하면서도 각 행정부처가 자기 책임 하에 각자 부처가 추진하는 주요 정책사업들을 소신껏 시행시킬 수 있는 자율성 증진을 추구한다. Top-down 예산제도의 효과는 단기적으로 점검하기 어렵지만, 대체로 재원배분의 자율성·효율성과 책임성·투명성의 조화를 가져올 수 있을 것으로 기대된다. 구체적으로 부처별 특성과 전략에 맞는 사업별 재원 배분의 합리성을 제고하고, 과다한 재정수요를 억제하는 동시에 사업별 부처별 예산편성에 관한 주요 정보를 해당부처와 재정당국이 공유함으로써 중장기 계획 하에서 지속가능한 공공서비스 공급뿐만 아니라 재정의 경기조절기능을향상시킬 수 있다는 점 등이 이 제도의 장점이라 할 수 있다.