장기적 관점에서 온라인수업의 체계적인 운영과 정착을 위해 온라인수업 전담지원기관이  필요한 대상에 따라 개별적으로 접근해서 발생할 수 있는 예산 등의 비효율적 운영을 최소화 해야 한다.
장기적 관점에서 온라인수업의 체계적인 운영과 정착을 위해서는 현재 특별교부금을 통한 온라인수업 사업 위탁 운영 방식의 제한적인 지원체제에서 나아가, 온라인수업지원을 위한 제반 인프라를 확보하고 있는 교육연구기관에 온라인수업 운영 등의 위탁을 위한 근거를 마련하고 적합한 기관을 선정하여 지정할 필요가 있다. 온라인수업 전담지원기관은 앞서 언급한 온라인수업 운영위원회의 구성과 운영, 온라인수업 운영 등 포괄적인 업무를 담당하게 된다. 또한 온라인수업 전담지원기관이 전체적인 온라인수업에 대한 요구사정을 하도록 함으로써 온라인수업이 필요한 대상에 따라 개별적으로 접근함으로써 발생할 수 있는 예산 등의 비효율적 운영을 최소화할 수 있다.