시차출퇴근제의 긍정적 효과는 업무 효율성과 생산성 증가, 높은 만족도이며 부정적 효과는 조기 퇴근의 어려움, 근무시간에 대한 예견 가능성 낮음이 제기되었다.
시차출퇴근제를 활용한 결과로 업무 효율성 증가, 업무생산성 증가, 높은 만족도 등이 있는 것으로 응답하였다. 시차출퇴근제의 부정적 요소는 조기 퇴근 하기 어렵다는 점을 지적하고 있다. 조기 출근은 문제가 없지만 9시 이후 출근 과 조기 퇴근은 조직 문화와 근무여건으로 인해 부담을 느끼는 것으로 나타났다. 특히, 조기 퇴근으로 인한 동료 근무자에게 업무 전가, 유관 부서와 업무 협조의 불가, 민원인의 불편 초래 등이 고려되는 문제로 지적되었다. 특히, 유연한 근무시간으로 인해 해당자의 근무시간에 대한 예견 가능성이 떨어지는 문제점이 부정적 요소로 제기되었다.