고유 등기번호 부여는 상업등기청외에 다른 기관에서도 행해지고 있다. 때문에, 중복 부여 방지를 위해 관련기관이 공유할 수 있는 중앙 데이터베이스가 필요하다.
고유 등기번호 부여의 주체는 상업등기청일 수도 있고 또는 과세기관이나 통합기관일 수도 있다. 예컨대 상업등기 시에 고유 등기번호가 부여될 수도 있지만, 다른 기관에 의해 공유 등기번호가 부여된 다음 상업등기 등 관련기간에 공유되는 것도 충분히 가능한 것이다. 다만 각 기관이 중복하여 등기번호를 부여하는 것은 방지해야 하는바,이를 위하여 통상적으로 중앙 데이터베이스(centralized database)가 필요하게 된다. 종이기반 시스템이 아닌 전자등록 시스템 하에서 고유 등기번호 제도 운영이 용이해지는 것은 사실이지만, 전자등록 시스템이 고유 등기번호 제도의 전제 요건은 아니다.