교육과정 거점학교의 등장 배경은 학생 선택을 중요시하게 되면서이다. 일반계 고등학교 교육과정에 진로 관련한 엄격한 과정을 두지 않고, 학생은 자신이 선택해 이수한 과목들로 과정을 만들어 가는 것을 원칙으로 한다고 하였다.
제7차 교육과정기에 등장한 고등학교 선택 중심 교육과정과 이에 따른 교육과정 거점학교 제도의 취지는 2016년 현재까지 국가와 교육청의 교육과정 정책의 기조를 유지하고 발전되어오고 있다. 먼저 교육과정 거점학교가 등장하게 된 배경은 학교에서 학생 선택을 중요시하게 되면서이다. 제 7차 교육과정에서 선택과목을 국가 수준에서 대량 개발해서 학교에서 개설할 수 있게 하고, 심지어 선택과목에 배당된 136단위 중에서 학생의 선택 비율은 최대 50%까지 하도록 지정하였다. 문과, 이과 등 과정을 두지 않은 것은 물론이고, “일반계 고등학교의 교육과정에는 학생의 진로와 관련한 엄격한 과정을 따로 두지 아니하며, 개별 학생은 자신이 선택하여 이수한 과목들을 모아 자신의 과정을 만들어 가는 것을 원칙으로 한다.”라고 하여, 학생의 선택을 중요시하였다(교육부, 1997).