전문계고 학생의 학업중단 실태를 살펴보면, 2000년 이후로 상당히 낮은 수준을 기록하고 있다. 이에 여러가지 원인이 존재하는데 '실업계 특별전형'과의 연관성을 고려해볼 필요가 있다. 이는 2003년 참여정부에서 대학입시에 대한 특혜를 도입했고 이후 전문계 고교 인기가 상승했다. 이후 문제점들이 발생햇다.
시계열적 관점에서 전문계고 학생의 학업중단 실태를 좀 더 구체적으로 살펴보면, 2000년도에는 4%가 넘는 상당히 높은 학업중단율을 보이다가 2002년부터 감소세에 접어들어 2004년에는 2.89%로 이례적으로 낮은 수준을 기록하고 있다. 이 같은 현상이 발생한 데는 여러 가지 원인이 있을 수 있지만, 그 무렵에 도입된‘실업계 특별전형’과의 연관성을 우선적으로 고려해볼 필요가 있다. 2003년에 당시 참여정부는 실업계 학생들을 대학입시에서 우대하는 이른바 ‘실업계 특별전형’을 2004학년도 대학입시부터 도입할 것이라고 발표했었다. 그리고 실제로 이 제도가 시행되면서 전문계(당시 실업계) 고교의 인기가 상승했었고, 이로 인해 이 제도를 염두에 두고 전문계 고교로 진학하는 학생들도 늘어나게 되었다. 그러나 제도가 본격적으로 시행되면서 점차 이 제도를 둘러싼 문제점들이 드러나게 되었고, 이에 따라 전문계고의 인기도 차츰 수그러들게 되었다. 이처럼 전문계고 학생들의 이탈 현상을 억제하던 제도의 효력이 약화되고 전문계고의 정체성 문제가 불거지면서, 2000년대 후반 들어 전문계고의 학업중단율이 다시 상승세를 보이게 된 것으로 생각된다.