과도기 이중체제 기간 동안 행정권은 중앙정부가 관리하지만 북한지역에 특별행정관리기구를 설치하여 관리하게 한다. 또한 재정과 예산은 별도로 운영하고 부족분은 중앙 정부가 부담하며 기본적으로 노동시장을 분리 운영하고 북한 근로자에게 최저임금제를 적용하며 기존의 북한 국유재산은 통일 정부가 재국유화한다.
둘째, 과도기 이중체제의 조건과 환경 설정과 관련하여 기간은 최소 3년에서 최대 10년으로 상정하며 이 기간에는 남북한의 상호 이질적인 제도가 공존하며 이러한 이질적인 요소가 완화되는 절차와 결과에 따라 과도기 이중체제가 운영되는 기간 역시 재설정될 수 있다. 과도기 이중체제 기간 동안 행정권은 중앙정부가 관리하되, 북한지역에 특별행정관리기구(부총리급 이상)를 설치하여 북한지역을 관리하도록 하게 한다. 또한 이기간 동안 북한 주민 기본권의 경우 현행 헌법 37조 2항의 기본권 제한규정에 의거하여 별도로 관리하며 각 부문별 권리 역시 별도로 관리 및 보장한다. 재정과 예산은 별도로 운영하되, 북한지역의 부족분은 중앙정부가 부담하며 조세의 종목과 세율은 특별행정관리기구에서 별도로 정하며 화폐는 신화폐를 발행해서 사용한다. 이에 더해 노동 이동은 취업 승인을 통해 중앙정부가 허용하는 가운데 기본적으로 남북한 노동시장을 분리 운영하며 북한지역으로의 남한 자본･상품 이동은 특별행정관리기구에서 별도로 관리하며 남한지역으로의 북한 자본･상품 이동은 허용한다. 아울러 이 기간 동안 북한 근로자에게 특별행정관리기구에서 정한 최저임금제를 적용하며 기존의 북한지역 국유재산은 통일 정부가 재국유화한다.