2차 조사의 특징은 탈북청소년만을 대상으로 한 교육 종단연구 설계가 한국의 청소년과 다른 특징을 찾을 수 없다는 문제의식에 기초하였다는 것이다. 그러나 이후 활용된 심리 검사 역시 문제를 해결하기는 어려웠다. 
2차 조사에서 특징적인 점은, 탈북청소년 교육 종단연구 설계가 탈북청소년만을 대상으로 한 것이어서 한국의 일반청소년과 다른 특징을 찾기 어렵게 되어 있다는 문제의식에 기초하여 표준화 심리 검사 도구를 활용한 검사를 실시했다는 점이다. 이 연구 설계에서 이미 확정된 설문 조사 도구와 연계시킬 수 있는 가능성을 검토하여 행동과학연구소가 개발한 심리 검사 도구 중 인성 검사를 기본 설문조사와 함께 진행하였다(이강주 외, 2012: 84-85). 이러한 심리 검사 도구 활용에는 자기보고식 설문으로 파악되는 ‘적응’ 수준이 과연 탈북청소년 교육의 결과로 이해할 수 있는 것인가에 대한 문제의식도 포함되어 있으나 활용된 심리 검사 역시 이 문제를 피해 가기는 어려웠음을 위 연구는 피력하고 있다(이강주 외, 2012: 172)