제1, 2차 한 페루 FTA 장관급 공동위원회를 개최하여 양국은 한 페루 FTA의 효과를 평가하고 분야별로 협의하며 FTA를 통한 양국간 협력 의지를 다시 확인했다.
2012년 11월 28일 한 페루 FTA 이행상황 점검을 위한 제1차 한 페루 FTA 장관급 공동위원회(Joint Commission)가 페루 리마에서 개최되었으며, 최근 2014년 6월 2∼3일 제2차 장관급 공동위원회가 서울에서 개최되었다. 공동위원회 계기 양측은 한 페루 FTA의 효과를 평가하고, 양국간 통상 현안 및 양국 지역통합정책 현황을 논의하는 한편, FTA를 통한 양국간 협력 의지를 다시 확인하였다. 2차례에 걸친 공동위원회 개최 시기에 관세위원회, SPS위원회 등 산하위원회도 함께 개최되어 FTA의 원활한 이행을 위한 분야별 협의가 이루어졌다.