자치분권 종합계획에서는 “(가칭)지방이양비용평가위원회”를 설치해서 지방이양일괄법을 발의할 때 관련된 비용을 산정하는 것을 의무화하고 “자치분권 법령 사전협의제”를 도입하여 법령을 제개정할때는 그 법령의 자치권 침해여부를 사전심의하여 지방정부의 자치권을 보호할 것이다.
지금까지 다양한 중앙행정권한이 지방으로 이양되어왔다. 그러나 함께 수반되어야할 재정이 이양되지 않아 지방정부가 재정적인 압박을 당하는 사례가 많았다. 이러한 사례들은 지방정부가 오히려 중앙행정권한의 지방이양을 꺼리는 이유 중의 하나가 되었다. 이러한 상황을 충분히 고려하여 자치분권 종합계획에서는 지방이양일괄법을 발의할 때 관련된 비용을 산정하는 것을 의무화하고 이를 위한 “(가칭)지방이양비용평가위원회”를 설치할 예정이다. 중앙정부는 그동안 특별법령을 통하여 지방정부의 자치권을 제약해 왔다. 이러한 폐단을 사전에 차단하기 위하여 “자치분권 법령 사전협의제”를 도입할 것을 계획하였다. 중앙정부가 법령을 제 개정할 때에는 제개정되는 법령의 자치권 침해여부를 사전에 심의하여 지방정부의 자치권을 보호할 계획이다. 이를 제도적으로 뒷받침하기 위한 법적 근거도 마련한 다는 것이다. 이러한 계획들이 구체적인 실천계획으로 반영이 되면, 중앙과 지방 및 자치단체간의 협력에도 상당한 진전이 이루어질 것으로 기대된다.