법무부는 출입국심사절차를 획기적으로 개선할 수 있는 방안을 모색하였다. 구조적 문제들 중 직원별 업무 중심의 운영 관행 타파와 담당 직원들의 의식전환이 요구되었다.  인천공항 개항에 대비하여 출입국정보시스템 서비스를 개통하였다.
이에 법무부는 출입국심사절차를 획기적으로 개선할 수 있는 방안 모색에 착수하였다. 비효율적 출입국심사의 핵심원인을 파악하기 위해 출입국심사 전반에 대한 환경분석을 실시하였다. 그 결과 오랫동안 출입국심사에 있어 구조적으로 안고 있었던 문제들 즉, 수기에 의존하는 전근대적 업무처리, 경직된 조직구조와 문화, 근무체제의 비효율, 그리고 복잡한 심사절차 등의 문제점들이 도출되었다. 무엇보다 지난 50여 년간 직원별 업무 중심으로 운영되어 오던 비효율적인 관행을 타파하고 고객 지향서비스 중심으로 담당 직원들의 의식전환이 우선되어야 한다는 점이 절실히 요구되었다. 그러던 중 인천공항 개항에 대비하여 2000년 1월에 출입국심사, 사증발급, 체류 관리, 사범처리, 외국인 보호 등 출입국관리행정 전반에 걸쳐 유기적 정보연계체계를 갖춘 출입국정보시스템 서비스를 개통하였다.