보건복지 부문 중에서도 사회보험 분야의 정보화는 업무 성격상 필수적이었고, 국민연금의 확대, 건강보험의 통합, 심사평가원의 분이 등으로 다른 분야보다 일찍 진행되었다. 이를 위해 시스템 연계 및 통합이 우선이었다.
보건복지 부문의 정보화는 사회복지, 사회보험, 보건산업, 보건의료, 기반 구축 등으로 구분되어 추진되어 왔다. 이 중에서 사회보험 분야의 산재보험과 고용보험은 노동부에서, 국민연금과 국민건강보험, 건강보험 심사평가는 보건복지부에서 담당하였다. 사회보험은 대량의 데이터를 신속히 처리해야 하는 업무 성격상 전산화가 필수적이었고, 1999년 국민연금의 도시지역 확대, 2000년 건강보험의 통합과 심사평가원의 분리 등으로 인해 다른 분야보다 비교적 일찍 정보화 기반이 갖추어졌다. 당시 사회보험 분야의 가장 큰 과제는 시스템 연계와 통합이었다. 국민건강보험공단과 건강보험심사평가원, 국민연금과 건강보험, 나아가 4대 보험의 연계·통합이 당면 과제였다. 이는 업무의 효율성 차원에서뿐만 아니라 사회보험 사각지대 해소와 인터넷 포털을 통한 정보서비스 제공 등 진일보한 정보화 기반을 마련할 수 있기 때문이었다.