자유학기제는 중학생들이 변화된 환경에 적응하고 자아를 형성해 다음 단계로 나아가도록 돕는 정책이다. 부적응 학생들은 다양한 일탈 행위를 보이게 되므로 중학교 단계에 적응할 수 있도록 지원하는 것이 중요하다.
첫째, 자유학기제는 학교의 제도적 및 구조적 개혁보다는 다양한 프로그램과 교육과정, 수업 방법 개선 등을 통해 중학생 연령 단계의 급격한 변화와 새로운 환경에 대응한 ‘전환’이 보다 원활하게 이루어지도록 하는 정책으로 파악될 수 있다. 초등학교에서 중학교로의 전환은 단순히 새로운 학교체제에의 적응이 아니라 중학생들의 심리·사회적 혼란을 자연스럽게 극복하여 자신의 정체성과 자아의식을 형성하고 다음 단계로 나아가기 위한 준비 과정에 들어가는 것을 말한다. 이러한 전환을 원활하게 이루지 못한 학생들은 학교 내 폭력 및 중도 탈락, 비행 등 다양한 형태의 일탈과 부적응 행동을 보이게 된다. 따라서 중학교 단계에서 학생들이 원활하고 원만하게 전환 할 수 있도록 지원하는 것이 대단히 중요하다.