감사를 받는 경우나 자체감사를 수행함에 있어서 자치권이 있는 기관과 없는 기관의 구분이 필요하다.
이상의 논의는 ｢공감법｣과 관련하여서는 제2조 제1호의 자체감사의 정의에도 반영하는 것이 필요하다고 생각된다. 즉 현재 ｢공감법｣은 자체감사를 정의하면서 지방자치단체를 중앙 행정기관이나 기타 공공기관과 구별하지 않으면서 정의하고 있다. 그러나 앞서 논의한 바와같이, 감사를 받는 경우는 물론이고 자체감사를 수행함에 있어서도 자치권이 있는 기관과 자치권이 없는 기관의 구분은 필요하다. 예컨대 ｢공감법｣에 규정된 기구설치 문제, 감사담당자의 인사문제 등과 관련하여, 자치권이 없는 중앙행정기관에 대해서는 이에 대한 획일적인 기준이나 의무를 부과할 수 있지만, 반드시 전국적인 통일성을 유지해야 할 이유가 없는 사항에 대해서는 지방자치단체의 조직고권이나 인사고권과 같은 자치권 행사의 여지를 인정하는 것이 바람직하기 때문이다. 이러한 관점에서 지방자치단체의 자체감사와 그 밖의 행정기관의 자체감사를 개념적으로 구분하는 것이 필요하다.