남한은 유전자  변형작물을 재배하지 않고 주로 수입하여 사용하는데 대부분 축산사료용으로 쓰이고 가공과정을 거치기에 유전자 변형 단백질  식품을 사게 될 일은 거의 없다.
남한이 생산․재배하는 유전자 변형작물이 없으므로 남한에서 판매되는 유전자변형생물체는 수입된 것들이다. 2012년까지 국내에서 유전자변형생물체를 수출한 경우는 지식경제부에 통고된 건수가 총 15건이었으며, 시험 연구를 위해 사용되는 쥐(Mouse)의 수출이 대부분을 차지하였다. 실험용 쥐 등 설치류도 2013년 한 해만 705건이 수입신고되는 등 수입 물량이 월등하게 많다. 2013년 한 해 동안 국내에 수입 승인된 식용․농업용 유전자변형생물체는 3,131건, 약 887.7만 톤, 28.6억 달러 규모이다. 이중 식용은 전체의 19%인 168만 톤 정도이다. 작물별로는 옥수수가 89.7%를 차지하고 대두와 면실류, 카놀라 등도 수입되고 있다. 아직까지는 식용으로 사용되는 비중보다 농업용 즉 축산사료용으로 소비되는 비중이 높고, 옥수수나 카놀라 등도 식용유 등으로 가공되어 유전자 변형 단백질이 남아있지 않은 형태가 되므로 실제 남한의 소비자들이 유전자변형생물체 표시가 되어 있는 식품을 사게 되는 경우는 거의 없다.