청소년법정은 다양한 기관에 의해  독립적으로 또는 기관 간 공동으로 운영될 수 있다. 청소년법정 프로그램은 소년법원, 민간비영리기관 법집행기관에서 주로 운영된다.
청소년법정은 법집행기관(경찰, 보안관), 사법기관(검찰, 순회재판소, 대법원, 지방법원, 보호관찰부서), 다른 정부기관, 민간비영리기관, 학교 등과 같은 다양한 기관에 의해 운영될 수 있다. 이러한 기관들이 각기 독립적으로 청소년법정을 운영할 수도 있고, 지역사회 또는 사법기관 간 파트너쉽을 통해 공동으로 운영할 수도 있다. 청소년법정 프로그램을 운영하는 기관은 보통 소년법원과 민간비영리기관이 각 29%로 가장 높은 비율을 차지하고 있으며, 법집행기관과 청소년 보호관찰 부서(17%), 학교(10%) 등의 순이다(Peterson & Jill, 2008).