실무상 외국인이 출입국항에서 난민인정신청 의사를 밝히면 입국처분을 하는데, 이 때 출입국은 국외 송환을 지시하고, 별개로 진행되는 난민인정심사는 규정에따라 처리한다.
현재 실무상 외국인이 출입국항에서 난민인정신청 의사를 밝히면 여하한 목적의 사증이 있는 경우에도 대한민국 입국 목적이 소지한 비자와는 부합하지 않는다는 이유로 일단 출입국관리법 제12조 제3, 4항에 따라 입국거부 처분을 하고 있다. 이 때 출입국 당국은 출입국관리법 제76조17)에 의하여 당해 외국인이 탑승하였던 비행기의 운수업자에게 외국인을 국외로 송환할 것을 지시하게 된다. 이 때 별개로 진행되는 난민인정심사 회부 여부 심사에 따른 결정이 내려지면 당해 외국인의 입국여부, 난민인정심사 절차 등은 난민법 시행령 제5조 제3항 이하의 규정에 따라 처리한다.