국민만족도 조사의 타당성 제고를 위해서 짚어봐야할 문제는 응답자의 변화이다.  페널 데이터를 구축할 경우라면 다양한 심층 분석을 할수 있는 장점이 있지만 국민만족도 조사 자료로는 구축할 수 없다는게 아쉬운 점이다.
첫 번째로 응답자 변화의 문제이다. 2015년 현재 14개 책형으로 구분하여 응답자 1인당 10개 국정과제를 응답하도록 하는 것은, 응답자가 140개나 되는 국정과제를 일일이 응답하기는 불가능할 것으로 보이기 때문이다. 즉 대답하는 과정에서 피로도 증가로 인해 불성실한 응답을 할 수 있는 가능성을 배제하기 위한 방안으로 타당성이 있다고 볼 수 있다. 그리고 일관된 표본 구성을 위해 책형마다 표본추출방식이 동일하게 적용되고 있다. 책형마다 동일한 표본구성을 유지하는 것은 이론적으로 각 책형에 포함된 사람들이 동일한 인식 하에 만족도 조사에 응답할 것이라는 점을 전제하고 있다. 그런데 이러한 이론적 전제가 현실에 합되는지 검증이 되지 않고 있는데, 이 문제는 국민만족도 조사의 타당성 제고를 위해 짚어보아야 한다. 나아가 책형의 표본 구성을 동일하게 하더라도 매년 응답자가 달라지기 때문에 패널 데이터로 구축하기 어려운 점도 있다. 패널 데이터를 구축할 경우 다양한 심층 분석을 실시할 수 있는 장점이 있는데, 국민만족도 조사 자료를 패널 데이터로 구축하지 못하는 한계는 매우 아쉬운 점이다.