특성화고등학교는 재학 중 전공이나 진로 변경이 어렵다. 학교에 진학 지원 프로그램의 부재, 대학 진학을 제한하는 분위기, 보통교과 시수 제한으로써 대학 진학으로 진로를 변경할 경우 학생은 이 과정을 홀로 준비해야 한다. 이런 상황 속에서 특성화고 출신 대학 진학생들의 전공 및 학과 만족도가 낮게 나온 건 이상한 일이 아니다. 따라서 특성화고 학생들이 다양한 전공 및 진로 결정 기회를 가질 수 있도록 지원해야 한다.
적지 않은 학생들이 학교나 학과에 대해서 충분히 알지 못하고 입학한 결과, 특성화고등학교 3학년 학생들은 44.1%의 학생만이 현재의 전공이 자신의 흥미 및 적성에 맞는다고 응답했다(정윤경 외, 2018). 이는 특성화고등학교에 재학 중인 학생들이 자신이 현재 배우고 있는 전공과 다른 새로운 진로를 모색하고자 하는 요구가 있음을 시사하고 있다. 하지만 학생들이 재학 중에 전공을 변경하는 것은 매우 어려우며, 전학을 통해서만 가능하다. 학생들의 진로 변경 속에는 자신의 전공분야 혹은 다른 분야와 관련된 대학 진학 계획이 상당수 포함되어 있으나, 학교에서는 이러한 진로경로에 대한 적극적인 지원은 없는 실정이다. 임 언 외(2018)가 만난 산학일체형도제학교 프로그램에 속해 있는 학생들의 경우, 학교에서 대학 진학을 계획하고 있다는 것을 친구들에게 비밀로 하고 있는 경우도 있었다. 반 분위기를 흐린다는 이유로 교사들이 제한하고 있기 때문이다. 2학년 이후 특성화고등학교 교육과정은 보통교과 시수가 제한되어 있어서 제대로 된 대학입학 준비를 하는 것은 불가능하다. 홀로 대학 진학을 계획하고 있는 학생의 경우, 학교에서의 도움이 거의 없이 혼자서 대학 진학 준비를 하고 있는 실정이다. 특성화고등학교 내에서는 학생들의 취업을 지원하기 위한 프로그램은 다양하지만, 진학을 원하는 학생들을 위한 적극적인 대응이 학교에는 없다. 특히 도제반에 속하면서 대학 진학을 계획할 경우, 학생들이 일종의 죄책감을 갖고, 특성화고등학교에서 대학 진학 지원을 받을 수 없는 것을 당연시 하고 있었다. 여기에는 학력 인구 감소로 학생들이 원하기만 하면 대학 진학이 가능하다는 구조적인 요인도 작용하고 있다.