국가교통물류기술의 경우 R&D 전담기관의 고유임무는 도로와 물류교통기술부문의 기술사업 R&D를 진행하는 데 필요한 기초 미래기술을 10년 이상 중장기적으로 확보할 임무, 공공 인프라로서 그것의 발전 및 혁신을 지원하는 임무, 기술의 산업화를 위한 지원체계 구축 임무이다.
각 출연(연)별로 제출된 고유임무 정립(안)은 미래창조과학부에서 제시하는 기술 분야를 3가지 유형으로 구분하여 중 장기적 기술달성 목표를 유형별 비율로 구분하는 포트폴리오 개념과 이를 달성할 성과지표로 제시하고 있다. 즉, 기초미래기술선도 유형, 공공 인프라 유형 및 기술산업화 유형이다. 즉, 국가교통물류기술의 경우 R&D 전담기관은 도로교통기술부문의 4대 Mobility 사업과 물류교통기술부문의 4대 기술사업 R&D를 진행하는 데 필요한 기초 미래기술을 10년 이상 중 장기적으로 확보하도록 고유임무로 지정하고 이를 위해 일정 비율의 예산과 인력을 투자하는 것이다. 그다음은 공공 연구 인프라로서 도로교통기술부문과 물류교통기술부문의 발전 및 혁신활동을 지원하는 서비스가 임무의 핵심이다. 또 다른 하나는 단계적으로 개발이 완료되는 기술을 분야별로 단기 혹은 중 장기 산업화가 가능하도록 교통물류 분야 공공산업계 및 민간산업계와 협업 혹은 지원체계를 구축하고 필요 시 예산 및 인력을 투자하는 것이다.