상담 내용은 주로 학업에 돌아갈 것을 제안하거나 학업중단 이후 상황 설명, 미래 직업정보 제공이다. 상담 종료 후에도 학생이 학업중단 의사를 나타내면 교외 상담센터로 이전한다.
상담 내용은 주로 학업복귀 권고 및 학업중단 이후 상황안내와 진로정보 제공이다. 운영 절차는 다음과 같다([그림 Ⅲ-5]). 우선 학업중단 징후가 있거나 의사를 밝힌 학생을 대상으로 Wee 클래스(전문상담교사)에서 진단 및 상담을 실시한 후 외부 상담기관(Wee 센터, 상담센터)과 연계를 위해 학생이나 보호자로부터 상담 신청서를 받아 숙려기간동안 상담을 한다. 상담 종료 후에도 학생이 학업중단 의사를 계속 보인다면 학교 밖 진로 정보 제공을 위해 상담센터로 연계한다. 숙려 기간이 종료된 후 학교로 복귀한 학생은 숙려 기간을 출석으로 인정하고 교내에서 지속적인 상담을 받을 수 있도록 하며, 학업을 중단한 경우에는 자퇴원 제출일을 기준으로 자퇴 처리한다.