보통의 온라인수업과 다르게  블루스카이 온라인 차터스쿨은 개별학습과 실시간 협동학습을 따로 제공한다. 개별학습 과정은 자기주도적인 학생에게 적합하며, 실시간 협동학습 과정은 다른 학생들과 상호 교류할 기회가 주어져 생산적인 토론과 다양한 학습활동이 가능하다.
온라인수업은 대개 개별학습 방식으로 이루어지며, 다른 학생들과의 상호 작용은 비동시적으로(asynchronous) 이루어진다. 가끔 실시간 토론 수업(Live session)을 진행하지만 의무 사항은 아니고 나중에 따로 녹화 방송을 다운 받아 볼 수 있다. 하지만 블루스카이 온라인 차터스쿨(BlueSky Online Charter School)은 개별학습 과정과(My Pace Course) 실시간 협동 학습 과정(Group Pace Course)을 따로 제공하고 있다. My Pace Course는 시작일과 종료일이 자유롭고 개별적으로 학습이 이루어지므로 자기 관리가 철저하고 자기주도적인 학생들에게 적합하다. 이 같은 수업은 주로 학점 회복(credit recovery) 과정의 수강생과 꾸준히 학습하여 적절한 진도를 유지하면서 뒤처지지 않을 자신이 있는 학생이 신청하는 것이 좋다. 반면, Group Pace Course는 상호 교류가 활발한 학생들을 위해 설계되었다. 이 코스에서는 주 1회 이상 실시간 수업을 통해 다른 학생과 소통할 기회가 주어지므로 보다 생산적인 토론과 협동 학습이 가능하고, 기타 다양한 양방향 학습 활동 또한 가능하다.