특성화 사업 컨설팅은 대학 자체의 개선을 지원하거나 특성화 총괄평가의 결과를 공개해 대학과 학과 선택에 활용하도록 한다. 나아가 대학의 장단점과 특징을 파악하여 보완하도록 한다.
특성화 사업 컨설팅은 다음과 같이 활용된다. 첫째, 대학의 요청에 의한 컨설팅 결과는 당해 대학에만 제공하고 대학이 자체적으로 개선할 수 있는 방향으로 지원된다. 둘째, 특성화 총괄평가에 따른 컨설팅 결과는 평가 결과를 일반에 공개하여 대학 선택과 학과 선택의 준거로 활용할 수 있도록 하고 있다. 부가적으로 각 영역 및 내용별로 대학의 강점과 약점을 파악할 수 있도록 하며, 대학의 자체 선정지표를 동시에 발표하여 대학별 특성을 고려할 수 있도록 하고 있다. 이 조치는 본 사업을 통하여 해당 대학에게 필요한 점을 보완하고 중장기적으로 본 사업을 추진해 나가는 데 조력하기 위한 시스템으로 볼 수 있다.