성별영향분석평가의 협력체계를 정부 내 협력, 정부와 전문가의 협력, 정부와 시민단체의 협력으로 분석해보고자 한다. 우선, 공무원내에서, 이에 대한 수행능력과 행정전반 이해도가 요구된다. 이를 통한 적극적 추진과 실효성을 유도한다.
성별영향분석평가의 협력체계를 정부 내 협력(성별영향분석평가를 담당하는 기관담당부서와 사업담당부서, 예산부서), 정부와 전문가(성별영향분석평가센터, 컨설턴트)의 협력, 정부와 시민단체의 협력으로 크게 세 측면으로 나눠 살펴보고자 한다. 가장 먼저 공무원 내부의 협력체계를 보면, 공무원 사회에 성인지적 관점 및 성별영향분석평가제도의 정착을 위해서는 무엇보다도 담당부서가 업무를 수행할 수 있는 능력과 행정전반에 대한 이해를 갖추고 있어야 한다. 아산시의 전담 공무원은 6급 임기제 공무원이지만, 시장직속의 기획실에 있어 국장급의 대우를 받는다. 또한 시의원 출신으로 공무원 내부의 업무체계 등 행정전반에 대해 잘 이해하고 있다. 이러한 경력을 기반으로 하여 전담 공무원은 공무원 조직 내부에서 성별영향분석평가를 적극적으로 추진할 수 있는 권한을 갖고 있을 뿐 아니라, 공무원 조직에 대한 이해를 기반으로 성별영향분석평가를 실효성 있게 수행하는 정책추진환경을 조성하고 있다.