고충 신고 역기능에 대처하기 위해서는, 음해･무고성 투서 적발 시 처벌될 수 있다는 점을 각인 시켜야 한다. 또한 장병들의 고충을 단순 불편 사항과 침해 구제로 나누고, 장병 고충처리 교육의 정례화 시 고충 신고의 역기능에 대한 교육을 강화해야한다.  
이상의 이론적 함의를 토대로 실제 정책에 활용 가능한 제언을 도출 하자면 다음과 같다. 첫째, 고충 신고로 인해 파생되는 역기능에 효과적으로 대처할 수 있는 방안을 제시해야 할 것이다. 특히 가장 많은 사람들이 속해 있는 유형 1에서 이러한 인식이 두드러지게 나타나는 것을 확인할 수 있었다. 이를 위해서는고충신고자의 음해･무고성 투서 적발 시 처벌될 수 있다는 점을 장병들에게 충분히 각인 시킬 수 있어야 할 것이다(박광국･주효진･김옥일, 2001). 또한 고충 신고가 장병들의 맹목적인 사익 추구를 위한 채널로 변질되는 것을 막기 위해 장병들의 고충을 단순한 불편 사항과 침해 구제로 구분하고, 실제 고충처리 과정에서는 침해 구제에 우선순위를 두고 해결을 도모해야 할 것이다. 현재 병영 문화 혁신 사업의 일환으로 장병 고충처리 교육의 정례화가 추진되고 있는데, 본 교육에 고충 신고의 역기능과 관련한 내용을 추가하고 교육의 횟수와 내용을 지속적으로 강화할 필요성이 제기된다.