총사업비 및 예측수요의 변경이 예상될 때 시행하는 타당성 재조사는 금융여건의 변경으로 인한 문제, 운영기간 중 민자사업의 문제, 건설 이후 발생하는 문제 등을 해결하기에는 한계가 있다.
사업시설의 건설이 완료되는 시점까지 적용이 가능한 타당성 재조사 또는 타당성 재평가는 총사업비 및 예측수요의 일정수준 변경이 예상되는 경우에 시행하는 것으로 금융여건의 변경으로 인한 철도민자사업에서 실시협약 체결 후 완공시점까지 발생하는 문제점을 해소하기에는 한계가 있다. 또한, 타당성 재조사 또는 타당성 재평가의 경우에는 사업의 운영시점에는 적용되지 못함에 따라 운영기간 중에 발생하는 민자사업의 문제점을 해결하지 못하게 된다. 또한, 건설이 완료된 이후에는 현재 적용이 되는 사후평가는 사업효과를 평가하고 향후 추진될 유사사업에 대한 시사점을 도출하기 위한 제도로서 민자철도사업의 건설이후에 발생하는 다양한 문제점을 해결하기에는 한계가 있다.