대리납부제도는 공급을 받는 자가 부가가치세 납세의무를 부담하는 것으로 대리납부의무자가 사업자인 경우 대리납부의무를 제대로 이행하지 않을 시, 가산세를 부담하고 제대로 이행할 시 매입세액공제를 받을 수 있기 때문에 실효성을 발휘할 수 있다. 하지만 용역을 공급받는 자가 개인인 경우 이러한 유인과 조세에 대한 지식이 없기 때문에, 제대로 작동하기 어려운 면도 있다.
국내에 사업장이 없는 비거주자 등이 국내에서 용역을 제공하는 경우 일반적인 거래의 경우처럼 공급자의 사업장 관할 세무서에 부가가치세를 납부하도록 하면, 소비지국 과세원칙과는 다른 결과를 초래하게 될 것이다. 가장 간단한 방법은 소비지국의 과세권자가 공급자로부터 세금을 징수하면 해결될 수 있지만, 국내에 사업장이 없는 비거주자 등으로부터 부가가치세를 징수하는 것은 현실적으로 거의 불가능에 가깝다고 할 것이다. 이러한 문제를 해결하는 가장 타당한 방법이 대리납부제도(reverse charge)이다. 즉 국내에 사업장이 없는 비거주자 등이 국내에서 용역을 제공하는 경우 공급자가 부가가치세 납세의무를 부담하는 것이 아니라, 그 공급을 받는 자가 부가가치세 납세의무를 부담하는 것이다. 이 경우 대리납부의무자가 사업자인 경우에는 대리납부의무를 제대로 이행하지 않을 경우에는 가산세를 부담하는 반면에, 제대로 이행할 경우에는 매입세액공제를 받을 수 있기 때문에 동 제도는 실효성을 발휘할 수 있을 것이다. 그러나 용역을 공급받는 자가 개인인 경우에는 이러한 유인이 없고, 조세에 대한 지식도 없기 때문에 동 제도가 제대로 작동하기 어려운 면도 있다. 즉 개인을 포함한 소비자들에게 부가가치세를 과세할 경우에는 납세의무자의 수가 너무 많아지게 되며, 개인들의 경우에는 매입세액공제를 받지 않기 때문에 성실하게 신고할 필요성을 느끼지 못한다. 그리고 각 개인들의 경우에는 복잡한 조세제도를 잘 알지 못하기 때문에 납세협력비용도 과다하게 될 가능성이 매우 높다.