전자정보는 정보의 주체와 보관하는 자가 다른 경우가 많다. 이 경우에는 제3자 보관 정보에 대한 압수･수색이 문제되고, 이 대상에 관해 수사기관, 피압수자, 정보 주체의 이익 문제가 연결된다.
또한 전자정보는 구체적인 형태가 없고 이동이 자유롭기 때문에, 현대 생활에서는 정보의 주체와 그 정보를 보관하는 자가 일치하지 않는 경우가 상당히 많다. 특히 개인 간의 금융거래, 이메일 또는 메신저를 통한 정보의 교환은 해당 금융기관 내지 인터넷서비스 제공자, 또는 웹사이트 운영 업체 등이 구축한 서버에 저장되어 정보 교환이 이루어진다. 따라서 이들을 대상으로 한 압수･수색영장의 집행에 있어서는 제3자 보관 정보에 대한 압수･수색이 문제되고, 정보의 압수･수색의 대상성에 관한 논란은 압수･수색 과정에서 수사기관은 물론, 정보보관자인 피압수자, 그리고 정보 주체의 이익을 어떻게 고려할 것인가의 문제로 자연스럽게 연결되는 구조를 가진다.