국제거래를 하는 사업자가 VAT사업자등록을 하는 경우에는 부담이 크다는 문제가 있다. 따라서 온라인사업자등록이 가능하게 해야 한다. 특히 B2C거래에서 소비지과세원칙이 적용되면 세율이나 세무집행에 대응해야 한다. 또한 국가간 조정이 없으면 새로운 신고비용이 발생할 수 있다.
한편 업계에서 제기되는 문제는 국제거래를 하는 사업자가 VAT사업자등록을 하는 경우에는 부담이 크고 시간도 많이 걸린다는 것이 문제로 제기되고 있다. 따라서 온라인사업자등록이 가능하도록 할 필요가 있다. 특히 2015년 이후 B2C거래에서 소비지과세원칙이 적용되면 27개국의 세율이나 세무집행에 대응해야만 한다. 다만, 2015년 이후에는 One-stop-shop제도가 도입되므로 이를 통한 비용경감을 기대할 수 있을 것이다. 2015년 이후 각 소비지의 부가가치세율의 차이로 인하여 세함가격인 판매가격은 조정이 필요할 것이다. 또한 영수증이나 세무조사 등에 대한 국가간 조정이 없으면 새로운 신고비용이 발생할 수도 있다. EU는 소비지과세원칙을 기초로 하는 VAT시스템에서 OSS는 단일시장으로의 접근을 용이하게 제도라는 확신을 가지고 있다. 그러나 공급자 입장에서는 여전히 27개국의 세무조사 대상이 되지 않을지, 신고 데이터가 많지 않을지, 27개국의 세제에 대응해야 하는 것은 아닌지에 대한 염려가 있어서 EU는 다음과 같은 추가조치를 검토하고 있다.