GSS파일은 GEMSIM이 GSS형식 파일을 바로 이해할 수 있기에 컴파일이 필요로 하지 않는다. 따라서 라이선스 비용이 저렴하지만 시간이 좀 더 걸린다.
다음 그림은 앞의 설명과 조금 다른 방식으로 작업하는 경우를 나타내고 있는데, 이번에는 TABLO 파일이 *.GSS 파일을 생성한다. 이 *.GSS 파일은 컴파일을 필요로 하지 않는데, 그 이유는 GEMPACK의 부속 프로그램인 GEMSIM이 *.GSS 파일을 바로 이해할 수 있기 때문이다. 이 방법의 장점은 Fortran 컴파일이 필요 없기 때문에 라이선스 비용이 저렴하다는 것이다. 반면 단점으로는 모형이 아주 큰 경우 해(solution)를 구하거나 시뮬레이션을 수행하는데 시간이 좀 더 필요하다는 정도일 것이다. 물론 이들 두 방법은 동일한 결과를 제공한다.