조기영어교육에 반대하는 목소리도 높다. 과도한 조기영어교육은 유아의 마음을 망가뜨린다는 우려와 정신적 문제를 유발하거나, 모국어가 없는 사람이 되면 앞으로 아이가 다른 언어를 익히는 일이 어렵게 된다는 폐해를 지적하고 아이가 불안감 없이 언어를 사용하게 함으로써 자신의 정체성을 기르도록 해야 한다고 주장한다.
반면, 조기 영어교육이 모국어발달에 악영향을 미칠 수 있다는 우려로 소학교에서의 영어교육에 반대하는 목소리도 높다. 조기영어교육이 유아의 마음을 망가뜨린다는 우려도 제기된 바 있다(椎名玲、吉中由紀, 2008). 그 사례를 구체적으로 살펴보면, 유아기부터 영어를 배운 아이가 말을 할 때 “엄마씨, 좋아해, 피치”와 같이 모국어보다는 영어 단어를 먼저 사용하고 문법에도 어긋나는 말을 하는 사례가 종종 나타난다는 것이다. 영어의 문법으로 생각하는 버릇이 생겨서 모국어의 문법이 이상하다고 생각해 버리며 자신의 이름조차 모국어로 쓸 수 없게 된 사례를 제시하면서 조기영어교육의 폐해를 경고하였다. 특히, 오사카의 명문 사립 소학교의 한 교사는 문제행동을 일으키는 국제학교 출신 아동이 늘고 있다고 하면서 ‘일본어로 하는 수업을 잘 이해하지 못하고 수업 중에 교실을 돌아다니거나 껌이나 과자를 먹는 아이들이 적지 않다’고 하였다. 뿐만 아니라 친구들과 대화할 기회가 없어서 폭력을 행사하거나 괴성을 지르는 경우도 흔하다고 하였다. 이 기사에서 인용한 게이오대 소아과 의사의 말에 의하면, 과도한 조기영어교육은 정신적 문제를 유발할 수 있으며 모국어가 없는 사람이 되면 앞으로 아이가 다른 언어를 익히는 일이 어렵게 되므로 아이가 불안감 없이 언어를 사용하게 함으로써 자신의 정체성을 기르도록 해야 한다고 하였다. 또한 일본인이라면 일본어로 사물을 생각하고 말하고 싶은 것을 말할 수 있도록 하는 것이 선결과제이며 모국어가 확립되지 않은 아이들에게 영어를 주입시키면 언어에 국적이 없는 일본인을 만드는 일이 된다고 덧붙였다.