통일정부가 동서독 통합 및 구동독 지역의 재건과 관련된 업무를 담당할 새로운 연방부처를 신설하지 않은 이유중 첫 번째는 새로운 연방부처의 설치가 연방주의 원칙에 어긋났기 때문이라는 것이다. 
통일정부가 동서독 통합 및 구동독 지역의 재건과 관련된 업무를 담당할 새로운 연방부처를 신설하지 않은 이유에 대해서는 다양한 주장들만이 제기될 뿐이다. 그 중 첫 번째는 새로운 연방부처의 설치가 연방주의 원칙에 어긋났기 때문이라는 주장이다. 연방국가인 독일에게 있어 각 연방주는 ‘국가’와도 같은 위치이며 따라서 연방정부가 주정부 담당 사항에 간섭할 수 없었다는 것이다. 구동독 지역의 재건이나 통합과 관련된 업무는 구동독 지역에 신설되는 ‘연방주’ 정부가 추진해야 할 사항이었기에 연방정부가 이에 대해 간섭하는 것은 원칙에 어긋나며, 따라서 연방정부가 재건 및 통합 관련 총괄 부처를 신설하는 것이 어려웠다는 주장이다(통일부, 2013c: 99).