현대적 국가방첩 조직은 초국가적안보위협세력에도 대처하고 독특한 안보환경에도 대처할 수 있는 유연한 조직이 되어야 한다. 방첩영역의 인력과 조직을 개편하여 한국판 FBI로 창설하는 것이 필요하다. 방첩 책임자는 정치색 없이 책무를 담당하며 소속은 별개의 독립조직으로 창설해야 한다.
대한민국은 UN 193개 회원국 가운데 국가안보 상황이 가장 열악한 나라임은 부인할 수 없다. 따라서 4대 국가안보사범에 대한 수요가 가장 많을 수밖에 없는 나라이다. 독일의 경험에 비추어 보면 통일 후 10-15년까지가 사상적 ․이념적 방황으로 인하여 국가안보사범이 빈발할 위험성이 더 높다. 그러므로 현대적 국가방첩 조직은 오늘날의 초국가적안보위협세력에도 즉응하면서 우리의 독특한 안보환경에도 대처할 수 있는 유연한 조직이 되어야 할 것이다. 그것은 정보와 수사의 결합이고, 책임자를 비롯하여 조직 구성원이 사명감을가지고 국가안보사범과의 전쟁을 담당하게 하는 실천적 대응 조직화의 길이다. 일국의 방첩 담당자를 순환보직의 일반직처럼 운영하는 것은 모든 것이 항상 새롭게 다시 시작하도록 하는 악순환을 반복하게 하는 일이다. 이러한 관점에서 현재 국가정보원, 검찰, 경찰, 군의 요소 가운데 방첩영역의 인력과 조직 그리고 장비를 헤쳐 모이게 한 연후에 중앙방첩청이나 국가방첩청이라는이름으로 한국판 FBI를 창설하는 것이 필요하다고 사료된다. 조직책임자는 대통령이 임명하는 독임제(獨任制) 기관으로 하되 임기는 FBI 국장처럼 10년 이상이 되게 하여야 한다. 방첩 책임자는 정권교체와 무관하게 그 어떤 정치색도없이 국가안보사범과의 전쟁을 지휘하는 방첩총 사령관의 책무를 담당하게 하여야 할 것이다. 그 소속은 국가정보원, 검찰 등과 별개의 독립조직으로 하는것이 가장 바람직하겠지만, 국가규모, 안보수요 등을 고려하여 법무부 장관이나 국가정보원 산하의 준 독립기구로 창설하는 방안이 가장 현실적일 것으로 사료된다.