원천징수의무자가 미리 징수, 납부하는 원천징수제도는 산출세액을 계산한 후 세액을 공제하는 예납적 원천징수, 연말정산으로 기납부세액과 과부족을 정산하는 종합적 원천징수, 원천징수의무자가 납부하는 완납적 원천징수로 나뉜다. 
원천징수제도는 납세의무자가 세금을 직접 납부하지 않고 원천징수 대상 소 득을 지급하는 원천징수의무자가 미리 징수하여 납부하는 제도다. 원천징수는 과세체계에 따라 예납적 원천징수, 종합적 원천징수, 완납적 원천징수로 나눠진다. 예납적 원천징수는 원천징수에 의해 납세의무가 종결되지 않고 종합 소득에 포함되어 산출세액을 다시 계산한 후 원천징수한 세액을 공제한다. 종 합적 원천징수는 원천징수에 의해 납세의무가 종결되지 않는 것까지는 예납적 원천징수와 동일하지만, 종합소득에 포함되지 않고 연말정산을 통해 산출세액을 다시 계산하여 기납부세액과 과부족을 정산하는 방법이다. 마지막으로 완 납적 원천징수는 원천징수의무자가 계산한 세액을 원천징수하여 납부함으로써 납세의무가 종결되는 것으로 완납적 원천징수에 해당되는 소득을 분리과세 소득이라고 부른다.