기금 운용 계획의 변경은 주로 지출 변경을 말하며, 주요 항목 지출 금액의 변경과 세부항목 지출 금액의 변경으로 구분된다. 변경 절차는 변경 금액 규모별로 차이가 있으며, 특정 목적의 국채 원리금 상환 등의 특정한 상황에서는 변경 범위 제한에 예외가 있다.
기금 운용 계획의 변경은 제70조에서 규정한다. 기금 운용 계획의 변경은 주로 지출 부분의 변경을 의미하는 것으로, 주요 항목 지출 금액의 변경과 세부항목 지출 금액의 변경으로 분류된다. 변경의 절차는 변경 금액의 규모에 따라 달라지는데, 주요 항목 20% 초과(금융성 30%), 주요 항목 20% 이내(금융성 30%), 세부항목으로 구분된다. 지출 변경 범위 제한의 예외로서 다른 법률 규정에 따른 의무적 지출 금액, 기금 운용 계획 상 여유자금 운용으로 계상된 지출 금액, 수입이 기금 운용계획상의 수입 계획을 초과하거나 초과할 것이 예상되는 경우 그 초과 수입과 직접 관련되는 지출 금액, 환율 및 금리의 변동과 기한 전 상환으로 인한 차입금 원리금 상환 지출 금액, 기존 국채를 새로운 국채로 대체하기 위한 국채 원리금 상환, 일반회계 예산의 세입 부족을 보전하기 위한 목적으로 해당 연도에 이미 발행한 국채의 금액 범위에서 해당 연도에 예상되는 초과 조세수입을 이용한 국채 원리금 상환 등을 두고 있다.