교육기관에서는 필요한 다양한 개인정보를 수집·운영하고 있다. 교육부는 이 중, 중요한 정보는 암호화하여 안전하게 관리하고 있다. 특히 교육행정정보시스템을 통해 관리체계를 강화하고 안전하게 운영하고 있다.
교육청, 대학, 학교 등 각 교육(행정)기관에서는 각종 개인정보처리시스템을 통하여 업무를 처리하기 위해 성명, 주민등록번호 등 각종 인적사항뿐만 아니라 성적, 건강 등 민감 정보를 포함한 교육에 필요한 다양한 형태의 개인정보를 수집·운영하고 있습니다. 교육부는 이들 교육(행정)기관과 다방면으로 협조하여, 이들 정보시스템이 여러 보안단계를 통과하도록 설계하여 운영하고 있으며, 중요한 정보는 암호화하여 안전하게 관리하고 있습니다. 특히, 2014년도에는 교육행정정보시스템(NEIS)을 국가 주요 정보통신기반시설로 지정하여 보안 관리체계를 더욱 강화하였고, 그 밖의 개인정보처리시스템에 대하여 지속적인 패치와 프로그램 개선 등을 통하여 더욱더 안전하게 시스템이 운영되도록 조치하고 있습니다.