전자상거래 활성화효과는 전자상거래 시장의 거래량을 분석했다. 그 결과 시장의 거래량을 분석한 결과  본 제도가 전자상거래시장 활성화에 기여했다고 보기에 한계가 있다.
이를 정책목표별로 살펴보면, 먼저 전자상거래 활성화효과는 제도 변화 시기에 나타나는 전자상거래시장의 거래량을 분석하여 살펴보았다. 분석 결과, 본 제도의 세액공제율 변화에 대해 시장참여자들은 민감하게 반응하지 않으며, 정책 대상의 확대에도 시장의 거래량은 영향이 없는 것으로 판단된다. 이에 따라 본 제도는 전자상거래 시장 개설 이전에 도입되었기 때문에 전자상거래시장 형성에는 기여했을 것으로는 판단되나, 정책대상과 공제율 변화에 대한 전자상거래시장 변화를 검토한 결과, 본 제도가 전자상거래시장 활성화에 기여했다는 상관관계 확인에 한계가 존재한다.