한국의 공인인증서는 1997년, 비대면 거래인 전자상거래의 필연적인 안전성 문제를 해결하기 위해 도입되었다. 정부는 거래자 신원 확인과 문서 위/변조 방지를 위해 공인인증기관이 발급하는 전자서명의 효력을 보장하였다.
한국의 공인인증서는 전자상거래의 확대에 따라 1999년 7월부터 시행된 「전자서명법」 에 기반을 두고 도입되었다. 전자상거래는 신속하고 편리하며 거래비용을 감소시킨다는 장점이 있다. 그러나 비대면 거래라는 특징으로 인해 전자상거래에서 안전성과 신뢰성 확보문제가 중요하게 대두되었고, 이 문제를 해결하기 위한 대표적 방법이 전자서명과 전자인증이다. 공인인증서는 「전자서명법」 제1조에서 명시되어 있듯, 전자상거래의 확산에 따라 “전자문서의 안전성과 신뢰성을 확보하고 그 이용을 활성화하기 위하여” 도입 되었다. 즉, 정부는 전자상거래 당사자의 신원을 확인하고 전자문서의 위⋅변조 및 부인을 방지하기 위해, 공인인증기관이 발급하는 인증서에 기초한 전자서명에 대해 “공인 전자서명”의 지위를 부여하고 그 법적 효력을 인정하였다.