교육부는 학업중단 숙려제를 도입하여 부적응학생의 학업중단을 막고자 한다. 그러나 학생 개개인에 적합한 프로그램을 운영하기가 어렵기에 실제로 제도가 잘 이행되지 않는다. 상담과 프로그램의 운영을 위한 전문적인 인력을 충원해야 해야 한다. 
교육부는 현재 학업중단 숙려제 운영 내실화에 대한 가장 많은 예산을 투입하여 학업중단 숙려제 통해 부적응학생의 학업중단을 예방하고자 노력하고 있다. 일선 학교 현장에서 학생들이 학업중단 숙려제를 가장 많이 실시하고 있는 기관은 학교 Wee클래스이다. 학업중단 위기 학생이 많은 학교에서는 학업중단 숙려제 실시 건수도 많기 때문에 학생 한 명 한 명에 맞는 맞춤형 프로그램을 운영하기가 쉽지 않다. 그래서 형식적으로 시늉만 내는 학교가 허다하다. 내실 있는 프로그램 운영을 위해서 선행되어야 하는 것은 상담인력 및 프로그램을 운영할 수 있는 전문 인력 확보이다. 그런데 예산만 지원하고 인력을 지원하지 않고 있기 때문에 실효성 있는 숙려제 프로그램을 운영하기란 여간 어려운 게 아니다. 인력을 충원하는 문제가 선행되어야 한다. 이런 문제가 있기 때문에 이제 숙려제를 통해 학업중단 수를 더 이상 줄이는 데는 한계가 있다고 본다.