둘째, 교과교실제가 당면한 1교사1교실제, 조닝 등 다양한 과제를 해결하기 위해서는 심층적이면서도 세밀한 조사와 연구가 필수적이다. 학생 특히 고등학생의 만족도와 소프트웨어에 대한 만족도를 높여야 하고 이를 위해 중장기적 로드맵을 마련해야 한다.
둘째, 교과교실제의 현안 해소 및 발전 방안 탐색을 위한 조사와 연구의 강화가 필수적이다. 현재 교과교실제는 1교사1교실제, 조닝(Zoning) 및 교사 공간구축 시 학년 반영, 수준별 수업, 교과교실제 유형(선진형, 과목중점형), 노후기자재 교체 등을 위한 예산 지원, 자유학기제 및 2015 개정 교육과정 적용 등심도 있는 검토가 필요한 많은 과제를 안고 있다. 아울러 학교구성원의 만족도를 제고할 필요성에 직면하고 있는데, 교원보다는 학생의 만족도를 높이고, 중학생보다는 고등학생의 만족도를 높이며, 하드웨어보다는 소프트웨어에 대한 만족도를 높일 필요성이 제기되고 있다(김재춘, 2010: 48). 이러한 현안 이외에도 교과교실제의 안정적이고 체계적인 운영을 위해서는 중·장기적 로드맵을 마련할 필요가 있다. 이처럼 교과교실제가 당면한 다양한 과제를 효과적으로 해결하기위한 정책적 판단을 하고, 교육현장에 교과교실제의 필요성과 효과를 보다 설득력 있게 제시하기 위해서는 심층적이면서도 세밀한 조사와 연구가 필수적임에도 불구하고 현재 교과교실제 관련 조사와 연구가 미흡한 상황이다.