동일한 기준의 지니계수 보정 결과는 동일하여야 하나, 가계동향조사와 가계금융복지조사 간의 보정 지니계수는 차이가 난다. 그 이유는 가구원 간의 소득상관관계 차이와 가구소득과 가구원수의 상관관계 차이 때문인데, 이것은 표본설계, 표본추출, 가중치 부여방식에 차이가 있어서 동일한 기준으로  지니계수를 보정해도 다른 결과가 나올 수 있기 때문이다.
가계동향조사와 가계금융복지조사를 이용하여 지니계수를 보정할 때 그 기준을 동일하게 국세통계로 설정하였기 때문에 어떤 조사자료를 이용하더라도 보정한 결과는 원칙적으로 동일하여야 한다. 그런데, 가계동향조사를 이용하여 보정한 지니계수는 0.4117이고 가계금융복지조사를 이용해 보정한 지니계수는 0.4016으로 약간 차이가 난다. 이러한 차이가 발생할 수 있는 이유는 몇 가지가 있다. 먼저, 가구 내 가구원 간의 소득 상관관계가 두 조사에서 다를 수 있다. 가구원의 개인소득 분포가 동일하더라도 두 조사에서 가구원 간의 소득 상관관계가 높으면 가구소득으로 측정하는 지니계수가 높을 수 있다. 둘째, 가구소득과 가구원수의 상관관계가 다를 수 있다. 지니계수는 균등화 가구소득으로 계산하는데 균등화가구소득은 가구소득을 가구원수 제곱근으로 나눈 값이다. 가구소득이 동일하더라도 가구원수가 적으면, 즉 가구소득과 가구원수 간의 상관관계가 작으면 가구소득이 동일하더라도 지니계수가 높을 수 있다. 이상과 같은 두 가지 이유는 모두 표본설계, 표본추출, 가중치 부여방식과 관련이 있다. 가계동향조사와 가계금융복지조사 모두 가구의 대표성을 중심으로 표본을 추출하고 가중치를 부여한다. 표본조사와 관련된 과정이 다르기 때문에 동일하게 국세통계를 기준으로 지니계수를 보정해도 다른 결과가 나올 수 있다.