검사는 수사와 재판에 걸쳐 사실상 모든 권한을 보유하고 있었다. 그러나 각종 과도한 검찰의 수사권을 제한해야 한다는 국민적 공감대와 1차적 수사기관의 관한 남용을 위해 만들어진 검찰 등장의 역사에 맞추어 개정 형사소송법에서는 개정 전 제196조 제1항 및 제3항을 삭제하여 사법경찰관의 1차 수사를 원칙적으로 폐지했다.  이는 검사와 사법경찰관의 관계를 감독관계에서 상호협력관계로 전환하려는 시도이며 사법경찰관의 책임감 있는 수사를 장려한다.
우리나라에서 그 동안 검사는 직접수사권, 수사지휘권, 수사종결권, 영장청구권, 기소독점권, 기소재량권, 공소유지권, 형집행권 등 수사와 재판에 걸쳐 사실상 모든 권한을 보유하고 있었다. 이와 같이 지나치게 과도한 검찰의 권한을 축소하여 남용의 소지를 없애야 하는 당위성의 측면에서 검찰의 수사권을 제한해야 한다는 점에 대한 국민적 공감대가 형성되어 왔는데, 이는 원래 검찰이 직접수사를 하는 기관이아니라 경찰 등 1차적 수사기관의 권한 남용을 견제･감독하고 인권을 보장하기 위해 등장하였던 역사에도 부합하는 것이다. 이와 더불어 검찰에게 과대하게 집중된 권한을 악용한 각종 비위 사건이 적지 않게 발생하여, 국민들이 검찰에 대해 갖는 신뢰도가 매우 낮은 수준에 그치고 있는 만큼 형사사법절차에서의 수사구조를 재설계하여 상호 견제와 균형이라는 권력분립의 원리 아래, 수사에 대한 공정성과 신뢰성을 담보할 필요가 강하게 대두되었다. 이러한 시대상황을 반영하여 개정 형사소송법에서는 수사지휘에 관한 일반적인 규정이라고 할 수 있는 개정 전 제196조 제1항(수사관, 경무관, 총경, 경정, 경감, 경위는 사법경찰관으로서 모든 수사에 관하여 검사의 지휘를 받는다.) 및 제3항(사법경찰관리는 검사의 지휘가 있는 때에는 이에 따라야 한다. 검사의 지휘에 관한 구체적 사항은 대통령령으로 정한다.)을 삭제하여, 사법경찰관의 1차 수사, 즉 송치 전 수사에 대하여 검사의 수사지휘를 원칙적으로 폐지하였다. 사법경찰관에 대한 송치 전 검사에 의한 수사지휘의 원칙적 폐지는 검사와 사법경찰관의 관계를 기존의 지휘감독관계에서 상호협력관계로 전환하기 위한 시도이자 사법경찰관이 책임감 있는 수사를 하기 위한 기틀을 마련해 준 것으로 평가된다.