보조사업 성과관리카드는 3년 간 관리되는데 기간 중 매년 성과평가를 하여 보조사업 지원의 지속 여부를 판단한다.
보조사업 신청 시, 신청자는 보조사업성과관리카드를 작성․제출하여 보조금을 신청하고, 보조사업 성과관리카드는 재정관리시스템 (e-호조)에 등록하여 3년간 관리한다. 동일사업에 지원기간이 3년이 지나면 일몰제를 적용하여 지원을 중단함을 원칙으로 하되, 성과평가를 통하여 지속 지원 여부를 판단 후 보조한다. 다만, 국고보조사업 및 사회복지보조예산으로 지원하는 사업에 대해서는 성과평가를 실시하지 아니한다. 보조사업의 관리 담당부서는 매년 정기적으로 보조사업에 대하여 성과평가를 실시하고 그 결과는 각 지방자치단체 홈페이지에 공개하여야 한다. 성과평가결과는 보조사업의 지원여부를 결정하는데 활용한다.