조직개편의 주요 내용은 재난 안전 관리 강화를 위한 국민안전처 신설과 재난안전본부 등의 이관, 공직 개혁을 위한 인사혁신처 신설과 인사실 등의 이관, 행정자치부의 기능 변경 등이 있다. 
조직개편의 주요 내용은 다음과 같다. 첫째, 강력한 재난 안전 컨트롤타워 구축을 통한 종합적이고 신속한 재난 안전 대응 및 분산된 재난 안전관리 기능의 통합관리를 위하여 국민안전처를 신설하고 舊 안전행정부의 재난 안전본부(본부, 3국 11과)와 국립재난안전연구원 등 189명을 이관하였다. 둘째, 공직사회의 개방성과 전문성 강화 등 공직 개혁을 강력하게 추진하기 위하여 인사혁신처를 신설하고 인사실(3관 10과), 윤리복무관(2과), 공무원 노사협력관, 중앙공무원 교육원 및 소청 심사위원회 등 431명을 이관하였다. 이에 따라 행정자치부는 기존 안전행정부에서 수행하던 기능 중 국민안전처와 인사혁신처에 이관된 기능을 제외하고, 정부조직·정원, 전자정부, 지방행정·재정·세제 및 정부 서무기능 등을 수행하게 되었다.