국내 중소기업이 세계시장으로 나갈 수 있도록 중소기업청은 해외 주요국과 신흥국 그리고 FTA 체결국과의 중소기업협력 MOU 체결을 넓히는데 주력하고 있다.
중소기업청은 국내 중소기업의 해외진출 확대를 위해 주요국 및 신흥국, FTA체결국과의 중소기업 협력 MOU 체결을 확대하고 있다, 2010년 11월에는 이스라엘 시몬 페레스 대통령이 배석한 가운데 산업통상부와 중소기업 분야 MOU를 체결하고, 구체적으로 양국간 공동펀드를 결성하기로 하여 이스라엘 선진기술과 한국의 우수한 제조 및 마케팅 분야를 결합, 세계시장 진출을 촉진하기 위한 기반을 마련하였다. 2010년 12월에는 원전수출을 계기로 중소기업 참여 확대 등 진출 촉진을 위해 UAE 경제부와 MOU 체결한 바 있으며, 터키ㆍ인도 등과도 중소기업 정책 교류, 협력사항의 발굴 등을 위한 실무회의를 지속하고 있다.