청사 옥상에 각 동마다 안전성과 보안을 갖춘 특별한 공간을 연출해 놓았다. 농림부가 위치한 동의 옥상에는 체력단련 시설과 휴게 공간, 유명한 산책코스를 국무총리실이 위치한 동의 옥상은 전시, 교류를 위한 공간으로 꾸며 놓았다.
농림부가 입주한 5동 옥상에는 건강마루가 있으며, 이용자의 체력증진을 위한 체력단련시설과 지압보도 및 폴리와 연계한 휴게 공간이 있어 촉각을 만족시킨다. 특히 5동과 6동사이에는 야생들판 느낌의 확트인 너른길과 억새군락, 다층식재로 억새길을 조성해 5동 내 위치한 식당에서 식사 후 전망마루를 둘러볼 수 있어 청사의 대표적인 산책코스로 꼽힌다. 또한 국무총리실이 입주한 1동 옥상에는 야외교육과 전시·교류를 위한 공간이 마련돼 있으며 4계절 붉은색 식재가 강렬하고 다양한 공간을 연출한다. 이와 같이 청사 옥상은 입체적이고 다양한 녹지공간으로 조성돼 있으며, 쿨링 타워와 실외기등의 설비들은 옥상에 노출되지 않도록 선큰(Sunken)공간에 배치해 미관을 충분히 고려했다. 또한, 전체 옥상조경의 유지관리를 위한 기능성을 고려해 가운데 산책로는 1톤 화물차량이 이동할 수 있는 구조와 폭원을 확보했으며, 이용자의 안전과 청사 보안을 위해 난간을 이중으로 설치하고 난간과 난간 사이의 공간은 관리용 통로로 계획했다. 청사에서 처음으로 맞이하는 이번 봄에는 매화나무, 산수유 등 봄꽃이 만발한 옥상 산책로를 마음껏 걸어볼 수 있다는 생각에 벌써부터 가슴이 설렌다.