국회에서 예산의 결산을 심사하는 것은 실질적으로 불가능하다. 따라서 예산의 집행을 상시적으로 감사할 필요가 있으나, 감사원은 행정부에 속하기 때문에 감사의 독립성에 우려가 존재한다.
다섯째, 예산의 결산과 관련해서는 국회의 결산심사기간이 단기간이어서 제대로 된 결산심사가 실질적으로 불가능하다. 상임위의 결산심사기간은 1주일에 불과하며, 예결위의 종합심사 기간은 한 달 정도의 시간이 주어질 뿐이다. 하지만, 이와 같은 시간도 20일 간의 국정감사 기간과 중복되기 때문에 결산심사를 위한 실질적인 시간은 절대적으로 부족하다. 이러한 상황에서는 심도 있는 결산심사가 이루어지기 어렵다(장용근, 2013). 따라서 예산집행에 대한 상시적 감사(회계감사)가 필요하다. 하지만, 우리나라에서 감사원은 행정부에 속한 기관이기 때문에, 감사의 독립성에 대한 우려가 존재한다. 따라서 국회 결산 심사와 회계검사기능의 효과적인 협조체제의 모색이 필요하다.