정부는 국가 재정 운용방식을 OECD 권고 기준에 맞춰 성과주의 방식으로 전환하기 위해, 새로운 회계제도를 도입, 시행하고 국가회계기준센터를 건립하여 국가회계 제도에 관한 기본 체계를 정비하였다.
먼저, 정부는 국가 재정 운용방식의 큰 틀을 OECD에서 권고하고 있는 성과주의 방식으로 전환하기 위해 1)프로그램 예산제도 2)예산 총액배분･자율편성제도 3)사업･성과계획서 및 중기재정운용 계획제도 4)발생주의･복식부기 회계제도를 도입하는 밑그림을 그리기 시작하였다. 이어서 약 6년간의 준비과정을 거쳐 2004년에 재정운용 관련 제도에 대한 본격적인 개혁을 시작하여, 2009년 ｢국가회계법｣에 의거하여 발생주의 회계제도를 시행하였고 2010년에는 현재의 ‘국가회계재정통계센터’의 전신인 ‘국가회계기준센터’를 설립하였다. 그리고 2012년에는 2011회계연도에 대한 국가재무제표가 국회에 최초로 제출되었으며, 2014년에는 국가회계편람을 발간하면서 현재 시행되고 있는 국가회계 제도에 관한 기본 체계를 확고하게 정비하였다.