넷째, 기획재정부는 예산의 편성과 경제정책을 총괄하고 있어 그 권한이 지나치다. 예산의 통제로 재정건전성을 이루고 경제정책으로 경기부양을 해야하는 상반된 목적을 가지게 된다. 결국, 국가채무를 증가시켜 재정건전성을 악화시키게 된다.
넷째, 현재 우리나라 기획재정부는 예산을 편성하는 기획예산처(현 예산실 중심의 2차관실)와 경제정책을 총괄하는 재정경제부(현 경제정책국 중심 1차관실)가 통합된 조직이어서 그 권한이 지나치게 강하다는 비판의 목소리가 크다. 예산을 통제하여 재정건전성을 제고하는 것이 기획예산처의 주요 목적이고, 경제정책을 통한 경기부양이 재정경제부의 최우선 목표이다. 이렇게 서로 상반된 목표를 가진 두 조직이 외형상 하나로 통합되어 있기 때문에 현재의 시스템 아래에서는 상호견제의 원리가 실제로 작동하기 어렵다. 일례로, 경제정책국이 현실적이지 않은 낙관적 경제전망을 세우고 이에 따라 세수전망 및 지출전망을 작성하더라도 예산실을 통한 실질적인 견제가 작동하지 못할 수 있다. 결과적으로 세수결손과 지출의 확대는 국채발행을 증가시키고 나아가 국가채무를 확대하여 재정건전성을 악화시키고 있다.