정부는 농수산물 수급/가격안정/유통구조 개선을 위해 다양한 경로에서 농안기금(농산물안정기금)을 수집했다. 공사는 여러 업무의 예산 배분에 이를 참고하며 지속적으로 유지시켰다.
농안기금(농산물안정기금)은 1968년 정부가 농수산물의 원활한 수급과 가격안정, 유통구조 개선을 위해 51억 원을 출연하면서 운용이 시작되었다. 농안기금은 크게 정부 출연금, 기금운영 수익금, 재정융자특별회계, 농산물 수익금, 타기금 출연금, 타기관 차입금 등으로 구성된다. 이렇게 다양한 경로로 형성되는 농안기금 운영의 핵심은 예산 편성에 있다. 유통공사는 농안기금설립과 함께 농림부의 예산편성 시 기존의 사업실적을 추정하여 예산에 반영하고 기금 운영의 개선 사항을 지속적으로 조사해 농림부에 적극 제공하는 역할을 꾸준히 수행하였다. 정부와 유통공사의 노력 결과 농안기금의 총액은 꾸준히 중대되었으며 2000년에는 2조 원을 돌파하였다.