부가조사는 3차는 만 15~30세, 4차는 만 45세 이상, 6차에는 만 50세이상, 7차는 근로시간 변화와 여가 사용에 대해 조사, 8차는 노동조합과 노사관계에 관한조사, 9차는 청년층 조사, 10차는 고용형태 조사, 11차년도 교육 부가조사를 실시하였다.
부가조사는 3차, 4차, 6차, 7차, 8차, 9차, 10차, 11차 연도에 각각 실시되었다. 3차 연도에는 만 15세 이상 30세 미만의 청년층을 대상으로 청년층 부가조사를 실시하였고, 4차 연도에는 만 45세 이상의 개인을 대상으로 건강과 은퇴 부가조사를 실시하였다. 5차 연도에는 별도의 부가조사를 실시하지 않았으며, 6차 연도에는 만 50세 이상의 중고령자를 대상으로 은퇴 및 노후생활과 관련된 부가조사를 실시하였다. 7차 연도에는 2004년 7월 1일부터 시행된 법정 근로시간 단축에 따라 응답자들의 근로시간 변화와 여가 사용에 대해 조사하였으며, 8차년도 조사에서는 노동조합과 노사관계에 관한 부가조사를 실시하였다. 9차년도 조사에서는 청년층을 대상으로 성장과정, 학업 및 학교생활을 조사하는 청년층 부가조사를 실시하였으며, 10차년도 조사에서는 임금근로자와 일부 자영업자를 대상으로 계약 형태 등을 심층 조사하는 고용형태 부가조사를 실시하였다. 11차년도 조사에서는 중고등학교 및 대학교 재학 경험과 사교육 등을 심층 조사하는 교육 부가조사를 실시하였다.