생물무기의 이중용도 활용이 가능하고, 해당 협약의 이행 여부 검증 체제가 부재하며, 생물안보의 기술적 투명성 제고와 생물무기 관련 정보의 보안 유지가 양립될 수 없는 등의 문제로, 생물무기금지협약의 역량은 구조적인 제약 아래 있다.
결론적으로 본 연구는 생물무기금지협약은 생물무기의 이중용도(dual-use)가 가능한 특성으로 인해 생물안보의 제고는 근본적으로 어렵다고 주장한다. 둘째, ‘생물무기금지협약’이 이미 1975년부터 발효되었음에도 불구하고, 협약 당사국의 이행을 보장하기 위한 검증체제가 부재한 이유로 인해 생물무기에 대한 국제사회 차원의 신뢰 구축은 제도적으로도 어려운 실정이다. 셋째, 냉전종식 이후 생물테러리즘의 가능성에 대비해 국가안보와 공중보건의 결합을 통한 접근법이 미국을 중심으로 이루어지고 있다. 그러나 생물무기의 전략적 억지효과는 어떠한 생물작용제(biological agent)를 갖고 있는가에 대한 정보가 유출되지 말아야 한다. 이에 반해, 공중보건(public health)의 발전과 과학기술의 진보를 위해 생물안보 차원의 기술적·지식적 투명성(transparency)은 제고되어야 한다는 특성이 있다. 이와같은 특성들의 양립 불가능성이 존재하기 때문에, 본 협약의 제도적 역량은 구조적으로 제약받고 있다.