GDI의 예산은 크게 세 가지 지원금으로 구성되는데, 이들 중 프로젝트 운용비는 추가 지원을 받는다. 프로젝트 지원금이 확대됨에 따라 GDI는 전보다 더 유동성 있게 연구와 정책제언 활동을 할 수 있게 되었다.
GDI의 예산은 크게 정부 지원금, 프로젝트 지원금, 외부 지원금으로 구성되어 있다. 우선적으로 독일연방정부와 NRW 주정부로부터 조직운영 자금의 59%인 5만 5천 유로를 충당한다. 이외 프로젝트 운용비 3만 5천유로는 BMZ과 교육부(Federal Ministry of Education and Research: BMBF)에서 프로젝트 비로 추가 지원을 받는다. 이 프로젝트 지원금은 GDI의 대표적인 지식공유사업인 글로벌거버넌스관리프로그램(Managing Global Governance: MGG)과 글로벌거버넌스스쿨(Global Governance School)을 운영하는 데 집행된다. 이 외에 정책제언⋅훈련을 위한 외부자금은 약 4천유로이다. 프로젝트 지원금이 확대됨에 따라 GDI는 예전보다 훨씬 더 유동성 있게 연구와 정책제언 활동을 할 수 있게 되었다. 외부 자금은 민간기업체 등 총 170여 개의 재단, 비정부단체, 민간기업, 정부, 대학 등으로부터 조달된 재원으로 구성된다.