온실가스 감축률이 가장 높은 수송분야가 배출권거래제에 포함되지 않았던 것과 관련하여, 정부는 2020년까지 저탄소차협력금제를 시행하기로 예정하고 있다.
확정된 온실가스 감축 로드맵에 따르면, 2020년 부문별 BAU 대비 감축률은 수송(34.3%), 건물(26.9%), 전환 발전(26.7%), 공공(25.0%), 산업(18.5%), 폐기물(12.3%), 농·어업(5.2%) 순으로, 수송 분야 감축률이 34.3%로 가장 높다. 그런데 수송 분야는 배출권거래제에 포함되지 않아 이를 위한 별도의 정책이 필요하다고 정부는 판단하였고, 그 결과 자동차의 연비에 따라 구매 시 보조금 혹은 부담금을 부과하는 저탄소차협력금제를 2015년부터 실시하기로 하였다. 하지만 2014년 9 월 정부는 결국 배출권거래제와 저탄소차협력금제 2015년 동시 시행 은 무리라고 판단, 배출권거래제는 예정대로 시행하되, 저탄소차협력 금제는 2020년 말까지 시행을 연기하기로 결정하였다.