교과 미이수와 수업결손 문제, 학생의 교과 선택권을 포함하기 위해 운영되는 온라인 수업은 교과 미이수 문제 해소에 집중한 반면, 수업결손 문제의 경우 배제되는 학생도 있어 상황에 따른 적용 여부가 안내되어야 한다.
스마트교육 추진 전략과 교육정보화 기본계획의 관점에서 바라보는 온라인수업의 목적 및 범위는 학기 중 학적변동에 의한 교과 미이수 및 일부 수업결손 문제의 해소는 물론, 고등학교 학생의 교과 선택권을 확대하는 것을 포함하고 있다. 하지만 실제 온라인수업 운영은 전 편입으로 발생하는 교과 미이수 문제 해소에 집중되는 경향을 보이고 있다. 이는 상대적으로 일부 수업결손 문제 해소와 선택교과 개설 확대 차원에서는 그 활용도가 낮다는 것을 의미한다. 이는 수업결손 문제에 해당하는 학생선수 및 특성화고 현장실습 참여 학생은 기본적인 온라인수업 대상에서 배제되어 개별적인 접근을 모색하게 되는 비효율적 운영의 결과로 나타나게 된다. 따라서 일반적인 교과 미이수 상황과 더불어, 이러한 수업결손 상황에 대한 온라인수업 적용도 명확하게 포함하여 학교 현장에 안내될 필요가 있다.