aT는 비축사업으로 마련된 식품을 북한 수해 복구 지원 사업에서 함께 기부하였다. 이 대북 식량지원 사업은 추후 대외사업의 밑거름이 되어 적절한 농산물 수입과 방출을 진행했다.
aT 비축사업은 북한에 대한 인도적 식량지원을 실현하는 창구로서 조명받기도 하였다. 1995년 북한 수해 복구 지원을 계기로 시작된 대북 식량지원 사업은 2000년 제1차 남북정상회담을 계기로 확대되었으며, 2002년부터는 정례 지원으로 이어졌다. 특히 2002년부터는 aT가 쌀 지원 사업의 주체로 선정되었다. 2004년 aT는 트럭을 통해 북으로 식량을 직접 인도하는 사업에 참여하기도 하였다. 대북 식량지원 사업 수행은 대외원조사업의 경쟁력이 애프터(APTERR) 등 해외로 확장될 때 밑거름이 되기도 하였다. aT는 이처럼 정부비축 사업 실시 기관으로 정부 지정 농산물의 수매와 국영무역으로 지정된 농산물의 도입, 방출 업무를 통해 국내 농산물의 수급안정에 기여하고 있다.