학업 성취도가 낮은 학생들이 수준향상프로그램에 참여를 꺼리거나 못하는 원인으로는 본인이 가난한 가정의 저성취 학생이라는 것을 알리고 싶지 않거나 원하더라도 예산 관계로 프로그램수가 한정되어 있어 참여 순위에 해당되지 않기 때문이다. 
이렇듯 나나중학교에서는 교육복지우선지원사업의 일환으로 여러 프로그램이 운영되고 있다. 그러나 어느 프로그램에서도 도움을 받지 못하는 저성취 학생들도 있다. 수업 시간에 내용이 어려워 알아듣지 못하는 준석이가 그 예이다. 저성취 학생들이 프로그램에 참여하지 않거나 못하는 이유는 다음과 같다. 교사들이 학생들에게 프로그램 참여를 권유해도 초등학생과는 달리 중학생이 되면 “가난한” 학생들을 위한 프로그램이라는 눈치를채기 때문에 방과후에 남아서 스스로 저소득층 학생이라는 것을 확인하고 싶지 않은 것이다. 혹은 “뿌리튼튼” 프로그램처럼 소수의 한정된 학생에게만 가능할 경우 담임교사가 추천하고 학생과 부모가 동의하여도 우선 순위에서 밀려 참여를 못하게 되는 경우도 있다. 이러한 프로그램과 같이 다른 프로그램에 비해 강사비가 많이 들어 추천된 학생들 모두에게 제공하기가 어려운 경우도 있는 것이다.