공공부문 비정규직 정규직화 추진 과정에서 총인건비제, 총정원제, 경영평가 등의 지침들을 수정해야한다. 비정규직 축소 및 정규직 전환, 차별해소 등을 수행한 기관에 대한 가점 부여나 좋은 일자리 만들기 등 여러가지 방안을 검토할 수 있다.
이상에서 살펴본 공공부문 비정규직 정규직화 추진 과정에서 무엇보다 우선되어야 할 과제는 정부가 총인건비제, 총정원제, 경영평가 등 현재 공공기관에 일률적으로 적용하고 있는 각종 지침들을 수정하는 것이다. 결자해지 차원에서 정부가 그동안 통제해 왔던 정원과 인건비 문제를 풀고 예산 확대 등을 약속해야 한다. 이와 관련하여, 공공기관 경영평가6)에서 동기부여 항목을 삽입하는 것을 검토할 수 있다. 예컨대 평가대상이 되는 고용지수를 만들어서 비정규직 비율 축소, 고용형태별 임금격차 완화 등에 따른 가점을 주는 방안이다. 이미 대통령 공약에서도 임금격차 해소를 위한 공정임금제 도입(현재 50~60% 수준인 격차를 80% 수준으로 완화), 비정규직 고용부담금 부과 등이 제시되어 있다. 또한 성과연봉제 도입 기관에 부여했던 3-4점의 가점을 비정규직 축소 및 정규직 전환, 차별해소 등을 수행한 기관에 대한 가점으로 전환하거나 100점 내에 좋은 일자리 만들기 항목을 포함시키는 등의 방법을 검토할 수 있다.