남북 키프로스 정상의 회담이 개최되었으나 영토 분배 등 이견으로 성과 없이 종결되었다. 코피 아난 유엔 사무총장의 통일방안이 조정을 거쳐 최종 아난 플랜 V를 국민투표에 부쳤으나 북쪽 주민의 대다수 찬성에도 남쪽 주민의 압도적 반대로 부결되었다. 이후 남키프로스는 단독으로 유럽연합에 가입하였다.
코피 아난 사무총장의 적극적 중재하에 1999년 제네바와 뉴욕에서 5차례에 걸친 남북 키프로스 정상의 근거리회담이 개최되었다. 2001년과 2002년에는 남북 키프로스를 가르는 그린라인의 유엔평화유지군 관할 지역에서 남북 키프로스 정상의 직접 회담이 개최되었다. 그러나 남북 키프로스의 영토 분배 등에 대한 이견으로 특별한 성과 없이 종결되었다. 코피 아난 사무총장은 2002년 11월 남북 양측의 이견을 조정하여 아난 플랜 I을 통일방안으로 제시하였고, 다시 양측의 의견을 반영하여 2002년 12월 아난 플랜 II, 2003년 2월 아난 플랜 III을, 2004년 3월 아난 플랜 IV를 제안하였으며, 2004년 3월 31일 국민투표를 앞두고 아난 플랜 V를 최종안으로 상정하였다. 그러나 2004년 4월 24일 실시된 아난 플랜 V에 대한 국민투표 결과 선거인 등록을 한 북키프로스 주민 중 64.9퍼센트는 아난 플랜 V에 찬성했으나 남키프로스 유권자 중 75.8퍼센트는 반대표를 던짐으로써 아난 계획은 실패로 돌아갔다. 2004년 5월 1일 남키프로스는 분단된 채로 유럽연합에 가입하였다.