페이퍼컴퍼니 판단기준은 중 하나는 주식 평가액으로 판단하는 것이다. 판례는 주식 흐름이 외국 자회사가 모회사로 바뀌는 것을 제시하고 있으나 평가액만으로 판단하는 건 판단방해요소가 될 수 있다. 그러므로 단순 변화가 아닌 그 과정을 봐야한다. 또한 외국법인과 페이퍼컴퍼니 사이의 구분이 있어야 한다.
이를 통해서 페이퍼컴퍼니의 판단기준으로는 다음과 같은 것을 이유로 제시해야 할 필요성이 있다. 먼저 1) 주식의 평가액으로 페이퍼컴퍼니를 판단하는 기준을 제시할 수 있다. 판례는 주식의 흐름을 통한 외국의 자회사가 모회사로 바뀌는 정도만을 제시하고 있을 뿐이다. 그러나 주식의 평가액으로 페이퍼컴퍼니를 판단하는 것은 위험의 소지를 남기 우려가 있다. 대법원 판례에 따르면 국외의 페이퍼컴퍼니가 주식을 100% 취득하여 모회사로 등극됨에 따라 국내의 모회사는 자회사로 전락되기 때문에 주식으로 페이퍼컴퍼니를 판단함에 있어서 오히려 페이퍼컴퍼니를 판단하는 것이 방해가 될 수 있다. 그러므로 페이퍼컴퍼니의 설립취지나 국외의 페이퍼컴퍼니를 설립하고 주식을 양도하는 이유나 과정을 지켜보는 것이 필요할 것이다. 왜냐하면 보통은 해외직접투자 외국법인의 경우, 소득이 증가하면 할수록 주식을 국내모회사에서 국외자회사로 이동시키면서 결국은 국외 자회사가 100% 주식을 가진 모회사로 바뀌게 되므로 주식의 평가액으로 판단기준을 제시하면 국외소재 외국법인은 모두다 페이퍼컴퍼니가 되는 불합리한 점이 발생하게 된다. 결국 실질과세의 원칙에 따라서 국외의 자회사가 모회사로 등극되고 이에 대한 실질적 지배(주식, 운영, 구조 등)을 행사한다면 페이퍼컴퍼니라도 실질적 과세를 인정하여 적용해야 할 필요성이 있기 때문에 외국법인인지, 페이퍼컴퍼니에 대한 구분이 필요하다.