형사소송에서 사실인정논증이 힘든 것은 간접증거로 사실인정을 하는 경우다. 법관은 수집된 정보를 기초로 사실을 인정하고 논증하나 간접증거만 있는 경우 어떻게 사실인정을 할지가 문제이다.
형사소송에서 사실인정을 논증하는 것이 어려운 이유는 직접증거가 아닌 간접증거만으로 사실을 인정해야 하는 경우가 많기 때문이다. 피고인의 진정성 있는 자백과 같은 직접증거는 존재하지 않고, 그 대신 서로 모순되는 사실을 뒷받침하는 간접증거만이 팽팽하게 대립하는 경우 어떻게 사실을 인정하고 이를 논증할 것인지가 문제된다. 형사법관은 신이 아닌 이상 역사적으로 발생한 사건 그 자체, 즉 실체적 진실을 알 수는 없다. 그 대신 공판절차를 통해 수집한 정보만을 기초로 하여 사실을 인정하고 논증해야 한다. 이러한 이유에서 범죄사실에 대한 간접증거만이 존재하는 경우에 어떻게 사실인정을 해야 할지가 중요한 문제로 부각된다.