지식 및 자원의 활용에 관련된 원주민의 권리에 대한 문제가 제기되었고, 원주민과 부속협정을 맺는 것이 필요하다는 의견이 나왔다. 하지만 퀸즐랜드 식물표본관 표본채집은 거의 왕유지에서 진행되었다. 
전통지식과 그 지식 및 자원의 이용에 대한 원주민의 권리, 특히 원주민 지역에서의 채집에 대한 우려가 제기되었고, 채집하는 자원의 지역 원주민과 부속협정을 체결하는 것이 필요하다는 의견이 있었다(예: Tooth, 2001). 연구에서 전통지식이 활용되지 않았다 하더라도 자원을 발견한 지역의 원주민들의 관리권 및 소유권이 인정되고 존중되는 것은 중요한 것임에 틀림없다(예: CBD 8(j)). 그러나 퀸즈랜드 식물표본관의 파트너십을 위한 표본채집활동은 원주민 지역이 아닌, 대부분이 데인트리 포레스트(Daintree Forest)나 왕유지에서 이루어졌다(P.Foster, pers. comm., 2007; G. Guymer, pers. comm., 2007).