교과용 도서로 개발되어 법적 지위까지 가지고 있는 디지털교과서는 문제가 존재한다. 단말기 부족과 같은 환경적 문제로 일부만 사용하거나, 수업 자료로 부족하다는 점이 있어 인식의 보완이 필요하다. 
디지털교과서는 분명히 구분 고시를 통해 교과용 도서로서 법적 지위를 획득하여 개발되었다. 그렇다면, 디지털교과서는 학교 현장에서도 학생을 위한 교과서로서 자리매김해야 한다. 그러나 단말기 부족으로 많은 학생들이 수업 중에 자신만의 교과서를 보지 못하고 몇 명과 공유하거나, 서책과 병행해야만 한다. 교사는 디지털교과서를 마치 교사용 지도서나, 교수학습 과정안과 같이 인식하며 수업에 사용할 자료가 부족하다는 비판을 하기도 한다. 학생을 위한 교과서로 출발했지만 활용 환경의 부족함이나 디지털교과서에 대한 인식 차이로 인해 발생하는 이러한 현상을 해결하기 위해서는 디지털교과서의 위상 및 디지털교과서를 통해 달성하고자 하는 정책 목표와 뚜렷한 방향성이 제시될 필요가 있다.