규제비용관리제도의 운영에서 점검 요인으로 규제의 범위와 적용대상을 결정해야 한다. 목적 달성의 적절 여부와 체계의 합리성이 중요 요인이 된다. 규제비용관리제는 기업의 규제부담 완화를 목표로 하는데 실상황을 반영하지 못하면 효과는 낮을 수 밖에 없다.
먼저 규제비용관리제도의 운영과 관련한 투입측면에서 점검하여야 할 요인으로서 규제비용관리제의 적용을 받는 규제의 범위와 규제비용관리제의 적용대상을 결정하는 시스템이 있다. 즉 규제비용관리제의 적용대상으로 비용을 관리할 필요가 있는 규제의 범위가 규제비용관리제의 목적인 기업 및 소상공인의 규제부담완화를 달성하는데 적절한지 여부와 이러한 적용대상 규제가 무엇인지를 결정하는 체계의 합리성 등이 중요한 요인이 된다. 규제비용관리제는 기업의 규제부담 완화를 궁극적인 목표로 제시하고 있는데, 현재 제도의 적용대상규제의 범위가 실제로 기업의 규제부담완화를 달성하는데 적절한 요인인지, 만약 규제의 범위가 기업에 영향을 미치는 규제의 내용을 제대로 반영하지 못한다면 사실상 제도의 효과는 낮아질 수밖에 없기 때문이다. 이러한 측면에서 규제비용관리제를 통해 비용을 관리하여야 하는 적용대상 규제는 적절한지, 이러한 적용대상 규제를 결정하는 시스템은 합리적인지 등을 기준으로 분석하였다.