연수원 신축청사의 실내공기질 개선은 총 3단계로 계획됐다. 우선 공사관리 단계에는 오염원을 관리하기 위해 환경표시 인증 제품 사용 등을 명기하고, 검증된 재료를 사용했다. 또 오염물질을 최소화하기 위해 공기 순환이 원활하도록 했으며, 환기도 했다.
연수원 신축청사의 실내공기질 개선은 총 3단계로 계획되었는데, 첫째, 공사관리 단계(~2013.4)로 건축자재, 가구 등 오염원 사전관리를 위하여 인테리어 관련 설계 및 공사 발주 시 새집증후군 방지를 위해 환경표시 인증 제품 사용 등을 과업지시서, 특기 시방서에 명기하고, 한국환경산업기술원(환경부 산하기관)이 인증한 ‘환경표시 인증 제품 또는 이와 동등하거나  천연재료로 만든 것을 사용하였다. 또한, 고품질 공사로 오염물질을 최소화되도록 하기 위하여, 공사 중에도 공기 순환이 원활하도록 자연환기 및 기계환기 등의 충분한 환기로 오염원을 최대한 실외로 배출 등 철저한 시공관리를 하였다. 그리고, 공사전 감독 공무원은 환경표시 인증 제품 여부 등을 확인하기 위하여 시공자로부터 사전 자재 리스트 및 시공방법을 제출받아 적합 여부를 검토하였고, 내부 마감공사 후에는 베이크아웃, 플러시 아웃 등으로 충분한 환기를 실시하였다.