민자발전사업의 방식은 여러가지 중 주로 BOT와 BOO를 택하는데 BOT는 아시아 국가들이 차용하는 방식으로 계약종료 후 전력구매자나 투자유치국 정부가 발전소를 넘겨주는 개념이고, BOO는 중동이 사용하는 방식으로 계약종료 후 발전사업자가 발전소를 소유하는 개념이다. 두가지는 계약종료 후 자산의 선택에 차이가 나지만 발전사업자에게는 비등하다 볼 수 있다. 
민자발전사업의 방식은 BOT(build-operate-transfer), BOOT(build-own-operate- transfer), BTO(build-transfer-operate), BOO(build,-own,-operate), BTL(buildtransfer-lease) 등 다양하다. 민자발전사업의 방식은 대부분 BOT와 BOO라고 한다. 두 가지 개념의 가장 큰 차이는 전력구매계약 계약기간이 종료된 후, 발전 사업자가 발전소의 자산에 대해 취할 수 있는 선택의 차이이다. BOT는 계약종료와 함께 전력구매자 혹은 투자유치국 정부에 발전소를 무상으로 이전하는 개념이다. 반면 BOO는 계약기간이 종료되더라도 발전사업자가 발전소를 계속 소유하는 개념이다. 아시아 국가들은 BOT가 많은 편이나, 중동은 BOO가 대부분이라 한다. BOO 사업에서 계약기간 종료 후, 발전사업자가 행사할 수 있는 선택은 다음과 같다. 전력구매자와 협의하여 전력구매계약 계약기간 연장을 협의하거나, 계속 발전소를 가동하여 생산한 전력을 자유경쟁시장(merchant market)에 판매하거나, 아니면 발전소를 철거하고 사용가능한 기자재를 유상처분하는 방안이다. 결국, 두 가지사업방식의 차이는 발전소 설계수명과 잔존가치에 차이가 있을 뿐, 제안된 사업기간 내 자본회수를 달성하도록 경제적 가치를 산정하면 되는 것이기에 발전사업자에게 사업방식은 크게 중요하지는 않다.