자치경찰제의 문제는 경찰 총량 증가에 의한 예산부담이 발생한다는 것이다. 실제로 자치경찰 도입에 필요한 재정을 감당할 수 있는 광역시도는 거의 없으며, 만약 감당이 가능하더라도 지역에서 원하는 치안서비스를 제공하지 못한다면 이를 운영하려 하지 않을 것이다.
넷째, 경찰개혁위의 권고안에 따르면, 자치경찰제 도입으로 경찰의 총량이 증가하게 된다. 재정부담이 커짐을 의미한다. 하지만 자치경찰의 설치 운영을 위한 국가의 재정 지원은 국가경찰에서 이관되는 인력과 필요한 일부 장비에 한정하고 있다. 이러한 상황 에서 자치경찰을 새로이 창설할 수 있는 광역단위 시도가 과연 얼마나 될지는 의문이 다. 자치경찰의 전체 소요인력을 약 2∼3만명으로 산정하고, 국가경찰에서 30%에 달하는 6,000∼9,000명의 인력을 이관한다고 가정하더라도 14,000∼21,000명의 경찰 관을 신규채용해야 한다. 여기에 1인당 인건비·장비비 등 약 1억2,300만원을 기준으로 계산하면 약 1조 7,200억원 내지 2조 5,830억원이 소요될 것으로 보인다. 문제 는 이러한 규모의 재정을 감당할 능력이 있는 광역시도는 거의 없다는 점이다. 게다가 이러한 예산 투입에도 불구하고 자치경찰이 국가경찰의 극히 제한된 기능만을 담당하여 지역민이 원하는 치안서비스를 제공하는데 한계가 있다면, 재정능력이 되는 광역시도라도 자치경찰을 운영하지 않으려 할 것이다.