새로운 산업단지의 경우에는 운영과 관리가 중요하다. 입주 기업의 선정과 관리가 없이는 성과를 내기 힘들다. 한편, 기존 산업단지의 경우에는 거버넌스 구축이 필요하다.
새로운 산업단지가 건설되면, 이 산업단지의 운영과 관리가 산업단지의 성공을 위하여 매우 중요하다. 만약 국가전략적으로 핵심적인 역할을 해야 하고 이를 위하여 적극적인 지원을 통하여 건설한 산업단지의 경우, 입주 기업의 선정과 관리가 없으면 지원의 성과를 내기 힘들다. 또한 이러한 새로운 계획입지의 건설이 아니라 기존의 생산집적지의 네트워크 강화나 클러스터 주변환경 개선을 위해서는 클러스터내의 기업간의 협의나 조정을 이루어낼 거버넌스가 필요하다. 이는 클러스터 조성과 운영은 물론 참여자들의 이해관계를 조정할 수 있는 가버넌스 시스템을 구축하는 것을 의미한다.