필리핀의 지식재산권 침해는 법무부에서 관할하며, 침해행위가 발생하면 검사와 권리자의 변호인이 법원에 소송을 제기한다.
형사 소송 내용은 마닐라에 있는 법무부(Department of Justice)의 ‘반 지식재산권 해적 행위에 대한 전국 검찰 서비스 태스크 포스’에 형사 고발하게 된다. 법무부는 지식재산권 침해에 관한 사건의 처리에 풍부한 경험이 있다. 충분한 소인이 존재한다고 판단하면 검사는 침해자를 기소하 기 위한 정보를 수집 준비한다. 그러한 정보는 침해 행위가 행해진 지역을 관할하는 지정된 지식재산권 법원에 제출된다. 형사 소송을 취급하는 주요 변호인은 검사이지만, 권리자의 변호인 도 소송에 있어서 검사를 지원하기 위해 임명되는 경우도 많다.