온실가스 감축 이행과정의 공식 절차는 이행평가자료와 시차가 있어 실제 감축 여부를 확인하기 어렵다. 매년 소관부처가 감축실적평가를 실시하고 있으나 전문성의 부재와 기준 및 절차의 부족 등으로 인한 한계가 있다.
이와 더불어, 감축 이행과정에 대한 공식적인 측정·보고·검증(MRV) 절차가 온실가스 로드맵 이행평가자료와 2년의 시차가 있어 실제적인 감축 여부 확인이 어렵다. 매년 세부과제별로 소관부처가 자체 평가한 감축실적 자료를 국무조정실에서 취합하여 다음해 초에 감축실적평가를 수행한다. 별도의 감축실적 평가위원회가 구성되지 않으며,  기술적 사항에 대해서도 감축·통계 총괄기관(온실가스종합정보센터)의 전문성이 활용되지 않고 있다. 또한 부처별 자체 평가시, 감축실적에 대한 중립적인 MRV기준 및 절차가 마련되어 있지 않아 부처별 평가방식이 서로 다르며, 세부과제별 감축기여도에 대한 MRV절차가 불분명하다. 따라서 평가 결과에 대한 신뢰성이 높지 않고 세부과제별 감축기여도를 확인하기 어려운 실정이다.