예산이 부족하면 부족한대로 민간부분, NGO 등 다른 기관들과 협력해 나가며 변화를 이끌어야 한다.
그러나 센터가 갖고 있는 근본적인 법적․인적․재정적 한계로 인해 사업운영에 몇 가지 아쉬움이 있었다. 첫째, 개선 건의 후 후속조치가 없거나 명확하지 않아 모니터링 결과 활용이 미흡한 점 둘째, 2013년 한해 주요 아동권리(아동학대 사망사건, 아동 정보 유출 관련 보도 등)와 관련 한 중대 사안이 발생했을 경우 이에 대한 신속한 모니터링 실시 및 대응에 어려움이 있었던 점 셋째, 아동 당사자의 참여와 관련하여 옴부즈키즈 모니터링 및 옹호활동이 성인 옴부즈퍼슨에 비해 저조한 점으로, 모니터링을 강화하고 이에 대한 실질적인 효과를 위해서는 센터의 위상 강화가 필요하다고 하겠다.