총무팀 요청에는 노임단가는 시중노임단가를 적용하도록 명시하였으나 시설팀과 예산팀의 협의 과정에서 낙찰률 적용 이후 최저임금을 받도록 설계가 수정하게 되어 시중노임단가 적용은 출발부터 불가능하였다.
D기관의 총무팀이 2012년 10월에 각 용역담당 부서에 다음 해 업무의 용역설계를 요청한 공문을 보면 기획재정부, 행정안전부, 고용노동부 공동의 “용역근로자 근로조건 보호지침”에 따라 산출내역 작성시 노임단가는 최저임금이 아닌 시중노임단가를 적용하여 작성하도록 명시하고 있다. 그러나 시설팀과 예산팀의 협의 과정에서 공공병원으로서 만성 적자에 시달리고 있는 상황 때문에 결국 낙찰률 적용 이후 최저임금을 받도록 설계가 수정되게 된다. 즉 낙찰률을 감안하여 시급을 약 5,938원으로 설정하고, 여기에 낙찰률 87.745%가 적용되면 5,210원 이상으로 임금을 지급하게 된다는 것이다. 따라서 이미 기관의 예산 상황 때문에 시중노임단가 적용은 출발부터 불가능하였다.