일반고는 전체 고교의 대부분을 차지했으나 학생선발과 교육과정에 있어 상대적으로 차별받아 왔는데, 이는 자유학기제 성공에 있어서도 걸림돌이 된다. 그 해결책으로 교육부는 일반고 교육역량 강화방안을 추진하고 있다.
최근 일반고 위기에 대한 다양한 진단과 대책이 논의되면서 일반고 육성이 중요한 쟁점으로 부각되고 있다. 일반고가 전체 고교의 대다수(학생수 기준 71.5%)를 차지하고 있음에도 불구하고, 학생선발권·교육과정 자율성 등에서 특목고나 자율고(자율형공립고, 자율형사립고)에 비해 상대적으로 차별 받아왔다는 문제 제기도 이어진다. 일반고에서도 잘 가르치기 위한 공정한 경쟁이 아니라 고교 유형에 따른 부당한 차별이라는 지적이 흘러나온다. 꿈과 끼를 살리기 위한 자유학기제의 성공을 위해서도 학교 간 서열화를 극복하고 학생진로와 연계된 고교교육의 다양화가 절실한 시점이다. 이에 교육부에서는 지난해부터 ‘일반고 교육역량 강화방안’을 마련해 추진해 오고 있다. 일반고의 교육역량을 한층 더 강화하려는 움직임이 속도를 내고 있다.