양국은 입국 및 일시적 체재하는 인원 수를 제한할수도 있다는 예외 조항을 근거로 일본정부는 도입인원 규모를 제한하기로 필리핀 정부와 합의하였다.
양국은 JPEPA 제110조 3항의 규정에 따라서 입국 및 일시적으로 체재하는 자연인의 수를 제한하지 않기로 원칙적으로 합의하였지만, ‘질서 있는 실시(orderly implementation)’를 위해서는 인원 수 등 을 제한할 수도 있음을 명시하고 있다. 따라서 일본정부는 노동시장에 미치는 악영향을 피한다는 명목으로 초기 2년 동안 도입규모를 간호사 400명과 개호복지사 600명으로 각각 제한하기로 필리핀 정부와 합의하였다. 국가자격에 대한 상 호인정이 합의되지 않았기 때문에 일본으로 입국하는 필리핀인 보건의료인력의 정식 명칭은 “간호사 후보자” 그리고 “개호복지사 후보자”가 되며, 따라서 국가자 격을 취득하기 전까지 일본에서 간호사 또는 개호복지사로서 취업할 수 없다.