건설교통부는 혁신도시 구상대로 구성을 수립하고 지구 지정을 위한 준비 중이었다. 이전 인원, 종전 시설 현황, 건물·부지 소요면적, 재원조달 방안, 동반 이전 기관 등을 조사하였다.
2006년 4월 당시 건설교통부는 혁신도시의 기본방향을 제시하는 ‘혁신도시 기본구상 방향’을 토대로 시･도별 기본구상 수립을 착수하여 혁신도시 지구 지정을 준비 중인 상황이었다. 지구 지정을 위해서는 이전 공공기관의 이전 규모와 청사 부지 등에 대한 적정 소요면적의 파악이 필요했기 때문에 2006년 5월부터는 연수원을 포함한 전국의 혁신도시 이전 대상기관 전체를 대상으로 공공기관 지방이전 계획 사전조사를 실시하였다. 주요 조사항목은 이전 인원, 종전 시설 현황, 건물 및 부지 소요면적, 재원조달 방안, 동반 이전이 예상되는 유관기관 현황 등이었으며, 이에 연수원은 다음과 같이 조사표를 작성하여 건설교통부에 제출하였다.