과거 인권위원회는 비능률적이자 무능하다는 평가가 있었다. 냉전이 끝난 후 인권위원회의 역할을 키우자는 의견이 제기됨에 따라 유엔총회는 인권이사회를 설치하기로 했다. 
과거 각국 정부의 대표로 구성된 인권위원회의 활동에 대하여는 각국의 정치적 이해관계에 따라 행동을 한다는 지적과 함께 비능률적이라는 비판이 가해졌다. 특히 강대국의 인권문제에 대하여는 무력하다는 평가도 받았다. 이에 냉전 종식 이후 유엔 체제 강화논의의 일환으로 인권위원회의 역할을 강화하자는 여론이 등장하였고, 마침내 2006년 3월 유엔 총회는 기존의 인권위원회를 폐지하고 새로이 총회 산하에 47개국 대표로 구성되는 인권이사회(HumanRights Council)를 설치하기로 결의하였다. 유엔 총회 산하로 옮긴 것은 그 동안 경제사회이사회 산하의 일개 단위부서에서, 유엔의 책임 있는 운영일원으로 독자적인 이사회(council)가 되었다는 의미이다.