선거구 제도에 상이한 선출 방식이 병존하면 선거구편차이론를 바로 적용할 수 없다. 단원제 단순 병립식인 우리나라와, 일본의 양원제 병립식인 일본의 경우이다.
반면 동일한 기관을 양적으로 분할하여 각기 다른 선거제도를 채택하고 이를 병립하여 적용하는 경우, 논의의 궤가 완전히 달라진다. 가령 선거구제도가 상이한 선출방식이 병존하는 경우, 해당 선출방식의 비율에 따라서 해당 기관의 구성에 대한 투표자의 의사반영비율이 상이해지는 것이다. 즉 선거구편차이론을 바로 적용할 수 없는 영역인 것이다. 예컨대 단원제 단순병립식의 법제인 경우, ‘원(院)에 대한 투표가치’와 ‘선거구에 대한 투표가치’는 상이하게 된다. 구체적으로는 일본과 같이 양원제를 채택했음에도 각 원(院)에 대해 다양한 선거제도를 병립식으로 적용하는 경우, 우리와 같이 단원제를 채택하면서 다양한 선거제도를 병립식으로 적용하여 원(院)을 구성하는 경우 등이 이에 해당할 것이다.