민간부문의 부정과 비리를 차단하기 위한 방법은 해당 기관에 대한 엄격한 관리와 공익신고의 활성화가 있다. 정부보조금을 사용하는 민간단체의 위반행위 처벌 기준이 마련되어야 하며 외부 민간전문가나 기관 내 감사활동 부서가 필요하다.
정부로부터의 지원과 보조에 의존하는 이들 민간단체 등 민간부문에서의 부정과 비리를 차단하기 위한 방법은 두 가지, 즉 해당 민간기관이나 단체에 대한 엄정한 관리와 민간부문에서의 부정행위에 대한 공익신고 등의 활성화이다. 정부보조금을 사용하는 민간단체 등에 대한 효과적 관리를 위해서는 예산집행과 활동수행실태에 대한 객관적이고 체계적인 점검체제와 더불어 위반행위 적발시 보조금의 회수 등 처벌기준이 마련되어야 한다. 특히 이러한 관리에 있어서는 민간단체와 담당 공직자간의 유착 가능성을 해소하기 위해 외부 민간전문가나 기관 내 감사활동 부서를 중심으로 접근될 필요가 있다. 이러한 체제는 민간에의 보조나 지원의 경우 지원판단의 근거와 기준 등 필요성, 지원대상자 선정 기준과 방법, 지원활동의 적절성에 대한 점검과 관리방법 등을 둘러싼 사전적인 준비와 심의가 매우 중요한 의미가 있다.