최근의 특허출원 행태 분석 연구는 기업 R&D와 같은 내부변수와 제도변화까지 고려하여 진행되고 있는데, 일본 기업을 대상으로 제도 변화가 R&D 투자와 특허출원에 미치는 영향을 분석한 Sakakibara et al의 연구에서는 특허제도의 변화가 크게 영향을 주지 않는 것으로 나타났다. 
이 밖에도 Bound et al(1984)은 1976년 미국 2,596개 제조업을 대상으로 특허와 R&D투자 및 매출액 사이 상관관계를 분석한 결과 기업규모가 특허에 미치는 영향이 큼을 보여주고 있다. 최근 기업 R&D를 비롯한 내부변수 뿐만 아니라 제도변화를 고려하여 특허출원 행태를 분석하는 연구가 수행되고 있다. 유사한 연구로 Sakakibara et al(2001)은 1981년부터 1994년까지 일본 내 307개 기업을 대상으로 특허제도 변화가 R&D투자와 특허출원에 미치는 영향을 분석하였다. 1988년 일본의 특허제도 개혁은 주요 무역상대국인 미국의 압력을 통해 이뤄졌으며, 다항제, 동등성 법리의 도입 등을 주 내용으로 한다. 특허제도 개혁이 R&D에 미치는 효과를 살피기 위해 매출액과 Tobin's Q, 연구생산성 및 14개 산업에 대한 더미변수를 포함한 회귀방정식을 추정하였다. 분석 결과 특허제도의 개혁 전후 R&D증가는 거의 없는 것으로 나타났다. 기업 특허행위에 있어서도 R&D지출, 연구생산성을 설명변수로 하고 산업 더미변수와 연도더미를 이용하여 추정한 결과, 특허 당 청구 수만 증가할 뿐 질적 수준의 향상은 확실치 않은 것으로 나타났다. 즉, 일본기업 특허제도의 변화는 R&D와 혁신활동에 인센티브를 부여하는 것으로 단정할 수 없음을 보여 준다.