고등교육기관 진학율이 낮은 것은 특성화고 졸업자들이 대학에 진학하지 않기 때문이다. 한때 대학 진학을 쉽게 하기 위한 특성화고였지만, 지금은 그런 특성이 많이 사라졌다.
최근 고등교육기관 진학률이 추세적으로 하향세를 보이게 된 데는 무엇보다 이전과 달리 특성화고(구 전문계고) 졸업자가 대학에 많이 진학하지 않는 것이 지대한 영향을 끼쳤다. 기실 일반계고 졸업자의 진학률은 2011년 75.2%로 저점을 기록한 후 다시 조금씩 상승하여 2018년 현재 77.7%에 이르러 있다. 반면 특성화고 졸업자의 진학률은 2009년 73.5%로 정점에 다다른 후 상당히 큰 폭으로 하락하면서 2018년 현재 36.0%에 머물러 있다. 이는 한때 학생들이 대학에 보다 쉽게 진학하기 위한 통로로 특성화고를 선택하던 행태가 지금은 거의 사라졌기 때문이다.