연구모형에서는 자아존중감이나 삶의 질, 미래역량 등에 대해 학교유형의 간접효과만을 가정하고 있지만, 직접효과가 존재하는 것으로 가정해야 한다. 예를 들어, 자아존중감의 차이는 학급풍토를 통해 나타나는 간접효과뿐 아니라 학교유형에 따른 직접적인 효과도 존재할 것이다.
연구모형에서 학교유형의 직접효과는 학급풍토(교사지지와 교사사기 및 열의, 수업참여)에만 있는 것으로 되어 있으며, 자아존중감이나 삶의 질, 미래역량 등에 대해서는 학급풍토를 통한 간접효과만 있는 것으로 가정하고 있습니다. 그런데 토론자가 보기에는 자아존중감과 삶의 질, 미래역량 모두 학교유형의 직접효과가 존재하는 것으로 가정해야 하지 않을까 싶습니다. 예를 들어, 학생들이 지각하는 자아존중감의 경우, 일반고와 특목고라는 학교특성이 교사들의 지지나 교사의 사기 및 열의, 수업참여 등에 영향을 미치고, 그것으로 인해 나타난 차이가 자아존중감의 차이로 이어질 수 있습니다. 그러나 자아존중감의 차이는 이처럼 학급풍토를 매개로 나타나는 차이만 있는 것이 아니라, 일반고와 특목고라는 학교특성의 차이에 의한 직접적인 효과도 분명히 존재할 수 있을 것으로 보입니다(회귀분석의 개념으로 접근해 보면, A 독립변수와 B 독립변수의 상호작용 효과를 살펴보고자 할 경우 분석모형에 상호작용 항(A×B)만을 투입해서는 안 되면, 반드시 A 변수와 B 변수의 주효과 항이 포함되어 있어야 하는 것과 같은 이치입니다).