정책조정체계 재구축을 위해 통일부를 부총리급으로 격상하는 방안과 기존의 통일부를 대체할 수 있는 대통령 직속의 행정위원회를 신설하여 '특별법'에 따라 설치되어 원칙적으로 독립성이 보장된다.
기존의 통일부 위상을 강화함으로써 정책 조정체계를 재구축한다면 통일부를 부총리급으로 격상하는 방안과 기존의 통일부를 대체할 수 있는 대통령 직속의 행정위원회인 ‘(가칭)통일위원회’를 신설하는 방안을 생각해 볼 수 있다. 통일위원회는 국무총리의 지휘·통솔을 받지 않는 대통령 직속의 행정위원회로서 ｢정부조직법｣이 아닌 ｢특별법(통일위원회법)｣에 따라 설치되어 원칙적으로 독립성이 보장된다. 위원회는 장관급 위원장 1명과 10~20명 정도의 ‘통일위원’(이하위원)으로 구성되는데, 위원은 대통령, 국회, 대법원장이 지명하는 자로 하며, 위원장은 위원 중 1명을 대통령이 지명한다. 위원장 및 위원은 그 임기가 정해져 있어 정권교체와 관계없이 임기동안 임무를 수행할 수 있다.