공공기관은 정부의 큰 국책사업을 수행하며 자금조달을 부채로 충당했고, 정부의 요금규제로 수익성이 악화되어 재무상태가 크게 악화되었다. 공공기관의 부채는 지난 정부에 약 80%  증가하여 국가 총부채 증가와 함께 해결해야 할 현안이 되었다.
공공기관의 부채에 대한 우려는 대규모 국책사업을 공공기관이 수행하는 과정에서 불거졌다. 지난 정부에서 해외자원개발사업, 하천정비사업, 임대 주택사업 등 규모가 큰 국책사업이 공공기관에서 수행되었고 공공기관은 사업수행에 대한 자금조달을 부채로 충당하게 되면서 재무상태가 크게 악화되었다. 공공기관에 대한 과도한 정부의 요금규제는 부채를 악화시키는 또 다른 요인으로 지목되었다. 실제로 정부의 물가인상에 대한 통제 때문에 지속적인 원가상승에도 불구하고 공공기관 요금이 동결되어 공공기관의 수익성이 악화되고 이는 투자와 사업경비 마련을 위해 공공기관의 부채를 증가시켜 왔다. 실제로 공공기관의 총부채는 지난 정부인 2008년부터 2013년까지 약 80% 증가하였으며 국가 총부채의 증가와 함께 시급히 해결해야 할 현안이 되었다. 더구나 수익으로 부채의 이자를 충당하지 못하는 공공기관도 발생하여 공공기관의 부채가 위험 수준에 도달했음을 보여주고 있다.