새로운 키프로스 정부 수립에 대한 협상이 무산된 후 터키군은 키프로스 영토의 부분을 점령하였다. 터키군은 전쟁 중 그리스계 키프로스 민간인을 공격할 뿐만 아니라 심각하게 탄압하였다. 그리스계 키프로스인 대부분은 터키군의 통제를 벗어나 남쪽으로 향했다.
이후 터키, 그리스, 영국의 협상에 의해 새로운 키프로스 정부 수립에 대한 협상이 진행되었으나 별다른 성과를 거두지 못한 상황에서 터키 군대는 8월 중순까지 군사 작전을 수행하여 키프로스 영토의 36.4퍼센트인 3355제곱킬로미터를 점령하였다. 1974년의 전쟁 당시 그리스계 측은 터키의 개입으로 6000명의 사상자가 발생한 것으로 추산했다. 유럽 인권위원회는 1976년 7월 10일 발간한 보고서에서 그리스계 키프로스 민간인에 대한 터키 군대의 심각한 인권침해 실태를 고발하였다. 또한 터키계 키프로스인 마을 세 곳에서 그리스계 키프로스 군대가 민간인을 공격했다는 보고도 있다. 공식 집계에 따르면 1619명의 그리스계 키프로스인이 실종되었으며 터키계 키프로스인도 다수 실종되었다. 대부분의 그리스계 키프로스인들은 터키 군사의 통제하에 있는 영토에서 탈출하였다. 그 수는 10만 5000명에서 20만 명 사이로 추정된다. 키프로스 북부에 거주하던 그리스계 키프로스인의 95퍼센트가 마을을 떠나 남쪽으로 향했다.