비영리민간단체 공익활동 지원사업 평가와 관련해 2014년에는 사업관리와 평가를 개선하여 부적절 집행으로 인한 환수 결정액이 줄어들 것으로 기대하고 있다. 
이와 같은 지적과 관련하여 ① 비영리민간단체 공익활동 지원사업의 평가는 사업평가 60%, 회계 평가 40%로 구성하고 있으며, 세부 평가지표의 합이 90점을 넘으면 우수, 60점 이상이면 보통, 60점 미만은 미흡으로 평가하므로 부당집행으로 평가받아 반납한 금액이 있어도 ‘보통’ 이상의 평가를 받을 수 있다. 다만, 2014년에는 「비영리민간단체 공익활동 지원사업 관리정보시스템(NPAS)」을 도입하여 사업비 집행상황을 수시로 점검하여 부적정 집행과 미흡 사항을 사업 기간 중에 시정·보완할 수 있도록 운영하는 등 사업관리와 평가를 개선하였으므로 부적절한 집행으로 인한 환수 결정액이 예년에 비해 줄어들 것으로 기대하고 있다.