해당 시스템에는 21개 은행, 금융결제원, 가상시장 등이 참여한다. 금융기관은 판매/구매기업 및 가상시장에 대한 계약/관리 등을 맡고, 금융결제원은 지급결제중계시스템 운영 등을 수행한다. 가상시장은 구매 및 판매기업 간의 거래를 중계하는 업무를 한다.
나. 참가기관 및 역할
기업 간 전자상거래 지급결제시스템에는 수출입은행을 제외한 21개 은행, 금융결제원, 가상시장(e-Marketplace), 구매 및 판매기업 등이 참여하게 된다. 금융기관은 자금결제 및 자금정산 이외에 판매/구매기업 및 가상시장에 대한 계약/관리, 특화서비스의 제공 및 에스크로우 관리 등을 맡게 되며 금융결제원은 중계센터 및 인증기관으로서 지급결제중계시스템을 운영, 자금결제 중계 및 차액결제금액의 산출, 거래내역 데이터베이스 관리 및 전자결제수단 인증관리 업무를 수행하게 된다.
한편 가상시장은 구매기업 및 판매기업 간의 거래를 중계 하기 위하여 다양한 지원기능을 수행하게 되는데 주로 거래정보 및 결제정보의 은행 앞 전송, 판매자 정보의 목록화, 필요 시 판매기업과의 협약에 따른 에스크로우 관리 등을 하게 된다. 구매 및 판매기업은 거래은행과 대금수수에 관한 계약을 체결하고 가상시장에서 물품을 매매하게 된다.