분야 간 사업의 우선순위 조정이 필요한 상황이어서 부처 단위 자율조정 방식에는 한계가 있고, 축적된 성과 정보를 정리 및 축소하고 더 나은 사업에 예산을 배분하는 등의 작업이 필요하므로, 기획재정부 예산안 편성 절차에 있어, 사업 간 우선순위 설정과 예산배분 조정 작업 등이 필요하다. 
우선, 기획재정부 예산안 편성 절차를 강화하는 방안이다. 기획재정부 예산안 편성 과정에서, 부문 및 분야별 우선순위 설정과 재정사업성과 관리 제도 등 성과평가 결과의 활용을 강화하여 지출절약 옵션을 설정하고 이에 맞춰 예산편성하는 것이다. 현재의 부처별 중기재정계획과 예산안 편성 지침, 그리고 재정성과관리제도 등은 부처 내의 배분적 효율성과 지출 절감을 목적으로 주로 운영되고 있다. 하지만, 다 부처 재정사업이 증가하고 있고, 특정 분야 내, 분야 간 사업의 우선순위 조정이 필요한 상황에서 현재와 같은 부처 단위의 자율조정 방식은 한계를 가진다. 또한, 계속 재정사업 중 더 이상 사업의 수요가 없어졌거나, 효과가 낮거나, 더 효율적인 정책수단을 활용한 재정사업이 있거나 하는 경우에도 불구하고 기존에 편성된 예산사업이 폐지되거나 축소되지 않는 관행 등을 제거하기 위해, 그동안 쌓여온 성과정보를 같은 분야의 유사 사업과 비교하여 사업의 정리와 축소, 그리고 더 나은 사업에 예산을 배분하는 등의 작업이 필요하다. 이를 위해, 분야별 혹은 분야 간 사업의 우선순위를 설정하고, 예산 배분을 조정하는 등의 작업이 기획재정부의 예산안 편성 지침 작성 과정 중에 이루어질 수 있을 것이다. 여기에는 민간이나 학계, 연구원의 관련 분야 전문가는 물론이고, 국회나 감사원 등과 같이 사업평가를 수행하는 기관의 전문가가 함께 참여하는 TF팀을 조직하는 방안이 검토될 수 있다.