정부도 고등교육에 대한 재원 확대와 지원을 통해 대학 발전을 꾀하고 있으며 1990년대 중반부터 대학의 지원규모가 확대되었고 이후 대학 교육의 경쟁력 강화, 대학개축 등을 위해 재정지원 사업을 지속적으로 해왔다. 대학 재정지원사업이 미치는 영향이 증가되고 있다.
또한, 학령인구의 감소에 따라 대부분의 고등교육 기관들이 재원확보 문제에 직면하고 있는 상황이다. 정부에서도 고등교육에 대한 정부재원의 확대와 효율적인 재정지원을 통해 대학 발전을 꾀하고 있다. 1990년대 중반부터 대학의 수월성 제고를 위해 대학의 다양화와 특성화를 지원하는 각종 정책을 시행하면서 지원규모가 확대되었으며, 이후 대학 교육의 질적 수준 제고 및 경쟁력 강화, 대학개축 추진 가속화 등을 위해 대학 재정지원 사업을 지속적으로 추진해왔다. 최근에는 고등교육에 대한 지원 확대를 국정과제로 상정할 만큼 대학지원에 대한 현 정부의 높은 관심에 힘입어 지원 규모가 지속적으로 확대되고 있어(서영인･김미란･김병주, 2014) 대학 재정지원사업이 대학에 미치는 영향 또한 증가하고 있다. 5･31교육개혁 이후 정부에서 중점을 두고 추진한 세부 고등교육개혁 방안들은 조금씩 차이가 있지만 고등교육 경쟁력 강화라는 기본목표, 그리고 경쟁, 평가, 선별적 지원방식이 비교적 일관성 있게 유지되고 있다(변기용･신현석･이석열･나민주･남수경, 2012).