D기관 행정실무원의 월급여는 1년차 기재부 사무원 나급, 일반직 공무원 9급과 큰 차이가 없지만, 그러나 직무급의 경우는 근속기간과 관계없이 동일한 기본급이 적용되어 근속기간이 10년차를 비교하더라도 호봉제인 기재부와 일반직 공무원과의 임금격차가 60%대로 커진다.
D기관 행정실무원의 2015년 월 봉급액 1,229,380원은 1년차 기획재정부 사무원 나급의 월 봉급액 1,294,080원의 95.0% 수준이며, 1년차 일반직 공무원 9급의 월 봉급액 1,282,800의 95.8% 수준으로 그 차이는 많지 않다. 그러나 직무급의 경우 근속기간의 증가에 관계없이 동일한 기본급이 적용되기 때문에 근속기간이 증가할수록 호봉제를 적용하는 기관의 동일한 근속기간을 가진 근로자와의 임금격차도 커진다. 예를 들어 2015년을 기준으로 근속기간이 10년인 기획재정부 사무원 나급에 해당하는 근로자의 기본급은 근속기간에 따른 호봉승급분이 반영된 1,987,600원, 일반직 공무원 9급의 기본급은 1,918,400원이다. 그러나 동일한 근속기간을 가진 D기관 무기계약직 근로자의 기본급은 1년차와 동일한 1,229,380원으로 이는 기획재정부 사무원 나급 근로자 기본급의 61.9%, 일반직 공무원 9급 기본급의 64.1%로 그 격차가 상당히 확대되었음을 알 수 있다.