국가지리정보체계를 효율적으로 추진하기 위하여, 국가지리정보체계 추진 위원회를 설치하였고, 산하에 총괄분과, 지리정보분과, 기술개발분과, 표준화분과, 토지정보분과로 총 5개의 실무분과를 두었다.
국가지리정보체계의 효율적인 추진을 위하여 건설교통부 차관을 위원장으로, 11개 부처 1급 공무원을 위원으로 하는 국가지리정보체계추진위원회를 설치하였다. 그리고 산하에 총괄분과(건설교통부), 지리정보분과(국립지리원), 기술개발분과(과학기술부), 표준화분과(정보통신부), 토지정보분과(행정자치부)로 총 5개의 실무분과를 구성하였다. 그중 지리정보분과(국립지리원)는 지리정보시스템 구축에 가장 근본인 전국의 지형도를 1/1,000,1/5,000 및 1/25,000 축척으로 디지털화하였다. 1999년까지 1/1,000 지형도는 전국 79개 도시를 정부와 지방자치단체가 사업비를 공동 부담하여 제작하였으며 1/5,000 및 1/25,000 지형도는 일부 산악지역을 제외한 전국 지형도제작을 완료하였다.