학년군제 찬성파는 내용에 위계를 부여하는 것을 부정적으로 보는데 신체활동 가치는 계열성을 전제로 구분할 성격이 아니므로 교육내용의 위계를 논하는 의미가 없다는 주장이다. 반면 신체활동이 계열성을 가진다는 반론이 존재한다.
우선 교육과정 편성의 문제로서 내용의 위계성이 쟁점의 핵심으로 부각되었다. 학년군제 적용에 찬성하는 입장에서는 내용에 위계를 부여하는 것을 부정적으로 본다. 현 교육과정은 신체활동 가치를 중심으로 내용 체계가 구성되어있다. 신체활동 가치는 계열성을 전제로 구분할 성격의 것이 아니며. 따라서 교육 내용의 위계를 논하는 것은 큰 의미가 없다는 주장이다. 또한 신체활동이 계열성을 갖는다는 것 역시 반론의 여지가 있다. 각각의 신체활동은 교사가 학생의 신체 및 기능 발달에 맞게 선택하거나 재구성할 수 있기 때문이다. 즉 신체 활동의 계열성은 부여된 것이 아니라 교사가 조직해야할 과제라는 점이다. 이러한 관점에서 본다면 학년군제의 적용은 교사의 자율권과 교육 의도를 보장할 수 있는 제도로서 지속적으로 추구해야 한다고 주장은 설득력이 있다.