복수노조 제도가 결사의 자유를 확대시켰다고 평가하긴 어렵다. 금속노조의 예를 보면 노조를 약화시키기 위해 사용자가 노조를 의도적으로 설립하면서 개입한 사례가 있다. 공공부문에서도 이러한 현상은 확인되었으며, 단결권의 부분은 모두 기존 노조에서 분리한 복수노조가 설립되는 것을 확인하였다.
복수노조 제도 시행 이후 기업 단위에 노동조합 설립이 증가한 것을 두고 복수노조 제도가 결사의 자유 또는 교섭의 자유를 확대시켰다고 평가하긴 어렵다. 금속산업 사례를 보면 기존 강성으로 분류되는 금속노조사업장 단위 지회를 약화(혹은 파괴)시키기 위해 사용자가 기업노조를 의도적으로 설립하면서 적극 개입전략을 활용한 사례가 적지 않게 확인된다. 이 과정에서 전문 법률집단(이른바 black lawyer)의 개입이 특징으로 꼽힌다. 기존 노조의 노동기본권은 오히려 제약되는 결과가 초래되었다. 공공부문에서는 금속산업에서만큼 복수노조 설립을 통한 기존 노조 약화/파괴 움직임이 두드러지지는 않았다. 하지만 노조 분할을 통한 복수노조 형성, 소수노조의 교섭권 배제, 초기업 단위 노조 약화 촉진 가능성 등이 금속산업과 유사하게 확인되었다. 특히 단결권 측면에서 보면, 금속산업과 공공부문 모두에서 기존 노조에서 분리되어 별도의 노조가 설립되는 조직분할형 복수노조가 많다는 것이 확인되었다. 조합원이 늘어나는 것이 아니라 하나의 노조에 있던 조합원들이 2개 이상의 노조로 그 소속을 달리하는 경우가 많다는 것이다. 현행 제도하에서 ‘결사의 자유’가 확대되었다기보다 ‘분열의 자유’가 확산된 것으로 평가할 수 있다.