신공공관리론 역시 기업형 경쟁원리를 통한 효율성을 강조한다. 문명재는 정부기능 재분류로 생산성, 자율성, 투명성 제고의 목적을 제시했다. 조직생태학의 관점에서 정부조직을 둘러싼 경제위기, 사회갈등, 미래수요의 변화 등  환경생태계에 대한 논의가 필요하다.
신공공관리론 역시 목적론적 시각에서, 전통적인 관료조직의 소극성, 나태함을 극복하기 위해서 시장형 또는 기업형 경쟁원리를 도입하여 효율성을 높여야 한다는 것이다(Osborne, 1993). 문명재(2009)는 조직개편의 정치적 목적과 함께 행정적 목적으로 정부기능 재분류를 통한 효율성과 생산성 증대, 정부의 자율성과 책임성 증대, 정부의 투명성 제고 등을 제시한다. 조직생태학에 의하면, 조직을 둘러쌓은 생태계의 변화는 개별조직의 생존에 직접적인 영향을 미치게 되며, 적응하지 못하는 조직은 소멸하게 된다는 것이다(Hannan & Freeman, 1977). 즉 조직 상호간의 경쟁이 심화되면서 환경과 조직의 정합성이 높지 않은 경우 도태될 수 있다. 이러한 조직생태학의 관점에서 정부조직개편을 요구하는 환경생태계의 수요가 무엇인가에 대한 논의가 필요하다. 정부조직의 생존을 위해서는 경제위기의 심화, 사회갈등의 증가, 미래수요의 변화에 탄력적으로 적응할 필요가 있다.