규제비용관리제의 기본 원칙은 매우 단순하다. 이는 기존의 규제관련 제도와 완전히 다른 차원의 새로운 내용은 신설･강화규제로 인해 발생하는 비용에 상응하여 기존규제로 인해 발생하는 비용을 상쇄하여야 한다는 것이다.
규제비용관리제의 기본 원칙은 매우 단순하며, 기존의 규제관련 제도와 완전히 다른 차원의 새로운 내용은 신설･강화규제로 인해 발생하는 비용에 상응하여 기존규제로 인해 발생하는 비용을 상쇄하여야 한다는 점이다. 이러한 규제비용의 총량을 관리하고자 하는 규제비용관리제의 핵심 원칙을 준수하기 위하여 전제되어야 하는 조건은 측정된 규제비용은 측정주체가 누구인지에 관계없이 그리고 규제의 내용이 무엇인지에 관계없이 보편타당한 규제비용분석결과를 확보하여야 한다는 점이다. 이를 위해 규제비용관리제가 효과적으로 운영되기 위해서는 무엇보다 보편타당한 규제비용분석방법을 개발하여야 하며, 모든 개별 부처는 이러한 표준산식에 근거하어 규제비용을 계산하여야 하고, 이러한 규제비용분석결과를 객관적･과학적으로 검증할 수 있는 독립된 기관이 필요하다.