IPE 분석시 겹치거나 원 보고서에 없는 내용은 제외하였다. 입력 자료 평가에서는 분석 계획 수립과 목적, 수행 조직 등을 대상으로 하였고, 과정 평가는 예산, 기관역량 등을 다루었으며, 효과 분석에서는 보고서 공개 여부, 활용성 등을 살펴 보았다. 본 연구에는 연구원 면담내용 등도 활용되었다.  
4개의 갈등영향분석 사례는 IPE 기법에 따라 분석을 시도하였다. 그러나 각 부분별 평가 요소 하나하나를 적용하여 비교분석하기에는 자료의 한계가 많았다. 따라서 분석은 가능한 한 각 부분 평가요소를 기준으로 평가하되, 중복되거나 갈등영향분석서에 없는 내용은 제외하였다. IE(Input Evaluation)에서는 사전 갈등영향분석 계획 수립 유무, 갈등영향분석 선정의 적합성, 갈등영향분석 수행 목적의 적정성, 갈등영향분석 수행 조직 및 인력의 전문성을 포함하였다. 그리고 PE(Process Evaluation)에서는 갈등영향분석 수행 예산 규모 및 적절성, 갈등영향분석 발주 기관의 역량 및 의지, 갈등영향분석 수행 분석 결과의 객관성 및 종합성을 포함하여 분석을 하였다. 또한 EE(Effectiveness Evaluation)에서는 갈등영향분석 보고서 공개 유무, 갈등영향분석의 실무 활용성, 갈등영향분석과 갈등 해결과의 연관성을 포함하여 분석하였다. 본 연구는 IPE 기법에 따른 각 갈등영향분석서에 대한 분석과 비교연구, 그리고 각 갈등영향분석의 책임(공동)연구원에 대한 인터뷰 내용 등이 활용되었다.