교육부에서는 학교폭력예방연구지원센터를 지정, 학교폭력예방 정책에 관한 전담기구를 설치하여 예방문화지표 개발, 어깨동무 사업 운영 등 체계적인 활동을 하고 있다. 
둘째, 학교폭력예방에 관한 정책연구를 수행하는 전담기구를 설치함으로써 체계적이고 효과적인 학교폭력예방활동을 수행하고 있다. 2012년 교육과학기술부(현 교육부)에서는 한국교육개발원에 [학교폭력예방연구지원센터]를 지정하고 학교폭력실태조사, 연구, 컨설팅 등을 수행하도록 하였다. 그동안 [학교폭력예방연구지원센터] 주관으로 학교폭력실태조사를 매년 실시, 분석하였고, 학교폭력예방에 관한 주요 기초･정책 연구들을 수행해왔다. 특히 [학교폭력예방연구지원센터]는 학교폭력 예방문화 지표 개발 연구를 비롯하여 어울림 프로그램을 개발하고 어깨동무학교 사업을 운영, 평가하는 데 있어 주도적인 역할을 담당해왔다.