공정거래위원회, 중앙노동위원회 등 합의제 행정기관의 재결은 운영이 활성화되고 있지만 행정심판을 재결하는 단독행정청의 경우엔 객관성 및 중립성이 부족하다는 한계가 드러난다. 
법령에서 합의체 행정청이 재결을 하는 경우도 있지만, 단독행정청이 재결을 하는 경우도 있다. 먼저 합의제 행정기관에 의하여 재결을 하는 경우는 소청심사위원회, 공정거래위원회, 중앙노동위원회 등을 들 수 있다. 단독행정청에 의하여 재결을 하는 경우로서는 집회및시위에 관한 법률에 의한 집회 및 시위의 금지통고에 대한 이의신청에 대한 재결이라거나 행정대집행법 제7조81)에서 규정하고 있는 행정심판이 이에 해당된다. 양자를 독립적이면서 전문적인 기관에 의하여 행하여지는가를 기준으로 구별하면 합의제 행정기관에 의한 경우가 비교적 운영이 활성화되고 있는데 반하여, 단독행정청의 경우에는 객관성과 중립성이 부족하여 한계를 드러내고 있다.