aT는 수입농산물의 안전성과 입찰가 유지를 위해 수입농산물 국영무역 제도를 개선하고 비축농산물의 수급관리 경쟁력 확보를 위해 차세대 비축 통합정보시스템을 구축했다.
더불어 2013년 10월 1일 '수입농산물 국영무역 제도'를 전면 개선해 △수입농산물의 품질 안전성 강화 △불합리한 입찰계약 근절 △소비자 불만해소 전략을 도출하였다. 2015년 5월에는 차세대 비축통합정보시스템을 구축함으로써 비축농산물 수급관리 경쟁력을 획기적으로 개선하였다. 이는 2015년 기준 aT가 대행하고 있던 WTO 물량 71만 4,000톤, FTA 물량 16만 5,000톤 등 96만 9,000톤의 농산물 관리를 효율화하고 8,000건에 달하는 추천서 발급 업무를 간소화함으로써 사회적 비용을 경감하기 위한 것이었다. 이를 위해 aT는 관세청 국가관세종합정보망과 연계하여 추천서 신청에서 발급, 사후관리까지의 업무를 원스톱으로 처리할 수 있도록 제도를 개선하였다. 또한 오프라인으로 검정결과를 통보해주던 농산물품질관리원의 검정 결과도 정보시스템과 연계해 사용자들의 편리함을 제고하였다.