커피전문점은 가맹점으로 운영되며, 대부분 대기업 본사의 일정한 통제와 지원을 받고 있다. 그러나, 스타벅스나 커피빈은 직영점으로 운영되며, 카페베네, 이디야, 투썸플레이스 및 파스구찌는 가맹점과 일부 직영점을 운영하고 있다. 직영점은 가맹점과 비슷하나, 조직운영원리와 노동시장적 특성이 매우 다르다.
가맹점으로 운영되는 커피전문점은 영세/소규모 조직구조이기 때문에 자본과 브랜드를 갖고 있는 대기업 본사와 갑을관계로 표현되는 수직적이고 불평등한 계약관계를 맺은 가운데 브랜드의 사용, 주요 제품이나 재료의 공급, 매출액, 영업시간 등에서 커피전문점 본사(대기업)의 일정한 통제와 지원을 받고 있다. 이와는 달리 스타벅스나 커피빈은 직영점 체제를 유지하여 대기업 본사가 전국에 지점을 내고 직접 고용한 근로자 혹은 파견받은 근로자들을 주로 사용하고 있다. 카페베네, 이디야, 투썸플레이스 및 파스구찌는 비교적 적은 자본으로 가맹점 가입을 통한 가입비 및 가맹비를 통해 자본을 늘리고 시장점유율을 높이기 위해, 가맹점 위주로 운영하고 있다. 하지만 가맹점들에 대한 효과적인 관리를 위해, 그리고 가맹점 모델 등을 시장에서 테스트하기 위해 전체 지점의 5～10%가량의 직영점도 운영하고 있다. 직영점의 경우 커피전문점 본사의 일부이기 때문에 겉으로는 영세한 가맹점들과 비슷한 외양을 갖추고 있으나 조직운영원리는 전혀 다르게 작동하고 있으며, 이에 따라 직영점과 가맹점의 노동시장적 특성도 매우 다르게 나타난다.