배출권거래제는 배출업자의 부담을 감소시킬 수 있다는 장점이 있다. 배출권의 법적 성격은 이행기간 완료 시 정해진 배출권을 다시 정부에 제출해야 한다는 점에서 특별한 권리로 보는 견해가 타당하다.
배출권거래제는 탄소세와 달리 시장메커니즘을 활용하여 가격에 유연하게 대응할 수 있도록 한다는 점에서 배출업자에게 그 부담을 감소시킬 수 있다는 점에 장점이 있다고 보고 있다. 배출권의 법적 성격에 관하여 많은 이견이 제시되고 있는데, 이는 정부에서 주어지는 오염시킬 수 있는 권리라는 설과 거래하여 이익을 만들 수 있다는 점에서 재산권으로 보는 설 등이 대표적이다. 일반적 행정적 권리와 같이 주어진 범위 내의 행위가 허용되는 것 외에 배출권은 제3자와의 거래를 통하여 이익을 창출할 수 있다는 점에서 사적인 재산권과 같은 성격을 지니고 있으나, 이행기간 완료 시 정해진 배출권을 다시 정부에 제출해야 한다는 점에서 특별한 권리로 보는 견해가 타당하다고 본다.