특별협의절차는 자발적이고 법적구속력이 없다. 하지만 신설된 특별협의절차는 'SPS위원회에서의 특정무역현안 논의'처럼 긍정적인 효과를 기대할수 있을것이다.
특별협의절차에의 참여는 자발적이고, 협의 결과에 직접적인 법적 구속력은 없다. 그러나 마찬가지로 법적 구속력이 없는 ‘SPS위원회에서의 특정무역현안 논의’가 흡사 ‘제소전 협의’(pre-litigation consultations) 절차처럼 활발히 이용되고 있으며 공식 법적 분쟁으로 발전하기 이전의 단계에서 사안 해결에 긍정적으로 기여한다고 평가되고 있듯이, 신설된 특별협의절차도 회원국 간의 식품안전 및 동․식물건강 분쟁을 저감시키고 SPS조치가 무역왜곡적 효과를 가지는 비관세장벽화되는 것을 예방하는 데 상당한 효과를 가질 수 있을 것이라 기대된다.