동일한 화합물이라 하더라도 약제학적 특성이 다를 수 있으므로, 결정형 발명에서 선행 발명과 다른 질적 효과나 현저한 양적 차이가 있는 경우 진보성이 인정된다. 다만 그 효과에 대한 상세한 기재가 필요하며 의심스러운 경우에는 비교실험자료 제출 등의 방법으로 그 효과를 입증하여야 한다. 
동일한 화합물이 여러 결정 형태를 가질 수 있고 그 결정 형태에 따라서 용해도, 안정성 등의 약제학적 특성이 다를 수 있음은 의약화합물 기술분야에서 널리 알려져 있어 의약화합물의 제제설계(製劑設計)를 위하여 그 결정다형(結晶多形)의 존재를 검토하는 것은 통상 행해지는 일이다. 따라서 의약화합물 분야에서선행발명에 공지된 화합물과 결정 형태만을 달리하는 특정 결정형의 화합물을 특허 청구 범위로 하는 이른바 결정형 발명은, 특별한 사정이 없는 한 선행발명에 공지된 화합물이 갖는 효과와 질적으로 다른 효과를 갖고 있거나 질적인 차이가 없더라도 양적으로 현저한 차이가 있는 경우에 한하여 그 진보성이 부정되지 않는다. 이때 결정형 발명의 상세한 설명에는 선행발명과의 비교실험자료까지는 아니라고 하더라도 위와 같은 효과가 있음이 명확히 기재되어 있어야만 진보성 판단에고려될 수 있으며, 만일 그 효과가 의심스러울 때에는 출원일 이후에 출원인 또는특허권자가 신뢰할 수 있는 비교실험자료를 제출하는 등의 방법에 의하여 그 효과를 구체적으로 주장․입증하여야 한다.