연차휴가 사용율이 낮은 이유는 연차휴가 청구에 대한 제한과 준수율이 낮기 때문이다. 무엇보다 연차휴가에 관한 제도들을 명확하게 재편해, 누구라도 그 권리를 인식할 수 있게 만들 필요가 있다.
이러한 연차휴가의 낮은 취득의 원인은 출근율에 따른 보상적 성격이, 연차휴가의 낮은 사용은 연차휴가의 청구에 대한 실질적인 제한이 그 원인으로 작용하고 있다. 그리고 무엇보다도 연차휴가에 관한 제도 자체보다 현실에서 이에 대한 준수율이 낮은 것도 원인으로 작용하고 있다. 한편 잔여 연차휴가일수에 관해서는 다양한 의견들이 제시되고 있지만, 제도적으로 볼 때 근로기준법 제61조와 같이 사용자가 촉진 조치를 함에도 불구하고 근로자가 휴가를 사용하지 않은 경우 휴가가 소멸되도록 하고 있다는 점이 지적되고 있다. 이러한 문제점들을 해결하기 위해서는 연차휴가에 관한 제도들을 단순하고 명확하게 재편하여 누구나 그 권리성을 명확하게 인식할 수 있게 만드는 제도 개선이 있어야 한다.