기업진단 비용 지원은 M&A 성사 건에 대해 정부가 비용지원을 하는 것이다. 이를 통해 53건의 M&A가 성사되었으나 규모와 지원 내용이 제한적이므로 비상장법인 거래와 같은 소규모가 대부분이다. 따라서 규모와 지원내용의 전문성을 강화할 필요가 있다.
기업진단 비용 지원은 M&A 성사 건에 대하여 사후적으로 건당 2천만원의 기업진단 · 실사 수수료를 매년 15건 이상 발굴하여 정부가 지원한다는 것이다. 컨설팅 비용 지원은 건당 20만원의 상담 · 자문비용을 지원하고, M&A거래정보망은 중소기업진흥공단에서 운영하는 M&A지원센터를 통해 매수 · 매도 희망기업 및 중개기관 정보를 제공하여 M&A거래를 활성화한다는 취지이다. 동 사업을 통해 2013년 53건의 M&A가 성사되었는데, 코스닥․유가증권 등 규모가 큰 M&A 매물이 나오지 않고 비상장법인 거래가 대부분으로, 이는 중소․벤처기업의 M&A를 지원하기 위한 M&A거래정보망의 취지에 따른 것으로 보인다. 동 사업은 정부가 제시한 M&A 관련 규제 완화 및 세제 지원 등 제도 개선을 통해 유인하려는 자율적 M&A활성화를 견인하는데 일조하고 있는 것으로 평가할 수 있다. 그러나 예산 규모가 작고 지원 내용이 제한적이므로, M&A 거래 활성화를 위해서는 규모와 지원내용의 전문성을 강화할 필요가 있는 것으로 보인다.