형사조정은 형사소송절차의 각 단계에서 진행, 효과도 다양하다. 적절한 개시 시점은 수사 초기에서 공소제기 전까지로 이 시점에서는 양측의 시간적 경제적 손실을 최소화할 수 있고 수사와 재판의 업무 부담도 줄일 수 있다. 
형사조정은 형사소송절차의 각 단계에서 진행될 수 있으며 그 법적 효과도 각각 다양하게 나타난다. 형사사건에 있어 경찰의 수사가 시작된 후 법원에서 공판절차가 진행되기 이전 사이에 이루어지는 것이 가장 이상적이다. 이 단계에서 형사조정이 성립될 경우 검사로부터 불기소 처분을 받을 수 있다. 그러나 형사조정에 적합한 사안이 형사조정절차의 진행 없이 공소가 제기된 경우에도 검사와 판사는 공판절차를 개시하기 전에 형사조정절차의 진행을 지시할 수 있다. 그러나 가장 적절한 형사조정절차의 개시 시점은 수사 초기 단계에서 공소제기 전까지라고 볼 수 있다. 이 시점에서 형사조정 절차가 개시된다면 피해자 및 가해자 양측의 시간적 경제적 손실을 최소화할 수 있을 뿐만 아니라 수사 및 재판 기관의 형사절차에 따른 업무 부담을 경감시킬 수 있을 것이다.