디지털 교과서는 서책형 교과서와 적절한 연계와 조화가 요구된다. 디지털교과서가 가진 특성과 장점을 적절히 활용하여 서책형 교과서는 실현하기 힘든 다양한 학습자료재공과 상호작용이 가능하도록 할 수 있다.  그러나 지나치게 모듈화되거나 교사의 활용이 힘들게 구성될 경우 오히려 교육현장 수업에 방해가 되어서 그 활용도가 떨어질 수 있다.
서책형 교과서와 연계될 디지털교과서의 구성 방안에 대한 결과에서는, 많은 교사들이 교사와 학생 간 및 학생과 학생 간 상호작용을 유도하는 다양한 활동 자료로 구성하는 방안과 서책형 교과서의 내용을 중심으로 추가적인 학습 정보와 자료로 구성하는 방안에 높은 응답을 보이고 있다. 이는 디지털교과서의 역할로서 서책형 교과서를 보조하는 교수 학습 교재에 높은 응답을 보인 설문 결과와 맥락을 같이한다고 볼 수 있다. 또한 디지털교과서의 다양한 멀티미디어 기능을 활용하여, 서책형 교과서에서 실현하기 힘든 학습주체 간의 상호작용을 유도하는 활동 자료를 중심으로 디지털교과서를 구성해야 한다는 요구로 해석할 수 있다. 서책과 디지털교과서의 연계 방안을 통해 교과서 완결 학습이 효과적으로 구현되기 위해서는, 디지털교과서의 역할과 구성 방식을 통해 서책형 교과서가 구현하기 힘든 다양한 교수 학습 자료 제공과 상호작용을 활성화하는 방안이 마련되어야 한다. 그럼에도 불구하고, 지나치게 모듈화되거나, 교사의 재구성이 힘들게 디지털교과서를 구성한다면, 오히려 교사의 활용도가 떨어질 수 있다. 안종욱(2014)에 따르면, 다양한 콘텐츠 위주로 디지털교과서를 지나치게 구조화하여 구성한다면, 오히려 교사의 콘텐츠 재구성을 통해 확보되는 자율적이고 다양한 수업 형태를 방해하게 되고, 이것이 오히려 현장 교사의 활용도를 떨어뜨릴 수 있음을 지적하고 있다.