기관장의 리더십은 정부업무평가제도의 책임성에는 긍정적 영향을 줬다. 기관장의 성과관리 지원은 평가제도의 관심과 제도적 지원이 있는지에 따르는데, 기관장의 관심과 지원이 높을수록 평가제도 능률성에는 부정적인 영향이 나타났다.
첫째, 리더십은 공공조직의 정책목표 달성과 성공적인 공공조직이 되기 위한 핵심적인 요인으로 논의되어 왔다(예. Holzer & Callahan, 1998, p. 160). 분석 결과 기관장의 리더십은 정부업무평가제도의 효과성에 대한 인식에는 유의미한 영향을 미치고 있지 않았으나, 책임성에는 긍정적인 영향을 미치고 있었으나 내재적 동기, 조직 문화, 목표명확성 등과 비교하여 계수 값의 크기는 0.095 정도로 상대적으로 낮았으며, 90% 신뢰수준에서 통계적으로 유의미하였다. 성과관리에 대한 기관장의 지원은 기관장이 평가제도에 대해 어느 정도 수준의 관심을 갖고 강조하고 있으며, 이와 관련한 인력, 예산 및 각종 제도적인 지원을 제공하고 있는지 여부와 밀접하게 연계되어 있다. 반면, 기관장의 관심과 지원이 높을수록 평가제도의 능률성에는 부정적인 영향을 미치는 것으로 나타났다.