만성질환군과 대조군 간의 비교연구를 통해서는 만성질환 청소년에 대한 지원의 구체적인 방향성은 제시할 수 없다는 한계가 있다.
만성질환 등의 건강상의 문제는 청소년기의 대표적인 역경 중 하나이다. 기존의 만성질환 청소년을 대상으로한 연구들은 주로 만성질환 집단과 건강 문제가 없는 집단과의 비교를 통해 이루어졌다. 이러한 연구들은 만성질환 청소년의 상대적으로 열악한 발달 결과를 확인하고, 개입의 필요성을 주장하는데 기여하였다. 아토피 피부염 청소년을 대상으로 한 연구에서도 유병 청소년의 상대적인 위험이 확인되어 왔다. 그러나 만성질환군과 대조군 간의 비교연구를 통해서는 만성질환 청소년에 대한 지원의 구체적인 방향성은 제시할 수 없다는 한계가 있다. 만성질환군과 대조군 간의 비교를 통해서 밝혀낸 차이는 만성질환 유병 여부 자체로만 설명된다. 완치가 어려운 만성질환의 특성 상 질환 자체를 제거하는 것은 현실적으로 매우 힘든 과제이며, 또한 이는 만성질환자의 삶을 바라보는 관점을 신체적 영역에 국한시키는 것이다.