'근원적 이해 차이'는 '입장차이'와는 구분되며 협상에 나서기 전 이해 당사자들은 자신들과 상대편의 욕망과 동기 등을 파악하는것이 가장 중요하다는 점을 강조한다.
마지막 선제 조건으로, 이해 당사자 간의 ‘근원적 이해 차이’가 분명하게 파악되어야 한다. 이때 이해 차이라고 하는 것은 갈등상황에서 단순히 의견이 충돌하는 지점들을 묶어 ‘입장 차이’라고 부르는 것과 구분되는 것으로, 협상에 나서기 전 이해 당사자들은 자신들과 상대편의 욕망과 동기, 욕구, 이유, 원인 등과 같은 ‘이해관계’를 정확히 파악하는 것이 가장 중요하다는 점을 강조한다. 이해관계란 객관적 사항들이 아닌 더 근원적 요소들을 말하는데, 다른 말로 표현하자면 표면적 입장이 아닌 근원적 관심사항을 말하는 것이다(임칠성 et al., 2013). 이처럼 개개인 혹은 집단 간의 근원적 이해 차이를 파악해야 동일 의제로 협상을 할 수 있는 기본적 단계들이 마련되는 것이다.