성취평가제는 변별력 확보가 어렵다는 한계가 있기 때문에 이를 이용하여 학생을 선발할 시 여러 가지 문제가 발생할 수 있다.
만약, 외고 입시에서 영어 내신이 성취평가제로만 표기된다면, 학생을 선발할 또 다른 평가 도구를 만들어 내야 하는 고민을 하게 된다. 외고에서는 내신에서 영어 과목만 반영하기 때문에 문제가 대입보다는 복잡하지 않지만, 대입에서는 수능 영어만 절대평가로 이루어진다면 변별력 있는 국어와 수학에서 높은 점수를 받기 위해 사교육비 증가하게 될 것이라는 것은 예상하기 쉽다. 현재 2014학년도 고등학교 1학년의 경우 내신에서 성취평가제의 대입 반영이 유보되어 있는 이유도 같은 맥락에서 이해할 수 있다. 따라서 내신의 변별력 확보 문제 때문에 상대평가제의 등급과 성취도를 병기하여 표기하고 있는 것이다.