거래의 취소 및 변경에 관해서는 두 가지로 분류된다. 첫째 의뢰인이 스스로 취소하려는 경우 취소여부 서점이 문제가 되었다. 둘째 하자있는 의사표시에 의한 경우 일반 법조에 따라 취소여부가 문제가 되었다. 
(3) 거래의 취소 및 변경
전자자금거래에 있어 고객의 "지급지시의 취소/변경"에 관해서는 ①의뢰인이 자신의 지급지시를 취소하고자 하는 경우 그 취소가능 시점의 문제, ② 고객의 지급지시가 사기, 강박 등 하자있는 의사표시에 의한 경우 민법의 일반원칙에 따라 해당 지급지시를 무효화 또는 취소할 수 있는지 여부 등이 문제가 되었다.
전자자금거래는 장표거래와는 달리 전산단말기를 통해 이루어지고 자금이체도 전산조작에 의해 순간적으로 일어나는 특성을 감안하여, 기본약관은 고객의 지급지시 취소가능시점을 계좌이체 및 계좌송금의 경우에는 지급은행이 지급지시를 발신할 때까지, 추심이체는 추심은행이 추심이체지시를 발신하기 전까지만 취소가능토록 규정하였다.
한편, 하자있는 지급지시의 무효 또는 취소에 관하여는 전자자금거래의 특성상 은행이 지급지시에 하자가 있는지 여부를 확인하는 것이 현실적으로 불가능하므로 이를 별도로 규정하지는 않았다.