조직의 운영 및 관리는 공공 거버넌스에 기반을 두고 있다. 공공 거버넌스는 공공 부분의 전략, 목적 달성을 위한 다양한 이해관계자의 역할 을 모아놓은 것으로 의사 결정 과정 감시를 통해 공공 부문 투명성 확보에 기여한다.
내부감사결과를 공개하는 결정요인으로서 공공 부문의 조직 운영과 관리 측면에서 접근하였다. 조직의 운영과 관리는 공공 거버넌스의 개념과 인식, 수립, 운영이라는 개념에 바탕을 두고 있다. 공공 거버넌스(Public Governance)는 공공 부문의 기관이 전략과 목적을 달성하기 위해 조직 기관장의 책임 아래 조직 내의 모든 책임과 권한을 정의․수행하고 의사결정을 하며, 이를 지속적으로 감시하는 것으로 다양한 이해관계자 등의 투명성 있는 역할과 책임을 집합해 놓은 것이다. 또한 조직의 기관장이나 책임자의 리더십을 바탕으로 하고 있으며, 지속적인 감시의 기능은 공공 부문의 투명성을 확보하는 데 기여하게 되고 윤리강령과 조직 내의 상하좌우의 자유로운 의사소통의 활성화는 내부감사결과 공개에 기본적인 요인으로 작용한다고 할 수 있다.