민간금융은 이윤극대화를, 정책금융은 사회적 후생의 극대화를 목표로 하기에 전자는 사회적 편익이 있는 프로젝트 기피 경향을 가지고, 후자는 산업 육성 및 발전 등 중장기적 성과에 초점을 맞춘다.
민간금융과 정책금융은 기본적으로 추구하는 목적이 다르다. 민간금융은 이윤극대화를 목표로 하지만 정책금융은 사회적 후생 극대화를 목표로 한다. 따라서 민간금융은 수익창출이 목적이므로 사회적 편익이 있는 프로젝트나 자금조달에 제한을 받는 중소기업, 창업지원 등에 대한 자금 지원을 기피하는 경향이 있다. 반면 정책금융은 비대칭 정보 하에 발생하는 신용할당, 역선택의 문제 등의 시장실패를 보완하고 사회후생 극대화를 추구한다. 또한 정책금융은 특정 산업 육성 및 발전 등의 목적을 갖고 단기적인 성과보다는 중장기적인 성과에 초점을 맞춘다. 그러나 정부의 정책금융을 통한 금융시장에 관여가 장기화되면 정책금융이 없이는 기능하지 않는 관치금융이 될 우려도 존재한다.