행정자치부는 매년 예산을 편성하여 중앙행정기관 등록 단체와 시·도 등록단체에 지원 사업을 실시하고 있는데, 매년 지원금을 확대하다가 2014년에는 135억원을 편성했다. 
연도별 지원액은 재정 상황 등에 따라 다소 변동이 있었다. 1999년부터 2003년까지는 매년 150억 원을, 2004년부터 2008년까지는 매년 100억 원의 예산을 편성하여 중앙행정기관 등록단체에 50%, 시·도 등록단체에 50%의 보조금을 지원하였으나, 2009년부터는 시·도는 자체 예산을 편성하여 해당 시·도 등록단체를 중심으로 지원하고 있으며 행정자치부는 중앙행정기관 등록단체를 대상으로 지원사업을 실시하고 있다. 행정자치부의 2009년과 2010년 지원예산은 50억 원이었으나 2011년에는 100억 원을, 2012년과 2013년에는 각각 150억 원으로 지원 규모를 확대하였고, 2014년에는 재정여건을 감안하여 전년 대비 10% 감액된 135억 원을 편성하여 지원하였다.