일부 기관의 경우 해당 지표를 통한 효율성 제고 효과 측정이 어려웠으며 세심한 계량지표의 목표치 설정이 필요한 것으로 판단된다. 또 주요 선진국 등의 체계적 분석이 이뤄질 수 있도록 개선이 필요하다.
계량지표의 경우 투입 대비 산출을 감안한 효율성을 측정하는 지표가 바람직하나 일부 기관의 경우 투입량을 감안하지 않은 산출지표 또는 투입량만을 측정하는 투입지표 등을 사용하여 해당 지표를 통한 효율성 제고 효과를 측정하기 어려운 경우가 발견되었다. 한편 계량지표의 목표치를 얼마나 도전적으로 설정하는지 여부는 매우 중요한 이슈인데, 일부 기관은 목표치의 과다 혹은 과소의 문제가 발생하고 있었으며, 목표치 설정 근거가 빈약하여 목표치 설정 시 좀 더 세심한 주의가 필요할 것으로 판단된다. 무엇보다도 세계적 수준의 목표를 추구하면서도 정작 주요 선진국 혹은 해외 경쟁기관의 실태에 대해서는 체계적인 분석을 하지 않는 경우가 종종 있어 향후 이에 대한 개선이 필요하다고 평가된다.