여러 외국인 사회통합 프로그램을 합쳐 외국인 사회통합기금으로 운영해야 하는데, 다만 기존 수혜자들에게 피해가 가서는 안 된다. 통합 취지는 중복된 서비스를 지양하여 예산의 이중 사용을 막자는 것이다. 여성가족부와 고용노동부가 하나의 사회통합기금을 배정받아 운영하여 여유재원이 발생한다면 국가의 다른 예산 사업을 기금사업으로 전환하여 사용하면 될 것이다. 
이러한 점을 고려하면 부처에서 추진하고 있는 모든 외국인 사회통합 프로그램들은 외국인 사회통합기금 사업으로 통합하여 운영할 필요가 있다. 다만, 각 부처에서 추진하고 있는 사회통합 프로그램의 종류 및 제공횟수 등이 외국인 사회통합기금사업대상에 포함되었다고 하여 축소되는 등의 현상이 발생하여 수혜자에게 더 적은 서비스를 제공하는 등의 현상이 발행되어서는 곤란하다. 외국인 사회통합기금 사업으로의 통합은 유사․중복적인 서비스를 지양함으로써 예산의 비효율적 활용과 낭비적 요소를 없애자는데 목적이 있다는 점을 염두에 두어야 할 것이다. 또한 별도의 기금을 보유하고 있는 여성가족부와 고용노동부는 다음과 같은 방식에 의하여 사회통합 프로그램을 운영하는 방식을 고려할 수 있다. 여성가족부와 고용노동부가 사회통합 프로그램을 추진하려면 먼저 (가칭) 외국인 사회통합기금 운용위원회에 사업계획을 제출한 후 의견을 교환한 다음 위원회로부터 사회통합기금을 배정받아 해당 사회통합 프로그램을 운영하면 될 것이다. 이 경우 여성가족부와 고용노동부는 지금까지 여성발전기금과 고용보험기금으로 운영하던 사회통합 프로그램을 사회통합기금으로 운영하기 때문에 여유재원이 발생할 수 있을 것이다. 이러한 여유재원은 일반회계사업으로 추진하고 있는 일부 예산사업을 기금사업으로 전환하여 추진함으로써 국가 전체적으로 효율성을 도모할 수 있을 것이다.