자유학기제의 성공적인 정착을 위한 방법 중 하나로 청소년관련 기관과의 인프라 연계가 필요하다. 따라서 청소년활동 기관에 대한 홍보와 연수가 필요하다.
자유학기제를 성공적으로 정착시키기 위해서는 지역사회에 기반한 인프라를 적극적으로 활용하여야 할 것이며, 그 중 중학생의 흥미와 수요에 기반한 프로그램과 인프라를 보유하고 있는 청소년관련 기관과의 인프라 연계가 선행되어야 할 것이다. 자유학기제를 통해 청소년활동을 활성화하고, 또 청소년활동의 활성화를 통해 자유학기제를 성공적으로 정착시키기 위해서는 다음과 같은 과제의 해결이 선행되어야 한다. 첫째, 자유학기제 학교와 청소년활동 기관이 서로의 역할을 이해하고 도움을 주고받을 수 있도록 자유학기제와 청소년활동 기관에 대한 홍보와 연수가 이루어져야 한다.