고용보험법 규정에 따르면 기금 관련 업무가 여러 기관에 분산되어있다. 고용노동부 장관의 통제가 어려운 구조이므로 제대로된 기능을 수행하고 있는지에 대하여 의문을 가질 수 있다.
다만 고용보험법 제115조에 따라 권한의 위임･위탁 사항을 정하고 있는 동법 시행 령 제145조 제8항의 규정에 의하면, 근로복지공단의 이사장, 한국산업인력공단의 이사장과 한국장애인고용공단의 이사장으로 하여금 그 위탁받은 업무를 수행하기 위하여 그 상임이사 중에서 기금수입 담당이사와 기금지출원인행위 담당이사를 임명 하고, 그 직원 중에서 기금지출직원과 기금출납 직원을 임명하며, 그 임명 사실을 고용노동부 장관에게 보고하도록 하고 있고, 기금수입 담당이사는 기금수입징수관의 직무를, 기금지출원인행위 담당이사는 기금재무관의 직무를, 기금지출직원은 기금지 출관의 직무를, 기금출납직원은 기금출납공무원의 직무를 수행하도록 하고 있다. 이 러한 규정을 감안한다면 기금 관련 업무가 여러 기관에 분산되어 고용노동부 장관의 통제가 간단치 않은 상황일 수도 있고, 국가재정법에 따른 기금운용심의회나 기금자 산운용위원회, 기금자산운용전담부서가 고용노동부에 별도로 조직되어 있다고 할지 라도 제 역할을 수행하고 있을지는 의문이 생길 수밖에 없다고 할 것이다.