5세 누리과정에 기초한 어린이 프로그램 총론과는 다르게 교수과정 안은 쌓기 놀이와 역할 놀이, 미술 영역 등으로 구분하여 지도하라고 제시하고 있다. 이는 교육 내용에 대한 논란을 야기할 수도 있다. 
넷째, 5세 누리과정에 기초한 보건복지부에서 발간한 어린이집 프로그램 총론(보건복지부, 2012b)에서 “누리과정에 기초한 어린이집 프로그램은 총 12개의 연간 주제와 52개의 소주제를 포함하고 있으며 누리과정의 5개 영역 목표를 통합적으로 제시할 수 있도록 유아의 발달특성과 흥미, 관심, 경험 등을 반영하여 구성하였다.”고 명시하고 있다. 그러나 교수·학습과정안을 살펴보면 ‘쌓기 놀이 영역’, ‘역할 놀이 영역’, ‘미술 영역’, ‘언어 영역’, ‘수·과학 영역’, ‘음률영역’으로 구분되어 지도하도록 제시되어 있다. 다루는 내용이 초등학교 1-2학년군의 내용과 범위를 벗어난 부분을 발견할 수 있다. 예를 들어, 수학·과학영역의 ‘양팔저울로 물건재기’ 활동이나 ‘그래프 표현’, 음률영역의 ‘리듬놀이’ 등은 ‘즐거운 생활’의 연계된 내용과 비교하여 어렵게 제시되어 있다. 관점의 차이일 수도 있지만 수학, 과학 또는 음악 영역의 내용을 쉽게 구성하는 것이 합당한 것인가 아니면 인지 발달에 따른 내용을 구성하는 것이 수월한 것인가에 관한 논란이 될 수 있다(홍영기, 2014: 24).