고등학교는 선택교육과정으로 운영된다. 이는 배울 내용을 스스로 선택할 권리가 있다는 의미다. 교과별 필수 이수 단위가 근거인데, 담당자들은 문과/이과에 따라 나뉘며 수능시험 범위만을 고려해 취지가 무력화된다.
고등학교는 초등학교나 중학교와는 달리 선택교육과정으로 운영된다. 이는 전국민이 동일하게 배워야 할 내용은 중학교까지로 끝나고, 고등학교에서는 자기가 배울 내용을 스스로 결정(선택)할 권리가 있다는 철학이 반영된 것이다. 이는 교과군별 필수 이수 단위수(국어, 수학, 영어, 사회, 과학, 체육, 예술 각각 10단위, 생활‧교양 16단위)를 보아도 알 수 있다. 그러나 일선 교육 담당자들 자신이 이를 잘 인식하지 못하고, 인문과정(문과)이냐 자연과정(이과)이냐에 따라 배울 과목이 결정되어 있다고 생각하는 경우가 많다. 심지어 그 과목도 대학 입시(수능) 시험범위에 포함되는 과목만을 생각하는 경우도 많다. 이는 선택교육과정인 고등학교 교육과정의 취지가 일선 학교에서 무시되고 무력화되게 만들고 있다.