 제조업에 대한 한국의 비관세장벽은 일본에 비해 매우 낮다. 일본은 품목별로 비관세장벽이 존재한다. 이로 인해 양국간 FTA체결시 비관세장벽의 일부는 완화될 것으로 보여 본 연구는 가격차의 10%만 해소될 것으로 가정한다.
 제조업에 대한 한국의 비관세장벽은 일본에 비해 매우 낮기 때문에 거의 무시할 수 있는 수준인 것으로 나타났다. 그러나 일본의 경우 품목에 따라 상당 수준의 비관세장벽이 존재하는 것으로 제시되었다. 한편, 일본 경제산업성(2001)의 자료에 의하면 일본과 주요 교역국간의 내외가격차가 심한 것으로 조사되었고, 이러한 가격차는 일본산 제품과 다른 국가 제품간 품질차이, 소득격차, 소비자 인식의 차이에서 기인할 수 있다. 그러나 이 중 일부는 일본의 비관세장벽에 기인하는 것으로 볼 수 있고, 양국간 FTA 체결시 이들 비관세장벽의 일부는 완화될 것으로 보인다. 문제는 과연 비관세장벽이 어느 정도로 완화될 수 있을 것인가가 되겠으나, 이에 대한 문헌을 찾기 어려우므로 여기서는 가격차의 10%만이 FTA 체결로 해소되는 것으로 가정하기로 한다.