광주마을분쟁해결센터에는 운영위원회와 센터 운영을 위한 사무국이 있다. 이에 더해 분쟁을 예방하고 분쟁 발생 시 쉽고 빠른 해결을 위한 '소통방'을 별도로 운영하고 있는데 2017년까지 전체 분쟁의 1/3이 여기서 접수되었을 정도로 그 중요성이 크다.
광주마을분쟁해결센터는 운영위원회, 사무국, 소통방으로 이루어져 있다. 운영위원회는 7인 내외로 구성되고 광주마을분쟁해결센터 운영 전반에 걸친 사항을 결정하는 역할을 한다. 사무국은 센터장과 사무직원으로 구성되어 있으며 주로 센터운영과 관련한 사무를 처리한다. 여기에 더하여 광주마을 분쟁해결센터까지 방문하는 것을 꺼리는 사람들을 배려하고, 이웃 간의 갈등을 예방하기 위해 ‘소통방’을 개설하여 운영하고 있다. 소통방이란 마을 및 아파트 내에 발생하는 분쟁을 예방하고 분쟁 발생 시 주민화해지원인을 통하여 센터 방문 없이 분쟁을 빠르고 쉽게 해결하기 위한 목적으로 만들어진 곳이다. 소통방은 분쟁을 예방하기 위하여 소통게시판, 공동체 밥상 외에 다양한 프로그램을 운영하며, 이를 통해 마을의 공동체성을 회복함을 목적으로 한다. 2017년까지 접수된 176건 중 64건이 소통방에서 접수되었을 정도로 소통방의 중요성이 크다고 할 것이다.