지방화의 경향에 역행하는 문제가 나타날 수 있고, 후자의 경우 해양안전 기능의 지방직화로 인해 기존 해양경찰 공무원들의 적극적인 반발이 예상되는 문제가 있을 것이다.
이러한 대안은 크게는 별도의 특별지방행정기관을 두는 방안, 소방과 해양경찰의 이원적 구조를 유지하는 방안, 통합을 통해 1원적 구조를 실현하는 방안 등으로 구분할 수 있다. 별도의 기관을 두는 경우 소방 조직과 해양안전 조직과의 기능 중복이나 갈등의 문제가 발생할 수 있을 것이다. 소방과 해양경찰의 이원적 구조를 유지하는 경우에는 정부조직의 정합성 차원의 문제와 소방직의 국가직화 요구 등이 강화 될 가능성이 있다. 마지막으로 1원적 구조를 실현하는 경우에는 모두 국가직화하거나 모두 지방직화하는 경우가 가능한데, 전자의 경우 지방 사무로 정착된 소방 기능을 국가직화하면 지방자치단체의 반발의 가능성, 지방화의 경향에 역행하는 문제가 나타날 수 있고, 후자의 경우 해양안전 기능의 지방직화로 인해 기존 해양경찰 공무원들의 적극적인 반발이 예상되는 문제가 있을 것이다.