한국은 세계최초로 100%로 전자통관체제를 수립했으나, 외환위기 극복과정에서 규제완화와 수입통관전자 행정의 헛점을 악용 불법이 늘자, 수출입 업무의 원스톱 서비스체제를 요하게 되었다.
우리나라는 1994년부터 1999년까지 6년에 걸쳐 EDI 통관자동화시스템을 미국, 일본 등 선진국보다 앞서 개통함으로써 세계 최초로 100% 전자통관체계를 완성하였다. 그러나 2000년대에 이르러 관세행정은 또 한 번의 변화와 도전을 받게 되었다. 1997년 외환위기를 극복하는 과정에서 대폭적 규제 완화와 1999년 1월 개통된 수입통관전자 행정의 허점을 악용한 불법 외환거래, 부정통관, 불성실신고가 급격히 증가하였다. 무역업체는 수출입 민원창구의 다원화로 자료의 중복입력·전송 등 업무의 비효율성이 초래되어 하나의 창구에서 여러 수출입기관 업무를 한 번에 처리할 수 있는 원스톱 서비스 체제를 요구하고 있었다.