국내 최근 고려대와 한국해양과학기술연구원, 한국생명공학연구원, 국립낙동강생물자원관에서 미세조류를 활용한 기능성 소재의 연구개발 및 제품화 추진을 통해 급속히 성장하고 있으며, 원천기술 개발로 인한 상업화의 도약기에 있다.
국내 최근 연구로는 고려대에서 미세조류 바이오디젤의 생산과정에서 나오는 당으로 베타락탐계 항생물질인 CPC(세팔로스포린 C)를 생산하는 연구를 세계 최초로 개발하였고, 한국해양과학기술연구원에서는 미세조류 Chlamydomonas hedleyi로부터 UV 호보 물질인 Mycosporine-like Amino Acid(MAA)의 확보와 추출된 Porphyra-334를 이용하여 항염 효과를 입증하였다. 한국생명공학연구원에서는 미세조류 Arthrospira sp.로부터 천연화장품으로 사용될 수 있는 β-carotene, Phycocyanin, Gamma-linolenic Acid(GLA)의 원료물질을 생산하는 연구를 수행하였다. 이외에도 국립낙동강생물자원관에서는 오메가-3 등 필수지방산 50% 이상의 파라클로렐라 미세조류를 발견하였다. 현재, 국내의 미세조류를 활용한 기능성 소재의 연구개발 및 제품화는 급속히 성장하고 있으며, 원천기술 개발로 인한 상업화의 도약기에 있다.