갈등영향분석 수행 방법은 일대일 심층면담을 통해 주된 이해관계와 쟁점을 확인하고, 충돌하는 이해관계의 해소 가능성을 판단하여 바람직한 해소절차를 제안하는 것이다.
갈등영향분석 수행 방법은 ‘갈등영향분석은 이해관계자 분석으로 부를 정도로 정책의 시행으로 권리와 의무에 영향을 받는 이해관계자들과, 의사결정 과정에 영향력이 있는 소수의 여론주도층을 대상으로 일대일 심층면담을 통해 주된 이해관계와 쟁점을 확인하고, 충돌하는 이해관계의 해소 가능성을 판단하여 바람직한 해소절차를 제안하는 기법’이라고 설명하고 있으며(보건복지부, 2005: 11), 분석기관은 미국에서 일반적으로 사용하고 있는 갈등영향분석의 5단계에 따라 병원 재건축에 관련된 이해관계자들을 면담하고, 갈등을 유발하고 있는 이해관계와 관심사항들을 확인한 후, 대안별 갈등해소 가능성을 판단하고, 바람직한 갈등해소 절차를 제안하고 있다.