지역별 미실시와 일반학교의 기반 및 관심 부족, 고등학교 선택과목 수요 불충족 등의 문제와 더불어 교사의 1일 수업부담 증가 또한 온라인수업 활성화 추진의 배경이 되고 있다.
이 중에서 온라인수업 활성화를 통한 학습자의 학습선택권 강화의 배경으로는 학생의 다양한 수요를 반영하는데 있어 기존 교육제도가 가지는 한계에서 출발하고 있다. 우선 건강상의 이유 등으로 등교하지 못하는 학생들을 위한 일부 온라인수업이 진행 중이나 13개 시 도교육청에서는 병원학교 온라인수업을 미실시하고 있어 이들 학생의 수업 결손은 여전한 상황으로 파악되고있다(교육과학기술부 한국교육학술정보원, 2010). 또한 일반학교에서의 온라인수업 실시 기반과 관심 미흡으로 실질적 시행에 한계가 있어, 고등학교 선택과목에 대한 수요를 충족시키는데 부족한 상황이다. 2012년 주5일제 수업 전면도입으로 수업일수 부족에 따른 교사의 1일 수업부담이 증가된 것도 온라인수업 활성화 추진의 배경이 되고 있다.