사후 민자적격성 평가는 협약 변경을 수반해 민간 투자자의 불확실성 증가에 따라 투자가 위축된다는 의견이 있을 수 있으나 이는 실시협약 변경을 통해 변동에 대응하는 것이 바람직하다. 다만 이는 불가피한 경우에 한해야 한다.
본 연구에서는 실시협약 체결 이후의 건설 및 운영기간에 걸쳐 적용하는 철도 민자사업에 대한 평가 제도를 제안하며, 이를 ‘사후 민자적격성 평가’로 정의한다. 철도 민자사업에 대한 사후 민자적격성 평가는 실시협약 체결 후 운영기간에 걸쳐 적용할 수 있다. 사후 민자적격성 평가를 통해 실시협약의 변경이 수반될 것으로 예상되며, 이에 따라 민간투자자의 불확실성이 높아져 민간투자가 위축될 가능성이 있다는 의견이 제기될 수 있다. 그러나 건설과 운영기간을 고려 시 최소 30년 이상의 장기간 지속되는 민자사업의 특성을 고려 시 실시협약의 변경을 통해 장래 여건변동에 적절히 대응하는 것이 바람직하다는데 많은 전문가가 공감하고 있는 상황이다. 다만, 불가피한 경우에만 실시협약의 변경을 함으로써 실시협약 변경으로 인한 문제점을 최소화할 필요가 있다.