학업중단숙려제의 운영 공통안은 교육부에서 제공하였으나 각 시도마다 자율적으로 운영하고 있는 실정이다. 학교마다 전문상담사가 있지 않는 한 프로그램을 운영하기 어렵기 때문에 교육청 단위에서 학업중단예방 센터를 설치하여 지원하는 것이 바람직하다. 예로 인천은 2019년에 한 곳을 시범운영하려는 준비 중에 있다.
둘째, 학업중단숙려제에 대해 살펴보자. 현재 운영의 기본 골격은 교육부에서 공통안을 마련하여 제공했으나, 각 시도마다 숙려제 운영 횟수나 출석인정 기준 및 운영기관 지정 등은 자율적으로 운영 중이다. 지역에 따라서는 학업중단 숙려제 프로그램을 다양하고 내실있게 준비하여 실효성 있게 운영되고 있는 곳도 있으나 아직도 숙려제 기간 중 학생을 학교에 나오게 하고 의미 없이 1~2시간을 보낸 뒤 출석으로 인정하는 예도 있다. 단위 학교에 전문상담(교)사가 배치되지 않는 경우에는 학업중단 숙려제 프로그램 운영을 학교 안에서 내실 있게 운영하기란 여간 어려운 일이 아닐 것이다. 그래서 학교 현장에서는 교육청에서 학업중단 예방 프로그램을 운영해 달라는 요구가 거세다. 학생의 상황에 따라 사안이 미미한 경우에는 학교 자체에서 실시할 수 있으나, 보다 전문성이 요구될 때에는 교육청 차원에서 교육지원청 단위로 학업중단예방 센터를 설치해 해당 지역의 학교 부적응 학생을 위한 프로그램을 마련· 지원하는 것도 좋은 방법이 될 수 있을 것이다. 물론 교육부 차원의 특별교부금 지원이 필수 선결조건이다. 인천의 경우, 2019학년도에 학업중단예방센터를 한 곳 시범운영해 봄으로서 보다 체계적이고 전문적인 지원을 위해 준비 중이다. 물론 지금 하고 있는 것처럼 지역사회의 다양한 기관들을 숙려제 운영기관으로 지정하여 학생들이 자유롭게 참여할 수 있도록 환경을 마련하는 노력도 지속되어야 할 것이다.