과거 연계와 협력이 진행되었던 사업들도 상호 오해 및 무관심 등으로 지속되지 못했다. 그 근본적 원인은 양 체계의 분리보다는 그 사이의 연계와 협력 기제의 작동 양상으로 봐야 한다. 예컨대 연계･협력체계는 왜 유명무실한 경우가 많은지, 왜 초･중등교육에는 이를 지원하는 법률이 왜 없는지 등의 질문에 대응하는 것이다.
방과후학교 돌봄교실, 토요주말학교 등 과거 연계와 협력이 진행되었던 사업들도 많은 경우 상호 오해 및 무관심 등으로 지속화되지 못하는 경험을 가지고 있다. 이러한 문제의 근본적 원인을 양 행정체계의 분리에 의한 것으로도 돌릴 수 있겠지만, 이는 사안의 본질을 오히려 흐리게 하는 요소로 작용할 수 있다. 자칫 정치적 프로세스를 통한 정책결정이 없으면 한 발짝도 나아가기 힘들다는 논의로 흐를 가능성이 더 크기 때문이다. 그보다는 실사구시 혹은 구동존이(求同存異)의 관점에서, 양 행정체계 사이의 연계와 협력 기제는 얼마나 그리고 어떻게 작동하고 있는지, 제대로 작동하지 않는 부분은 무엇인지, 작동하지 않는 부분이 있다면 왜 그러한지 등을 살펴보는 것이 사안의 본질에 더욱 가까이 접근하는 방식이라고도 할 것이다. 예컨대, 지방교육자치법에 의한 지방교육행정협의회와 같은 양 행정기관 간의 연계･협력체계는 왜 유명무실하게 운영되는 지역이 많은지, 평생교육법 제20조 및 제21조에 의한 평생교육진흥기관의 협력체계와 달리 초･중등교육에는 연계･협력을 지원하는 법률이 왜 없는지 등의 질문에 적극적으로 대응하는 것이 보다 현실적이고도 사안의 본질에 접근하는 방식이라는 것이다.