국립외교원 외교안보연구소도는 동북아평화협력구상연구 팀을 구성해 연구하였다. 연구소는  관련주제를 회의 소주제 지정 및 현 방안 소개, 의견수렴을 진행하였다.
또한 국립외교원 외교안보연구소도 ‘동북아평화협력구상 연구 프로그램’ TF를 구성해 국내 저명한 관련 전문가들을 초청해 수차례에 걸친 워크샵을 개최했으며 연구결과물을 생산하였다. 그리고 해외 연구기관들과 다양한 양자·삼자 회의를 연례적으로 개최해 오고 있는 국립외교원 외교안보연구소는 국제회의 개최 시마다 ‘동북아평화협력구상’과 관련된 주제를 회의 소주제로 지정, 외국학자들에게 ‘동북아평화협력구상’의 내용 및 추진 방안을 소개하였고 그것에 대한 의견을 청취하였다. 물론 세종연구소도 2013년에‘동북아평화협력구상’에 대한 연구 프로그램을 진행시켰으며, 결과물을 책자로 발간하였다.