보건소는 복지센터와 연계해 면접조사를 통해 정신질환 고위험군에 우울증 선별검사를 통한 추후 관리 같은 서비스를 제공한다. 이외에도 중증정신질환자 관리나 만성신체질환을 가진 정신질환자에게 방문 서비스를 제공한다.
보건소에서는 정신건강복지센터와 연계하여 정신질환자와 정신질환 고위험군을 위한 건강관리 서비스를 제공하고 있다. 즉, 방문 건강 관리 시 건강면접조사표를 사용 하여 건강행태, 만성질환, 주관적 건강 상태 등을 파악하고 고위험군 대상자에게는 질병보건소 내·외 자원연계를 통해 적절한 보건·복지 서비스를 제공한다. 예를 들어 한국어판 PHQ-9를 사용하여 우울증 선별검사를 시행한 후 10점 이상의 위험군은 정신건강복지센터로 연계하여 추후 관리를 받도록 한다. 그 외의 중증정신질환자를 위한 건강서비스는 정신건강복지센터의 중증정신질환자 관리 사업을 통해 제공되고 있다. 지속적인 관리가 필요한 만성 신체 질환을 가지고 있는 정신질환자의 경우 보건소와 정신건강복지센터가 함께 방문건강관리 서비스를 제공하고 있다.