직원의 배치는 임명권자의 재량이며 그 기준은 없다. 육아휴업의 전후 또는 그 기간 중 직원의 보직변경은 임명권자의 불이익취급으로 인정되지 않는다. 또 육아휴업 중 육아휴업 이외의 특별한 사유가 있으면 휴직이나 정직 처분은 가능하나 육아휴업 승인은 효력을 상실한다.
직원의 배치는 임명권자의 재량에 의한 것으로 그 기준이 특히 마련되지 않고 있다. 그리고 육아휴업의 전후 또는 그 기간 중 직원의 보직변경은 재량권의 일괄 또는 남용으로 되지 않는 한 임명권자는 자유로 행할 수 있는 것이므로, 불이익취급으로 되지 않는다. 따라서 육아휴업을 하는 직원은 육아휴업의 승인을 받은 시점에 있던 관직, 그 후 이동한 경우에는 이동후의 관직을 보유하는 뜻의 확인적 규정을 두고 있다(법 제5조 1항, 규칙 제8조). 이것은 교직원, 간호사, 보모 등의 특정직종에서 다른 직종에 보직변경하는 경우도 마찬가지며, 직종의 이동에 의해 육아휴업급이 지급되지 않는 경우에도 이동자체는 불이익취굽으로 되지 않는다.  
또 육아휴업중에 예컨대, 직원이 장기요양을 요하는 질병에 걸린 경우 육아휴업 이전의 위법행위가 발견된 경우 등 육아휴업 이외의 사유에 의한 휴직/정직처분은 가능하고 이러한 처분이 있던 경우에는 육아휴업 승인이 효력을 상실하는 것으로 하고 있다(법 제6조 제1항).  