일본도 학교의 통폐합이 추진되고 있다. 일본 정부는 자치구의 통합으로 학교가 통합할 경우 교직원 수가 갑작스레 크게 변하지 않도록 하도록 하고 있으며, 인구 감소로 학교가 통합될 경우 교통비와 증축 경비를 보조한다.
참고로 일본에서도 지자체간 합병과 학생수 감소로  적정배치에 따른 학교통폐합이 추진되고 있는데, 학교통폐 합과 관련한 정부의 지원으로는 교직원 정수면에서는 시정촌 합병으로 학교를 통합할 경우 교육상 특별한 배려가 필요하다고 인정되는 학교에 대해 초등학교는 최장 5년간, 중학교는 최장 2년간 교원 정수가 격변하는 것을 완화하는 조치를 취하도록 하고 있으며, 통합에 따른 학교 건물이 완성되지 않아 통합 이전의 학교에서 수업을 하고 있을 경우에도 통합 이전의 학교 각각의 교직원 정수대로 산정하도록 하고 있다. 또한 벽지나 인구과소현상으로 인한 학교통합의 경우에는 스쿨버스나 보트의 구입비 1/2, 원거리 통학에 소요되는 교통비의 1/2을 보조하며, 학교 건물이나 운동장의 신축 또는 증축에 필요한 경비의 1/2을 정부가 보조한다.