남북한 체제통합을 위해서는 통일국가를 목표로 하기 때문에 다른 거버넌스와 다르게 더욱 준비에 만전을 기해야 하고 강력한 개혁능력과 상호유기적, 쌍방향적 연계를 겸비해야 한다. 
그러나 이러한 남북한 체제통합을 위한 거버넌스는 일반적인 정책 거버넌스 또는 로컬 거버넌스와는 차원을 달리 한다. 왜냐하면, 체제통합 거버넌스는 그것을 구성하는 분야의 광범위성, 행위자의 다양성, 네트워크의 복잡성뿐만 아니라 통일국가를 완성하기 위한 역사적･전략적 중요성을 안고 있기 때문이다. 따라서 체제통합 거버넌스는 다른 거버넌스와 달리 좀 더 철저히 준비되어 있어야 하고, 국가사회의 구성원들은 통합목표를 효율적으로 달성할 수 있는 강력한 개혁능력을 가지고 있어야 한다. 또한 이 과정에서 다양한 하위통합 분야들이 상호 유기적으로 연결될 수 있어야 하고, 상･하위 수준 간의 쌍방향적 연계도 이루어져야 한다.