조합원이 도정법에 의한 정비사업조합에 대한 현물출자는 양도소득세 대상이 아니다. 그러나 관리처분계획인가일 이전에 현물 출자한 경우는 과세대상이다. 비조합원으로 토지를 조합에 현물출자하고 조합원으로 상가를 분양받으면 교환 거래로서 과세대상이다. 
조합원이 종전 부동산을 조합에 현물출자하는 것도 이론적으로는 부동산의 양도에 해당하지만, 도정법에 의한 정비사업조합에 대한 현물출자는 도시개발법이나 그 밖의 법률에 따른 환지처분으로 지목 또는 지번이 변경되거나 보류지(保留地)로 충당되는 경우에 해당하므로, 양도소득세의 과세원인이 되는 소득세법상 부동산의 양도에는 포함되지 않는다. 따라서 조합원이 조합에 종전 부동산을 현물출자하는 경우에는 양도소득세가 과세되지 않고, 양도소득세 납세의무자도 존재하지 않는다. 그러나 그 외의 경우로서 관리처분계획인가일 이전에 종전 부동산을 양도하는 경우 등에는 종전 부동산의 소유자가 부동산을 양도하는 것이되어, 종전 소유자가 납세의무자로 부동산 양도에 따른 양도소득세 납세의무를 부담한다. 그리고 재건축조합의 조합원이 비조합원으로서의 지위에서 조합과 교환거래를 하여 토지를 조합에 현물출자하고 상가를 분양받은 경우에는 교환 거래로서 양도소득세과세대상이다.