2000년 중앙정부부문의 부처 및 기관 내에서 이사회 조직이 강조되기 시작했고, 2006년 이사회 운영에 대한 재무성의 요구사항을 보면 이사회 조직의 활성화와 이사회를 중심으로 한 내부통제의 강화는 앞으로 지속될 것으로 보인다.
중앙정부부문의 부처 및 기관 내에서 이사회 조직이 강조되기 시작한 것은 2000년 재무성의 통지에서 그때까지 내부통제에 대한 책임을 지고 있던 재무관을 감사위원회의 구성을 통해 지원하라는 권고를 하면서부터이다. 사실 이 시기부터 내부통제가 위험관리의 중요한 수단으로 인식되기 시작하였다는 점과 내부통제의 목적이 재무통제에서 조직 운영 전반에 대한 내부통제로 확대되었다는 점을 고려해볼 때, 재무관 1인에 의한 내부통제 관리보다는 감사위원회를 포함한 이사회라는 집단적인 관리체제가 더 적합하였을 것으로 볼 수 있다. 2006년 재무성이 재무관에게 보낸 ｢지배구조: 보고｣라는 통지를 통해 각 중앙부처에서 감사위원회를포함한 이사회의 운영에 대한 지배구조 운영보고서를 내부통제보고와는 별도로 회계보고서에 첨부하여 제출할 것을 요구한 것으로 보아, 적어도 중앙정부부문에서 이사회 조직의 활성화와 이사회를 중심으로 한 내부통제의 강화는 앞으로 계속될 것으로 보인다.