유전자 변형 작물로 최초의 성공을 이룬 것은 토마토다. 그 이후 유전자 변형 작물은 세계적으로 붐을 일으켰고, 종류도 다양해졌다. 현재는 제초제 저항성이나 해충 저항성을 가지지만 가뭄 저항성과 에너지용 변형 연구가 진행 중이다.
최초로 상업화에 성공한 유전자변형생물체는 유전자 변형작물로 1994년 미국의 칼진사가 개발한 무르지 않는 토마토였다. 그러나 이 토마토는 소비자에게 인기를 얻지 못해 실패하였고, 1996년 몬산토사가 개발한 제초제저항성 대두가 대규모 상업화에 성공하였다. 이후 유전자 변형작물은 세계 각국에 급속도로 확대되어 재배면적은 상용화 첫해인 1996년의 170만 헥타르에서 2012년 1억 7,000만 헥타르로 전례 없는 100배의 증가를 기록하였다. 2013년 말 기준 세계 27개국에서 총 1억 7,530만 헥타르에 달하는 면적에서 재배되고 있으며, 아메리카․유럽․아시아․아프리카․호주에 이르는 모든 대륙에서 재배․이용되고 있다. 현재 재배되고 있는 유전자 변형작물은 옥수수, 면화, 콩, 캐놀라, 파파야, 포플러, 토마토, 파프리카, 사탕무, 알팔파, 스쿼시 등 11개 작물이다. 현재 상업화된 유전자 변형작물은 제초제 저항성이나 해충 저항성을 갖고 있는 것들이 대부분이다. 최근에는 가뭄 저항성 상업용 유전자 변형작물과 바이오 에너지용 유전자 변형작물 연구가 활발하다.