자체평가를 통한 학습효과의 발전에는 여전히 한계가 있다. 평가자는 평가 등급을 부여하지만, 보고서는 직접 쓰지 않는다. 또한 실무자는 평가 자료를 제공하는 동시에 위원회에게 평가를 받는다.
그러나 자체평가의 품질개선 노력에도 불구하고 자체평가의 한계는 여전히 존재한다. 자체평가의 경우, 평가자들은 평가등급을 부여하는 역할은 하지만, 평가보고서는 직접 집필하지 않기 때문에 자체평가에 의한 학습효과에 한계가 있다(이광희･김주환, 2013). 또한 실제 사업 및 정책을 담당하는 실무자는 평가과정에서 평가에 필요한 자료를 제공하고 자체평가위원회에 의해 평가를 받는 주체가 되기 때문에 스스로 평가함으로써 얻는 학습효과에 한계가 있다는 점도 중립적･전문적인 외부평가자에 의한 자체평가 실시의 또 다른 측면이다(이광희･김주환, 2013). 즉, 자체평가 품질 개선을 위한 노력에도 불구하고 자체평가를 통한 학습효과로의 발전에는 여전히 한계가 있다.