설문조사, 심층면접을 위해 부대와 인원을 선정하여 목적, 취지, 중요성, 계획에 대해 설명했다. 사전에 설명한 것과 같은 내용으로 설문, 심층면접조사, 인터뷰를 진행했다.
본 조사를 위해 과제 연구원이 실태조사 전에 설문조사 및 심층면접조사를 위해 대상 부대를 선정하여 공문과 전화로 협조를 하고, 해당 업무 담당자에게 전화로 실태조사 목적과 취지, 중요성, 계획에 대해 주지를 시켰다. 해당 부대에 도착하여 대상인원을 선정 후 업무 담당자에게 하였던 동일한 내용과 인권침해 구제제도에 대한 교육을 한 후에 설문 및 심층면접조사를 하였다. 이와 병행하여 지휘관, 업무 담당자, 병영생활 전문상담관, 여성고충상담관 등과 인터뷰를 하였으며, 부대별로 사전 계획된 인원을 격리된 장소에 집결시켜 심층면접을 함으로써 설문조사의 단점을 보완하였다.