총 사업비 관리지침에서 중앙관서가 수행할 사항과 장관과의 협의를 정하고 있다. 각 단계가 끝나면 장관과 협의해 심사하고 결과를 반영해 조정하도록 한다. 
｢총사업비 관리지침｣에서는 대규모 재정사업의 효율적 관리를 위해 사업단계 별로 중앙관서의 장이 수행해야 할 사항과 기획재정부장관과의 협의가 필요한 사항을 정하고 있는데, [그림 Ⅲ-1-6]과 같이 ‘기본계획 수립’, ‘기본설계’, ‘실시설계’ 등 각 단계가 종료된 때에는 기획재정부장관과의 협의를 통해 이전 단계에 비해 총사업비 등이 증가하였는지 여부 등을 심사 받도록 되어 있고, 시공 단계에서는 총사업비(공사비, 보상비, 시설부대경비) 등의 조정이 필요한 경우 수시로 기획 재정부장관과 협의한 후 그 결과를 반영하여 총사업비를 조정하도록 되어 있다.