기지국 수사 기법은 추정하기 어려운 사건에 활용되며, 경찰은 개인정보 침해나 범죄자 특정 오류에 대한 우려에도 범죄 수사나 불법 시위 참가 여부를 파악할 때 이 기법을 적용한다. 
최근 용의자를 특정할 수 없는 범죄가 발생하거나, 동일 사건 단서가 여러 지역에서 시차를 두고 발견될 경우, 사건 발생 지역 기지국에서 발신된 전화번호를 추적하여 수사를 전개하는 소위 ‘기지국 수사’기법이 활용되고 있다. 경찰은 살인 등 강력 범죄 수사 뿐만 아니라 불법 집회 시위 참가 여부를 확인하기 위해서도 기지국 수사 기법을 적용하고 있다. 기지국 통신 기록 조회 자료를 근거로 불법 집회 시위 참가 여부를 판단하는 것은 헌법상 기본권인 통신의 비밀 보호, 사생활 보호, 정보 자기 결정권 등을 침해 할 수 있고, 오류의 가능성도 높아 자칫 모든 시민을 잠재적 범죄자로 보게 될 우려 가 있다는 논란에도 불구하고 계속되고 있다.