합리적 선택 제도주의와 사회학적 제도주의는 점진적 제도 변화를 가정한다는 점에서 유사하나, 전자는 합리적 인간이 제도 구축을 '선택'했다는 결과론적 입장을, 후자는 인간의 선택한 것이 아니라 사회문화를 인지하고 적응해 나가는 과정론적 입장에 초점을 둔다.
이상의 내용을 종합할 때, 제도 변화를 바라보는 합리적 선택 제도주의와 사회학적 제도주의는 점진적으로 변화한다는 것을 가정한다는 점에서 유사하다. 합리적 선택 제도주의는 거래비용을 감소시키기 위한 불확실성을 없애고 정보를 축적하면서 문제에 대응하는 다양한 대안을 설정함으로써, 제도를 점진적으로 변화시킨다고 볼 수 있다. 그리고 사회학적 제도주의는 제도라는 것은 원래 사회문화 등에 의해 인지적으로 적응해 나가는 점진적인 행위라고 본다. 그러나 제도의 변화를 설명하는 합리적 선택 제도주의와 사회학적 제도주의의 본질적인 내용에서는 다소 차이가 있다. 먼저, 합리적 선택 제도주의는 합리적이고, 이기적인 인간으로 전제하고 제도는 자신의 효용을 극대화하기 위해서 선택한 것으로, 의식적인 설계에 의한 것이라고 본다. 반면, 사회학적 제도주의는 사회문제의 발생 이후, 문화적인 수용을 할 뿐 인간은 적극적으로 선택행위를 하지 않고 단순히 문화나 사회에 대한 인지에 의해 제도의 변화가 이루어진다고 본다. 즉 제도 변화를 설명하는 데 있어 합리적인 선택 제도주의는 제도의 구축이 합리적인 최선의 선택이었다는 결과론적 입장에 초점을 두나, 사회학적 제도주의는 사회문화를 인지해서 적응해 나가는 과정론적 입장에 초점을 둔다.