산업기술보호법은 침해행위를 7년 이하의 징역이나 7억원 이하의 벌금으로 처벌한다. 외국에서 사용되게 할 목적인 경우 형이 가중되며, 과실인줄 몰랐다면 감소될 수 있다.
산업기술보호법의 벌칙 규정을 살펴보면 침해행위가 있는 경우에는 7년 이하의 징역 또는 7억원 이하의 벌금에 처하도록 하는 가운데, 외국에서 사용하거나 사용되게 할 목적으로 산업기술 침해행위를 한 자는 15년 이하의 징역 또는 15억원 이하의 벌금에 처하도록 가중하고 있다. 다만, 침해행위가 개입된 사실을 중대한 과실로 알지 못하고 그 산업기술 취득ㆍ사용 및 공개하거나 산업기술을 취득한 후에 그 산업기술에 대하여 침해행위가 개입된 사실을 중대한 과실로 알지 못하고 그 산업기술을 사용하거나 공개하는 행위는 3년 이하의 징역 또는 3억원 이하의 벌금에 처한다.