재정 사업 성과 관리 제도는 성과 계획서 작성-집행 및 점검(성과 보고서)-평가(통합 재정 사업 평가)-환류 체계(세출 조정 등)을 통해 이루어지고 있어 재정 통제를 통한 성과 관리적 특성이 강하다.
재정 사업 자율 평가 등 기존의 평가를 개편하여 마련된 통합 재정 사업 평가 제도(2016)는 개별 사업의 성과 정보를 예산 편성에 연계시킴으로써 재정 성과 목표 관리 제도의 실효성을 제고할 수 있도록 고안된 제도이다. 사업 수행 부처가 매년 전체 재정 사업을 대상으로 자체 평가를 하고 평가 후 자율적 세출 조정 방안(총세출의 1%)을 마련하도록 하며,기획재정부는 자체 평가에 대한 메타 평가를 하도록 함으로써 부처에 평가 자율성을 주고 있다. 심층 평가 제도는 기획재정부가 주체가 되어 재정 사업들에 대해 정밀 분석을 실시하여 문제의 원인을 파악고 평가 결과로 부처의 제도 개선을 유도하고 예산 편성 시 반영하기 위한 평가이다(「국가재정법」 제8조 제6항 및 같은 법 시행령 제3조). 통합 재정 사업 평가 결과 추가적 평가가 요구되는 사업, 유사 중복 사업, 예산 낭비가 우려되는 사업, 지출 효율화가 필요한 사업, 기타 성과 점검이 필요한 사업을 대상으로 한다. 재정 사업 성과 관리 제도는 성과 계획서 작성-집행 및 점검(성과 보고서)-평가(통합 재정 사업 평가)-환류 체계(세출 조정 등)을 통해 이루어지고 있어 재정 통제를 통한 성과 관리적 특성이 강하다.