키프로스 연방공화국의 영토조정 문제 처리를 위해 유엔 대표를 위원장으로 하는 이주위원회가 운영되고 있다. 재산권위원회와 공동체와 협력하여 이주민들의 거주시설과 생계지원 및 재산반환을 돕고 영토 합의에 따라 규칙을 만들기도 한다.
키프로스 연방공화국은 영토조정으로 인하여 현재 영토조정의 대상이 되는 이주위원회를 설치하는데, 이와 같은 이주자들의 특별한 보호에 대하여는 각 구성주 대표 1명과 그리스, 터키 및 영국 국민이 아닌 외국인 3명 등 5명으로 구성되는 이주위원회가 관리한다. 위원장은 유엔 대표가 되며, 유엔 사무총장이 이주위원회의 외국인 위원을 임명한다. 각 구성주는 각각 주택공급 및 재산문제를 관장하는 기관, 고용 및 경제문제를 관장하는 기관, 경찰기관, 영토조정 대상 지역에 위치하는 지방기관 등의 대표들을 임명하여, 그들로 하여금 이주위원회와 협력하고 연락책의 역할을 수행하며, 이주위원회의 요구에 따라 개최되는 추가 기획회의에 참석하도록 해야 한다. 특히, 이주위원회는 이주 대상이 되는 주민들이 이주 일자를 확정하기 전에 그들이 거주할 대체 거주시설의 준비 상태를 확인해야 하며, 이주 대상 주민이 이주해가는 자치단체 지역에서 생계를 확보하는 데 필요한 지원을 받을 수 있도록 이주민을 받는 자치단체의 해당 기관과 그에 관한 약정을 체결해야 한다. 또한 이주위원회는 영토 조정 대상지역 내의 재산반환 또는 대체 거주시설의 확정에 관한 결정과 관련하여 재산권위원회(Property Board)와 긴밀하게 협력하며, 대체 거주시설의 건설을 계획할 때는 공동체 단위의 이주를 원하는 공동체의 요구를 특별히 고려해야 한다. 이주위원회는 영토에 관한 합의에 따라 규칙을 제정하며, 각 구성주는 이주위원회의 결정을 최대한 존중하고 그에 따라 정해진 시기에 그 결정내용을 시행해야 하며, 이를 위하여 필요한 경우에는 법령을 제정해야 한다(부속문서 6. ‘영토에 관한합의’ 제7조).