공정거래법 위반 사건은 수범자가 대기업인 경우가 대다수이고, 범죄의 대상이 국책사업인 경우가 많은점, 이해관계인이 다수라 복잡하게 얽혀있는점 등을 특징으로 하고 있기 때문에 불법행위에 대한 형사처벌과 더불어 재발을 방지하기 위한 유관기관의 협업이 강화될 필요성이 있다.
그리고 공정거래법위반사건은 수범자가 대기업인 경우가 비일비재한 점, 특히 입찰담합 사건의 경우 범죄의 대상이 대규모 국책사업으로서 수년에 걸쳐 천문학적 규모의 국가재정이 투입되는 사업이 대부분인 점, 불공정거래사건의 경우 사회적으로 대기업의 갑질 논란을 불러 일으켰던 ‘남양유업의 유제품 밀어내기 사건’ 등과 같이 이해관계인이 다수인 점 등을 고려할 때 그 수사결과가 해당 사건 뿐 아니라 관련 시장 전반에 영향을 미칠 수밖에 없다는 측면에서 일반 형사사건과 비교하여 그 파급력이 매우 중대한 점을 감안하면 사후적인 형사처벌 뿐만 아니라 평소 업무 유관기관인 중소기업청, 조달청, 감사원과의 협력 체계를 정비하고 강화하여 공정거래 분야에서의 불법행위가 재발되지 않도록 예방함과 동시에 불법행위 발견시 신속히 수사에 착수하는 것이 필요하다.  따라서 검찰의 수사결과를 유관기관에 제공함으로써 각 유관기관이 맡은 바 소관 업무를 처리하고 향후 유사한 불법행위의 재발을 방지하기 위한 제도개선에 활용할 수 있도록 하는 등 업무 유관기관과의 협력을 강화하는 것이 중요하다.