미래학교 운영을 위해 ‘클라우드 기반 전국단위시스템 구축’으로 통합해 소요 예산을 추정했다. ‘학습 단위로 모듈 개발’은 무학년제, 초중고 교육과정 통합운영 등을 기본으로 했으며, 정책추진을 위해 타당성 검토와 시범운영이 필요하다고 판단, 예산소요를 예측했다.  
이에 여기에서는 앞서 분류한 대규모 추가적 재정소요를 유발하는 추진과제에 한하여 예산 소요판단을 하고자 한다. 앞에서 예산소요 추정이 지극히 제한적이고 대략적 수준에서 예측하고 있다는 한계를 거듭 밝히며, 여기에서는 1기 추진과제를 중심으로 재정소요 규모를 예측하고자 한다. 우선, 미래학교 운영을 위해 제안된 다양한 시스템 구축을 ‘클라우드 기반 전국단위시스템 구축’으로 통합하여 대략적인 소요 예산을 추정하였고, 이를 운영하기 위한 학교기반 구축비용을 추정해 보았다. 그리고 1기 추진과제를 중심으로 예산소요를 예측한다고 하였으나, 2기 추진과제로 분류된 ‘학습 단위로 모듈 개발’은 기본적으로 무학년제(교수학습수준을 기준으로 1~12단계 구분), 초･중･고 교육과정 통합운영 등이 기본 전제이기도 하고 정책 추진을 위해서는 다른 어떤 과제에 비해 준비 시간이 많이 필요할 뿐 아니라 충분한 타당성 검토 및 시범운영이 필요하다고 판단하여 시범적 운영 수준에서 예산소요를 예측하였다.