부서가 자체판단하여 갈등진단대상을 제안하면 이에 대해 맞춤형 대응방안을 기획하는데, 갈등영향분석과 실시의 연관성을 높여 갈등예방과 해소 방안을 마련해야 한다. 
먼저 갈등이 예상되는 사업에 대해 부서의 자체판단에 의해 갈등진단대상으로 제안하면, 갈등전담부서나 갈등관리심의위원회에서 갈등진단 및 등급을 결정하고, 이후 갈등대응계획을 수립하여 실행하는 과정에서 갈등등급에 맞는 맞춤형 대응방안을 마련하고, 특히 이 절차에서 갈등영향분석 실시 여부를 갈등관리심의위원회에서 심의의결하고, 갈등영향분석서가 작성되면 갈등예방 및 해결절차 필요성과 가능성을 진단하는 절차를 마련하여 갈등관리 전체의 프로세스 중에 갈등영향분석의 실시와의 연관성을 높여, 실질적인 갈등예방 및 해소 방안 마련을 모색할 필요가 있다.