개정된 한미 FTA 허가특허 연계제도 규정 내용을 살펴보면, 특허권자는 허가 이후 30일 이내에 특허정보를 식품의약품안전처에 신고하고 관련성이 인정되면 특허목록에 등재해 공개한다. 제3자는 특허의 내용이나 만료일 등에 관하여 알 수 있다.
한미 FTA 제18.9조 제5항은 허가특허 연계제도를 규정하고 있다. 특히, 제5항 가호는 통지제도를, 제5항 나호는 허가절차중지제도를 규율하고 있다. 가호가 규정하는 통지제도에 관한 사항은 2011년 12월 2일 개정 법률 제11118호로 약사법에 반영이 되었으며, 그 개정사항은 2012. 3. 31.에 발효되었다. 그 개정법에 의하면, 신약에 관한 판매허가를 획득한 신약 특허권자가 통지제도의 혜택을 보고자 하는 경우, 허가를 받은 날로부터 30일 이내에 관련 특허정보를 식품의약품안전처에 신고하여야 한다. 신고를 받은 식품의약품안전처는 신고된 특허가 허가된 약품과 관련성이 있는지 등에 대하여 심사한 후,관련성이 인정되는 경우 해당 특허를 특허목록에 등재하고 외부에 공개한다. 그 특허목록에 따라서 제3자는 해당 신약과 관련된 특허의 내용 및 그 특허의 존속기간 만료일 등에 관하여 알 수 있다.