학교 폭력의 가해자가 교사인 경우, 학교폭력대책자치위원회 내에서 가해자의 징계는 불가능하더라도 피해자 보호나 재발 방지를 위한 노력은 가능하다.
교사가 가해자인 사건에서는 교사의 징계는 학교폭력대책자치위원회의 심의 사항이 아니지만 학교폭력대책자치위원회에서는 학교폭력의 예방 및 대책수립을 위한 학교 체제 구축, 피해학생의 보호, 학교폭력의 예방 및 대책과 관련하여 학교폭력문제 책임교사 또는 학생회의 대표가 건의하는 사항을 심의할 수 있으므로, 피해자 보호 및 재발 방지대책 마련을 위한 절차로서의 기능을 할 수 있다. 자치위원회는 소집 사유가 발생한 날로부터 14일 이내에 개최하며 7일 이내로 연기할 수 있다. 피해자 진술은 피해자의 2차피해 방지를 위하여 수사기관의 사건 담당 경찰이나 상담기관 상담원이 출석하여 대신 진술하는 것도 가능하다.