원래 청년유니온은 서울과 경기 등 수도권 지역을 중심으로 한 조직으로 탄생하였으나, 내부적으로 중앙과 지역 간 사업의 유기적 연계나 캠페인 활동의 전국화를 도모하기에는 아직까지 미약한 점이 많은 것으로 지적된다.
셋째, 원래 청년유니온은 서울과 경기 등 수도권 지역을 중심으로 한 조직으로 탄생하였으나, 현재는 광역시도 단위로 9개의 지역지부(서울, 경기, 인천, 대전․충남, 충북, 광주․전남, 대구․경북, 부산, 경남)가 존재하는 전국 조직으로 발전하였다. 지역의 청년유니온은 중앙으로부터 하향식으로 건설된 것이 아니라, 청년유니온의 초기 활동을 접한 각 지역의 청년들이 자체적으로 지역모임을 결성하는 상향식으로 만들어졌다. 그러므로 내부적으로 중앙과 지역 간 사업의 유기적 연계나 캠페인 활동의 전국화를 도모하기에는 아직까지 미약한 점이 많은 것으로 지적된다. 우선 조합원의 지역별 분포를 보면, 서울․경기․인천 등 수도권 지역이 전체 조합원의 약 70%에 달할 정도로 편중되어 있다(표 4-4 참조). 또한 9개 지역지부들 간에도 활동 역량의 편차가 매우 큰 편이다. 현재 상근활동가를 두고 있는 지역지부는 대구와 경기 지부 정도에 그치고, 독자적인 활동을 비교적 활발하게 하는 지역은 부산․대구․경남․인천․경기 등 5개 지역 정도이다(인터뷰 참여자 3-B, 3-C).