MBS 발행비용은 예측이 쉬우나, MBS의 원활한 소화를 위해 보통 금융기관이 취급한 보금자리론을 대출취급 후 통상 1~2개월 이후 양수하기 때문에 MBS 발행금리는 예측이 힘들다. 공사는 이들을 합산한 손익균형금리를 매일 도출하고 있다.
MBS 발행비용은 MBS 발행금액의 일정한 비율로 계산되므로 비교적 예측이 쉬운 반면, MBS 발행금리는 예측이 매우 곤란한 측면이 있다. 왜냐하면, 공사는 보통 금융기관이 취급한 보금자리론을 대출취급 후 통상 1~2개월 이후 사오기(양수하기) 때문이다. 따라서 이러한 1~2개월간의 시중 금리 변화에 따른 리스크를 회피하기 위하여 공사는 헤지거래를 수행하고 있다. 한편 금융기관이 취급한 보금자리론을 판매 즉시 사오지 않고 일정 기간 후에 사오는 것은 채권시장에서의 MBS의 원활한 소화를 위해서이다. 예컨대 매일 취급되는 보금자리론 규모가 100억 원이고 회차별 적정 MBS 발행규모가 5,000억 원이라면 MBS 발행을 위한 기초자산 확보에 50영업일이 필요하다. 이러한 시차 차이로 인하여 취급 시점과 양수시점의 차이가 발생하고 있다. 공사는 이러한 MBS 발행금리와 발행비용을 합산하여 손익균형금리를 매일 도출하고 있다.