수행하는 사업과 여성가족부에서 수행하는 각각의 사업의 정책목표, 집행 방식, 성과 관리 등에 차이가 있다면 이런 각각의 사업의 집합체인 기본계획상의 정책 성과를 달성하기 어려운 구조이다.
이럴 경우 설령 기본계획에 근거하여 시행 계획이 수립된다고 하더라도 성과 목표의 설정이 개별 부처를 중심으로 이루어지기 때문에 성과 목표를 측정하는 성과 지표 및 측정 방식 역시 사후적으로 취합하는 수준에 그치고 있다. 즉 개별 부처에서 실질적으로 집행한 실적과 제시한 성과지표를 가지고 정책의 성과를 측정할 수밖에 없는 구조를 가지고 있다. 사회보장 기본계획에 포함되는 사업들이 대부분 장기적인 성과가 나거나 다른 사업과 결합하여 성과가 나는 경우가 빈번하다. 예를 들어 보건복지부에서 수행하는 사업과 여성가족부에서 수행하는 각각의 사업의 정책목표, 집행 방식, 성과 관리 등에 차이가 있다면 이런 각각의 사업의 집합체인 기본계획상의 정책 성과를 달성하기 어려운 구조이다.