경찰에게 수사결과를 보고받은 검사는 피해자의 의사확인을 거쳐 가정보호 사건 송치 여부를 결정한다. 그러나 실제로는 통신수단을 이용한 의사확인이 대부분이었다. 반의사불벌죄로 규정되지 않은 범죄에서도 피해자의 의사를 확인하는 단계를 두고 있었으며, 처벌보다는 가정유지 의사가 더 중요하게 다루어지기도 했다.
경찰에게 수사결과를 보고받은 검사는 그 이후 피해자의 의사확인을 거쳐 가정보호 사건 송치 여부를 결정한다. 또한 검사는 경찰의 임시조치 신청을 법원에 청구하는 중간 역할도 하고 있다. ‘가정폭력 사건처리 및 피해자 지원에 관한 지침’에 따르면 검사는 가정폭력사건을 처리함에 있어 피해자의 처벌 의사, 피해정도, 현재 상태 등을 충분히 고려하여야 하고(지침 제10조), 결정 전 면담제도를 활용하거나 전화 등 통신수단을 이용하여 가정폭력행위자에 대한 처벌여부, 가정유지 희망여부, 피해자 지원 및 보호조치 희망여부 등에 관한 피해자 의사를 확인하여 가정폭력 사건을 처리한다. 그러나 사건기록에 의하면, 결정전 면담제도보다는 통신수단을 이용한 의사확인이 대부분이었다. 피해자의 의사는 경찰단계에서 처벌을 원한다는 강력한 의사를 보였던 사건에서조차 이 단계에서 번복되는 경향을 보였다. 또한 형법상 반의사불벌죄로 규정되지 아니한 범죄에서도 검찰단계에서 피해자의 의사를 확인하는 단계를 두어 사건처리에 중요한 영향을 미치고 있었다. 더욱이 피해자의 처벌의사보다는 가정유지 의사가 더 중요하게 다루어지고 있는 사건도 종종 존재하였다.