양육수당의 기준이 시설 이용료인 탓에 형평성에서 논란이 있다. 월 10만원인 가정 양육수당에 비해 시설 양육수당이 더 많아 금액 인상 요구가 있으나 여성경제활동 측면에서 인상의 악영향을 우려하고 있다.
2016년 6월 현재 기준으로 어린이집･유치원･종일제 아이돌봄서비스등을 이용하지 않고 가정에서 영유아를 양육하는 경우, 초등학교 미취학만 84개월 미만 전 계층 아동을 대상으로 가정양육수당이 지원되며, 지원금액은 10만~20만 원이다. 연령별 양육수당 지원 금액은 <표 3-7>과 같다. 0세~11개월 영아는 20만 원, 12개월~23개월 영아는 15만 원, 36개월 이상의 유아에게는 10만 원이 지급되고 있으며, 농어촌 양육수당과 장애아동수당은 다소 차별적인 금액을 지원하고 있는 상황이다. 양육수당의 경우, 시설 이용료 지원 금액 대비 지원의 형평성 차원에서 많은 논란이 있는 상황으로 금액 인상에 대한 의견들이 있으나, 한편으로는 여성경제활동 제고 측면에서 양육수당 인상이 미칠 영향을 우려하고 있다.