휴일근로시간을 연장근로시간에 포함시키는 것으로 근로기준법을 개정할 경우 노동시간을 줄여야 하기 때문에 장시간 노동을 해왔던 중소기업은 큰 타격을 입을 수 있다. 따라서 여러 사안들을 고려하는 가운데 기업 규모별로 단계적으로 시행되어야 할 것이다.
셋째, 휴일근로시간을 연장근로시간에 포함하는 경우 노동시간을 어떻게 줄일 것인가의 문제도 업종이나 소업종 혹은 기업 수준에서 노사 간에 시급히 타협을 이루어야 할 사안이다. 그 일환으로 휴일근로시간을 연장 근로시간에서 제외했던 종래의 임의적 행정해석이 가능했던 여지를 없애고, 법적으로 주간 근로시간을 엄정하게 관리하고 규율할 필요가 있다. 다만 종래의 행정해석이 제조업 등의 교대제와 장시간 노동 관행의 유지에 큰 영향을 발휘해 왔기 때문에 그것을 폐기하고 곧바로 휴일근로시간을 연장근로시간에 포함하도록 하는 것으로만은 충분하지 않다. 그것은 자칫 기존의 장시간 노동관행에 의존해 온 많은 중소기업들에게 지나친 충격을 줄 수 있다. 따라서 휴일근로시간에 연장근로시간을 포함하는 쪽으로 새로이 규율을 하는 것은 일단 근로기준법의 개정을 통해서 하되 기업 규모별로 단계적으로 적용할 필요가 있다. 다만 근로기준법의 개정만으로 자동적으로 노동시간이 줄지는 않을 것이기에, 많은 제조업 사업체들이 이런 변화된 법적 규제내용을 준수하도록 하기 위해서는 줄어든 노동시간, 바뀌는 교대제에 따라 여러 가지들을 새롭게 고려해 나가야 한다. 분명 임금 보전, 생산성 향상의 정도, 생산물량 보전, 기업들의 비용증가에 대한 분담 등 많은 문제들이 동시에 제기될 것이기에 이에 대한 고려가 병행된 제도 개혁이어야 할 것이다.