품의제의 역기능으로 장관과 부처 정책입안자들이 다른 부처와의 협의가 어려워질 수 있다. 그렇기 때문에 각종 부처들의 정책 협상력을 향상시킬 필요가 있다.
이와 같이 품의제의 역기능에 의해 장관과 부처 정책입안자들은 타부처와 이해를 조정하는 데 어려움에 직면하게 되며 오히려 의제주도정책과정을 가장 효과적으로 수행할 수 있는 행위자들은 전략적 사고와 행동을 하기에 적합한 대통령과 비서실, 언론, 대학, 연구기관 등이라 할 수 있다. 따라서 사회부총리 하에서 정책의 총괄 조정은 품의제의 역기능을 발생시키지 않기 위해서 정부부처, 입법부, 기타 정책집단들 사이의 정책 협상력을 끌어올리는 것이 핵심이 될 것이다. 또한 협상력을 높이기 위해서는 전문가들의 결집을 통한 의제발굴과 정책분석 기능을 하게하고, 이를 충분히 활용할 필요가 있다.