의료분쟁조정 중재제도의 장점은  진료기록과 자료만 제출하면 과실  입증 부담이나 변호사 없이  저렴한 수수료로 이용 가능하며  의학 검토도 해준다는 것이다.
의료분쟁조정ㆍ중재제도를 이용할 경우 환자는 의료인의 과실과 인과관계를 증명할 필요가 없이 조정신청을 하고 진료기록 등 자료만 제출하면 조정중재원에 설치된 감정부에서 과실 및 인과관계를 검토하여 의견을 제시하게 되므로, 환자는 입증의 부담에서 벗어날 수 있고, 소송과 달리 당사자가 변호사 없이도 절차를 이용하는 것이 어렵지 않으며, 제도 이용에 있어서 비교적 저렴한 수수료만 지출하면 되고, 무엇보다도 자격이 검증된 의료전문가 등으로 구성된 감정부에서 사실관계와 분쟁관련 쟁점을 정리하고 이에 대한 의학적인 검토까지 해준다는 장점이 있다.