학교 내 프로그램으로 실시되는 초등돌봄교실의 경우 지역아동센터 등에 평가하듯이 엄격한 평가기준의 적용은 어렵다는 의견도 보인다.
물론 초등돌봄교실은 기본적으로 ‘학교’라는 공식 교육기관에서 설치 ․ 운영하는 돌봄서비스이고, 돌봄교사 역시 일정한 자격을 갖추도록 하고 있기 때문에 모든 돌봄교실이 어느 정도의 서비스 수준은 갖추고 있을 것이라고 예상되는 부분은 있다. 또한 기본적으로 민간영역에서 설치· 운영하는 지역아동센터나 공공성을 갖춘 기관․단체가 운영하기는 하지만 지역사회에 속해 있는 방과후아카데미와 달리 학교 내에서 실시하는 하나의 프로그램이라는 점에서 평가의 수준을 지역아동센터나 방과후아카데미에 대한 평가와 같이 엄격하게 적용하기는 어렵다는 의견도 있다.