대통령과 국무총리의 역할범위를 정치와 행정 사안으로 분리한다. 국무총리는 실질적 행정업무의 책임자가 되고 (가칭)한반도체제통합위원회 위원장은 원칙적으로 대통령이 맡는다.
그러나 제2안과 같이 대통령과 국무총리의 역할범위를 정치적 사안과 행정적 사안을 분리한다면, (가칭)한반도체제통합위원회 위원장은 원칙적으로 대통령이 맡아 수행하며 국무총리는 대내적 행정업무의 책임자로서 행정각부를 실질적으로 통할하는 것이 마땅할 것이다. 따라서 국무회의의 의장은 국무총리가 맡게 된다. 이 경우 국무총리는 외교부, 국방부, 통일부(통합부) 장관을 제외한 부처들의 장관의 임명제청권이나 해임건의권도 실질적으로 발할 수 있고, 정책조정권도 폭 넓게 행사할 수 있을 것이다. 국무총리가 이러한 권한을 실질적으로 행사할 수 있게 되면, 경제, 사회 분야 등의 체제통합 과정에서 발생될 다양한 정책조정도 이루어질 것으로 판단된다.