학생들이 의사 결정권을 가지는 협동수업에서 교사의 개입이 있어야 하는지에 대해 어떤 학자들은 교사가 어느 정도 통제와 간섭을 해야 한다고 주장하고, 일부 학자들은 교사가 지나치게 간섭하는 것을 경계해야 한다고 주장한다.
특히 협동언어 교수법에서 조를 구성하는 결정권을 누가 가지는가에 따라 교사와 학생의 역할이 달라질 수 있다. 학생들이 의사 결정권을 가지는 협동수업에서는 학생은 수업 주도자, 교사는 격려자와 감독자의 역할을 수행한다. 이 수업에서는 학생이 수업을 주도하고, 교사는 학생이 조를 자율적으로 구성해서 상호작용을 하도록 격려를 하고 필요한 자료와 정보를 제공한다. 그러나 교사의 간섭이 없이 학생들끼리 조를 만들도록 했을 때 비슷한 성격과 수준, 학습유형을 가진 학생들끼리 동질적인 조를 형성할 가능성이 높다. 그래서 Ruddock(1978), McCafferty 외(2006) 등은 협동수업에서 교사가 어느 정도 통제와 간섭을 해야 한다고 주장한다. 이들에 의하면 협동수업에서는 다양한 사람들을 대화의 상대로 해서 여러가지 의사소통 기능을 연습하는 것이 중요하기 때문에 어느정도 이질적인 학생들끼리 조를 형성하는 것이 바람직하다. 그러나 일부 학자들(Brookes 와 Grundy, 1990)은 협동학습에서 교사가 지나치게 간섭하는 것을 경계한다. 이들에 의하면 교사가 조구성을 통제하기 보다는 학생들이 공통 관심사, 태어나 연도, 어린 시절의 꿈, 취미 등과 같이 여러 재미있는 요인을 고려해서 조를 구성하도록 유도하는 것이 효과적이다. 그래야 학생 간에 자율적인 상호작용이 활발하게 진행이 되고 언어발달이 자연스럽게 이루어진다는 것이다.