셋째, 북한 정권 붕괴 이후 북한군 지휘부를 어떻게 처리할 것인가에 대해 논의해야 한다. 북한군은 규모가 크고 능력 또한 상당해 무장해제시켜야 한다. 그렇지만 그 존재 자체를 부정할 수는 없다. 제도적 틀을 유지하도록 함으로써 비국가적 저항세력의 확산을 차단할 수 있을 것이다. 군은 지휘부의 저항 포기만으로도 쉽게 통제할 수 있지만 비국가적 저항세력은 그렇지 않기 때문이다.
셋째, 차세대 지도집단 구성과 같은 맥락에서 북한 정권 붕괴 이후 북한군 지휘부를 어떻게 처리할 것인가에 대한 진지한 논의가 이루어져야 한다. 전술한 바와 같이 북한군의 규모는 대단히 크며, 그 능력 또한 상당하다. 따라서 북한 정권 붕괴 이후 북한군의 무장해제는 필수적이다. 그럼에도 불구하고 제도적 장치로서의 북한군의 존재 자체가 부정되는 것은 곤란하다. 왜냐하면 북한 정권붕괴 후 사실상 북한 내부의 안정화 활동과 더불어 내부 치안을 지속할 수 있는 핵심적 기능을 가질 수 있는 소수의 행위자 가운데 하나가 바로 북한군이기 때문이다. 군이라는 제도적 틀을 일정 정도 유지하도록 함으로써 잠재적인 비국가적 저항세력의 확산을 차단할 수 있다. 이라크에서 미군이 경험한 바와 같이 군은 제도적 조직이기 때문에 지휘부의 저항 포기만으로도 비교적 쉽게 통제가 가능하지만 비국가적 저항세력은 국가의 제도적 장치가 아니기 때문에 통제가 대단히 어렵고 저항이 장기적으로 지속된다. 북한의 군 조직이 정권 붕괴 이후에도 제도적 통제 속에서 남아 비국가적 저항세력으로 전이되지 않도록 막기 위해서라도 최소한의 북한군 체제는 일정기간 유지시킬 필요가 있다. 특히 무력 저항을 포기한 북한군 지휘부를 포섭하고 이들의 처우를 보장함으로써 이들이 죽기살기로 저항하지 않도록 회유하고, 장기적으로 새로운 차세대 민간 리더십과 더불어 북한 사회를 재건할 수 있도록 유도해야 한다.