미래 성장 동력 분야가 물리적 통합만으로 그칠 수 있다는 우려가 제기됐다. 정부가 실질적 정책 통합을 추진한 결과, 미래 성장 동력 분야가 확대되고 전략적 투자 분야가 2배 늘어났다.
미래성장동력 분야의 정책 통합은 정책 추진의 효율성 및 책임성 확보 측면에서는 바람직하였지만, 자칫 양 부처 선정분야의 물리적 통합 수준에 머무를 수 있다는 우려도 제기되었다. 이에 정부는 책임부처가 복수인 분야는 부처 간 의견 조율 등을 효과적으로 수행할 수 있도록 간사부처를 지정하여 부처간 협력을 유도하고 관계부처 국장급 협의회를 개최하는 등 미래성장동력 추진 주체 간 긴밀한 협업체계를 마련하여 실질적 정책통합을 추진하였다고 밝히고 있다. 결과적으로 정부의 미래성장동력 분야는 중복분야를 제외하고 19대 분야로 확대되었으며, 참여정부의 10대 분야에 비해 전략적 투자분야가 2배 가까이 늘어나게 되었다.