총회검사인은 회사나 소수주주의 청구로 선임됨에 따라 그 목적과 기능에 한계가 있다. 총회검사인의 직접적인 직무는 법원에 대한 조사보고 제출이고 이를 통해 총회의 공정한 운영은 간접적으로 확보된다.
그러나 총회검사인은 모든 총회에서 항상 선임되는 것은 아니며, 회사나 소수주주의 청구에의해 선임되는 데에 불과하다. 이에 따라 총회검사인 제도의 목적 내지 그 기능에 한계가 생긴다. 특히 총회검사인은 적극적으로 총회의 공정한 운영을 확보하는 직책을 가지는 것은 아니다. 법원에 대한 조사보고의 제출이 그 직접적인 직무이며, 이를 통하여 공정한 총회의 운영이 간접적으로 확보될 수 있다. 또한 검사인 선임청구권이 소수주주권이라는 점을 이유로 총회의 올바른 운영을 일반적으로 확보하는 제도는 아니며, 소수주주가 불공정한 취급을 받지 않는 것을 담보한다는 견해가 많다. 그러나 회사도 검사인의 선임을 청구할 수 있으므로 이러한 한정적 해석을 강조할 필요는 없을 것이다.