지방행정연수원은 건설교통부 추진단을 방문하여 실무 검토의 문제점과 요구안이 작성된 검토의견서를 제출하였다. 업무시설과 기숙사는 확대되었으나 기타 교육연수시설은 축소된 안으로 최종 협의하여 지방이전계획을 조정,제출했다.
검토의견서를 제출한 당일 연수원은 건설교통부 추진단을 방문하여 실무 검토의 문제점과 요구안을 설명하였다. 바로 다음 날인 2008년 2월 14일, 연수원은 건설교통부 추진단과 협의하여 51,698㎡의 면적을 제시받고, 이후 업무시설 2,770㎡를 추가하여 총 54,468㎡를 최종안으로 협의하였다. 결국 건설교통부 추진단이 최종 제시한 연수원 신청사 시설 규모 54,468㎡는 기존 시설 규모(39,195㎡) 대비 124% 수준이며, 업무시설 8,762㎡, 기숙사 16,608㎡, 기타 교육연수시설이 25,098㎡이다. 업무시설이 3.3배, 기숙사는 2배 이상 확대되었으나 기타 교육연수시설은 약 1,500㎡ 축소되었다. 이 축소분은 주차타워 설치가 타 기관과의 형평성 문제로 시설 규모를 전부 인정받지 못한 것에 기인했다. 이렇게 해서 최종 제시한 시설 규모를 기준으로 2008년 3월 19일 지방이전 계획을 조정하여 건설교통부에 다시 제출하였다.