지방자치단체에서 많은 비용을 투입해 모바일 공공서비스를 개발했지만 다운로드 실적이 낮거나 민간 서비스와 중복되어 없어진 경우 등 모바일 앱 관리에 문제점을 보이고 있다.
각 부처 및 지방자치단체에서 경쟁적으로 모바일 공공서비스를 개발한 것은 2012년에서 2013년도 사이였다. 중앙행정기관에서 개발된 어플리케이션 중에서 이 기간에 개발된 것이 181개로 58.4%에 달한다는 사실이 이를 반증한다. 바른사회시민회의가 54개 공공기관에 대한 정보공개청구와 앱 마켓 정보를 기반으로 조사한 결과를 보면 2014년 5월 기준 총 310개의 공공 앱 서비스가 제공되고 있는데, 이들 기관이 앱 개발에 사용한 순수비용은 267억 원에 달하였다. 그러나 투입된 개발비용과는 대조적으로 앱의 시장성을 대변하는 다운로드 실적은 미미한 수준이다. 2014년 연말 기준 정부 전체적으로 약 1,300여 개의 앱 서비스가 제공되었으나 이 중 1,000건 이하의 다운로드를 기록한 앱이 전체의 약 40%에 달하였으며 지난 2년간 업데이트가 이뤄지지 않은 앱이 30%에 달하는 등 모바일 앱 관리에 큰 문제점을 드러내기도 하였다. 2015년 12월 말 기준, 정부·지방자치단체, 공사·공단 등이 개발한 공공 앱은 총 1,768개에 달했다. 정부 기관이 이렇듯 모바일 앱을 경쟁적으로 내놓고 있었지만 그중 3분의 1은 이용이 저조하거나 민간이 제공하는 서비스와 중복되어 폐지된 것으로 나타났다.