자율고 제도 개선 및 특목고 지도·감독은 일반고에 대한 차별을 해소하는 방향으로 추진되고 있다. 자공고의 경우 후기 우선 선발권을 폐지하였고, 자사고의 경우 학생 선발 방식을 제한하도록 하였다.
자율고 제도 개선 및 특목고 지도·감독은 고교 유형에 따른 학생 선발시기, 교육과정 운영의 자율성 등 일반고에 대한 차별을 해소하는 방향으로 추진되고 있다. 자공고의 경우 일반고에 앞서 우선 선발함으로써 부당 특혜라는 지적이 있는 만큼 후기 우선 선발권을 ’15학년도부터 폐지하도록 했다. 아울러, 성적으로 지원자격을 제한하거나(서울, 내신 50% 이내 추첨), 성적을 반영해 학생을 선발(지방, 자기주도학습전형 등)하는 현행 자사고 입시제도로는 꿈과 끼를 살리는 교육이 어렵다고 판단됨에 따라 ’15학년도부터 평준화지역 중 서울 소재 자사고는 1단계에서는 성적제한 없이 추첨해 입학정원의 1.5배수 학생을 선발하고, 2단계에서 면접으로 학생의 꿈과 끼와 인성을 평가하는 방식으로 학생 선발 방식을 제한하도록 한 것이 주요 골자다.