자체감사에서 가장 중요한 요소는 우수한 인적자원이다. 이를 확충, 보급하기 위한 방안으로 감사직렬제도 도입이 가장 많이 등장하지만 한계가 많다. 세심한 제도적 접근, 자체감사 수행 필요인력 분석을 통한 수감기관의 업무수행 효율성 파악 및 점검 가능한 인력구성 계획 수립 기준이 필요하다.
자체감사는 자본집약이 아니라, 인적자본 집약성을 갖는다. 따라서 우수한 인력자원을 확충하고 보급하는 것이 관건이다. 자체감사의 인력충원으로 감사직렬제도의 도입을 가장 많이 주장한다. 그러나 이것은 자체감사기구의 조직 크기와 인력구성의 폐쇄성으로 인해서 제 기능을 수행하는 데 한계가 있다는 점을 간과한 결과이다. 예컨대, 지방의회의 의회직렬 신설을 통해서 지방의회의 인사 독립성을 강조하는 맥락과 유시하다. 문제는 A광역시 의회의 경우 100명의 직원이 있음에도 불구하고 이를 의회직렬로 폐쇄시킬 때는 일정기간 유능한 인력으로 의회의 전문성을 확보할 수 있겠지만, 인사상 폐쇄성은 다양하고 넓은 시각에서 공공행정을 이해할 수 없다는 한계가 있다. 특히, 자체감사가 작동하는 지방자치단체나 지방교육청의 경우 일반행정가 중심으로 행정이 운영되고 있는 상황에서 감사인력만 전문화하거나 감사직렬을 신설하여 감사인력의 시야와 경험을 갖추지 못한 인력자원 풀이 가동될 경우 자체감사제도라는 장치는 제 기능을 효율적으로 달성할 수 없기 때문이다. 즉, 감사직렬의 도입은 감사기구가 작동하는 부서의 규모가 감사원과 같이 인력자원 풀(pool)이 마련되지 않으면, 감사조직의 역량 강화를 기대하기 어렵다는 문제가 있다. 따라서 감사직렬 도입은 일견 타당해 보이지만, 여러 가지 한계점이 있기 때문에 이에 대한 세심한 제도적 접근이 필요하다. 또한 자체감사를 수행하기 위한 적정인력 규모에 대한 인력분석을 통해서 수감기관이 효율적으로 업무수행 여부를 확인․점검할 수 있는 효과적인 인력구성에 대한 계획 수립을 위해 기준을 마련할 필요가 있다.