국유재산관리기금은 국유재산에 대한 관리에서 문제가 생기자, 이에 대응하기 위해 국유재산 관리 현황과 제도를 집중적으로 검토한 결과, 2011년 3월 국유재산법을 고쳐 진행하고 있다. 해당 기금은 공용재산으로 하나로 통합하여 운영되고, 투명성을 강화하였다.  
국유재산관리기금은 그동안 각 부처가 소관 국유재산을 각각 분산하여 관리하는 방식에 의함에 따라 유휴 행정재산의 과다 보유, 관리의 소홀, 재정의 비효율성 등 국유재산 관리상 문제점이 지속적으로 발생하자 이를 개선하기 위해 국유재산 관리 현황 및 제도를 전면적으로 검토한 결과로 2011년 3월 국유재산법을 개정해 2012년부터 신설 운용하고 있다. 본 기금은 그동안 정부 부처별로 개별적·경쟁적으로 추진해 오던 청사 등 공용재산 취득사업을 기금으로 통합하여 국유재산에 대한 종합적인 수급조정을 강화하고, 기금을 통한 토지비축 및 국유재산개발을 지원하여 국유재산의 활용도 및 가치를 제고함으로써 재정건전성에 기여함을 목적으로 하고 있으며, 현재 공용재산의 취득사업 통합관리, 장래 행정목적으로 사용되는 토지의 비축사업, 그리고 기금개발사업 등을 지원하고 있다. 본 사업의 총괄은 기획재정부가, 회계와 결산, 개발, 여유자금 운용 등의 부분적인 사업관리 업무는 한국자산관리공사에 위탁하고 있다.