정부업무평가 내 부처 간 협업평가 등 행정협업 평가에서 구체적인 평가 방법으로 서면평가, 대면평가 등이 활용된다. 이들은 합리적인 평가방법 이라고 여겨지며 특히 대면평가는 담당자들의 직접 설명을 통해 협업과제의 최종판단에 큰 도움을 준다.
먼저 정부업무평가 내 부처 간 협업평가, 정부 3.0 평가 내 일하는 방식 혁신평가, 협업 조력기관 포상 대상 선정 등 행정협업 평가에서 구체적인 평가 방법으로 서면평가, 대면평가, 심사위원 심층토의 등이 취사선택되어 활용되고 있었다. 서면평가에서는 각 부처에서 제출한 협업 사례 설명자료 및 증빙자료를 검토하고 평가지표에 따른 평정을 실시하였으며, 대면평가는 각 부처별 발표에 이은 질의응답으로 구성되었다. 그리고 심사위원 심층토의를 통해 평정결과를 조정하여 최종 확정하거나 포상 기관을 확정하는 절차를 거친다. 이러한 평가방법들은 대체로 합리적인 평가 방법으로 여겨지고 있으며, 특히 대면평가는 협업 과제 담당자들이 과제에 대해 직접 설명을 함으로서 협업 과제를 최종적으로 판단하는데 도움이 된다는 의견이 있었다. 다만 대면평가 시간이 충분치 않아 심도 있는 질의응답을 위해서는 충분한 시간 확보가 필요한 것으로 나타 났다.