가족친화기업 인증은 최고 경영층의 리더십, 가족친화 실행제도, 가족친화경영 만족도를 기준으로 70점 이상(중소기업은 60점)을 획득하면 부여된다. 중소기업은 인증제도 진입이 비교적 용이하다.
가족친화기업 인증을 위한 기준은 최고 경영층의 리더십, 가족친화 실행제도, 가족친화경영 만족도 등 3개 대영역과 가점 영역으로 구성되어 있으며, 신규인증의 경우 평가를 통해 70점 이상(중소기업은 60점) 획득하면 인증이 부여된다. 인증의 유효기간은 인증을 받은 날부터 3년이며, 인증유효기간 내 가족친화경영 이행실적 등에 따라 1회에 한하여 2년 이내에서 연장이 가능하다. 제도 시행 초기에는 기업규모에 관계없이 동일한 심사기준을 적용하였으나 2014년부터는 인증기준을 대기업 등과 중소기업으로 분리하여 중소기업의 제도 접근성을 높였다. 즉 중소기업의 경우, 인증기준을 일·가정 양립 지원을 위한 핵심지표를 중심으로 구성하여 인증제도 진입을 용이하게 하였다.