국립대학을 총괄적으로 운영할 수 있는 협치형 운영 기구 설치를 검토한다. 개별 국립대학의 자율성을 최대한 허용하면서 전체 국립대학이 통일되고 체계적인 틀 안에서 고등교육 발전에 기여할 수 있도록 국립대학의의사결정 운영 구조를 마련하는 것이 필요한 시점이다.
국립대학을 전체적으로 총괄 운영할 수 있는 협치형 운영 기구 설치를 검토한다. 한 예를 들어(가칭)국립대학위원회를 설치하는데 대통령이 국가교육위원회의 추천을 받아 지명하고 의회가 승인하는 위원들을 20명 이내로 구성할 수 있을 것이다. 위원들은 교육계 인사들은 물론 과학계, 산업계, 시민사회, 전문가, 지역 시민대표 등으로 구성하는 것이 바람직하다. 이 위원회는 전체 국립대학을 총괄하는 총장의 선임, 국립대학 전반의 장기발전계획, 재원배분의 규칙 등을 국가교육위원회의장기발전계획에 기초하여 결정하도록 한다. 개별 국립대학은 대학교의 평의회, 교무회의, (캠퍼스)총장의 권한과 책임을 법제화함으로 총장은 캠퍼스를 대표하여 위원회에 의견을 제출할 수 있고 협상과 계약을 진행할 수 있을 것이다. 프로그램에 따른 입학기준, 연구, 학사평가, 대학내 정원조정, 교수평가 등은 개별 대학이 연합체와 협력을 통해 조정할 수도 있을 것이다. 대학별로는 대학평의원회와 총장(실)을 중심으로 의사결정의 리더십을 구성한다. 개별 국립대학의 자율성을 최대한 허용하면서 전체 국립대학이 통일되고 체계적인 틀 안에서 고등교육 발전에 기여할 수 있도록 국립대학의의사결정 운영 구조를 마련하는 것이 필요한 시점이다.