인적자원개발기본법은 교육부총리의 정책수단이었지만 여러 논쟁이 벌어졌고 이에 따라 우리나라 정부조직 특성에 기인해 합의하고 수정하는 과정을 거쳐야 했다.
인적자원개발기본법은 교육부총리의 정책 총괄･조정에 따른 제도적 장치를 마련하는 정책수단이었다. 정부조직법이 2001년 1월 29일에 개정되어 교육인적자원부의 직제가 명시되었지만 그로부터 1년 7개월이 지난 2002년 8월 26일에 인적자원개발기본법을 공포하는 과정에서 법률을 둘러싼 지지와 논쟁이 벌어졌다. 국무조정실이 정책조정의 역할을 충분히 수행하지 못하는 우리나라 정부조직의 특성에 기인하여 정부 내 부처간 상호 충돌하거나 모순되는 많은 정책들이 숙의과정 없이 결정･집행 되었다면 국가인적자원개발정책은 법령의 필요성, 형태, 다른 법령과의 관계 등을 합의하여 정립하는 필요불급한 과정을 거쳐야 했다.