R&D는 인력의 전문성을 요하므로 연구기관의 역할 및 역량 개선을 위해서는 현재의 정부 주도 의사결정구조에서 벗어나 전문가들이 참여하는 평의회의 도입을 통해 의사결정의 합리성을 향상시킬 필요가 있다.
R&D는 고도화된 전문활동으로 연구 활동에 참여하는 연구자 및 지배구조에 관여하는 인력의 전문성을 요한다. 그러나 현재 출연(연)의 지배구조는 정부 주도의 의사결정구조로 이루어지고 있다. 문제해결 중심의 연구기관의 역할 및 역량 개선이라는 변화를 위해서는 전문적인 의사결정이 더욱 필요하다. 따라서 평의회 제도 도입과 같은 의사결정 거버넌스 체계의 개편을 고려하는 것이 중요하다. 평의회 제도를 정부의 역할을 견제하는 기구가 아니라 부족한 부분을 서로 보완 가능한 기구로서 인식을 전환하는 것이 필요하다. 즉 정부의 역할과 과학기술 및 관련 전문가들이 참여하는 평의회와 같은 기구가 각각의 장점을 살리고 상호 보완적 관계 속에서 의사결정의 합리성을 높이는 방향으로 개선해 가는 것이 필요하다.