연구기관과 학계에서 농수산물 수출을 농업의 구조조정과 함께 한국 농업의 생존전략이라고 제안하자 공사는 이에 맞춰 국내외 환경 여건의 변화 속에서 새로운 사업 기회를 만들어내 위상을 재정립했다.
연구기관 및 학계에서도 우리 농수산물 수출의 필요성을 지적하고 정책으로 발전시키기 위한 이론적 기반을 제시하기 시작했다. 이는 수입개방을 막을 수 없는 상황에서 농업의 구조조정과 함께 우수 농산물의 수출만이 무역자유화 시대에 한국 농업의 생존전략이라는 의미였다. 농수산물유통공사는 이 같은 경영환경에 대응하기 위해 1991년 8월 수출농업 육성을 위한 수출지원 기능 확충을 골자로 하는 '2000년대의 공사 장기 경영전략'을 수립하였다. 이 경영전략은 1991년 5월부터 100일 동안 장기경영작업반에서 직접 수립하였다. 협상의 진전, 남북한 교역 여건 조성, 세계 경제의 블록화, 농수산 정책 방향의 전환, 지방자치제 실시 등 국내외 환경 여건의 변화 속에서 유통공사의 사업을 재조명하고 새로운 사업 기회를 도출해 내기 위한 것이었다. 2000년대 개방 농업시대 유통공사의 위상을 재정립하기 위한 목적도 있었다. 이어 1991년 11월에는 서울대학교 및 농촌경제연구원과 공동으로 '수출 농업의 타당성 검토와 UR 타결 이후의 수출지원 방안'을 강구하기 위한 공동연구를 실시하였다.