연기금의 국채 투자가 가진 장기적  위험 요소는 국민연금이 본격적으로 급여 지급액이 증가하게 될 때, 국채의 처분이 어려워 유동성 확보에 문제가 생길 수 있다는 것이다.
기금 측면에서는 국채에 대한 투자가 장기적으로 야기할 수 있는 문제점을 분석해 보았다. 국채에 대한 국민연금의 투자는 제도가 지속되는 상황에서는 안정적인 이자 수입을 제공하는 투자 상품이지만 제도성숙기를 지나 본격적인 급여지출기가 되면 대규모 매도가 현실적으로 어려울 수 있다는 문제점이 있다. 국채를 발행하는 정부 입장에서도 발행된 국채의 상당 부분이 일정 시점을 기해 상환된다는 것을 전제하기보다는 만기 연장이 당연하다고 기대할 수 있다. 국민연금의 급여가 급격히 증가하는 시점에 국민연금이 보유한 국채를 현금으로 상환해 주기 위해서는 세금을 더 징수하거나 다른 국채를 발행해야만 하나 이는 국민연금을 대신할 수 있을 정도로 거대한 국내 자본이 국채 매입을 해 줘야만 가능할 것이다. 국민연금이 보유한 국공채 규모를 감안한다면 현금화가 쉽게 진행되지 않을 수도 있다는 점을 염두에 둘 수밖에 없다.