무지개 학교 운영을 통해 미래지향적 공교육 혁신학교 모델을 창출해 낼 것이다. 또한 맞춤형 교육과정으로 공교육을 정상화하고 만족도를 높이는 것을 목표로 한다. 예산지원과 함께 지역 협의체를 구성해 무지개학교 교육지구 지정을 추진할 예정이다.
행정력을 집중적으로 투입할 역점과제로는 첫째, 새로운 학교 모델, 무지개학교 운영이다. 무지개학교 운영의 목표는 자율화·다양화·특성화를 통한 미래지향적 공교육 혁신학교 모델 창출이다. 또한 맞춤형 교육과정 운영을 통하여 공교육을 정상화하고 교육 만족도를 제고하는 데 목적이 있다. 2011년 30개교, 2012년에는 40개교, 2013년에는 51개교를 지정하여 1년간 교당 4천만 원~8천만원의 예산을 지원·운영하였고, 2014년에는 10여 개 학교를 추가 지정하여 운영할 예정이다. 또한, 학교혁신 역량 강화와 무지개학교 사업 확산을 위해 기초 지방자치단체와 지역교육청이 협의체를 구성하고, 참여와 협력의 신뢰받는 공교육을 실현하기 위해 무지개학교 교육지구를 지정하여 지역과 함께하는 교육지구 모델을 창출할 계획이다. 2013년에는 장흥군을 무지개학교 교육지구로 지정·운영하였고, 이후 지속적으로 이를 확산시켜나갈 계획이다.