학습종학클리닉센터는 주로 전문 상담사로 구성된 학습코칭단을 두어 기초학력부진 요인을 진단, 분석하여 체계적, 조직적으로 기초학력부진 학생들의 학습코칭을 하고 있다.
학력 향상 사업과 관련된 학습종합클리닉센터에서는 비교적 체계적, 조직적으로 학습코칭을 활용하고 있다. 시도교육청에서 운영하는 학습종학클리닉센터에서는 학습코칭단을 두어 센터나 학교 현장을 방문하면서 기초학력부진 학생들을 지도하고 있다. 다음은 교육부와 인천시교육청의 지원을 받는 북부학습종합클리닉센터의 학습코칭단에 대한 뉴스 보도이다. 그러나 이 보도에서도 알 수 있듯, 학습종학클릭닉센터의 학습코칭단은 주로 전문 상담사로 구성이 되며, 인지․정서․행동 등 기초학력부진에 대한 다양한 요인을 진단․분석하지만 주로 기초학력부진 학생들의 정서적인 안정과 발달에 대한 지원을 하고 있는 것으로 보인다.