국가 전략과학기술 개발 부문에서 이명박 정부는 국정과제와 정책과제의 연계성이 낮고 기존 정책의 지속 비율이 높은 정책 이행 패턴을 보였다. 성과 면에서는 각 정책의 세부과제 간 격차가 크게 나는 등의 모습을 띠었다.
이명박 정부가 제안했던 국정과제에서는 국가 전략과학기술 개발 부문은 융합 신기술을 비롯한 일부 과학기술 분야에 대한 기술개발 지원을 논의하였을 뿐이며, 그 결과 전반적인 정책과제와의 연계성은 낮고 기존 정책이 지속되는 비율은 높은 정책 이행패턴을 보이게 되었다(제17대 대통령직 인수위원회, 2008, p.4). 이 기간 동안 추진되었던 성장 동력 발굴 사업의 경우 “기존의 기술개발 사업과의 연계 방안, 연구개발활성화와 관련된 중장기 계획의 부재 등으로 인해 다소 미흡(교육과학기술부, 2013,pp.68-75)”한 성과를 거둔 것으로 평가되었다. 주력 산업 육성과 거대 국책 연구개발사업의 각 세부과제별로 매우 우수한 성과와 매우 미흡한 정책과제들이 공존하는 양상을 보였다(지식경제부, 2013, pp.89-126)