두 번째 위험은 잘못 설계된 공론화 방법과 공론화 프로그램이 진행되지 않는 것이다. 극복하기 위해 관련 전문가(기술, 소통전문가)의 참여 하에 사전 연구 진행, 공론화 프로세스를 설계해야 한다.
두 번째 위험 요소는 잘못 설계된 공론화 방법과 공론화 프로그램의 진행이 원활하게 이루어지지 않는 것이다. 이를 극복하기 위해서는 공론화 프로세스를 설계하기 이전에 관련 정책의 이해관계자 및 전문가를 대상으로 사전 연구 및 조사가 이루어져야 하고, 이를 바탕으로 프로세스 전문가나 기관, 혹은 갈등관리 전문기관이 참여 프로세스를 설계해야 한다. 공론화 과정은 일반적 상식에서부터 전문지식에 이르기까지 다양하고 폭넓은 대화나 토론을 통하여 진행되므로 방사성폐기물 관련 과학기술 전문가뿐만 아니라, 커뮤니케이션 전문가의 적극적 개입도 필요하다. 매 공론화 프로세스 진행 시 마다 요소에 적합한 전문가가 개입함으로써 이러한 위험을 최소화할 수 있다.