1960년 5,16 쿠데타 이후 정부는 노동조합 조직을 산업별로 재조직하였으며 개정된 노동조합법에서는 단체협약 체결단위에 관한 조항 등이 삭제되고 신고의무 부여나 교섭 권한에 대한 범위도 수정되었다. 
1960년 5.16 쿠데타 이후 정부는 기존 노조를 해체한 뒤 노동조합 조직을 산업별로 재조직하였는데, 1963년 개정된 노동조합법(1963.4.7.)에서는 노조 조직형태에 관한 제약은 발견되지 않는다. 공장․사업장 기타 직장으로 제한하였던 단체협약 체결 단위에 관한 조항과 제정법 시행령에 명시되어 있던 단위노동조합 정의규정을 삭제하였다. 대신 개정법에서 설립신고를 할 수 있는 노동조합을 전국 규모, 지역별 또는 기업별로 나누어 모두 허용하였다. 또한 산별노조 산하 지부에게도 신고의무를 부여하였다. 교섭 권한에 대해서는 노동조합 대표자 또는 노동조합으로부터 위임을 받은 자는 물론 “전국적인 규모를 가진 노동조합의 산하 지부의 대표자”(제33조2항)를 포함하였다.