현재 BTL사업 주무관청 담당자 및 운영사의 이해 및 능력 부족, 역할 상의 어려움으로 인한 여러 문제가 발생하고 있다. 따라서 운영개시 이전에  주무관청 담당자와 운영사 모두 빈틈없이 준비할 수 있도록 BTL사업 운영 관련 교육프로그램과 매뉴얼을 작성하여 제공하여야 한다.
마지막으로 운영개시 이전에 주무관청의 BTL사업 담당자에 대한 교육을 통해 성과요구수준서 등에 대해 명확하게 습득케 할 필요가 있으며, 운영주체와 사업시행자간의 업무범위를 포함하는 BTL운영 매뉴얼을 작성하여 제공할 필요가 있다. 주무관청의 담당자가 시설유지관리에 관한 운영사의 역할의 범위를 명확히 알지 못하고, 전문적이고 다양한 내용을 담고 있는 성과요구수준서 및 실시협약서에 대하여 충분히 이해하지 못하는 경향이 있기 때문이다. 또한 BTL사업의 사업시행자는 건설사, 시공사, 재무적투자자와 운영사로 구성되는데, 이중 운영사는 영세하여 건설사에게 종속적인 입장이고 사업초기의 사업계획서 작성과정에 능동적으로 참여하기가 어렵다. 이로 인해 운영사도 성과요구수준서 및 협약서의 내용을 제대로 파악하지 못하고, 시설관리체제에 대한 면밀한 준비가 부족하여 미리 예측하지 못한 상황에 대한 대응능력이 부족한 것으로 나타나고 있다. 따라서 주무관청 담당자와 운영사 모두 운영개시 이전에 면밀한 준비를 할 수 있도록 BTL사업 운영 관련 교육프로그램과 매뉴얼을 제공할 필요가 있다.