스마트워크의 장애요인은 정보시스템, 조직구조 및 운영체계, 법제도, 조직문화로 나눌 수 있다. 구체적 요인으로 분석과 관련 가이드라인의 미흡, 기존의 조직문화와 상이한 것이 지적되었다.
스마트워크 장애요인 분석에서 정보시스템 상의 장애요인, 조직구조 및 운영 체계 상의 장애요인, 법제도상의 장애요인, 조직문화상의 장애요인에 대해 정보시스템상의 장애요인은 정보보안의 문제점이 인식 강도가 가장 높게 나타났다. 조직구조 및 운영체계 상의 장애요인은 첫째, 스마트워크에 적합한 직무에 대한 분석이 이루어지 않은 상태에서 복무 및 성과관리의 현실성이 부족하다는 문제점이 제기되었다. 법제도 상의 장애요인은 스마트워크의 구체적인 실 행 가이드라인 및 관리지침 정비가 미흡한 것이 가장 큰 장애요소로 지적되었다. 조직문화상의 장애요인은 대면 중심의 문화 및 통제적인 조직 문화가 강하게 부정적으로 작용하는 것으로 나타났다.