2016년 7월, 2015년 1주기 평가 이후 대학 개선 노력 및 실적 점검이 이뤄졌다. 점검 결과에 따라 2017년 정부 재정지원제한 해제 여부나 범위 관련 조치가 이뤄졌다.
2016년 7월에는 2015년 1주기 평가 이후 대학의 개선 노력과 실적을 점검하였다. 점검 결과에 따라 2017년 정부 재정지원제한 해제 여부나 범위에 대한 조치가 이루어졌다. 66개 대학 중 상시 컨설팅 대상인 5개 대학을 제외한 61개 대학을 대상으로 대학별 이행과제나 세부이행과제에 대해 추진계획의 충실성, 이행실적과 이행실적의 지표 개선 효과 등에 대한 점검을 실시하였다. 점검결과가 우수한 대학에 대해서는 1주기 평가 결과 이들 대학에 주어졌던 재정지원 제한의 전부 또는 일부가 해제되었다. 이행점검 결과가 미흡한 일부 대학의 경우에는 재정지원 제한이 유지되거나 강화되었다.