유럽사법재판소는 2014년 4월 8일 이 지침은 유럽연합 기본권헌장 제7조와 제8조를 위반하여 무효라고 판결하였다. 먼저 보관된 데이터의 보호에 관한 절차적 요건이 없다는 것과 데이터 저장과 접근에 대한 실질적 제한이 부재하다는 것이 이유이다.
유럽사법재판소는 2014년 4월 8일 이 지침은 유럽연합 기본권헌장 제7조(사생활존중권)와 제8조(개인정보보호권)를 위반하여 처음부터 무효라고 판결하였다. 첫째, 지침은 데이터보관에 관한 규정만을 포함하고 보관된 데이터의 보호와 접근에 관한 절차적 요건이 부재하다. 보관된 데이터에 대한 접근이 감독기관이나 독립 관청으로 통제받고 있지 않으며, 직업상 비밀유지를 위한 면제 조항도 없다. 둘째, 지침은 데이터 저장 및 접근에 대한 실질적 제한이 부재하다. 광범위한 데이터보관은 거의 모든 유럽인들의 기본권을 침해하기 때문에 절대적으로 필수적인 경우로만 제한되어야 하며, 만일 사람들이 직접적이든 간접적이든 적어도 중대한 범죄와 연관되어 있지 않다면, 이들 데이터의 저장은 적정하지 않다. 효과적인 범죄 대응의 차원에서도 광범위한 저장은 필요하지 않다. 중대범죄의 정의나 보관 기간의 정의가 광범위한 점도 비판받았다.