선행연구에서 체계적인 프로그램 예산제도 평가 연구는 없다. 2013 한국 행정연구원의 평가 연구 시 2007년 도입된 '프로그램 예산제도'를 사용했다. 담당자 인터뷰 및 사례분석을 실시하고 평가모형 설문조사를 실시해 평가했다.
프로그램 예산제도에 관한 선행연구들은 프로그램 예산제도의 문제점들을 규명하고 개선방안을 일부 논하고 있지만, 체계적으로 프로그램 예산제도를 평가하는 연구는 없다. 프로그램 예산이 기존 투입중심의 예산 운용을 프로그램 및 성과중심 예산운영의 패러다임으로 전환하는 기대효과를 달성하고 있는지 평가할 필요가 있을 것이다. 한국 행정연구원에서는 2013년 기본과제로 프로그램 예산제도에 대한 평가에 관한 연구를수행하였는데, 2007년에 노무 현 정부에서 도입된 ‘프로그램 예산제도’를 주된 범위로 하고 있다. 기획재정부의 예산총괄과 관계자, 재정사업 평가 담당자 등을 인터뷰하고, 성과계획서 및 성과보고서, 예산서 및 결산서의 프로그램 예산 현황 등에 대한 사례분석을 실시하였으며, 평가모형을 설정하여 설문조사를 실시함으로써 프로그램 예산제도에 대한 평가를 시도하였다.