특정무역현안에 관하여 회원국이 안건 포함을 요청할 때 사무국에 SPS통보국과 교환한 서한 사본을 보내거나 SPS통보국에 사무국에 제출한 요청서 사본을 보내기도 한다. 특정무역현안의 안건으로 SPS 위원회 의장은 이를 제기한 회원국과 그밖의 회원국들, 문제되는 방법을 시행하는 회원국 순으로 발언권을 주며 논의는 보고서와 개정본에 기록된다. 
실무에서는, 회원국들은 특정무역현안을 위원회 회의의 안건 항목으로 포함시켜 줄 것을 요청할 때에 그 회원국이 SPS통보 국과 사전에 교환한 서한의 사본을 사무국에 제출하기도 하고 반대로 그 회원국이 특정무역현안을 회의 안건 항목으로 포함 시켜 줄 것을 요청한, 사무국에 제출한 요청서의 사본을 이후 SPS통보국에게 송부하기도 한다. SPS통보국이 적절히 공지를 받았는지가 명확하지 않은 경우, 사무국은 SPS통보국에게 그러한 내용을 알리도록 특정무역현안 요청회원국을 상기시킬 수 있다. 그러나 요청회원국이 특정무역현안의 개괄적인 내용을 명확하게 제시하지 않는 경우도 적지 않다. 특정무역현안이 안건으로 있는 동안, SPS 위원회 의장은 우선 특정무역현안을 제기한 회원국에게 발언권을 주고, 이후 해당 문제에 관해 의견제시를 희망하는 그 밖의 회원국들에게 발언권을 주며, 마지막으로 문제된 조치를 시행하고 있는 회원국에게 발언권을 부여한다. 또한 모든 회원국은 해당 특정무역현안에 관하여 보다 구체적인 정보를 포함하는 문서를 위원회 회의 이전 또는 중간에 회람시킬 수 있다. 특정 무역현안에 관해 위원회 회의에서 이루어진 논의는 위원회 회의 보고서에 요약되어 기록되며, 특정무역현안 문서의 개정본(G/SPS/GEN/204/Rev.)에도 수록된다.