학교스포츠클럽의 운영은 특정 활동으로 쏠리는 현상과 운영상 혼란으로 교사들은 걱정을 하지만 체육교사들은 학생들의 활발한 신체활동이 긍정적이나 문제 등에 대한 보완 방안이 필요하다고 하였다.
학교스포츠클럽 활동을 바라보는 시각은 대상에 따라 차이를 보이고 있다. 우선 교사들 입장에서 학교관리자나 일반교과 교사들은 창의적 체험활동으로 대부분 학교스포츠클럽을 운영하기 때문에 창의적 체험활동에서 이수할 내용이 어느 특정 활동으로 치우치는 현상이 발생하고, 학교스포츠클럽 활동을 일괄적으로 시행하면서 학교교육과정의 운영상에 혼란스럽다며 우려를 하고 있다. 체육교사들은 학생들이 보다 많은 신체활동을 할 수 있다는 점에는 원칙적으로 찬성하고, 학교교육 현장에서 스포츠 활동이 활발하게 이루어지는 것은 긍정적인 방향이지만, 운영상의 많은 어려움과 문제점이 나타나고 있으므로 이 문제에 대해서는 보완할 방안이 마련되어야 한다는 입장이다.