미인가 대안교육 시설의 양질의 교육을 담보하기 위해서는 국가적으로 관련 법규 제정과 등록제 실시로 기관에 대한 관리  및 차등화 된 재정 지원이 이루어 져야 한다.
넷째, 미인가 대안교육 시설 운영과 관련하여 살펴보자. 현재 비인가 대안교육 시설은 전국에 몇 개가 있는지 정확히 알 수 없는 상황이다. 학업을 중단한 학생의 경우, 비인가 대안교육시설에서 교육을 받고 있는 경우는 학교 밖 청소년의 상황에 비추어 보았을 때 매우 안전하고 양질의 교육을 받고 있는 편이다. 이제는 국가적으로 비인가 대안교육 시설 관련한 법규 제정 및 재정적 지원이 이루어질 때라고 본다. 등록제를 실시하여 전국적으로 비인가 대안교육시설에 대한 정확한 파악이 먼저 이루어져야 한다. 그리고 비인가 대안교실 시설에 다니는 학생들의 교육의 질을 담보하기 위해서는 기관에 대한 최소한의 관리 및 차등화 된 재정 지원이 필요하다.