성공불융자 지원을 비판론자들은 융자 지원이 불필요한 투자나 유망한 사업을 우선지원을 조장할 수 있다고 본다. 성공불융자 지원이 민간 기업의 자생력을 헤친다는 것이다.
하지만, 성공불융자 지원에 대한 비판론자는 정부의 융자지원이 불필요한 탐사 사업 투자를 조장할 수 있는 도덕적 해이 가능성이 나타난다거나 융자지원의 실패에 따른 (감면액의 증가) 우려 때문에 성공 가능성이 높은 프로젝트나 분명한 성과를 보일수 있는 프로젝트에 주로 지원금을 제공하려는 역차별적 문제가 야기될 수 있다고 지적하고 있다. 즉, 프로젝트를 내부 자금 조달이나 외부 투자 자금 유입으로도 추진할 수 있는데도 정부의 성공불융자 지원으로 인해 오히려 과대투자 유입을 초래해 민간 기업의 자체 투자 잠재력을 위축시키거나 소극적으로 만들 수 있다는 점도 간과해서는 안 된다는 것이다.