국가전략 프로젝트 사업은 과학기술계 의견 등을 취합하여 최종지원 내용을 확정하였다. 미래창조과학부의 5개 프로젝트에 대한 예비타당성조사를 한국과학기술기획 평가원에서 수행한다.
국가전략 프로젝트 사업은 2016년 5월 제1차 과학기술 전략회의(대통령 주관)에서 추진을 결정한 후 과학기술계 의견 등을 취합하여 2016년 8월 제2차 전략회의에서 최종 지원 내용을 확정하였다. 미래창조과학부는 전체 9개 프로젝트 중 5개를 대상으로 2016년 7~8월에 예비타당성조사를 위한 사전 기술성 평가를 진행하였으며, 2016년 10월 현재 미래창조과학부가 주관하는 ｢인공지능｣ 프로젝트를 포함하여 ｢스마트시티｣, ｢자율주행차｣, ｢경량소재｣, ｢정밀의료｣ 등 5개 프로젝트에 대한 예비타당성조사를 한국과학기술기획평가원에서 수행하고 있다. 미래창조과학부는 국회의 예산 심사가 종료되기 이전에 예비타당성조사 결과가 나올 경우 2017년 예산에 반영하도록 요청할 수도 있다는 입장이다.