학습모듈을 활용한 수업은 수업의 진행은 더디지만 학생들의 참여도 및 학습태도, 성취도를 높일 수 있다는 장점이 있다. 다만 수업내용을 교사들이 별도로 학습해야 하거나 학생들의 내용이해도가 낮아지는 등 저효율의 가능성도 있다.
학습모듈을 활용한 수업의 장점 중 하나는 학생들의 수업 참여도가 높다는 것이다. 교사의 수업 진행시 학생 스스로 포트폴리오를 작성하면서 계획, 실행, 성과확인 등을 진행하게 되므로 수업의 진행 정도는 느리지만 참여도는 높아지게 된다. 하지만 학습모듈상의 내용이 생소한 분야일 경우에는 가르치는 교사들이 먼저 학습을 해야 하고, 가르치는 방향 및 교육방법 등이 처음 실행되는 내용이므로 학생들이 학습모듈의 내용을 이해하는데 효율성이 떨어질 수 있는 단점도 생길 수 있다. 그럼에도 불구하고 학습모듈을 활용한 수업은 기존의 결과 위주 평가 방식인 지필고사와 기능사 시험 위주의 평가에서 벗어나 학습 과정(계획, 실행, 결과)이 평가에 반영될 수 있는 다양한 방식(포트폴리오, 체크리스트, 작업장 평가)이 제공되므로 학습태도 및 성취도가 높아지는 경향을 보이게 된다.