사업시행자 등이 대출기관 등으로부터 금전채무 및 대출로써 기금의 부담으로 보증할 수 있는데, 기금의 보증료는 시행령에 ㄸ라 가능하며 차등 적용 가능하고, 신용보증 신청 후 신용조사에 따라 보증서를 발급받는다.
사업시행자 등이 대출기관 등으로부터 민간투자사업자금의 대출, 급부 등을 받음으로써 부담하는 금전채무, 사회기반시설채권을 발행함으로써 부담하는 금전채무 및 그 채권의 원리금 지급을 위한 대출 등을 받음으로써 부담하는 금전채무를 기금의 부담으로 보증할 수 있다. 기금의 보증료는 민간투자법 시행령에서 정한 연율 100분의 1.5범위 내에서 가능하며, 민간투자기본계획에 보증료 기준에 따라 차등 적용할수 있다. 사업시행자는 기금에 대해 보증상담을 거쳐 신용보증을 신청할 수 있으며, 관리기관은 신청자에 대하여 신용조사를 실시한 후 신용보증 약정을 체결하고 신용보증서를 발급한다. 또한 산업기반신용보증기금은 지방자치단체 등에 대한 민간투자제도 교육, 지역 중소업체에 대한 무료 금융자문 및 주선서비스 등을 제공할 수 있다.