대학교육 이원화 과정의 장점에도 불구하고 학생들은 이 교육을 받는 것을 고심하고 있는데, 이는 이론과 실무를 병행해서 진행해야 하기에 부담이 크기 때문이다. 또한 전공 분야가 제한되어 있고 신청 절차도 엄격하다.
대학교육 이원화 과정의 많은 장점에도 불구하고 학생들은 이원화 대학교육을 받는 것을 고심하고 있다. 이론과 실무를 병행해서 진행하여야 하기 때문에 학업기간 내 쉬는 기간이 거의 없어 정신적으로 신체적으로 부담이 크기 때문이다. 또한 기업의 재정적인 지원은 보통 졸업 후 그 기업에 취업을 해야 하는 조건으로 제공되고 있어, 기업에 종속될 수 있다는 문제도 있다. 그리고 이원화 대학교육 과정의 학생은 이미 직업이 정해졌다고 볼 수 있으므로, 본인의 관심사를 여러 분야에서 시도해 볼 수 있는 기회가 일반 대학교육 학생들보다 적다. 더불어 이원화 대학교육 과정이 제공되는 전공 분야가 제한되어 있고 입학 정원도 매우 적어 이원화 대학교육 과정에 대한 학생들 사이의 경쟁도 존재하며, 직업교육 자리에 대한 신청 절차도 엄격하다.