우리나라의 산업단지는 정부가 계획해 왔으며, 이를 집행하기 위한 관리기관이 필요했다. 이 기관은 초기 수동적으로 공간을 관리하는 역할에서 지역 전체를 포괄하는 지역혁신클러스터에 대한 관심이 높아지며 점진적으로 적극적인 역할이 부상되었으며 공간적 관리를 뛰어넘는 혁신클러스터 관리가 중요해지며 혁신관리조직이 설치되었다.
이렇게 우리나라의 산업단지 조성은 정부가 주도하여 건설초기부터 장기적인 산업발전전략에 입각하여 계획되었으며, 이를 추진하기 위하여 다양한 지원정책이 수립되었다. 이를 집행하기 위하여 산업단지의 조성과 운영을 담당할 관리기관이 필요했다. 이러한 관리기관의 설치는 산업단지의 조성과 운영을 효율적이고 합리적으로 하는데 기여했다. 특히, 산업단지 관리기관은 산업단지 조성 이후 주요 입주기업의 분양 유치와 입주기업에 대한 지원이 산업단지 조성의 원래 취지에 적합하도록 유지함으로써 공적 자금이 투입된 산업단지가 국가경제에 기여하도록 하는 역할을 한다. 나아가 산업구조가 고도화되며, 산업단지 조성보다는 혁신클러스터 조성에 정책적 비중이 옮겨가며 수동적으로 공간을 관리하는 역할에서 입주 기업의 기업활동을 포괄적으로 지원하는 적극적인 역할이 부상되었다. 즉, 산업단지의 혁신역량 제고를 통한 입주 기업의 경쟁력 강화가 새로운 역할로 부상된 것이다. 또한 이러한 전통적인 산업단지의 관리와 함께 산업단지를 넘어서 지역 전체를 포괄하는 지역혁신클러스터에 대한 정책적인 관심이 높아짐에 따라 공간적 관리를 뛰어넘는 혁신클러스터 자체의 관리가 중요해지게 되었고, 이를 위하여 지역별 혁신관리조직이 설치되었다.