디지털교과서 사용을 꺼리는 이유에 대해 교사는 디지털교과서에 대한 이해도와 활용 능력의 부족, 효과적인 활용을 위한 수업 사례, 교사용 지도서 등 디지털 교과서 수업 지원 체계가 부족하다는 의견을 냈다. 
부족함을 핵심어로 분석한 결과, 교사는 디지털교과서에 대한 이해도 및 활용 능력의 부족과 디지털교과서의 효과적인 활용을 위한 수업 사례, 가이드, 교사용 지도서 등 수업 지원 체계의 부족을 문제로 꼽았다. 연구학교 면담을 통해 디지털교과서를 사용하는 것에 부담이나 두려움을 가진 교사들이 있음을 알 수 있었는데, 고경력 교사인 경우는 특히 새로운 수업 환경에 적응하는 것을 부담스러워 했다. 그래서 디지털교과서가 적용되는 학년을 맡는 것을 기피하는 현상도 있었다고 한다(C초등학교, 2014. 5. 28). 디지털교과서에 대한 부담감은 사용 방법을 익히는 데 따른 어려움도 있지만, 어떻게 활용하여 수업을 이끌어가야 하는가에 대한 충분한 안내가 없는 점과, 단말기를 활용하여 수업을 진행해야 하고 문제 발생 시 적극적으로 대처해야 하는 것도 하나의 부담으로 작용하는 것 같았다. 이에 대해 D중학교의 교사는 다음과 같이 언급했다.