통일교육에 대한 관심이 높아지면서 통일부가 추죽으로 통일부 교육부 각 시도 교육청간의 업무협약 체결등 통일교육 유관기관 간 업무협약을 강화하고 있다. 협력내용은 매년 학교  통일교육 실태조사 공동실시, 통일교육주간등 다양하다. 중앙부처 및 교육청 외에도 통일교육협의회 산하기관 및 민간단체에서도 청소년을 대상으로 한 통일교육을 실시한다.
최근 통일교육에 대한 관심이 고조되면서 통일부가 주축이 되어 통일부-교육부-각 시･도교육청 간의 업무협약 체결 등 통일교육 유관기관 간 협력을 강화하고 있다. 통일부와 교육부는 학교통일교육 활성화를 위해 2014년 5월에 업무 협약을 체결하였다(교육부･통일부, 2014. 5. 26). 주요 협력 내용은 매년 학교 통일교육 실태 조사 공동 실시, 교원 사이버 연수 콘텐츠 공동 사용, 통일 대비 미래세대 교육프로그램 개발･보급, 통일교육 주간 ‘계기교육’확대 실시, 자유학기제 프로그램 지원 등이다. 학교통일교육 내실화 및 청소년 통일의식 함양을 위해 통일부는 통일교육 콘텐츠 제공, 교원연수 강화, 체험교육 장소 제공, 교육부는 통일교육 비중 및 시수 확대(8시간 이상 권장), 교육청은 교과 및 창의적 체험활동 통일교육 시수 준수, 교원연수원 교육과정 개설 등을 담당하였다. 중앙 부처 및 교육청 이외에도 통일교육협의회 산하 기관 및 기타 민간단체에서도 청소년을 대상으로 한 통일교육을 실시하고 있다. 2011년 이후 통일교육원과 지방자치체 및 민간 교육기관간의 업무협약 체결이 증가하였다. 2014년 6월 현재 경기도, 지방행정연수원, 한국교총, 한국방송공사, 한국방송통신대학, 서울대 인문대학, 숭실대학교 등 총 14개 기관과 업무협약이 체결되어 있다(조정아, 2015).