재생에너지 발전설비에 직접 장치를 설치해 수소를 생산할 시 기회비용이 발생하므로 현행 정책 하에서는 수전해 수소생산 확대가 어려우며 향후 재생에너지 전기 관련 보상을 확대한다면 위축은 불가피하다.
경제적 측면에서 태양광, 풍력 등 재생에너지 발전설비에 직접 수전해 수소 생산 장치를 설치하여 수소를 생산할 경우 재생에너지 전기의기회비용을 무시할 수 없다. 이는 재생에너지 전기에 대해 계통한계가격(SMP)와 함께 가중치 적용 신재생에너지 공급인증서(REC) 가격까지 보상을 해주는 현행 재생에너지 확대 정책 기조 하에서는 수전해 수소생산 확대가 어려울 수 있음을 의미한다. 더욱이 제3차 에너지기본계획을 통해 천명한 바와 같이 2040년 재생에너지 발전비중을 30~35%까지 확대를 위해 만일 인센티브 제공 차원에서 재생에너지 전기에 대해 더 많은 보상이 이루어질 경우, 재생에너지 연계 수전해 수소 생산의 손익분기점 상승으로 이어져, 위축이 불가피해진다.