대·중소기업상생협력기금에서 기금의 활용에 대한 관리가 체계적으로 이행되고 있다고 보기 어렵다. 따라서 기금의 운용내역에 대한 관리 강화와 함께 기금 활용으로 인해 대기업과 협력사의 상생협력 수준이 높아졌는지 평가가 있어야 한다.
대·중소기업상생협력기금은 2011년부터 현재까지 기금을 모집하고 활용하는 업무를 수행하고 있다. 기금모집과 관련한 내역은 기관의 존속여부와 직결되는 부분이므로 상대적으로 체계적인 관리체계를 갖고 있다고 파악된다. 반면, 기금의 활용 측면에서는 체계적인 관리체계를 갖고 있지 못한 것으로 판단된다. 해당 관리체계는 앞서 논의한 사전심사 및 사후관계 평가 이전에 기금운용기관으로서 필수적으로 갖추어야 하는 체계임에도 불구하고, 해당 내역이 효과적으로 관리되지 못하는 것으로 나타났다. 일부 사례에서 수혜기업의 담당자 연락처마저 체계적으로 관리하지 못하고 있는 경우가 있다는 점을 고려할 때, 기금 활용에 대한 관리가 체계적으로 이행되고 있다고 보기는 어렵다고 판단된다. 따라서 기금의 운용내역에 대한 데이터베이스 구축 등 관리 강화와 함께 기금 활용으로 인해 대기업과 협력사의 상생협력 수준이 높아졌는지 지속적으로 평가해야 한다.