김정은은 군 조직을 개편하여, 지휘체계를 일원화하고 다종화된 타격력을 제고하려 하며 공군을 개편하여 핵시설 보호를 높이려 노력하고 있다. 이는 한미 동맹의 1차 공격으로부터 핵과 미사일 시설을 보호, 2격 능력의 생존성 강화를 위한 것이다.
김정은은 핵무기 능력의 고도화에 따라 군 조직도 개편하고 있다. 북한은 탄도미사일 전력 운용을 담당하던 미사일지도국을 2012년 전략로케트사령부로 확대개편하였고, 2014년부터는 육･해･공군과 동격의 제4군종으로서 전략군을 창설하였다(국방부, 2016, p. 23). 전략군 신설 및 체계화는 중국의 ‘제2포병’과 유사하게 다양한 미사일부대를 통합하여 지휘체계를 일원화하고, 핵의 소형화, 경량화를 통해 다종화된 타격력을 제고하기 위한 노력으로 평가된다(통일연구원,2015). 나아가, 북한은 2012년 5월 공군을 ‘항공 및 반항공군’으로 개편하여 핵시설 보호 전력 증강을 시도하고 있다. 제7차 당 대회에서도 북한은 재차 ‘반항공전력’의 중요성을 언급하면서 대공방어 능력을 강화하는 등 한미동맹의 1차 공격으로부터 핵과 미사일시설을 보호하여 2격 능력의 생존성을 강화하는 데 정성을 쏟고 있다(김동엽, 2016. 5. 20).