주니어하이스쿨의 목적 중 하나는 초등교육과 중등교육간 분절을 개선하는 것으로서 초등학교와 고등학교 교육간 연계, 학교급 간 이동을 지원하는 교육이다.
넷째, 초등학교와 고등학교 교육간 연계, 학교급 간 이동(transition)을 지원하는 교육이다. 이는 주니어하이스쿨의 목적을 5가지로 제시한 Lounsbury(1956)도 언급한 바 있다. 이에 의하면, 주니어하이스쿨의 목적 중 하나는 중간 단계(intermediate step) 교육기관을 도입함으로써 초등교육과 중등교육간 분절(articulation)을 개선하는 것이다(Hunt et al., 2014: 5-6 재인용). 청소년 전기 아동들은 초등에서 중학교로, 또 중학교에서 고등학교로 두 번의 학교 이동을 하게 된다. 중학교 교육에서는 학교급간의 이동, 연계를 유연하게 하기 위한 다양한 교육 프로그램, 활동이 요구되며, 이러한 학교급간 연계 활동으로는 정보 제공, 학교 방문 기회 제공을 들 수 있다. K-8, 6-12학년 학교와 같이 학생들이 동일한 학교 내에서 상급학교로 진학하는 경우에도 학교는 학생의 이동을 유연하게 하기 위해 다양한 활동을 제공한다.