인권영향평가는 다양한 층위의 소수자에 대한 인권 침해를 예방하는 도구다. 성별영향평가가 성별에 따른 차별을 예방하듯이 인권영향평가는 인권침해를 예방할 수 있다. 국가인권위원회법령에는 인권침해에 대한 내용이 열거되어 있다. 하지만 법과 정책의 입안 과정에서 차별적 요소를 충분히 제어할 수 있는 체계는 미흡하다. 인권영향평가는 사전평가를 통해 법과 정책에 있어 차별적 요소가 있는지 파악하여 예방하여, 소수자의 인권보장을 위한 도구로 사용될 수 있다.
세 번째 특징적 요소는 다양한 층위의 소수자에 대한 인권 침해를 예방하는 도구라는 점이다. 성별영향평가가 성별에 따른 차별적 요소를 갖는 법과 정책을 사전적으로 예방하는데 큰 기여를 하고 있다는 점에서 볼 수 있듯이 인권영향평가는 다양한 층위의 소수자에 대한 차별과 인권 침해를 사전에 예방하는 역할을 수행할 수 있다. 국가인권위원회법 제2조 제3호는 성별뿐만 아니라 “종교, 장애, 나이, 사회적 신분, 출신 지역, 출신 국가, 출신 민족, 용모 등 신체 조건, 기혼ㆍ미혼ㆍ별거ㆍ이혼ㆍ사별ㆍ재혼ㆍ사실혼 등 혼인 여부, 임신 또는 출산, 가족 형태 또는 가족 상황, 인종, 피부색, 사상 또는 정치적 의견, 형의 효력이 실효된 전과(前科), 성적(性的) 지향, 학력, 병력 (病歷) 등을 이유로 한” 합리적 근거 없는 우대, 배제, 구별, 불리한 대우를 평등권 침해의 차별행위로 규정하고 있다. 하지만 여전히 법과 정책의 입안 과정에서 이러한 차별적 요소를 충분히 제어할 수 있는 체계는 구축되지 않은 상황이다. 특히 차별판단의 핵심이라고 할 수 있는 합리성에 대한 판단은 우선 자의적 결정에 대한 배제(자의금지원칙)에서 출발하며 결국 자의적 결정의 배제는 법과 정책에 대한 다양한 시각의 평가를 통해 이뤄질 수 있는 것이다. 이러한 다양한 시각의 평가를 제도화하는 인권영향평가는 법과 정책에 있어 차별적 요소가 존재하는지를 사전에 평가하여 평등권의 실현에 기여하고, 소수자에 대한 인권 침해를 예방할 수 있을 것이다. 한 국가의 인권 실현 정도는 다수자의 권리 보장보다는 소수자의 권리 보장 수준과 밀접하게 연 관되어 있다. 그리고 민주적 정치과정에서 소수자는 다수자와 비교할 때 상대적으로 약한 대표성을 가질 수밖에 없다. 이러한 점에서 소수자의 인권 보장을 위한 도구로써 인권영향평가의 도입이 필요하다고 할 수 있다.