지지부진하던 공무원 인사 전자관리가 1999년 본격 추진되었다. 이어 전자인사 관리시스템은 2000년 10월 1단계를 시작하여 2003년 총 3단계 진행을 완료하였다.
공무원 인사의 전자적 관리 필요성과 추진방향 등에 대해선 이전부터 거론이 되어왔으나 여러 가지 여건상 채택이 되지 못하다가 1999년 인사개혁을 담당하는 중앙인사위원회가 출범하면서 이듬해 7월 한국전산원 정보화 지원사업정책지원과제로 선정, 본격 추진되었다. 이어 2000년 10월 전자인사 관리시스템(PPSS: Personnel Policy Support System) 구축사업을 효과적으로 추진하기 위한 ‘인사정책지원시스템추진단’이 발족되었고, 이듬해 5월 17일 전자정부 구현을 위한 11대 중점 과제 중 하나로 선정되어 3단계로 진행되었다. 제1단계는 2000년10월부터 2001년 9월 말까지 전자인사 관리시스템 프로그램 개발과 기획예산처를 비롯한 농림부, 농촌진흥청, 중앙인사위원회 4개 부처를 대상으로 한 시범 적용이 이루어졌고 시범 적용을 통해 검증된 시스템은 전 중앙부처에 보급되었다. 2002년도에는 제2단계 사업으로 31개 중앙부처에 전자인사 관리시스템 프로그램을 우선 보급하였고, 2003년도에는 제3단계로 16개 부·청·위원회 등 나머지 기관에도 보급을 완료하였다.