자영업자는 우리나라의 사회보장제도인 사회보험, 공공부조, 사회서비스의 혜택을 제대로 받지 못하는것으로 나타났다. 그들은 사회보험에서 제도적으로 배제되었다. 공공부조에서는 예산제약을 이유로 수급자규모를 통제해왔다.
우리나라의 사회보장제도는 크게 사회보험, 공공부조, 사회서비스로 구성된다. 사회보험에서 자영업자는 제도적으로 배제되거나 또는 상당수가 실질적으로 보호를 받지 못하고 있다. 근로자를 적용대상으로 하는 고용보험과 산재보험에서 자영업자는 의무가입대상에서 제도적으로 제외되어 있다. 반면 국민연금과 건강보험은 자영업자를 지역가입자로 분류하여 적용하지만, 특히 국민연금에서 보험료를 납부하지 않고 있는 납부 예외 문제가 심각하다. 공공부조에서는 취업상태 또는 종사상 지위와 무관하게 수급자를 선정하지만, 예산 제약을 이유로 수급자 규모는 적은 수준에서 통제되어 왔다. 개별급여체계로의 기초생활보장제도 개편에 따라 욕구별 현물급여가 근로빈곤층에게도 확대되었지만, 근로연령대 소득보장은 확충되지 않았다. 한편 소기업․소상공인 공제제도를 2007년부터 운영하고 있는데, 임의가입이며, 소득 공제 형태의 세제 지원이 있지만 납부부금에 연계된 공제금을 지급한다.