갈등으로 인한 사회적 비용은 다양하게 결정되는데 이는 손실비용 측정에 다소 난해함을 가져온다. 또한 사회적 파급효과에 대한 비용 이회의 편익측정도 어려워 파급효과와 갈등영향분석을 어렵게한다.
앞에서 살펴본 것처럼 갈등으로 인한 사회적 비용의 추정은 비용의 어느 측면에 초점을 맞추느냐에 따라 다양한 결과가 나올 수 있다. 대부분의 연구들은 경제적 측면에서의 손실에 초점을 맞추고 있지만 손실비용 산출이 추상적이거나 편협적인 경우가 많다. 또한 손실은 경제적 손실 외에 다른 유형적 ․ 무형적 손실도 많이 있으며 이를 모두 포함해서 비용추정을 하는 것은 더욱 어렵다. 더 근본적인 문제는 갈등으로 유발되는 사회적 파급효과를 파악하기 위해서는 비용뿐만 아니라 갈등의 긍정적 기능, 즉 편익도 같이 측정을 해야 하는데, 편익측정 역시 비슷한 어려움에 직면하게 된다. 이러한 요인들은 갈등으로 인한 사회적 파급효과, 즉 갈등영향분석을 어렵게 하는 원인이 되고 있다.