호주는 정권 변화에 따라 성인지예산에 부침을 겪었다. 1996년 보수당의 집권으로 성인지예산서는 비판에 직면했고 여성실의 예산 감소와 여성통계과 폐지 등 제도는 약화되었으며 관련 보고서 발간으로 전체 프로젝트가 축소되었다가 이마저도 2013년부터는 발행되지 않고 있다.
현재까지 호주의 성인지예산서는 집권정당에 따라 명칭이나 형식이 바뀌거나, 작성 자체가 단절되었다가 재개되는 등 부침을 겪었다. 1990년대 중반 정권의 변화와 함께 성인지예산에 대한 관심과 시행은 점차 쇠퇴하게 된다. 1996년부터 신자유주의적인 개혁을 표방한 보수당 정권이 집권하면서 성인지예산서는 비판의 대상이 되기에 이른다. 이로 인하여 1996년 여성실(Office of the Status of Women: OSW)의 예산이 대폭 감소되었고, 성인지예산서 작성의 기초 작업인 성별분리 통계를 담당하던 통계청 내 여성 통계과(Women’s Statistics Unit)가 폐지되는 등의 성인지예산 제도가 약화되는 과정을 거치게 된다. 1997년 이후 2000년 중반까지 호주 정부는 매년 여성정책 및 관련 예산에 대한 내용을 담은 간략한 보고서인 ‘Women’s Budget Highlights’를 발간하는 것으로 성인지예산 프로젝트가 축소되었으며 2013년부터는 해당 보고서도 발행되지 않는 것으로 파악된다.