혁신기업의 목표시장은 신흥시장 중에서 성장기에 있는 중간 규모의 틈새시장 발굴을 고려해야 한다. 혁신기업 제품의 소량 주문형 생산으로 적기 공급력을  발휘하려면 중간 규모의 틈새시장이 적합하다.
다음으로 혁신기업의 목표시장은 신흥시장 중에서도 성장기에 있는 중간 규모의 틈새시장 발굴이 용이한가를 판단할 필요가 있다. 중국, 인도, 인도네시아 등의 신흥시장은 혁신기업이 감당하기에 힘들 정도로 대규모 시장 규모를 가지고 있어 해당 시장을 단일시장으로 파악하는 형태의 목표시장 선택은 바람직하지 않을 수 있다. 특히, 혁신기업 제품의 장점인 소량 주문형 생산에 의한 적기 공급력이 발휘되기 위해서는 대량생산에 의한 규모의 경제 장점이 잘 작동하지 않는 중간 규모의 틈새시장이 적합하다. 표준 제품에 의한 대량 생산체제가 작동하는 성숙 분야는 해당 도시에 진출해 있는 대기업 중심의 글로벌화 압력이 강하고 틈새시장의 발굴이 어려워 혁신기업의 시장 진입이 쉽지 않다.