혁신활동의 고용효과는 지역의 경제구조와 특정 부문 전문화 여부에 따라 좌우된다. 교역재 부문의 고용은 주로 대도시에 한정되지만 공정혁신은 오히려 대도시에 부정적인 영향을 미칠 수 있다.
고용의 양과 질의 공간적 분포는 상이하고, 지역의 제도적․역사적 특성으로 인해 모든 근로자가 동일한 유연성과 이동성을 가지지는 못한다. 고소득 지역에 거주하는 근로자일수록 지리적 이동성이 상대적으로 높다(OECD, 2005). 혁신활동의 고용효과는 지역의 경제구조에 의존한다. 전술한 바와 같이, 사업서비스와 같은 교역재 부문에서 고용이 창출되는 경우 이는 주로 공간적으로 대도시에 한정되는 경향을 갖는다. 지역경제가 특정 부문에 전문화되어 있으며 제품혁신과 연관된 경우 일자리의 창출 능력이 제고될 수 있다. 하지만 공정혁신은 특히 대도시의 고용에 더욱더 부정적인 영향을 미칠 수 있다(Capello & Lenzi, 2013).