여성가족부와 법제처가 법제업무운영규정 시행규칙개정으로 성별영향분석평가 제도의 절차를 마련했다. 반면에 성별영향분석평가 제도의 중장기 계획은 추진 과제 수도 적고 차별성이 없다.
2012년~2013년 동안 제도를 추진한 결과 법령 성별영향분석평가는 활발하게 추진되고 있다. 여성가족부와 법제처가 법제업무운영규정 시행규칙개정(2012.1.4.)을 통해 정부가 법령을 제·개정하고자 할 때는 반드시 성별영향분석평가를 하도록 명시함으로써 분석평가를 반드시 해야 하는 절차상의 장치를 마련하였다. 반면 중장기 계획에 대한 성별영향분석평가는 그렇지 못한 실정이다. 추진 과제수도 적을 뿐 아니라(여성가족부, 2013, 2014b) 개선내용도 사업 성별영향분석평가 개선내용과 유사하여 중장기 계획 성별영향분석평가의 차별성을 구축하지 못하고 있다고 지적하기도 한다(손문금, 2014).