활동 규모가 커지고 넓어지면서 운영자들이 부담을 느끼고 있으며 운영상 비효율과 문제점도 생긴 것으로 분석됐다. 또 학교체육 활성화 세부 정책이 너무 다양해서 체육교사들이 시행하기 어려운 점들도 있어 정부 및 지역청 중심의 운영 전담기구가 필요하다고 생각된다.
교내 활동에서 더 나아가 교외 활동 및 대회 참여 등 활동 폭이 넓어짐에 따라 담당 교사 등은 지도상에 어려움이 있는 것으로 보고되었다. 또한, 운영자의 입장에서도 이러한 대규모 활동에 대한 운영 책임과 업무 부담의 증가로 힘들어 하고 있으며, 책임 있는 특정기구 또는 집단에 전담된 체계적인 운영이 되지 못함으로써 운영상의 비효율성과 문제점이 발생하고 있는 상황인 것으로 분석되었다. 더불어 학교체육 활성화 정책에서 시행하는 세부 정책 내용이 다양하고 많기 때문에 체육교과 관련 업무로서 각각의 정책에 필요한 역할의 업무 부담을 모두 갖게 되는 체육교사는 학생들에게 정책 투여를 통한 긍정적 교육 효과를 예측하면서도 집중하여 시행하기 어려운 상황에 처하게 되며 시행을 한다고 해도 질적인 면이 확보되기에는 현실적인 어려움이 있는 것으로 나타났다. 따라서 향후정책 수립 시에는 정부 및 지역청 중심으로 운영 전담 기구가 마련되어 운영 인력 지원과 효과적 운영을 도모할 필요가 있는 것으로 판단된다.