PD수첩이 불법 난자 사용 의혹을 제기하자 비난 글이 폭주했다. 국익 담론이 퍼지며 서울대 징계위원회의 조사 당시 팬클럽 회원 수는 12배 가까이 증가했다. 비이성적인 현상 속 지지 분위기는 사이버 공간에서 무르익었다.
황우석을 절대적 존재로 떠받드는 사회 분위기는 사이버 공간에서 고조되었다. PD수첩이 배아줄기세포 연구 중 불법 거래된 난자와 연구원의 난자가 사용되었다는 의혹을 제기하자, 각 포털사이트 게시판에는 PD수첩을 비난하고 황우석을 지지하는 글들이 폭주하였고, 황우석의 팬클럽 회원 수도 폭발적으로 증가하였다. 이성적으로 볼 때 황우석의 연구윤리 의혹이 불거진 시점부터 그에 대한 지지는 가라앉아야 하지만, 국익 담론이 들끓으면서 회원 수가 증가하는 역설적인 현상이 벌어졌다. 1만 명 정도였던 황우석 팬클럽 회원 수는 PD수첩 방영을 계기로 6만 명을 넘었고, 2006년 1월 서울대가 황우석 등 관련자들을 징계위원회에 회부할 무렵에는 약 12만 명에 달하였다. PD수첩 방영 당일 MBC 홈페이지에는 4000여 개의 비난 글이 게시되었다.