미래 학교교육은 학습자가 학습의 주체이기 때문에 그에 맞는 내용 조직이 필요하다. 그러므로 교과별, 학교급별, 학습 상황별로 내용 조직 방식을 개발해 현장에 적용해야 한다.
둘째 내용 조직 측면에서 볼 때, 미래 학교교육은 미래 공학적 패러다임에 따라 학습자가 학습을 이끌어 가는 주체가 될 것이므로 미래 교과서의 내용 조직은 학습자의 구성적인 학습 과정을 실효성 있게 지원할 수 있는 학습자 중심의 내용 조직을 갖추어야 한다. 이를 위해 미래 교과서는 문제 해결 및 주제 중심 프로젝트 체제, 활동 및 공유와 네트워킹이 가능한 체제, 학습자 수준에 따른 단계형 맞춤 체제, 학습 내용 및 학습자 조건 및 상황에 따라 자기 주도적 학습 유형이나 협력 학습 유형을 효율적으로 지향하는 체제 등과 같은 내용 조직 방식을 교과별, 학교급별, 학습 상황별로 구체적으로 연구 개발하여 현장에 적용할 필요가 있다.