사업이 동반되지 않는 지구단위계획이 개발제한구역의 우선해제지역에 적용되어 여러 가지 한계가 나타나는 것으로 조사되었다. 아파트 위주의 개발 계획으로 지속가능성의 문제점, 교통 인프라 부족 등의 시가지의 연담화에 따른 문제점, 공공시설과 지역 내 연계도로 등의 문제가 생기고 있다.  임대주택 지구와 보금자리주택지구의 위치가 정해져 난개발이 우려되고 있다.
개발제한구역에서 해제되는 집단취락 중에서 우선해제지역은 대규모 건설 예정 부지 조정 가능지와 달리 그 규모가 작아 지구단위계획을 수립하도록 되어 있다. 하지만 사업이 동반되지 않는 지구단위계획이 개발제한구역의 해제지역에 적용되다 보니 기반시설 설치비용의 재원조달과 계획의 집행력 확보 등에 있어 여러 가지 한계가 나타나는 것으로 조사되었다. 지속가능 측면에서의 문제점은 대체로 지역의 차이는 있지만 임대주택 공급의 과중한 부담감과 수익성 차원에서 13~20층에 이르는 아파트 위주의 개발을 계획하였으며 이로 인해 자연지형의 훼손과 주변 지역과의 부조화 등 지속가능성 측면에서 문제가 발생하고 있다. 시가지의 연담화에 따른 문제점으로는 주거 위주의 개발이 도시 외곽에 집단화됨에 따라 도심 출퇴근으로 인한 교통 인프라 부족이 심화되고 임대주택단지와 인접해서 보금자리주택단지 등이 위치하게 됨에 따라 상당수의 개발이 상호 인접하여 상하수도, 쓰레기처리, 보육시설의 문제 등 관련 인프라가 충분치 않은 점을 들 수 있다. 사업지구 입지 및 주체와 관련해서는 큰 규모로 여러 개의 지구를 계획함에 따라 총 인구에 걸맞은 공공시설과 지역 내 연계도로 등의 문제가 생긴다. 이렇듯 개발제한구역의 긍정적 역할을 떠나 정부 정책에 따라 임대주택 지구와 보금자리주택지구의 위치가 정해짐에 따라 또 다른 난개발이 우려되고 있다.