한국의 관료제적 속성으로 인해 정책 마련 시 부처간 경쟁적 관계로 인한 갈등이 발생할 가능성이 크기에, 조직구조 재설계 과정에서 명확한 역할분담의 고려가 필요하다. 
첫째, 조직구조 재설계에서 명확한 조직간 역할분담이 고려되어야 한다. 한국의 관료제적 속성을 고려할 때 부처 간 경쟁적 관계가 발생할 확률이 높다. 특히 정책에 대한 입장이 대립될 경우 정책노선에 대한 기관 간 경쟁이 발생하게 된다. 이 때 현대 행정기구의 확대와 정책이슈의 다양화･복잡화가 부처 간 대립과 갈등을 부추기는 요인으로 지적된다. 정부부처의 편제는 분업의 의미와 함께 관할권의 분할을 의미한다. 부처 간 정책영역이 중첩되면 필연적으로 관할권 다툼이 일어나고 이러한 상황에서 부처간 경쟁은 자원 확보를 위한 갈등으로 나타난다. 행정통합과정에서도 이러한 갈등의 소지가 클 수 있다는 점에서 명확한 역할분담을 고려한 조직 설계가 이루어져야 한다.