2000년대 보육료 지원사업은 영유아, 시간연장, 취학아동 방과 후를 위한 보육료 지원이 시행되었다. 2005년에는 두 자녀 보육료 지원 도입, 2010년대에는 맞벌이 및 다문화 가구를 위한 보육료 지원을 시행하였다.
우선 <표 4-3>에서 제시된 만 0~5세 영유아를 대상으로 하는 보육료 지원 사업의 변천을 살펴보자. 2000년대 초반까지 보육 지원 사업은 만 0~5세 영유아가 어린이집을 이용하는 경우 보육료를 지원하는 영유아 보육료 지원, 취학 아동의 방과 후 보육료를 지원하는 시간 연장 방과 후 보육료 지원, 그리고 장애아 무상 보육료 지원 등이 시행되었다. 2005년에는 두 자녀 보육료 지원이 도입되었고 2010년 전후에 맞벌이가구 보육료 지원, 다문화가구 보육료 지원 등이 도입되면서 보육서비스의 다양한 사회적 수요를 충족하는 방향으로 발전하였다. 한편 2009년부터는 어린이집을 이용하지 않는 유아에게는 양육수당을 지원함으로써 부모의 자녀 양육 부담을 낮추고 어린이집을 이용하는 유아에게 지급되는 영유아 보육료와의 형평성을 개선하고자 하였다.