전자상거래로 발생하는 세무상 쟁점과 정부의 규제완화에 따른 추가적인 쟁점을 검토할 필요가 있다. 먼저, 세무상 문제는 과세체계가 명확하지 않다는 것이다. 국내거래와 달리 국제거래의 경우에는 거래주체별 또는 거래상품별로 과세가 달라질 수 있기 때문이다.
전자상거래로 발생하는 세무상 쟁점과 정부의 규제완화에 따른 추가적인 쟁점을 검토할 필요가 있다. 먼저, 전자상거래와 관련하여 과세체계가 명확하지 못하다는 점이 세무상 문제이다. 협의의 전자상거래는 인터넷상에 홈페이지로 개설된 상점을 통해 실시간으로 상품을 거래하는 것을 의미하며, 상품은 전자부품과 같은 실물뿐 아니라, 원거리 교육이나 의학적 진단과 같은 용역도 포함되며, 뉴스․오디오 및 소프트웨어와 같은 디지털 상품도 포함된다고 한다. 전자상거래의 대상이 실물재화냐, 용역이냐 또는 디지털 재화냐에 따라 다른 방식으로 과세될 가능성이 있는데, 우리나라의 세법은 이를 명확하게 구별하고 있지 않고 있으며, 이에 따라 거래주체별 또는 거래상품별로 과세가 달라지는 문제점이 있다. 즉 어떤 종류의 거래든 국내거래는 직접세인 법인세 또는 소득세와 간접세인 부가가치세가 과세되고 있지만, 국제거래의 경우에는 거래주체별 또는 거래상품별로 과세가 달라질 수 있다.