국가교육과정 모니터링 측면의 문제점을 살펴보면, 기존 교육과정을 평가해 결과를 활용하는 것이 부족한 점, 모니터링 기간이 부족한 점, 개정 후 주기적인 모니터링 체제가 정책되지 않는 점, 위에서 아래로만 일방적으로 모니터링 하는 점 등이 있다.
국가교육과정 모니터링 측면의 문제점을 살펴보면, 기존 교육과정의 장단점을 파악하고 그 결과를 환류하는 과정이 제대로 이루어지지 않고 있다는 점, 교육과정 주기가 불안정하고 개정 기간이 짧기 때문에 모니터링 기간이 부족하다는 점, 개정 후의 주기적 모니터링 체제가 정착되어 있지 않다는 점, 상부기관이 하부기관에 일방적으로 모니터링 한다는 점, 상부기관의 모니터링을 학교에서는 지원이 아닌 평가로 인식한다는 점, 총론 중심의 모니터링으로 인해 각 교과별 각론 차원의 모니터링을 상대적으로 경시한다는 점, 모니터링 대상을 주로 교사에 한정하여 학생과 학부모에 대한 모니터링이 부족하다는 점, 문서나 설문 중심의 모니터링 등으로 인하여 수업현장에서 발생하는 실행상의 문제점이 심도 있게 드러나기에 한계가 있다는 점 등이다. 또한 연구학교나 실험학교 운영 결과 보고서, 연구기관 자체 보고서 혹은 교육부나 시·도교육청의 위탁을 받은 연구기관의 연구 결과 보고서가 워크숍 등의 토론이나 세미나 등을 통한 연수의 장으로 연결되는 경우가 부족하다는 문제점이 있다.