권리 의무의 이행 및 감독 업무의 체계적인 수행을 위해 한미 양국은 한 미 FTA 공동위원회를 비롯해 여러 산하 위원회 등을 운영하며 제반 사항들을 협의 조정하고 있다.
협정상 권리 의무의 이행 및 감독 업무를 체계적으로 수행하기 위하여, 한미 양국은 한 미 FTA 공동위원회를 비롯한 여러 산하 위원회 및 작업반을 수립 운영중이다. 2013년의 경우, 10월 5일 제2차 한 미 FTA 장관급 공동위원회가 개최되었고, 상품무역위원회, 무역구제위원회, 한반도역외가공지역위원회, SPS(위생 및 식물위생 조치) TBT(무역에 대한 기술장벽) 위원회, 환경 노무 협의회, 중소기업작업반 등 총 13개의 분과 위원회 및 작업반이 개최되었다. 이와 같은 협정 이행체계를 통해, 양국은 협정 운영과 관련된 제반 사항들을 협의 조정해 나가고 있다.