청소년들은 중장기쉼터에서 2년 간 머물며 정서적, 재정적 지원을 통해 안정을 찾고 현실적 목표를 찾아 퇴소를 준비하게 된다. 
중장기쉼터에서 거주하는 청소년들은 중장기쉼터의 지원 속에서 정서적 재정적으로 안정을 이루어 가며, 현실적 목표를 정하고 목표성취를 위해 매진해 나간다. 일상 생활에 대해 스스로 계획하고 행동하며, 자신을 위해 무엇을 해야 하는지 알아 가면서 사회구성원으로 자질을 갖추어 계획된 목표를 이루어가면서 퇴소에 대한 논의를 하게 된다. 청소년들은 중장기쉼터에 2년 내외의 기간 동안 머물면서 퇴소를 준비하게 되는데 각 쉼터의 퇴소기준에 따라 사례회의를 통해 퇴소를 결정하고 퇴소일정은 청소년과 협의하여 준비한다. 쉼터마다 퇴소 기준은 다르게 적용되고 있으며 그 내용은 같다.