연수원은 교육생의 경험과 자질, 강한 학업성취 욕구를 적극 활용하기 위해 장기교육과정의 중점 교육 운영 방향을 자기 주도형 교육으로 설정하였다. 성공적인 자기 주도 교육을 위해 안내 교육 입교 전 자기주도 학습에 관한 안내, 자문단 구성, 맞춤형 지도 교수제 등을 도입˙실시하여 연구의 전문성을 확보하고 자율성을 부여할 수 있도록 하였다.
첫째, 자기주도적 학습법의 본격 도입･적용이다. 연수원은 공무원 교육 기관의 특성상, 입교 동기가 교육정원과 인사배치에 따른 비자발적인 성격이 있기는 하지만, 교육생 개개인의 경험과 자질, 학업성취 욕구는 매우 강하다고 보아 이를 적극 활용해야 한다고 판단하고, 장기교육과정의 중점 교육 운영 방향을 자기 주도형 교육으로 설정하였다. 구체적으로는 교육 입교 전부터 교육과정과 자기주도학습에 대해 안내하고, 입교 초 실시하는 자기변화 촉진 훈련 시 전문가의 특강을 통해 자기주도학습에 대한 개념을 정립하고, 이를 토대로 개인별 학습계획을 수립하도록 하였다. 이러한 전반적인 자기 주도 교육계획의 수립 과정에서의 전문성 확보를 위해, 2014년 2월 6일 연수원은 외부 전문가 및 원내 교수 등 6명으로 자문단을 구성･운영하였다. 또한, 개인별로 1개의 정책 연구과제를 자기주도 학습과제로 정하고, 연수원 겸임교수를 중심으로 수시로 연구과제를 지도할 수 있도록, 개인별 ‘맞춤형 지도 교수제’를 도입하였다. 지도교수 1인당 15명 내외의 교육생을 배정하여 10개월간 교육생 주도의 연구 수행을 지도･지원하도록 하였다. 한편, 개인 연구과제와 관심에 따라 분야별로 자율적인 교과목을 선택하여 들을 수 있도록 하고, 연수원 밖에서 열리는 학회나 세미나 참석, 정책현장 방문 등도 연간 14시간의 범위 내에서 정식 출석으로 인정함으로써 과제 연구의 자율성을 부여하였으며, 격월로 ‘자기주도학습의 날’을 지정하여 지도 교수의 특강, 개인 지도, 연구성과 중간발표와 토론, 그밖에 개별 연구를 하도록 하였다. 그리고, 이를 통한 연구결과는 연구자료집으로 발간하여 시･도에 배포하고, 지도 교수의 가이드에 따라 학술지 발표, 칼럼 게재, 국민제안 응모 등에 활용하도록 함으로써, 자율적으로 과제 연구의 품질에 만전을 기하도록 하였다.