제대군인 의료처는 신규 연구에 중점을 둔 특별 프로그램과 센터를 설립하였다. 다발성외상진료센터는 전쟁으로 장애를 갖게 된 제대군인들을 위해 다양한 방법으로 회복과 재활을 지원하고 있다.
수년 동안 제대군인 의료처는 국립 외상 후 스트레스 장애 센터(National Center for Post-Traumatic Stress Disorders)와 맹인 재활 서비스(Blind Rehabilitation Service)와 같이 임상적 요구와 새로운 연구에 초점을 맞춘 특별 프로그램과 센터를 설립하였다. 주로 이라크 및 아프가니스탄전에 참전한 다중 상이군인 및 여군들을 위해 의료서비스를 제공하였다. 2005년도에는 다발성외상진료센터(Polytrauma System of Care)를 설립하였는데 4곳의 다발성외상진료센터는 최근의 전쟁으로부터 상해를 입은 제대군인들을 위해 다분야에 걸친 회복과 재활 서비스를 제공하는 지역의 대표 시설이며 다섯 번째 센터는 텍사스의 샌안토니오에 설립하는 계획이 있다.