제주해군기지 건설은 해군 기동부대가 제주기지에 현시하여 힘을 보임으로 해상교통로 보호, 해양주권 수호, 해양자원 보호의 목적을 달성할 수 있다.
일찍이 해양학자 알프레드 T. 마한(Alfred T. Mahan)은 “해군은 해상무역을 지키기 위해 존재하는데, 해상교통선과 기지는 분리될 수 없는 관계”라고 역설 하면서 ‘해군력과 이를 담을 수 있는 기지’의 중요성을 강조했다. 그리고 역사적으로 해군력은 ‘현시(presence)’를 통해 힘을 보임으로써 그 목적을 달성해 왔다. 현시는 지난 2010년 3월 26일 북한의 천안함 폭침 때 미국 항공모함이 우리의 동･서해에 출동함으로써 긴장국면을 힘으로 완화한 사례에서 볼 수 있다. 오늘날 제주해군기지 건설은 해군기동부대가 제주기지에 현시함으로써 이 일대에서 대한민국의 젖줄인 해상교통로를 보호하고, 해양주권을 지키며, 해양자원을 보호하려는데 그 목적이 있다.