초창기 인적자원개발회의에는 위원 12명이 참여하였다. 그 뒤 교육부가 격상하고, 여성특별위원회는 여성부로 개편되며, 위원수가 늘고, 몇몇 조직이 새로 참여하는 변화가 있었다.
초창기 인적자원개발회의에는 교육부, 행정자치부, 과학기술부, 문화관광부, 산업자원부, 정보통신부, 노동부, 기획예산처 등 인적자원 관계부처 장관과 국무조정실장, 여성특별위원장, 국정홍보처장, 대통령 비시설 교육문화수석비서관 등 모두 12명의 위원이 참여하였다. 2001년 1월 정부조직법이 개정되면서 교육부가 부총리급의 교육인적자원부로 격상되어 회의를 주재하고, 여성특별위원회는 여성부로 개편되면서 행정부처의 위상을 갖고 참여하게 되었다. 2002년 8월 인적자원개발기본법 제정으로 위원수가 12인에서 15인으로 늘어났고, 재정경제부, 보건복지부, 중앙인사위원회 등이 새롭게 참여하였다.