학교의 윤리교육은 두 가지로 나누어 볼 수 있다. 하나는 교과목 수업을 통한 윤리교육이고 다른 하나는 교내 생활에서의 경험을 통한 실질적 윤리교육이다.
학교에서의 윤리교육은 크게 두 가지 방식으로 이루어지도록 한다. 첫째, 학과목으로써의 윤리교육이다. 초등학교 에서는 교과서, 문학, 애니메이션, 영화 등 다양한 수업 자료를 통해 도덕, 가치, 원칙에 대한 학습이 이루어지도록 하며, 중등학교에서는 통합교과적인 방식으로 다른 과목과 연계하여 윤리적 가치 판단에 대한 교육, 적극적인 시민 성 교육이 이루어질 수 있도록 한다. 둘째, 학교생활, 학급생활에서의 실질적인 윤리교육이다. 이는 학급 및 학교생활 전반에서 학생들이 평등, 연대를 실천하고, 차별하지 않고 다양성을 인정하는 등 도덕적 가치 판단에 근거하여 윤리적 생활 태도를 학습하도록 하며, 학급 위원회, 학생 대표 선출과 같은 방식을 통해 민주주의의 기본 원칙을 경험 하고 배울 수 있도록 하는 방식이다.