지방자치단체의 외부감사와 자체감사 사항의 항목들에 대한 감사중복문제와 감사 미실시 영역 문제를 해결하기 위해 비교 또는 알림 기능을 통해 체크할 수 있도록 해야 한다.
셋째, 지방자치단체의 외부감사 항목은 현재 공공감사 정보시스템에 등록을 하게 되어 있으며, 자체감사 사항도 세부 항목을 등록하게 하고 있으나 감사중복문제는 크게 개선되지 않았음을 볼 수 있다. 그리고 중복감사도 문제이지만 공공감사에 관한 법률에서 규정하고 있는 6가지의 자체감사 중 실시되지 않는 영역이 있다. 따라서 지방자치단체에서 실시한 자체감사의 항목과 외부감사 항목을 비교하여 중복감사, 종류별 감사 미실시 등은 공공감사 정보시스템 내 알림 기능을 부여해 체크하여 관리할 수 있도록 하여 감사원이나, 지방자치단체 등 감사기구에서는 중복과 누락 감사를 방지할 수 있도록 해야 한다.