운영의 어려움은 정부의 다양한 지원을 통해 해결할 수 있다. 기업이 임금 효과성을 추구하더라도, 연공급이 아닌 임금체계는 운영하고 관리하는 데 어려움이 있다. 그러나 정부의 임금정보시스템이나 직업능력개발원의 직무 데이터 등을 참조해 운영의 효율성을 제고할 수 있다.
둘째, 운영의 어려움은 정부의 다양한 지원을 통해 해결할 수 있다. 앞서 논의한 바와 같이 기업이 임금 효과성을 추구하더라도, 연공급이 아닌 임금체계는 운영하고 관리하는 데 어려움이 있는 것이 사실이다. 중소사업장의 경우 인력 부족으로 도입해서 운영하기는 더욱 힘들 것이다. 그러나 운영의 효율성을 모색할 수 있다. 예를 들어, 직무급의 경우 모든 직무에 대한 가치 평가를 할 필요는 없다. 대표 직무(예: 저난이도, 중난이도, 고난이도)만을 설정하고 다른 직무들은 요소비교법과 같이 대표 직무와 비교평가해서 수준을 결정하면 된다. 더구나 정부에서는 올해 3월에 임금체계 매뉴얼을 발간하여 사업장에 배포하였으니 참고할 수 있다. 정부가 노사발전재단과 함께 임금체계 개편을 지원하고 있으니 활용할 수 있다. 직무급에 관련해 정부가 직무분류체계를 구축하고, 직무 임금 데이터를 현실적으로 제공하는 것이 선결되어야 하겠지만, 기존의 임금정보시스템이나 직업능력개발원의 직무 데이터 등을 참조할 수 있다.