NCS는 다양한 방법으로 유연하게 활용될 수 있어야 한다. 이를 위해서 자율성을 부과하고, 동일 교육이더라도 그 강조점이 달라져야 한다. 융통성있는 활용은 해당 분야의 발전을 가져올 것이다. 이 와중에도 NCS 기반 교육과정으로 진행되는 것을 인정받을 수 있게 해야 한다. 
둘째, 교육훈련기관과 기업체 등에서 NCS를 필요에 따라 유연하게 적용할 수 있도록 자율성을 부여하는 것이 필요하다. 때로는 교육훈련 기관이나 기업에서 NCS를 직접 적용하지 않아도 참고하는 것만으로 도 해당 산업계의 발전에 도움을 줄 수 있을 것이다. NCS는 직업분류 를 중심으로 구분되어 있고, 수행준거에는 직무내용(또는 역량과 절 차)이 기술되어 있기 때문에, 교육을 실시할 때에는 교과목과 교육목 표를 NCS와 다르게 구성할 필요가 있다. 또한 동일한 NCS로 교육하 더라도 교육목표, 교수자의 역량과 성향, 학생의 특성과 수준, 교육환 경 등에 따라서 강조점과 가르치는 방법이 달라질 수 있다. 따라서 NCS를 부분적으로 선택하여 활용하거나 변형하여 활용하는 경우에도 때로는 NCS 기반 교육과정으로 인정받을 수 있어야 한다. 이와 유사 하게 NCS 기반 자격에서 필수 및 선택 능력단위를 탄력적으로 운영 하는 것에도 융통성을 부여할 필요가 있다. 이는 기업에서의 NCS 활 용에 있어서도 마찬가지이다.