목포고에서는 과거 학업중심의 교육에서 인성중심의 교육으로 시행착오를 통해 변화하고 있다. 27개의 비교과 프로그램을 운영하고 자격을 갖춘 교사와 외부 강사들의 전문적 교육으로 학생들의 반응이 뜨겁다.
학생들의 실력향상만큼이나 목포고에서 열정을 쏟고 있는 것은 인성교육이다. 지역 명문고가 추구해 온 학업중심의 교육을 하루 아침에 바꾸기란 쉽지 않았다. 첫 해부터 많은 시행착오를 겪었지만 이제는 조금씩 안정을 찾아가고 있다. 목포고는 인성교육 프로그램의 하나로, 매주 수요일 방과후에 비교과 중심의 특기·적성활동을 한다. 평소 교과목 중심의 방과후 수업으로 지친 학생들에게 일주일에 하루만큼은 개개인의 소질과 적성을 계발할 수 있도록 시간을 마련한 것이다. 이날은 종이접기, 바둑, 밴드, 기타연주, 연극, 목공, 공예, 배드민턴 등 27개의 비교과 프로그램을 운영, 전문적 소양과 자격을 갖춘 교사들과 외부 강사들의 전문적 교육이 이뤄져 참여하는 학생들의 반응이 뜨겁다.