학교제도의 균열은 학교 밖에서 시작되었다. 입시에 찌든 학생들에게 신선한 바람을 쐬게하기 위해 일부 사회운동가들이 방과 후나 주말, 방학을 이용하여 프로그램 학교를 개설하였다. 최초의 비인가 학교인 ‘간디청소년학교’를 설립하여 ‘학교’ 밖에서도 교육이 가능함을 보여 주었다.
하지만 철옹성 같던 우리나라의 학교제도도 균열을 피할 수는 없었다. 그것은 두 가지 원천에서 시작되었다. 선도적인 노력은 학교 밖에서 시작되었다. 80년대 말에서 90년대 초에 이르는 시기는 입시와 성적 등으로 인한 청소년 자살자가 충격적일 만큼 증가하였는데, 이러한 현실에 작은 숨통이라도 틀 요량으로 일부 사회운동가나 교사들이 방과 후나 주말, 방학을 이용하여 일종의 프로그램 학교를 개설하였다(강태중 외, 1996). 입시에 찌든 학생들을 학교 밖으로 불러 내 신선한 바람을 쐬게 한 것이다. 이 일을 주도한 사람들은 1995년을 계기로 하여 서로 연계활동을 시작했으며, 1996년부터는 일부 인사들이 비인가 학교 설립을 준비하여 1997년 3월에 한국 최초의 ‘간디청소년학교’를 설립하였다. 이것은 ‘학교’ 밖에서도 교육이 가능함을 실천적으로 보여 준 것으로서, 기존의 학교제도에 대한 도전인 동시에 기존 학교 권력에 대한 불복종 운동이었다. 2000년을 넘기면서 이러한 움직임은 다수의 비인가 대안학교 설립으로 확산되었다.