기관중재는 중재 기관에 의해 절차가 진행되는데, 중재기관은 행정적인 지원과 판정문의 검토 등을 수행한다. 그러나 실체적 판단은 중재판정부에 맡겨지고, 국제중재 경험이 많은 중재기관에 맡길 경우 많은 노하우를 얻을 수 있다는 장점이 있다.
중재는 크게 기관중재 및 임의중재(ad-hoc arbitration)로 나눌 수 있다. 기관중재는 중재 기관에 의해 절차가 진행되는 형태로, 대표적인 중재 기관으로 파리의 ICC, 런던의 LCIA, 홍콩국제중재센터(Hong Kong International Arbitration Centre, 이하 HKIAC), 싱가포르 국제중재원(Singapore International Arbitration Centre, 이하 SIAC), 한국의 대한상사중재원 등이 있으며 이들은 중재절차 진행 비용의 대가로 소정의 수수료를 받는다. 중재기관은 중재 변론 기일 및 장소 등의 행정적인 지원 또는 중재인 선정, 중재인에 대한 기피 또는 중재판정문의 검토를 담당하나, 분쟁에 대한 실체적 판단은 중재판정부에게 맡겨져 있으며 중재기관은 관여하지 않는다. 국제중재 수행 경험이 많고 유명한 중재기관이 중재를 진행할 경우, 중재기관으로부터 절차에 대한 상당한 노하우를 제공받을 수 있어 국제중재 경험이 적은 당사자들에게 적합하다.