입양특례법과 민법이 다른 시기에 다른 주무부처에서 개정이 이루어지면서 내용이 충돌하는 문제가 지적되어 왔는데, 입양 관련 법률에서 명시하고 있는 내용과 해석의 차이로 인해 아동의 권리가 침해되지 않도록 대안을 마련할 필요가 있다.
입양특례법 개정에 따라 모든 입양을 최종적으로 가정법원에서 허가하도록 함에 따라 입양 절차에서의 사법기관의 감독과 규제가 가능하게 되었다. 또한 민법에서의 입양 역시 개정 절차를 통해 가정법원의 허가를 받도록 하고 있다. 그러나 입양특례법과 민법이 다른 시기에 다른 주무부처에서 개정이 이루어지면서 내용이 충돌하는 등 문제가 지적되어 왔다(현소혜, 2013). 민법상 입양에서 입양특례법의 적용을 받지 않는 경우가 발생할 수 있는데, 예를 들면, 입양특례법 제10조에 따르면 아동을 입양할 양친이 될 자격을 구체적으로 명시하고 있으나, 민법에 따른 일반입양 또는 친양자 입양 신청의 경우 특례법에 따른 국내 입양 절차를 따르도록 할 것인지 등에 대해 문제 제기가 있을 수 있어, 이 경우 별도의 양부모 자격심사를 강화해야 한다는 지적도 있다(현소혜, 2013). 이러한 입양이라는 동일 사안에 대해 관련 법률에서 명시하고 있는 내용이나 또 해석의 차이로 인해 입양과 관련하여 아동의 권리가 침해되지 않도록 더욱 관심을 갖고 대안을 마련할 필요가 있다.