통일 이후에는 남북 체제 통합을 비롯하여 여러 행정수요가 나타날 것이므로 행정기관에서 담당 업무를 수행해야 한다. 이중 북한 국유재산의 민영화, 통일한국 인사제도의 재정립 등은 국무총리가 직접 담당할 필요가 있는 정책 또는 사업이 될 것이다.
통일 이전과는 달리 통일 이후에는 남북 체제통합을 비롯하여 다양한 행정수요가 나타날 것이기 때문에 관련 행정기관에서 담당 업무를 수행하여야 한다. 이럴 경우 그 업무 성격이 여러 부처에 걸쳐 있어 특정 부처가 단독으로 수행할 수 없을 경우나 또는 그 사안이 중요성 등을 비추어 볼 때 일반 행정기관이 수행하는 것보다 국무총리가 직접 담당하여야 할 정책 또는 사업이 있을 것이다. 예를 들어 통일 이후 남북한 경제통합을 이루기 위해서는 우선적으로 북한 국유재산의 민영화과정을 거쳐야 하는데, 이러한 과업은 매우 중요할 뿐만 아니라 기획재정부, 산업통상자원부, 한국은행 등 여러 부처가 관여하면서 추진되어야 하기 때문에 1개 부처가 관할하기 보다는 국무총리(실)가 책임지고 담당할 필요도 있을 것이다. 이밖에 북한지역의 재건, 북한출신 공무원의 재임용을 통한 통일한국 인사제도의 재정립 역시 특정 부처가 담당하는 것보다 국무총리가 여러 행정기관 네트워크를 구축하면서 수행하는 것이 효율적일 수도 있다.