화훼공판장 상장 경매제는 기존의 관행과 달랐기 때문에 대상 농민들에게 바로 적용되지는 못했다. 이에 공사는 농가 지원책 마련과 지속적인 소통을 통해 화훼 경매 실적을 높였다.
그러나 개장 초기, 화훼 재배 농민들은 화훼공판장의 상장 경매제도에 적응하지 못했다. 수십 년 간 익숙해져 있던 유사 도매시장의 관행과 달랐기 때문이다. 유통공사는 이를 해결하기 위해 농가 지원책을 마련하고 농가와 지속적인 간담회를 마련해 나갔다. 이러한 적극적인 소통 노력으로 화훼 경매 실적은 연간 10% 이상 증가하기 시작했다. 개장 첫해인 1991년 17.2억 원이었던 총 화훼 매출액은 1992년 72.4억 원으로 급증했으며, 2011년에는 1,000억원으로 껑충 뛰었다. 절화(切花, 꽃꽃이, 꽃다발, 화환에 쓰이는 꽃) 경매 실적 또한 1991년 개장 시기부터 경매물량 연평균 증가율이 43.1%, 경매금액 연평균 증가율이 42.7%로 꾸준히 증가했다.