정부에서 고등교육을 육성/지원하기 위해 재정지원을 하고 있다. 약 375개 사업이 재정지원 수혜를 평가와 연계하여 실시한다. 그러나 중복, 비체계성 등의 비효율이 초래되고 있다.
고등교육이 국가발전의 핵심 역할을 함에 따라 정부에서는 이를 육성⋅지원하기 위해 다양한 재정지원을 해오고 있다. 이는 주로 사업의 형식으로 이루어지는데 중앙부처 수준에서만 약 31개 부처를 통해 약 408개 사업이 추진되고 있다. 이 중 재정지원의 수혜여부를 평가와 연계하여 실시하고 있는 사업이 약 375개로 추산되는데 이들 사업은 제한된 국고를 효율적으로 운용하고 대학 간 선의의 경쟁을 통해 자율적 질 제고를 유도하기 위한 목적으로 각 사업별로 평가준거를 마련하여 지원 대상 대학 선정을 위한 평가에 활용하고 있다. 그러나 다양한 부처에서 사업을 추진하다 보니 사업간 중복, 평가항목의 비체계성 등으로 재정지원사업 평가의 비효율이 초래되고 있다.