프로그램 예산제도에 대한 만족도는 행정부는 약간 만족하는 입장이고, 입법부는 만족하지 않는다는 입장으로 전반적으로 만족하지 못하고 있다. 이는 프로그램 예산제도에 대한 낮은 경험이 원인이 된 것으로 추정된다.
첫째, 프로그램 예산제도에 대한 전반적인 만족도를 보면, 행정부는 약간 만족하는 입장이며 입법부는 만족하지 않는다는 입장이다. 현재 운영되고 있는 프로그램 예산제도에 대해 전반적으로 만족하고 있는지 여부에 대해, 리커트 5점 척도로 조사한 결과, 행정부 응답자들의 평균은 3.20으로 약간 만족한다는 입장이지만, 입법부 응답자들은 2.82로 입법부 응답자들은 현재 운영되고 있는 프로그램 예산제도에 대해 전반적으로 만족하지 못하고 있다. 프로그램 예산제도는 통합재정정보시스템인 디지털예산회계시스템에 구현되어 있는데, 설문조사 결과에 의하면, 통합재정정보시스템인 디지털예산회계시스템(dBrain)의 사이트에 접속하여 사용해 본 경험이 있는지에 대하여 행정부 응답자는 84.4%가 그렇다고 응답했지만, 입법부 응답자는 46.7%가 그렇다고 응답하여 입법부 응답자가 상대적으로 사용해본 경험이 적은 것이 프로그램 예산제도에 대한 만족도가 낮은 하나의 원인이 될 수 있을 것으로 추정된다.