과학기술계 현장에서 공통으로 주목한 이슈는 정부 R&D 구조개혁이다. 이전의 조치가 현장에서 요구하는 만큼 적극적인 정책적 변화가 없기에, 사업구조부터 예산집행 구조까지 개혁적 변화를 요구하였다.
특히 과학기술계 현장에서 공통적으로 주목한 이슈는 정부 R&D 구조개혁이다. 정치권에서도 5개 정당 모두 정부 R&D 투자 확대 및 효율화의 문제를 지적한 바 있다. 물론 신정부에서 과학기술혁신본부의 출범 등으로 과학기술계 컨트롤타워 강화를 위한 정책적 조치를 취했다. 그러나 아직까지는 현장에서 요구하는 만큼 적극적으로 정책적 변화가 이루어진 것은 아닌 것으로 판단된다. 현장에서는 사업 구조부터 예산집행 구조까지 개혁적 변화를 요구했으며, 이번 대선뿐만 아니라, 지속적으로 제기해 온 문제다. 특히 공공연구노조와 한국공학한림원은 정부의 연구개발 구조의 직접적 영향을 받는 조직으로서, 대대적 구조 개혁을 요구한 바 있다. 일류강국연구회 역시 정부역할의 재정립을 강조했다.