국가과학기술연구회가 중점적으로 융합연구체제를 추진하고 있다. 하양식으로 NAP을 추진해 왔다. 상향식으로 CAP은 원천기술 중 미래전략기술 또는 사회현안해결기술 방면에 융합연구가 가능한 분야를 지원하는 사업이다.
국가과학기술연구회가 중점적으로 추진하고 있는 것이 융합연구체제의 강화이다. 융합연구와 관련해서는 (구)기초기술연구회가 2008년부터 하향식 융합연구사업인 국가문제해결형연구사업(NAP)을 추진해 왔다. 6년까지 사업이 지원되며2014년도에 4개 사업 그리고 2016년까지 나머지 사업이 단계적으로 종료될 예정이다(국가과학기술연구회 웹사이트60)). 그 외에도 상향식 방식으로 미래전략기술 및신산업 창출과 관련한 창의형 융합연구사업(CAP), 중소 및 중견기업의 수요기술을지원하는 융합실용화연구사업, 국방기술 분야의 민군융합기술연구사업이 추진 중이다. CAP는 고유 미션 및 기능에 부합하는 원천기술 중 미래전략기술 또는 사회현안해결기술 방면에 융합연구가 가능한 분야를 지원하는 사업이다. 연 3개 내외로14억원 규모로 지원된다.