교육 개혁을 위한 시나리오 워크숍 참여 단체의 대표성 문제가 제기되었다.  이는 오래된 문제로 생소한 단체도 참가 가능한 국민제안 마당에 참여했던 단체들로 구성한 탓이다.
시나리오 워크숍 참여자와 관련하여 첫째, 소속 단체의 대표성 문제가 제기되고 있었다. 앞서 살펴보았던 것처럼 “국민제안마당을 할 때 거기에 적극적으로 참여했던 단체들로 구성”되다 보니, 기존에 알려지지 않은 생소한 단체도 참여하게 되어 이해관계 집단을 대표하는 단체인가라는 문제 제기가 이루어지기도 하였다. 한 연구 참여자는 “홈페이지”도 없는 단체도 참여하고 있어 실체가 의심된다는 견해를 피력하기도 하였다. 이런 문제의식은 오랜 역사를 갖고 있으며, 특정한 교육 운동 영역에서 인지도가 높은 단체 소속 연구 참여자뿐만 아니라, 신생 단체 소속 연구 참여자도 갖고 있었다.