공기업의 감사와 준정부기관의 감사는 기관 규모에 따라 임원추천위원회가 추천, 공공기관운영위원회의 심의, 의결을 거쳐 기획재정부장관이 임명, 혹은 기획재정부 장관의 제청으로 대통령이 임명한다. 감사는 기획재정부 장관이 정하는 감사 기준에 따라 공기업, 준정부기관의 업무와 회계를 감사한다.
공기업의 감사는 ‘임원추천위원회’가 복수로 추천하여 ‘공공기관운영위원회’의 심의･의결을 거친 사람 중에서 기획재정부 장관의 제청으로 대통령이 임명한다. 다만, 기관 규모가 대통령령이 정하는 기준이하(총수입액이 1천억원미만이거나 직원정원이 500명 미만인 공기업)인 공기업의 감사는 임원추천위원회가 복수로 추천하여 공공기관운영위원회가 심의･의결을 거친 사람 중에서 기획재정부 장관이 임명한다(공운법 제 25조). 준정부기관의 감사는 임원추천위원회가 복수로 추천하여 운영위원회의 심의･의 결을 거친 사람 중에서 기획재정부 장관이 임명한다. 다만, 기관 규모가 대통령령이 정하는 기준 이상이거나 업무내용의 특수성을 감안하여 대통령령으로 정하는 준정부기관 의 감사는 임원추천위원회가 복수로 추천하여 운영위원회의 심의･의결을 거친 사람 중 에서 기획재정부 장관의 제청으로 대통령이 임명한다(공운법 제26조). 감사의 임기는 2 년이며, 1년을 단위로 연임될 수 있다(공운법 제26조). 감사는 기획재정부 장관이 정하는 감사 기준(공기업･준정부기관 감사 기준)에 따라 공기업･준정부기관의 업무와 회계 를 감사하고, 그 의견을 이사회에 제출한다(공운법 제32조).