한국에서 대안교육이 중등과정으로 집중되는 원인은 학업중단을 사회문제로 보고 경쟁과 입시를 장려하기 때문이다. 유치-초등교육을 중심으로 대안교육이 발달된 해외와는 차이가 있다.
대안교육이 중등과정에 집중되는 원인은 두 가지로 유추해볼 수 있다. 첫 번째로는 그 자체로 한국교육 현실의 문제를 드러내고 있다는 점이다. 앞서 지적한대로 한국 대안교육은 ‘행복은 성적순이 아니잖아요’로 대표되는 청소년 자살문제와 입시위주의 교육체제, 그리고 그로 인한 학업중단율이 시급한 사회적 문제로 등장함으로써 초등과정에서부터 천천히 체질강화를 꾀하기에는 한계가 있을 수밖에 없었다. 대학입시에 매몰된 경쟁교육에 대안을 내놓는 일에 집중하다보니고교과정을 중심으로 시작되는 것이 당연한 수순이었다. 앞서 언급한 바 1997년 최초의 전일제 대안학교로 생겨난 간디청소년학교도 중등과정으로 설립되었으며, 1998년 첫 인가된 대안교육 특성화학교 6곳도 모두 고등학교였다. 한국의 사회적·교육적 특수맥락은 중등교육중심의 대안교육을 시급하게 요구하고 있었으며 여전히 같은 상황에 있다. 이는 유치-초등을 중심으로 대안교육이 발전해온 서구 사례와 큰 차별점이라 하겠다.