공인전자문서센터는 우리의 독특한 제도로 이것의 활성화를 위해서는 보관 중인 전자문서에 작성 등 확실한 효력을 부여하고 전자문서의 형식요건과 연계하는 방안도 고려해야 한다.
공인전자문서센터는 우리나라에서만 운영되고 있는 독특한 제도이다. 그런데 전자문서의 안정성 및 신뢰성을 보호하기 위한 입법목적과 달리 전자문서의 원본성과 동일성에 대해서 규정하고 있지 않다. 따라서 공인전자문서센터의 활성화를 위해서는 공인전자문서센터에 보관 중인 전자문서에 대해서 보다 확실한 법적 효력을 부여할 필요가 있다. 즉 전자문서를 공인전자문서센터에 보관하는 경우에 전자문서법 제4조 제2항에 따른 문서의 기록·보고·보관·비치 또는 작성 등의 효력을 인정하는 방안을 고려할 수 있다. 또한 공인전자문서센터의 활성화를 위해서 전자문서의 형식요건과 연계하는 방안도 고려할 수 있다.