조합원들의 조직 이동이 수시로 이루어져 조직 확대 과정에서 경쟁을 벌일 수밖에 없는 상황이라 3개 조직 간의 불만과 갈등이 지속적으로 나타나고 있다.
연대회의를 통한 공동대응의 기저에는 크고 작은 3개 조직 간 조직화를 둘러싼 갈등이 지속적으로 나타나고 있다. 교섭 과정에서도 조직 간의 선명성 경쟁이나, 주로 조직하고 있는 학교 비정규직 직종의 차이로 인해 노조마다 핵심 요구사항의 초점이 다른 경우가 종종 발생하기도 한다는 것이다. 이에 일부 지역 교육청 사용자 교섭위원들이 “노조들 사이에 의견을 통일해 달라”며 불만을 내비치기도 한다는 것이다. 더욱이 조합원들의 조직 이동이 자유롭고 수시로 이루어짐에 따라 각 조직마다 조직 확대 과정에서 불가피하게 경쟁을 벌일 수밖에 없는 상황이라 3개 조직 간의 불만과 갈등은 심정적인 영역으로까지 확대되고 있는 실정이다.