신체의 자유를 제한하는 징계영창은 헌법 상 영장주의 위반 및 기본권의 본질적 내용을 침해할 수 없다고 규정된 것을 위반한다는 위헌성 논의가 제시되어 왔다. 
징계영창은 군인사법상의 규정을 근거로 신체의 자유(헌법 제12조)를 제한하는 제도이다. 징계영창 제도의 위헌성 논의는 크게 두가지 헌법적 관점에서 논의되어 왔다. 하나는 영창제도가 국민을 구속하거나 구금할 때는 영장(검사의 신청에 의하여 법관이 발부한 영장 제시의무)에 의하여야 한다는 헌법 제12조 제3항의 영장주의를 위반한 것이 아니냐는 것이다. 다른 하나는 국민의 자유와 권리는 국가안전보장·질서유지 또는 공공복리를 위하여 제한할 수 있으나 기본권(인권)의 본질적인 내용을 침해할 수 없다고 규정하고 있는 헌법 제37조 제2항을 위반하는 것이 아니냐는 것이다.