모니터링과 평가는 클러스터 사업에서 사업 관련 결정 및 참여주체들의 활동을 조정하는 기초이다. UNIDO는 이를 통해 진행상황을 점검하는 체계를 갖추고 있다.
모니터링과 평가(M&E)는 클러스터 사업의 중요한 한 부분이다. 작업진행에 대한 모니터링을 통한 정보체제 확립은 매일 매일 사업과 관련하여 취할 결정과 참여주체들의 활동을 조정하는 기초가 된다. UNIDO는 사전에 준비된 모니터링 시스템을 통해 사업 출범 초기부터 클러스터 발전에 영향을 줄 수 있는 요인들 간 인과관계를 도출하고, 관련 주요 성과지표를 설정하여 진행상황을 면밀하게 점검하는 체제를 갖추고 있다. 이러한 모니터링과 평가 시스템을 통해 UNIDO는 클러스터 사업의 종료와 함께 사업의 적절성, 효율성, 효과성, 영향 및 지속성 등을 평가한다.