u-보금자리론은 고객이 원하는 날짜에 대출금을 받을 수 있도록 하며 주택저당채권 사후관리업무를 공사가 직접 수행하도록 하였다. u-보금자리론 수납거래시스템 하에서는 모든 거래를 자동으로 인식, 총괄관리자 한 명만 필요한 업무 효율성을 달성하였다. 다만 사후관리와 경매 등의 업무는 면담이 필요해 소수인력을 통한 기초자산 건전성 유지가 어렵다. 
취급금융기관에 대출심사부터 자산관리까지 모든 것을 의존하는 t-보금자리론과는 달리 u-보금자리론은 판매와 함께 공사의 영업점에서 대출자에 대한 직접심사를 거쳐 대출자에 대한 모든 정보를 사전에 확보하고 금융기관에 이를 통지하여 고객이 원하는 날짜에 대출금을 받을 수 있도록 하였다. 또한, 사전에 확보한 모든 정보를 활용하여 주택저당채권 사후관리업무를 공사가 직접 수행하도록 하였다. 기존 위탁업무시스템 하에서는 금융기관으로 납입되는 원리금 등을 전산 전문으로 받아 공사가 대사인력을 투입하여 오류를 바로잡고 수납거래를 처리하는 방식으로 관리하고 있으나, u-보금자리론 수납거래시스템 하에서는 모든 거래를 자동으로 인식하여 단 한 명의 총괄관리자만을 필요로 하는 가시적인 업무 효율성을 달성하였다. 다만 수납관리 이외에 처분조건부대출관리, 우대형 보금자리론의 사후관리 및 경매 등의 업무는 시스템으로 자동화하기 어렵고 직접 고객과의 면담이 필요해 소수인력을 통한 기초자산 건전성 유지는 매우 어려운 현실이다. 또한 경매관리 등 오랜 경험과 노하우를 절대적으로 요구하는 업무에 대한 경험이 부족하고 정부정책 및 주택금융시장 환경의 변화 등으로 보금자리론 공급이 증대함에 따라 주택저당채권 관리대상 규모를 소화해 낼 관리 인력 및 예산이 부족한 상황이다.