소방 기능과 방재 기능 간 갈등 내지는 부조화 문제가 국가예산처에서도 반복될 가능성이 있는 것이다. 따라서 국가안전처안의 경우 내부적인 조직통합 문제가, 국민안전부안의 경우 외부적인 조직통합 문제가 상대적으로 보다 중요한 과제가 될 가능성이 높다.
다른 한편 정부조직 전체적 관점에서 보면 조직의 분화는 통합의 정도를 낮출 수 있다. 소방 기능이나 해양안전 기능을 외청화하는 경우에는 조직 간 협력을 위한 비용과 같은 거래비용이 나타나게 될 것이다. 특히 내부 기능의 독립적 외부화의 경우 조직 간 주인-대리인 관계를 형성시켜 정보비대칭 문제가 나타나게 될 것이다. 이 경우에는 통제 비용의 증가를 초래하게 된다. 반면 기능의 내부화는 새로운 조직통합의 이슈를 야기한다. 즉 서로 다른 이질적 기능이 하나의 조직에 포괄되는 경우에는 조직 내 기능 간 부조화나 갈등으로 인한 조직통합의 저해가 가능한 것이다. 특히 하나의 조직에서 주된 기능과 종된 기능이 형성되는 경우에는 인사관리나 예산의 분배 과정에서 종된 기능을 수행하는 구성원들의 소외감이나 근무 의욕 저하를 초래할 수 있다. 송용선(2013)이 제시한 소방방재청에서의 소방 기능과 방재 기능 간 갈등 내지는 부조화 문제가 국가예산처에서도 반복될 가능성이 있는 것이다. 따라서 국가안전처안의 경우 내부적인 조직통합 문제가, 국민안전부안의 경우 외부적인 조직통합 문제가 상대적으로 보다 중요한 과제가 될 가능성이 높다.