이 시스템은 유관기관과 정보연계가 가능하게 한다. 최근 전국 스마트폰 기반 PORT-MIS 모바일 서비스 제공과 항만이용 관계자의 시, 공간 제약 해소 등이 이뤄졌다.
이 시스템은 각 항만공사, 세관, 출입국사무소, 국립검역소, 도선사협회 등 유관기관과의 정보연계가 가능하도록 하고 있다. 특히 최근에는 항만이용자들의 편의 증진과 업계의 수출입 물류비 부담 완화를 위해 전국 무역항과 연안항에서 스마트폰 기반 PORT-MIS 모바일 서비스를 제공하고 있다. 항만이용 관계자가 옴니아, 아이폰, 안드로이드 등의 환경에서 스마트폰에 맞는 앱을 다운받아 사용이 가능하도록 하여 시간과 공간적인 제약을 받지않도록 발전시켰다. 또한 최근에는 관련 시스템과 연계하여 ‘Yes! U Port’라는 브랜드로 Port-MIS 시스템을 개도국 등에 수출하는 것을 모색 중이다.