원조 선진화를 향한 한국 정부의 정책과 협업활성화라는 정부의 정책기조를 반영하여 교육부는 ｢교육 ODA 활성화 방안(시안)｣을 제시하였다. 교육부-외교부 협업 강화 등 각 기관 간의 강점과 비교우위를 최대한 활용하는 협력 방안을 모색하였다. 다만 시행기관 수준 논의 부족, 정보공유와 소통 등의 한계도 있다.
이러한 원조 선진화를 향한 한국 정부의 정책과 더불어 각 분야별, 부처별로 어떻게 협업할 것인지에 대한 구체적인 방안 모색의 요구도 높아졌다. 이에 따라 교육부도 교육개발협력사업의 독자적인 추진이 아니라, 협업활성화라는 정부의 정책기조를 반영하여 ｢교육 ODA 활성화 방안(시안) (2013.12)｣을 마련하였다(교육부, 2013). 그리고 통합추진체제에서의 교육 ODA 전략 마련을 목적으로 관계기관과 유기적인 협력 및 전략적 사업 추진을 통해 교육부의 강점을 살린 사업의 추진을 강조하였다. 이를 위해서 사업 2년 전 예비검토제 도입을 적극 활용하여 다른 ODA과의 전략적 연계를 시도하고, 교육부-외교부 (KOICA) 협업 강화를 주요한 정책 추진 방향으로 명시하였다(교육부, 2013). 또한 사업 전 주기에 걸친 외교부와의 협업체제를 구축, KOICA ODA 교육원과 협력, KOICA와 연 계한 패키지 지원 등, 각 기관 간의 강점과 비교우위를 최대한 활용하는 협력 방안을 제시 하였다. 이처럼 중앙정부 수준에서는 교육개발협력 사업의 추진에 있어서 부처간의 협업을 통한 효과성 제고에 대한 공감대가 형성되고 구체적인 협업 방안을 모색하는 단계에 이르렀다. 그러나 교육개발협력 관련 연구나 사업을 수행하는 시행기관 수준에서는 이러 한 논의가 부족할 뿐만 아니라, 정보공유와 소통에도 한계가 있다. 이로 인해 신규 참여기관이 시행착오를 답습하거나, 다양한 기관들의 사업 참여로 인한 사업 중복 문제도 반복 되고 있다.