M-BcN 구성 장비는 외산과 국산으로 이루어져 있는데 이들 간에 호환성이 떨어져 중앙 집권적인 네트워크 운용이 제한되고 유지보수에도 어려움이 있다.
셋째, M-BcN 구성 장비의 호환성 문제로서, 중앙 집권적인 네트워크 운용이 제한되고, 유지보수에도 제한사항이 있다. M-BcN의 광전송장비는 외산과 국산이 있으며, 이들 장비 간에는 호환성이 매우 떨어져 망관리 및 원격 제어를 통합적으로 수행할 수 없다. 현재 설치된 M-BcN의 광전송장비인 MSPP는 외산 제품으로, 국내에서 생산된 광전송장비를 설치할 경우 통합적인 망 관제가 제한된다. 이에 따라 최근에 네트워크 장비 보강을 추진했던 일부 부대에서는 특정 지역에만 1:1로 국산광전송장비를 설치하여 M-BcN에 연결하는 방식을 적용하여, 자체적인 망 감시, 대역폭 설정 및 운용 등의 망 제어를 실시하고 있다. 이러한 현상은 군에서 필요시 특정업체 장비에 의존할 수밖에 없는 구조를 만들게 되어, 신규 장비 설치가 어렵고 예비카드 확보 등 수리부속 조달 측면에서도 장애가 된다.