의료기관 내에서 왓슨을 어떠한 목적으로 사용하느냐에 따라 의료기기에 해당하는지 여부가 달라지므로, 의료현장에서는 왓슨을 전면적으로 의료행위에 활용해도 되는 것인지 의문을 품게 된다.
동 가이드라인안에 의한다면, 왓슨의 경우 의료용 빅데이터를 활용하고 기계 학습을 통하여 결론을 도출해내는 인공지능 기술을 적용하고 있지만, 의료기관 내에서 왓슨을 어떠한 목적으로 사용하느냐에 따라 의료기기에 해당하는지 여부가 달라질 수 있다. 만약 단순히 의료정보를 검색하기 위하여 왓슨을 이용하는 경우에는 의료기기에 해당하지 않을 것이며, 환자의 질병의 진단과 처방을 위해 왓슨을 이용한 경우에는 의료기기에 해당한다고 할 것이다. 동 가이드 라인안은 이와 같이 하나의 제품에 대하여 사용목적에 따라 의료기기 해당 여부가 달라지는 결과에 이르기 때문에, 의료현장에서는 왓슨을 전면적으로 의료행위에 활용하여도 되는 것인지에 대하여 의문을 가질 수밖에 없다.