재판부는 일본이 저지른 위안시스템과 관련해 일왕 히로히토 등 9명에게 강간과 성노예에 관한 직접책임과 지휘관 책임에 유죄를 선고하였다. 이때 직접책임은 고의적으로 교사, 방조 등의 범죄행위를 한 것이고, 지휘관책임은 부하의 범죄를 억제, 처벌하는 의무를 다하지 않은 것이다.
재판부는 일본이 피해국가에서 저지른 위안시스템(comfort system)과 관련하여 피고인 일왕 히로히토 등 피고인 9명에 대하여 인도에 반하는 죄의 강간과 성노예(sexual slavery)에 관한 직접책임[여성국제법정 헌장 제3조(1)]과 지휘관 책임[제3조(2)]에 대하여 각각 유죄, 일본군이 필리핀 마파니크(Mapanique)에서 저지른 대규모의 집단강간과 관련하여 피고인 일왕 히로히토에 대하여 인도에 반하는 죄의 강간에 관한 지휘관책임[제3조(2)]에 대하여 유죄, 일본군 14방면군 총사령관 야마시타 대장에 대하여 인도에 반하는 죄의 강간에 관한 직접책임[여성국제법정 헌장 제3조(1)]과 지휘관책임[제3조(2)]에 대하여 유죄를 선고하였다. 여성국제법정 헌장 제3조(1)의 직접책임은 고의를 가지고 실행, 교사, 방조와 같은 범죄행위를 한 것이고, 헌장 제3조(2)의 지휘관책임 (간접책임)은 부하 또는 하급자의 범죄를 방지, 억제, 처벌하여야 하는 의무를 고의 또는 과실로 이행하지 않은 것이다.