급여의 대상이 되는 수술 비용은 공적으로 결정되어 비급여 수술보다 낮아지기 때문에 요양기관에서는 비용 산정때문에 급여항목으로 편입되기를 원하지 않는 측면이 예상된다.
경우에 따라서는 요양기관이 예상되는 요양급여 비용의 산정에 만족하지 못하여 급여항목으로 편입되기를 원하지 않는 측면도 예상되는 바이다. 왜냐하면 급여비용의 산정에서 장비의 물리적 내구연한만을 고려한다면 빠르게 업그레이드 되는 의료기기의 경우 물리적 내구연한이 남아 있어도 기술적 내구연한이 매우 짧은 경우 비용산정에서 비합리적인 결과가 도출될 수 있기 때문이다. 그래서 비급여로서 인정되는 수술의 비용은 환자 쪽과 임의로 합의하여 결정될 수 있지만, 급여의 대상이 되는 수술의 경우 그 비용은 획일적으로 공적으로 결정되어 비급여의 경우보다 낮아지는 경향이 있다.