조직개편이 조직 간의 구조적･기능적･문화적 맥락이 고려되지 않고 물리적･ 구조적  결합수준을 벗어나지 못했으며 구조적･기능적 협업에도 한계가 있었다. 부처 간의 기능 재배열과 통합 기능, 업무에 대한 분석과 그 결과에 대한 다양한 예측이 선행되어야 한다.
이와 관련하여 과거 이명박 정부 시기 추진되었던 대부처 중심의 조직개편이나, 박근혜 정부에서 과학기술부문과 정보통신부문을 통합하여 설치한 ‘미래창조과학부’의 사례를 들 수 있다. 창조경제를 지향하며 첨단기술을 육성하고 우리나라의 산업경쟁력을 제고하기 위한 목표를 설정하고 ‘미래창조과학부’를 신설하는 과정에서 두 조직 간의 구조적･기능적･문화적 맥락이 충분히 고려된 것은 아니었다. 실제로 과학기술 부문과 정보통신 부문이 각각 제1차관실과 제2차관실로 분리･운영하는 상황에서 문화적･화학적 융합을 기대하기 어려웠을 뿐만 아니라 구조적･기능적 협업 촉진에도 한계가 있었다. 업무와 기능의 재설계를 토대로 정부혁신을 추구할 경우 화학적 융합이 토대가 되어야 함에도, 사실상 부처 간의 단순한 물리적･구조적 결합의 수준을 벗어나지 못했다는 것이다. 이는 부처 간의 기능 재배열과 통합 기능, 업무에 대한 분석과 그 결과에 대한 다양한 예측이 선행되어야 할 필요가 있음을 시사한다.