한편, 행정부는 조세지출평가서 및 계획서에 현황과 예산 명시로 사업 중복을 심층평가하는 제도 정비를 계획했으나, 유사 재정사업 소개 및 예산 규모 소개에 그친 것으로 나타났다.
한편, 행정부는 소관부처에서 작성하는 조세지출평가서 및 평가계획서에 관련 재정지출 현황과 예산 등을 명시하도록 하여 유사 · 중복 사업 여부를 파악하고 있다. 이를 토대로 재정지출과 유사 · 중복이 있는 것으로 판단되는 조세지출은 향후 조세지출 심층평가 대상으로 우선 선정되고, 심층평가를 통해 중복지원으로 판단될 경우 이들 제도를 정비할 계획이다. 그러나 2016년 ‘조세지출평가서’ 및 ‘조세지출평가계획서’를 살펴보면, 정책목적 및 주된 수혜대상 등의 유사성을 엄밀하게 판단하여 중복성 여부를 판단하는 것이 아니라, 유사 재정사업에 대한 소개 및 예산 규모 등을 소개하는 것에 그친 것으로 나타났다.