자유학기제는 학생들의 학습동기 유발과 교사의 직업적 보람을 유발하는 가치가 높은 제도이다. 이 제도는 급격한 학교 제도의 변화 없이 점진적인 교체가 가능하며, 한 학기 뿐만 아닌 다른 학년 혹은 학교급으로의 확대를 검토해야한다.
연구의 조사 결과에서도 나타났듯이 학생들은 자유학기 활동을 대단히 좋아하고 즐기고 있으며 전에 없이 활기가 넘치고 학습동기 유발에도 상당히 기여하고 있다. 교사들은 업무 부담에 힘은 들지만 교사로서 보람을 느끼고 적극적인 교육활동을 전개하는 것을 볼 수 있었다. 이러한 모습에서 볼 때 자유학기제의 교육적 가치는 대단히 높은 것으로 파악된다. 자유학기제의 교육적 가치는 특히 학교 제도를 바꾸지 않고 제도 내에서 다양한 프로그램 활동 전개를 통해 학교 제도적 구획 및 학교 내 생활의 원활한 전환에 기여한다는 점을 들 수 있다. 따라서 자유학기제의 이러한 교육적 가치를 중학교의 한 학기에만 제한하지 않고 다른 학년 및 학교급으로 확대·보급하는 것을 검토해 볼 필요가 있다. 우리나라 학교 제도 내에서 우선 가능하고 필요하다고 판단되는 학교급 최종 학년의 4/4분기를 전환 학년 개념의 자유학기제로 고려해 불 수 있다. 이를 통해 자유학기제의 확대·보급과 함께 학생들의 원활한 전환을 도모해 볼 수 있을 것으로 본다.