파일명 변경, 해쉬값 불일치를 보이는 일부 녹음파일들은 증거능력 부족으로 상고를 기각하였다. 그러나 주요 녹음파일에 대해서는 인위적 개작 없이 원본내용 그대로 복사된 사본임을 인정하여 항소심 선고를 확정하였다.
같은 맥락에서 녹음파일의 증거능력에 대하여 증거 녹음파일 중 파일명이 변경되거나 해쉬값이 일치하지 않는 일부 파일에 대해서는 원본의 내용 그대로 복사한 사본임이 증명되었다고 보기 어렵다는 이유로 상고를 기각하였다. 그러나, ‘5.12. 내란선동회합’ 등 주요 녹음파일에 대해서는 녹음을 한 제보자와 국정원 수사관의 증언 및 녹음파일을 감정한 대검찰청과 국립과학수사연구원의감정결과를 토대로, 증거 녹음파일 중 일부는 녹음 당시 대화 내용이 편집되거나 조작되지 않고 그 대화 내용 그대로 녹음된 원본임을 인정하였고, 녹음파일 사본에 대해서는 원본으로부터 복사하는 과정에서 편집되는 등의 인위적 개작 없이 원본내용 그대로 복사된 사본임을 인정하여 녹음파일의 증거능력을 인정할 수 있다고 판단하여 항소심 선고를 확정하였다.