운영 대상은 관할내 모든 어린이집이며 부모와 전문가가 1:1 비율로 10명 이내 구성된다. 여러 분야에 걸쳐 모니터링을 하며 모니터링단은 컨설팅 서비스를 제공한다. 결과는 심의사항에 포함되며 위반 행위 의심시 즉시 경찰 및 지자체에 통보한다.
운영 주체는 시·도지사 또는 시장·군수·구청장이며, 부모와 보육·보건전문가가 1대 1 비율로 시·군·구별 10명 이내로 구성된다. 대상 기관은 관할 지역내 모든 어린이집이며, 신청한 어린이집에 대해 우선적으로 실시한다. 모니터링 주요 분야는 ① 건강관리-영유아 예방접종, 응급조치 체계, 건강 검진 등, ② 급식관리-식단 및 영양, 조리, 식재료 관리 등, ③ 위생관리-급식 위생, 조리실 청결 등, ④ 안전관리-환경 안전, 차량 안전, 아동학대 예방 등이다. 모니터링단은 해당 분야에 대한 어린이집 운영 및 사후관리의 적정성 여부를 모니터링하게 되는데 모니터링 후 현장에서 컨설팅이 가능한 경우에는 바로 실시하며 어린이집의 요청이 있거나 필요한 경우에 컨설팅 서비스를 제공한다. 모니터링 결과는 해당 어린이집 운영위원회의 심의사항에 포함하고, 아동학대 등 법 위반 행위가 의심될 경우는 즉시 지자체 및 경찰에 통보해야 한다.