다수부처 연계사업에 대한 감사원의 기능이 강화됐을 때의 접근에 있어 다수부처 연계의 중요성 인식이 선행돼야 한다. 이후 부처 간 연계의 장애요인을 도출하고 연계의 성공요인 및 우수사례를 확산시켜야 한다. 끝으로 다수부처연계사업에 대한 종합적 점검이 요구되는데, 심화된 점검기준을 개발, 종합점검해야 한다.
선진국 최고감사기구의 감사 트렌드에 비추어볼 때, 다수부처 연계사업의 효과성과 관련하여 향후 감사원의 기능이 강화될 것으로 예상되는데, 이를 위한 단계적 접근방법을 제시하면 다음과 같다. 먼저, 다수부처 간 또는 다수기관 간 연계의 중요성에 대한 인식 공유가 필요하다. 서비스 및 기관 간 연계가 정책 및 사업의 효율성과 효과성 제고에 중요한 의미가 있다는 인식을 공유해야 할 것이다. 다음으로 기관 간 실질적 연계를 가로막는 요인에 대한 감사와 연구를 진행함으로써 연계의 장애요인을 도출해야 할 것이다. 기관 간 업무협약, 다양한 심급의 업무조정회의, 지역별 조정심의회, 데이터 공유 인프라 등 여러 가지 노력 및 수단 구축에도 불구하고 실질적인 연계가 잘 이루어지지 않는 원인에 대한 규명이 시급하다. 이와 동시에 연계의 성공요인 및 우수사례도 확산시킬 필요가 있다. 그리고 마지막으로 다수부처 간 연계사업에 대한 종합적인 점검이 필요하다. 본 연구에서 제시한 연계사업 점검 프레임워크를 기초로 정책부처, 중앙-지방, 공공-민간 등 다양한 연계유형에 따른 보다 심화된 점검기준을 개발하고 종합적인 점검을 수행해야 할 것이다.