SPS위원회를 통한 특정무역현안의 해결하는 방식의 장점은 현안을 사전에 공개하여 분쟁을 최대한 예방할 수 있다는 점, 다자적인 참여와 투명성 강화, 관련 국제기구측 대표들에게 문제해결 위한 정보 등을 제공받을 수 있다는 점 등이 있다.
전반적으로, SPS위원회를 통한 특정무역현안의 해결은 효과적인 수단이라 평가되어 왔다. 위원회 회의를 통해 특정무역현안을 해결하는 방식의 장점으로는, 첫째, ‘법적 분쟁’(legal disputes)으로 발전할 가능성이 있는 현안을 사전에 공개적으로 가시화하여 당사국들뿐 아니라 제3자인 그 밖의 회원국들이 다자적 차원에서 해결책을 모색하고 분쟁을 최대한 예방할 수 있다는 점, 둘째, 다자적인 참여와 투명성을 강화하는 기능을 할 수 있다는 점, 셋째, 관련 국제기구 즉 Codex, IPPC, OIE 측 대표들이 위원회 회의에 옵저버 지위로 참석하고 있기 때문에 기술적인 명확성을 제공 받거나 문제해결을 위한 정보 등을 제공 받을 수 있다는 점, 넷째, 특히 개발 도상회원국의 경우 SPS현안을 위원회에 회부하여 다자적으로 논의하고 전문적인 자문을 얻을 수 있음으로써, 과학˙기술적 측면에서의 역량부족, 선진국으로부터의 외교적 압력과 같은 문제를 극복할 수 있다는 점 등이 있다.