정부연구 개발사업은 해결과제를 정의하고 사업목표를 설정한 후 해결방법과 수행체계를 설정, 결과에 대한 평가를 하는 바, 이러한 과정은 관리시스템의 관리구조와 성격에 영향을 받는다.
정부는 과학기술 관련 문제해결활동 수행을 위해 정부연구 개발 사업을 추진한다.정부연구 개발 사업의 연구과제들은 해결해야 할 문제를 정의하여 사업목표를 설정하고 문제를 해결하기 위한 방법과 수행체계를 설정한다. 이러한 목표 설정 및 추진 방법 설계, 절차추진에 의해 문제해결활동이 이루어지고 창출된 결과에 대해 평가가 이루어진다. 이러한 일련의 과정은 기획, 수행, 평가라는 사업관리시스템의 관리과정을 통해 이루어지게 된다. 그리고 이러한 관리과정은 관리시스템의 구조적, 관리적 특성에 의해서 관리의 방향, 속성, 방법이 결정된다. 즉, 문제정의 및 해결과정은 관리시스템의 관리구조와 관리적 성격에 의해서 직접적인 영향을 받게된다.