일본 정부는 산학관 연계시스템 개혁을 위해 산학관 연계활동 자립화, 민간과의 공동연구 강화 등 여러 조치를 추진했다.
일본에서도 TLO 재정자립화 등 산학관연계시스템 개혁의 필요성이 대두되었다. 예를 들어  승인  TLO가  어려운  경영상황에  놓인  곳이  많고,  2007년도  대학내부  TLO이외의 33기관 중 15기관(45%)이 적자를 기록하였다. 이 때문에 대학 등 산학관연계활동의 자립 화를 촉진하고, 향후의 대학 등과 TLO의 산학관연계기능 최적화를 위해 산학관연계시스 템의  개혁  필요성이  제기되었다.  이에  따라,  일본정부는  산학관연계시스템  개혁을  위한 조사검토(단기), 대학 등 산학관연계활동 자립화, 산학관협동네트워크시스템구축(중기), 민 간과의 공동연구강화, 대학특허의 전략적 집적활용(단기) 등을 추진하였다.