전북이전추진단은 연수원장 주재로 월 1회 정례 회의를 개최했다. 이전자문단 위원들도 참여했으며, 유관기관 협의회도 월1회 개최했다. 그리하여 이전 시까지 추진단 회의를 총 31회, 유관기관협의회를 총 7회 개최했다. 또한 실무인력을 구성하고, 각 팀별로 연간 활동 계획서를 작성하도록 했으며, 소규모 연구용역도 실시할 수 있도록 했다.
2011년 4월 연수원 훈령으로 제정된 전북이전추진단의 구성 및 운영에 관한 규정(참고)에 따라 추진단이 운영되었다. 추진단의 운영은 추진단장인 연수원장 주재로 월 1회 정례 회의를 개최하되, 주요 현안사항 발생 시에는 탄력적으로 운영하였다. 또한, 각 팀별 정례 회의는 여건에 따라 월 1~4회 운영하였다. 이전자문단 위원은 격월로 추진단 정례 회의에 참여하고, 각 팀별로 자문 위원 협조가 필요한 사항이 있는 경우에는 수시로 협의와 자문을 실시하였다. 유관기관 협의회는 기획부장이 주재하여 월 1회 개최하고 협의회에서 제시된 사항은 추진단 정례 회의 시 보고하고 토론하였다. 그리하여 2011년에는 추진단 회의 7회, 유관기관협의회 2회, 2012년에는 추진단 회의 9회, 유관기관협의회 4회, 2013년에는 추진단 회의 15회, 유관기관협의회 1회를 개최하여 결국 2011년 5월 설립 이후 2013년 7월 이전 시까지 추진단 회의를 총 31회, 유관기관협의회를 총 7회 개최하였다. 한편, 팀별로 효과적인 업무추진을 위해 필요한 실무인력을 구성하고, 각 팀별로 연간 활동 계획서를 작성하도록 하였다. 또한, 각 팀별 활동 계획 수립 및 과제의 심층 연구를 위해 필요시 외부 자문 위원을 대상으로 소규모 연구용역를 실시할 수 있도록 하였다.