국토교통부는 구 국민안전처와 협의를 거처 물관리정보 송수신 기능을 물관리유통정보시스템이나 재난정보공동이용시스템 중 하나의 시스템으로 통합 관리하는 방안을 마련하여야 했다.
따라서 국토교통부는 구 국민안전처와 상호 협의절차를 거쳐 물관리정보유통시스템의 물관리정보 송수신 기능에 대하여 신규연계 대상기관, 시스템 구축비용, 유지보수비, 시스템 운영의 안전성 등을 종합적으로 고려하여 물관리정보 송수신 기능을 물관리유통정보시스템 또는 재난정보공동이용시스템 중 하나의 시스템으로 통합하는 방안을 마련하고 이에 따라 운영이 중단되는 시스템 자원에 대해서는 재활용하는 방안을 마련하며, 구 국민안전처는 기관 간의 협의를 제대로 이행하지 않아 중복된 송수신 기능 구축·운영에 따른 불필요한 예산이 낭비되지 않도록 국토교통부의 물관리정보 송수신 기능을 통합관리하는 방안을 마련하여야 했다.