법제처의 법령 해석 시기를 주관 부처와 제도 변경에 따라 구분하면, 정부 수립 후에 국무총리 배하 법제처에서 담당하였고 그 후 법무부 법제실에서 주괸하였으나, 1960년 법제처로 승격 이후에도 계속 법무부에서  법령 해석을 하였다. 이는 헌법 정신과 ｢정부조직법｣ 목적을 신중히 검토하지 않고 진행한 정부 조직 개편의 영향인 것으로 판단된다.
법제처 법령해석의 역사에 대한 시기를 구분하는 기준은 여러 가지가 있을 수 있지만 법령해석업무 담당주체의 변화를 중심으로 하여, 관계법령이 개정됨에 따라 법령해석의 요청주체가 확대되고 제도에 주요한 변화가 발생한 시기에 따라 구분을 하고자 한다. 이는 법제처의 기존 구분방법과도 동일한 맥락이라 할 수 있겠다. 먼저, 연혁적인 측면에서 보면 정부 출범 직후부터 헌법의 개정으로 법제처가 소속되어 있던 국무총리제도가 폐지되어 법무부에 통합되기 전까지 법령해석업무는 법제처 소관업무로 되어 있었으며, 1955년 국무총리제도가 폐지됨에 따라 법제처가 법무부 법제실로 통합된 뒤에도 법제실은 별도의 직제를 두어 독립적으로 법령해석업무를 계속 수행하여 왔다. 1960년 법제실이 국무원사무처 소속 법제국으로 개편되었다가, 내각의 독립부처인 법제처로 승격됨에 따라 종전의 법제업무가 법제처로 이관되었으나 법령해석업무는 표면적으로는 이관되지 않았는데, 이처럼 법령해석업무가 법무부에 일시적으로 남는 것처럼 된 이유는 법령해석업무의 특성이나 양부처의 관장업무의 특성을 고려한 후에 업무를 분장한 것이라기보다는 헌법 정신과 ｢정부조직법｣의 입법취지에 대한 성찰 없이 양 부처를 통합 재분리하는 정부조직개편의 혼란 과정에서 발생한 결과라고 보는 것이 타당하다.