통행료 종합수지율은 통행료 수입으로 자금을 충당할 수 있는지 나타내주는 지표로서, 통행료 수입을 건설투자비와 도로운영비, 차입금이자를 더해 나누어 산정한다. 통행료 적절성을 판단하는 지표로는 한계가 있다.
통행료 종합수지율은 통행료 수입으로 고속도로의 건설과 운영 및 차입금 이 자를  충당할 수 있는지 여부를 나타내주는 지표로서, 통행료 수입을 한국도로공사 의 도로건설투자비와 도로운영비, 차입금이자의 합으로 나누어 산정한다. 그런데 통 행료 종합수지율은 한국도로공사의 당해연도 도로건설투자비에 따라  편차가 크다. 도로건설투자비가  1조9,287억원으로  컸던 2010년의 통행료 종합수지율은  60.7%였 으나 다음해에 도로건설투자비가  1조3,243억원으로 감소하자 통행료 종합수지율은 70.3%로 10%p 가까이 상승했다. 이는 전체적인 원가 수준의 변화와는 관계없이 당 해연도의 투자비에 따라 변동하는 개념이라는 점에서 통행료 수준의 적절성을  판단 하는 지표로 한계가 있다.