세관의 주요 업무는 수입관세의 산정과 징수, 관세관련 사기 방지, 수출규제 법규의 집행 등 19세기 중반의 업무가 그대로 존속되고 있으며 '88년 면세판매사업 규제 업무가 추가되었다.
세관의 주된 업무는 본질적으로는 19세기 중반까지 세관이 담당한 바 그대로 존속하고 있다. 이 임무에는 1930년  관세법(Tariff  Act  of 1930)에 따른 수입관세의 산정과 징수, 미국으로 들어오는 사람, 수송설비, 화물 그리고 우편물에 관한 서류작성, 관세관련 사기의 방지, 수출관리 법(Export Administration Act) 등 수출규제법규의 집행, 각종 항해법규 의 관장, 마약 및 기타 금제품 밀수 방지를 위한 법집행 책무, 각종 소비 자 보호 법규의 집행, 사기적 수출입 무역관행의 방지 그리고 은행보안법 (Bank Secrecy Act)상의 보고 요구의 집행 등이다. 1988년 의회는 또한 면세판매사업의 규제를 업무로 추가시켰다.