사례관리기관은 많으나 사례의 특성에 따른 주 관리기관과 관리자의 배정과 여러 기관의 협력이 필요한 사례에 대한 총괄적인 조정을 담당하는 기능이 없는 것이 문제다.
한편 드림스타트와 일부 동 주민센터에서도 사례관리 업무를 맡고 있고, 민간 기관인 건강가정 지원센터, 사회복지관에서도 사례관리가 기본 업무로 이루어지고 있지만 주 사례관리기관을 배정하는 등 총괄 조정 기능이 부재한 상황이다. 이로 인해 유사업무 추진 시 공공과 민간 기관이 협업보다 경쟁관계에 놓이는 경우까지 일부 발생하고 있다. 사례관리기관은 난립해 있으나 사례의 특성을 고려하여 주 사례관리기관과 사례관리자를 배정하고, 경우에 따라 다기관이 협력적으로 개입해야 하는 사례에 대한 총괄적인 조정을 담당하는 기능이 부재한 것이 문제점으로 지적된다.