이 사건 제9항 발명의 특징적 구성은 의약 물질의 투여 방법에 관한 것이기 때문에 특허 받을 수 없는 의약을 사용한 의료행위 등은 진보성 판단에 고려될 수 없다. 
이 사건 출원 발명의 특허 청구 범위 제9항(이하 ‘이 사건 제9항 발명’이라 한다)은 공지의 물질인 비스포스네이트의 투여주기와 단위투여량을 특징으로 하는 조성물 발명인데, 이와 같은 이 사건 제9항 발명의 특징적 구성은 조성물인 의약 물질을 구성하는부분이 아니라 의약 물질을 인간 등에게 투여하는 방법이어서 특허를 받을 수 없는의약을 사용한 의료행위이거나, 조성물 발명에서 비교대상발명과 대비 대상이 되는그 특허 청구 범위 기재에 의하여 얻어진 최종적인 물건 자체에 관한 것이 아니어서, 이 사건 제9항 발명의 진보성을 판단할 때 이를 고려할 수 없다.