UR 보조금협정 제9조는 허용보조금 프로그램이 국내 산업에 심각한 유해효과를 불러올 때 회원국의 이의제기를 허가하고 있다. 이의신청 후 상무부는 분석 의무를 가진다.
UR 보조금협정 제9조는 허용보조금 프로그램이 제8조 제2항에 규정된 기준에 합치된다고 할지라도 국내 산업에 ‘심각한 유해효과(serious adverse effects)’를 초래하는  경우에  회원국으로 하여금  그 허용보조금에 대하여 이의를 제기할 수 있도록 규정하고 있다. 이에 따라 미 우루과이라운드협 정법 제281조 (e)(2)항은 미국 산업이 상무부에 ‘심각한 유해효과’를 주장하는 신청서를 제출할 수 있다고 규정하고 있다. 이러한 경우 상무부는 가능한 신속하게 그 신청서에 대한 분석을 끝내야 하며, 필요할 경우 국제무역위원회에 자문을 구할 수 있다.