신탁 실체설은 신탁도 관설보다 세무처리가 훨씬 간단하지만, 이중과세가 야기될 위험이 있지만 신탁도 관설은 실질과세원칙에는 부합하나, 수익자가 상당히 다수인 신탁의 경우 과세관청과 원천징수의무자에게 행정상 큰 부담을 준다는 단점이 있다.
그런데 신탁실체설은 신탁재산에 귀속되는 모든 수입과 지출은 외견상 신탁재산에 귀속되는것으로 나타나는 점에 부합하고, 신탁도관설에 비하여 세무처리가 훨씬 간단하다는 등의 장점이 있다. 그러나 국세기본법 제14조에서 정하는 실질과세의 원칙에 반하며, 신탁재산 단계와 수익자 단계에서 이중과세가 야기될 위험이 있다는 등의 단점이 지적된다. 반면 신탁도관설은 실질과세원칙에는 부합한다는 등의 장점이 있으나, 신탁재산의 소득 실현 시기와 수익자의소득 실현 시기 사이에 차이가 발생하는 점을 설명할 수 없고, 수익자가 상당히 다수인 신탁의 경우 과세관청과 원천징수의무자에게 행정상 큰 부담을 준다는 점 등의 단점이 지적된다. 이에 현행 세법은 원칙적으로 신탁도관설에 입각하여 납세의무의 내용을 규율하고 있으나, 일부 신탁 거래에 대해서는 정책적 목적과 과세의 효율성 등을 감안하여 다르게 취급하고 있다.