바람직한 대학구조조정방식은 비영리법인이라는 전제하에 투명한 공시를 전제로 경쟁력 없는 대학을 퇴출 시키는 식으로 전개되어야 한다.
그렇다면 바람직한 대학구조조정방식은 어떠한 것이어야 할 것인가? 대학은 비영리법인이라는 제약 하에서 대학의 성과(예컨대 학과별 취업률, 학과별 평균임금, 학과별 졸업생의 취업업체 및 진로 등)와 운영 결과의 투명한 공시를 전제로 자율적인 정원조정의 준시장적 경쟁을 통한 경쟁력 없는 대학의 퇴출이 가장 바람직한 방안일 것이다. 학생들의 선택을 받지 못하는 대학, 즉 학생 충원율이 지속적으로 낮은 대학은 퇴출시켜야 하는데, 이에 대한 명확한 매뉴얼이 마련되어야 할 것이다. 좀 더 구체적으로 사립대학 구조조정방식은 다음과 같은 내용을 담아야 할 것으로 사료된다.