보건복지부의 의료기관의 해외진출을 지원하는 펀드는 담보를 확보해야 하고 이자율은 10%에 달하며 상환기간도 3~5년으로 짧아 효과가 크지 않다. 따라서 대부분의 의료기관은 투자재원을 자체적으로 조달하고 있다.
앞서 언급한 바와 같이, 보건복지부는 해외진출을 준비 중인 의료기관을 대상으로 해외진출지원 펀드를 운용하고 있으나, 현재는 펀드 운용이 경직되어 있어서 효과가 크지 않다는 지적이 있다. 우선, 펀드를 지원받기 위해서는 대출금에 상당하는 담보를 확보하여야 하는데, 중소의원은 이러한 담보능력을 가지고 있는 경우가 많지 않다. 또한 이자율이 10%로 되어 있어서 금융기관에서 대출받는 것에 비해 크게 유리하지 않다. 그리고 상환기간이 3~5년으로 제한되어 있는데, 중국 진출 이후 이 기간 내에 충분한 이익을 확보하여 대출받은 자금을 모두 상환하는 것은 매우 어려운 일이다. 이러한 이유로 아직까지 해외진출 지원펀드의 이용실적이 거의 없는 상황이며, 대부분의 해외진출 의료기관들은 투자재원을 자체적으로 조달하고 있다.