지역사회를 기초로 한 교육공동체 거버넌스의 운영을 위해서는 주민들의 자발적·자생적 참여가 바탕이 되어야 한다. 이를 위해 지역주민들의 교육네트워크 형성과 지역사회 건강배움터조성, 생태적 학습공동체 구축이 필요하다.
교육자치와 일반자치의 협력만으로는 마을교육공동체를 위한 생태적이고 협력적인 거버넌스 를 완성할 수 없다. 주민들의 자발적·자생적 참여를 바탕으로 한 주민자치가 합류해야 비로소 지역사회를 기초로 한 교육공동체 거버넌스가 실천적으로 운영될 수 있다. 때문에 지역사회가 마을교육에 대한 올바른 인식을 공유하고 이를 실천하기 위한 참여와 협력을 활성화시켜야 한다. 이를 위해 지역의 물적·인적 자원 개발에 적극적으로 참여할 수 있는 발판으로써 지역 주 민들의 교육 네트워크를 형성해야 한다. 또한, 일반 주민자치 활동과 교육 주민 자치 활동을 연계해 지역사회를 건강한 배움터로 조성하는 것 그리고 생태적 학습공동체를 구축하는 일이 궁극적으로 지역 주민의 삶을 향상시키는 것과 같은 활동임을 인식하고 이를 실천해야 한다.