통일부는 통일교육 체계의 중심축으로 방향성 및 내용의 지침을 제공하며 학교 통일교육과 학교 밖 사회통일교육은 각각 교육부, 관련 정부기관 및 민간단체를 통해 이루어진다.
통일교육은 크게 초･중･고등학교 및 대학교 등 제도화된 교육기관에서 학생들을 대상으로 이루어지는 학교 통일교육과 학교 밖에서 이루어지는 사회통일교육으로 나뉜다. 1999년 제정된 통일교육지원법에 따라 통일부가 통일교육 정책을 수립･조정･종합하는 기능을 갖게 되면서 통일교육 체계의 중심축으로 기능하고 있다. 통일부는 통일교육의 전반적 방향성 및 내용에 관한 지침을 제공한다. 사회통일 교육은 지역통일교육센터, 통일교육위원협의회, 통일교육협의회, 기타 정부기관 및 민간단체 간 네트워크를 통해서 이루어지며, 학생과 교사를 대상으로 한 학교통일 교육은 통일부가 제시한 통일교육 지침에 따라 교육부가 총괄한다.