의료급여 환자의 입내원일수도 진료건수 외의 의료이용 증가를 보여주는데 이는 2009년 이후에도 증가추세에 있다. 의료급여 대상자의 진료건수와 입내원일수 모두 지속적으로 증가하고 있다.
진료건수 외에 의료이용 증가를 보여주는 지표는 의료급여 환자의 입내원일수이다. 입내원일수 또한 진료건수와 유사하게 2000년 이후 상당한 증가세를 보이고 있으며, 차상위 계층이 빠진 2009년 이후에도 증가추세에 있다. 입내원일수의 2000~2012년 기간 동안의 연평균 증가율은 진료건수 증가율 14.5%보다는 완만한 5.6%의 증가율을 보였다. 입내원일수는 외래보다는 입원의 경우 증가율이 큰 것을 볼 수 있다. 의료급여 대상자가 감소추세에 접어든 2000년대 이후도 입내원일수는 줄어들지 않고 있어, 의료급여 대상자의 진료건수와 더불어 입내원일수도 증가하는 등 의료 이용이 증가하고 있음을 보여준다. 1인당 입내원일수는 2009년 이후에도 지속적으로 증가하고 있는 것을 볼 수 있는데, 특히 입원의 입내원일수 증가폭이 큰 것을 볼 수 있다. 2000~2012년간 1인당 입내원일수는 연평균 6%의 증가율을 보이고 있다.