성별영향분석평가제의 목적은 성 중립적 정책에서 성 인지적 정책으로 개선이다. 성별영향분석평가 결과는 정책환류로 연결시켜야 하는데, 공무원의 순환보직으로 성별영향분석평가센터 연구원이 정책 개선의 이행 여부를 확인하는 경우도 있었다.
성별영향분석평가제도의 일차적인 목적은 성 중립적인(gender-neutral) 정책을 성 인지적인(gender-sensitive) 정책으로 개선하는 데 있다. 따라서 성별 영향분석평가 대상과제를 선정하고 분석평가서를 작성하는 목적은 성차별적일 수 있는 정책 내용을 성평등한 방향으로 개선하는 데 있기 때문에 이 제도의 핵심은 성별영향분석평가 결과를 정책환류로 연결시키는 것이다. 본 연구의 조사결과에서 알 수 있듯이, 성별영향분석평가 결과 제시된 정책 개선 이행은 다양한 방식으로 나타났다. 이때 공무원이 정책개선 이행 여부를 점검하는 경우가 대부분이지만, 공무원의 잦은 순환보직으로 인해 정책 개선이 원활하게 이루어지지 않는다는 점을 고려해서 성별영향분석평가센터의 연구원이 법령과 지침 개선 여부를 자료로 확인하거나 공무원에게 정책개선 이행 여부를 확인하는 경우도 있었다.