주민자치센터 프로그램은 '평생교육' 프로그램을 이용하여 주민자치의 새로운 관계 설정이 아닌 실제 평생학습에 대한 이해가 충분하지 않은 사람들이 논의의 중심에 있다. 주민자체센터의 공적 평생교육프로그램을 보다 전문적이고 지역사회적 구성을 강화해야 한다. 
그동안 몇 차례의 주민자치센터 개편 방안이나 2014년 지방행정체제 개편 논의에서 읍․면․동 주민자치회 모형을 연구하면서 주민자치센터 프로그램에 대한 반성과 개선 방향이 제시되어 왔다. 이는 그동안 관행적으로 ‘평생교육’이라 불리던 프로그램들에 대한 오해에서 생긴 문제라고 할 수 있다. 지자체의 평생학습 정책과 주민자치의 새로운 관계 설정이 필요하지만 실제 그 논의의 중심에 서 있는 정책개발자들이나 학자들, 시민활동가들이 평생학습에 대한 이해가 충분하지 않다는 난점을 가지고 있다. 이는 주민자치를 사회 참여라는 활동 형태로만 인식하여 그 실천의 주체 형성과정의 교육적 가치에 보편적 공유 인식이 충분하지 않기 때문이다. 결국 한국 평생교육 실천에서 지역에 뿌리내리는 주민 학습의 중요성을 사회적으로 설득해야 하는 시점인 것이다. 따라서 주민자치센터의 공적 평생교육 프로그램은 보다 전문적 관점과 지역사회적 구성을 보강하지 않으면 안 되는 것이다.