잠수함이 조난되면 4단계에 걸쳐 구조를 실시한다. 첫 번째 음탐장비나 조난통신 주파수 등을 통해 조난 위치를 파악한다. 두 번째 구조함을 잠수함 상부에 고정시키고 유인 또는 무인탐색을 실시하여  잠수함 및 해저 상태를 파악한다. 세 번째 심해잠수구조정 및 심해잠수체계를 통해 승조원 구조작업을 실시한다. 네 번째 환자를 자체 치료하거나 병원으로 이송한다.
잠수함이 조난되었을 경우 첫 번째 단계는 조난 잠수함의 위치를 파악하는 것이다. 이는 주로 잠수함 구조함에 탑재된 음탐장비(sonar)나 잠수함 조난통신 주파수(HF, UHF), 수중통신장비를 통해 이루어진다. 조난 잠수함의 위치가 파악되면 자동함위유지장치 등을 이용하여 구조함을 조난 잠수함의 상부에 고정시키고, 잠수사를 이용한 유인탐색이나 수중무인탐사기(ROV: Remotely Operated Vehicle)를 이용한 무인탐색을 실시하여 조난 잠수함 및 해저 상태를 파악한다. 즉 해저지형, 사고 잠수함 주위의 수심, 수중시정, 경사도, 묻힌 깊이 등 침몰된 잠수함의 조난상태, 구조 중 예상되는 위험도 등 획득된 정보를 종합하여 조난 잠수함의 상태를 파악한다. 다음으로 심해잠수구조정(DSRV: Deep Submergence Rescue Vehicle) 및 심해잠수체계(DDS: Deep Diving System)를 이용하여 조난된 잠수함의 승조원 구조작업을 실시한다. DSRV는 구조함에서 진수되어 조난 잠수함에 접근하여 탈출해치 상에 위치하게 되면 접합부에 안착하여 스커트 내의 해수를 배출하여 흡착력을 발생시켜 수밀을 유지한 채 승조원을 구조한다. 구출된 잠수함 승조원은 구조함의 함상감압챔버(DDC: Deck Decompression Chamber) 및 함 자체 의료설비로 치료를 하거나 필요시 헬기를 이용하여 환자를 육상병원으로 이송하여 구조를 실시하게 된다.