공급인증서 가격의 변동부분은 국내외 전력시장에 대한 구조차이 이해가 필요하다. 국내는 REC시장 형성 및 활성화를 위한 RPS의무 부과를 하였으나, 대부분 신재생 에너지 발전 사업이므로 수익이 감소된다.
공급인증서 가격 안정화 정책 제시에 앞서 국내 외 전력 시장 구조차이에 대한 이해가 필요하다. 왜냐하면 전력시장 구조의 근본적인 차이로 인해 공급인증서 가격의 변동이 커지는 부분이 있기 때문이다. 국내의 경우 REC 시장 형성 및 활성화를 위해서 독점인 판매사 대신에 다수의 발전사에 대해 RPS 의무를 부과하였다. 다수의 플레이어인 발전사가 시장에 참여하는 경쟁구도를 마련한 것이다. 하지만 국내 발전사의 대부분이 신재생에너지 발전 사업에 참여하고 있기 때문에 발전사 입장에서는 REC 가격이 하락할 경우 발전 수익이 감소하게 된다. 그러므로 REC 매입 당사자인 RPS 의무사가 동시에 신재생에너지 전력을 공급하는 구조에서는 REC 가격 하락의 유인이 크지 않다는 모순이 발생한다.