지역 차원에서 혁신생태계는 지역문제를 해결하는 차원에서도 고려될 수 있으며 산업 위주로 추진되어 왔던 한계를 극복하기 위해 지역 차원의 인적자원 역량에 바탕을 두어야 한다.
첫째, 지역 차원에서 혁신생태계는 전통적인 산업정책 이외에도 지역문제를 해결하는 차원에서도 고려될 수 있다. 이제 지역혁신체제 또는 혁신클러스터는 산업 위주로 추진되어 온 한계를 극복하기 위하여 인적자원에 바탕을 두는 새로운 혁신생태계의 필요성이 제기된다. 스마트전문화(smart specialization), 트리플헬릭스(triple helix), 지식트라이앵글(knowledge triangle) 등은 새로운 지역혁신생태계에 대한 이론이다. 한편 지역특화자원을 활용하거나 지역문제를 해결하는 방식에 있어서도 혁신생태계가 새롭게 구축될 필요성이 있다. 산업, 과학기술, 대학 등에서 지식의 창출․활용을 통한 혁신생태계는 지역 차원의 인적자원 역량에 기반을 두고 확충될 수 있다.