신산업분야 민간자격은 해당 등록기관이 산업 관련 관리 법률 규정을 집행하는 부처를 주무부처로 정하고, 유사한 자격의 주무부처는 등록관리자문위원회를 통해 협의한다.
따라서 신산업분야 민간자격의 경우 해당 산업에 대한 관리 법률 규정을 집행하는 부처를 주무부처로 정해 주는 것이 적절할 것이다. 현재의 주무부처는 해당 자격의 등록기관이 정하도록 하고 있으나, 유사한 자격의 주무부처를 결정할 때에는 ｢자격기본법｣에 따라 민간자격등록관리자문위원회의 심의를 거쳐 정하도록 한다.(국가법령정보센터 인터넷자료, 2017a) 예컨대 3D프린팅과 관련된 자격은 산업통상자원부가, 빅데이터 관련자격은 과학기술정보통신부가, 드론 관련 자격은 국토교통부가 주무부처가 되도록 가이드해 줄 필요가 있거나 등록관리자문위원회를 통해 협의하도록 한다.