신길중은 교과 시수를 한 시간씩 전환 및 감축하여 오후의 자율과정으로 재편성했다. 감축된 교과는 오후의 자율과정과 연계 또는 교사의 자율적인 교과 구성을 통해 진행하였다.
신길중은 이와 같은 형태로 교육과정을 운영하기 위해 기존의 교과 수업에 배당된 시수를 일부 조정하였다. 국어, 영어, 수학, 과학, 도덕, 한문 수업의 교과 시수를 각 한 시간씩 전환하거나 감축하여 오후의 자율과정으로 재편성하였다. 그 결과 교과로 이루어지는 교과 수업은 주당 20시간 정도로 오전에 이루어졌다. 시수가 감축된 교과의 경우, 일부 교과는 관련된 내용을 자율과정으로 전환하여 교과 연계 프로그램을 오후에 운영하기도 하고, 다른 일부 교과는 줄어든 시간 동안 지엽적이고 단편적인 지식 전달의 수업 대신 핵심 성취기준을 중심으로 교사가 수업을 자율적으로 재구성하여 진행하였다.