창업초기기업의 경우, R&D지원효과는 우수하지만 정부의 중소기업지원 R&D사업에서 차지하는 비중은 낮으며, 창업초기기업 지원의 50% 이상이 창업초기기업전용R&D사업인 “창업성장기술개발사업”에 편중되어 있다. 
이 중 업력 5년 미만의 창업초기기업 전용 R&D사업인 “창업성장기술개발사업”의 지원과제 2,807건을 제외하면, 업력 5년 미만 기업의 지원비중은 전체 중소기업 지원과제의 15.6%(3,570)로 나타나며, 이중 업력 3년 미만 기업은 전체 중소기업 지원과제의 6.8%(1,562건)에 불과하다. 업력 5년 미만 창업초기기업 지원과제의 예산 비중도 [표 13]과 같이 조사대상 중소기업 지원과제 전체 예산의 12.8%(6,679억원)로 나타나고 있으며, 이중 “창업성장기술개발사업”을 제외하면 9.9%(4,823억원) 수준이다. 즉, 창업초기기업의 경우, R&D지원효과는 우수하지만 정부의 중소기업지원 R&D사업에서 차지하는 지원 비중은 낮게 나타나고 있으며, 창업초기기업 지원의 50% 이상이 창업초기기업전용R&D사업인 “창업성장기술개발사업”에 편중되어 있음을 알 수 있다.