과학기술부로 개편할 경우 에너지 업무의 특수성과 전문성을 감안해 별도의 조직인 ‘에너지개발청’으로 분리, 신설하여 법률입안기능을 부여하고  이를 통해 에너지자원기능을 관리중심에서 개발중심으로 전환하는 방안을 검토할 필요가 있다.
다만, 과학기술부로 개편할 경우, 헌법상의 자원개발기능을 강화하기 위하여 과학기술부에 “에너지개발청”을 신설하는 방안도 가능하다. 헌법 제120조제1항에서 ‘광물 기타 중요한 지하자원･수산자원･수력과 경제상 이용할 수 있는 자연력은 법률이 정하는 바에 의하여 일정한 기간 그 채취･개발 또는 이용을 특허할 수 있다’고 규정되어 있다. 헌법규정에 표현된 에너지 업무는 국가정책적인 중요성과 함께 개발이용에 대한 집행적 성격의 기능을 전제하고 있다. 에너지 업무의 특수성과 전문성을 감안하여 별도의 청 단위 조직으로 구성하되, 현재의 중소기업청이 입법기능을 수행한 것과 같이 법률입안기능을 부여하는 방식으로 운영할 필요가 있다. 이를 통해 에너지자원기능을 과거 관리중심에서 개발중심으로 전환하고, 과학기술 개발 차원에서 별도의 ‘에너지개발청’으로 분리 설치하는 검토할 필요가 있다.