다양한 교육정책 사업들이 중복되어 운영되는 등 정책의 구체성 및 실효성 부족으로 학교가 중심이된 통합 지원을 이끌어 내는 데 어려움이 있다. 따라서 학교 차원에서 학생을 중심에 둔 통합 지원 체제를 만들고, 이를 바탕으로 교육청 및 교육부 등의 교육정책 사업 계획 및 운영을 기대해야 한다.
지금까지 여러 수준에서 다양한 교육정책 사업들이 중복되어 운영되면서 예산 활용, 대상 학생 선별과 지원 과정에서 사각지대 발생 등 부작용이 많이 보고되고 있다. 학생 맞춤형 다층적 지원이 필요함에도 불구하고 각 사업 간 연계 또는 이를 체계적으로 조정할 수 있는 기제가 제대로 작동하지 못하는 것도 현실이다. 통합 지원의 필요성을 인식하고 각 사업 간 연계 및 통합을 위한 여러 방안들이 제시되고 있지만, 여전히 정책의 구체성 및 실효성 부족 등으로 학교가 중심이 된 통합 지원을 이끌어 내는 데는 어려움이 있다. 국가 및 시·도교육청 수준에서의 사업 간 연계 및 통합의 어려움이 학교에 그대로 반영되기도 한다. 그렇지만 학습부진 학생 지원의 절박한 문제를 해결하기 위해서는 학교 밖 조직의 변화를 기대하기보다 학교 차원에서 학생을 중심에 둔 통합 지원 체제를 만들어 내고, 이를 바탕으로 시·도교육청, 교육부 등의 교육정책 사업 계획 및 운영을 바꾸기 위해 노력해야 한다. 학생의 변화는 학교 밖뿐 아니라 학생을 중심에 둔 교원과 학교장의 협력적 수업 및 학교 운영에 달려 있기 때문이다.