프로젝트가 잘 실행되도록 관리하기 위해서는 기업, 재직자, 실업자의 참여 활성화를 위한 인센티브 시스템의 구축과 프로젝트를 관리할 조직이 필요하다. 또한 이 관리 기구는 기획 역량, 스텝, 자금 등을 갖춰야 한다.
기업, 재직자, 실업자의 참여 활성화를 위한 인센티브 시스템의 구축과 더불어 전문적으로 JobRotation 프로젝트를 관리할 기구(조직)가 필요하다. 프로젝트가 잘 실행될수 있도록 하는 관리가 매우 중요하기 때문이다. 특히 중소기업이 주 대상인 경우 중소기업 참여 설득, 이들 중소기업에서의 숙련수요 파악, 필요 숙련에 맞는 교육훈련과정 설계 및 교육훈련기관과의 매칭, 대체근로자에 대한 사전교육훈련, 멘토링 등에서 프로젝트 관리 기능이 요청된다. 여러 이해당자자들(기업, 노조, 사용자단체, 교육훈련기관, PES 등)간의 이해관계 조율도 관리기구가 수행해야 할 중요한 역할이다. 이 관리 기구는 기획 역량, 스텝, 자금 등을 갖춰야 한다. 덴마크에서는 AOF가 지역 차원의 코디네이션 기관으로 기능하고 있다. AOF는 민간, 비영리 훈련 조직이다. JobRotation은 8개의 지역 AOF에 의해 시행되고 있으며, AOF를 통해 지역 차원의 숙련 수요에 대해 분기별, 산업부문과 직업별로 조사가 이루어지고 있다.