성별영향분석평가제도의 실효성을 높이기 위한 방안으로 제도운영 측면에서는 4가지 별로 분석하는 것, 협력체계 측면에서는 2가지 협력 유형으로 나누어 구분하여 제도운영의 사례를 분석하는 것이 있다.
또한 성별영향분석평가제도의 운영현황을 파악하고 협력체계의 유형을 분석함으로써 이 제도의 실효성을 높이기 위한 방안을 제시하고자 한다. 먼저, 제도운영의 측면은 4가지 단계별로 분석하고자 한다. 즉, 성별영향분석평가 교육・컨설팅 등의 투입(input) 측면, 성별영향분석평가 부서간 협조 및 분석평가서의 실행(implementation) 측면, 제도운영의 추진결과에 해당되는 산출(output)의 측면, 제도운영을 통한 성평등 실현에 해당하는 성과(outcome)의 측면에서 제도운영의 현황을 파악하고자 한다. 또한 협력체계의 측면은 정부기관에서의 협력과 민관협력의 유형을 공무원 중심의 전문가 협력형, 전문가 중심의 공무원 협력형, 공무원-전문가-시민단체 협력형으로 구분하고 제도운영의 사례를 분석하고자 한다.