원전은 기술적인 측면에서는 중대 원전사고가 발생할 확률이 매우 낮지만 실제로 심각한 원전사고가 과거에 발생했었고 이는 중대 원전사고 발생확률에 대한 충분한 논의 및 합의점이 없다는 한계점을 시사한다.
원전 외부비용 추정의 또 다른 한계점은 ‘중대 원전사고 발생확률’ 에 대한 충분한 논의 및 합의점이 없다는 점이다. 원자력발전 설비는 설계단계에서 확률론적 통계 방법을 통해 규제기관이 설정하고 있는 원전사고 발생확률 기준을 만족시켜야 한다. 즉 원전은 기술적인 측면 에서는 중대 원전사고가 발생할 확률이 거의 없다고 볼 수 있다. 그러나 TMI, 체르노빌, 후쿠시마 등 심각한 원전사고가 실제로 발생하였고, 이는 확률론적 방법을 통해 도출한 원전사고 발생 확률과는 정면으로 배치되고 있다. 따라서 ‘중대 원전사고 발생확률’ 추정을 위한 종합적인 연구가 수반될 필요가 있다. 중대 원전사고 발생 확률은 원자로 노형, 원자로 수명, 규제체계의 투명성 등 기술적·제도적 요소에 따라 달라질 수 있으므로, ‘사회적 논의기구’에서 해당 분야의 전문가 도 다수 포함할 필요가 있다.