북한에서의 조선산업은 다양한 문제가 있다.  먼저 북한에 대한 이미지가 대체로 부정적이어서 원산지에 대한 신뢰도가 문제 될 수 있다. 그리고 선박 건조에 필요한 일부 품목이 국제전략 물자 수출통제 체제에 의한 제약으로 반출이 어렵다. 마지막으로 전력 및 강재 등의 공급이 원활치 않을 수 있다.
조선산업의 경우 전반적인 원산지 문제에 더하여 고가의 단일 제품이 거래된다는 점에서 북한에서 생산된 제품의 신뢰도가 문제가 될 수 있다. 즉, 선박이나 해양플랜트의 경우 선주들의 입장에서 보면 북한에서 선박 블록이나 기자재를 건조할 경우 리스크가 커지는 측면이 있고, 북한에 대한 이미지가 대체적으로 부정적이므로 선주들의 선박 발주에 영향이 있을 수도 있다는 문제가 있다. 아울러 국제전략 물자 수출통제 체제에 의한 제약도 고려되어야 한다. 선박 건조를 할 경우 소요되는 기자재 가운데는 선박용 엔진 뿐만 아니라 각 종항해 통신장비(GMDSS, Navigation 장치 등), 레이더 등의 대상 품목들이 탑재되어야 하는데 이러한 품목들의 경우 전략물자로 지정되어 있을 가능성이 높다. 특히 이러한 품목의 생산이 북한에서 이루어질 경우 선박에의 탑재 뿐 아니라 수출까지 제약 할 가능성이 있다. 예를 들어 북한지역에서 선박을 건조할 경우 수출 선박이라 하더라도 선박용 엔진을 비롯한 각종 기자재의 북한으로의 반출이 어려워질 것으로 보인다. 마지막으로 전력 및 강재 등의 공급이 원활 하지않을가능성이있는점도한계로지적된다. 북한지역의부족한 전력사정을 감안할 때남한에서 송전한다고 해도 전력공급 상황이 여의치 않을 수 있고, 필수 자재인 강재의 안정적 수급도 어려울 수 있기 때문이다.