각군 참모총장은 지원을 받았을 때 신체검사, 면접 등의 전형을 실시 군장학생을 선발하거나 추천해야 한다. 또한 수학기간 중 장학금도 지원하는데 이를 반납 시 통지서를 본인 또는 친권자 등에 보낸다. 반납이 면제되는 경우는 자연재해나 전상 등 심신장애로 임용이나 복무가 불가능한 때이다.
⌜군장학생 규정 시행규칙⌟ 제6조제1항에 따르면 각군 참모총장은 제5조에 따른 지원을 받았을 때에는 신체검사, 면접, 그 밖의 전형을 실시하여 군장학생을 선발하거나 선발을 위한 추천을 한다고 되어 있고, 같은 시행규칙 제11조 제1항·제3항에 따르면 ⌜군장학생 규정⌟ (이하 ‘영’이라 한다) 제7조에 따라 군장학생에게 수학기간 중 생활비를 지원하기 위하여 ⌜고등교육법⌟ 제11조제1항에 따른 등록금에 해당하는 금액을 장학금으로 지급한다고 되어 있으며, 같은 시행규칙 제13조제1항에 따르면 각군 참모총장이 영 제15조에 따라 지급된 장학금을 반납하게 하는 경우에는 별지 제6호서식에 따른 장학금 반납 통지서를 본인 또는 그의 친권자 및 보험회사에게 보내야 한다고 되어 있고, 같은 시행규칙 제14조에 따르면 영 제15조에 따른 반납의 면제는 군장학생이 ‘군 의료기관에서 신체검사를 한 결과 자연재해나 전상(戰傷)·공상(公傷)으로 인한 심신장애로 장교 또는 부사관으로 임용되거나 복무할 수 없다고 판단된 경우’(제2호) 등에 해당하는 경우로 한정한다고 되어 있다.