경제특구 관련 예산은 2013년 4538억에 달했지만 국내 외국인투자 유치규모 성장은 정체되고 국내 기업들의 해외투자금액은 계속 늘고 있어 경제특구정책에 대한 의문이 제기되고 있다.
현재 중앙정부의 경제특구 지원 예산 대부분은 경제특구의 기반시설 조성 및 유지·관리에 사용되고 있다. 이 예산은 지속적으로 증가하여 2013년의 경우 4,538억원에 달하였다. 그러나 이러한 경제특구 지원정책에도 불구하고 국내 외국인투자 유치규모의 성장은 정체된 반면, 국내 기업들의 해외투자금액은 꾸준히 증가하는 추세이다. 이에 따라 양질의 외국인투자기업을 유치하기 위한 경제특구정책의 적절성과 효과성에 대한 의문이 제기되고 있다. 정부 예산을 통해 국내 기업에 비해 더 나은 유인책을 제공하여 외국인투자기업을 유치하려는 정책은 국내 기업보다 외국인투자기업이 한국 경제 전반에 미치는 양의 외부효과가 클 경우에 정당화될 수 있다.