규제개혁 특정업무평가는 등록규제가 6개 이상인 28개 중앙행정기관을 대상으로 규제개혁 평가단에 의해 정량적 평가와 정성적 평가를 병행하여 진행되며 종합평가와 중점과제평가가 각각 7:3 비율로 평가점수에 반영된다.
규제개혁 특정업무평가는 중앙행정기관의 규제개혁 추진노력 및 성과를 평가함으로써 규제개혁 추진 노력을 유도하는 것을 목적으로 한다(정부업무평가위원회, 2013: 87). 해당 평가는 등록규제가 6개 이상인 28개 중앙행정기관을 대상으로, 정량적 평가와 정성적 평가를 병행하는 방식으로 이루어진다. 평가대상은 항상 동일한 것은 아니며 부처상황에 따라 변화되기도 한다. 구체적으로 평가의 객관성 담보를 위해 규제개혁평가단을 구성하여 평가단이 각 부처에서 제출한 서면자료를 토대로 평가한다. 평가는 부처의 규제개혁 노력을 종합적으로 평가하는 종합성과평가와 부처가 추진한 규제개혁과제 중 파급효과가 큰 핵심과제는 따로 분리하여 중점과제성과평가로 구분하여 이루어진다. 종합평가와 중점과제 평가결과는 각각 7:3 비율로 평가점수에 반영된다.