기업마다 기술혁신 시스템과 행태가 달라 효율성에서 차이가 있다. 이에 기술혁신이 부족한 기업은 우수한 기업을 벤치마킹하여 개선하고, 정부는 이 활동을 촉진, 확산시켜야 한다.
다시 말해 각 기업마다 기술혁신 투입요소를 산출성과로 변환시키는 내부의 기술혁신 시스템과 행태가 서로 달라 효율성에서 차이를 보이는 것이다. 따라서 기술혁신 활동의 효율성이 부족한 기업은 내부 변환시스템이 우수한 기업을 벤치마킹하여 자사의 부족한 부분을 개선할 필요가 있으며, 정부는 이러한 활동을 촉진, 확산시킬 필요가 있다. 국내 중소기업의 기술혁신 효율성을 측정하기 위해 본 연구에서는 DEA(Data Envelopment Analysis)를 사용하였다. 동 기법은 투입대비 산출이나 산출대비 투입의 상대적 효율성을 측정하는 데, 분석 가정의 유연성으로 현실 적합성이 커 경영·경제 등 여러 분야에서 널리 활용되고 있다.