동작구는 성별영향분석평가 결과 제시된 정책개선안의 이행 여부를 전년도 대상과제 이행점검과 전년도 대상과제에 대한 정책개선 실적 제출로 점검한다. 다만 공무원의 순환보직  등으로 이행점검이 활발하지 않다는 의견도 있다.
동작구는 성별영향분석평가 결과 제시된 정책개선안이 이행되었는지 여부를 두 단계의 과정을 거쳐 점검한다. 1단계에서 서울 성별영향분석평가 센터는 정책개선이 실제로 이루어졌는지 여부를 환류점검하기 위해 대상과제를 선정하는 과정에 전년도 대상과제에 대한 이행점검을 포함시킨다. 2단계에서는 동작구의 기관담당부서가 업무담당 공무원들에게 전년도 대상 과제에 대한 정책개선 실적을 작성해서 제출하게 한다. 그러나 성별영향분석평가의 이행점검과 관련해 공무원의 순환보직 등으로 인해 정책개선이 행점검이 활발하게 이루어지고 있지 않다는 의견이 제시되고 있다. 결국, 시민단체는 젠더 거버넌스의 파트너로서 성별영향분석평가 과제를 모니터링하고 있지만 자신들이 모니터링한 결과가 실제로 어느정도 정책개선에 반영되었는지에 대해 알기는 어려워, 이에 대한 해결책이 필요한 상황이다.