2001년 고평법 개정에는 자율적 고충처리를 위해 민간단체의 상담지원, 명예고용평등감독관제도를 도입하였으나, 잘 활성화되고 있지 않다. 2006년 개정에서는 이러한 고충처리를 노사협의회에 위임하도록 하였다.
자율적 고충처리와 관련하여 2001년 이후 개정된 고평법 개정 내용으로는 민간단체에 의한 상담지원, 명예고용평등감독관제도 등이 있고 이는 현재까지 유지되고 있다. 명예고용평등감독관제도는 노사협의회나 고충처리위원 등을 기반으로 하여 사업장단위의 고용평등 수준을 제고하기 위해 도입된 제도인데 현재 명예고용평등감독관 제도는 제대로 활성화되고 있지 못하는 형편이다. 2001년 고평법 개정에서는 사업장에 노사협의회가 있을 경우 고충처리기관을 대체할 수 있도록 하였고 2006년 고평법 개정에서는 고충의 처리를 노사협의회에 위임하도록 하였다. 다만 노사협의회에 대해서는 제도 자체의 실효성에 대한 의문이 제기되고 있고, 실제 근로자의 이해를 제대로 대변하는 기능을 하지 못한다는 비판도 많이 가해지고 있는 상황이다.