시간선택제 교사도 전일제 교사처럼 같은 시간을 근무하거나 자격을 갖춘다면 각종 권리를 보장받는다.
전일제 교사가 시간선택제 교사로 전환하면 기존 근속기간은 인정되나, 그 이후 축적되는 장기근속휴가 권리는 시간선택제 근무 비율에 따라 적용된다. 그리고 모든 여성 시간선택제 교사는 출산예정일 이전 6주 간 출산 휴가를 사용할 수 있으며, 전일제 교사로 40주 근무했거나 전일제 교사와 동일한 근무 시간을 시간선택제 교사로 근무한 여교사의 경우 유급 출산휴가를 보장받는다. 유급 출산 휴가도 마찬가지로 근무 기간에 비례하여 적용되며, 시간선택제 교사가 출산휴가를 받았다가 복직할 때에는 전일제 교사와 동등하게 이전 직위를 보장받는다. 시간선택제 교사도 전일제 교사와 마찬가지로 요구되는 자격을 갖추었을 경우 승진에 지원할 수 있으며, 승진될 경우 시간제 근무에 대한 재협의가 필요하다. 만약 승진 직위가 전일제 직위라면 시간선택제 교사는 전일제 근무를 준비해야만 한다(한국인사행정학회, 2014:29-30).