보건복지부는 어린이집 설치, 평가인증, 어린이집 운영, 보육교직원 자격, 관리 세부 지침을 내놓고, 육아종합지원세터를 설치운영한다. 또한 영유아 보육료와 양육수당지원사업과 어린이집 보조금 지원사업을 시행하는데 보육통합정보시스템의 '어린이집 및 이용자 통계'로 관리한다.
보건복지부는 보육사업을 통해 어린이집 설치, 평가인증, 어린이집 운영, 보육교직원 자격 및 관리에 관한 세부 지침을 제시하고, 육아종합지원세터를 설치운영하고 있다. 또한, 0-5세 영유아에게 지원하는 보육료 및 양육수당지원사업과 어린이집 보조금 지원사업을 수행하고 있는데 이 같은 보육사업의 세부 사업 정보가 보육통합정보시스템을 통해 관리되고 있다. 따라서 「어린이집 및 이용자 통계」는 기준시점에 보육통합정보시스템 상에 정상운영 상태로 등록되어 있는 어린이집을 기준으로 통계 자료를 산출하고 있다. 이 같은 정보시스템을 통한 통계 생산에 의문을 제시할 수 있으나, 「어린이집 및 이용자 통계」에서 생산되고 있는 항목들은 보육료 지급과 보조금 지원에 직 간접적으로 연관되어 있고 이를 부정확하게 입력할 경우 행정제재의 대상이 되므로 데이터의 신뢰성은 높은 편이다. 하지만 일부 재정지원과 관련되지 않은 항목(예, 다문화, 한부모 등)들이 있어 이 통계의 신뢰성을 확보하기 위한 방안 마련이 필요하다.