수산물 유통의 효율성이 낮은 이유로는 제한된 유통경로로 인한 경쟁 부족과 유통 단계별 인프라의 부족으로 인한 유통비용의 상승을 들 수 있다. 수산물의 유통비용은 농산물보다 약 13% 높았고, 소매단계에서도 9% 높았다.
첫째, 수산물 유통의 효율성이 낮은 이유는 유통경로가 제한되어 경쟁이 부족하고, 유통 단계별 인프라 구축이 미흡하여 유통비용이 상승한다는 것이었다. 실제 수산물의 유통비용율(유통비용/최종가격)은 농산물의 평균 42% 비해 55%로 약 13%p 높았고, 소매단계에서도 농산물의 23%에 비해 9%p 높은 32%였다. 이렇게 농산물보다 수산물의 유통비용율이 높은 이유는 농산물에 비해 낮은 저장성(수산물의 부패율이 높음)에 따라 유통참여자들이 부족한 인프라 속에서 재고 부담을 수익화하려는 성향이 더 강했기 때문이다. 또한 수산물이 주로 도매시장이나 장외시장(대형소매점 포함) 경로로 유통되면서 산지 주체들의 수요처가 제한되고, 이는 유통 과정에서 수요자 독과점으로 이어지면서 유통 비용 혁신이 제대로 일어나지 않은 점도 간과할 수 없다. 특히, 산지에서는 산지 주체들이 영세하여 그들이 이용하는 유통시설이 도 소매의 유통시설에 비해 낙후되거나 근대적이라는 점은 현대의 유통 환경에 적응하기 어려운 구조를 만들어냈다.