최저임금 인상의 고용효과 추정에도 준실험적 방법이 활용됐다. 최저임금이 인상된 곳과 그렇지 않은 곳을 비교 ,고용률의 변화를  추정하는 방법이 사용됐으며, 단일최저임금제도 하에서 두 집단을 비교하기 위해 변형된 방법도 이용 가능하다.
1990년대 이후 정책효과 분석에 준실험적 방법이 본격적으로 이용되면서, 최저임금 인상의 고용효과 추정에도 준실험적 방법이 활발하게 이용되기 시작하였다. 대표적으로 최저임금이 인상되지 않은 인근 지역에 비해 인상된 지역의 고용이 어떻게 변했는지를 추정하는 방법이 이용되었다. 다만, 이는 지역별로 최저임금이 결정되고 최저임금이 결정되는 시기가 다른 경우에 적용할 수 있다. 전국 단일최저임금제도하에서는 최저임금 인상의 영향을 받는 집단을 영향을 받는 또는 덜 받는 집단과 직접 비교하기 위해 약간 변형된 방법을 이용할 수 있다. 예를 들어, 인상의 영향을 받는 집단과 최저임금보다 조금 더 많은 임금을 받는 집단과 비교해서 최저임금 영향집단을 비교하는 것이다. 분석 대상이나 분석 방법에 따라, 영향을 받는지 여부를 나타내는 이산변수 외에도 영향 근로자 비중, 임금 격차(wage gap) 등을 이용할 수 있다.