기초 생활수급 대상 학생과 다문화 가정 학생의 비율이 낮을 때, 학교장이 학교경영활동과 학교풍토 조성활동을 많이할 때, 교과 관련 방과 후 강좌와 학습부진 학생 지도 프로그램, 동아리 활동 등이 운영될 때와 학교 풍토가 높을 때 기초학력 미달 비율이 낮았다. 
학생 구성과 학교장 특성 측면에서 살펴보면 기초 생활수급 대상 학생 비율 및 다문화 가정 학생 비율이 낮을수록 전반적으로 우수학력 비율이 높고 기초학력 미달 비율이 낮으며, 학교장의 학교경영활동, 학교풍토 조성활동 정도가 높은 학교에서 기초학력 미달 비율이 낮게 나타났다. 학교의 학습활동 측면에서는 교과 관련 방과 후 강좌가 많을수록, 비교과 관련 방과 후 강좌가 적을수록 모든 교과의 기초학력 미달 비율이 낮게 나타났다. 학습부진학생 지도 프로그램을 운영하는 학교의 경우 운영하지 않는 학교에 비해 모든 교과에서 기초학력 미달 비율이 낮았다. 전반적으로 동아리를 운영하고 동아리 활동 제공 수가 많은 학교일수록 모든 교과에서 우수학력 비율이 높고 기초학력 미달 비율이 낮았다. 학교 풍토(학생 풍토, 교사 풍토, 학부모 풍토)가 높을수록 대체로 모든 교과에서 우수학력 비율이 높고 기초학력 미달 비율이 낮으나 특히, 학생 풍토에 따른 차이가 가장 크게 나타났다.