자율과정의 예로 든 4가지 중점 모형 중 학생 선택프로그램은 자유학기제의 특징을 보여준다. 학생들이 관심과 흥미를 가지고 참여할 수 있는 프로그램들을 학생 수요조사에 기반해 정한 뒤 교과 연계 또는 진로･동아리 활동 연계 등 다양한 형태로 제공하는 것이다.
또한 자율과정의 예로 든 4가지 중점 모형 중 진로탐색, 동아리 활동, 예술･체육은 창의적 체험활동에서 유래한 반면, 학생 선택프로그램은 자유학기제의 특징을 보여준다고 할 수 있다. 즉, 현 교육과정 운영시스템에서는 필수교과나 선택교과가 되려면 교육과정에 명시되고 교과서가 집필되어야 하며 담당 교사 양성이 이루어져야하기 때문에 요즘처럼 빠르게 변하는 학생들의 관심을 정규 교육과정에 반영하기는 거의 불가능하다. 따라서 학생들이 관심과 흥미를 가지고 적극 참여할 수 있는 프로그램들을 학생 수요조사에 기반해 정한 뒤 교사 또는 외부 전문가가 한국교육개발원 자유학기제지원센터 또는 시･도교육청 등에서 개발한 자료를 활용해 제공하도록 한 것이다. 이는 학교 차원에서 교과 연계 또는 진로･동아리 활동 연계 등 다양한 형태로 제공되고 있으며, 학생들이 가장 선호하는 활동으로 정착되고 있다. 이는 현재의 교과중심 교육과정의 유연화 방향과 관련해 많은 시사점을 준다고 할 수 있다.