1998년 사법개혁위원회에서 5000억 원을 3개년 정도에 걸쳐 출연할 것이 무산되었으나 대한법률구조공단이 일반 법률구조 적립금을 마련하고 있다.
이와 관련하여 법률구조법 제24조5)는 정부의 출연금 및 보조금 등을 통하여 법률구조를 위한 재원을 마련하도록 규정하고 있다.덧붙여 현재, 조흥은행이나 농협, KT&G에서 기부금을 받는 예에서 보듯이 능동적으로 민간기부금을 늘려 조직의 독립성을 높이려는 노력을 해나가는 것도 중요한 방법이 될 것이다. 1998년 정부는 대한법률구조공단에 기금적립을 위해 300억을 출연할 예정이었으나 실제로는 5억원만을 출연하였고 이후에는 출연금이 아닌 보조금을 지급하고 있다. 1998년에도 사법개혁위원회에서 5,000억원을 3개년 정도에 걸쳐 출연할 것을 제안하였으나 무산된 바 있다. 현재 대한법률구조공단은 정부 보조금의 일부분을(2004년에는 7억 5,600만원) 공단의 일반회계에서 전입, 일반법률구조적립금을 마련하고 있는 실정이다. 5) 제24조(공단의 재원) 공단은 다음 각호의 재원으로 운영한다. 1. 정부의 출연금 및 보조금 2. 정부외의 자가 기부하는 현금 그 밖의 재산 3. 제26조의 규정에 의한 차입금 4. 공단의 사업으로 생기는 수입금 5. 그 밖의 수입금제. 대한법률구조공단의 인적 독립성 분석인사 측면에서도 대한법률구조공단의 이사장은 법무부 장관이 임명하고, 이사 및 감사는 이사장의 제청에 의하여 법무부 장관이 임명하고 있다.대한법률구조공단은 2004년말 현재, 전국 각 지방검찰청과 지청에 대응하여 18개 지부 및 37개 출장소를 설치하고 있는데, 법무부 장관이 지방검찰청 검사장 등 검찰직원 79명을 공단 지부장 등으로 겸직 임명하여 공단의 부족한 인력을 지원하는 한편, 각급 검찰청사의 일부를 사무실로 무상 사용토록 하는 등 법률구조사업을 적극 지원하고 있다.