알렉산드로스는 마케도니아군의 휘하 장군들이 자신의 의견에 반대하는 것을 참지 못했으며 자신을 배반하고 역모를 꾸미는 일에 대해서는 가차 없이 처단하였다.
 알렉산드로스는 마케도니아군의 휘하 장군들이 자신의 의견에 반대하고 나서는 것을 참지 못했다. 더구나 자신을 배반하고 역모를 꾸미는 일에 대해서는 지위고하를 막론하고 가차 없이 처단하였다.
 기원전 330년, 알렉산드로스는 마케도니아군의 2인자라 할 정도로 혁혁한 공을 세운 필로타스와 파르메니온을 제거하였다. 마케도니아군의 기마군단 총사령관으로 있던 필로타스는 ‘망치’ 작전으로 적의 기선을 제압하고, 파르메니온은 보병부대를 이끌고 ‘모루’ 작전으로 적을 분쇄하였다. 즉 마케도니아군의 ‘망치와 모루’ 작전이었다. 필로타스는 파르메니온의 아들로 이들 부자(父子)가 모두 이 작전에 선봉을 서서 마케도니아군의 명장으로 이름을 날렸다. 그런데 페르시아 공략 후 필로타스가 알렉산드로스의 전제군주적인 행위에 대해 비판을 하자, 마케도니아군 사이에서 모반을 꾀한다는 소문이 났다. 결국 필로타스는 알렉산드로스를 암살하려 했다는 누명을 쓰고 처형되었다. 후환이 두려웠던 알렉산드로스는 파르메니온의 부관인 클레안드로스에게 비밀 지령을 내려 필로타스의 아버지인 파르메니온까지 암살했다.
 그로부터 2년 후인 기원전 328년에는 자신의 친구이자 측근의 장군인 클레이토스도 죽였다. 마케도니아 귀족 도로피데스의 아들인 클레이토스는 알렉산드로스의 유모인 라니케의 친동생이기도 했다. 부왕(父王)인 필리포스를 섬긴 클레이토스는 페르시아 원정 때는 알렉산드로스의 근위대장을 맡고 있었다. 첫 전투인 그라니코스 전투에서 클레이토스는 위험에 처해 있던 알렉산드로스의 목숨을 구해준 은인이기도 했다.
