우량농지를 보전하기 위해서 토양, 수질 개선을 내용으로 하는 신규사업이 요구된다.
2004년도 기금 결산 분석할 수 있다고 규정하고 있으며, 동법시행령 제 31조 제 1호는 ‘토양 및 지하수의 오염방지에 관한 사항에 관한 조사 ‧ 시험 ‧ 연구 및 홍보’를 기금의 기타 사업이라고 규정하고 있다.
토양 ․ 수질오염문제가 심각한 상황을 고려하여 토양 ․ 수질오염에 관한 조사‧ 평가 및 오염토양 개선사업을 적극적으로 검토할 필요가 있다. 
그리고 현행 법률에서도 농지관리기금에서 토양 ․ 수질오염에 관한 조사 ․ 평가 및 오염토양개선사업을 실시할 수 있는 근거가 있는 것으로 해석할 수 있으므로 토양 ‧ 수질오염을 미연에 방지하고 오염된 토양 ‧ 수질을 개선하는 것을 내용으로 하는 신규사업을 실시할 필요가 있다.
동 신규사업은 우량농지를 보전, 관리 ‧ 유지한다는 측면에서 시급히 요구되는 사업이다.
설치 목적 및 근거양곡증권정리기금은 양곡관리기금의 부담으로 발행한 양곡증권의 원리금과 차관양곡의 원리금 등 부채상환을 관리하기 위하여, 양곡증권정리기금법에 근거를 두고 설치되었다. 
동법률은 1999년 1월 21일에 제정된 이후 지금까지 두 차례 개정이 이루어졌다.