이에 따라 행정법무담당관실에서는 연구원의 기능을 재정립하는 방안을 모색하였고, 마침내 국회운영위원회 법안심사소위원회에 연구원의 기능을 ‘국가정책 전반의 조사 분석’에서 ‘예결산 및 기금관련 업무’로 한정할 필요가 있다는 내용의 한국의정연구원법안 수정의견 을 보고(2003. 3. 26)하기에 이르렀다.
 이에 따라 행정법무담당관실에서는 연구원의 기능을 재정립하는 방안을 모색하였고, 마침내 국회운영위원회 법안심사소위원회에 연구원의 기능을 ‘국가정책 전반의 조사 분석’에서 ‘예결산 및 기금관련 업무’로 한정할 필요가 있다는 내용의 한국의정연구원법안 수정의견 을 보고(2003. 3. 26)하기에 이르렀다. 연구원 명칭도 ‘한국의회예산연구원’ ‘한국의회재정연구원’ 등 몇 가지로 제시하였다.  이때 행정법무담당관실에서는 의정연구원의 업무 범위를 예결산 분야로 한정할 경우 당초의 법인형태보다는 국가기관(국회의장 직속기관)으로 설립 하는 것이 더 타당하다는 내부 의견이 있었다. 법인은 기본적으로 민간조직이고 그 구성원도 민간인 신분이므로 기획예산처 등 국가기관을 상대로 하여 업무수행에 필수적인 예산관련 자료를 실효성 있게 확보하는 것이 현실적으로 용이하지 않다고 보았기 때문이다. 또 하나의 중요한 이유는 즉각적인 대응의 필요성이다. 입법부 소속 연구기관의 경우 중장기적인 연구과제 수행보 다는 의정활동 수행에 필요한 자료 요청에 즉각적으로 대응하는 것이 보다 중요한데, 자체의 의사결정기구인 이사회를 중심으로 자율적으로 운영되는 National Assembly Budget Office055Part 1.  2003~2008국회예산정책처 설립과 기반 구축 Part 2.  2009~2013의정지원 재정전문기관으로서의 성장과 발전 Part 3.NABO의 오늘과 내일Part 4.