신항 진입도로 환경영향평가 협의가 지연됨에 따라 집행부진 이월되고 12월 사업 착수하였다고 설명하고 있다.
건설교통 인천신항 개발사업의 집행부진의 원인을 세부사업별 살펴보면 관리부두, 실시설계 는 표[20]에서 보는 바와 같이 예산액 17억 9,200만원 중 7억 6,400만원이 지출되고 5억 400만원이 이월되었으며 29.3%인 5억 3,200만원이 불용처리 되어 집행률이 42.4%에 그치고 있다. 
집행부진 사유는 신항 진입도로 환경영향평가 협의가 지연됨에 따라 절대공기 부족으로 이월되었다.
진입도로 및 부두가호안 공구 예산액 198억 3,000만원 중 5억원이 지출되고 193억 3,000만원이 이월되어 집행률이 2.5%에 불과하였다. 
집행부진에 대하여 국토해양부는 타당성 재조사 완료 후 계약기간 장기소요로 인한 사업 미착수가 예상되어 설계와 시공을 병행하여 추진하는 Fast Track 방식으로 사업을 발주하여 12월 사업 착수하였다고 설명하고 있다.
전용사유에 대하여 국토해양부는 환경영향평가협의결과 쟁점부분 협의가 장기간 소요로 연내 사업착수가 곤란하여 부산신항 배후철도사업의 진행이 시급하여 전용하였다고 설명하고 있으나 이는 환경영향평가 협의 과정에서 공유수면매립문제에 대한 쟁점이 발생하여 사업추진이 보류된데 기인한 것이다.