영화 속의 조엘은 클레멘타인을 잊지 못해 고통스러운 나날을 보내다 자신의 기억 속에 담긴 클레멘타인에 대한 기억을 모두 지우기로 결심한다.
 영화 속 조엘은 클레멘타인을 잊지 못한다. 그녀가 일하는 곳을 찾아가지만 조엘을 낯선 이 취급을 한다. 그리고 새로운 연인과 키스를 주고받는다. 충격에 빠진 조엘은 잠시 후 이런 편지를 받는다.
 “댁은 클레멘타인 씨의 기억에서 삭제됐습니다. 다시 둘 사이 관계에 대해 말하지 마세요.”(Clementine has had Joel erased from her memory. Please never mention their relationship to her again.)
 기억을 지워 주는 회사가 조엘에게 보낸 것이다. 고통스러운 나날을 보내던 조엘은 결심한다. 자신의 기억 속에 담긴, 클레멘타인에 대한 기억을 모두 지우기로.
 조엘은 기억 속 클레멘타인과의 만남을 하나하나 불러낸다. 가까운 기억은 대부분 싸운 기억밖에 없다. 삭제하기 편하다. 그러나 점점 이전 기억을 들출수록 지우기 어렵다. 그녀와의 추억(기억)이 너무 아름답다는 사실을 깨닫는다. 삭제를 거부하는 기억이 하나둘씩 늘어난다. 조엘은 괴로워하며 소리친다.
 “내가 무슨 짓을 한 거야. 그만할래!”
 결국 조엘은 클레멘타인과의 기억을 지키기로 결심한다. 어쩌면 클레멘타인의 기억은 조엘에게 ‘영원한 햇살’과 같다. 어느 것과도 바꿀 수 없는, 순수함의 상징이다.
 조엘은 더는 클레멘타인에 대한 기억을 억지로 끌어내거나 지우려 하지 않는다. 자기 기억 속에 그대로 저장한 채 필요한 경우(사랑이 그리울 때) 꺼내 보리라. 사실, 사람의 기억은 불완전하고 망각할 수 있지만 원하는 기억을 남겨둘 수 있다. 기억은 의지를 동반하기 때문이다.
