산업·중소기업분야에서는 미래 성장동력 기술개발·부품소재 산업의 글로벌 기지화, 4+9지역산업진흥사업, 외국인투자유치, 에너지및자원개발, 중소기업의 기술혁신역량의 강화 등 국가재정운용의 내실화를 통하여 해결해 나가야 할 정책과제가 산재되어 있다.
1997~1998년의 경제위기 시에는 중소기업의 연쇄도산 방지와 경기조기회복을 위하여 신용보증기금 출연, 중소·벤처창업 및 소상공인 창업지원 등 금융부문을 중심으로 지원을 확대하다. 
 그러나 경제가 정상화된 2000년 이후에는 금융성 재정지원이 정상화로 지원규모가 축소되었으며, 기술개발, 수출구조고도화 등 산업경쟁력 확충과 국가균형발전을 위한 지역산업진흥사업, 그리고 에너지 및 자원개발 등에 집중지원 하고 있다.
 2006년도 산업·중소기업 분야의 예산 및 기금을 합한 총 지출규모는 산업자원부 소관 8조 3,731억원, 중소기업청 소관 8조 7,825억원, 특허청의 소관 2,980억원 등 총 17조 4,536억원의 규모이다. 
 산업·중소기업분야에서는 미래 성장동력 기술개발·부품소재 산업의 글로벌 기지화, 4+9지역산업진흥사업, 외국인투자유치, 에너지및자원개발, 중소기업의 기술혁신역량의 강화 등 국가재정운용의 내실화를 통하여 해결해 나가야 할 정책과제가 산재되어 있다. 
정부는 이러한 국정과제의 추진을 체계적으로 뒷받침한다는 취지에서, 2009년까지 재정투자를 전망한 국가재정운용계획을 수립하고 이를 토대로 분야별 ․ 부처별 재정지출한도를 결정한 후 하향식 예산배분방식인 총액배분자율편성(Topdown)방식을 이용하여 2006년도 예산을 편성하다. 이러한 배경에서 본 분석은 국가재정운용계획에서 제시된 2009년까지 산업·중소기업분야 투자계획의 문제점을 분석하며, 2006년도 예산안 특징 및 문제점 그리고 주요사업의 분석을 통하여 바람직한 정책방향을 모색하고자 한다.