스토리가 보낸 트리뷴 기사에 대해 고종이 조약에 날인하지 않은 것은 일반적인 외교 관례라는 주장으로 일본대사관이 반론을 제기했다.
 스토리가 보낸 《트리뷴》 기사에 대해 영국 주재 일본대사관은 즉각적으로 반론(反論)을 제기했다. 고종이 조약에 날인하지 않은 것은 일반적인 외교 관례라는 주장이었다. 영일동맹 조약에 영국 에드워드 왕이나 일본 천황이 직접 날인하지 않고 대표자를 시켜 서명케 한 사실이 이를 증명한다는 것이다. 주영 일본대사관은 한국 황제와 그 정부가 외국에 주재하고 있던 영사와 공사를 모두 철수시킨 것만 보더라도 황제가 조약에 동의했음을 뜻하는 증거라고 반박했다.
 이에 대해 스토리는 2월10일자에 일본의 주장에 반박하는 기사를 썼다. ‘일본이 한국 황제와 대신들을 협박하여 보호조약을 체결하게 된 상세한 전말을 한국 황제의 총애를 받는 측근으로부터 받았다’고 밝혔다.
 그런데 스토리가 베이징에서 보낸 을사조약 강제 체결에 관한 기사 내용은 대부분 《코리아 데일리 뉴스》가 11월 27일에 발행한 호외(號外) 기사를 전재(轉載)한 것으로 보인다.
 앞서 장지연(張志淵)은 을사늑약 직후인 1905년 11월20일자 《황성신문》에 을사조약에 반대하는 명논설 ‘시일야방성대곡’과 함께 ‘오건조약청체전말(五件條約請締顚末)’을 실었다. 일본군의 검열을 받지 않고 배포한 이 논설은 ‘이토 히로부미가 한국 대신들을 협박하여 을사조약이 부당하게 체결되었다’는 요지였다. 영국인 배설은 《코리아 데일리 뉴스》에 《황성신문》 기사를 영문으로 번역하여 호외를 발행하였다. 스토리는 출전(出典)을 밝히지 않았지만 대부분 《코리아 데일리 뉴스》의 호외 기사를 인용한 것이다.
