재정투융자 특별회계에서의 재정투융자는 금융적 투융자 활동만을 지원하고 있는데 이는 여러 특별회계를 통해 자본지출에 지출될 수도 있다는 것을 의미한다.
만약 주요 선진국들과의 비교에 있어 단순히 일반회계로 비교할 경우는 자본지출이 다소 과소평가될 가능성이 있다.
이와 관련해 재정융자특별회계의 역할을 살펴보자 일반적 개념에 따른 재정투융자는 재정지출 중 자본적 지출과 금융적 투융자지출을 의미한다. 
자본적 지출은 정부지출 중 인건비와 소비적 물건비를 제외한 건물 설비 기계 도로 교량 등 정부자산을 증대키는 일체의 지출을 말하며 금융적 투융자지출은 정부가 재정자금 및 각종 기금 등의 유무상 자금을 민간사업이나 정부정책 사업에 출자 또는 지출하는 것으로 기간산업의 육성 농업구조개선 등을 위하여 민간기업의 자금부족을 보완하거나 민간자금에 의하여 행할 수 없는 부문에 자금을 공급하는 것을 말한다.
통상적인 자본지출은 일반회계 및 각종 특별회계 기금 등에 포함되어 운영되고 있으며 지난 1996년까지는 재정투융자특별회계에서의 재정투융자는 자본적 지출을 제외한 정부 출자 출연 및 재정융자 등 금융적 투융자 활동만을 지원하고 있다. 
이는 곧 재정투융자를 통해서 자본지출에 직접 지출되는 것은 아니지만 여러 특별회계를 통해 자본지출에 지출될 수도 있다는 것을 의미한다. 
따라서 정확한 자본지출 규모를 알기 위해서는 일반회계뿐만 아니라 특별회계 등을 통해서 지출되는 자본지출도 포함되어야 한다.