둘째 지역아동센터의 다양한 프로그램을 개발할 수 있는 지출이 충분하지 않다는 것이다. 지역아동센터의 지원은 운영비 위주로 이루어지고 있으나 지역 법정기준을 충족한 신고 시설은 2,130개소 법정기준을 충족하지 못한 시설 중 조건부신고시설, 시설설치 및 종사자 자격유예기관이 438개소 미신고 시설이 50개소이다.
둘째 지역아동센터의 다양한 프로그램을 개발할 수 있는 지출이 충분하지 않다는 것이다. 
지역아동센터의 지원은 운영비 위주로 이루어지고 있으나 지역 법정기준을 충족한 신고 시설은 2,130개소 법정기준을 충족하지 못한 시설 중 조건부신고시설, 시설설치 및 종사자 자격유예기관이 438개소 미신고 시설이 50개소이다. 
지역아동센터는 사무실, 조리실, 식당, 집단지도실을 포함하여 이용아동이 20인 이상일 경우 82.5제곱미터와 20인 미만인 경우 60제곱미터의 전용공간을 확보해야 한다.환경노동 아동센터의 운영에 내실을 기하기 위한 프로그램 개발 지원에 지출된 금액은2007년 2,100만원에 불과하다. 
이는 지역아동센터 수요에 충족할 수 있는 다양한 프로그램을 개발하는데 매우 미흡한 수준이라고 할 수 있다. 
따라서 다양한 프로그램 개발 보급, 정보관리시스템 구축 등 질적 향상을 위하여 운영비 외에도 프로그램 개발지원을 확대해 나갈 필요가 있다.
셋째 지역아동센터 시설 종사자와 파견 아동복지교사의 인건비 차이로 인한 근로의욕 저하의 문제이다. 
센터에 파견되는 아동복지교사의 인건비는 월 100만원인 반면 센터에 근무하는 시설종사자의 평균 인건비는 이보다 낮다. 
또한 많은 지역아동센터에서 자원봉사자가 활동하고 있어 상대적으로 높은 임금을 받고 있는 아동복지교사로 인하여 센터 시설종사자 및 자원봉사자의 근로 봉사 의욕을 저해할 우려가 있다.