보호대상 특성과 목적을 바탕으로 기존 행위위주 관리수단에서 실제적으로 보호구역 지정 목적을 달성할 수 있는 관리수단을 마련해야 한다.
환경노동 바탕으로 이루어지는 중복규제의 가능성을 줄일 수 있고 비록 중복규제가 발생하더라도 관리의 내용이 상이하여 관리책임의 소재를 명확히 할 수 있어 재원의 낭비를 가져오는 사례를 방지할 수 있을 것이다. 둘째 지정목적에 따라 보호구역의 면적산정이나 위치를 지정하는 기준을 명확히 설정함으로써 보호구역 경계설정을 둘러싼 갈등을 해소할 수 있을 것이다. 셋째 보호대상의 특성과 보호목적을 바탕으로 기존의 행위위주의 관리수단에서 실제적으로 보호구역지정목적을 달성할 수 있는 관리수단 을 마련하고 지방자치단체와 지역주민의 참여하에 지역적 특성에 맞는 관리수단을 선택하여 이를 바탕으로 해당 보호구역의 관리계획이 수립되어져야 할 것이다. 넷째 보호구역 지정으로 행위규제를 받는 지역주민의 불편 해소와 보호구역 지정의 실효성을 확보하기 위해서 사유지매입은 지속되어야하나 지금까지의 집행실적 부진을 고려할 때, 향후 사유지매립은 보호구역 지정 전에 선매입할 수 있는 방안이 강구되어져야 할 것이다 더불어 규제에 따른 주민피해의 보상차원에서 다양한 내용의 주민지원사업이 개발되어져서 보호구역 지정에 따르는 주민불편의 감소와 더불어갈등을 방지하도록 해야 할 것이다. 최근 들어 공단과 폐금속광산지역 중금속오염으로 인한 주민들의 건강피해호소가 늘고 석면과 라돈 등 발암물질의 위해성에 대한 인식이 증가하고 있으며 아토피 피부질환이나 천식 등 환경성질환에 대한 사회적 관심이 증가하고 있다.