ICU는 정보통신진흥기금의 운영의 사례로 지적받고 필요한 재원을 의존하기 보다 자체 재원 확보 등 자구노력을 통해 확보해야 한다.
국회는 2003년도 결산결과 정보화촉진기금에 대한 감사를 감사원에 청구하였으며, 그 결과 ICU의 설립과 운영에 있어서 정보화촉진기금의 투입이 적절하지 않은 것으로 나타났다. 이에 따라 정보통신부는 향후 교수 인건비 등 최소 운영비만 지원하고, ICU가 자구 노력에 의하여 기부금 등 자체수익을 확대하기로 하였다. 그러나, ICU는 감사원으로부터 잉여 시설로 지적받아 매각할 것을 통보받은 디지털미디어 연구소도 계속 운영하고 있는 등 적극적인 자구노력의 결과를 보여주지 못하고 있다. ICU의 설립과 운영에 관련된 사항이 정보통신진흥기금의 방만한 운영의 사례로 지적받은 이상, ICU는 운영에 필요한 재원을 정보통신진흥기금에 의존 하기 보다는 자체 재원 확보 등 자구노력을 통하여 확보해야 할 것이다. [표 12]에서 알 수 있듯이, ICU와 학교법인의 기부금 적립액이 925억 원에 이르고 있는 상황에서, ICU에 대한 정보통신부의 지원은 축소가 가능할 것으로 보인다. 이상에서 살펴본 것과 같이, 정보통신부의 ICU 교육여건 개선사업은 ICU의 재정상황 및 자구노력을 감안하여 재검토가 필요하다.