참여정부의 국가균형발전모델은 혁신주도형 지역발전으로의 정책을 추진하고 혁신주도형 경제발전을 통해 국민통합과 국가경쟁력의 강화라는 과제를 동시에 해결하는 것이다.
참여정부 국가균형발전정책의 형성배경은 우선 대내외적 사회경제 상황에 대한 인식에서 비롯된다. 대내적으로는 근대화 과정에서 채택되었던 중앙집권적 발전전략의 부작용이 존속하는 가운데 대외적으로 세계화와 지방화라는 추세가 가속되고 있는 한편 새로운 지식의 창출과 확산으로 경제활동의 패러다임의 변화하고 있으므로 우리도 이제 모든 지역의 잠재력을 극대화하지 않고서는 지속적인 국가발전이 어려운 환경이 도래하고 있다는 것이다. 이러한 여건변화에 대응하기 위한 참여정부의 국가균형발전모델은 과거 요소 투입위주의 발전에서 혁신주도형 지역발전으로의 정책전환을 추진하고 성장과 분배의 선순환을 위한 혁신주도형 경제발전을 통해서 국민통합과 국가경쟁력의 강화라는 두 가지 과제를 동시에 해결하는 것이다. 과거 압축적 성장과정에서 나타난 지역적 불균형발전의 폐해를 극복하고 모든 지역이 잘사는 균형사회의 건설을 통해 궁극적으로 국가전체의 경쟁력을 극대화하고자 한다. 이는 앞서 언급한 국가균형발전의 정의와 일치하는 것으로 경제학 등 사회과학에서일반적으로 이야기하는 효율성과 형평성을 동시에 추구하겠다는 것이다. 국가균형발전정책에서는 효율성은 역동적 균형으로 형평성은 통합적 균형으로 표현되고 있다. 일반적으로 상충관계 로 알려진 효율성과 형평성이라는 두 마리 토끼를 한꺼번에 잡기는 그다지 쉽지 않을 것이며 결국 문제는 시기별로 어느 목표를 우선할 것인지 두 목표 간 비중을 어떻게 할 것인지에 달려 있는 것으로 보인다.