정부가 제출한 기금운용계획안에서는 2조 6124억원이 계산되어 있었으나 증액하여 확정하였고 실제 수입액은 계획보다 적었다.
정부가 제출한 기금운용계획안에서는 2조 6,124억원이 계산되어 있었으나, 국회는 5,000억원을 증액하여 확정하였다. 
그런데 실제 수입액은 계획보다 9,121억원 적은 2조 2,003억원에 그쳤다. 
2006년에도 계획 2조 672억원보다 2,452억원 적은 1조 8,218억원이 수입된 바 있다.
매각수입 내역은 우리금융지주 보통주 매각대금 9,168억원, 신한금융지주 보통주 매각대금 1조 1,148억원, 신한금융지주 상환우선주 매각대금 1,685억원, 제주은행 보통주 장내 매각대금 1.6억원이다 2007년도에 매각이 계획되었던 공적자금상환기금법 제 7조 재계산제도 금융위원회는 기금설치 후 매 5년이 경과한 날이 속하는 연도에 예금보험기금채권상환기금 및 부실채권정리기금의 자산과 부채를 실사하여야 한다. 
다만 금융위원회가 필요하다고 인정하는 때에는 수시로 실사할 수 있다.
금융위원회는 제 1항에 따라 실사한 결과 필요하다고 인정하는 경우에는 기획재정부장관과 협의하여 예금보험기금, 채권상환기금 및 부실채권정리기금, 채무의 변경 등 조치를 하여야 한다.
금융위원회는 제 2항의 규정에 의한 조치를 하는 경우 제 4조 제 2항 제 1호의 규정에 의한 기금 출연금과 예금자보호법 제 30조의 3의 규정에 의한 예금보험기금채권상환특별기여금으로 조성하는 자금 간의 비율 등을 감안하도록 노력하여야 한다.