2004년도에 과학기술진흥기금 5070억 원을 조달 및 운용했는데 기술담보 대출이 축소되고 일반담보 대출이 확대됐다.
정부는 동해선 철도·도로연결사업, 경의선 출입시설(CIQ) 신축 및 개성공단기반시설 건설지원 등과 같이 대규모 예산이 소요되는 사업에 대해서 국회에 구체적인 사업추진 일정과 사업에 대한 비용 근거를 함께 제시할 필요가 있을 것으로 보임.
과학기술진흥기금은 2004년도에 5,070억원을 조달 및 운용하였음. 
연구개발융자사업의 경우 기술담보 융자사업의 활성화가 필요함. 2004년도에는 기술담보 대출이 축소되고 일반담보 대출이 확대되었음. 
과학기술진흥기금을 통한 연구개발융자사업이, 기술담보대출의 활성화를 통하여 원천연구 및 후속 연구개발 사업을 지원하는 형태로 발전할 수 있도록 노력할 필요가 있음. 
2004년도 기금 결산 분석 국립과학관 건설 사업은 부지매입의 지연에 따라 부지매입비 예산이 증가 하고 있으며, 당초 2006년도였던 개관 일정도 2008년도로 연기되었음. 
 이는 각종 인허가 절차와 관련한 업무가 예상보다 복잡하고 기간이 많이 소요되었기 때문이며, 직접 대규모 개발사업을 수행한 경험이 부족한 중앙행정부처의 공무원들이 타부처 및 지자체와의 인허가 업무 등을 수행하면서 시행착오를 거치고 있기 때문으로 보임. 과학기술부는 국립과학관 건설 과정에서 겪은 시행착오를 바탕으로 관련 인허가 절차 등을 정리함으로써, 유사한 사업에서 똑같은 시행착오를 겪지 않도록 정보를 제공하고 있음.