이의 효과적 달성을 위해 예산총액배정 · 자율편성(Topdown)제도와 예산사업 구성의 새로운 시도를 추구하는 포트폴리오(portfolio) 예산편성의 결합을 통해 저비용 · 고효율의 예산구조를 시도해 볼 수 있다.
결국 국가재정운용계획의 수행으로 기금과 예산이 동일시되고 있는 상황에서, 동일목적사업 등에 대한 정비 및 역할분담을 통한 기금 · 예산사업의 효율적 조화를 도모함과 동시에 부담금 등으로 초래되는 국민부담을 경감하는 차원에서 여유자금운용의 적정규모를 산정하는 작업이 필요하다. 이의 효과적 달성을 위해 예산총액배정 · 자율편성(Topdown)제도와 예산사업 구성의 새로운 시도를 추구하는 포트폴리오(portfolio) 예산편성의 결합을 통해 저비용 · 고효율의 예산구조를 시도해 볼 수 있다. 이는 국민연금 · 공무원연금 등 각종 연금과 사망보험 등 특정사건(contingency)이 없을 경우 저축으로 남는 형태를 지칭한다(World Bank의 견해). 2005년 현재 일반회계, 19개의 특별회계, 그리고 57개 기금으로 구성된 우리나라의 중앙정부 재정체계는 복잡한 운영 체계로 인해 국가적 투자지출 우선순위에 따른 합리적인 자원 배분을 저해한다는 문제점이 지적되어 왔다. 특히 설치목적을 이미 달성하였거나 국가적 우선순위가 떨어지는 특별회계와 기금이 여전히 부담금 등을 징수함으로써 국가자원의 비효율적인 사용을 초래하는 사례도 적지 않게 발생하고 있다. 2004년부터 국가재원배분의 중장기 전략인 국가재정운용계획을 수립함에 따라 예산에 대한 중장기적 재원배분 방향이 설정됨에 따라 재원확보 목적의 특별회계 및 기금의 필요성이 축소되었다.