농산어촌의 기초 생활여건이 도시에 비해 크게 취약한 현실을 감안할 때 지역개발예산이 증가한 것은 타당한 측면이 있다. 그러나 농산어촌 지역개발을 실시하는데 앞서 다음과 같은 점은 개선할 필요가 있다. 첫째, 집행률을 제고할 필요가 있다는 것이다.
대부분의 사업 예산이 증가하였으나 일부 감소한 사업이 있다. 특히 농림부 소관의 농촌마을종합개발의 경우 2005년도에 비해 27.6%나 감소하였다. 농촌마을종합개발사업은 농특회계에서 예산지원이 이루어지는 연구용역비, 계획수립비, 주택정비, 행정경비와 균특회계에서 예산지원이 이루어지는 본사업비로 구성된다. 농촌마을종합개발사업비가 감소한 이유는 농특회계에서 예산지원이 이루어졌던 주택정비가 2006년부터 이차보전사업으로 전환되면서 농촌마을종합개발사업에 포함되지 않았기 때문이다.농산어촌의 기초 생활여건이 도시에 비해 크게 취약한 현실을 감안할 때 지역개발예산이 증가한 것은 타당한 측면이 있다. 그리고 중기적인 투융자계획을 마련하여 농산어촌 지역개발을 실시하는 것은 바람직한 일이라고 할 수 있다. 그러나 농산어촌 지역개발을 실시하는데 앞서 다음과 같은 점은 개선할 필요가 있다. 첫째, 집행률을 제고할 필요가 있다는 것이다. 농어촌분야 소관부처인 농림부, 해양수산부, 농진청, 산림청이 시행하는 농산어촌 지역개발사업의 2006년도 예산안 상세내역을 정리한 것이 [표 16]이다. 집행률이 상대적으로 저조한 사업으로는 농촌마을종합개발, 전원마을조성, 어촌종합개발사업이다. 특히 농촌마을종합개발사업의 경우 2005년 8월말 집행률이 19.0%에 지나지 않으며, 이 사업의 경우 2004년도 집행률은 43.6%이었다. 이와 같이 집행률이 저조한 이유는 지역특성화를 위해 전문가의 의견수렴, 주민합의 등에 많은 시간이 소요되었기 때문이다.