과학기술정보통신위원회 소관의 3개 부처에 대하여 국회는 기금 결산에서 7건 등에 대해 시정요구를 하였다.
기술료의 사례를 보면 각 부처가 기술료 수입을 세입세출예산외로 운용하면서 국회의 심의를 받지 아니하고 사용한 것에 대하여 국회는 국고금관리법,  제 7조 수입의 직접사용금지 등 및 국가재정법 제 17조 예산총계주의의 규정.
2005년도 결산시정요구사항 조치결과 분석을 들어 문제를 계속 제기하였고 이에 국가재정법 제 53조 예산총계주의 원칙의 예외에 기술료의 경우에는 세입세출예산외로 운용할 수 있되 그 내역에 대해서는 국회예산결산특별위원회에 보고하는 것으로 해결하였다.
따라서 향후 각 부처의 출연금 이자수입 사용이 정당화되기 위해서는 이를 세입세출예산에 반영한 후 국회의 심의를 받아 사용 하거나 혹은 현행과 같이 사용하고자 할 경우에는 기술료 사례와 마찬가지로 세입세출예산외 혹은 수입의 직접사용이 가능토록 명시적인 법적 근거를 마련하여야 타당할 것으로 본다.
국회는 2005년도 결산심사결과 과학기술정보통신위원회 소관의 3개 부처에 대하여 세입세출결산에서 13건, 기금결산에서 7건에 대하여 시정요구를 하였으며 예비비결산과 관련해서는 시정요구 사항이 없다. 
시정요구사항을 수준별로 살펴보면 시정요구 6건 주의요구 1건 제도개선요구 13건이며 부처별로는 과학기술부가 8건 정보통신부가 11건 기상청은 1건에 해당한다.