환경부는 국립공원 재해복구 사업 예산을 조기 배정하고 이월액 최소화를 위해 노력했다. 
 그러나 충전소 설치에 따른 투자비 과다, 투자비 회수기간의 장기화 등으로 인한 도시가스사의 설치기피 문제와 운송업계 경영난으로 인한 신차구매 기피, 차령연장 등으로 인한 충전소 설치지연 등으로 인해 발생하는 융자사업 부진에 대한 해결방안은 미흡한 것으로 분석된다. 2003년도 국립공원사업비 중 재해복구비 96억원의 이월사유는 재해발생이 7~9월에 집중되는 관계로 인해 10월에 예산이 배정되고 11월경에 공사가 착공되어 공사기간 부족과 동절기 공사중지에 기인한 것으로 분석된다. 환경부는 국립공원 재해복구사업 예산의 이월을 줄이기 위해서 재해복구 예산을 조기배정하고 철저한 공정관리의 시행을 통해 이월액 최소화를 위해 노력한 결과 재해복구비 이월액이 현저히 감소하여 2004년에는 10억원이 이월되었다.2003년도 46%, 2004년도 50%에 해당하는 경유자동차에 부과되는 환경개선부담금의 미수납액 비중을 줄이기 위해 환경부는 관계부처와의 협의를 통해 에너지가격 개편 논의 시 환경개선부담금 부과대상을 기존 경유자동차에서 경유로 전환하는 방안을 추진 중이다. 지자체 자본보조사업의 자치단체 실제 집행률이 저조한 문제를 해소하기 위해서 환경부는 사업신청 단계에서부터 철저한 사전검토 및 집행가능성을 고려하여 예산을 편성하고, 조기집행을 위한 사전준비를 강화하여 연초부터 예산이 집행되도록 하고 정기적인 사업현장 점검 및 집행실적 보고를 통해 조기집행을 독려하는 등 보조사업에 대한 집행관리를 강화해 나가고 있다.