동 사업은 향후 막대한 재정이 투입되므로 연구단에 엄격한 평가를 시행하고, 평가와 연구비 지원을 보다 적극적으로 연계할 필요성이 있다.
이에 대해 과학기술정보통신부는 2015년 선정한 4개 과제는 다년도 협약기간에 따라 1단계가 2018년 2월 3일에 완료될 예정이며, 2018년 2월에 1단계 단계평가를 실시해야 한다고 설명한다. 그러나 2015년 선정과제는 2015년 12월에 연구를 시작하여 1단계 연구기간이 26개월이므로, 예비타당성 조사결과에 따라 1단계 성과를 평가할 수 있는 36개월 내외로 연구기간을 조정하는 방안을 검토 중이라는 입장이다. 그 결과 2015년 선정된 과제의 단계평가를 검토 중에 있어 2018년 예산안에는 반영하지 않았으며, 2019년 예산안 검토시 단계평가 계획을 고려하여 반영하겠다고 설명하고 있다. 2018년은 미래소재디스커버리 지원 사업에 착수한 이후 처음으로 1단계 연구가 종료 하고 연구단 평가가 이루어지는 시점이다. 동 사업은 세상에 없는 소재를 개발한다는 목적으로 출발하여 향후 막대한 재정이 투입된다. 따라서 연구단에 엄격한 평가를 시행하고, 평가와 연구비 지원을 보다 적극적으로 연계할 필요가 있다.