그러나 초과현원 해소를 위해서는 정원을 늘리거나 기존 고용인력을 인위적으로 감축하여야 하는데 정원을 늘리는 방식은 인건비 증가와 이로 인한 비효율 문제를 낳을 수 있고, 인위적인 인력감축은 노조의 반발을 불러일으킬 수 있다. 청년실업률이 심각해지는 최근 상황에서 모범적 고용주로서 공공기관이 선도 하여 청년 고용을 늘리기 위해서는 기관의 초과현원 해소가 중요하다.
실제로 앞서 청년고용 의무를 미준수하여 명단이 공표된 기관들을 조사해 본 결과 법률이 정한 기준을 준수하지 못하는 가장 큰 이유는 기관 인력상황이 초과현원 상태라 추가로 인력을 채용할 여유가 없는 경우가 많았다.
 이는 공공기관의 경우 상대적으로 고용안정성이 높으므로 초과현원이 생길 경우 자연감소와 희망퇴직 등으로 초과현원이 해소되지 않는 이상 인위적인 인력감축이 힘들기 때문이다. 청년실업률이 심각해지는 최근 상황에서 모범적 고용주로서 공공기관이 선도 하여 청년 고용을 늘리기 위해서는 기관의 초과현원 해소가 중요하다. 
 그러나 초과현원 해소를 위해서는 정원을 늘리거나 기존 고용인력을 인위적으로 감축하여야 하는데 정원을 늘리는 방식은 인건비 증가와 이로 인한 비효율 문제를 낳을 수 있고, 인위적인 인력감축은 노조의 반발을 불러일으킬 수 있다. 따라서 청년고용 의무제가 실효성을 가지기 위해서는 정원을 초과하는 의무채용 인원에 대해서도 임시로 별도정원으로 인정해주고, 그 비용은 임금상승 억제분이나 성과급 재원을 활용하도록 하는 등의 방식을 검토해 볼 필요가 있다. 또한 청년고용 의무제가 적용되는 3년 동안에는 예외적으로 청년고용과 관련하여서는 초과현원을 허용해 주는 방식을 통해 문제를 해결해주고, 이로 인해 발생하는 초과현원은 정년연장으로 인한 효과가 안정된 이후 일정 기간내에 해소할 수 있도록 하는 것도 대안으로서 검토해 볼 필요가 있다. 공공기관의 조직과 정원에 관한 지침 제3조(조직과 정원의 관리 원칙)  공공기관의 장은 조직과 정원을 운영함에 있어 그 업무의 성질과 양에 따라 업무수행을 위한 적정규모가 유지되도록 하여야 하며 원칙적으로 정원과 현원을 일치시켜야 한다.