영창대군이 세상에 나왔을 때 영의정 유영경은 좌부승지 최염을 시켜 대군 탄생 축하 하례를 올려야 한다고 건의했으며 이에 좌의정 허욱과 우의정 한응인은 반대 의견을 표명했다. 
 그러고 나서 3월 7일 문제의 대군, 영창대군이 세상에 나왔다. 영의정 유영경은 즉각 좌부승지 최염을 시켜 “세종 때에도 광평대군과 임영대군이 태어났을 때 하례를 올렸다”며 “대군 탄생을 축하하는 하례를 올려야 한다”고 건의했다. 이에 좌의정 허욱과 우의정 한응인은 “대군 한명을 낳았다고 반드시 하례할 것까지 있느냐”고 반대 의견을 표명했다.
 이건창은 《당의통략》에서 유영경은 선조의 뜻이 대군에게 가 있다는 것을 알고서 대군의 지위를 튼튼히 하기 위해 이처럼 하례를 해야 한다고 주장한 것이라고 해석했다. 결국 하례는 이루어졌다.
 회복되는 듯하던 선조의 건강은 선조 39년(1606년) 4월을 지나면서 급속하게 나빠지기 시작한다. 세자와 약방 도제조(都提調) 유영경의 문안인사가 이어졌고, 매일 침을 맞아야 했다. 증상은 왼쪽 팔에 마비 증세가 오고 다리에서부터 어깨를 거쳐 귀밑까지 통증이 간헐적으로 찾아오는 것이었다. 한의학에 조예가 깊었던 선조는 자신의 증상을 스스로 진단하고 때로는 적절한 처방을 제시하기도 했다. 9월이 되면서 병세가 조금씩 악화돼갔다. 당시 선조의 치료를 담당한 어의 중에는 《동의보감》 저자인 허준도 포함돼 있었다. 이런 증세는 큰 차도를 보이지 않고 1년 이상 계속됐다.
 선조 40년(1607년) 10월 9일 새벽, 선조는 잠자리에서 일어나 문을 열고 나가려다가 갑자기 기가 막히면서 쓰러졌다. 궁중 나인이 달려와 이 같은 사실을 세자에게 알렸고 곧바로 세자를 비롯해 유영경·허준 등이 달려왔다. 이들이 왔을 때 선조는 의식을 차리지 못하고 있었다. 숨막히는 정적만이 편전을 짓누르고 있었다. 허준 등이 각종 약을 번갈아 먹인 끝에 마침내 의식이 약간 돌아온 선조는 “이 어찌 된 일인가, 이 어찌 된 일인가”라는 말만 반복할 뿐이었다. 이날 하루 만에도 여러 차례 의식이 멀어지다가 돌아오다가를 반복했다. 의원들은 ‘한기엄습(寒氣掩襲)’이 원인이라고 진단했다.
