정부 지원대상을 기초연구 및 혁신 인프라 조성에 두는 한편 정부의 혁신성장 및 R&D 투자에 대한 성과평가를 보다 내실화 하는 등 혁신성장 관련 투자 효율성의 제고방안이 마련되어야 한다. 또한 혁신성장 및 R&D 관련 정부 조세지원 방식을 네거티브 방식으로 전환할 필요가 있다.
4차 산업혁명과 조세 이슈혁신성장 관련 민간 및 공공 부문의 양적 투자는 지속적인 증가세를 보이지만 동 분야의 질적 효율성에 대한 이슈는 지속적으로 제기되는 상황이다. 
 OECD(2009)는 우리나라의 국가 R&D 사업과 대학 ․ 공공연구기관의 투자 대비 효과성이 낮다는 문제를 지적한바 있다. 
 이러한 문제의 원인으로 혁신기술 및 R&D 투자 필요성에 대한 공감대 형성에도 불구하고 정부 정책의 일관성 부족, 정부지원을 받는 R&D 활동의 전체 프로세스 내에 다양한 주체가 개입하는 점, 최종 성과의 사업화 추진 부진 등이 낮은 효과성의 주요 요인으로 지적된다.
 이러한 문제점 해결을 위해서는 우선적으로 정부지원의 방향성을 명확히 수립할 필요가 있다. 정부 지원대상을 기초연구 및 혁신 인프라 조성에 두는 한편 정부의 혁신성장 및 R&D 투자에 대한 성과평가를 보다 내실화 하는 등 혁신성장 관련 투자 효율성의 제고방안이 마련되어야 한다. 또한 혁신성장 및 R&D 관련 정부 조세지원 방식을 네거티브 방식으로 전환할 필요가 있다. 이를 통해 제도의 유연성을 높이고 지원대상 혁신기술의 지정방식을 공급자인 국가주도에서 첨단 기술산업의 수요자 중심에 초점을 맞춘 개방적 ․ 수평적 지원 형태로 개선해야 한다.