정부는 어항 수요를 산정해 필요한 국가어항 수를 다시 산정하고 집중투자를 위해 필요한 어항 수 전체의 일부만을 지정하려는 계획을 세우고 있다.
2005년 정부는 감사원 감사에서 지적된 바에 따라 어항수요를 재산정해 국가어항 수 37개소 및 지방어항 4개소를 지정할 것을 계획했다. 그러나 이 같은 계획에 대해 2006년 12월 KDI공공투자관리센터와 한국해양수산개발원이 수행한 어항건설에 관한 심층평가에서는 기존의 어항지정규모가 단순히 안전수용률에 의거하여 신규어항 수를 지정하였기 때문에 경제성 등 제반 상황을 고려하여 재검토할 필요가 있다는 지적과 함께 일시에 많은 어항을 지정하는 경우 분산투자를 할 수 밖에 없으며, 수산업 환경변화에 따라 낭비요소가 발생할 수 있으므로 510년 주기로 어항의 수요를 예측하고 이에 따라 어항을 신규로 지정하고 개발하는 것이 바람직하다는 의견이 제시됐다.2008년에 정부는 연구용역을 발주해 어촌어항발전기본계획을 수립하면서 위의 심층평가에서 제시된 의견에 따라 어항수요를 다시 산정했고, 그 결과 향후 30개의 어항을 신규로 국가어항으로 지정할 필요가 있다는 계획을 밝히고 그 가운데 6개항을 국가어항으로 지정했다.정부는 2012년쯤 새로이 어항수요를 산정해 필요한 국가어항 수를 다시 산정하고 집중투자를 위해 필요한 어항 수 전체를 국가어항으로 지정하지 않고 일부만을 지정하려는 계획을 세우고 있다.위에서 살펴본 바와 같이 정부가 국가어항개발사업을 하기 위해 어항수요를 산정하려는 노력을 기울이고 있지만, 예측된 어항수요가 타당성을 결여하거나 경제성 등을 고려하지 않아 재산정이 필요하다고 지적됐다.