공동제작 영화를 신고하거나 한국영화로 인정받기 위한 정확한 지침이 필요하다. 필요한 서류와 통관 절차 그리고 세금문제 같은 것이 정확하게 정해져 있지 못해 혼란스럽다. 현재 공동제작한 영화가 겪고 있는 문제점을 잘 보여주는 것이 <미션 바라바> 이다.
그러나 공동제작 영화로 인정받는 것은 그리 쉬운 문제가 아니었다. 기존의 예가 거의 없었기 때문에 공동제작 영화임을 신고하고 인정받기 위한 과정에서 정확한 가이드가 부족하다는 것이 가장 큰 문제였다. 예를 들어 변주현씨가 처음 받아본 문화관광부 서류에 일본주재 한국영사관에서 직인을 받는 조항이 있어 이를 어렵사리 이루었는데, 알고보니 굳이 그럴 필요가 없는 내용이었다. 또한 영화가 완성되고 난 후, 프린트를 일본에서 가져올 때 통관문제 역시 애매한 문제로 남아있다. 통관시 합작영화 관세 규정을 적용하기 위해서 문화부 합작영화 신고필증을 제시하자 세관 측에서는 이 영화의 계약서에서 제시한 20%의 제작비 투자, 즉 6억 8천만 원을 외국에 투자한 것이니 이 부분에 대해서 따로 부과세 10%를 내야 한다고 주장해서 현재 프린트 수입이 보류된 상태이다. 현재 <미션 바라바>가 보여주는 공동제작 규정의 가장 큰 맹점은 공동제작 영화로 신고를 하긴 했으되, 아직 한국영화로 인정을 받지 못했기 때문에 그 지위가 애매하다는 점이다.