진도 쌍계사에 소장되어 있는 목조석가여래삼존상의 목조대좌는 목조 불상의 보존성을 높이기 위한 장치를 갖고 있다는 점에서 학술적 가치가 있고 역사적 가치도 높다.
진도 쌍계사에 소장되어 있는 목조석가여래삼존상의 목조대좌는 <조성발원문>에 의해 좌대의 시주자(文信元 兩主, 權得精 兩主, 朴㖯伊)가 밝혀져 있어 삼존상과 동시대에 만들어졌을 가능성이 높고, 절대연대를 가진 대좌라면그 역사적 가치는 높다. 더욱이 3기의 대좌의 하층부를 이루는 팔각연엽대좌의 경우 상중하대의 수 미좌형식을 가지고 있으며, 가운데부분이 방형으로 뚫려 있어 목재의 통기성이나 통풍을 용이하게 하여 원형을 유지하기에 적합한 구조여서, 목조 대좌가 목조 불 상의 보존성을 높이기 위한 장치를 가지고 있다는 점에서 학술적 가치가 있는 편이다.