주요내용으로 위원회, 특별회계, 계획의 명칭을 균형발전위원회,국가균형발전특별회계,국가균형발전계획으로 변경하고, 시･도지사가 신청 시 위원회 의결로 국가혁신융복합단지를 지정하며, 국가혁신융복합단지는 정부가 육성하고, 시･도의 중앙부처와의 추진사업 예산을 우선 지원하며, 협의체 대표자의 당연직 위원 포함, 시･도의 지역혁신지원단 설치 등이다.
주요 내용으로는 첫째, 균형발전에 대한 국가의 책무를 강조하기 위하여 위원회, 특별회계, 계획의 명칭을 각각 균형발전위원회, 국가균형발전특별회계, 국가균형발전계획으로 변경하고, 주요 사항에 대해서는 위원회가 의결할 수 있도록 하였다(제4조, 제22조 및 제30조). 둘째, 시･도지사가 관할구역의 행정중심복합도시, 혁신도시 등과 인근 산업단지 등을 연계하여 국가혁신융복합단지 지정을 신청할 경우 국가균형발전위원회의 의결에 따라 국가혁신융복합단지를 지정하도록 하였다(제18조의2). 셋째, 정부에게 기업유치와 신산업 실증, 인･허가 지원 등을 통하여 국가혁신융복합단지를 육성하도록 하였다(제18조의3). 넷째, 시･도가 중앙부처와 계약을 맺고 추진하는 사업에 대해서는 예산을 우선 지원할 수 있도록 지역발전투자협약 제도를 개선한다는 것이다(제20조). 다섯째, 국가균형발전위원회의 당연직위원에 지방자치법에 따른 협의체의 대표자를 포함하도록 하였다(제23조). 여섯째, 시･도가 주도하는 지역혁신체계로서 지역혁신협의회와 지역혁신지원단을 설치하고, 시･도 계획 등 시･도의 중요 사항을 심의하도록 하였다(제28조). 일곱째 국가균형발전위원회가 국가균형발전 정책을 총괄 조정할 수 있도록 국가균형발전특별회계 예산에 대한 위원회 의견을 효력을 강화하였다(제38조).