중앙아시아의 이슬람은 극단적 이슬람, 전통적 이슬람, 정부 주도 이슬람 등 3가지인데 90년대 이후 급진적 원리주의가 대두되면서 정부와 극단적 이슬람 간의 충돌이 날로 확대되어 타지키스탄 내전 등 인명손실이 커지고 있다. 서로 양립할 수 없기에 정치적인 해결책은 없어 보이며 국제감시단체의 개입으로서만 평화가 유지될 것이다.
첫째, 이슬람 원리주의는 우선 극단적 이슬람(Radical Islam)의 형태를 띠고 있다. 원리주의 이슬람을 추종하는 이들은 전통적으로 국민들에게 수용되었던 관습으로서의 생활 이슬람은 진정한 이슬람의 성격에는 맞지 않는다는 판단을 하고 있다. 그들은 생활 이슬람을 강조하는 성직자들은 이슬람 본질을 국민들에게 설파하지 못한다고 주장한다. 중앙아시아 이슬람은 극단적 이슬람 이외에 전통적 이슬람, 그리고 정부 주도의 이슬람 등 3가지 부류로 나누어진다. 상대적으로 극단적 세력이 중앙아시아 사회의 불안 요소로 부각되자, 이슬람 전통주의자들과 정부 간에는 상호 간에 타협을 시도했다. 1990년대 초부터 급진적인 이슬람 원리주의 운동이 많이 나타났는데, 표면적으로 나타난 대표적 분쟁은 타지키스탄 내전이다. 내전을 통해 촉발된 이슬람 원리주의의 동학은 중앙아시아 사회에서 매우 강력했다. 불안정성이 증가되었다. 정부와 이슬람 원리주의자들 사이에 군사적 충돌이 확대되었다. 정부는 이슬람 원리주의자들을 강력하게 공격하고, 반대편에서는 정부에 강력히 투쟁하는 일들이 빈번히 일어났다. 동일하게 군사적 행동이 일어났다. 특히 우즈베키스탄과 타지키스탄에서 일어난 극한적인 대립으로 많은 인명 손실이 일어났다. 상호 폭력성으로 양쪽 진영은 더욱 더 힘겨운 정치적 상황이 발생하는 일들이 반복되었다. 평화를 위해서는 국제 감시 단체들의 역할이 매우 필요하였다. 당시에도 정치 전문가들은 정부와 이슬람 원리주의자들 간에 권력 분점은 전혀 불가능하다고 생각했는데, 정부는 정부 나름대로 이슬람 원리주의자들의 이슬람 신정국가 건설이라는 원대한 이상과 부합될 수 없는 강력한 현실적 정치 지도자를 가지고 있는 것이다.