독립단편 영상물의 중요한 시장인 국내 배급은 가장 시급한 문제이다. 국내 배급 환경은 매우 냉담하기 때문에 각종 공적 지원기관은 제작 지원보다 지원을 늘려 배급 부분을 해결해 주어야 한다.
그러나 가장 시급한 문제는 역시 국내 배급이다. 독립단편 영상물의 가장 중요한 시장이기도 한 국내 배급과 관련해 절실한 것은 결국 돈이다. 배급은 작가에게는 자신의 창작물을 시장에 유통시켜 새로운 창작을 위한 자금을 회수하는 기회이며 배급사 역시 일정한 이윤을 남겨야 보다 왕성한 배급이 가능해 진다. 그러나 국내 배급 환경은 독립단편 영화/애니메이션에 매우 냉담한 편이다. 현재 인디스토리의 경우 KBS의 독립영화관 방영이 가장 중요한 수입원이라 한다. 이 프로그램이 사라지면 독립단편물의 배급은 또 한 차례 난항을 겪을 수밖에 없는 것이다. 그렇다면 각종 공적 지원기관들이 독립단편 애니메이션에서 공을 들여야 할 부분은 바로 이 배급 부분을 해결해 주는 것이어야 한다. 배급 부문에 비교하면 현재 각 지원기관들의 독립 애니메이션 제작지원은 비교적 무난하게 이뤄지는 편이다. 개별 감독들의 특정 작품 지원이 주를 이루는 제작 지원에 대해서는 비교적 여유 있게 지원을 하면서 정작 보다 공적인 사업일 수도 있는 배급 지원에 인색한 것은 지원의 균형에 비추어도 옳지 않다.