문화재청은 세계유산으로 등재하고 보존, 관리하는 일과 아시아태평양지역의 유네스코에 신탁기금을 지원하고 있다.  또한 유네스코 세계유산의 심사와 자문을 맡고 있는 국제기념물유적협의회, 국제문화재보존복구협회, 세계자연유산연맹과도 협력하여 유산 보호를 위한 다양한 활동을 하고 있다.
문화재청은 세계유산으로 등재하고 보존·관리하는 것뿐만 아니라 아시아태평양지역의 세계유산 등재와 보호를 위해 유네스코에 신탁기금을 지원하고 있다. 2000년부터 북한 고구려 고분 및 벽화 보존처리와 보존기술 향상을 위한 지원을 지속하고 있으며, 약수리 고분, 수산리 고분, 진파리 고분 등의 보존처리와 유네스코 전문가 워크숍, 고구려 고분 및 벽화 전시회 등을 개최하였다. 2012년부터 북한을 포함한 아시아태평양지역으로 세계유산 보호를 위한 신탁기금 사업을 확대하면서 실크로드 유산의 유네스코 세계유산 등재 및 보존 연구, 세계유산 역량강화 정기보고, 세계유산 지역의 지속 가능한 발전과 주민참여 사업 등을 유네스코를 통해 지원하고 있다. 세계기록유산 분야에서도 국가적 관심이나 재원 등 역량이 부족하여 기록유산 등재와 보호가 어려운 국가들을 지원하고 있다. 유네스코뿐만 아니라 유네스코 세계유산의 심사와 자문을 맡고 있는 국제기념물유적협의회(ICOMOS), 국제문화재보존복구협회(ICCROM), 세계자연유산연맹(IUCN)과도 협력하여 유산 보호를 위한 활동을 적극적으로 전개하고 있다.