웅진기 도성에는 장방형 석실도 축조되었다. 이는 한성기 중앙 석실의 영향으로 일부귀족이 남쪽으로 내려왔음을 보여준다. 웅진기 일반적 묘제는 횡혈식석실이지만 아직 통일된 건 아님을 알 수 있다.
한편 웅진기 도성에는 송산리형 석실만 축조된 것은 아니다. 공주 금학동 고분군에서는 평면이 장방형인 석실분이 조사되었다. 석실의 횡단면은 터널형이고, 종단면은 아치형이다. 장벽은 약간 밖으로 배부른 흔적이 남아 있다. 천장석은 한 장이다. 한성기에 조성된 하남 감일동 고분군의 석실과 구조가 유사하다. 즉, 한성기 중앙의 석실 전통을 이어받고 있다는 점이 주목된다. 이것은 한성기에 왕릉과는 구별되는 석실을 축조한 일부 귀족 집단의 남하를 의미한다고 할 수 있다. 한성기와 달리 웅진기에는 왕릉, 귀족의 무덤, 일부 지방의 무덤이 횡혈식석실이라는 묘제로 바뀌었지만 세부적으로는 아직 차이가 여전하다는 점을 보여준다. 이러한 양상은 사비기에 이르러 달라진다.