기본적인 협력 원칙은 한국 촬영은 한국영화사가, 일본 촬영은 일본영화사가 책임지고 진행하는 것이었다. 양국간의 스탭이 섞이지 않았기 때문에 기술이나 제작과정에 대한 노하우의 교류는 없었다. 그러나 오히려 이것이 제작과정을 수월하게 했고 외국의 감독에게 좋은 모습을 보이자는 분위기까지 더해져 긍정적인 효과를 가져왔다. 일본 판권은 쇼치쿠가, 한국 판권은 시네마서비스가 갖고 그 외 판권에 대해서는 제작투자비율인 35:65로 나누는 것으로 계약했다.
기본적인 공동제작 협력 원칙은 한국 촬영은 한국영화사가, 일본 촬영은 일본영화사가 책임지고 진행하는 것이었다. 한국에서 촬영되는 모든 내용은 한국 스탭에 의해 이루어지고, 일본에서 만들어지는 모든 장면은 감독과 주연 남자 배우를 제외하고는 일본 스탭과 캐스트에 의해 이루어지는데, 그것을 일본 쪽 파트너인 쇼치쿠 측이 책임을 지는 방식인 것이다. 일본에서의 촬영 과정에 한국 측은 단지 이재용 감독만이 참여하고 주연배우인 이정재가 간혹 들르는 정도였다고 한다. 실제로 양국간의 스탭이 섞이지 않았기 때문에 기술이나 제작과정에 대한 노하우의 교류 등이 이루어지지는 못했다. 그러나 이러한 측면이 오히려 장점으로 작용하기도 했다. 뒤에 언급할 중국과 합작을 했던 <비천무>나 <아나키스트>의 경우처럼 언어가 다른 여러 나라의 스탭들이 섞여 있어서 제작과정이 더디게 진척되었던 상황과 달리, <순애보>의 경우는 언어 소통에 문제가 없는 한 나라의 스탭들이 작업을 하면서 오히려 더 작업과정이 수월했던 경우이다. 일본 촬영의 경우 이재용 감독을 제외하고 모두 일본 스탭들이었는데 외국의 감독에게 좋은 모습을 보이자는 분위기가 팽배해서 오히려 다른 영화를 찍을 때보다 더 열심히 일을 하는 긍정적인 효과를 가져오기도 했다.  쇼치쿠는 앞에서 언급한 바와 같이 일본 프로덕션을 책임지는 것 외에 제작비도 일부 부담했는데 그 비율은 전체 제작액에서 보면 일본 측이 35%를 투자한 것이고 한국 측이 65%를 투자한 것이다. 일본 판권은 쇼치쿠에서 갖게 되고, 한국 판권은 시네마서비스가 갖고, 일본과 한국을 제외한 전세계 판권에 대해서는 일단 시네마 서비스 투자분에 대해서 변제가 되고 나면 수익을 35:65로 나누는 것으로 계약을 했다.