영화산업계에서 단편 애니매이션, 혹은 대학창작 애니메이션 제작 지원이 시행되고 있지만 장기적 성장 및 인프라 구축으로 이어지지 못하고 있다. 게다가 지원사업 수혜자들의 대부분은 애니메이션 학과 재학생들이라 다른 창작인들을 위한 지원은 매우 미비하다. 독립 애니메이션 분야는 발전 가능성이 높은 분야이기 때문에 장기적인 육성책이 필요하다.
지금까지 영화진흥위원회를 비롯하여 서울산업진흥재단(서울 애니메이션 센터), 한국문화콘텐츠진흥원 등은 각각 연간 1-2회씩 단편 애니메이션 제작지원 혹은 대학창작애니메이션 제작지원사업을 시행해 왔다. 그러나 이들 지원정책들은 모두 개별 작품에 대한 사전 제작 지원에 머무를 뿐, 장기적인 인력 양성, 인력 인프라 구축으로 이어지지 못하고 있다. 따라서 작품은 계속적으로 양산되지만 지속적으로 창작을 하는 개인 및 창작팀의 양성으로 이어지지 못해 독립단편 애니메이션의 실질적인 역량으로 승화되지 못하고 있다. 작품지원 자체도 문제가 있다. 각 기관이 시행하는 지원사업 수혜자의 70-80% 가 애니메이션 학과 재학생들로 이들의 졸업작품 및 워크샵 작품에 지원이 집중되고 있어 정작 아카데미 외부에서 힘겹게 독립 애니메이션 작업을 진행하는 창작인들의 작업환경 조성 및 개선을 위한 지원은 거의 손이 미치지 못한다.(영화진흥위원회의 경우 2001년부터는 학생작품 이외의 독립 애니메이션을 주로 지원하는 방향으로 나아가고 있다.) 그러나 잇따른 해외 애니메이션 페스티발에서의 수상에서 확인할 수 있듯이 독립 애니메이션은 분명히 애니메이션 분야 가운데서도 중장기적으로 발전 가능성이 가장 높은 분야 중 하나로 장기적인 육성책이 필요하다.