귀래정은 육각형 정자에 팔작 형식의 지붕으로 구성되어 있고 온돌방을 구성하는 기둥들이 대들보 하단부에 통맞춤으로 단단히 결구되어 있다. 온돌방 전면에 분합들문을 달아 개방할 수 있고 나머지 삼면은 벽을 치고 출입문을 달았다. 온돌방 문 위에 놓인 기다란 널빤지는 방 상부 천장 위의 흙이 떨어지는 것을 막기 위한 것으로 보인다. 많은 부재들을 매우 공을 들여 결구하였고 여러 가지 장식물을 넣어 격식 있게 건축하였다. 
집의 천장은 가운데서부터 우물천장-빗천장-연등천자 등의 순으로 구성된 셈이다. 육각형 정자의 지붕은 추녀를 옥심주에 결구하고 지붕을 받친 뒤 지붕 상부에 절병통을 설치하여 6모지붕으로 구성하는 것이 일반적이다. 하지만 귀래정 지붕은 이 가구 위에 팔작 형식의 지붕을 올렸다. 확인할 수 없지만 추녀의 곡을 볼 때 일반 모임지붕의 곡과 크게 차이가 없는 것을 보아 합각부에 덧서까래 혹은 헛지붕을 올린 것이 아닌가 추정된다. 온돌방을 구획하는 심주와 내진주는 서로 창방으로 연결되어 있지 않고 그 사이에 인방부재로만 결구된 구조적 특징이 있다. 심주 양 옆의 내진주 2본이 모두 대들보 하단부에 통맞춤으로 단단히 결구되어 있기 때문에 창방이 필요치 않았던 것으로 판단된다. 온돌방은 이들 심주와 내진주 사이에 축조되어 있는데 전면 주칸에는 문인방과 문선을 짜 넣어 문얼굴을 형성하고 분합들문을 달아 전칸이 개방되도록 하였고 나머지 삼면은 심벽을 치고 출입문을 달았다. 특히 온돌방 상부 문인방과 상인방 위에는 길다란 판재를 비스듬하게 눕여 설치하고 양쪽 기둥에 단단히 끼워 두었는데 아마도 방 상부 고미반자 위에 올려 둔 더그메의 흙이 밖으로 떨어지는 것을 방지하기 위한 것이 아닌가 추측된다. 일반적인 사례에서는 볼 수 없는 법식이지만 대단히 실용적이고 합리적인 부재 용례(用例)로 생각된다. 뿐만 아니라 문선과 인방 그리고 천장의 귀틀 등 부재가 장부맞춤과 연귀 맞춤 그리고 제비초리 맞춤 등 매우 공을 들여 치목하여야 하는 공법으로 결구되었고 쌍사와 변탕 그리고 국화정으로 장식한 것이 보여 주목된다. 그만큼 정자 건립과정에 공을 들이고 격식을 차려 건축하였음을 확인할 수 있다.