공동제작영화에 부과되는 부가세는 프린트를 국내로 반입할 때 부과되는 관세로 현재는 자국영화 해외 로케이션과 외화 수입의 중간 수준이다. 공동제작영화의 활성화를 위해 이 관세를 자국영화 수준으로 낮출 필요가 있다.
이런 문제는 과거에 영화사를 복덕방처럼 사무실 하나 얻어놓고 경리 한 사람을 고용해서 운영하던 방식에서는 필요 없던 지식이다. 그러나 요즘과 같이 법인 형태로 운영하는 것과 관련해서는 기본적으로 영화인들이 각종 경영에 관련된 정보를 수집하고 공부해야 할 필요성이 점차 대두되고 있다. 이와 연관해서 공동제작을 경험한 몇몇 영화인들이 세관에서 내도록 요구한 부가세를 부적절하다고 주장한 문제는 경영과 관련된 지식 부족에서 비롯한 주장이라고 할 수 있다. 즉, 자국 영화에 대해서도 부가세가 면세되지 않는 상황에서 공동제작 영화에 대해 부과되는 부가세를 내는 것이 부당하다는 것은 조세형평에도 문제가 생기는 것이다. 공동제작 영화가 특별히 자국 영화와 분리되어 적용되는 세금은 프린트를 국내로 반입할 때 부과되는 관세다. 현재 공동제작영화에 부과되는 관세는 자국영화 해외 로케이션과 외화 수입의 중간 지점 정도 수준이다. 어찌보면 합리적인 수준이라고 할 수도 있지만 만약 공동제작 영화를 자국영화와 동일하게 분류 취급해야 공동제작영화가 활성화 될 것이라는 측면에서 본다면, 이 관세를 자국영화 수준으로 낮추는 것은 고려할 만 한다.