공립 작은도서관은 지자체의 판단에 따라 등록되는데 일부의 경우 임의로 운영 유형을 변경하기도 한다. 따라서 공립도 행정적인 절차에 따라 등록·변경·폐관·등록취소 등이 관리되어야 한다. 또한 사립작은조서관을 등록 취소하려 해도 잘 시행되지 않는 문제점이 있는데 이를 막기 위해 「행정절차법」 상 ‘긴급히 처분을 할 필요가 있는 경우’를 보완할 필요가 있다.
셋째, 작은도서관의 설치 기준과 관련하여 분석결과 「도서관법」 시행령에 근거하여 공립·사립작은도서관 모두 동일하게 적용 받고 있으나 등록과 그에 따른 변경·폐관·등록취소 등의 절차는 「행정절차법」에 따라 사립작은도서관에 한하여 적용받고 있다. 「2018년 작은도서관 운영 실태조사 결과보고서」에 따르면 2018년 12월 말 현재 공립작은도서관은 1,433개관, 사립작은도서관은 4,897개관 운영되고 있다. 이 가운데 공립작은 도서관 1,433개관은 작은도서관 등록 절차에 적용 받지 않고 기초지방자치단체의 자율적 판단에 따르고 있다. 이에 정부의 지방자치단체 평가에 따른 기준에 따라 일부 기초지방자치단체에서는 공립작은도서관에 대하여 임의적으로 운영 유형을 변경하여 「작은도서관 진흥법」에 따라 매년 실시되는 전국 작은도서관 실태조사의 결과에도 오류가 발생되는 원인이 되고 있다. 따라서 공립작은도서관에 대해서도 사립작은도서관과 함께「도서관법」 시행령에 따른 작은도서관 등록 기준에 따라 등록·변경·폐관·등록취소 등의 행정적인 절차하에 관리되도록 할 필요가 있다. 그리고 기초지방자치단체 담당자가 「행정절차법」에 따라 작은도서관의 등록 취소 하려함에도 사립작은도서관 운영 당사자가 불분명하거나 연락 두절 및 회피 그리고 실제 현장 방문 시 폐관 수준의 운영 중단 등으로 인해 등록취소하기 어려운 문제점이 발생되고 있다. 이를 위해 「행정절차법」제23조(처분의 이유 제시) 제1호 제3항 ‘긴급히 처분을 할 필요가 있는 경우’를 보완하여 지방자치단체의 직권 등록취소 권한을 부여하는 법 개정이 필요하다.