이홍근 선생은 1967년에 직접 미술관을 만들고 1971년 성북동 자택으로 미술관을 이전하였다. 선생은 이 동원미술관에 거주하면서 수장고 관리에 힘쓰고 소장품을 꼼꼼히 정리하며 각별히 관리하는 등 문화재 관리와 보존에 정성을 기울였다. 또한 사찰의 보물을 매입한 후에는 사찰에 이 사실을 알려 이를 가져가게 했을 만큼 문화재를 향한 곧고 바른 마음을 가지고 있었다.
이홍근 선생은 문화재를 잘 관리하고 보존하기 위해 1967년 종로구 내자동에 미술관을 설립하였고, 1971년에는 성북동에 새롭게 건물을 지어서 이전했다. 성북동 자택 안쪽에 별도로 덕수궁 석조전을 모델로 하여 건립된 동원미술관은 지하 1층, 지상 2층 규모의 석조 건물로서, 수장고와 진열실을 갖춘 전문 미술관을 지향했다. 선생은 이 건물 1층에 직접 기거했는데, 선생의 방을 지나야 지하 수장고로 들어가게 되어 있을 정도로 소장품을 철저하게 관리하였다. 기름 값이 오를 때는 자신의 거주 공간난방비를 줄이면서도 지하 수장고만은 냉난방 제습시설을 가동하는 등 각별한 노력을 기울였다. 그는 소장품을 체계적으로 관리하였는데, 소장품의 실측치를 기록하였으며, 귀중한 문화재는 딸과 며느리가 제작한 비단보와 비단주머니로 싸서 오동상자에 보관하였다. 상자에 명칭을 적고 막내아들이 촬영한 소장품 사진을 부착하기도 했다. 소장품 중 조선시대 묵죽화가 이정의 대나무 5폭이 상태가 좋지 않자 일본으로 가서 일본 왕실에 출입하는 표구상을 찾아가서 장황을 요청할 정도로 적극적인 자세로 수집품 보존에도 정성을 쏟았다. 이홍근 선생의 곧은 성품과 윤리적인 자세를 확인할 수 있는 일화가 전해진다. 그는 어느 상인이 팔려고 가져온 고려시대 <청동 은입사 향로>가 충남 개심사의 보물임을 알아차리고 매입한 후, 사찰 측에 알려 찾아가도록 하였다고 한다.