필름자료에 있어서 수집보다 중요한 것은 수집된 자료의 보존과 유실 자료의 복원이지만 일본의 필름센터 자료원이 기후 변화에 영향을 최저로 줄일 수 있게 지하에 여러 보관소를 보유하고 있는것에 반해 한국영상자료원의 시설은 전문적인 영상 자료 복원 및 보존에 크게 따라가지 못하고 있는 현황인데, 구체적으로 전문적인 건물과 환경을 갖추지 못하고 있고 보존에 필수적인 장비도 갖추지 못하고 있는 실정이다.
앞에서 지적한 바와 같이 필름 자료에 있어서 자료 수집보다 중요한 것이 수집된 자료의 보존과 유실된 자료의 복원이다. 그러나 한국영상자료원의 시설은 전문적인 영상 자료 복원 및 보존에 크게 미흡한 실정이다. 앞에서도 말했듯 전문적인 건물 및 환경을 갖추지 못한 채 많은 영상자료를 보관하고 있는 실정이며 복원 및 보존에 필수적으로 사용해야 할 기자재도 갖추지 못하고 있다. 시중에서 특수 시각 효과 장비로 사용되고 있는 아날로그 옵티컬 프린터나 디지털 영상 합성 프로그램 등은 훼손된 영상물 복원에 필수적인 기자재임에도 불구하고 아직 확보치 못하고 있는 것이 현실이다. 이에 반해 일본의 필름센터 자료원(사가미하라 별관)은 외부 기온의 변화가 미치는 영향을 최저 수준으로 줄일 수 있도록 지하에 18개의 보관고가 위치하고 있다. 이 지하 보관고는 2개 층으로 나뉘어져 있으며 지진에 대비해 안전하게 보관되도록 칸막이가 디자인되어 있다. 흑백자료들을 위한 지하 1층의 보관고들은 항상 온도 10도(±2도)와 습도 40%(±5%)로 완벽하게 통제, 유지되며 컬러 자료와 Preprint elements(negatives, master positives 등) 필름을 위한 지하 2층 보관고들 역시 온도 5도(±2도)와 습도 40%(±5%)로 완벽하게 통제, 유지되고 있다. 이 보관고는 총 2,000피트 35㎜필름을 120,000개 정도 수용할 수 있는데 이는 22,000편의 극영화 장편을 수용할 수 있는 것이다. 그러나 현재 진행중인 재건축이 끝나면 보관용량은 더욱 커져서 약 2,000피트 35㎜필름 약 145,000개, 1,500과 1,000피트 필름을 각각 40,000개씩 수용할 수 있을 것으로 보인다.