45년 미군이 인천에 상륙했고, 이들은 한국 내 모든 정치조직을 인정하지 않았다. 주한미군 사령관은 정부로 행세하려는 모든 조직의 행동을 불법이라 발표하는 등 인민공화국의 활동을 제한하였고, 인공은 해체의 순서를 밟게 되었다.
그런 와중에 1945년 9월 8일 미군이 인천에 도착하였고, 미군정이 실시되었다. 과거 일본 총독부의 지위와 체계를 그대로 인수하고 그들만이 38도선 이남의 한국에서 '유일한 정부'임을 강조하였다. 나아가 "미국의 정책은 미군이 이른바 한국 임시정부나 그 밖의 어떠한 정치조직들의 정치적 목적을 금하는 것"이라고 하며 인공과 그 외 모든 정치조직을 인정하지 않았다.
이에 인공은 전국인민대표자대회를 열어 정치 기반을 강화하려고 했지만 미군정은 표면상으로 '한 나라에 두 개의 정부가 있을 수 없다'는 이유를 내세워 인공의 활동을 극도로 제한하였다. 주한미군 사령관 하지(Hodge) 장군은 1945년 12월 12일 성명에서 "인민공화국은 그 자체가 선택한 명칭 여하를 불문하고 어떤 의미에서든지 정부도 아니고 그러한 직능을 집행할 아무런 권리도 없으며, 따라서 어떠한 정당이든지 정부로 행세하려는 행동이 있으면 이것을 불법 행동으로 취급하도록 주둔군과 군 정부에 명령을 내렸다."라고 발표하였다. 이후 인공은 점차 해체되기 시작하였다.