학술분야는 남북간 직접왕래 보다는 주로 제3국에서 교류되고 있는데 중국을 가장 많이 이용하고 있다. 이는 북한과의 교류 경험과 지리적 근접성을 활용할 수 있기 때문인데 보다 조직적이고 장기적인 안목에서 교류를 추진하고 있다. 또한 남북 대학간 교류나  교원단체간 교류도 시도되는 등 점차 다양화, 정례화 되고 있다.
학술분야는 사회문화분야 중 교류가 비교적 활발했던 분야로 남북간 직접왕래 보다는 주로 제3국에서 교류되고 있다. 우리 학자들도 이러한 현실을 감안하여 제3국을 통한 학술교류 추진을 모색해 왔고 중국을 가장 많이 이용하고 있다. 이는 연변지역 교포 학자‧단체들의 과거 북한과의 교류경험과 지리적 근접성을 활용하여 북한측을 남북학술교류의 장으로 쉽게 이끌어 내기 위해서인 것으로 보이며, 이 지역의 교포 학술단체와 자매결연‧연구원 상호교환 등으로 유대를 강화하면서 보다 조직적이고 장기적인 안목에서 교류를 추진하는 접근방법을 취하고 있다. 개최시기는 하계 방학기간인 7～8월에 집중되고 있으며, 점차 다양화‧정례화되고 있다. 남북 대학간 교류, 남북 교원단체간 교류도 시도되어 왔다. 1998년에는 성균관대, 강원대, 경남대, 총장이 방북하였고 1999년에는 경북대, 고려대 총장이 방북하여 대학간 교류문제를 협의하였다. 또한, 2001. 3. 1～6간 사운연구소와 북한 사회과학원 역사연구소가 공동주관으로 일제 강제병합 남북공동 자료전시회 및 학술토론회를 평양에서 연 바 있다. 이 분야의 협력사업으로는 동북아교육문화협력재단(구 연변과기대 후원회)이 2001년 6월 5일 협력사업 승인을 받고 추진하고 있는 평양정보과학기술대학 건립‧운영사업이 있다.