문화적 다양성 증진을 위해 독립 애니메이션에 제작 및 배급을 지원하는 정책이 실시되어야 한다. 다만 창작자의 비판정신이 두드러지는 장르 특성상 국가의 간섭을 배제하여 작가의 자격, 상업성 등에 제한을 두지 않고 지속적으로 지원해야만 공익적 효과를 거둘 수 있을 것이다.
상업적인 투자대상으로서의 가치보다는 일차적으로 사회문화적인 가치로서, 문화적 다양성의 보장을 위한 장치로서 장기적이고 지속적인 지원, 투자가 이루어진다면 단기적인 상업적 이익을 초월하는 공익적 효과를 거둘 수 있는 분야라는 것이다. 독립 애니메이션을 상업적 논리만으로 접근한다면 관련 시장이 확대되지 않는 이상 투자자를 기대할 수 없다. 이러한 현실을 감안하여 독립 애니메이션이 비영리적 공공성의 지원 차원에서 독자적으로 제작, 배급, 유통할 수 있도록 하는 지원정책이 실시되어야 한다. 2003년 영화진흥위원회의 공공 애니메이션 지원제도 신설은 이 미진한 부분-영상의 공공성 보장-을 보완하기 위한 제도라 할 수 있다. 단 방식은 지원은 하되 국가의 간섭은 배제하는 것이어야 한다. 정부주도 육성 지원책이 자칫 독립 애니메이션을 제도화된 울타리 속에 가둬 독립 애니메이션의 비판정신, 인디정신을 무디게 하는 부정적 가능성을 경계해야 한다. 독립 애니메이션 지원은 대학창작 애니메이션 지원과 달리 엘리트 전문 인력을 선발하기 위한 제도가 아니다. 산업적 가능성이 있는 몇몇 독립작가 양성이 독립영화 지원제도의 목표라면 그것은 애시 당초 독립 애니메이션 지원의 취지에서 벗어나 있는 것이다.