토요학교는 두가지 프로그램으로 짜여져 있다. 먼저, 아우름 프로그램으로 참여자들은 이를 통해 문화예술의 전반적 기본 소양을 배운다. 다음, 차오름 프로그램으로 이를 넓힌다.
토요학교의 프로그램은 ‘아우름 프로그램’과 ‘차오름 프로그램’이라는 두 가지 영역으로 구성되어 있다. 아우름 프로그램은 공연예술, 조형예술, 시각예술, 인문예술로 분류된다. 참가자들은 수업을 통해 각 분야에 대한 기초적인 지식과 여러 장르의 문화예술 분야에 대한 입문을 하게 된다. 이를 통하여 문화예술 전반에 대한 기초적인 소양과 이해력과 교양을 육성하는데 목적을 두고 있다. 차오름 프로그램은 주제별, 장르별로 심화된 프로그램을 만들어서 접근하는 문화예술교육으로 문화예술에 내재되어 있는 가치를 통하여 자아와 타자, 그리고 세계를 이해하고 정신적 지평을 넓히는 데 기여한다.