방송쿼터제의 가장 큰 문제점은 한국형 블럭버스터라고 불리는 흥행대작만을 방영한다는 점이다. 현행 스크린쿼터 제도 하에서 독립영화는 극장에서 상영되기 어려우며, 방송에서도 마찬가지다. 이는 방송사가 시청자의 볼 권리를 빼앗는 것이며, 시장원리로 문화적 종다양성이라는 중요한 가치를 깔아뭉개는 행위다.
현재 시행 중인 방송쿼터제의 가장 큰 문제점 중 하나는 현재의 방송쿼터를 통해 방영되는 한국영화의 대부분은 이른바 한국형블럭버스터라고 불릴만한 흥행대작들이라는 사실이다. 이는 사실 스크린쿼터제가 쉽게 빠지는  함정이기도 한데, 사실상 현재 스크린쿼터제도는 그 시행과정에서 할리우드 자본으로부터 한국의 자본을 보호하는 것 뿐이지 그 횡단을 가로지르는 문화적 종다양성의 확보는 놓치고 있기 때문이다. 현재 우리나라의 극장에서 독립영화가 입장료 수입을 얻으면서 상영되기를 기대하는 것은 말그대로 감나무 밑에 누워서 감떨어지기를 기다리는 것 만큼이나 미련한 짓이다. 그만큼 스크린쿼터가 지켜내고 있는 한국 영화시장은 독립영화들에 대해 배타적이다. 이는 방송쿼터에도 똑같이 적용되어, 자정에나마 방영되는 영화는 다만 1개월이라도 극장에서 인기를 끌었던 흥행작들이며, 그 어느 곳에서도 한국의 유명 독립영화를 감상할 기회를 접하기 힘들다. 그나마 EBS에서 일요일밤 자정에 방영하는 ‘단편영화 산책’이 유일한 프로그램이다. 이러한 현상은 영화시장과 마찬가지로 시장 논리를 최우선으로 하는 우리 방송사들의 편성방침에 따른 것이다. 이는 방송사가 독점적 채널편성권을 통해 시청자에게서 채널선택권과 볼 권리를 빼앗는 것이며, 결국 문화적 종다양성이라는 민주주의의 대원칙을 시장원리로 깔아뭉개는 것에 다름 아니다.