조세지원은 정부가 받아야 할 세금을 포기하는 것으로 규모나 대상을 사전에 파악하기 어렵다. 조세지원은 그 혜택이 한정될 여지가 많고 고수익의 기업이 혜택을 받는 역효과가 생길 수 있다.
그러나 정부의 입장에서 보면 조세지원은 일반적인 법령의 규정에 따라 정부가 받아야 할 세금을 포기하는 형태가 되므로 그 수혜 규모나 대상을 사전에 파악하기가 쉽지 않다. 이 점은 어떤 산업 분야에 새로운 조세지원을 도입하고자 할 때 그 도입 필요성에 대한 수치적 근거를 제시하기가 쉽지 않은 한 이유가 된다. 또한 일반 재정지원이나 금융지원의 경우 이익의 발생을 전제로 하지 않는 반면 조세지원은 이익의 발생을 전제로 하고 있기 때문에 그 지원의 혜택이 한정될 여지가 많으며, 수익이 많은 기업이 세제혜택을 가장 많이 받음으로써 결국 혜택이 가장 필요하지 않은 기업이 가장 많은 혜택을 가져가는 역효과를 야기할 여지가 있다.