위원회는 블랙리스트 사태가 시간상, 범위상 광범위하고 다양해 충분한 활동 기간을 확보하려 했으나 자유한국당 국회의원들의 조사 방해 등으로 충분한 시간을 확보할 수 없었다.
위원회는 구성 단계에서 6개월의 활동 기간을 명시하되 3개월 단위로 연장할 수 있도록 하여 충분한 활동 기간을 확보하고자 하였다. 이는 블랙리스트 사태가 시간 상, 범위상 매우 광범위하고 다양하기 때문에 많은 시간이 필요할 것이라는 판단 때문이었다. 하지만 위원회는 앞서 언급했던 자유한국당 소속 국회의원들의 조사 방해 행위 등으로 인해 충분한 시간을 확보할 수 없었다. 특히 이전의 과거사 위원회들이 다룬 사건들과는 달리 블랙리스트 사태는 현재성을 강하게 담고 있기 때문에 충분하게 시간을 두고 꾸준하게 조사할 수 있는 사회적 환경 자체를 조성하는 데 많은 어려움이 있었다.