만년제는 정조가 추진한 수원 화성의 만석거와 같이 농업의 발전을 통한 번성과 민생안정, 재정 충원 등의 목적으로 건축된 수리시설 중 하나로 융·건릉과 축만제와도 연관성이 있다. 가장 먼저 만석거가 설치되고 3년 뒤에 만년제 설치, 다음해에는 축만제가 완공되어 만년제로 원활한 물 공급으로 생활안정을 증진할 수 있었다. 
화성 만년제는 융·건릉과 용주사, 수원 화성 건설과 밀접한 역사적 연관성을 가지고 있다. 융릉(현륭원)은 장헌세자와 혜경궁 홍씨의 합장릉으로 만년제와의 직접적인 연관성을 가진다. 우선 정조가 여러 번 천명하듯이 현륭원 풍수를 보완하기 위해 수축하였다. 만년제는 수원 화성의 만석거( 石渠), 축만제(祝萬堤)와 더불어 정조가 추진한 수원 화성의 농업 진흥을 통한 번영과 생활안정, 현륭원 경영을 위한 재정 확보 등의 목적으로 축조된 수리시설의 하나이다. 18세기말 정조는 화성유수부 주변에 제언(堤堰)을 축조하여 둔전(屯田)을 경영하거나 민전(民田)에 도움을 줄 수 있는 수리정책을 펼쳤다. 그리하여 화성유수부의 북쪽에는 만석거( 石渠)와 대유둔(大有屯)[북둔(北屯)], 남쪽에는 만년제(萬年堤)와 만년들을, 서쪽에는 축만제(祝萬堤)와 축만제둔(祝萬堤屯)[서둔(西屯)]을 설치 경영하였다. 이중 가장 먼저 설치된 제언은 만석거로 1795년 5월에 축조되었고, 3년 뒤인 1798년 4월에 만년제가, 그 다음해인 1799년 5월에 축만제가 완공되었다. 만년제 수축으로 만년제 아래 농토에 안정적인 물 공급을 하여 현륭원 경영과 주변 민생안정을 도모할 수 있게 되었다.