문체부는 연극 <개구리>에 대해 편향된 정치적 소재를 다룬다 하여 배제 조치 하도록 하는 문서를 작성 후 청와대 보고하였다. 심지어 '개구리' 폴더를 만들어 블랙리스트 실행 문건들을 관리하였다.
문체부 공연전통예술과 김OO 과장이 2013년 9월 12일경 최종 완성하여 청와대에 보고한 ｢국립극단 기획공연 <개구리> 관련 현안 보고｣ 문서는 연극 <개구리>가 노무현 전 대통령을 미화하고 박정희 전 대통령을 비하적으로 묘사한 점 등을 지적하면서 ‘향후 조치 계획’으로는 “향후 국립극단 작품에서 ‘편향된 정치적 소재’는 배제토록 강력 조치”, “현 국립극단 예술감독(손진책) 교체 추진” 등이 기술되어 있다. 이러한 정황들을 종합해 보면 2013년 9월 3일 <개구리> 개막 직후 청와대에서 공연을 먼저 문제 삼아 문체부에 대책 마련을 지시했고, 9월 9일에 실수비에서는 ‘국립극단 개구리 상영 용서 안돼’라는 김기춘의 발언이 나왔다. 바로 그날, 문체부는 ‘문화예술정책 점검 TF’를 구성하여 기금 보조사업에서 특정 문예인에 대한 지원 배제책을 마련하기 시작했다. 9월 12일경에는 문체부로부터 ｢국립극단 기획공연 <개구리> 관련 현안 보고｣가 청와대로 올라갔고, 9월 12일에 중앙일보 기사가 나온 것으로 정리할 수 있다. 심지어 문체부는 컴퓨터에 ‘개구리’라는 폴더를 만들어 블랙리스트 실행 관련 문건들을 저장했다. 문체부 창조행정담당관이었던 황OO의 진술에 의하면 “전임자인 김OO으로부터 ‘개구리’라는 폴더를 인수인계받았는데, 그 폴더는 청와대 보고용으로 회의 결과를 보관하였던 용도로 알고 있다”라고 했다.