만년제는 구황실 재산으로 이왕직에서 관리하였으나 국유화되어 문화재관리국에서 관리, 이후 인근 용주토지개량계에 매각되었다. 그후 만년제를 논으로 전용하다 지역주민들의 건의서로 경기도기념물 제161호로 지정되었다.
만년제가 위치한 화성시 안녕동 152번지 일원은 본래 구황실재산으로 이왕직(李王職)에서 관리하였으나, 구황실재산법(1954.9.23.)이 시행되면서 국유화되어 문화재관리국에서 관리하였다. 이후 개정 구황실재산법(1961.10.17.)에 의거 을종재산으로 구분되었고, 을종재산은 대부 또는 매각할 수 있다는 규정에 따라 1964년 2월 26일에 문화재관리국은 인근 용주토지개량계(龍珠土地改良契)에 매각되었다. 그후 용주토지개량계는 만년제를 논으로 전용하다 농업용수조달에 어려움을 겪게 되자, 1990년 3월 개인에게 매각하였고, 이웃한 수리계 사이에 분쟁으로 인해 1991년 3월 지역주민들이 유적지로 복원되기를 희망한다는 건의서를 화성군에 제출함에 따라 1996년에 경기도기념물 제161호로 지정되었다.