청원루는 대홍수가 있어서 한 동이 훼손되고 한동만 남았다고 하는 기록이 있다. 이후 청원루 본채의 전면적인 해체수리는 물론 대대적인 수리 공사가 있었다. 
김수증의 이미 매우 낡았다는 기록 이후 청원루에 대한 특별한 중수의 기록은 없다. 오히려 1934년 대홍수가 있어서 사랑채와 안채를 합해 2동 41칸의 건물 가운데 한 동이 훼손되고 한동만 남았다고 하는 기록이 있을 뿐이다. 이후 청원루의 수리는 몇 차례 더 있었으나 대체로 현황을 이룬 것은 1977년과 1978년의 대수리이다. 이때 본채의 전면적인 해체수리는 물론 자연석 담장과 솟을 삼문, 협문, 기단과 마당 등에 대한 대대적인 수리 공사가 있었다. 최근에는 2008년에 다시 벽체 미자와 담장 기와고르기 등의 부분적인 보수 공사가 있었다.