애니메이션에서 제작된 캐릭터나 시나리오를 바탕으로 게임이 만들어지는 경우가 많았으나, 최근에는 <포켓몬스터> 등과 같이 게임에서 출발한 캐릭터가 애니메이션으로 제작되기도 한다.
반면에 게임 산업은 애니메이션에서 제작된 캐릭터나 소재 및 시나리오를 바탕으로 하여 소프트웨어를 제작하는 파생시장이기도 하다. 요미우리 TV로부터 원청을 받아 <명탐정 코난>을 제작한 TMS 엔터테인먼트는 같은 작품을 게임 소프트웨어로 제작을 계획하고 있으며, <드래곤볼>은 게임팩으로 발매된 직후 낱개 당 가격이 11만원대에 판매되고 있다. 최근에는 게임 붐에 편승, 빅히트 게임 소프트웨어를 만화로 만든 작품들도 발간 즉시 1000만부 이상 판매되고 있을 뿐만 아니라, 게임의 내용을 소재로 한 애니메이션의 제작도 활발히 진행되고 있다. 한국을 비롯한 세계 시장에서 많은 인기를 얻은 <포켓몬스터>도 게임 소프트웨어에서 출발한 캐릭터가 애니메이션으로 제작된 것이다. 즉 일본 애니메이션 산업은 출판만화 산업과 게임산업간의 상호 교류를 통해 부가가치 창출 효과를 극대화하고 있다.