김 장관은 공군참모총장 이·취임식에 참석 후 각 군 참모총장과 간담회를 하고 군 병영 내의 구타·폭행에 의한 사망사건의 심각성을 인식하고 부대를 정밀 진단할 것을 지시할 것이다.
이후에 김 장관은 4월 11일 계룡대에서 공군참모총장 이·취임식에 참석합니다. 참석한 뒤에 장관 간담회를 각 군 참모총장과 하는데, 여기에서 군 병영 내에 발생한 구타·폭행에 의한 사망사건의 심각성을 인식하고, 전군에 지휘관 책임하에 부대를 정밀 진단할 것을 지시합니다.  이에 따라서 4월 11일부터 28일까지 전군 부대정밀진단을 실시합니다. 그리고 그 결과에 대해서는 5월 9일 각 군 참모총장으로부터 김 장관이 그 결과를 보고 받습니다. 하지만 공소장에 나와 있는 치약을 먹이고 가래침을 뱉어서 핥게 하고 수액을 맞춰서 때리는 엽기적인 행위에 대해서는 4월 15일 해당 사단, 28사단 헌병대 조사결과에서 밝혀졌습니다. 이러한 내용은 국방장관에게 이후에 보고되지 않았습니다.  그래서 지금 감사하는 것은 왜 이런 내용이 보고되지 않았는지, 어느 선에서 중단이 됐는지 누락을 시켰는지, 하는 데에 중점을 두고 감사를 하고 있습니다.  이에 대한 후속조치로 헌병대 조사결과에 따라서 연대장, 대대장, 포대장을 보직해임하고 4월 21일입니다. 관련자 16명을 4월 25일 징계 조치합니다. 이와 별도로 법적 절차에 따라서 28사단 헌병대가 4월 7일 가해자 4명을 긴급 체포합니다. 또 4월 9일에는 상해치사로 구속시킵니다.  군 검찰은 4월 15일 이 사건을 송치 받아서 5월 2일 기소합니다. 이 사건은 28사단 군사법원에서 5월 22일부터 7월 10일까지 세 차례에 걸쳐서 공개적으로 심리공판을 진행했습니다. 따라서 이 내용에 대해서는 은폐 자체가 불가능합니다.