연구팀은 국내의 대표적인 일곱 가지 젓갈에 원핵 미생물의 한 종류인 고세균종이 상당히 높은 비율로 존재하고 있는 것을 규명했다.
메타지놈 분석에는 가장 진화된 분석방법인 파이로시퀀싱 기술을 사용하였으며, 김치의 발효과정에 관여하는 모든 미생물에 대한 유전자 분석을 수행한 것으로, 김치 내에 특정 미생물 유전자가 존재하는 것과 그에 따른 특정 발효산물을 생성하게 되는 상호관계를 세계 최초로 규명하게 됐습니다. 이번 연구 결과로 김치 내에 어떤 다양한 미생물이 존재하고 있는지 보다 명확하게 분석이 됐고, 이 미생물들의 유전자 발현조절을 통해 김치의 맛과 건강에 대한 기능성을 높이는데 관여하는 과학적 비밀을 풀어가는 실마리를 마련하였습니다. 특히, 안정적인 김치 발효를 위해서는 발효 후반기에 급격히 증가하는 세균을 숙주로 하는 바이러스인 박테리오파지의 역할이 중요하다는 사실을 과학적으로 확인한 것도 큰 성과로 생각이 됩니다. 또한, 연구팀은 동일한 분석방법을 이용하여 국내의 대표적 일곱 가지 젓갈(새우젓, 조개젓, 오징어젓, 굴젓, 명란젓, 창란젓, 게젓)에 존재하는 미생물을 분석하여, 바다에는 널리 존재하지만 아직 분리되지 않고 있어 학계의 높은 관심을 불러일으키고 있는 원핵 미생물의 한 종류인 고세균종(Crenarchaeota)이 상당히 높은 비율로 존재하고 있음도 규명하였습니다. 이러한 연구 결과는 2009년도에 <Nature>의 자매지인 미생물 생태학 및 응용미생물 분야에서 최고의 저널로 알려진 <The ISME (International Society for Microbial Ecology)>에 1편, 그리고 2010년과 2011년에는 미국 미생물학회가 발간하는 관련 분야 최고의 저널인 <응용환경미생물학회지(Applied and Environmental Microbiology)>에 2편을 연달아 게재하는 성과를 얻었습니다.