4대강 조사평가위의 정책 재원과 병행하여 녹조 발생을 예방하기 위한 수질관리 대책을 강화하고 제2차 물환경관리 기본계획을 수립해 추가 저감 방안을 마련할 예정이다.
또한 기상변동 영향 등을 고려한 장기적인 수질평가 기법을 2015년 말까지 개발하는 등 과학적인 조사와 연구시스템을 구축해 나갈 예정입니다. 영산강 일부 지류나 낙동강 상류 지역 등 4대강사업 이전에 비해 인 농도가 다소 높아진 수역에 대해서는 2016년부터 실시할 제2차 물환경관리 기본계획을 수립할 때 인 추가 저감 방안을 마련해 나갈 예정입니다. 또한, 이와 같은 4대강 조사평가위의 정책재원과 병행하여 녹조발생을 사전에 예방하기 위한 지류의 수질관리 대책도 강화해 나갈 예정입니다. 이 지류는 하·폐수처리장의 방류수, 농경지와 같은 곳에서 발생하는 비점오염물질 등이 바로 직유입 되어 본류에 영향을 미치고, 특히 유량이 적어 수온이 상승하기 시작하면 본류보다 먼저 수질이 악화되거나 녹조현상이 발생되는 현상들이 항상 문제가 되어왔습니다 이에 따라서 올해에는 낙동강 수계 합천창녕보, 강정고령보, 창녕함안보 등 3개보 유역을 대상으로 본류로 유입되는 지류에 대한 오염원 현황, 저수지 관리, 오염 본류 기여율 등의 정밀진단을 실시 중에 있으며, 2017년까지는 다른 보 유역까지 대상을 점차적으로 확대해 나갈 예정입니다. 이와 함께 오염도가 심한 지류를 대상으로 총인(T-P), 화학적 산소요구량(COD) 등 기존의 총량관리에서 시행해 오지 않았던 항목 등에 대해서 수질오염물질을 미리 할당하여 책임지도록 하는 ´지류총량제´를 낙동강 일부 지역을 대상으로 시범적으로 일단 실시해볼 예정입니다.