농촌진흥청에서는 고려인삼과 외국산의 품종을 구분할 수 있는 다양한 DNA 마크를 개발하였고 4종의 첨단 분석기기를 동시에 활용하여 원산지 판별을 하고 있다. 
먼저, DNA를 이용한 국내산과 외국산 판별에 대해서 말씀을 드리겠습니다. 평상시에 농촌진흥청에서는 고려인삼과 외국산 등의 품종을 구분할 수 있는 다양한 DNA 마크를 개발하여 우리 품종의 우수성과 지적재산권 보호를 위해 노력해오고 있습니다. DNA 마크를 이용한 홍삼 농축액 판매기술은 2012년부터 시작하였으며, 홍삼 농축액은 제조과정에서 열에 의해 DNA 손상이 많이 되기 때문에 식물체의 잎과 뿌리를 가지고 DNA를 추출하고 유전자를 분석하는 일반적인 실험과는 많은 다른 어려움이 있었습니다. 그래서 우리 연구진은 이러한 문제를 극복하기 위해서 짧은 단편의 염기서열이 증폭될 수 있는 DNA 마크를 개발하였습니다. 이를 이용해서 종의 기원이 다른 고려인삼, 미국삼, 중국삼으로 만든 홍삼 농축액을 확실하게 판별할 수 있게 되었습니다. 두 번째로, 첨단 분석기기를 이용한 원산지 판별에 대해서 말씀드리겠습니다. 첨단 분석기기를 이용해 종의 기원이 같은, 즉 첫 번째로 동일 품종을 다른 생산지에서 생산한 품종을 가지고 홍삼 엑기스를 만들었을 때, 두 번째는 고려인삼을 동일 품종일 때 *** 중국삼이 혼합되었을 경우, 또는 사포닌 성분을 가진 도라지, 더덕 등이 함유된 위조 홍삼 농축액을 구분할 수 있는 원천기술을 개발하였습니다. 이 기술은 우리나라와 외국, 중국이나 미국의 토양, 기후, 재배 및 가공방법이 다르다는 점에 착안해서 각국에서 재배한 인삼으로 만든 홍삼 농축액을 전자코, 근적외선분광분석기 등 4종의 첨단 분석기기를 동시에 활용하여 분석하였습니다. 이에 판별정확도는 100% 정도로 완벽하다고 볼 수 있습니다.