토지이용의 변화로 탄소가 풍부한 유출물 침전과 지표유출수 내 고형물 퇴적은 정비하천 혼합대 상부에 하상퇴적물로 쌓인다. 이는 하천수의 오염으로 지표수-지하수의 혼합 저해나 수교환 단절을 야기한다. 이 때 오염 퇴적오니의 준설로환경적 기능을 복원시킬 수 있지만, 무차별한 준설은 생태계서비스를 파괴하므로 지양해야 한다.
일반적으로 정비하천은 자연하천에 비해 댐이나 보 등의 영향으로 하천유량이 많고 유속이 느려서 지표수-지하수 혼합대 상부에 환원환경의 하상퇴적물이 쌓이게 된다. 하천 직강화로 인해 하천주변의 토지를 농지로 이용하는 등 토지이용의 변화가 생기면서 정비하천의 하상에는 탄소가 풍부한 하수나 농업유출수의 유입으로 탄소가 풍부한 유출물이 침전되거나, 하천변 도로나 불투수성 표면으로부터의 지표유출수(runoff) 내 고형물이 퇴적된다. 이러한 외부에서 유입된 요소에 의한 침전물 또는 퇴적물은 정비하천의 하상퇴적물을 구성하게 된다. 이러한 퇴적물은 하천수의 오염이 심한 경우 지표수-지하수의 혼합을 저해하는 요인이 되며 극한의 경우 지표수-지하수의 수교환 단절을 초래하여 지표수-지하수 혼합대가 사라지는 경우가 발생한다. 이같은 경우, 오염 퇴적오니의 준설은 지표수-지하수의 혼합을 재생시킴으로써 환경적 기능을 복원시킬 수 있다. 그러나 혼합대를 포함하는 무분별한 준설은 기형성된 혼합대 생태계서비스를 파괴함으로써 원래 가지고 있는 혼합대의 기능을 저하시킴과 동시에 궁극적으로 혼합대 생태계로의 회복 또한 불가능하게 만드는 결과를 야기할 수도 있다(박희두, 2011).