지하수 개발 사업에서의 환경영향평가는  ｢지하수법｣과 ｢환경영향평가법｣ 간의 관계 특징 상 선행된 지하수 영향조사의 결과를 따른다.
지하수 개발이 포함된 사업에서 환경영향평가의 중요한 특징은 관정 개발 시 미리 실시되었던 지하수영향조사를 인용하고 있다는 점이다. 예를 들어, 온천 사업은 지하수 개발을 목적으로 하는 것으로 환경영향평가 이전에 온천공조사가 수행되고, 환경영향평가는 이 보고서를 인용하여 사업이 지하수에 미치는 영향을 파악한다. 즉, 지하수 개발이 환경영향평가 이전에 수행되는 경우, 지하수 영향조사(온천공조사)를 통해 지하수 개발의 적정성 및 관정 개발이 주변 환경에 미치는 영향이 미리 파악되고, 환경영향평가는 개발계획(온천 개발계획)이 수립된 후 수행된다. 결론적으로 지하수 개발이 포함된 사업의 경우, ｢지하수법｣이 ｢환경영향평가법｣에 먼저 적용되므로 환경영향평가는 지하수 영향조사에 종속되는 것이 일반적인 실정이다.