인공지능과 마찬가지로 합성생물학 분야 역시 빅데이터를 활용하는 데 제약이 있다. 이를 해결하기 위해 데이터 3법의 개정 논의가 있었는데, 특히 가명 정보 개념을 도입하면 특정 목적에서는 정보 주체의 동의 없이 사용 가능해지고  산업의 복합 분야에서 활용이 가능해진다. 이 문제가 해결되어야 빅데이터 구축을 통한 합성생물학 분야의 기술 개발이 가능할 것이다.
빅데이터, 딥러닝, 인공지능이 불과 3년 반 전, 알파고가 이세돌 9단을 누르면서 인공지능시대의 도래를 알렸지만 아직까지 국내의 법규나 제도적인 시스템들이 갖추어지지 않아 기업들이 데이터를 활용하는 데는 큰 제약이 있습니다. 데이터 활용에 대한 국내 규제들 때문에 인재의 외부 유출과 연구를 중단하는 문제점이 있는 것으로 보입니다. 합성생물학 분야도 마찬가지로 빅데이터를 구축하더라도 이를 활용하는 데에는 법적·제도적 장치가 없기 때문에 실제 연구를 진행함에 있어서 현재로서는 많은 한계가 있을 것으로 생각됩니다. 최근 이러한 문제를 해결하기 위하여 개인정보보호법, 정보통신망법, 신용정보법과 관련된 데이터 3법의 개정에 대한 논의가 국회에서 있었습니다. 공청회나 토론회를 통해 사회적 합의를 하고 해결 방안을 마련하여 제도화 및 법제화해야 합니다. 현재는 가명 조치한 개인정보를 사전에 구체적 동의를 얻은 범위 내에서 데이터를 활용해야 하고, 특정 목적 달성 이후 5일 이내에 지체 없이 폐기해야 합니다. 개정이 되면, 가명 정보 개념을 도입하여 연구 등의 특정 목적에서는 정보 주체의 동의 없이 사용이 가능해지고 나아가서 산업의 복합 분야에서 활용이 가능해 집니다. 가명 정보의 사용과 관련하여 동의 없이 사용 가능한 목적 범위의 구체화, 가명 정보 이용 시 안전장치 및 통제 수단 마련, 개인정보를 관리·감독하는 개인정보보호위원회를 통해서 일원화된 연구를 진행해야 합니다. 이러한 문제가 해결되어야만, 빅데이터 구축을 통한 합성생물학 기술개발이 가능할 것으로 생각합니다.