복숭아 육종 프로그램은 다양한 요구를 만족시키기 위해 시행됐는데, 최근에는 소비자들의 요구가 점차 증대되어 기능성 과수 육성도 중요한 과제가 됐다.
복숭아 육종 프로그램은 수요자의 다양한 요구를 충족하기 위해 진행돼왔으며, 이를 통해 많은 품종들이 개발 및 보급돼왔다. 최근에는 기능성 과실에 대한 소비자 요구가 증대됨에 따라 기능성 과수 품종 육성도 중요한 육종 목표가 됐다. 복숭아의 기능성 함량 증진 품종 육성을 위해 적육계 복숭아 유전자원이 교배친으로 활용되고 있으나 그 수가 많지 않고, 대체적으로 산미가 높아 소비자의 기호도가 낮은 단점이 있다. 따라서 기능성 함량이 높은 복숭아 품종을 육성하기 위해서는 적육계 복숭아 품종과 산미가 적고 당도가 높은 백육계 또는 황육계 품종을 교배해 세대를 진전시켜야 한다.