BRC 종합진단운 네 부분으로 진행된다. BRC 구축 운영을 주도하는 국가 차원의 전략을 진단해 국가 정책•전략을 파악하고, 계획•현실 간 정합성 등을 살핀다. 이어 BRC의 생물자원 생명정보에 대한 접근성•윤리 안전 문제를 중점으로 사회경제적 정당성을 살핀다. 또한  BRC의 기능적 효율성을 점검한다. 마지막으로 BCR의 재정지속가능성을 살핀다.
BRC에 관한 종합 진단은 제2장에서 수립한 BRC 분석 틀에 근거하여 크게 네 부분으로 진행된다. 첫째, BRC 구축 운영을 주도하는 국가 차원의 전략을 진단한다. 국공립 BRC를 구축 운영하는 과정을 지탱해온 국가 정책과 전략이 무엇인지를 밝히고, 수립된 계획 전략들 간의 호환성, 계획과 현실 간 정합성, 미래 변화에 대응한 국가 전략의 적절성 등을 살핀다. 둘째, BRC의 사회경제적 정당성을 살핀다. BRC도 하나의 사회조직으로서 BRC의 생물자원과 생명정보, 그리고 관련 기술 서비스를 마련하고 제공하는 과정에서 형성된 규범들이 사회적으로 적절한 지를 살핀다. BRC의 사회경제적 측면 중에서도 특히 생물자원 생명정보에 대한 접근성과 활용 시 발생하는 윤리 안전의 문제를 중점적으로 살핀다. 셋째, BRC의 기능적 효율성에 대해 점검한다. 다시 말해, BRC가 연구 인프라로서 본연의 기능을 수행하기 위하여 기술적 조직적으로 효율적 운영 체계를 갖추고 있는지를 살핀다. BRC가 확보 제공하고 있는 생물자원과 생명정보의 양과 질이 핵심 기능을 수행하기 위해 적절한 수준인지에 대해서도 진단한다. 넷째, BRC의 재정적 지속 가능성에 관하여 살핀다. 구체적으로 BRC가 중장기적으로 지속 가능하기 위해 재원 확보, 재무 관리, 외부 후원자 및 사회적 지지 동원 등과 같은 사항을 계획 준비 이행하고 있는지를 살핀다.