연구는 프로그램 디렉터가 제도를 총괄하고 검토하는 버추얼 네트워크형 연구소를 구축해 추진한다. 최적의 연구영역·총괄을 설정해 선도적인 연구자를 발굴한다. 연구총괄은 여러 능력이 있어야 하며 과제의 평가에 책임이 있다. 
연구는 대학․기업․공공연구기관 등의 연구자로 구성된 버추얼 네트워크형 연구소를 구축하여 추진한다. 버추얼 네트워크형 연구소란 조직의 틀을 벗어난 연구체제를 말하는데 프로그램 디렉터(PD)가 제도의 전체를 총괄하고 운영 방침 등을 검토한다. 과제달성을 위한 최적의 연구영역․연구총괄을 설정하고, 이를 바탕으로 선도적․독창적인 연구를 추진할 수 있는 연구자를 발굴하게 된다. 연구총괄의 요건은 해당 연구영역에 있어서 선견성 및 통찰력을 보유하고, 연구과제의 효과적․효율적인 추진을 위한 연구 매니지먼트의 경험과 능력이 있어야 할 것을 요구하고 있다. 뿐만 아니라, 우수한 연구실적을 보유하고 관련 분야의 연구자로부터 신뢰가 있는 인물이어야 한다. 그리고 연구총괄(PO)은 연구영역에 따른 과제의 사전․중간․사후 평가에 대한 책임이 있으며, 영역 어드바이저 선정과 평가 결과에 따른 연구비 배분, 연구진척 현황 파악 및 조언 등을 수행한다.