논문, 특허 산출물 중심의 관리는 다른 과학기술 분야에 알리기 위해 긍정적인 역할을 해왔지만 문제해결성과는 미비하여 정부의 개발생산성을 하락시키는 요인이 된다. 
지금까지 논문, 특허 등 산출물 중심의 관리는 과학기술분야의 발전을 위해 과학기술개발활동을 통해 일차적으로 창출되는 산출물 확대의 필요성과 타 분야와 차별화되는 과학기술분야 산출물의 특성을 타 분야에 알리기 위한 보편적 수단 활용 측면에서 긍정적인 역할을 해 왔다. 그러나 이러한 논문, 특허 등 일반적 산출물 중심의 성과관리는 실질적인 문제해결성과와는 거리가 있어 정부연구개발의 생산성을 하락시키는 중요한 요인으로 작용하고 있다. 이러한 성과관리의 문제는 연구개발의 본원적 성격인 문제해결활동이라는 점을 충분히 고려하지 않은 성과관리제도로부터 비롯되고 있다.