나노물질은 폐기 이후에도 잔류하는 독성물질에 대한 처리방법이 알려져 있지 않다는 것과 다른 영역의 기술들과 융합하면서 기존에 없던 사회적 문제를 야기할 수 있다는 것 역시 문제점으로 지적된다.
셋째, 폐기 이후에도 잔류하는 독성물질에 대한 처리방법이 알려져 있지 않다는 점이다. 기존에 생산된 각종 제품에 나노 기술을 적용할 때, 내구성이나 방오, 방취 등 다양한 기능들이 향상될 수 있다. 그러나 이러한 제품이 폐기 단계에서 생물학적으로 완전히 분해되지 않는 경우, 또 다른 오염의 발생원이 될 수 있다. 넷째, 다른 영역의 기술들과의 융합을 통해 발생할 수 있는 위험들이 있다. 나노기술과 바이오기술, 정보통신기술, 인지과학들 사이의 접점에 새로운 의료기술이 발전하고 있다는 점은 예의 주시해야 할 부분이다. 생체정보전달기기의 경우, 인체 내 삽입이나 휴대가 용이하게 된다. 이로써 인간의 신체적, 정신적, 감각적 기능향상이 용이해 질 것으로 예상되는데, 이는 또 기존에 없었던 다른 사회적 문제를 야기할 수 있다. 인간이 할 수 있는 것과 기계가 할 수 있는 것의 구분이 모호해지면서, 인간고유의 정체성에 대한 논란과 인간이 점하고 있던 많은 업무들을 대체하는 기계와의 관계 등 여러 가지 갈등과 불평등의 문제도 위험으로 보아야 한다.