산업통산자원부는 국가책임기관으로 유전자변형생물체 사전수입, 정보센터의 정보교환, 공시 공고 및 정보 관리, 의정서 등을 관할한다. 위원회를 설치할 수 있고 정보센터는 전문 업무를 한다.
또한 국가책임기관의 역할은 산업통상자원부가, 국가연락기관의 역할은 외교부에서 담당하고 있다. 국가책임기관인 산업통상자원부는 환경 방출로 사용되는 유전 자변형생물체의 사전수입동의에 관한 사항, 바이오안전성정보센터와의 정보교환에 관한 사항, 규정에 의한 고시․공고의 통합공고, 관계 중앙행정기관의 장으로부터 제공받은 정보의 관리에 관한 사항, 의정서 이행에 관하여 필요한 사항 등의 업무를 수행한다. 그리고 GMO의 수출입 등을 심의하기 위하여 산업통상부장관 소속으로 바이오안전성위원회를 둘 수 있으며, GMO의 정보관리 및 정보교환에 관한 사항을 전문적으로 수행하는 업무는 산업통상자원부에서 지정한 바이오안전성정보센터에 서 담당하고 있다([그림 4-1] 참조).