연구개발사업의 평가는 성질이 같은  부류의 논문이나 특허 등  간에 이뤄져야 한다.  그 가치 수준의 정확한 평가를 위해서는 구조적인  개조가 필요하다.
평가는 단지 동질적인 요소들에 대해 이루어질 때 공정한 것이다(Schutz, 1967). 여기에서 동질적 요소는 동일한 적합성(relevance) 영역에 속하는 요소를 의미하며, 이질적인 적합성 영역에 속하는 요소들은 서로 비교되어 평가될 수 없는 것이다. 현재의 평가시스템은 이질적인 적합성 영역에 있는 요소들 즉 연구과제들을 하나로 묶어 논문과 특허 등의 객관성이라는 잣대로 평가하는 것이다. 따라서 평가 대상 사업들의 구성이 적합성 있게 이루어지지 않는 한, 질적 평가를 수행한 방법이 없을 수 있다. 질적 평가를 효과적으로 수행하기 위해서는 연구과제를 동질적으로 구성하는 R&D 사업구조의 개편이 전제되어야 한다.