KISTEP은 정부 연구개발투자 추이와 포트폴리오 분석을 수행하는 보고서를 매년 발간한다. 이를 민간투자현황과 비교분석하면 정부 연구개발투자의 방향성을 파악할 수 있다.
정부와 민간의 연구개발투자 포트폴리오 분석을 통해 다양한 측면에서 정부와 민간의 투자 현황을 비교분석함으로써 정부 연구개발투자의 방향성을 파악하는데 그 의의가 있다고 할 수 있다. 연구개발투자 포트폴리오 분석과 관련한 대부분의 연구는 주로 정부의 연구개발투자 DB(NTIS 데이터)를 가지고 있는 KISTEP에 의해 이루어지고 있다. KISTEP은 매년 󰡔국가연구개발사업 조사분석 보고서』를 발간하고 있는데, 이 보고서에서 부처별, 연구수행 주체별, 연구개발단계별, 지역별, 기술분야별 등의 측면에서 정부의 연구개발투자 추이 및 포트폴리오 분석을 수행하고 있다.