슈퍼 스마트 사회의 전개에 필요한 추진체계의 역할을 강조한다. 특히 사회 구현을 위한 개발과 기초연구가 상호 자극하면서 새로운 과학의 창출, 혁신기술의 실현, 실용화 및 사업화를 동시에 추진할 수 있는 환경이 필요하다. 또한 연구개발을 통한 인재육성과 융합연구개발을 강조한다. 종합과학기술혁신회의에서는 기반기술들을 효율적으로 연구개발 할 수 있도록 선도한다. 
이러한 기반기술 분야에 대한 강조이외에 슈퍼 스마트 사회의 전개에 필요한 추진체계의 역할을 강조하고 있다. 즉, 슈퍼 스마트 사회의 전개에 필요한 기술의 목표 달성을 위해 산학연 협동연구를 통한 연구개발체계를 강화하고 있다. 특히 기초연구에서 개발까지 선형모델로 추진하는 것이 아니라 사회 구현을 위한 개발과 기초연구가 상호 자극하면서 서로 나선형으로 연구개발하는 방식을 통해 새로운 과학의 창출, 혁신기술의 실현, 실용화 및 사업화를 동시 병행적으로 추진할 수 있는 환경을 조성할 것을 강조하고 있다(일본 내각부, 2016, p.18). 이러한 방식의 전개는 연구개발의 목표 달성을 위해 기존의 기초, 응용, 개발을 구분하는 연구개발방식 및 단계별 연구개발방식에서 벗어나는 새로운 시도이자 현상이라고 볼 수 있다. 이외에도 연구개발을 통한 인재육성을 강조하고 있으며 융합연구개발을 강조하고 있다. 특히, 인공지능기술과 보안기술의 영역 등에서는 기술의 진화가 가져오는 사회에의 영향과 인간과 사회의 본연의 자세에 대한 통찰력 심화를 위해 인문사회과학 및 자연과학 분야 연구자간의 연계 융합 연구개발을 강조하고 있다. 또한 뛰어난 지도자 밑에 우수한 인재들을 결집하고 연구개발 프로젝트를 유연하게 운영할 수 있는 체제의 구축도 강조하고 있다. 그리고 상위 컨트롤타워인 종합과학기술혁신회의에서는 각 부처들이 기반기술들을 효율적으로 연구개발을 추진할 수 있도록 선도하고 진행상황에 대한 평가와 그에 따른 탄력적인 추진을 하는 역할을 하도록 제시하고 있다(일본 내각부, 2016, p. 64).