시장기반조치는 기업에 큰 영향을 줄 것으로 보이는데, 대부분 기업 운영에 부담을 주는 방향인 것으로 보인다. 
기술적 및 운항적 조치에 이은 시장기반조치는 해운기업과 관련 기업의 경영과 영업에 상당한 영향을 미칠 것이다. 제시된 대안의 내용을 보면, 연료소모량에 부가하여 추가비용이 부과되는 대안, 해운업 본질과 직접적인 관련이 없는 파생상품의 특징을 갖는 대안 또는 연료효율 개선을 위해 미래의 혁신기술 선택의 부담을 주는 대안 등 대부분이 해운업계에 부담을 주게 된다. 물론 변화를 기회로 활용하려는 선도기업도 나타나고 있지만, 제시된 대안들이 저성장 국면에 직면한 현재 해운업계에 부담인 것은 분명하다. 특히 유동성 위기에 직면한 국내 해운기업은 변화를 선도하지 못하고 대응하기에 급급한 실정이며 정보력에 뒤진 중소기업은 대응하기도 쉽지 않은 상황이다.