STOA는 STOA패널, STOA국, STOA유닛으로 구성되어 있다. STOA패널은 활동을 총괄하며 투표권을 가진 15명의 유럽의회 의원으로 구성되어 있고 임기는 2년 6개월이다. STOA국은 패널 회의 준비와 제반 활동을 담당하고, STOA유닛은 사무국과 함께 실제 운영을 맡는다.
STOA는 STOA 패널과 STOA 국(Bureau), STOA 유닛(Unit)으로 이루어져 있다. STOA 패널은 의회 구조의 통합적 일부로 STOA 활동을 총괄하며, 투표권을 가진 15명의 유럽의회 의원으로 구성되어 있다(STOA, 2012). 유럽의회 부의장이 STOA 패널의 총 책임을 맡고, 산업연구에너지 위원회에서 4인, 고용 및 사회문제 위원회에서 2인, 환경공중보건 및 식품안전 위원회에서 2인, 내부시장 및 소비자보호 위원회에서 2인, 운송 및 관광 위원회에서 2인, 농업위원회에서 2인을 선출한다 (STOA, 2012). 이들의 임기는 2년 6개월이다. STOA 국은 패널 회의를 준비하고 STOA의 제반 활동을 담당하는 조직으로, SOTA 패널이 국장과 2명의 부국장을 의원 가운데서 선출한다(STOA, 2012). 유럽의회의 부의장은 직무상 STOA 패널의 총 책임자일 뿐만 아니라 STOA 국의 일원이기도 하다(EPTA, 2012). STOA 유닛은 STOA 사무국(Secretariat)과 함께 실제 운영 업무를 맡는다(EPTA, 2012).