COD, 총인 등을 종합적으로 볼 때 새만금 방조제 외해역 수질은 좋은 편이다. 따라서 방조제 건설 사업이 환경 생태를 악화시켰다고 판단하는 것은 어불성설이다. 
이상 살펴본 바와 같이, COD, 총인, 총질소, 수질평가지수 등을 종합적으로 볼 때 새만금 방조제 외해역의 수질은 전반적으로 양호한 수준으로 유지되고 있다. COD와 총질소 연평균 농도가 최근 10~11년간 안정적으로 II등급 이하로 유지되고 있으며, 연도별 수질평가지수도 I등급 혹은 II등급으로 지속적으로 양호하게 나타나고 있다. 총인의 경우 2007년도까지 연평균 농도가 III등급 이상으로 다소 높게 나타났으나, 2008년 이후 최근 3년간 수치가 크게 개선되어 II등급을 유지하고 있다. 따라서, 방조제 건설 및 개발사업의 영향이 새만금 외해역의 해양환경 상태에 높은 수준으로 악영향을 주었다고 판단할 수 있는 근거는 미흡하다.