근친교배를 통해 만들어진 우량돈군은 경제형질의 우수성이 문제가 된다. 경제형질 간에는 유전적으로 정 또는 부의 상관관계가 있어 한 형질이 개량되면 다른 형질이 저하될 수 있기 때문에 품종 특성에 맞는 계통 조성이 필요하다. 계통조성의 목적은 실용돈과 종돈의 제일성 제고, 엘리트핵돈 내에 고정된 우량유전자의 유지와 활용, 잡종강세효과, 상호보완효과의 효율적 발휘이다.
유전적으로 우수한 우량종돈에 의해 생산된 돼지를 비육하는 것이 양돈경영에 있어 성공의 지름길이라는 것은 누구나 알고 있다. 이 우수한 우량종돈을 만들어 가는 한 방편이 계통조성이라 하겠다. 한편, 근친교배를 통해서 유전적으로 우수한 우량돈군이 만들어졌다 하더라도 번식, 산육, 육질과 같은 경제형질이 우수하지 못하면 산업적으로는 쓸모가 없다. 그러나 여러 가지 혹은 모든 경제형질이 우수한 돈군을 육종하는 것은 현실적으로 불가능하다. 돼지의 경제형질 간에는 유전적으로 정(+) 혹은 부(-)의 상관관계를 가지고 있어 한 형질을 위주로 개량해 나가면 다른 형질에서 능력의 저하가 발생하는 경우가 있다. 예를 들면 일당증체량과 등지방두께의 상관관계는 0.4-0.5 정도로 일당증체량의 증가에 따라 등지방두께도 함께 증가하는 경향을 보인다. 따라서 계통조성을 하는데 있어 번식, 산육, 육질의 계통을 구분하여 각 품종의 특성에 맞는 개량목표에 따라 각각의 계통을 조성해야 할 필요가 있다. 이렇게 특정한 형질들에서 우수한 계통이 만들어지면 최종적으로 육종 계획에 따른 계통간 교배 혹은 품종간 교배에 의해서 형질간의 상호보완적인 우수한 비육돈을 생산하는 것이 계통조성의 목적이라 하겠으며 이를 정리하면 다음과 같다. 첫째, 실용돈과 종돈의 제일성을 높인다. 둘째, 우량유전자를 앨리트핵돈내에 고정시켜 거의 영속적으로 계통내에 유지하고 활용할 수 있다. 셋째, 계통간 교배에 의하여 발현되는 잡종강세효과 및 상호보완효과를 보다 효율적으로 발휘할 수 있다.