안전성 조사에서 부적합 판정을 받아 출하 연기된 사례의 사후관리 실태를 확인했을 때 여전히 안전성재조사를 받지 않은 양식장이 있는데도 국립수산물품질관리원은 이를 그대로 두고 있었다. 
이번 감사원 감사기간 중 2014년부터 2017년까지 안전성조사에서 부적합 판정을 받아 출하연기된 사례 64건의 사후관리 실태를 확인한 결과, 60건의 경우 안전성재조사를 받은 것으로 확인되었으나 2016. 10. 19. 엔로플록사신 잔류허용기준 초과로 부적합 판정되어 출하연기를 통보받은 ◉◉송어장(송어 양식)은 2018년 7월 현재까지 안전성재조사를 받지 않는 등 [표 56]과 같이 4개 양식장의 경우 안전성조사 결과 부적합 판정을 받은 후 길게는 4년에서 짧게는 1년이 경과한 2018년 7월 현재까지 안전성재조사를 받지 않고 있는데도 국립수산물품질관리원은 이에 대한 실태 파악 없이 그대로 두고 있었다.