올바른 R&D 사업구조는 무작위적인 외적관계가 아닌 원인과 결과 관계를 갖는 내적관계를 중심으로 유형화되어야 하므로 적정 범위의 문제해결 중심 사업구조를 설계해야 하고 해결 대상이 되는 문제가 논리적으로 분명히 정의되어야 한다.
앞에서 논의된 바와 같이 R&D 아키텍처는 두 가지 단계에서 이루어질 수 있는데 그 첫 번째 단계가 적정 범위의 문제해결 중심 사업구조를 설계하는 것이다. 이를 위해서는 해결 대상이 되는 문제가 가능한 논리적으로 분명하게 정의되어야 하며, 이와 같이 정의된 문제해결의 범위가 적정해야 한다. [그림 2-2]는 혼란스런 R&D 사업구조와 올바른 R&D 사업구조의 예를 제시하고 있다(Sayer, 이기홍 역, 1999, 안두현 외, 2014에서 재인용). 올바른 R&D 사업구조는 문제 대상들에 대한 내적 관계를 중심으로 유형화되어 있는 반면, 혼란스런 R&D 사업구조는 내적(necessary)관계가 불분명하거나 무관한 것들로 유형화되어 있는 것을 알 수 있다. 즉, 올바른 R&D 사업구조는 무작위적인 외적관계가 아니라 원인과 결과 관계를 갖는 내적관계를 중심으로 유형화되어야 한다.