IMF의 영향으로 재정적 압박이 있던 바이오벤처는 정부의 육성정책에 크게 성장했지만 벤처붐이 꺼짐으로 일시적 침체도 있었다. 바이오 벤처들은 기술성평가제도와 우회상장을 통해 연구개발과 사업비의 자금을 확보하고 재도약의 발판을 마련했다.
1997년 말 IMF 구제금융의 여파로 재정적 압박을 받기도 한 바이오 벤처는, 경제위기 극복을 위해 정부가 의욕적으로 추진한 중소기업 및 벤처기업 육성정책과 벤처캐피탈 등의 투자에 힘입어 1999년 이후 양적으로 크게 성장했다. 그렇지만 2002년 이후에는 나스닥 버블의 붕괴와 함께 국내에서도 벤처 붐이 꺼지면서 코스닥 시장의 부진과 투자환경 악화로 바이오 벤처는 일시적인 침체를 겪을 수밖에 없었다. 특히나 다른 분야에 비해 기초적인 연구개발 및 상품화에 훨씬 더 많은 시간과 자본을 투자해야 하는 바이오 분야의 특성을 이런 상황을 더욱 악화시켰다. 그렇지만 시장의 흐름에 맞추어 위축되었던 바이오 벤처들은 기술성평가제도의 도입과 우회상장 등 시장의 규제가 완화되면서 위기를 극복할 수 있었다. 일시적인 침체에 빠졌던 바이오 벤처들은 기술성평가제도와 우회상장을 통해 코스닥에 등록, 연구개발과사업운영을 위한 자금을 다시 확보할 수 있었고, 여기에 정부의 정책적, 제도적 뒷받침과 대기업의 바이오산업 투자가 결합되어, 바이오 벤처는 재도약을 위한 발판을 마련할 수 있었다.