비교효과연구를 보건의료 정책의 근거로 삼으려면 법체계 보완과 참여 촉진으로 연구역량 최적화가 필요하다. 공민의 파트너십을 통한 분담과 협력으로 비교효과연구 수행을 발전시킬 수 있다.
즉 비교효과연구를 국가적인 연구 사업으로 발전시켜 보건의료 정책근거 산출 기전으로 활용하기 위해서는 일부 연구기관이나 조직에 의존하는 것보다는 기존의 관련 법체계를 보완하고 유관기관들의 참여 방안을 마련하여 연구수행 역량을 최적화하는 것이 바람직하다. 이를 위한 핵심적인 개념은 많은 공공과 민간기관들의 역량을 모으기 위한 파트너십을 구축하는 것인데, 이는 유관 기관들의 기능과 역할을 고려한 강점들을 활용하는 방안을 모색하기 위한 것이다. 공공 부문의 기관들이 갖고 있는 강점과 민간 부문 기관들의 강점을 적절한 역할 분담과 협력체계로 연결하여 비교효과연구라는 정책근거 연구사업의 수행체계로 발전시킬 수 있다.