정신보건복지행정은  1994년에 시정촌에서 실시하고, 1999년에는 정신장해자 거택생활지원사업을 시정촌에서 실시하고, 2006년에는 자립지원을 목적으로 하는 복지서비스를 주민에게 가장 가까운 시정촌으로 일원화했다.
정신보건복지행정에 대해서는 종래 장해자기본계획에 따라 도도부현(都道府県) 및 보건소가 중심이 되어 왔으나, 1994년 제정된 지역보건법(地域保健法)에 따라 기본방침에서 정신장해자의 사회복귀대책 중, “가까운 곳에서 이용 빈도 높은 복지서비스” 는 시정촌(市町村) 보건센터 등에서, 보건소 협력 하에 실시하는 것이 바람직한 것이 되었다. 1999년 정신보건복지법(精神保健福祉法) 개정에서는 정신장해자 거택생활지원사업을 시정촌(市町村) 단위에서 실시하고, 시정촌(市町村)이 정신장해자 복지서비스 이용에 관한 상담·조사 등과 정신장해자 보건복지수첩, 통원의료비 공비부담 창구가 된다는 규정 등을 신설하였고, 2006년 시행된 장해자자립지원법(障害者自立支援法)에서는 자립지원을 목적으로 하는 복지서비스를 주민에게 가장 가까운 시정촌(市町村)으로 일원화하게 되었다.