바이오화학산업을 포함한 바이오산업은 신산업 특유의 실패 위험성이 크기 때문에 대부분의 국가에서 정부 주도 연구개발 투자가 이루어지고 있으나 우리나라는 바이오화학산업을 포함한 연구개발사업단이 1개에 불과하는 등 그 투자가 매우 미흡한 편이다. 
셋째, 바이오화학산업에 대한 정부 연구개발 투자 확대이다. 바이오화학산업을 포함하는 바이오산업은 신산업 특유의 실패 위험성이 커서 민간에 비해 정부 주도의 연구개발 투자가 이루어지고 있다. OECD자료를 보더라도 미국 등 일부 국가를 제외한 대부분 국가에서 정부 주도의 연구개발 투자가 이루어지는 것을 확인할 수 있다. 특히, 독일과 일본은 바이오산업에 대한 정부 연구개발 투자가 매우 적극적으로 이루어지고 있다. 한편, 우리나라는 바이오산업 연구개발에 대한 투자의 56%를 정부가 지원하고 있다. 우리나라에서는 민간뿐만 아니라 정부 연구개발투자에서도 바이오화학산업에 대한 투자가 매우 미흡하다. 2007~2010년 중 우리정부의 바이오산업 투자 총액 중 바이오화학산업을 포함하는 white바이오산업 투자 비중은 8.8%에 불과하다. 그리고 총 24개에 달하는 바이오산업 관련 정부 연구개발사업단 중에서도 바이오화학이 포함된 연구개발사업단은 단 1개뿐이다.