부시 2기 당시 2004년 국가과학기술위원회가 발간한 '21세기를 위한 과학' 보고서는 과학기술 혁신 주체의 임무 네 가지를, '혁신의 새로운 세대' 보고서는 세 가지 추진방향을 제시했다.
부시 2기가 시작된 2004년에 국가과학기술위원회(NSTC)가 부처 협의를 통해 ‘21세기를 위한 과학(Science for the 21st Century)’이라는 보고서를 발간하였다. 부시정부 과학기술정책의 청사진이라고도 할 수 있는 이 보고서에서 제시하고 있는 과학기술 혁신 주체들의 임무는 창조적 과학발견의 촉진과 국가 과학연구 주체의 우수성 유지, 국가의 도전과제에 대한 시의적절한 대응과 혁신적 접근, 과학을 국가적 효익으로 전환하는 것에 대한 투자와 가속화, 과학기술 교육과 인력개발의 우수성 확보의 네 가지가 제시되었다. 또한 ‘혁신의 새로운 세대(A New Generation of American Innovation)’ 보고서에서는 수소기술, 건강정보기술, 광대역기술의 세 가지 추진방향이 제시되었다.