부처 이기주의를 지적한 경우 근거로 단기 과시성 정책이 남발되는 점과, 수요자가 아닌 공급자의 입장에서 정책을 낸다는 점을 들었다. 따라서 정부 차원에서 투자 효율성을 높여야 한다.
설문조사 결과 부처 이기주의의 문제점을 지적한 응답자의 경우 그 근거로 해당 정권 5년 내에 성과를 요구하는 단기 과시성 정책의 남발로 장기적인 기초연구가 시행되지 못한다는 점과, 수요자가 아닌 공급자의 측면에서 정책을 경쟁적으로 입안하는 부처별 이기주의에 대해 비판하는 목소리가 높았다. 현재 바이오 분야의 경우 미래창조과학부, 보건복지부, 산업통상자원부가주로 참여하고 있지만 크고 작은 사업까지 합하면 관련 부처의 개수가 8-9개에달하기 때문에 이들 간의 연계 및 협력을 증진시켜, 불필요한 중복 과제는 배제하고, 정부 차원의 바이오 투자의 효율성을 증진시키는 방향으로 나아갈 것이 필요할 것으로 판단된다.