감염으로부터 발병과 진행은, 제 1기 비말핵이 폐포 대식구에서 증식하는 감염기이고, 제 2기는 조기증식과 확산 시기, 제 3기는 숙주면역반응 발전 시기로, 이때 10%가 활동성 결핵으로 진전한다. 결핵균은 기하학적 증식으로 새 전염성 환자를 만들고, 이 액화 및 증식 촉진 시기를 제 4기라 한다.
감염으로부터 발병과 진행은 네 단계로 나누어 설명되고 있다. 제 1기 (phaseⅠ, transmission)는 결핵균을 함유한 비말핵이 호흡세기관지나 폐포에 도달, 초기의 숙주 방어능력을 극복하여 폐포 대식구(macrophage)에서 증식하게 되는 감염기이고, 제2기는 조기증식과 확산(phageⅡ, early proliferation and spread)이 이루어지는 시기이며, 제 3기는 숙주면역반응이 발전되는 시기(phageⅢ, evolution of host immune response)로 세포면역의 형성과 과민반응을 나타내게 되며, T세포에 의해 활성화된 대식세포가 육아종을 형성, 결핵균의 증식과 전파를 억제하며 초감염 결핵은 치유된다. 감염된 사람중의 10%가 활동성 결핵으로 진전하며, 이들의 절반은 2년 내에 발병한다. 폐의 병변이 재활성화 하고 병변이 액화를 거쳐 공동을 형성하게 되며, 이 때 결핵균은 기하학적으로 증식하여 새로운 전염성 환자를 만들어내게 된다. 이러한 액화 및 증식 촉진이 일어나는 시기를 제 4기(phageⅣ, liquefaction and accelerated bacillary proliferation)라 한다.