정부는 1985년 한국과학기술원 산하에 유전공학센터를 설립하였다. 초기 센터는 40여 명을 바탕으로 연구부, 특수사업부, 연구기획실로 구성되어 효소공학, 분자 생물학, 세포분양 등을 연구하였다. 센터는 인재의 적극 스카웃과 연구실 확대 개편으로 연구 분야를 다양화시켰고 그 결과 1987년 유전공학센터는 166명이 종사하는 센터로 확대되였다.
그리고 정부는 유전공학육성법과 시행령이 제정된 직후인 1985년 2월 1일 한국과학기술원 산하에 유전공학센터를 설립했다. 당시 한국과학기술원에 재직 중이던 한문희 교수가 초대 소장을 맡은 유전공학센터는 소장을 중심으로 연구업무를 수행하는 연구부와 ‘유전자은행 설립, DNA 안정성 실험 및 효소․숙주 등 기본소재의 생산과 공급’을 관할하는 특수사업부, 그리고 중장기 연구계획을 마련하고 산학과의 연계 및 사무업무를 담당할 연구기획실로 구성되었다. 특히 연구부에는 6개의 연구실을 두고, 각각 효소공학, 분자생물학, 미생물공학, 미생물유전자, 세포분양, 생물고분자화학 등을 연구하도록 했다. 설립 당시 한국과학기술원의 기존 연구 인력과 교수진 40여 명을 바탕으로 설립된 유전공학센터는 재외 한국인 과학자를 적극 유치할 전망도 제시했다(경향신문, 1985. 2. 5; 매일경제, 1985. 2. 7). 1986년 10월 유전공학센터는 기존 체계를 2부 15연구실 1연구기획실로 확대 개편하면서 식량시스템연구실, 생물화학공정연구실, 단백질화학연구실, 미생물생태연구실 등을 신설했고(매일경제, 1986. 10. 9), 1987년에는 60명의 박사학위 연구원을 포함 166명의 직원이 종사하는 센터로 커졌다(한국생화학분자생물학회, 1987). [그림 2-2]는 1987년 당시 유전공학센터의 조직도이다.