정부의 연구개발에 대한 직접지원의 대체 문제점인 모든 기업에 대한 비탄력성과 낮은 영향력등으로 기초연구에 집중된 지원의 필요성이 요구된다. 또한 정부지원 민간연구 개발투자의 경우 대체적인 관계와 지원으로 인한 구축 효과의 분석결과가 나타다.
국내에선 권남훈·고상원(2004)이 1995년부터 1998년까지 과학기술연구개발활동조사의 자료를 활용하여 정부의 연구개발에 대한 직접지원이 민간의 연구개발활동을 지원하는 것이 아닌 대체하고 있다는 것을 지적하였다. 즉 직접지원방식의 문제점에 대한 원천적 질문을 제시하였다고 평가할 수 있다. 송종국·김혁준(2009) 역시 정부의 연구개발지원이 대기업과 중소기업 모두에 있어 비탄력적이고 정부의 연구개발지원이 실제 민간에 미치는 영향이 미미하다고 분석하면서 기초연구에 국한된 지원이 필요함을 지적하였다. 손원익(2002)은 조세 지원과 민간 연구개발투자의 관계를 살펴보면서 부가적으로 정부지원 민간연구개발투자와 민간연구개발투자간의 관계가 보완적인 지대체적인지를 살펴보았다. 분석 결과에 따르면 정부 지원 민간연구개발투자의 경우 민간연구개발투자에 대해 보완적이기 보다는 대체적인 관계, 즉 정부지원으로 인한 구축 효과가 있음을 보이고 있다.