CDI는 인지도가 낮고 검사법이 표준화되어 있지 않아 예방관리가 어렵고, 우리나라의 재발률은 20% 정도이다. 그러나 연구를 통해 장내세균의 안전성이 확보되고, CDI 백신이 FDA 허가권고를 받고 임상 3상까지 진행되어 대변은행의 경쟁대상으로 부상한다. 제왕절개 아기에게 미생울을 이식하는 등의 미생물 이식 연구를 진행 중이나 재발성 대장염 치료가 유일하게 입증된 효과일 뿐이다.
CDI에 대한 인지도가 아직 낮고, 감염 검사법이 표준화되어 있지 못해 유럽에서 매일 74건으로 CDI가 진단에서 놓친다고 예측하였다. 입을 통해 전염되는 CDI는 집단 발병 위험성을 안고 있으나, 감염경로 파악 등 측면에서 다른 병원균보다 예방관리가 어렵다고 한다. 염증성 장질환에 대한 관심이 증가하고 있는 우리나라에서 CDI는 10명 중 2명 비율로 재발한다. 아무튼 잘못된 진단으로 적절하게 치료받지 못하면 질 병이 심각해지거나 합병증을 초래하는 위험이 있다. 그럼에도 불구하고 Human Microbiome Project 등 연구 결과로 장내세균의 안전성은 더욱 확보되고 있다. CDI 재발 예방약물로 Merck사의 Zinplava(bezlotoxumab)는 2016년 6월 10일 FDA 자문위원회는 FDA에 허가권고하였고, 임상3상이 세계적으로 진행되고 있는 CDI 백신이 대변은행의 경쟁대상이다. 미생물을 이식하는 연구는 여러 증상을 대상으로 시도되고 있다. 제왕절개로 태어나는 아기는 정상분만으로 태어나는 아기보다 미생물총이 부족하므로, 2016년 제왕절개로 태어난 아기에게 엄마의 질내 미생물을 이식하여 아기의 부족한 미생물총을 회복시켰다. 그러나 효과가 입증된 것은 Clostridium difficile 감염에 따른 재발성 대장염 치료 효과가 유일하다. 한편 OpenBiome은 개인 대변을 보관하는 PersonalBiome 사업을 시작하였는데, 자신의 아기와 가족을 위해 보관하는 제대혈 보관 은행 사업 개념과 같다.