2001년부터 2010년까지 새만금 외해역은 대체로 수질 II등급 이하로 유지되었다. 한편 2004년부터 2010년 기간 사이 총질소 기준의 새만금 외해역의 수질은 양호한 편이라고 볼 수 있다.
2001년부터 2010년까지 10년간 새만금 외해역의 연평균 총질소 농도 추이를 살펴보면, 다소 등락은 있으나 수질 II등급 이하로 유지됨을 볼 수 있다. 2001년 수질 I등급에 해당하는 총질소 농도 0.16㎎/ℓ을 기록한 후, 2002년에 0.54㎎/ℓ로 높아진 이래 2007년까지 지속적으로 0.50~0.60㎎/ℓ을 나타내었으나, 2008년도부터 다시 급격히 감소하였다. 한편 2004년부터 2010년 기간 중 2004년, 2006년, 2007년을 제외한 4개 연도 새만금 외해역의 연평균 총질소 농도가 전국평균보다 더 낮은 수치를 기록하는 등 총질소 기준으로는 새만금 외해역의 수질이 양호하게 유지되고 있다고 판단할 수 있다. 2009년부터 2010년까지 최근 2년 동안 평균 총질소 농도는 수질 I등급을 기록하였다.