해양 신산업 정책방향은 해양산업 간의 시너지 강화와 긴장해소로 혁신 여건을 만들고 혁신주체 간 인프라 조성과 지방과 중앙 정부 간의 협력 및 조정을 위한 제도 개선이 필요하다. 
내부와 외부의 여건을 고려할 때 해양 신산업 발전을 위한 정책 방향은 크게 두 가지로 정리할 수 있다. 첫째는 해양산업 간의 시너지는 강화하고 긴장은 해소함으로써 해양산업 전반의 혁신 여건을 조성하는 것이다. 여기에는 혁신주체 간의 네트워크 구축과 인력, 정보, 물리적 기반 등의 강화와 함께 부처 간 혹은 지방과 중앙 정부 간의 협력 및 조정을 위한 제도 개선이 포함되어야 할 것이다. 또 국내 해양산업이 현재 누리고 있는 정태적 비교우위 요인에 안주하지 않고 역동적인 경쟁력 우위의 상황을 창출할 수 있도록 혁신의 공통적 투입요소를 강화하기 위한 정책적 노력이 지속적으로 전개되어야 한다.