자율 시스템이란 개체들이 운명을 만들어가며 질서를 조화롭게 구성하는 시스템으로 개별성, 다양성, 상호연결성, 공생․공존성등의 특징을 지녀 살아있는 유기체 간 상호작용이 이뤄지는 자연생태계와 비슷하다.
자율 시스템이란 자기의 운명을 스스로 개척해 나가는 개체(개인, 소단위 조직 등)들이 상호작용하면서 전체의 질서를 조화롭게 만들어 나가는 시스템을 말한다. 이 개념은 자연생태계나 혁신생태계와 유사하다. 자연생태계란 기본적으로 살아있는 유기체 간의 상호작용이 이뤄지는 체계라고 볼 수 있다. 이는 다양한 종(種)이 상호 연결성을 유지하며 공생․공존하는 자기 구동적 열린 시스템의 특성을 지니고 있다. 스스로 치열하게 뿌리를 내리는 개별성, 거대한 자연생태계의 자기조절 메커니즘의 기초를 이루는 종의 다양성, 생태계를 구성하는 모든 개체들이 서로 내적 필연성으로 연결되어 있는 상호연결성, 특정 종이 지나치게 비대하여 지배하는 일이 없는 공생․공존성 등의 특징을 지니고 있다.