식약처는 '미래식품 안전관리 사업 연구'를 통해 나노식품의 현황과 안전성 평가를 위한 중장기 방안을 제안하고 안전성 평가 체계를 확립하며 관련 국제 협력을 주도하고 있다.
한편, 식약처는 ‘미래식품 안전관리 사전 연구’ 사업으로 2012년 이후 나노식품 현황 파악 및 안전성 평가를 위한 중장기 방안을 제시하고 나노 식품의 안전기준과 규격 마련을 위한 안전성 평가 체계 확립에 나서고 있다. 식약처는 나노물질의 독성 평가기술개발을 통해 나노식품, 의약품, 화장품, 의료기기 등의 기준을 마련하고 평가 가이드라인을 제시하며 나노물질 독성 시험법 국제 공동연구 수행으로 국가 위상을 강화한다는 목표를 세우고 있다. 2010년만 해도 관련 국제 협력을 주도한 것이 환경부였는데, 현재는 나노물질 독성 평가 기술 등에 대한 국제 협력은 식약처 에 의해 주도되고 있다.