과학기술계는 과학기술행정에서 정부주도 전통이 유지-확장되어 왔다. 이는 적극적-능동적 정부관에 기반한 과대성장국가론의 틀이 유지되는 것이다. 60년대 이후 과학기술과 산업발전을 국익과 동일시하는 국가주의적 과학관의 영향으로 정부의 정책과 행정수단이 정당화됐다.
실제로 과학기술계의 경우 지속적인 정부 R&D 투자 확대, 연구비 배분을 위한 정부중심의 획일적 평가방식의 확대에서 볼 수 있듯이 과학기술행정에서 정부주도의 전통이 강하게 유지·확장되어 왔다. 이는 우리나라의 독특한 제도적 특성인 국민의 행정의존 및 행정만능사상 등 적극적이고 능동적인 정부관에 기반을 두고 있으며, 정부주도의 경제개발을 거치면서 구축된 과대성장국가론의 틀이 여전히 유지되는 것으로 볼 수 있다(최장집, 1985; 박동서 외, 1992). 또한 1960년대 이후 과학기술 및 산업발전을 국가 경제발전이자 국익과 동일시하는 국가주의적 과학관도 이를 촉진시켰다(박희제, 2006; 박희제 외, 2014). 정부 개입에 의한 비약적인 과학기술 발전 경험은 정부 주도성을 더욱 견고하게 했으며, 연구개발투자 확대, 출연(연) 설립 및 적극적인 지원, 연구개발 주체 육성과 인프라 구축 등 정부가 추진해 온 일련의 정책 및 행정수단을 정당화시켜 왔다(성지은 외, 2013).