각종 심의위원회와 행복청과의 협의, 세종시로의 자치사무 분할을 통해 각종 계획 수립 및 조화가 용이하다. 
또한, 상호협조체계 유지를 위해 도시계획위원회․광고물관리 및 디자인심의위원회에 세종시 소속공무원을 포함시켜 세종시 의견이 충분히 반영될 수 있도록 하였다. 자치사무가 이관함에 따라 세종시 이관 사무 후속 조치를 위해 행복청은 2개의 고시를 폐지(문화재 보호고시, 하천점용 고시)하였고, 세종시에서는 예정지역과 편입지역을 포함한 각종 계획(지능형교통체계 지방계획, 지방 대중교통계획, 수도정비기본계획, 하수도정비기본계획, 소하천정비종합계획, 지방하천정비기본계획)을 수립할 경우 행복청과 협의 할 수 있도록 하였으며, 행정중심복합도시 건설에 영향을 미치는 기준 등을 마련하는 경우 사전에 행복청과 협의토록 하였다(문화재 주변 현상변경 허용기준 마련, 부설주차장 관련 각종 기준마련, BRT노선 사업자선정과 버스노선 결정).