생물다양성협약에서는 당사국총회를 통해 생물다양성에 영향을 끼칠 수 있는 생명공학과 합성생물학에 대한 논의가 지속적으로 이루어졌다. 하지만 아직까지 생명공학과 합성생물학의 부정적 혹은 잠재적인 가능성에 대한 증거가 충분하지 않기 때문에 2020년 개최될 당사국총회에 많은 기대를 한다.
1994년 제1차 당사국총회가 개최된 이래로 다양한 이슈가 당사국총회를 통해 논의된 바 있다. 특히 생물다양성협약에서는 생명공학의 발전이 생물다양성에 미칠 영향에 대한 가능성에 대한 우려로 생명공학의 발전으로 제기될 수 있는 다양한 이슈를 다루어 왔다. 생명공학에 기인한 유전자변형생물체가 생물다양성 및 인간의 인체에 미칠 영향에 대한 문제가 먼저 제기되며 카르타헤나 의정서가 채택된 바 있으며, 합성생물학과 관련한 논의 역시 생명공학의 발전적 상황에서 자연스럽게 제기되었다. 합성생물학과 관련한 논의는 2010년 당사국총회를 통해 제기되며, 2012년 개최된 제11차 당사국총회를 통해 합성생물학이 생물다양성 보전과 지속가능한 이용에 미칠 영향에 대한 논의를 필요로 한다는 점이 의제로 채택된다(Decision X/13, 2010 / Decision XI/11, 2012). 제13차 당사국총회를 통해서는 합성생물학이 지속적인 논의를 필요로 하는 의제로 결정되었으며, 제14차 당사국총회를 통해 합성생물학이 생물다양성에 미칠 부정적 영향을 최소화하기 위해 사전예방적 관리 방안의 필요성이 제기되었다(Decision XIII/17, 2016 / Decision XIII/17, 2018). 그러나 아직까지 당사국총회를 통해 합성생물학과 관련한 문제의 제기와 과학적 근거가 충분하지 못하거나 부정적 또는 잠재적 영향에 대한 증거가 축적되지 않아, 이후 2020년 개최될 당사국총회에 거는 기대가 크다.