혁신도약형 R&D사업은 2015년 기준으로, 주요 국가 R&D 예산 대비 약 6%로, 2012년 당시 중장기 목표인 30~40%에는 크게 미치지 못하고 있다.
이들 혁신도약형 R&D사업은 2015년 예산규모 기준으로 주요 국가R&D 예산 대비 6.1% 수준에 머물러, 제도 도입을 처음 검토하였던 2012년 당시의 중장기 목표(30~40%)9)에는 크게 미치지 못하고 있다. 부처별 혁신도약형 R&D사업의 예산규모 및 비중을 살펴보면, 예산규모 기준으로는 미래창조과학부(4,063억원), 산업통상자원부(2,381억원), 해양수산부(810억원), 국토교통부(452억원), 교육부(312억원) 등 5개 부처가 95.6%의 비중을 차지하고 있으며, 이 중에서 해양수산부(24.1%), 미래창조과학부(11.2%) 등 2개 부처만이 국가R&D 예산 중 10% 이상을 혁신도약형 R&D사업으로 추진하고 있다.