연구 장려금은 공공성을 위한 지원이며 연구의 자율이 강조되고, 계약은 명확한 요구 조건과 특정된 결과물이므로 책임이 강조된다. 또한 전자의 지원 과제 선정은 동료 평가에 반면 후자는 미리 정의된 평가 요소에 따른다.
연구 장려금은 국가가 필요로 하는 상품이나 서비스가 아니라 공익적 목적이 크다고 인정되기 때문에 지원하는 수요이다. 미국 국립 보건원(NIH)은 연구 장려금은 공공선을 위한 지원(Assistance)인 반면, 계약은 명확한 요구 조건과 특정된 결과물, 정해진 일정을 지닌다고 설명하고 있다. 이에 따라 연구장려금 지원 과제의 선정은 포괄적 기준에 의한 동료 평가에, 계약 연구 지원 과제는 미리 정의된 평가 요소에 의한다. 또한 통상적으로 연구 장려금 형태의 지원에서는 결과 평가가 없거나 간소하며 연구비의 사용 도 매우 자율적인 반면, 계약 연구 지원에서는 처음 계약된 최종 결과를 산출하였는지 여부가 매우 중요하게 평가된다. 따라서 연구 장려금 지원 방식에서는 연구의 자율이, 계약 연구 지원에서는 책임성이 더욱 강조된다고 요약할 수 있다.