에이즈라는 병은 HIV 성매개 감염병이며, 예방이 가능하고, 설사 걸렸다 하더라도 평생의 건강유지가 가능하다는 사실이 알려지게 되었다. 이것이 정책에 반영되어, 감염인 소외 및 결리 같은 인권침해적 조항이 없어졌다. 또한, 금기시 되었던 에이즈 공익 광고가 방영되기 시작했으며, 법적으로 성병 검진대상자에 대한 예방사업의 근본적 대책 마련이 시급하다는 의견이 나오기 시작했다. 
에이즈 예방을 위한 대국민 교육홍보 시기: 민간단체를 통한 대국민 교육홍보 사업의 법적 근거를 명시한 1995년부터 2004년도 까지가 이에 해당한다. 초기 충격과 공포의 단계를 지나며 에이즈의 실체에 대한 의과학적인 이해와 합리적 판단 분위기가 형성되게 되었다. 즉, 에이즈라는 질병은 ‘HIV’에 의한 성매개감염병의 진행된 상태이며, 콘돔사용 등을 통해 예방이 가능하고 일단 감염된다고 하더라도 적절한 항바이러스제제를 투여한다면 건강유지도 가능하다는 사실이 알려지게 된 것이다. 이러한 내용이 관련정책에 반영되기 시작한 것이다. 후천성면역결핍증 예방법에서 규정하고 있는 감염인 격리 등과 같은 실효성 없는 인권침해 조항은 폐지되었고, 쉼터 등 환자들을 위한 실질적인 보호 조치들이 강구되기도 하였다. 이 시기의 가장 현저한 변화라고 한다면 민간단체 등을 활용한 대국민 교육홍보활동이 본격적으로 시작되었다는 것이라 할 수 있다. 안전한 성 행동 실천, 콘돔 사용, 자발적 에이즈 검사의 편익이 대국민 교육홍보의 핵심메시지가 되었으며, 콘돔사용 촉진을 위한 무료 콘돔배포사업도 국가 에이즈 사업에서 차지하는 비중이 매우 커지게 되었다. 방송에서 금기시 되던 ‘에이즈’ 관련 공익광고가 2004년도부터 송출되었으며, 첫 번째 주제는 역시 ‘에이즈 예방을 위한 콘돔사용 캠페인’이었다. 성매매 금지 특별법이 발효됨에 따라 성병 검진대상자에 대한 관리, 그리고 콘돔사용 활성화를 주된 전략으로 하는 국가 에이즈 예방 사업에 근본적인 수정이 필요하다는 주장이 제기되기도 하였다. 또한 질병관리본부 내 에이즈결핵관리과가 신설됨에 따라 중앙정부 수준에서의 체계적인 에이즈 사업 추진기반이 마련되기도 하였다.