위 공단은 구 공사 기능직 직원의 실적급 지급기준을 구 공단 수준으로 샹향조정해주었음에도 수행하지도 않는 특수업무수당을 지속적으로 지급하고 있었다.
그런데 위 공단은 2012년 8월 구 한국환경자원공사(이하 “구 공사”라 한다) 기능직 직원의 실적급 지급기준을 구 환경관리공단(이하 “구 공단”이라 한다) 수준으로 상향 조정하는 등 보수체계 개편을 통해 구 공사 직원과 구 공단 직원 간의 급여 차이가 크지 않은 실정인데도 통합 이전에 직무(중장비 차량 운전․정비 등)수당을 받아 왔던 구 공사 출신 장비 관리직 직원들의 급여를 보전한다는 사유로 통합 이후에 폐비닐처리시설 민간위탁 등에 따라 더 이상 중장비 및 차량 운전․정비 업무를 수행하지 않고 있는 구 공사 출신 장비 관리직 직원들에게 월 5∼6만 원의 특수업무수당을 계속 지급하고 있었다.