캐나다 연방정부는 보건의료재정의 분배를 맡고 주정부와 준주정부가 의료보장을 맡고 있다. 주와 준주는 보건의료의 구조, 재원 등을 국가 원칙 하에서 다양하게 운영할 수 있으며 재정 권한은 연방정부에게 있다. 지역보건당국은 의료 공급자이자 소비자로서 지역민에게 직접 의료서비스를 제공할 수도 있고 계약을 맺은 의료기관을 통해 제공할 수도 있다.
캐나다의 연방정부는 법률에 따라 보건의료재정의 분배와 자금 이전의 권한을 가지고 있고, 10개의 주정부와 3개의 준주정부가 대부분의 의료 보장을 책임진다 (김성옥 외 2013, p.185). 캐나다 인구의 60% 정도가 가장 큰 두 개의 주인 온타리오와 퀘벡에 거주하고 있다. 보건의료보험법에 따라 국가 전체 보건의료체계의 기본 틀이 확정되어 있지만, 각 주 및 준주별로 보건의료의 구조, 계획, 규정 재원 및 급여 형태 등은 국가 기본 원칙의 범위 내에서 다양하게 운영된다. 주와 준주정부는 지역 내 건강보험 행정, 의료서비스, 급여, 지불 및 평가, 수가 협상 등을 담당하고 있으나, 대부분의 재원은 연방정부 지원금이어서 재정에 대한 권한은 크지 않다. 주 및 준주에 소재하고 있는 지역보건당국(Regional Health Authority)은 지역의 보건의료체계를 관리하고 예산 분배를 담당하는데, 의료를 제공하는 의사 및 의료기관과 계약관계이다. 즉 의료 공급자이면서 소비자로서의 역할을 수행한다. 지역보건당국은 지역주민에게 직접 의료를 제공할지 의료기관과의 계약을 통해 제공할지를 결정한다. 예산 설정 및 분배 방법은 지역별로 다양한데, 일반적으로 과거의 지출을 고려한 총액예산제를 채택하고 있다 (김성옥 외 2013, p.194~196).