미국 NIH는 질환 중심의 조직과 기술 중심의 매트리스형 조직과 사업 구조를 반영하여 총 27개의 연구소와 센터로 구성되며, 각각의 기관은 개별적 법안에 의해 설치되고 매년 독립적으로 예산을 승인 받는다. 예를 들어, NIDDK는 대학병원의 임상적 분류와 거의 동일하게 6개의 부서는 나눠서 운영하여 시장적 접근을 취하고 있다.
미국 NIH 전체는 21개의 연구소(institutes)와 6개의 센터(centers) 총 27개의 기관으로 구성되어 있는데, 이는 NIDDK(National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases)와 NHLBI(National Heart, Lung, and Blood Institute) 등과 같은 의료 시장 즉 질환 중심의 조직과 NHGRI(National Human Genome Research Institute)와 NIBIB(National Institute of Biomedical Imaging and Bioengineering) 등과 같은 기술 중심의 매트릭스형 조직 및 사업 구조를 반영한 결과이다. 그리고 이들 각각의 기관들은 개별적 법안에 의해 설치될 것으로 매년 의회에서 각각 독립적으로 예산을 승인받아야 한다. 예를 들어, 2012년 기준 약 20억 달러를 사용한 질환 중심 연구소인 NIDDK는 6개의 부서를 운영하고 있는데 이 중 4개 부서가 외부연구 지원하고 있다. NIDDK가 담당하고 있는 질환 영역은 크게 당뇨와 내분비 및 대사질환, 소화질환과 영양, 신장과 비뇨기 그리고 혈액질환으로 구분되어 있는데 이러한 분류는 일반 대학병원의 임상적 분류와 거의 동일하다는 의미에서 시장적 접근을 취하고 있다.