자료원을 구축할 때에는 지역이나 의료기관 쏠림을 피하도록 여러 기관과 연계를 해야 한다. 이를 위해서는 소규모 의료기관도 참여가 쉽도록 국가적 지원이 필요하다.
향후 자료원을 구출할 때에는 단일의 목적보다는 다양한 목적으로 활용될 수 있는 포괄적이고 다목적 자료원 구축을 기획하는 것이 더 유용할 것으로 판단된다. 또한 주로 학회 및 일부 임상센터를 중심으로 자료원을 구축하던 형식에서 벗어나 국가수준의 다기관, 다학제 연구가 진행되어야 할 것으로 판단된다. 지역적 편중, 의료기관 종별 편중을 극복할 수 있는 다기관 연계 자료원을 구축하여야 하며, 이때는 소규모 의료기관도 임상연구에 참여가 용이하도록 국가적 지원이 이루어져야 한다. 예컨대 영국에서는 National Cancer Research Network 운영을 통해 일선의료기관의 임상연구팀을 지원하여 다양한 의료기관이 임상연구에 참여할 수 있도록 하고 있다. 이는 결국 자료원의 대표성으로 이어지는 것으로 연구결과 활용 측면에서 중요하다. 또 다른 예시로 영국 General Practice Research Database(GPRD)는 실제 임상현장에서의 일차의료의 임상시험의 역량을 위해 개발된 것으로 일반의(GP)를 통해 치료의 관점에서 환자들이 등록된다.