사후환급형 예산 지원은 예산을 효율적 집행하고 사업을 진행하는 과정에 나타날 수 있는 위험을 관리할 수 있는 전략인데, 기술혁신형 공공구매 사업에 있어서 사후환급형 지원이 효과를 가지려면 충분한 자율성의 확보가 전제되어야 한다.
EU는 이러한 사후환급형 지원을 사업의 위험관리 차원에서 활용한다. 즉 기술혁신형 공공구매 사업에 있어 수요기관의 자율성을 제고하는 대신, 공공자금 투입의 책무 성 제고를 위해 전략적으로 사후환급형 예산 지원을 추진하는 것이다. 사후환급형 예산 지원은 예산의 효율적 집행과 더불어 부적절한 자금 운용 등 사업을 진행하는 과정 에 나타날 수 있는 위험을 관리할 수 있는 전략으로 평가할 수 있다. 이러한 개념 설계와 필요성에 대해선 정부R&D 혁신 방안을 통해 정부 차원에서 이미 제안된 바 있다(관계부처 합동, 2016. 6. 27). 그러나 기술혁신형 공공구매 사업에 있어 사후환급형 지원의 효과성이 제고되기 위해선, 수요기관과 결성된 컨소시엄이 자율적으로 예산을 운용할 수 있는 구조, 즉 사업 기획을 담당하고 연구 방법을 결정하는 충분한 자율성 의 확보가 전제되어야 한다.