국내에는 혁신기술 스타트업만의 차별화된 지원 체계가 미비하다. 혁신기술 기반 스타트업은 기술집약적이며 신산업 창출 가능성이 높기 때문에 사업 초기에는 적자이나 성장할시 높은 성과를 이룩한다.
기존 연구에 따르면, 혁신기술 기반 스타트업은 타 기술기반 스타트업과 구별되는 모종의 차이점을 갖고 있으며, 국내에는 혁신기술 기반 스타트업의 특성을 고려한 세밀한 지원체계가 미비하다. 일반적으로, 혁신기술 기반 스타트업은 기술집약적인 특징을 가지며, 신기술에 의한 신산업 창출 가능성이 높은 기업들이다. 따라서, 혁신기술을 창출하기 위한 R&D의 집중도가 높고, 신규 제품 및 서비스를 개발하여 새로운 시장을 창출할 가능성이 높으나, 기존 기술과 시장이 없는 상태에서 출발했기 때문에 연구개발과 상업화, 시장 창출에 오랜 시간이 걸린다는 점이 특징이다. 초기 R&D 투자와 프로토타이핑, 테스팅 등에 초반 몇 년은 재무상 적자를 보이기도 하지만, 한번 성장을 시작하면 그 속도는 일반 기업보다 훨씬 빠르다.