System-GMM은 과거 변수값과 변수의 first difference값을 도구 변수로 활용하여 두 등식을 추정하기 때문에 System-GMM이라고 불린다.
Blundell and Bond(1998)의 System-GMM은 위에서 지적된 바와 같이 변수의AR(1) 계수가 1에 가까워지는 경우 효율성(asymptotic efficiency)과 편이를 줄이기위해 추가적인 moment 조건을 더하는 방식이다. First-difference GMM의 방법대로difference equation 추정을 위해서 변수의 과거 값을 도구변수로 활용하여 추정하는동시에, level equation 추정을 위해서 변수의 first difference 값을 도구 변수로 활용하여 두 등식을 추정하기 때문에 system-GMM이라 불린다.