우리나라는 병원급 의료기관에 대한 인증을 법으로 정해놓았지만 서비스나 병원의 관리체계가 대부분으로 어떤 의료시설이 있는지 살피는데 불충분하다. 국제 JCI 인증에서도 이러한 문제는 동일하다.
우리나라는 의료의 질 향상을 위해 의료법 제58조에 근거하여 병원급 의료기관에 대한 인증을 할 수 있도록 규정하고 2010년 10월부터 의료기관 평가 인증원을 개원하여 의료기관 인증제를 운영하고 있다. 그러나 인증의 주요 내용은 시설보다는 의료서비스, 병원의 운영 및 관리체계 등에 관한 사항위주로 되어 있어 의료기관 건립시 시설 기준으로 참고하기에는 어려움이 있다(연세대학교 의료법윤리학연구원, 2013: 1). 국제 JCI 인증에서도 시설기준에 대한 사항이 일부 포함되지만 포괄적인 시설기준이나 가이드라인이 아닌 주로 의료서비스의 제공에 대한 사항을 위주로 인증이 수행되고 있다. 더욱이 의료시설에 대한 일부 항목도 병원건축분야와 충분한 공감대에서 도출된 내용이 아닌 것이 많아 실제 시설의 환경적수준을 적정화하는 데에는 한계가 있는 실정이다.