이해당사자 간 갈등이 내․외부에서 표출된 이후 이를 중앙정부 또는 지자체 등 행정기관의 중재나 민․형사상의 소송에 의해 해결이 되며 적지 않은 사회적 비용을 초래하게 된다. 
지금까지 어촌공동체의 갈등은 투명성, 객관적인 사실관계 확인, 민주적인 의사결정 등 여러 가지 요인에 의해 이해당사자 간 갈등이 내․외부에서 표출된 이후 이를 중앙정부 또는 지자체 등 행정기관의 중재나 민․형사상의 소송에 의해 해결이 되고 있다. 하지만 사실 상 갈등의 해결 보다는 조정과 심판․판결 과정에서 적지 않은 사회적 비용을 초래하게 된다. 통상적으로 “갈등에는 시간이 약(藥)이다”라는 사회적 관념이 크게 자리 잡고 있다. 지금까지 갈등은 문제가 표출된 이후 사후적인 대응을 모색했던 관행으로 제대로 관리되지 않아 갈등은 심화되고, 이해관계자 간에 상호 불신의 대립적 관계로 악화되는 경우가 많다.