질병 위험도를 예측하는 유전자 분석 서비스는 유전적 소인이 질병의 모든 원인이 아니기 때문에 한계를 가진다. 대부분의 만성질환은 후천적 요인의 영향이 더 중요하다. 따라서 유전적·후천적 요인을 결합한 새로운 예측 모델 개발이 필요하다. 
질병 위험도를 예측하는 유전자 분석 서비스가 지닌 근원적인 기술적 한계는 유전적 소인이 질병 발생의 모든 원인이 아니라는 점이다. 유전질환과 같이 유전적 변이가 질병 발생에 직접적으로 연관되는 경우도 있지만 대부분의 만성질환들은 생활 습관이나 환경적 요인의 영향이 더 중요한 경우가 많다. 이는 유전자 분석에 의한 질병 위험도 예측에 근원적인 한계가 있음을 의미한다. 이를 극복하고 만성질환에 대한 위험도 예측의 정확성을 높이기 위해서는 유전적 요인과 후천적 요인(환경, 생활 습관 등)을 결합한 새로운 예측 모델을 개발하는 것이 필요해 보인다. 애플 등 모바일 디바이스 기업들이 앞 다투어 출시하고 있는 건강관리 앱을 이용하면 소비자들의 생활 습관과 주거 환경 등을 정밀하게 모니터할 수 있게 될 것인데, 여기 서 나온 데이터와 게놈 데이터를 결합한다면 새로운 예측 모델을 만들 수도 있을 것이다.