배출권거래제, 목표관리제의 대상업체가 배출하는 온실가스의 비중을 파악해 제도의 효과성을 판단할 수 있으나 정부는 공개하지 않는다. 업체들이 보고하는 온실가스 배출량은 '직접배출'과 '간접배출'을 포함하는데 명세서 배출량 합계에 '간접배출'이 이중계산된다. '직접배출'로 배출권거래, 목표관리제의 비중을 알 수 있어 <표 25>처럼 업종 특성에 따라 추정했다. 
한편, 우리나라 전체 온실가스 배출량 중 배출권거래제 및 목표관리제 등 2개 제도의 대상업체들이 배출하는 온실가스의 비중을 파악하는 것은 본 제도의 효과성을 판단하기 위해 중요하다. 하지만, 정부에서는 이들 제도가 우리나라 전체 배출량에서 차지하는 비중을 공식적으로 공개하지 않고 있다. 업체들이 보고하고 있는 온실가스 배출량은 녹색성장법 제2조 10항에 따라 직접 대기 중으로 배출하는 ‘직접배출(Scope1)’과 외부로부터 공급받은 전기 또는 열을 사용함으로써 배출되는 ‘간접배출(Scope2)’을 모두 포함하고 있다. 예를 들어 전기의 경우, 발전회사는 전기를 생산하기 위한 화석연료 연소에 따른 ‘직접배출’을 신고하고, 이 전기를 사용하는 산업체는 발전회사가 전기를 생산하기 위해 화석연료를 연소하면서 배출하는 온실가스를 ‘간접배출’로 신고하는 것이다. 따라서, 명세서 배출량 합계에는 ‘간접배출’ 부분만큼이 이중계산되어 있으며, ‘직접배출’량 만을 파악하여야 배출권거래제 및 목표관리제 등 2개 제도가 우리나라 배출량 전체에서 차지하는 비중을 파악할 수 있다. 정부에서 공식적으로 공개하는 자료 중 업체별·업종별 ‘직접배출’과 ‘간접배출’의 양 또는 비율을 구분하여 공개하는 자료는 없기 때문에, <표 25>와 같이 업종별 특성에 따라 ‘직접배출’의 비율을 추정하여 직접배출량을 추산하였다.