갯벌의 간척 및 매립과 오염, 지구온난화가 초래한 갯벌의 서식환경 변화 등으로 갯벌패류의 생산량이 매우 줄어들었다. 생산량이 감소한 품종 중 2000년 대비 2016년에 생산량이 약 94% 감소한 꼬막, 약 79% 감소한 백합류를 비롯해 개량조개, 맛류 등을 복원품종으로 정할 수 있다. 가무락과 동죽도 생산량이 감소하였으나, 이들은 앞서 언급한 품종들에 비해 감소 폭이 작고 현재 생산량이 적지 않으므로 복원품종 후보군에서 제외된다.
새만금, 시화 등의 대규모 간척과 매립에 의한 인위적인 갯벌 소실 및 환경 변화와 서해안의 허베이 스피리트호 유류오염 사고로 인한 갯벌 오염, 지구온난화에 따른 해수면 상승과 수온상승으로 인한 갯벌 서식환경 변화 등으로 인해서 꼬막, 백합 등 갯벌패류의 생산량이 크게 감소하였다. 생산량이 급감한 품종을 대상으로 복원품종을 선정할 경우 대상 후보군은 개량조개, 꼬막, 맛류, 백합 등이 될 수 있다. 가무락과 동죽은 2000년 대비 2016년 생산량의 감소율이 각각 66.3%, 42.0%으로 높은 편이나 상대적으로 다른 품종에 비해 감소율이 높지 않으며, 현재 생산되는 절대적인 양이 작지 않으므로 복원 대상 후보군에서 제외한다. 개량조개의 경우 1980년에 생산량이 16,633톤이었으나 1990년에 생산량이 3,353톤으로 감소하였다. 2000년에는 생산량이 4150톤으로 증가하였으나 2010년에는 생산량이 248톤으로 1/20수준으로 감소하였다. 2010년 이후 감소한 생산량이 크게 증가하지 않고 있다. 꼬막은 1990년대 11,735톤이 생산되었으나 10년 후인 2000년에 5,000여 톤으로 생산량이 절반 이상 감소하였으며, 2016년에는 생산량이 269톤으로 생산량이 2000년 대비 94.6% 감소하였다. 동죽은 1990년에 32,841톤이 생산되었으나 10년 후인 2000년에는 2,468톤으로 1/15수준으로 감소하였으며, 2016년에는 2010년 대비 42% 감소하여 1,431톤이 생산되었다. 맛류는 1990년에 생산량이 2,511톤, 2000년에는 1,572톤이었으나 2016년에 생산량이 295톤으로 감소하였다. 백합류 2000년에 생산량이 1430톤이었으나 2016년에 생산량이 294톤으로 79.4% 감소하였다.