국가적 의료비 부담과 질병의 위험성이 큰 경우 조건부 급여결정으로 급여 결정제도를 확립해야 한다. 비교효과연구가 수행되고 게임의 룰, 비교효과연구의 개념이 충분히 반영돼야 한다. 
특히 국가적 의료비 부담이 크고 질병의 위중성이 있는 경우 급여결정을 하게 될 경우 조건부 급여결정을 통해 일정기간 전향적 데이터 수집과 연계된 급여 결정제도를 확립할 필요가 있다(이상무, 2009; 박실비아, 2011). 이 경우 역시 공적 연구의 성격이 강하고 그 결과 해당 의료기술에 대한 추후 급여 유지 여부에 대한 의사결정이 필요한 만큼 조건이 성립되는 경우라면 반드시 비교효과연구를 수행하여야 할 것이며, 약제와 마찬가지로 연구의 설계, 비용의 분담 정책 그리고 연구의 수행 및 데이터 수집 분석의 주체에 대한 게임의 룰이 있어야 하며 이 과정에서 비교효과연구의 개념이 충분히 반영되어야 할 것이다.