혼농임업은 숲의 다양한 기능을 활용하여 온실가스 감축, 농작물의 기후변화 적응, 생태계 다양성 확보 등에 도움을 주고 있다.
숲은 <그림 3-13>에서 제시된 바와 같이 다양한 기능을 제공한다. 혼농임업은 숲의 이러한 기능을 활용해 온실가스를 감축하고 농작물의 기후변화 적응을 돕는 기법이라 할 수 있다. 혼농임업의 효과는 많은 연구들에서 보고되어 왔다. 예를 들어 Udawatta et al.(2011)은 단일경작보다 혼농임업 방식에서 탄소흡수량이 11~41% 많은 것으로 보고했으며, Verchot et al.(2007)은 단일경작의 탄소흡수량이 10MgC/ha인데 반해 혼농임업의 탄소흡수량은 50~75MgC/ha라고 보고했다. 또한 많은 연구들에서 혼농임업을 통해 기후회복력이 높아지고 생태계의 다양성이 확보되는 것으로 보고되고 있다(Matocha et al., 2012).