의료기술평가는 의료 서비스의 질을 높이기 위해서 고가의 의료기술을 분석하고 급여를 결정하도록 지원한다. 여기에 권고된 의료기술은 보건부와 BPJS가 분석, 보험 재정을 고려한 후 JKN 포함 여부가 결정된다.
시장지배력은 최신 의료기술의 도입을 요구하며 이는 인구고령화 및 만성질환자의 증가와 더불어 의료비 지출의 증가를 야기한다. JKN은 고가의 항암제 등을 포함한 포괄적 의료서비스를 포함하며 2014년 인도네시아의 의료비 지출은 약 42조 루피아에 달하였다. 이로 인해 의료기술의 임상적 효과와 급여로 인한 재정적 영향을 바탕으로 효율적 의료비 지출과 궁극적으로 건강보장제도의 지속성을 도모하고 의료의 질을 향상시키기 위해 의료기술평가에 대한 수요가 증가하고 있다. 특히 의료기술평가는 사용량이 높고 고가의 의료기술에 대한 분석을 통해 급여등재 여부의 결정을 지원한다. 의료기술평가를 통해 권고된 의료기술은 보건부와 BPJS에 의해 재정영향분석 과정을 거치게 되며 보험재정을 고려하여 JKN 포함여부가 최종적으로 결정된다.