합성생물학은 생물다양성 보전에 미칠 영향 검토가 불충분하고 생물다양성협약 채택에도 직접적으로 다루어지지 않았으며 일부 국가는 기술력으로 인한 이익 공유 논의에 소극적이다.
합성생물학은 21세기 들어 빠른 성장세를 보이기 시작한 분야로 합성생물학의 발전이 생물다양성의 보전에 미칠 영향에 대한 논의가 공적인 영역에서 이루어지기 시작한 것이 그리 오래되지 않았다. 따라서 생물다양성 보전에 미칠 영향에 대해 충분한 검토가 이루어지지 않았으며, 생물다양성협약의 채택에도 합성생물학과 관련한 이슈는 직접적으로 다루어지지 않았다. 일부 국가에서는 합성생물학의 산업화에 성공하면서 합성생물학을 국가의 성장동력으로 지정하여 적극적으로 지원·육성하는데 치중하고 있어, 규제적 관점이나 기술력으로부터 발생하는 이익 공유 등과 관련한 논의에 있어 소극적인 태도를 보이기도 한다.