성공적인 과학기술 ․ ICT 융합 혁신을 위해서는 조직 혁신이 먼저 요구된다. 예를 들면 사회문제는 1차관과 2차관에서 사회적 수용성을 논의하고 반면 규정 개선과 관련해서는 2차관에 편중되어 있다. 인재 양성 ․ 교육은 1차관과 2차관에 균형있게 배분되었다. 이에 참다운 융합을 이끌어내기 위해 조직 혁신을 이루어야 한다.
성공적인 과학기술 ․ ICT 융합 혁신을 이뤄내기 위해서는 과학기술과 ICT를 담당하는 부서 간 조직 혁신이 우선적으로 필요하다. 대표적으로 과학기술정보통신부의 1차관과 2차관을 예로 들 수 있다. 과학기술정보통신부와 그 소속기관 직제 시행규칙에 관한 법령을 살펴보면, 사회문제 해결과 규제 개선 면에서 1차관과 2차관의 업무 분장이 비대칭적임을 알 수 있다. 예를 들어, [그림 6－6]에서 보는 것과 같이, 사회문제 해결은 1차관과 2차관에서 각각 과학기술 발전 또는 ICT 기술의 발전에 따른 사회적 수용성을 균형적으로 논의해야 하는데, 직제 상에서는 1차관과 과학기술혁신본부를 중심으로 사회문제 해결형 과학기술 연구개발에 집중되어 있는 것을 알 수 있다. 이와 반대로 규제 개선과 관련해서는 1차관보다는 2차관에 집중된 것으로 나타나는데, 이는 과학기술이 주로 원천기술에 집중되어 있는 반면, ICT는 응용기술 및 상용화에 집중되어 있기 때문인 것으로 판단된다. 전문인력 양성 ․ 교육과 관련해서는 1차관과 2차관에 고르게 업무 분장이 된 것으로 판단된다. 이처럼 업무 분장의 비대칭성을 해결하고 진정한 융합을 이루어내기 위해서는 조직 혁신을 만들어내는 것이 중요하다.