효율적인 중장기계획 추진을 위해 정부와 보건복지부장관은 보건의료기술 연구 사업을 수행하고 보건의료기술정책 심의위원회를 둔다. 또한 '한국보건산업진흥원법'에 따라 보건의료산업체의 연구와 기술개발을 지원하는 등 학계와 산업계 간 협동연구를 촉진한다. 
중장기계획을 효율적으로 추진하기 위하여 정부는 보건의료기술 연구개발사업을 수행하고, 보건복지부장관은 연구개발 사업으로 연도별․분야별 연구과제를 선정하여 기관이나 단체 등과 협약을 맺어 연구를 할 수 있다. 또한 보건복지부장관 소속으로 보건의료기술정책 심의위원회를 두고 중장기계획의 수립, 중장기 보건의료기술 개발전략의 수립, 연구개발과 제의 우선순위 결정, 지원 자금의 배분, 정보․통계 관리 및 전산화, 학계․연구기관 및 산업계 간의 보건의료기술 공동연구에 관한 사항 등 중요 사항을 심의한다. 보건복지부장관은 '한국보건산업진흥원법'에 따라 한국보건산업진흥원이나 보건의료 분야의 기관․단체를 연구개발사업 전문기관으로 지정하여 보건의료산업체에 대한 연구․기술개발 지원, 연구개발사업의 조사․기획․평가 및 관리 등을 수행하게 한다. 그밖에 보건의료정보의 생산․유통 및 활용을 위하여 보건의료정보를 관리하기 위한 전문연구기관을 육성하고 전산화를 촉진하기 위한 업무의 표준에 관한 연구․개발 및 관리, 보건의료정보의 공동이용 활성화 사업을 추진하며 보 건의료기술을 효율적으로 개발․육성하기 위한 학계․연구기관 및 산업계 간의 협동연구를 촉진하고 협동연구개발을 우선적으로 지원할 수 있다.