사업 계획에 따라 환경영향에 대한 객관적 자료 수집 후 정책 판단에 반영시키는 점을 보면 부인할 수 없는 여러 부정적인 부분이 있으며 특히 일본의 환경영향평가제도는 시스템 상 오해가 생길 우려도 있다. 
반면에 사업 계획에 따라 환경영향에 대한 객관적인 자료를 수집하여 정책 판단에 반영시키는(또는 그 과정의 타당성에 대해 사후에 검증을 할 수 있다) 점에서 보면 환경에 많은 부담을 주는 계획이 검토 대상이 된 사실을 표면화시키지 않으며, 환경을 위한 바람직한 행정이나 주민들이 비교･검증할 수 있는 기회가 있었을 리 없다(어떤 면에서 보면 단 하나의 계획에 환경영향평가 절차가 이루어진다는 오해가 생겨 환경을 생각하고 세운 계획이라도 과도하거나 무리한 비판을 불러일으킬 우려가 잠재해 있다)는 점도 부정할 수 없다. 특히 일본의 환경영향평가제도는 ‘평가’를 한 뒤, 사업이 환경을 위하는지의 여부를 판단하는 시스템이기 때문에 단 하나만의 계획이 기준에 맞는다는 것을 향하여 책정되었다는 오해가 생길 우려가 있다.