과학기술정책분야의 선진화를 위해 과학인력양성/활용을 위한 정책이 제시되었고 기초/원천연구 투자비율을 높였으며 KOSBIR를 통해 기술개발지원을 확대하였다. 또한 국제협력정책을 실시하고 지방R&D 투자의 효율성을 증대하며 생명자원을 확보하고 과학기술문화사업과 문화 인프라를 갖추고자 했다.
7대 시스템 선진화․효율화 부문은 주요 과학기술 정책 분야를 포함하고 있다. 과학인재, 주력산업 인력, 지식서비스 인력, 중소․벤처 인력으로 구분하여 세계적 과학기술인력을 양성하고 활용하기 위한 정책을 제시했다. 2008년에 기초연구 비중이 25.6%였는데 2012년 까지 기초․원천연구에 대한 투자를 50%까지 높이고자 했다. 이를 통해 이공계 교수와 신진연구자의 기초연구비 수혜율이 상승될 것으로 기대하였다. 공공기관의 중소기업 기술혁신지원제도(KOSBIR)를 통해 기술혁신형 중소‧벤처기업의 기술개발 지원도 확대하고자 했다. 국제협력 정책에서는 글로벌 네트워킹형 과학기술 개방체제를 확립하고 지구적 차원의 문제해결에 기여하고자 했다. 지역 혁신역량 구축을 통해 내생적 지역발전의 동력을 확대하고 중앙정부와 지차체의 공조를 통해 지방 R&D 투자 효율성을 높일 계획이었다. 과학기술 하부 구조를 개선하기 위해 연구시설·장비와 정보를 공유하고 생명자원을 확보할 노력을 기울였다. 국민이 필요로 하고 재미있게 즐기는 과학기술문화를 확산하기 위해 수요자 중심의 과학기술문화 사업을 추진하고 과학기술 문화 인프라를 갖추고자 노력했다.