환경관리해역 관리기본계획을 바탕으로 ‘시화호 종합관리계획’이 수립되었다. 연안환경의 보전과 개선, 연안자원의 관리와 이용까지 포함하며, 통합관리를 위해 처음으로 법·제도적 기반을 만들어 수립한 법정관리계획이다.
경기도 관내 안산시, 시흥시, 화성시의 시화호 유역을 대상으로 해양오염방지법에 근거하여 2000년 6월 기본정책방향인 ‘환경관리해역 관리기본계획’이 마련되었다. 이를 바탕으로 연안환경의 보전과 개선뿐만 아니라, 연안자원의 관리와 이용까지 포함한 ‘시화호 종합관리계획’이 수립되었다. 시화호 종합관리계획은 우리나라에서 처음으로 연안 통합관리를 실행에 옮기기 위해 법·제도적 기반을 마련하여 수립한 법정관리계획으로서 우리나라의 연안관리와 환경관리 측면에 있어서 매우 중요한 의미를 갖는다. 시화호에서는 연안통합관리계획 수립원칙에 기초하여 정밀한 환경조사를 실시하고 기존 자료를 수집하여 당면 문제를 도출, 관리우선순위를 설정했다. 또한 진단·예측체계를 활용하여 계획을 수립하는 의사결정체계가 마련되었다. 시화호 유역의 오염부하량과 시화호의 환경용량을 산정하고, 수질개선 대책이 시행된 후 오염부하가 삭감되었을 경우의 수질을 예측하여 대책이 수립되었다.