일본정부가 식량자급률 목표를 낮춤으로써 생긴 잉여 보조금을 미래 농업경쟁력 강화에 전환투자되도록 유도한 정책은 식량안보를 위협할 수 있다. 이 때문에 잠재적 식량 자급력을 높이는 방식을 취하고 있다.
일본 농림수산성도 최근 자국의 농업 경쟁력 강화 정책의 대전환을 시도하고 있다.일본은 식량자급률 향상을 위해 보조금을 투입하여 생산력을 높이고 있다. 현재의 식량자급률 목표를 실현 가능한 수준으로 낮춤으로써 농업생산력 유지에 필요한 보조금 예산이 농가 후계자 양성,농업기술 효율화,농산물의 고부가 가치화 등 미래 농업경쟁력 강화에 전환투자가 되도록 하는 시책을 중시한 행보이다.그러나 식량자급률이 현실화되면 식량안보적 차원에서 위험요소가 될 수 있다는 문제가 발생한다. 새롭게 발표한 식량· 농업·농촌 기본계획을 통해서 일본 정부는 식량수입이 중단되었을 경우를 대비하여 국민에게 필요한 식량 공급이 가능한 잠재적 식량 자급력을 높이는 관점 에서농업경쟁력 강화 정책에 접근하고 있다.