자료원 구축의 추진력 강화와 지원, 관리 주체의 명확화를 위해, 자료원을 가지고 있는 연구자와 질병관리본부 등의 기관이 참여하여 자료원을 연계하는 "비교효과연구 컨소시엄"의 구성을 제안한다. 또한 담당 사무국 설립 및 관계형성을 통해 컨소시엄의 실효성과 시너지 효과를 높여야 한다.
이를 위해서 보건복지부 차원의 역량강화 및 구심점 역할 수행을 통해 자료원 구축의 실제적인 추진력을 강화해야 하며 특히 이 과정에서 국가적으로 자료원 구축에 대한 기획, 지원, 관리를 할 주체도 필요하다. 이에 본 연구에서는 국내에서 "비교효과연구 컨소시엄"을 구성하는 것을 제안한다. 비교효과연구 컨소시엄은 기존 자료원을 가지고 있던 연구자들 및 연구모임들이 참여하여 질환영역으로 TF가 구성되며 이들 통해 자연스럽게 기존에 단일기관으로 추구된 자료원들간의 연계를 가능하게 하고, 이 컨소시엄의 다른 축으로 질병관리본부, 국립암센터, 국민건강보험공단, 건강보험심사평가원, 한국보건산업진흥원 등이 참여하여 TF의 자료원과 이들 기관에서 구축하고 있는 자료원간의 연계를 가능하게 하도록 해야 한다. 또한 컨소시엄에 기획, 관리, 주제 선정 등을 담당하는 사무국을 두어 이들 TF들간의 시너지를 최대화할 수 있도록 해야 할 것이다. 마지막으로 비교효과연구 컨소시엄과 보건복지부의 긴밀한 관계형성을 통해 비교효과연구 컨소시엄의 실효성을 높여야 할 것이다.