나고야 의정서 발효 전후 세계 주요 BRC들은 새로운 가이드라인 개발이 필요하다고 주장한다. 기존 연구들은 해외 생물자원을 인류 공동의 자산이라 여겼으나, 나고야 의정서는 각국이 보유 생물자원을 통제할 수 있는 기반을 만들었다. 따라서 이런 변화에 대응해 해외 생물자원의 확보 등에 관한 지침을 만들어야 한다.
나고야 의정서의 발효를 전후로 세계 주요 BRC들은 새로운 가이드라인 개발의 필요성을 제기하고 있다. 기존 생태환경연구나 국제 농업연구에서는 해외 생물자원도 인류 공동의 자산으로 여기고 상호 교환해왔다. 2010년 국제식량농업기구(FAO)에서 만든 ITPGRFA(International Treaty on Plant Genetic Resources for Food and Agriculture)가 트러스트 펀드(Trust Fund)를 조성하여 해외생물자원에 대한 이익공유 메커니즘을 만들기는 했지만 ITPGRFA도 기본적으로 전 세계 농생명 자원에 대한 접근성을 개방하도록 하는데 초점이 맞추어져 있었다(FAO 2009). 이런 상황에서 나고야 의정서는 각 국이 보유 생물자원에 대한 통제할 수 있는 기반을 만들었고 이러한 변화에 대응하여 해외 생물자원을 어떻게 확보, 보존, 관리, 분양할 것인지에 관한 실천적 지침을 만들어나가야 한다. 이는 단순히 선진국과 개발도상국 간 형평성을 조율하는 문제만이 아니다. 일국 내에서도 해외 생물자원을 이용하려는 측과 자국의 생물자원을 보호하려는 측의 상반된 이해를 조율하는 것은 정치 경제적 과제이다.