STTR 프로그램은 중소기업의 기술이전을 지원하며 SBIR과 특성이 비슷하지만 공동연구 과제라는 특성과 상대 연구기관의 규모 제한이 없다는 점에서 차이가 있다. 
SBIR 프로그램과 유사 성격을 지니고 있는 중소기업기술이전(STTR: Small Business Technology Transfer) 프로그램은 기술혁신형 소기업과 비영리 연구기관의 협력연구과제에 한해 기술이전 자금을 지원하고 있다. 공공연구조직 연구물의 민간부문 이전 촉진과 함께, 알맞은 전문 인력을 보유하지 모한 중소기업들도 정부 지원 R&D 사업에 참여할 수 있도록 지원하고 있으며 SBIR과 동일하게 3단계로 구성된 지원 프로그램을 시행중에 있다. SBIR과의 차이점으로서는 중소기업과 연방정부 산하 연구센터, 비영리 공공연구기관, 대학 등과의 공동연구 과제라는 특성을 지니고 있으며, 상대 연구기관의 규모에 대한 제한이 없다.