맥류 붉은곰팡이병은 기상 조건에 따라 발생 차가 크지만 이삭 패기 직전, 직후 기상조건을 살펴 10일 간격 2-3회 적용약제를 뿌려야 한다. 비가 갠 뒤 약제를 뿌리며 수확 21일 전까지만 해야 한다.
맥류 붉은곰팡이병은 기상 조건에 따라서 병 발생에 차이가 크다. 보리나 밀 이삭이 패는 시기부터 여물기 전 까지 비가 잦고 3∼5일 동안 습도가 95% 이상 지속되면 병이 급속히 퍼질 수 있다. 지역, 품종에 따라 맥류의 생육 상황이 달라지기 때문에 약제 살포 시기도 달라질 수 있으나 이삭이 패기 직전이나 팬 후 병 발생이 우려되는 기상조건에서는적용약제를 안전 사용 기준에 맞추어 10일 간격으로 2∼3회 뿌려주어야 한다. 붉은곰팡이병 방제는 적기를 놓치지 않는 것이 중요하므로 비가 지속적으로 올 때는 잠시 비가 갠 때 약제를 뿌린다. 적용 약제로는 캡탄수화제, 트리플록시스트로빈입상수화제, 디페노코나졸·프로피코나졸유제가 등록되어 있다. 약제는 수확 21일 전까지만 사용해야 한다.