경피용 펜타닐과 서방형 경구용 모르핀을 비교하면,  통증점수 개선에서는 효과적이었다. 부작용은 펜타닐의 경우, 더 적었고, 투여중단 수준까지 역시 적게 발생했다. 이에 펜나틸은 변비와 졸음을 줄이는 것에 좀더 유리하다. 
경피용 펜타닐을 서방형 경구용 모르핀과 비교한 Clark 등(2004)의 연구에서는 두 군의 효과에 대해 메타분석을 수행하였다(포함 문헌수 4건, 환자수 997명). 두 군 모두 평균 통증점수 개선 측면에서 유사하게 효과적이었으며 효과의 차이는 유의하지 않았다. 심각한 부작용은 경피형 펜타닐군에서 유의하게 더 적게 발생하였으며 약제관련 부작용 및 부작용으로 인한 투여중단 또한 경피형 펜타닐군에서 유의하게 적게 발생하였다. 변비, 오심, 구토, 졸림현상(somnolence) 모두 서방형 모르핀에서 더 자주 발생, 변비와 졸림현상의 경우 그 차이가 유의하여 전반적인 부작용은 경피용 펜타닐이 더 적은 것으로 확인하였다. 따라서 경피용 펜타닐은 서방형 모르핀과 비교하였을 때 변비와 졸림현상의 감소 측면에서 특히 내약성에 유리하였다.