R&D 투자를 고정자본투자와 동일하게 보며 기본적인 GDP 값을 그대로 유지하려하면 행과 열이 일치하지 않게 된다. 김용건 외의 연구는 이와 비슷하게 지식기반 SAM을 추정, 산업분류 중 연구기관 등을 지식산업으로 정의하고 열과 행의 총합을 각기 다르게 정의했다.
다음으로 Otto(2008)의 연구의 경우 기본적으로 Goulder-Schneider(1999)의 접근방법이나 Wing(2003)의 접근방식과 유사하여 R&D 투자를 고정자본투자와 동일하게 취급하지만 중복계상과 부가가치 증대효과를 막기 위하여 고정자본투자에서 R&D 투자만큼을 차감하는 방식으로 기본적인 GDP 값을 그대로 유지하고자 하나 행과 열이 일치하지 않는 문제점을 그대로 안게 된다고 지적한다. 김용건 외(2010)의 연구도 이와 유사한 선상에서의 지식기반 SAM을 추정하게 되는데 즉 지식산업을 정의하고 이 지식산업에서만 R&D 투자가 이루어지고 이 지식산업은 다른 산업에 지식서비스를 제공하고 수익을 창출하는 방식으로 SAM을 구성한다. 이에 김용건 외(2010)의 연구에서는 산업분류 중 연구기관(357, 358, 359), 산업 내 연구활동(360)을 지식산업으로 정의하고 열 총합은 R&D투자액으로 행 총합은 노동에 대한 보수로 지식서비스 투입액으로 정의하였다.