자유무역지역에 차별점을 두기 위해 기업이 수출입 시에 거래비용을 줄일 수 있도록 정책을 지원해야 한다. 경제자유구역과는 다르게 국가의 지원으로만 가능한 사업지원 서비스 기능 제공에 초점을 맞추어 수출증대와 외화획득을 독려할 수 있을 것이다. 
셋째, 자유무역지역의 차별화를 위한 요인으로 기업의 수출입 활동과 관련한 각종 거래비용을 최소화할 수 있는 지원정책 마련이 중요하다. 자유무역 지역은 수출주도형 성장 전략 과정에서 외국인투자를 유치하여 수출 증대와 외화획득 달성을 도모하기 위한 거점으로서의 역할을 효과적으로 수행해 왔다. 특히, 최근의 경제자유구역 등 특구 전략이 서비스 산업 및 신성장 산업에 집중하는 반면, 자유무역지역은 생산 및 수출입 활동과 연계된 거점 특구로서 차별점을 가진다. 이러한 자유무역지역의 차별점을 보다 강화하기 위해서는 기업들의 수출입활동을 보다 효율적으로 지원하기 위한 체계를 갖추는 것이 필요하다. 이는 자유무역지역내 입주기업들이 생산, 수출입, 물류ㆍ유통 전반에서의 거래비용을 최소화하는 방식으로 접근되어야 할 것이며, 특히 기업자체적으로 해결할 수 없는 사업지원 서비스 기능의 확충에 초점이 맞추어 질 필요가 있다.