농업유전 자원센터는 농업유전 자원관리를 위한 사업을 하고 있다. 국가등록사업을 통해 국가적으로 중요한 식물자원을 선별, 보존, 활용할 수 있도록 연구 재료로 제공한다.
농업유전 자원 관리의 연장선 상에서 농업유전 자원센터는 여러 가지 사업을 수행하고 있다. 첫째, 농업생명자원(식물)에 관한 국가등록사업을 수행한다(농업유전 자원정보 센터 웹페이지 2015.10.27.). 이를 통해 국가적으로 중요한 식물자원(종자 및 영양체)을 선별, 소요에 맞게 중 장기 저장고에 보존한 후, 활용될 수 있도록 일정량을 연구 재료로 제공한다. 농업유전 자원의 국가등록 제도는 분야별 전문가 중심의 심의위원회를 구성, 합의된 기준을 준거로 하여 운영하고, 보존자원의 지속적 이용을 위한 활력의 갱신이나 신규 등록을 위하여 증식을 수행한다.