단기산업기술개발과제의 정성평가는 전문기관의 분석 자료를 제공받지 못해 임시 방편적인 성격을 가진다. 표준지침상의 대면평가 시 권고 평가시간을 적용하기 어려우므로  최근 사전 워크샵 등을 통해 정보를 교류하나 전문성에 한계가 있다.
단기산업기술개발과제의 정성평가 과정을 보면 대부분이 평가에 필요한 자료나 피평가자(과제제안자)를 충분히 관찰할 기회를 갖지 못한다는 점이다(조현대, 2015). 대부분의 경우 평가 시 전문기관으로부터 충분한 분석 자료를 제공받지 못한 상태에서 평가를 함으로서 임시방편적인 성격을 갖게 한다(조현대, 2015). 표준지침에서는 대면평가 시 중소형과제는 과제당 1시간 이상 제공하며, 사업단 및 연구단 등 심층평가가 필요한 대형 과제는 2일 이상의 장기평가가 가능하고 과제당 2시간 이상 발표 질의응답 시간 제공할 것을 권고하고 있으나 과제별 경쟁이 치열한 경우 실질적으로 적용하기 어려운 실정이다(조현대, 2015). 최근에는 앞서 언급한 것처럼 평가자간의 사전 워크샵 등을 통해 정보를 교류하고 있으나 시간적으로나 전문성 면에서 역시 한계를 갖고 평가에 임할 수 밖에 없는 실정이다