혁신시스템은 연구개발, 교육, 기업 등 연구혁신 활동으로 구성된다. 이를 미시적 관점으로 성과를 보면 지식의 창출과 확산, 활용이 있으며 거시적으로 보면 국가 관점, 지리적, 산업, 글로벌 관점으로 나누어 볼 수있다.
셋째, 혁신시스템은 연구개발, 교육, 기업 등 연구혁신 활동의 주체들로 구성되며, 지식의 창출과 확산, 활용을 그 미시적 성과로 드러낸다. 다만, 혁신시스템을 보는 관점은 거시적 혁신 단위를 묶는 방식에 따라 다르다. 국가 관점에서 혁신시스 템은 활동 주체에 따라 대학, 정부연구소, 기업으로 구성되며, 국가혁신시스템(NIS, National Innovation System)으로 통칭한다. 혁신클러스터와 같이 지리적 단위 관점에서 이해하는 혁신시스템은 지역혁신시스템(RIS, Regional Innovation System)으로 그 핵심 행위자는 지역의 대학, 연구소, 기업 등으로 구분된다. 산업관점에서는 특정 산업을 둘러싼 혁신 주체들을 기반으로 산업혁신시스템(SIS, Sectoral Innovation Systems)을 이해한다. 최근에는 글로벌 관점에서의 글로벌혁신시스템 또는 글로벌 혁신네트워크(GIS, Global Innovation System 또는 GIN Global Innovation Network) 논의가 활발하므로 이와 국가 혁신 시스템 사이의 관계에 대한 고려가 수반되어야 한다.