국내 융합연구는 기반이 취약하며 도전적인 연구가 현장에서 사라지고 있는 추세이다. 융합연구에 대한 이해가 필요하다. 
첫째, 기존 계량적 평가체계로 인한 융합연구 발전 저해에 대한 우려다. 지속적으로 투입 예산이 늘고 있고 계량적 성과도 나오고 있지만, 현장에선 도전적 연구가 실종되고 있다는 문제 제기가 많다. 또한 앞서 글로벌 트렌드와 비교할 때 국내 융합연구는 기술중심의 발전에 비해 기반이 취약하다. 이러한 이율배반적 현상에 대한 이해와 원인규명이 필요하다. 그러기 위해서는 융합연구가 기존연구와 비교해서 어떠한 점에서 차별성을 갖고 있는지 먼저 파악해야 한다. 지금까지 많은 정부 융합연구개발사업에서 융합연구 특성에 대한 이해없이 기존 연구의 연장선상에서 평가가 추진되고 있다는 문제의식이 본 연구의 출발점이다.