소나무재선충병발현의 세균 관여성이 여러 연구에 의해 제시되고 있지만 그를 반증하는 연구결과도 많아 논란의 여지가 있다. 서로의 연구방법과 결과에 대한 불확실성과 반론을 제시하고 있기 때문에 정확한 결론을 위해서는 독소생산 유전자 조작 세균(비병원성, 저병원성)의 이용을 통한 정확한 메카니즘 발견이 중요할 것이다.
최근 이슈가 되고 있는 소나무재선충병의 병징 발현에 세균이 관여하고 있다는 학설은 몇몇 연구결과와 함께 주목받고 있다. 그러나 Kuroda와 Ito(1992)는 곰팡이 또는 세균이 증식하기 훨씬 전에 소나무 사관부에서 수분이동이 차단되고 있다는 해부학적 연구결과를 근거로 세균관여설을 일축하고 있는 등 논란의 여지가 많이 있는 것도 사실이다. 앞에서도 언급한 바와 같이 세균관여설이 제시하고 있는 연구결과 중에서 무균 소나무재선충을 접종했음에도 일부 나무가 죽는 현상에 대한 설명이 불확실하며, 무균 소나무재선충을 접종한 후에 발생한 세균오염 가능성, 그리고 과연 접종한 소나무재선충이 진정한 무균 상태이었는가 등에 대한 논란도 있다. 아울러 필자는 어떤 지역에 분포하는 소나무재선충은 그 지역에 분포하는 특정 그룹 세균만을 갖고 있는지, 소나무재선충의 병원성 정도는 동반 세균의 종류에 기인하는 것인지에 대한 의문을 갖고 있다. 그러므로 소나무재선충과 세균과의 공생관계에 대한 보다 명확한 증거를 찾기 위해서는 독소생산 유전자를 조작한 세균(비병원성, 저병원성)을 이용하는 연구 등을 통하여 관련 메카니즘을 밝혀야 할 것이다. 끝으로 세포관여설을 선도하고 있는 Zhao박사(2003)가 제시한 개잎갈나무에 관한 추론 한 가지를 소개하며, 이 분야에 관심이 있는 연구자라면 한번 시도해볼만한 흥미롭고 중요한 연구주제가 아닐까 한다.