신의료기술평가위원회는 새로운 의료기술이 안전한지, 효과가 있는지를 검토하여 그 결과를 보건복지부 장관에게 보고하며 장관은 1년내에 기술평가결과를 보고한다.
신의료기술평가위원회는 대상의료기술의 평가대상 여부와 평가방법에 관한 사항을 심의하며, 평가 절차 및 기준 변경에 관한 사항 및 결과 활용방법에 관한 사항 또한 심의하게 된다. 무엇보다 신의료기술의 안전성․유효성에 관한 전문위원회의 검토 결과를 심의하여 결과를 보건복지부 장관에게 보고하여야 한다. 그리고 보건복지부장관은 신청서 접수한 날로부터 1년 이내에 해당 기술의 평가결과를 신청인과 건강보험심사평가원장에게 통보하여야 한다. 또한 해당 의료기술의 안전성․유효성에 대한 평가결과, 사용목적, 사용대상 및 시술방법 등을 고시하여야 한다.