우리나라의 바이오 벤처는 외환위기와 닷컴 버블의 영향을 받아 2000년에 일시적으로 200여 개의 기업이 창업됐지만 거품이 꺼진 뒤에 창업의 수가 현격히 줄어들었고 지금까지 이어졌다. 
올해는 한국 최초의 바이오 벤처인 한국생공(現 바이오니아, 1992년 설립)이 설립된 지 21년이 되는 해이다. 지난 20여 년 동안 우리나라의 바이오 벤처는 여러 부침과 우여곡절을 겪으면서 양과 질의 측면에서 조금씩 발전해왔다고 볼 수 있다. 바이오니아의 설립 이후 1990년대 중반까지는 매년 20~30개의 바이오 벤처기업이 설립되다가, 1997년 외환위기 이후 정부가 적극적으로 추진했던 벤처 육성 정책과 당시 전 세계적인 닷컴 버블의 영향을 받아 2000년에는 200개가 넘는 기업이 창업될 정도로 반짝 창업 붐이 일기도 했다. 그러나 2000년의 버블이 꺼진 후에는 다른 분야와 마찬가지로 창업 열기가 급격히 식어서 소극적 창업의 기조가 현재까지 이어지고 있다. 그 사이 업계는 황우석 사태, 코스닥 기술성 평가 상장 제도의 도입, 우회상장 러시, 문제 기업의 코스닥 퇴출과 폐업 등 여러 부침을 겪기도 했다.