종업원제안제도의 실질적 효과는 경제적 목적의 실질적 제안 안을 얻을 수 있으며, 조직과 구성원의 상호 이해를 돕고, 제안을 수집/채택/상호 교환하면서 인관관계를 향상시킬 수 있으며 종업원의 창의력을 개발할 수 있다는 것이다. 
종업원제안제도의 실질적 효과에 대한 다양한 선행연구들을 정리하면 다음과 같다. 박노국･이성호(2008)에서는 제안 제도의 효과를 다음과 같이 정리하고 있다. 첫째, 경제적 목적으로 제안 그 자체에서 실질적 제안 안을 얻을 수 있으며, 제안의 내용에 따라 작업 능률을 촉진시키거나 경비를 절약 할 수 있거나 구성원의 안정과 건강을 향상시키는 것도 있다. 둘째, 제안의 채택에 의하여 구성원의 사기와 근로의욕을 높이고 조직과 구성원의 상호 이해를 돕는 효과가 있다. 셋째, 기업에 종사하는 구성원들은 여러 가지 작업을 수행하는데 있어서 개선이 필요한 점에 관한 제안 안을 가지고 있는데, 제안 제도를 통하여 제안(안)을 수집 채택 상호 교환함으로써 인관관계 향상을 시킬 수 있다. 넷째, 종업원의 창의력을 개발한다. 그러나 제안 제도의 효과에 대해서 한계를 지적한 논문들도 있었다.