국가검진사업 진행 시 비교 대안과 서비스 제공에 대한 기대 이득을 비교하여 사업을 도입 하는 것을 권장하며 보훈대상자의 의료 혜택 보장 및 비교효과연구 활성화도 요구된다.
국가적 보건의료사업의 의사결정과정에도 이러한 연구가 필요할 수 있다. 예를 들어 국가검진사업의 의사결정이나 국가치매 관리사업에서 치매 검진방법 도입, 응급의학 분야 제도 도입 등 많은 분야에서 특정 의료기술의 사용이나 의료서비스 제공에 대해 비교대안과의 기대 이득과 위해를 평가하여 그 근거 하에 사업을 도입하기 위한 체계의 정비도 필요하다. 또한 보훈처의 의료보장체계 의사결정과정에 있어서도 기존의 급여되지 않는 항목들도 보훈대상자의 의료혜택 제공 측면에서 보장의 강화가 필요할 수 있다. 또한 국가가 지원하는 임상연구결과로 임상진료지침을 개발하는 경우 역시 이러한 비교효과연구의 활성화가 필요한 분야이다.