소독은 병원균을 가축에 해가 없도록 죽이는 방법과 작용으로, 가축전염병 발생과 만연을 방지하는 중요한 작업이다. 최근 소독개념은 가축이 마시는 물의 소독 등도 포함한다.
소독이란 직접적으로 가축에 병을 일으키고 있는 병원균(바이러스, 세균, 곰팡이 등)을 가축에 해가 없도록 죽이는 방법과 작용을 말한다. 또한 동물이 전염병에 감염될 위험성이 있는 병원균과 그 병원균을 전파시키는 해충 및 동물을 박멸하여 전염병으로부터 동물을 보호하는 수단으로서 가축전염병의 발생이나 만연을 방지하는 방법 중에서 가장 중요한 작업이다. 한번의 예방이 열 번의 치료보다 낫다는 생각을 갖고 사양관리의 기본업무에 넣어 반드시 실시하여야 하는 것이 소독이다.
최근의 소독개념은 축사 및 축체소독과 해충의 방제뿐만 아니라 가축이 마시는 물의 소독, 사료의 방부처치 및 악취 방지의 목적으로 실시하는 약제의 투여도 포함시키고 있다.