운반체 단백질에는 비독성유전자변형 디프테리아 독소 분자, 디프테리아·파상풍 톡소이드 등이 있다. 접합백신은 모니터링에 좋다. 영유아 백신과 새 접합백신을 투여하면 항독소량이 많아진다. 반응율 증가 반응 원성에 주의한다. 혼합백신 항원은 운반체 단백질의 다른 접합백신과 함께 넣으면 줄어든다.
현재까지, 기허가 다당류 접합백신에 사용되는 운반체 단백질에는 비독성유전자변형 디프테리아 독소 분자(CRM197), 디프테리아 톡소이드, 파상풍 톡소이드, 헤모필루스 인플루엔자의 단백질 D, Neisseria meningitidis 혈청군 B의 외막단백복합체(OMPC)가 포함되었다. 경우에 따라 이러한 운반체 단백질에 대한 면역반응을모니터링하는 게 적절할 수도 있다. 운반체로서 디프테리아 톡소이드, 파상풍톡소이드나 CRM197을 사용하는 접합백신을 투여하면 관련 항독소 항체량이 높아지는 것으로 나타났기 때문이다. 하지만, 이것은 지금까지 디프테리아 톡소이드 및 파상풍톡소이드가 들어있는 백신을 사용하는 것이 일반접종을 대체하는 것으로 용인되지는 않았다. 일반적인 영유아 백신(즉, 디프테리아 톡소이드 및 파상풍 톡소이드가 함유된백신)과 함께 새로운 접합백신을 동시투여하면 항독소량이 많아질 수 있다. 일부반응율의 증가는 높은 항독소량과 관련될 수 있으므로, 이러한 사용 환경에서 관찰되는 반응 원성에는 세심한 주의를 기울여야 한다. 운반체 단백질에 결합된 혼합백신 항원의 반응은 동일한 운반체 단백질을 사용하는 다른 접합백신과 함께 투여했을 때 줄어들 수도 있다.