한국형 메커니즘의 단점이자 리스크는 감축실적에 대한 국제적인 인정 여부이다. 즉 투명성 확보를 위한 정부의 행정 부담과 재정 부담이 크다는 것이다.
이와는 반대로 한국형 메커니즘의 단점은, 국가 간의 합의에 의하여 실행됨으로써, 감축실적의 국제적인 인정 가능성 여부에 대한 리스크가 가장 크게 존재한다. 이에 대한 기본적인 대응방안으로, 감축실적의 국제적인 인정을 위하여 국제적인 수준의 MRV 및 이행 절차, 이중계산 방지를 위한 투명성 확보 등을 위한 정부의 행정적인 부담과 아울러, 제도 운영과 기업 지원 등을 위한 정부의 재정적인 부담이 SDM과 비교하여 훨씬 많이 소요될 수 있다는 단점이 있다. 즉, 한국형 메커니즘의 가장 큰 단점이자 리스크는 감축실적에 대한 국제적인 인정여부라고 하겠다.