융합연구단 선정이 예상이 불가능하여 출연연들 간에 주관연구기관과 협동연구기관 참가 방법에 대한 동등한 대우를 습득할 수 있는 기회가 없다는 문제점을 해결하기 위해 국가과학기술연구회에서 ‘중장기 융합연구 로드맵’의 제안이 필요하다. 
이를 해소하기 위해서는 국가과학기술연구회에서 ‘중장기 융합연구 로드맵’을 제시할 필요가 있다. 그래서 융합연구단 선정을 예측가능성 있는 반복게임으로 전환해야 한다. 반복게임이 될 때에는 출연연들 간에 주관연구기관과 협동연구기관 참여 방식에 대한 상호호혜성을 학습할 수 있는 기회를 갖게 된다. 즉 주관연구기관을 맡을 수 있는 융합연구 주제가 어떤 연도에 있는지를 예측하게 되면, 여기에 참여가 필요한 협동연구기관을 예상할수 있게 된다. 타 출연연에서 협동연구기관으로 참여를 요청하게 될 때에 차후에 참여를 약속받고 컨소시엄에 참여함에 따라 신뢰자본을 형성할 수 있는 학습기회를 갖게 된다. 이런 과정이 반복되면서 상호호혜 차원의 최상의 컨소시엄 구성이라는 보상과 배신에 따른 자기 이익 추구를 할 경우 구성하고 싶거나 참여하고 싶은 컨소시엄에서 배제되는 불이익이라는 학습이 루틴으로 자리를 잡을 수 있을 것이다.