track 1은 주최국이 JI의 자격요건을 충족하는 사업을 모두 충족할 수 있는 단계로, 주최국에 협의에 따라 JI 사업의 여부를 판정한다. 주최국이 모든 자격요건을 만족하지 못할 때 활용되는 track 2에서는 인증 독립기구가 JI 사업의 여부를 판정한다. 이때 track2의 사업 참여자는 인증 독립기구에 사업판정을 위해 사업 계획서의 제출이 필요하다.
제안된 사업이 JI 사업으로서의 요건을 갖추었는지 결정하는 단계로, track 1과 track 2가 각각 판정방법을 달리한다. 주최국이 모든 JI의 자격요건을 만족하는 사업이 추진 가능한 track 1의 경우, JI 사업은 주최국의 협의 하에 JI 사업 여부가 판정된다. track 2의 경우는 주최국이 모든 자격요건을 만족하지 못하는 경우 사용되는 접근방법으로 track 2에서의 JI 사업 여부는 각 주최국이 아닌 인증 독립기구가 판정한다. JI 지침서에 따라 track 2의 사업 참여자는 인증 독립기구에게 사업 판정을 위한 사업 계획서를 제출해야 된다. 사업 계획서를 통해 인증 독립기구는 사업 요건으로 ① 사업에 관련된 당사국으로부터 승인, ② 해당 사업 활동을 하지 않았을 경우와 대비하여 추가적인 온실가스 감축 효과 수반, ③ JI지침서 내의 관련 기준에 따라 베이스라인 및 모니터링 계획 수립 여부를 판단한다. 또한, 참여 요건을 모두 만족하는 주최국이 원하는 경우 본래의 track 1이 아닌 track 2로 진행하여 JI 감독 위원회의 감독 하에 사업 여부 및 감축량을 검증받는 절차를 선택할 수도 있다. 사업 여부에 대한 판정은 인증 독립기구에 의한 판정 결과가 UNFCCC 홈페이지를 통해 공개일로부터 45일 이내에 사업 관련 당사국이나 JI 감독위원회 3명 이상의 검토를 요청하지 않는 이상 JI 사업으로 판정된 것으로 간주한다 (DEHSt 2008).