어장에 너무 많은 수를 입식하고, 기후변화까지 겹쳐 패류의 종수가 감소하여 중국산이 수입이 증가하고 있는 상황이다. 
기후변화로 인한 어장환경 변화와 과다입식으로 인한 어장 오염으로 자연산 패류의 개체량이 감소해 자연채묘로 공급되는 종묘가 줄어들게 되었다. 이로 인해 중국산 치패 수입이 확대됨에 따라 국내 종패생산기반이 흔들릴 위험에 처해있다. 국내에서 인공종묘 생산이 가능한 갯벌서식 패류는 백합, 바지락, 꼬막 등 3종으로 한정되어 있다.47) 또한 자연패묘는 특정 기간에 한정되고 종묘 품질의 일관성을 기대하기 힘들다는 한계가 있다. 갯벌양식 품종별 전략을 다변화하기 위해서는 다양한 갯벌패류에 대한 인공종묘생산 기술 개발 및 자연종자 관리가 요구된다.