유전자검사평가제도는 의료기관, 비의료기관을 불문하고 유전자검사실에서 이루어지는 검사의 질과 정확성을 평가하기 위해 한국유전자검사평가원이 시행하고 있다.
이러한 문제제기에 대해서 비의료기관에는 유전자검사평가가 실시된다고 반박할 수도 있다. 유전자검사평가제도는 의료기관에 있는 유전자검사실을 포함해서 비 의료기관의 유전자검사실에서 이루어지는 검사의 질과 정확도에 대한 평가제도이다. 유전자검사평가를 위해서 2005년 6월 한국유전자검사평가원이 창립되었고, 유전자 검사결과의 정확도 평가 및 관리, 유전자검사기관의 업무수행과정의 적정성 평가 및 관리, 유전자검사를 위한 시설 및 장비의 적합성 평가 및 관리, 유전자검사 인력의 적정성 평가 및 관리, 유전자검사의 적절성 평가 및 지침 마련 등이며, 이를 평가 업무 현장실사, 숙련도평가 및 적절성 평가를 통해 시행하고 있다.