감사기간동안 미꾸라지 수거검사 실적을 확인했을 때, 서울특별시의 것들이 대부분이였고 지방식품의약품안전청과 지방자치단체들은 아예 하지 않거나 검사 비율이 매우 적었다. 
그런데 이번 감사원 감사기간(2018. 6. 4.~7. 20.) 중 각 지방식품의약품안전청과 지방자치단체가 수거검사한 실적을 확인해 본 결과, 부적합 발생 비율이 높은 미꾸라지의 경우 2017년에 총 65건 수거검사를 실시하였으나 전체 검사 건수의 89.2%인 58건을 서울특별시가 검사한 것으로 확인되었으며 2018년 5월 현재까지 서울특별시만 22건의 미꾸라지에 대한 수거검사를 실시하였고, 지방식품의약품안전청과 다른 지방자치단체는 미꾸라지에 대한 수거검사를 실시하지 아니하는 등 부적합 발생 비율이 높은 미꾸라지에 대한 수거검사를 소홀히 하고 있었다.