세종시 공공급식지원센터의 3-6-9 프로젝트는 2020년까지 지역 농산물 30품목, 공급비율 60%, 공급액 60억 원, 만족도 90% 이상을 달성하기 위한 목표를 의미한다. 
세종시 공공급식지원센터의 목표는 3-6-9 프로젝트로 일컬어진다. 2020년까지 지역 농산물 30품목, 공급비율 60%, 공급액 60억 원, 만족도 90% 이상을 달성하기 위한 목표를 프로젝트명에 담았다. 3-6-9 프로젝트는 학교급식 등 공공급식뿐만 아니라, 세종형 로컬푸드 운동의 주요한 목표이기도 하다. 더욱 중요한 것은 목표연도에서 보듯이 공공급식지원센터가 본격 운영되는 해인 2020년까지 해당 준비사항을 사전에 완료하겠다는 것이다. 현재의 컨트롤타워형 운영 체계를 중심으로 만반의 준비사항을 미리 완료하고 안정적인 공공급식지원센터 운영을 차질 없이 진행하겠다는 것이 특징이다.