동물용의약품은 동물에게 직접 투여함으로써 가식부위 축적되어 인체에 유입된다. 이는 알러지, 약물치료효과 부작용, 항생제 내성 등의 원인이 된다. 특히 치료목적의 동물용의약품은 인수공통의 의약품을 사용하게 되므로 이를 제도적으로 금한다. 그 예로 EU는 문서를 통해 식용동물의 동물용의약품 사용을 규제해 왔으며 이후 항생제의 사료첨가도 금지시켰다. 문서는 네 종류의 약리활성 물질들을 두 종류로 재분류 하였다.
작물과는 달리 동물용의약품은 질병의 치료와 성장 촉진을 위해 동물에게 주사, 음수, 사료 등을 통해 직접 투여함으로써 식품으로 이용되는 가식부위 또는 생화학적 대사과정 중 특정 기관(organ, 잔류검사목적에서는 표적장기 target organ)내 축적되어 잔류한다. 잔류는 직접적인 모화합물 뿐만 아니라, 생화학적 대사과정을 거친 대사체로 존재하며 인체에는 주로 음식을 통해 유입된다. 직접적 위해 요소가 될 수 있는 농약이나 다른 유기오염물질과 다르게 음식을 통해 잔류 의약품이 체내 유입된다는 것은 불필요한 치료제가 체내로 유입됨으로써 체내 항상성 교란, 약물특이반응(allergic reactions in hypersensitive individuals), 약물치료 중인 환자인 경우 치료효과의 억제 또는 부작용은 물론, 인체 항생제 내성유발(indirectly through induction of resistant strains of bacteria) 등의 원인이 될 수도 있다. 특히, 치료목적에서 동물용의약품과 인체 약품은 불가피하게 동일화합물을 약으로 이용하게 되므로, 제도적으로 이러한 인수공통의 의약품은 사용을 제한하고 있다. 이러한 동물용의약품 사용의 제한의 예는 유럽 연합 (EU) 에서도 발견할 수 있다. EU에서는 식용으로 이용되는 동물에서 성장촉진제를 포함한 동물용의약품의 사용을 다양한 규정과 지시를 사용하여 엄격히 규제해 왔으며, 1998년부터 사료에 첨가되는 항생제를 금지해왔다. 이러한 동물용의약품의 사용은 Commission Regulation 470/ 2009/EU와 37/2010/EU를 통하여 규제된다. 이 규제문서들은 기존의 2377/90/EC을 대체하는 문서이며, Commission Regulation 470/2009/EU의 단순화된 분류 시스템을 따르기 위하여 37/2010/EU에서는 2377/90/EC에서 네 종류로 분류된 약리활성이 있는 물질들을 다음과 같이 두 종류 (allowed와 prohibited)로 재 분류 하였다.