임상자료는 표본수가 적지만 세부적 임상정보가 있다. 종단자료는 다양한 많은 자료를 포함하고잇다. 연계시스템이 없어 보험청구자료와 임상자료를 연계하고 있다.
임상자료의 경우 비록 표본수는 적지만 세부적인 임상정보를 많이 가지고 있는 장점이 있다. 그러나 이러한 자료들의 정확도와 신뢰도는 연구참여자의 데이터 입력에 달려있다. 현재 임상등록자료의 경우 주요사건 당시 상세한 환자와 임상정보를 확보하고 있으며, 행정자료는 환자들이 시간에 따라 다양한 기관에서 치료를 받기에 종단자료를 제공한다. 보건의료체계자료는 대부분 많은 자료를 포함하고 있다. 하지만 임상자료와 종단자료에 모두 연계하는 통합적 시스템은 거의 없다. 그러나 이러한 문제 해결을 위해 환자의 종단평가와 명확한 질병상태 또는 치료와 관련된 정확한 비용자료 등을 나타낼 수 있는 보험청구자료와 임상자료를 연계하고 있다.