수자원관리법 제34조 제1항과 제2항은 자율관리 및 자율관리어업 등에 관한 법률적 근거를 두고 있으며, 법집행은 해양수산부의 자원관리과가 하고 있다. 
수산자원관리법 제34조 제1항에서는 “해양수산부 장관 또는 시·도지사는 자율적으로 수산자원을 관리하고 어업경영을 개선하며 어업질서를 유지하기 위한 자체규약을 제정하여 실행한 어업인단체에 대해 행정적·기술적·재정적 지원을 할 수 있다”라고 규정하여 자율관리에 관한 법적 근거를 두고 있다. 또한 동조 제2항은 “제1항에 따른 자체규약 실행의 기준과 어업인단체의 범위, 어업인단체에 대한 지원 방법과 절차에 필요한 사항은 해양수산부령으로 정한다”라고 규정하여 시행령과 자율관리어업 관리 등에 관한 규정의 법률적 근거를 제공하고 있다. 동 규정과 관련된 법집행은 해양수산부의 자원관리과에서 담당하고 있다.