식중독에 의한 급성 설사의 치료는 탈수 방지와 수분손실 보충에 초점을 두어야 한다. 우유나 락토오즈, 카페인을 함유한 음식은 피해야 한다.
식중독에 의한 급성 설사는 대부분 자연적으로 회복되며 특별한 치료가 필요하지 않는데, 치료가 필요한 경우의 기본 방침은 탈수를 방지하고 수분손실을 보충하는데 초점을 맞추어야 한다. 주사제를 사용하기도 하지만 경구수액요법으로의 대체가 가능한 경우가 많으며, 장을 쉬게 한다든지 경구섭취가 설사를 악화시킬 것이라는 생각으로 금식하는 것은 잘못된 인식이다. 그러나 우유나 락토오즈 함유식품은 피해야 하는데, 바이러스성 혹은 세균성 장내 병원균 중 일부는 일시적인 락타아제 결핍에 따른 락토오즈 흡수장애로 생기기 때문이다. 카페인이 함유된 음식도 피해야 하는데, 이는 카페인이 cyclic AMP의 농도를 높여 수분 배설을 촉진시키기 때문이다.