바이오 뱅킹 2세대는 질에 초점을 맞추었다. 생물자원의 질 관리에 문제가 제기되며 BRC의 관리 기준을 표준화, 과학화하는 작업이 시작되었다. 한편으로는 바이오 샘플에 대한 보고 체계를 개선하였고, 유럽에는 BRISQ 제도가 고안되어 생물자원의 출처를 명시하도록 유도하였다.
바이오 뱅킹 2.0세대는 질(quality)에 초점을 맞추기 시작한다(Simeon-Dubach and Watson 2014). 2000년경에 이르러서 확보한 샘플들이 많지만 상당수가 활용되지 않고 많은 경우 오염되거나 정확하기 확인되지 않는 사례가 증가하면서 질 관리의 문제가 제기되었다(Simeon-Dubach and Watson 2014). BRC의 규모와 범주, 운영 형태가 각양각색인 탓에 BRC에서 받은 생물자원이라 하더라도 그 품질이 고르지 못하고, 증거 기반 표준(evidence-based standard)이 부족했던 것이다(Simeon-Dubach and Watson 2014). 그러면서 BRC가 질 관리(quality control)에 더 투자해야 한다는 주장이 설득력을 얻었다(Simeon-Dubach and Watson 2014).한편에서는 ISO TC/276과 같이 BRC의 관리 기준을 표준화, 과학화하는 작업이 시작됐다. 다른 한편에서는 바이오 샘플에 대한 정확한 보고를 생략하는 연구개발계의 관행을 개선하는 데 주력하기 시작했다. 실제 BRC에서 분양받은 샘플로 연구를 진행한 경우 어떤 자원을 어디서 어떤 상태로 분양받았으며 어떤 처리 과정을 거쳐 연구개발에 활용했는지에 대해 정확하게 보고하도록 하는 출판사가 증가하고 있다. 한편 연구자들이 논문 출판에 활용된 생물자원의 출처에 대해 명시하도록 유도하기 위해 유럽에서는 BRISQ(Biospecimen Reporting for Improved Study Quality) 제도가 고안되기도 했다.