심평원 청구 자료나 공단 자료를 사용해 비용을 산출하는 방법을 사용했었으나 질병의 분류가 세분화되면서 이러한 자료를 사용하는 것이 한계가 있다.
의료비용과 약제비용은 산출방법이 거의 유사하였다. 심평원 청구 자료나 공단 자료를 사용하여 비용을 산출하는 방법을 많이 사용하고 있었으나 질병의 분류가 점점 세분화되면서 이러한 자료를 사용하는 것이 한계가 있다고 언급하였다. 의료기관 자료 등을 이용할 경우 미시적 비용 산출방법을 사용하게 되는데, 이 방법에서는 진료유형을 표준화시키는 어려움을 이야기하였다. 반면 심평원 자료나 공단 자료를 사용할 때의 한계로 산출하는 방법에 따른 비용차이와 청구 자료 특성상 과소 추계되는 점을 들었다. 의료비용 중 비급여비용을 산출할 때 연구자들은 주로 건강보험환자진료비 실태조사자료를 활용하는 것으로 나타났다.