한국인 고유의 SNP 데이터베이스를 구축했고 한국인에서 발병 가능성이 높은 질병 후보 유전자의 유전적 변이를 발굴하였다. 유전적 변이와 인종 간 차이를 파악할 수 있을 것이다. 
국립보건원은 한국인 고유의 SNP 관련 정보를 저장하고 이를 국외의 SNP 관련 데이터베이스와 비교 분석하기 수월하도록 데이터베이스 구축을 진행하여 2003년 처음으로 데이터베이스를 만들었다. KSNP 데이터베이스 구축 사업은 가족으로의 관련성이 없는 24명의 한국인 DNA를 비교 분석하여 당뇨나 천식과 같이 한국인에 서 발병 가능성이 높은 주요 질병에 대한 질병 후보 유전자의 유전적 변이를 발굴하였다. 이 연구를 통해 한국인에게 특이적으로 나타나는 유전적 변이와 인종 간 차이를 파악할 수 있을 것으로 기대되었다. http://ksnp.cdc.go.kr에서 데이터베이스 접속이 가능하다.