과학기술정책연구원은 연구개발투자의 정부와 민간의 역할 분담 방안을 모색하기 위해, NTIS DB를 활용하여 정부의 연구개발투자 구조, 과학기술연구개발활동조사 DB를 가지고 민간의 연구개발투자 구조에 대해 포트폴리오분석 후 비교 분석했다. 
과학기술정책연구원(2006)은 연구개발투자의 정부와 민간의 역할 분담 방안을 모색하기 위하여 NTIS DB를 활용하여 정부의 연구개발투자 구조, 과학기술연구개발활동조사 DB를 가지고 민간의 연구개발투자 구조에 대해 포트폴리오분석을 수행한 후 양자를 비교 분석하였다. 분석은 연구개발단계별, 기술별, 미래유망 신기술별, 차세대 성장동력별, 경제사회목적별, 지역별 등 다각적 차원에서 이루어졌다. 이러한 분석을 통해 정부의 연구개발투자는 시장실패가 일어나기 쉬운 기초연구에 집중, 정부 연구개발투자 배분의 방향을 산업개발 진흥에서 원천기술과 공공･복지기술에 대한 배분의 증가로 전환, 연구의 성격 측면에서는 도입기 기술의 기초연구로 전환, 산업진흥을 위한 정부 연구개발투자에 있어서는 지나친 산업 편중 지양, 연구개발역량이 취약한 중소기업의 역할 보완, 수도권 편중 완화 등에 초점을 맞출 필요가 있음을 지적하고 있다.