본 연구는 연구현장의 의견을 반영하기 위해 미래부와의 상호 연구협력관계를 구축하였고, 기존의 연구자료에 KISTEP의 자료문건들을 협조받아 연구 내용에 반영하였다는 연구방법론상의 특징을 가지고 있다. 
본 연구는 연구방법론상 다음과 같은 특징을 가지고 있다. 즉 본 연구는 연구를 진행하는 과정에서 미래부와 함께 정성(질적) 평가에 대한 연구현장(대학교수, 출연연 연구자들, 산업계 연구자들, 국가연구개발사업 전문관리기관들 등)의 의견과 목소리를 듣고, 현재 평가개선방안을 강구 중인 한국과학기술기획평가원(KISTEP) 연구자들과 협력연구를 진행하였다는 점이다. 좀 더 구체적으로 설명한다면, 본 연구과제 관련하여 지난 2016년 5월 미래부의 제안과 중재 하에 기관차원(STEPI와 KISTEP)에서 상호 연구협력을 하기로 하였고, 그 이후 본 연구과제의 연구팀은 KISTEP의 담당 연구자들과 꾸준히 접촉하면서 그들과 수차례 전문가 회의 및 세미나 실시 등을 통해서 돌아가는 상황을 파악하였다. 아울러 기존의 관련 연구자료들은 물론 KISTEP의 담당연구자들이 만들고 있는 자료문건들을 협조 받아서 이를 본 연구내용에 충실히 반영하고자 노력하였다.