부처 내의 정책 조정은 한 등급 상급자나 조직이 조율권을 가지며, 부처 간의 정책 조정은 국무 총리실이나 대통령실이 한다. 국무총리실이나 대통령실이 해결 못할 경우 국무총리나 대통령 주재 위원회에서 해결을 시도한다.
보통 부처 내에서 발생하는 정책 조정은 한 등급 상급자 또는 조직이  조율권을 갖고 정책 조율을 시도하며, 부처 간 요구되는 조정의 역할은 그 보다 상위 계층인 국무 총리실이나  대통령실이 개입하여 하향식으로 조정한다(함영진 외, 2012). 물론 국무총리실 또는 대통령실 단독으로 해결하기 어려운 경우에는 국무총리 또는 대통령 주재 위원회에서 문제의 해결을 시도한다. 이명박 정부의 경우 부 처간 정책 조정 기능을 수행하기 위해 ‘국가정책조정회의’를 설치하여 국무총리를 의장으로 하고 기획재정부 장관, 행정 안정부 장관 및 협의․조정 대상 안건 관련 중앙 행정 기관장 등을 구성원으로 하여 중앙 행정기관 사이의 정부 정책에 대한 이견과 주요 국정 현안을 협의․조정하는 회의를 2008년 설치 이후 약 200여 회 진행하였다.