공동자원화시설로 만든 퇴/액비로 축산농가는 가축분뇨 문제를 해결하고 경종농가는 비용 절감 했지만 인근지역 민원과 가축분뇨의 저품질로 어려움이있다.
공동자원화시설을 통해 당진에서 발생하는 축산분뇨의 10% 정도를 처리하고, 생산된 퇴・액비를 경종농가가 이용함에 따라 축산농가는 가축분뇨 처리문제를 해결하고 경종농가는 고품질의 비료를 구입하여 비용을 최소화할 수 있게 되었다. 또한, 생산된 조사료와 퇴・액비는 지역 외부에서도 사용이 조금씩 증가하고 있는 상황이다. 그러나 사업추진 초기에 분뇨자원화센터의 분뇨처리기술 부족으로 악취문제가 발생하여 당진 지역과 인근지역에서 집단 민원이 끊이지 않아 어려움을 겪었다. 또한, 가축분뇨는 비료 기능 이외에 토지개량 등 친환경농업에 기여할 수 있으나, 비료성분이 적고 품질이 균일하지 못하여 많은 비용과 노동력을 필요로 하므로 화학비료와의 경쟁에서 불리한 상황에 있는 것도 사실이다.