항만지역 관련 개발에서 지방자치단체에 의한 난개발에 대한 우려가 있다. 수익성만으로 사업을 추진하면 공익적 의미가 약해질 수 있다. 사업내용 유지 및 사업의 주체간 협력이 필수다.
둘째, 항만지역 관련 개발을 도시개발법을 적용하여 추진할 경우 지방자치단체가 사업을 주도적으로 시행할 것인데, 이때 각 지방자치단체의 이해관계에 따른 난개발의 문제가 발생할 우려도 있다. 즉, 친환경적 친수공간 개발 및 임항 지역 개발이라는 기본 틀에서 벗어나 지방자치단체가 수익성 위주로만 사업을 추진하는 경우 애초 달성하고자 하는 공익적 부분이 소홀해질 수 있다. 우리나라의 항만은 기본적으로 수출입 물동량을 지원하는 물류기능을 담당하는 국가기간산업으로서 공익적 부분의 비중이 높기 때문에, 도시개발법 위주로 사업이 추진될 경우에도 반드시 항만법 또는 항만재개발계획과 도시개발법 또는 도시기본계획이 부합할 수 있도록 사업내용의 균형 유지 및 사업 주체간 협력이 필수적이라고 할 수 있다.