중간평가의 경우 평가관대화가  나타난다.  정량화된 평가체계를 갖고있어 부합성 여부를 확인 점검하여 점수및 등급을 부여하므로 평가대상 부처는 평가관대화를 통해 점수감점을 미리 고려해 점수를 부여하려 한다.
사업평가시 프로세스별 관점에서의 특징과 시사점은 살펴보면 중간평가의 경우 평가 관대화 문제가 여전히 나타나고 있다. 중간평가는 정량화된 평가체계를 갖고 있어 7~9개 평가항목에 대한 부합성 여부를 확인·점검하여 평가점수 및 등급을 부여하는 체제이므로 평가대상 부처는 평가 관대화를 통해 점수 감점을 사전에 고려하여 점수를 부여하는 경향이 상존한다(이태근 외, 2014). 또한 평가지표 항목 중 변별력이 부족한 지표가 여전히 존재한다. 사업 내용의 목표와 적합성, 양적 달성도가 상대적으로 높은 수준인 반면, 성과목표·지표 관리체계, 성과확산·활용 체계 및 종합적 성과분석 점수가 낮은 수준이다. 질적 평가 수행에 필요한 인적·물적 인프라가 여전히 부족한 편이다. 논문, 특허 등 사업성과의 질적 우수성 판단을 위해서는 성과 증빙을 위한 객관적 데이터의 안정적 확보가 필요하다(한국과학기술기획평가원, 2015).