새로운 GDP의 도입에 따라 기존 연구개발비 목표가 달라지는 문제를 고려했는데, 한국은행은 GDP를 산정할 때 개정 SNA를 사용했다. 그 결과 GDP와 국민 일인당 소득이 증대한 것으로 알려졌는데 개정된 SNA를 채택해 GDP규모가 확대되는 효과를 누릴 수 있었다. 국민소득 산정 방법은 변경이 정부와 민간의 연구개발투자 증가에 직접적 영향을 미친다고 할 수는 없지만 간접적 요인으로 적용될수는 있다.
여기서 특히, 새로운 GDP 개념의 도입에 따라 기존의 GDP 개념에 따라 설정된GDP 대비 연구개발비 목표와 추세가 새로운 GDP 개념에 따라 달라지는 문제도 고려하였다. 한국은행은 그 동안 1993 SNA에 의해 국민계정 통계를 편제하여 왔으나 최근 GDP 산정에 있어서 2008년에 개정된 SNA (2008 SNA)를 적용하도록 하였다. 새로운 국민소득 통계 방식에서는 연구개발투자와 전투기 군함 등 무기에 대한 지출 등을 총고정자본형성으로 처리하도록 하였다. 이러한 기준 변경으로 말미암아GDP 규모와 일인당 소득 등의 수준이 커지고 성장률도 커진 것으로 발표하였다. 새로운 SNA에서는 종전에 중간투입비용으로 처리하던 연구개발투자액을 비용으로 처리하지 않고 고정자본형성(투자, 즉 자산의 증가)으로 처리하여 연구개발투자액 만큼 투입비용이 줄어들고 그 만큼 부가가치가 늘어나는 효과를 가져왔다. 이것이 새로운 SNA 채택에 따른 GDP 규모 확대의 직접적인 요인이다. 이러한 국민소득 산정 방식의 변경이 직접적으로 정부부문과 민간부문의 연구개발투자 증가에 영향을 미친다고는 볼 수 없으나, 기업의 연구개발비 회계처리 방식의 변경, 정부의 연구 개발투자에 대한 인식 변경이 있을 경우 향후 간접적으로 연구개발투자를 증가 시키는 요인으로도 작용할 수도 있다. GDP 산정 방식의 변경이 연구개발투자를 증가시키는 효과가 중립적이라고 하더라도 GDP 규모를 분모로 하여 이에 대한 일정 비율을 목표로 연구개발투자 증대 목표를 설정한 경우 종전의 GDP 산정방식에 비해 연구개발비가 커지게 되는 현상이 발생할 것이다.