해양수산분야의 자연재난은 해양수산부 주관인 적조와 조수이며 표준 매뉴얼이 마련돼 있다. 사회재난중 대 규모 환경오염과 해양선박사고의 경우 해양수산부가 주관기관이 된다.
해양수산분야의 자연재난으로는 적조, 조수, 풍수해, 지진, 대형화산 폭발 등이 있으며, 이중 해양수산부가 주관으로 담당하는 자연재난은 적조와 조수이다. 이 들은 해양수산부의 표준 매뉴얼이 마련되어 있다. 사회재난으로는 해양의 대규모 환경오염, 해양선박사고, 인접국가의 방사능 누출, 감염병 등이 있으며, 이 중 대 규모 환경오염과 해양선박사고의 경우 해양수산부가 주관기관이 된다. 인접국가 의 방사능 누출, 감염병 등의 사회재난은 주관기관이 타 부처이며 해양수산부는 유관기관으로서 역할을 수행하고, 해양수산부 내의 주관부서가 주를 이루어 타 부처와 협력한다.