우리나라에서 과학자의 자율성 부족 문제가 많이 지적되고 있으나, 공공 연구에서의 문제는 자율과 책임의 조화가 이뤄지고 있지 않는 것이다. 
연구자 주도의 기초 연구 지원 사업 확대를 과학자들이 집단적으로 요청하고 국정 감사에서 과학자들의 자율성과 창의성이 보장된 연구 환경 조성에 실패했다는 지적이 나오는 등 우리나라에서는 과학자의 자율과 책임의 균형에서 유독 과학자의 자율성 부족의 문제가 많이 지적되는 현실이다. 그러나 이 연구에서는 자율성은 그 자체로서 보다 책임과의 관계를 통해 살펴보아야 함을 강조하고자 한다. 다시 말해 우리나라의 과학기술, 특히 대학을 중심으로 한 공공 연구에서의 문제는 자율성의 부족이 아니라 자율과 책임의 조화가 제대로 이루어지지 않고 있다는 점이다.