정부 연구개발사업 상의 변화를 소화하기 위해서는 수요를 담을 그릇으로서 정부의 역할을 조정하는 적절한 형태의 사업구조가 필요하다. 
이처럼 정부 연구개발사업은 새로운 혁신 환경의 변화에 따라 연구영역 및 지원 분야 등에서 많은 변화가 나타난다. 그런데 이러한 변화적 내용을 담아서 적절히 소화하기 위해서는 요구되는 수요들을 적절히 담을 수 있는 적절한 그릇들이 필요한데 이러한 그릇과 같은 역할을 하는 것이 사업구조이다. 즉, 환경 변화, 수요 변화, 역량 재고, 인프라 조성 등 국가 혁신성과 창출을 위해 정부가 담당해야 할 역할과 내용들을 적절한 모습으로 적절하게 배열하여 효율적인 투자와 성과를 창출하도록 하는 것이 사업구조이다. 그리고 적절한 사업구조의 형태가 지식의 창출과 활용 가치를 높이는 데도 중요하다.