의료기술평가 기금 지원을 받는 첫 번째 경로는 연간 세 번의 의료기술평가 신청을 받아 이해관계자가 주제를 선정, 자문기구에서 결정하는 방식이며, 두 번째는 연구주제에 대해 평가하는 것이고, 세 번째는 NIHR 연구 프로그램에 참여하는 연구자로부터 제안을 받아 수행하는 경우이다. 
의료기술평가는 NHS 의사결정자가 임상에서 즉각적으로 활용할 수 있는 유용한 연구이며, 효능을 입증할 수 있는 근거가 있으나 실제 NHS 환경에서 기존의 기술과 비교하여 임상적, 비용 효과성이 불확실할 때 수행된다. 주제 선정은 NICE, 환자조직, 보건 자선단체와 같이 다양한 조직이 참여하여 이루어지는데, 의료기술평가는 다음의 세 가지 경로를 통해 제안되고 기금을 지원받게 된다. 첫 번째 경로는 연간 세 번의 의료기술평가 신청을 받아 환자, 전문가 등 여러 이해관계자가 중요한 주제를 선정하고 자문기구에서 결정하는 방식이다. 두 번째로는 연구자들이 제안하는 연구주제에 대하여 평가하는 경우이며, 마지막으로는 주요 우선순위의 보건학적 문제에 대해 근거를 향상시키기 위해 NIHR(National Institute for Health Research) 연구 프로그램에 참여하는 연구자로부터 제안을 받아 수행하는 경우이다. 이와 같이 선정되는 경우는 매년 횟수가 다르며, 비만, 아동용 의약품, 진단 검사, 치매, 1차 의료와 같은 주제를 다루었었다 (National Institute for Health Research 2013a).