의료시설 설계가이드라인 부재로 외국기준이나 기존 설계지침을 참고하는 경우가 있으나, 국내환경과 해당 기관 특수성과 달라 한계가 있기에 의료기관 시설성능향상에 큰 어려움이있으며 시설간 수준편차가 심화되고있다.
의료시설에 대한 적정한 설계가이드라인이 없기 때문에 의료시설의 계획과 설계 작업뿐만 아니라 의료시설에 대한 연구에서도 전술한 외국기준을 참고하거나 건축주로부터 참조하도록 요구받는 경우가 왕왕 발생하고 있다. 그러나 국내의 의료환경이 국외와는 다르기 때문에, 국외 기준을 그대로 도입하기에는 한계가 있다. 물론 기존에 수행된 국·공립의료기관 및 민간병원의 시설현대화 사업에서 제시한 설계지침을 타 병원에서 활용하는 방안도 가능하다. 그러나 이러한 지침은 개별 연구기관, 설계사, 또는 각 의료기관 등의 경험을 기초로 해당 의료기관의 특수한 상황에 따라 작용되었기 때문에 범용적인 설계지침으로 활용하는 데에는 역시 한계가 있다. 이에 따라 국내 의료기관의 전반적인 시설성능을 향상하는데 많은 어려움이 발생하고 있으며 동시에 의료시설 간 시설 수준의 편차가 심화되고 있는 실정이다.