폐기물 부담금 제도는 유독물을 함유하고, 폐기물 관리상 문제를 일으킬 가능성에 대해 제조업자에 폐기물 처리 소요 비용을 부과하는 제도로 EPR과 함께 환경비용의 합리적 배분을 꾀한다. 이 제도는 생산 억제 및 재활용을 유도함에 있어 EPR과 구분된다.
폐기물부담금제도는 폐기물의 발생을 억제하고 자원의 낭비를 막기 위하여 유독물을 함유하고 있거나, 재활용이 어렵고 폐기물관리상의 문제를 초래할 가능성이 있는 제품･재료･용기 등의 제조업자나 수입업자에게 그 폐기물의 처리에 소요되는 비용을 부과하고 있다(재촉법 제12조). 이는 생산자책임재활용제도(Extended Producer Responsibility, EPR)와 더불어 오염자부담의 원칙에 근거한 것으로 환경 부하가 높은 제품에 대하여 제품의 가격에 환경비용을 내재화시켜 환경비용의 합리적 배분을 도모한다. 다만, EPR이 재활용가능성이 있는 제품의 생산자에게 재활용의무를 주고 이를 이행하지 않을 경우 경제적 제재를 부과하는 데 비하여, 폐기물부담금제도는 유독물을 함유하고 있거나, 재활용이 어렵고 폐기물관리상의 문제를 초래할 가능성이 있는 제품에 경제적 부담을 주어 생산 억제 및 재활용을 유도하는 점에서 다르다고 볼 수 있다.