조공장·주용준은 운영상의 문제점을 도출했다. 공청회를 주재하는 전문가를 승인기관이 정하는 경우가 많으며, 현장에서 결정하기 힘든 사항들을 주로 논의하여 의미 있는 결과를 전달하기 힘들고, 주민참여를 생략하기도 한다는 것이다.
조공장·주용준(2015)은 환경영향평가 협의과정에서 이미 실시된 주민 설명회와 공청회 자료를 분석하여 운영상 문제점을 도출하였다. 공청회 주재 전문가는 승인기관에서 정하는 경우가 대부분인데, 많은 경우 승인기관이 계획이나 사업을 진행하고 있어 중립적으로 공청회를 주재하는지에 대한 의문이 제기되고 있다. 이와 더불어 사업자 측에서는, 설명회나 공청회를 개최하는 경우 주민들의 질문이 보상이나 노선 변경 등 대행자가 현장에서 결정하기 힘든 사항에 대해 논의되다 보니 주민에게 의미 있는 결과를 전달하기 힘든 실정이다. 마지막으로 주민참여를 생략하는 경우도 주민들이 설명회를 거부하는 것은 해당 사업에 대한 반대의사가 크다는 것을 방증하고 이러한 사업일수록 주민참여 기회를 다양하게 제공해야 하지만, 이것이 주민참여를 생략하는 이유가 되는 것은 적절치 않다고 지적하고 있다.