본 연구는 WTO 분쟁해결기구의 농산물 분쟁 현황과 전개과정을 실증분석하였다. 동식물검역과 수입면허 협정의 분쟁 관련 비중이 높았고, 동식물검역 협정은 패널절차를 거치는 경우가 많고, 농업협정은 보류상태가 많고, 수입면허 협정은 양자합의가 높았다. 현행 수입면허 협정은 양자합의가 쉬운 데에 반해, 농업협정은 양자합의나 패널절차가 애매한 상황이다. 
본 연구에서는 그동안 WTO 분쟁해결기구를 통해 양자협의가 요청된 농산물 관련 분쟁의 현황과 전개과정을 개괄적 통계분석과 계량경제학적 실증분석을 통해 검토하였다. 지난 20년 가까운 기간 동안 발생한 전체 WTO 분쟁 가운데 농산물 관련 분쟁은 30% 이상의 비중을 차지할 정도로 중요한 문제이다. 2004년 이후에는 분쟁의 수가 줄어들었지만 전체에서 차지하는 비중은 여전하며 매년 꾸준히 분쟁이 발생되기 때문에 지속적으로 관심을 기울일 필요가 있다. 따라서 우선 개괄적 통계분석을 통해, 농산물의 주요 수출국인 미국과 케언즈 그룹의 분쟁제소가 활발한 가운데 농업협정을 비롯해 동식물검역과 수입면허 협정의 농산물 분쟁 관련 비중이 높은 것을 확인하였다. 또한 농산물 관련 분쟁은 양자합의에 이르거나 보류상태로 남는 비중이 전체 분쟁에 비해 높은 것을 알 수 있었다. 농산물 분쟁의 그러한 특성에 대한 원인을 규명하고자 Logit 회귀모형을 이용한 실증분석을 통해 본 논문에서 확인한 주요 사실들은 다음과 같다. 우선 인접국가의 분쟁은 보류상태에 남는 경우가 많고 농산물 분야의 경쟁력 차이는 분쟁당사국 사이의 양자합의에 긍정적인 영향을 미치며 패널절차를 거치지 않도록 유도하는 것으로 보인다. 농산물 분쟁과 밀접한 관련이 있는 협정 가운데 동식물검역 협정은 패널절차를 거치는 경우가 많지만, 농업협정은 보류상태에 남는 경우가 많고, 수입면허협정은 양자합의 가능성이 높다. 앞서도 설명했지만 동식물검역 조치에 대한 과학적 근거가 요구되지만 협정상 그 정의가 분명하지 않기 때문에 패널절차를 거치는 경우가 많은 것으로 볼 수 있다. 같은 맥락으로 보자면 현행 수입면허 협정은 비교적 명확한 내용을 지니고 있어 그만큼 양자합의가 쉬운 것으로 해석할 수 있다. 반면에 농업협정은 불분명한 내용이 많아 양자합의나 패널절차 진행 모두가 애매한 상황이라 말할 수 있겠다.