생물다양성관리전략은 각 부처별로 계획을 수립하여 관리평가체제를 유지하고 있다. 환경부는 계획을 종합하여 전략을 완성하는 일을 하며, 범부처 실무위원회를 구성, 운여할 수 있는 권한을 가진다.
생명연구 자원 관리 제도와 같이 생물 다양성 관리 전략도 각 중앙 부처가 관할하는 사무에 따라 생물 다양성 관리 계획을 수립하도록 하여 각 부처의 관련 계획 관리 평가 권한을 유지하도록 하고 있다. 다만 환경부는 개별 부처에서 마련한 계획을 종합하여 국가 생물 다양성 전략을 완성하는 일을 담당한다. 일차적으로 완성된 국가전략은 국무회의에서 심의 확정되며 환경부가 확정안을 공고하면 개별 부처에서 관련 시행 작업을 추진하도록 되어 있다. 또한 환경부 주관으로 범부처 실무위원회를 구성, 운영할 수 있는데 실무위원회는 중앙 행정기관의 장이 임명한 4급 이상 공무원 20명 이내로 구성하도록 규정되어 있다(생물 다양성 법 시행령 제3조).