JCM 방식은 저렴한 감축실적 획득이 가능하나 현재는 사업성이 없고 일반 납세자에 비용 부담을 전가한다는 우려가 있다. 이에 해외 감축 프로젝트 진행시 수익발생이나 비용 절감 가능성을 전제로 하되 민간의 주도로 추진되는 것이 필요하다.
일본 JCM 방식의 경우 해외 프로젝트로 인해 현재 유통되는 크레딧보다 저렴한 감축실적 획득이 가능하다는 장점이 있다. 한편, 단점으로는 현재로서 사업성이 없다는 것이며, 이미 CER 등 가격이 크게 떨어진 상태에서 이정도로 저렴한 감축실적은 획득이 불가능하다. 또한 비용부담 문제에 있어 온실가스의 “원인자부담“ 원칙에 따라 배출한 측에서 부담하는 것이 아니라, 일반 납세자들에 비용전가한다는 점은 우려할 만 하다. 또한 일본 사례처럼 민간 주도 사업이 아닌 정부 주도 사업인 경우 비효율 발생 가능성이 존재한다. 해외 감축 프로젝트의 경우 비용 투입에 비해 온실가스 감축실적이 상대적으로 매우 적은 것이 현실이다. 예를 들어, 과거 정부주도의 탄소배출권 사업으로 인해 수출입은행 등 국책은행이 CDM 사업을 추진했다가 막대한 손실만을 남긴 사례는 우려할 만 하다. 결과적으로 해외 감축 프로젝트 경우 수익발생 또는 비용절감 가능성을 전제로 민간이 주도하는 사업으로 추진되는 것이 필요하다.