2006년도 나노 안전 정책을 제안하고 논의를 이끌어 온 환경부는 2014년 현재 나노 안전 정책과 관련 미래부, 식약처와 더불어 국제협력 연구 참여에만 관여 하고 있는 것으로 나타났지만, 이후「유해물질화학물질 관리법」과 「화학물질 등록 및 평가 등에 관한 법률」 개정을 통해 나노물질 안전 규제를 담당하고자 한다. 
2006년도 나노 안전 정책을 제안하고 논의를 이끌어 온 환경부는 2014년 현재 나노 안전 정책과 연관하여 미래부, 식약처와 더불어 국제 협력 연구 참여에만 관여 하고 있는 것으로 나타났다. "2015년도 나노기술발전시행계획"에 따르면, 환경부는 산업부, 미래부와 더불어 NANoREG에 공동으로 참여하고 OECD 제조나노물질시 험법 국제 검증 연구에 참여한다는 계획을 갖고 있다(국과위, 2015, 별지 p.24). 환 경부 사업 중에 나노 환경, 건강(EHS) 관련 사업으로 ‘환경융합신기술개발사업’이 분류되어 있다. 한편, 환경부는 「유해물질화학물질 관리법」과 「화학물질 등록 및 평가 등에 관한 법률」 개정을 통해 나노물질 안전 규제를 담당하고자 한다. 식품의약품 관련 나노물질 및 나노제품은 환경부의 관리 대상에 해당하지 않지만 관 련 물질에 의한 비자발적 노출에 의한 영향은 환경부 관리 사항이며 화학물질 뿐 아니 제품의 폐기, 재활용 및 재사용과 의약품의 폐기 업무도 환경부가 담당하고 있다. 안전 관리 종합계획에서는 나노물질, 나노제품의 전주기 안전 관리를 목표로 내세우며 제품의 폐기, 재활용 과정에서의 안전 관리의 필요성을 제기하고 있다.