GMO표시제엔 두가지 접근법이 있다. 증거기반과 과정기반이다. EU는 증거기반에서 과정기반 표시제로 바꿔 엄격하게 실시하고 있다.
GMO표시제 또한 두 가지 접근법이 있다. 증거기반 표시제는 최종생산물에 유전자변형 유전자가 있는지의 여부에 따라 표시제를 실시하는 것이고, 과정기반 표시제는 최종생산물에 유전자변형 유전자가 잔존하지 않더라도 과정 중에 포함되었다면 표시하는 것이다(권수민, 2011). EU는 2000년대 초반 증거기반 표시제에서 과정기반 표시제로 전환하고 EU지역에 국한해서 GMOs의 생산 유통 전과정을 관리하는 엄격한 표시제를 실시하고 있다. 하지만 수출품목에 대해서는 최종생산물에 유전자변형 유전자가 발견되지 않는 경우 표시제를 강제하지 않는다.