학문 분야별로 논문 게재 난이도와 피인용도 격차가 크고, 공학 분야 내에서도 세분류 상 사업화 가능성 등에 큰 차이가 있어 획일적 기준을 통한 평가는 부적합하다.
분야에 따라서도 평가방법이 달라야 한다. 학문 분야별로 저널의 논문 게재 난이도와 피인용도의 편차가 크므로 논문 수, 피인용도, 상위 10% 저널 논문 수 등의 지표는 평가자가 참고 목적으로만 활용해야 한다. 공학 분야 출연(연)의 경우 대분류 상으로는 유사한 분야일 경우에도 세분류 상으로는 기술의 사업화 가능성 등에서 큰 차이를 보일 수 있으므로 동일하게 기술료 지표로 평가하는 것은 부적절하다. 현재도 연구, 기술 등 트랙별로 평가 체계를 차별화하는 시도를 하고 있으나 연구자들의 니즈에 비해서는 불충분한 상황이다(날리지웍스, 2011:9-10).