정부 R&D 투자에 의한 직접적 및 간접적 효과를 염두에 두고 민간 R&D 투자를 촉진하기 위해 어떠한 방법을 세울 것인가 선택할 필요가 있다. 
정부 R&D 투자는 후광효과(Halo effect)를 발생시킬 수 있다(David, et al., 2000). 즉, 특정 기업이 정부 R&D 사업에 선정되는 경우 시장에서의 해당 기업 인지도와 신뢰도 등이 제고될 수 있는 부가적 효과를 가질 수 있다. 이 경우 경쟁기업에서는 관련 영역에 대한 R&D 투자를 신설하거나 증가시킬 유인이 감소하게 된다. 또한 정부 R&D 투자는 특정 분야 전문 인력 양성과 훈련을 위해 이루어질 수 있다. 따라서 정부 R&D 투자에 대한 합리적 의사결정, 즉, 민간 R&D 투자를 촉진하기 위해 어떠한 방법이 최선인가에 대한 결정은 정부 R&D 투자에 따른 직간접 효과를 모두 고려하여 이루어져야 한다.