자연환경요소를 3가지로 나눈 뒤 '보전에 노력', '상당한 정도로 보전', '영향을 가능한 최소화'의 목표를 설정하는 방식으로 자연환경 보전 목표를 세우고 있다.
또한 현재 자연환경을 보전하는 목표는 해당 자연환경요소를 ‘일본 전국, 도･도･부･현, 시･정･촌’으로 가치를 3단계로 나눈 후, 각각 ‘보전에 노력, 상당한 정도로 보전, 영향을 가능한 한 최소화’라는 목표가 정해진다. 그러나 시･정･촌의 가치가 당연히 낮다는 생각과 주민들이 느끼는 감각의 차이는 크다. 많이 이용되는 ‘식생 자연도’(10~1)의 평가 지표도 이와 마찬가지라고 말할 수 있다. 보전 목표에 따라 평가하는 목표는 지금까지 쌓아온 경험에 의해 개별적으로 생각해 왔지만 이제는 새롭게 종합적인 검토가 필요한 단계에 이르렀다고 할 수 있다.