통합 6년제는 체계적인 약학 교육과 우수학생 유치 등의 장점과 교육비 증가 및 사회변화 대응이 미흡하다는 단점을, 2, 4년제는 진로 선택 개방적 기회 보장 등의 장점과 사회적 비용 발생 등의 단점을 가진다.
제1안 통합 6년제와 제2안 2+4년제의 주요 특징은 이미 앞서 학제별 특징에서 논의되었으나 정리해서 나타내면 다음 <표 Ⅶ-1>과 같다. 통합 6년제로 운영되는 유사 학과는 건축학과로 고교 졸업생이 공대에 진학하여 6년의 교육과정을 거치는 형식이다. 약학대학의 통합 6년제는 체계적인 약학교육과 우수학생 유치, 인접학분 부작용 완화 등의 장점이 있으나 교육비 증가 및 사회변화에 탄력적 대응이 미흡할 수 있다는 단점도 고려해야 한다. 2+4년제를 유지할경우 타 전공 2년 수료생이 약학대학에 진학하여 4년의 교육과정을 거치게 되며 진로 선택의 개방적 기회 보장, 기존 체제 유지로 인한 혼란 방지의 장점이 있으나 PEET 시험으로 인한 사회적 비용 발생 및 입직 고령화라는 단점을 특징으로 한다.