배아줄기 세포와 역분화 세포는 모든 조직으로 분화가 가능하고, 성체줄기 세포는 특정한 조직으로만 분화가 가능하다.
줄기세포는 뼈·신경·혈관·근육·장기들을 만드는 세포로 주로 배아줄기, 성체줄기, 역분화(유도 만능) 줄기세포로 분류된다. 배아줄기세포는 수정란에서 추출되는 세포로 세포 분열이 완성하여 모든 조직으로 분화가 가능하고, 성체줄기 세포는 골수·지방·제 대열 같은 성인 몸에서 추출되는 세포로 특정한 조직으로만 분화가 가능하다. 마지막 으로 역분화 세포는 2006년 일본 교토대 야마나카 신야 교수가 개발한 인공줄기세포 로 성인의 피부 세포에 분화를 유도하는 유전자가 주입되어 줄기세포로 탈바꿈되면서 배아줄기세포와 동일하게 모든 조직으로 분화가 가능하다.