정부 R&D 전략의 목적은 민간 투자를 늘리는 것이다. 이를 위해 기회 확대, 비용 절감, 비전 및 전략 수립, 정부와 민간의 투자 영역 조정 등이 필요하며 효과적 운용을 위한 통제처도 요구된다.
정부 R&D 전략의 기본적인 목적은 민간의 혁신 활동 즉 민간 R&D 투자를 촉진하는 것이다. 이를 위해서는 혁신 기회를 확대하거나 혁신 비용을 절감할 수 있는 제도적 지원이 필요하다. 혁신 기회의 확대를 위해 국가 비전을 정립하고 분야별 R&D 전략을 수립하는 것이 필요하며, 이를 통해 정부와 민간의 R&D 투자가 불일치된(mismatched) 영역을 발굴하여 R&D 투자 및 제도적 지원 방안을 조정하여 시행해야 한다. 영역별 R&D 투자 및 지원 정책을 효과적으로 수립하고 집행하기 위해서는 국가적 분야별 컨트롤 타워 기능 즉, 이른바 국가 차원의 영역별 CTOs(Chief Technology Officers) 기능을 확보하는 것이 필요하다.