스타트업 응원형은 지역경제에 크게 공헌하는 중소기업에 대해 실시하는 지역밀착형 사업으로 도도부현을 통한 펀드운용 이익으로 창업 또는 경영 혁신을 지원한다.
우선, 스타트업 응원형은 지역밀착형 사업으로, 지역사회에 대한 공헌도가 높은 새로운 사업에 대한 대처, 지역 투자원을 활용한 초기대응 등 지역경제 활성화에 이바지하는 중소기업에 대해 실시한다. 펀드를 조성하는 도도부현에 대해 중소기업 기반 정비기구가 필요한 자금의 일부를 무이자 대부, 도도부현을 통해 펀드관리자에게 무이자 대출을 실시한다. 펀드운용 이익을 재원으로 창업 또는 경영 혁신을 시도하는 중소기업을 대상으로 지원을 실시한다. 펀드는 각 도도부현의 창의력에 의해 조성되기 때문에 조성분야, 대상, 규정 등은 각 도도부현에 따라 다르다.