이흥권은 정부 R&D 예산편성의 전략성과 효율을 높이기 위해 연구개발투자 전략을 제시했고 이는 크게 정부 R&D 기초연구의 투자 효울성 제고, 관리 시스템 개선, 투자전략 , 투자 효율화, 주요국의 R&D 예산편성 정책 등으로 이루어져 있다. 특히 정부 연구개발투의 방향성에서는 공공적,사회적 요구에 대응할 수 있도록 연구개발 지원의 구조적 우선순위를 개편해야 함을 강조하고 있다.
이흥권(2012)은 정부 R&D 예산편성에 있어서 전략성과 효율성을 제고하기 위하여 주요 이슈 분석을 통해 정부의 연구개발투자 전략을 제시하고 있다. 연구 구성은 크게 정부 R&D 기초연구 투자 효율성 제고, 정부 R&D 예산의 관리시스템 개선, 정부 R&D 투자전략, 정부 R&D 투자 효율화, 주요국의 R&D 예산편성 정책 다섯 부분으로 구성되어 있다. 정부 R&D 기초연구 투자 효율성 제고와 관련하여서는 성과확산 제고, 과학벨트 사업과 기초연구지원사업의 연계강화, 기초연구 내실화를 위한 정부 재정투자 방향, 정부 R&D 예산의 관리시스템 개선과 관련하여서는 국가혁신시스템과 R&D 투자, 지방 R&D 투자, 성과지향적 사업관리, 정부 R&D 투자전략과 관련하여서는 대형연구개발사업 재원관리, 서비스 R&D 분야 투자전략, 경직성 R&D 사업이 R&D 분야 중장기 재정운영에 미치는 영향, 출연연 연구성과 제고 재정지원전략, 정부 R&D 총량규모 설정 등이 세부 주제로 제시되고 있다. 정부 R&D 투자 효율화와 관련하여서는 정부 R&D 투자 효율성의 정의 및 측정, 제고방안 및 R&D 투자에 있어서 정부의 역할론 등이 다루어지고 있다. 특히 정부 연구개발투자의 방향성과 관련하여 민간기업의 혁신 역량이 크게 강화된 상황에서 산업혁신 역량 지원을 위한 정부의 역할을 전반적으로 재조명하고 산업의 경쟁력 강화에 치중해 온 연구개발투자 우선순위를 탈피하여 공공적, 사회적 요구에 대응한 연구개발투자 우선순위를 강화할 필요가 있으며, 중소･중견기업의 혁신 역량 강화를 위한 연구개발투자의 구조적 우선순위를 크게 강화해야 한다는 것 등을 강조하고 있다.