의료정보 데이터 중 진료기록정보는 사람이 입력하기 때문에 오류나 조작 가능성이 있으며 실제로 건강보험공단 등에 의해 부적정 지출이 적발되고 있다. 
의료정보 데이터는 진료기록정보, 영상정보, 생체신호정보 등으로 구분 가능한데 영상정보와 생체신호정보는 의료기기에서 바로 수집되는 정보이기 때문에 정확성, 신뢰성, 신속성, 일관성 등에는 문제가 없지만 진료기록정보의 경우에는 의료진이 전자기록 시스템에 직접 입력하기 때문에 기록의 오류 또는 보험수가를 위해 부당청구 등의 조작 가능성이 일부 있다. 건강보험공단에서 적발한 부적정 지출 규모를 보면 요양기관의 청구오류 금액이 연평균 148억 원에 이르며 건강보험공단, 복지부, 심평원에서 조사하여 적발된 부적정 지출은 연평균 7,341억 원으로 급여비의 2.15%에 해당한다. 영국과 미국의 경우도 부적정 지출의 추계 결과 3~10% 사이의 규모를 보이고 있다(신영석 외, 2015).