지역낙후도 지수는 인구증가율, 제조업종사자 등 8개의 지표를 제시하여 산정한다. 산정시 야기되는 문제점을 해소하기 위해 단위 정상법등을 통해 표준화시키고 있다. 산출된 결과를 종합해 전국 순위를 제시하고 있다.
표준지침에서는 지역 낙후도 지수를 산정하기 위해 국토해양부와 국토연구원에서 수행한 개발촉진지구 선정지표 개선에 관한 연구 결과를 반영하여 인구증가율, 제조업종사자, 도로율, 재정자립도, 승용차 등록대수, 인구당 의사수, 노령화 지수 및 도시적 토지이용 비율 등 8개의 지표를 제시하고 있다. 또한 지표간 측정단위, 분포가 상이함에 따른 비교의 어려움을 해소하기 위하여 단위 정상법(unit normal scaling)을 사용하여 표준화시켰다. 표준화된 8개 지표에 지표 간 상대적 중요도를 반영하기 위하여 분석적 계층화법(AHP; Analytic Hierarchy Process)을 이용하여 산정한 가중치를 곱하여 산출된 결과를 종합해 지방자치단체별로 지역 낙후도 지수를 산정한 후 지수가 높은 순서로 전국 순위를 제시하고 있다.