하천의 수질은 인위적인 것에 큰 영향을 받는다. 하천의 유기물 오염 지표 BOD는 도시 및 산업 지역의 영향에 비례하여 나타난다.
시화호로 유입하는 하천의 수질은 자연적인 유역의 특성과 함께 인위적인 영향 정도에 따라 큰 변화를 나타낸다. 6개 주요 하천에 대한 대표적인 유기물 오염지표인 BOD의 연도별(1997년〜2010년) 변화에 의하면, 시화호 조성 초기인 1997년에 신길천 28.5mg/L, 화정천 69.9mg/L, 안산천 29.1mg/L, 반월천 20.4mg/L, 동화천 12.7mg/L, 삼화천 6.5mg/ L였다. 삼화천을 제외하면 각 하천의 BOD는 다른 연도보다 높았다. 도시 및 산업지역의 영향을 많이 받는 하천에서 높은 농도로 나타났으며, 농경지 영향을 많이 받는 하천은 농도가 낮았다. 2009년의 경우 신길천 5.8mg/L, 화정천 3.7mg/L, 안산천 3.5mg/L, 반월천 8.3mg/L, 동화천 6.5mg/L, 삼화천 5.1mg/L로 나타났다. 화정천과 안산천은 1997년에 비해 각각 1/19, 1/8에 불과했다. 전체적으로 시간 경과에 따라 BOD가 감소하는 추세였으며, 특히 신길천, 화정천, 안산천에서는 그 변화가 뚜렷했다. 초기에 비교적 낮은 농도를 나타낸 삼화천은 감소폭이 크지 않았다(표 4-2).