90년대 이후 과학기술정책의 중심은 경제의 도약에 필요한 연구 시스템의 구축과 원천 기반 기술의 개발로 옮겼다. 이에 과학기술인력으로 초점이 맞추어졌다. 그리고 시장 실패 보안의 논리에 의해 정부는 우리가 취약한 점인 생명공학 연구를 대학에 대폭 지원했다. 이에 BT분야 연구비가 대학 연구의 40% 이상을 차지하게 되었다.
과거 정책 패러다임 한계의 예로 과기인재정책과 연구개발정책간 부조화 문제를 들 수 있다. 90년대 이후 과학기술정책의 중심은 우리 경제의 도약을 위해 필요한 연구개발 시스템의 구축과 원천․기반 기술의 개발로 옮겨 갔다. 이에 따라 과학기술인력의 수요 역시 우수 과학기술인력으로 초점이 맞추어졌다. 신성장동력, 녹색성장 등 주요 국책연구개발정책에서는 하위 인프라로 연구개발인력의 양성 정책이 빠짐없이 자리잡았고 연구개발 지원은 고급인력의 양성에 필수적인 요소로 간주되었다. 그러나 시장 수요와 무관한 R&D 정책은 오히려 고급 과학기술인재정책과 상충할 수도 있음을 보여주는 사례들이 늘고 있다. 시장 실패 보완의 논리에 의해 정부는 우리 산업체가 취약한 생명공학 연구를 대학을 통해 대폭 지원하였다. 이에 따라 BT 분야 연구비가 대학 연구의 40% 이상을 차지하게 되고 BT 분야 석박사 대학원생도 비례하여 증가하였으나 이들이 막상 졸업 후에는 마땅히 취업할 산업계 수요가 부족하여 고급인력의 미활용 문제를 낳고 있다. 이는 과거 산업계를 포함한 사회 전 분야가 빠르게 성장하던 고도 성장기에는 전혀 예상치 않았고 우려할 필요도 없었던 문제이다. 이제는 연구개발 지원의 결과로 양성된 과학기술인력에 대해 R&D 정책과 과기인재정책간 적절한 연계와 통합적 시각이 필요한 시점이나 과기인재정책이 주요 연구개발정책의 하위 인프라로 간주되는 과거의 패러다임에서는 이러한 한계에 대응이 어렵다.