정부는 ‘신행정수도의건설을위한특별조치법 위헌결정에 따른 후속대책위원회’를 통해 효과적으로 국가 균형 발전을 이루기 위해 점진적인 대안 마련에 힘썼다. 
국가 균형 발전은 우리나라가 선진국가로 진입하는 데 있어서 반드시 이루어야 할 시대적 과제가 분명합니다. 그래서 정부는 2004년 11월 15일 대통령 훈령을 제정하여 ‘신행정수도의건설을위한특별조치법 위헌결정에 따른 후속대책위원회’를 설치했습니다. 헌법재판소가 위헌 결정을 내리면서 신행정수도와 연계한 균형발전사업의 차질 및 주민들의 손실 우려 등 부작용을 해결하기 위한 후속대책이었습니다. 그리고 본위원회 및 소위원회 심의를 통해 ‘후속대안 마련 기본원칙’과 ‘후속대안선정 기본원칙’을 마련해 발표했습니다. 특히 다음과 같이 3단계에 걸친 단계적 대안수립 절차를 따라 국민 여론을 바탕으로 효과적인 후속대안을 마련하기 위해 노력했습니다.