시화호 유역의제를 위해 지역 시민단체, 주민 등 소위원회를 만들고 여러번의 회의를 거쳐 초안 작성 후 작업이 이뤄졌다. 
시범활동 후 2008년 12월 9일 개최되었던 4차 회의에서는 2009년 시화호 유역의제 운영방안이 논의되었다. 이 자리에서 시화호 유역의제(안) 작성사업 및 시화호 환경실천 공동사업이 제안되었다. 이에 사무국은 2009년에 시화호 유역의제(안)을 작성하기 위한 사업을 본격적으로 착수하게 되었다. 지역의 다양한 시민그룹, 의제, 주민, 전문가 등을 포함한 소위원회를 구성했고, 2009년 6회의 정례회의와 4회의 실무회의를 거쳐 초안을 마련했다. 작성된 초안은 2010년 안산, 시흥, 화성 지역설명회와 외부 자문과 의견수렴 과정을 거쳤으며, 2011년 최종적으로 확정되었다. 이에 따라 세부실천사업과 우선사업 설계 작업이 이루어졌다(그림 5-20).