규모와 자원의 한계 극복을 위해 스타트업간 협력으로 기술교류, 시장 확보 등을 모색하고자 하나, 혁신군과 일반군 기업은 아직 협업비중이 각 약 8%와 약 9%로 낮다.
동종업계 경쟁사와의 협력이 약하고, VC나 엔젤투자자의 역할이 자금조달에만 머물러 있다는 점이 한계점으로 드러난다. 스타트업간 협력을 통한 기술교류, 시장 확보, 이용자 확보, 비용절감 등을 모색하는 것은 스타트업의 규모와 자원의 한계를 극복하기 위한 수단으로 활용된다. 혁신군 기업들은 동종업계 경쟁사와 마케팅, 판로개척 등(60.0%)을 수행하고, 공동연구나 기술이전(각 10%)을 진행하며, 일반군 기업들은 공동연구와 기술이전(23.1%), 생산/제조 협업(38.5%)을 주로 수행하는 것으로 나타났으나, 아직 그 협업비중이 각 7.6%와 8.7%로 낮다.