미국은 비교효과연구를 위해 다음과 같이 재정을 투자했다. 당뇨예방프로그램에 4억 달러, 비교효과연구 강화 사업에 4억 달러, AHRQ의 제고 사업에 3억 달러를 배분했다. 이 중 AHRQ의 연구사업은 이슈 모니터링과 다양한 지원, 레지스트리 구축 등을 포함한다.
비교효과연구를 위한 재정투자에 대한 미국의 사례를 살펴보면, ARRA에 의한 2009년도 투자분 11억 달러를 국립보건원(NIH)의 약물, 식이, 운동습관 변화에 따른 제2형당뇨병 예방의 비교효과를 평가하기 위한 다기관 임상시험과 같은 당뇨예방프로그램에 4억 달러, 미국 보건복지부에서 주관하는 연구용 보험청구데이터베이스 개발, 환자등록자료 구축, 데이터베이스 연계 등 비교효과연구 기반 강화 사업에 4억 달러, AHRQ의 의료서비스질, 안전성, 효율성, 효과성 제고를 위한 사업에 3억 달러 등을 배분하여 집행한 바 있다. 이 가운데 AHRQ의 연구사업은 특히 최신 비교효과연구 이슈 모니터링, 근거기반진료센터들에 대한 지원, 임상지침에 반영하기 위한 전략과 시험연구, 비교임상효과 관련 근거생성을 위한 보조금 지원, 특이질환자나 특정 서비스를 받는 환자 임상정보를 수집하기 위한 레지스트리 구축, 비교효과연구에 대한 국민적 관심을 제고하기 위한 사업 등을 포함하고 있다.