수소의 경제성에 관한 문제점이 해당 법안 검토에서도 주요 주제였다. 나아가 이와 관련한 체계를 갖춘 법안과 업무 조정, 정책과 산업육성법 또한 필요하다.
수소경제의 방향은 맞으나 수소의 경제성을 감안하여야 한다는 문제점이 본 법안의 검토에도 주요한 이슈가 된다. 수소산업이 신산업이지만, 미래에너지원으로서 투자가치가 불확실한 측면이 있다. 다음으로 일본은 법률로서가 아닌 수소기본계획과 같은 정부정책으로 수소산업을 추진하고 있다. 그러나 수소경제활성화법안과 수소안전관리 및 사업법과 체계를 갖춘 법안이 필요가 있다. 한국은 이니셔티브나 지자체의 정책과 집행을 통하는 것보다는 법안을 두고 이에 근거한 계획과 지자체 조례 등을 통한 확산을 통했을 때 거버넌스 메커니즘이 원활할 것이다. 또한 수소산업진흥원은 에너지공단에 설치된 신재생에너지센터와 일부의 업무가 중복된다. 중복성이 우려되는 부분으로 중복은 조정하는 절차가 필요할 것이다. 밸류체인 상 연구개발과 투자확대가 가능한 부분의 새로운 시장을 형성하면서 민간 투자를 가져오게 유도하는 정책이 필요하고 이를 위한 본 산업육성법도 필요하다. 또한 연료전지용 천연가스 요금 체계를 설계하는 부분은 다른 에너지 관련 요금 체계와의 형평성을 고려하여야 마찰이 없을 것이다.