모든 권한을 주최국에게 전담하도록 하여, 거버넌스 체계 및 규정에 있어서 CDM과 JCM에 비해 각 국의 자유도가 높다.
협상과정에서 주요 논의 사항 중 하나가 항공분야의 ETS 편입이었는데, EU-ETS는 ‘12년 이후 항공분야를 규제해 왔으나, EU/EEA 밖에서의 이착륙 항공편의 경우 규제대상에서 제외하였다. 이에 현재 스위스-EU 간 항공운행으로 인한 온실가스 배출량은 EU-ETS의 규제를 받지 않고 있다. ‘16년 가을, 국제민간항공기구(ICAO, International Civil Aviation Organization)가 통합된 국제 레짐을 채택하지 않는다면, EU는 EU/EEA 구역 내 이착륙하는 모든 항공편에 대한 규제를 시작할 수 있으며, EU-스위스간 ETS 연계 협정 발효 시에는 스위스 역시 항공부문 규제를 해야 한다. 스위스와 EU는 배출권 거래제 운영 측면에서 일부 다르게 운영되고 있으나, 스위스의 경우 EU-ETS와의 연계를 고려하여 CO2 법안(‘13년 1월 시행) 개정을 통해 제도적ㆍ기술적인 연계 측면의 양립가능성이 높아졌다. 다음의 <표 5.19>는 스위스 ETS와 EU-ETS의 차이를 설명한표이다.