국내 상하수도 사업은 높은 보급률과는 달리 구조, 재정, 조직적 측면에서는 많은 문제점이 존재한다. 하물며 계속 변화하는 과제까지 생기고 있는 상황이다.
보급 확대에 중점을 둔 정책으로서 우리나라의 상하수도 사업은 높은 보급률은 달성한 반면 구조적·재정적·조직적인 측면에서는 여러 문제점을 나타내고 있다. 먼저 인프라가 노후화됨에 따라 시설개량 및 보수를 위해 재투자 수요를 고려하기 위한 재원과 구체적인 계획이 부재한 문제점이 있다. 인프라 사업의 타당성을 평가하는 체계가 부족하며, 자산관리 등을 기반으로 한 전략적 투자 및 재정계획이 부족하다. 또한 사업의 효율성과 재정책임성을 촉진할 수 있는 방안이 부족한 점 또한 상하수도 사업의 지속가능성과 효율성을 악화시키고 있다. 한편으로는 인프라 시설의 노후화, 기후변화 대응, 물 수요에 대한 특성변화 등 상하수도 부문은 변화하는 새로운 과제에 당면하고 있는 상황이다.