맞춤 의료를 병원 시스템 안에서 효과적으로 구현하기 위해서는 유전자 검사가 보편화되어야 한다. 외부 검사기관에 의뢰하는 것 보다는 병원 내 상설 기능으로 구축되어야 하고 전자의료기록과 연계될 수 있는 인프라를 구축하고 담당 조직을 설치해야 할 것이다. 
맞춤 의료를 기존의 병원 시스템 안에서 효과적으로 구현하기 위해서는 여러 측 면에서 병원과 의료 시스템의 대응이 요구된다. 우선 진료 현장에서의 유전자 검사 (point-of-care genetic testing)가 보편화되어야 한다. 지금은 일부 병원에서 주로 암 환자에 대해 유전자 검사를 시행하고 있고 그것도 외부 검사기관에 의뢰해서 분석하는 경우가 많으나, 향후 맞춤 의료가 전체 질환으로 확대되기 위해서는 현재의 CT나 MRI 검사와 같이 유전자 검사 기능이 병원 내의 상설 기능으로 구축되어야 할 것이다. 더 나아가 병원 내의 유전자 검사가 전자의료기록(EMR)과 연계될 필요 가 있다. 지금 많은 환자들이 필요에 따라 CT나 MRI를 찍어보고 그것을 EMR로 확 인하듯이 앞으로는 필요에 따라 시퀀싱을 해보고 그것을 EMR로 확인하는 시기가 올 것이므로, 병원은 적절한 시기에 이에 대한 인프라를 구축하고 담당 조직을 설치하는 대응이 필요하다.