구근 화훼류는 수출액이 증가해도 대부분의 종묘를 수입하고 있기에 구근 수입에 대한 부담을 줄이기 위해 국내 품종을 육성하는데 노력하였고 현재는 국산 품종 점유율을 23%까지 확대했다. 
구근 화훼류는 지난 10년간 수출액이 크게 증가하고 있으나 대부분의 종묘를 수입에 의존하고 있어 수입액도 꾸준히 증가하고 있다. 이에 1990년대 초반부터 초세가 강하고 국내 환경에 잘 적응하는 다양한 품종을 육성, 보급해 농가 소득을 높이고 구근 수입 부담을 줄이기 위해 노력하고 있다. 1991년부터 현재까지 나리 ‘핑크펄’ 등 80품종, 프리지아 ‘샤이니골드’ 등 구근 화훼 94품종을 육성하였다. 또한 농가 보급을 확대하기 위해 ‘화훼류 신품종 이용 촉진 사업’, ‘나리 국산품종 주산지 시범 재배 사업’을 통한 현장 평가회, 홍보 등을 통해 우리 품종을 널리 알린 결과 국산 품종 점유율을 23%로 확대하였다.