약제급여는 선별등재제도에 의거하여 운영되고 있으며 치료재료는 보건복지부장관이 급여대상 치료재료에 대한 급여 상한금액을 결정하게 된다. 
급여에 관한 의사결정은 약제급여와 치료재료급여 그리고 의료행위로 크게 분류할 수 있다. 약제급여는 2006년 12월부터 선별등재제도에 의거하여 운영되고 있으며 치료재료의 경우 약제와 마찬가지로 보건복지부장관리 급여대상 치료재료에 대한 급여 상한금액을 결정하게 된다. 이를 위해 치료재료는 급여 및 비급여목록이 정해지고 관리된다. 의료행위는 행위별 수가제임에 따라 행위별 업무량, 진료비용 및 위험도 등을 고려하여 점수화하는 상대가치제이며 매연도마다 수가계약 시 적용되는 인상률을 고려한 환산지수를 곱하여 수가가 결정된다. 신의료기술에 해당하는 행위를 중심으로 하는 의사결정과 약제의 급여의사결정을 위한 절차는 다음 그림과 같다.