현 TA 주관 조직인 미래부가 TA결과에 대한 후속 조치 강제 수단이 없어, 즉 과학기술 지휘소 기능이 부족해서 결과가 활용되지 못해 실효성이 떨어진다는 주장이다.
미래부가 아닌 행정부 차원에서 새로운 범부처조직이 TA 수행주체로 고려될 수도 있다. TA의 실효성 미흡이 이를 주관하는 미래부가 과학기술 컨트롤타워로서의 기능을 충분히 수행하지 못하는 데서 비롯된다는 인식이 있기 때문이다(전문가 E 서면인터뷰, 2015. 10. 26). 과학기술기본법에는 TA결과가 국과심에 보고되면 관련 부처들은 후속 조치를 마련해야 한다고 명시하고 있긴 하지만, 이것이 실현되었는지를 강제할 수 있는 수단이 미래부에 없기 때문에 TA 결과가 활용되지 못한다는 것이다(전문가 D 서면인터뷰, 2015. 10. 21; 전문가 E 서면인터뷰, 2015. 10. 26).