우리나라의 건강보험은 비록 사회보험 방식이지만 1988년 취약한 지역가입자들의 보험료를 지원하면서 국고지원 방식이 형성되었고, 이는 부족한 급여비 지출 등에 사용된다.
우리나라는 건강보험을 사회보험 방식으로 운영하고 있음에도 불구하고 총 재정의 약 13%가 국고에서 투입되고 있다. 건강보험에 국고지원이 필요한 이유는 다양하지만, 우리나라는 1988년 취약계층이 다수 분포하는 지역가입자들의 보험료를 지원하면서 시작되었다. 이렇게 투입된 국고는 보험료만으로는 충분하지 않는 급여비 지출을 커버하기 위해 사용되었고, 두 번의 제도변화 끝에 현행 국고지원 방식(보험료예상 수입의 20%)이 탄생되었다. 그러나 현행 국고지원 방식은 내년 말까지 한시적으로 운영되기 때문에 2016년 이후 건강보험 국고지원 방식에 대해 논의가 필요하다.