정보이동권 비용부담 문제는 수익자 부담 원칙의 정보주체 부담 견해와 정보처리자 부담 견해를 불러일으켰고 또 과도한 비용을 부담하는 정보처리자의 정보이동 대상 제외 견해는 법령 취지에 어긋나므로 정보주체의 비용 부담이 맞다.
먼저 정보이동에 과도한 비용을 발생하는 경우 그 비용을 누가 부담할 것인가의 문제가 제기된다. 일반적으로 정보주체가 요청하는 경우이므로 정보이동에 발생하는 비용은 수익 자부담 원칙에 의해 정보주체가 부담해야 한다는 견해와 정보처리자는 개인정보를 활용하 여 많은 이익을 발생시켰으므로 정보이동에 드는 비용은 정보처리자가 부담하여야 한다는 견해가 있을 수 있다. 한편 정보처리자가 많은 비용을 부담하는 경우 정보이동의 대상에 서 제외하자는 견해도 있는데, 이 경우 역시 기본적으로 정보처리자 비용 부담을 전제한 다. 정보이동에 과도한 비용을 부담하는 경우 정보이동에서 제외하는 것은 정보이동의 필 요성과 무관하게 단지 비용만을 가지고 정보이동 여부를 결정한다는 점에서 본래의 법령 의도와 맞지 않다. 수익자 부담원칙에 따른다면 정보이동을 요청하는 자가 부담하는 것이 타당하다.