사업의 특성과 유형 등에 맞춘 지표선정 및 평가방식이 필요하다. STAR Metrics는 연구개발 투자의 성과 및 경제사회적 효과 등의 측정에는 유용하나 기초연구사업 평가 시에는 적절하지 않다. 따라서 다양한 방법들 중 적절하게 선택하여 적용해야 한다.
연구개발사업 질적 평가를 위해서는 사업의 목적과 특성, 사업유형에 맞춘 차별화된 접근 방식이 필요하다(유승준, 2011). 모든 사업에 동일한 방식을 적용하기보다는, 기초연구, 원천연구,산업기술개발 등 연구유형별 차별화된 지표설정 및 인과관계 규명방식이 필요하며 기초연구사업에 대한 평가에서 STAR Metrics와 같이 연구개발투자 대비 성과를 보는 것은 무의미할 수 있다(유승준, 2011). 모든 제도를 무분별하게 도입하는 것보다는 국내 현실에 맞게 취사선택하는 것이 중요한 바, STAR Metrics는 연구개발 투자의 질적 성과, 장‧단기적 경제사회적 효과의 유무 및 정도의 측정도구로서는 적절하다(유승준, 2013). 그러나 평가를 위해서는 기획-집행-결과 등 사업의 모든 단계에 대한 정보가 필요하기 때문에, 중복투자 모니터링, 사업 개선 등 투자효율성 제고를 위한 평가 도구로 사용하기에는 투입·산출하는 성과정보가 다소 제한적이다(유승준, 2013).