4대강 수계 특별법은 공통적으로 수변구역의 지정 및 행위제한, 하류구간에서의 수질오염원 관리, 오염총량관리제의 실시, 수질개선사업, 수질개선특별회계의 설치, 물이용부담금의 부과 ․징수, 수계관리위원회의 설치 ․ 운영 등에 관해 규정함으로써 오염원 관리를 위한 토대를 제공한다. 
｢한강수계 상수원수질개선 및 주민지원 등에 관한 법률｣, ｢금강수계물관리 및 주민지원 등에 관한 법률｣, ｢낙동강수계 물관리 및 주민지원 등에 관한 법률｣, ｢영산강 ․ 섬진강수계 물관리 및 주민지원 등에 관한 법률｣(이하 ‘4대강 수계 특별법’)은 공통적으로 상수원의 적절한 관리와 상수원상류지역의 수질개선 및 주민지원에 관한 사항에 관하여 규정하고 있다. 4대강 수계 특별법은 법률 명칭에 나타난 구분에 따라 그 적용범위가 각각 한강, 금강, 낙동강, 영산강 ․ 섬진강의 수계 및 수계에서 취수한 수돗물을 사용하는 수계외측지역으로 한정되어있다는 점만 차이가 있을 뿐, 대부분의 규정은 동일하다. 즉, 4대강 수계 특별법은 공통적으로 수변구역의 지정 및 행위제한, 수변구역관리기본계획의 수립 ․ 시행, 하천구역 또는 하류구간에서의 수질오염원 관리, 오염총량관리제의 실시, 오염총량관리비용등의우선지원, 수질개선사업, 수질개선특별회계의 설치, 물이용부담금의 부과 ․징수, 수계관리위원회의 설치 ․ 운영 등에 관하여 규정함으로써 오염원 관리를 위한 기반을 제공한다.