혁신환경은 혁신 이슈 관련 환경을 뜻한다. 이에 대한 인식과 대응이 국가별로 전략의 차이가 있다는 것을 시스템적 이유로 설명할 수 있다는 것이 국가혁신체계의 본질이다. NIS는 시스템적 관점에서 그 차이를 설명한다. 
본 연구에서는 각국의 혁신환경에 대한 인식에 따른 대응은 각국의 문화·사회적 특성이 반영되어 다르게 나타난다고 본다. 또한, 이러한 차이가 국가전략의 독특함과 차별성을 만들어 내는데, 그 원인을 시스템적 관점에서 규명할 수 있다는 것이다. 이것이 국가혁신체계의 본질이다. 혁신환경은 여러 환경요소들 중에서도 특히 혁신 이슈와 관련된 환경으로서, 각국의 환경에 대한 인식으로 연결된다. 각 환경요소에 대한 각국의 인식의 비중과 전략적 주안점은 다르게 나타나기 마련이다. 또한, 동일한 환경요소라고 하더라도 이에 대한 대응 과정에서 국가별 전략의 차이가 나타나게 되고, 관련 제도와 정책 프로그램도 당연히 차이를 보이게 된다. 이와 같은 국가별 차별성과 독특성으로 인한 국가전략의 차이를 시스템적 관점에서 설명하는 것이 NIS이다.