다문화교육의 목표는 다문화사회의 구성원들이 개별 문화의 고유가치를 인정, 존중하고 문화적 차이를 수용하면서 공존할 수 있는 능력을 길러주는 것이다. 또한 상호문화교육의 목표는 다문화사회의 서로 다른 문화적 배경을 지닌 개인들이 대화를 통해 갈등을 조정하고 협력과 연대감을 끌어내어 서로 공생할 수 있는 능력을 기르는 것이다. 
이런 공통점에도 불구하고, ‘다문화’와 ‘상호문화’의 개념 구분에서와 마찬가지로, 다문화교육과 상호문화교육은 교육학적 목표와 관련하여 분명한 차이점을 나타낸다. 다문화교육의 목표는 다문화사회의 구성원들이 개별 문화의 고유가치를 인정하고 존중할 뿐만 아니라 문화적 차이를 수용하면서 공존할 수 있는 능력을 길러주는 것이다. 즉, 다문화교육은 인종이나 민족의 다양성은 물론 문화의 다양성을 인정하고, 개개의 문화가 동등한 가치를 갖는 것으로 인식하며, 다른 문화에 대한 편견을 줄이고, 다양한 문화를 올바르게 이해하도록 하기 위한 교육방법이다(장인실, 2003: 409; 2006: 28 참고). 한편 상호문화교육의 목표는 다문화사회의 서로 다른 문화집단들 또는 서로 다른 문화적 배경을 지닌 개인들이 대화를 통해 갈등을 조정하고 협력과 연대감을 끌어내어 서로 공생할 수 있는 능력을 배양하는 것이다. 즉 상호문화교육은 문화의 다양성을 인정하면서도 문화와 문화 사이의 접촉과 교류 및 상호작용을 강조하여, 문화갈등이 발생할 시 상황에 맞춰 적절하게 행동할 수 있는 역량을 기르도록 하기 위한 교육방법이다. 이런 의미에서 상호문화교육은 다양한 문화들을 단순히 학습하는 것이 아니라, 문화접촉에서 발생할 수 있는 갈등의 해결을 위한 행위능력을 배양시키기 위한 교육학적 접근이다(장한업 역, 2012: 34 참고). 따라서 상호문화교육은 학습자에게 타문화를 단순히 이해하는 차원을 넘어서, 타자의 문제를 자신의 문제로 받아들이는 책임의식과 그에 합당한 행동을 취할 수 있도록 ‘상호문화 감수성(intercultural sensitivity)’을 훈련시킬 수 있는 기회를 제공해야 한다.