NIH는 매년 경과 보고서를 제출하고 승인을 받아야 한다. 경과 보고서에는 연구 성과, 논문 출판 사항, 인력 변동 사항, 다음년도 계획, 과제에 대한 해결 방안 등에 관한 보고 내용이 필요하고, 추가로 발명 보고서, 재무 보고서, 지출 보고서가 제출되어야 한다. 
NIH는 비경쟁으로 연장이 되는 다년 과제에 대해서는 매년 경과 보고서를 제출하도록 한다. NSF의 연차 보고서가 연구의 성과를 정리하는 간략한 보고의 성격을 띠는 반면에, NIH의 경과 보고서는 더 많은 정보를 요구하고 NIH의 승인을 받아야만 한다. 경과 보고서에는 연구 목표에 대한 성취, 논문 출판 사항, 연구 인력 변동 사항, 그 다음 해 프로젝트에 대한 계획, 프로젝트의 직면 과제나 예상 과제 및 해결 방안, 인간 실험 대상이나 동물 실험 대상의 중대한 변화, 임상 연구에서 실험 참가자의 인종 및 성별 분포 보고 등의 내용이 담겨 있어야 하고, 추가적으로 발명 보고서, 재무 보고서, 지출 보고서 등이 포함되어야 한다. 발명 보고서의 경우 연구 과정 중에 이루어진 발명에 대한 정보를 담는다. NIH는 지원을 받은 연구에서 발생한 모든 특허에 대해 연방 정부비 사사 표시를 포함시킬 것을 요구한다. 또한 베이-돌 법안을 준수하여 관련된 지적 재산권 보고에 관한 요구 사항을 충족시켜야 한다.