지수에 포함되는 변수의 변별력이 문제가 될 때가 있으므로 환경정의 커뮤니티 선정을 위한 EJSEAT은 지수 개발시 이를 고려해야 한다. 문제는 카운티에 속한 센서트랙의 건강이나 규정준수 변수값에 차이가 있음에도 이를 무시해 변별력을 떨어뜨린다는 데 있다.
가중치 문제와 함께 지수에 포함되는 변수의 변별력이 문제가 되는 경우가 있다. 환경정의 커뮤니티를 선정하기 위한 EJSEAT은 지수를 개발할 때 고려하여야 하는 점을 분명히 보여준다고 하겠다. 먼저 EJSEAT의 건강영역의 공간단위는 센서스트랙보다 큰 카운티(County)이므로 카운티에 속한 모든 센서스트랙은 동일한 건강변수의 값을 가진다고 가정을 한다. 이 가정의 중요한 문제는 건강변수의 수치가 카운티 내에서도 상당한 차이가 있지만 이를 무시하기 때문에 EJSEAT 점수의 변별력을 크게 떨어뜨리는 결과를 초래할 수 있다(NEJAC, 2010). 건강과 함께 규정준수의 영역의 경우 특정 변수의 변별력이 상당히 떨어지는 것이 문제이다. 행정지도를 받은 사업장 수의 경우 미시간주에는 해당 사항이 없어서 모든 센서스트랙의 수치가 50이다. 또한 미국 전역으로 봤을 때도 미국 주의 상당수가 행정지도를 받은 사업장의 수가 하나도 없고 이 수치는 50이다.