국민의 정부는 공공부문을 국정개혁 과제로 두었고, 이를 기획예산위원회에서 담당하였다. 행정개혁위원회와 예산지문위원회를 운영하고, 정부개혁실에서 실무작업을 하였다.
1997년 외환위기 직후 집권한 ‘국민의 정부’는 국정개혁 4대과제 중 하나로 ‘공공부문 개혁’을 제시했다. 공공부문 개혁의 계획수립·추진을 담당한 것은 기획예산위원회(위원장 진념)였다. 기획예산위원회는 국민의 정부 출범 직후 1998년 2월 28일에 단행된 제1차 정부조직개편에 따라 설치된 기관으로, 예산편성지침을 작성하는 행정기관인 동시에 대통령 직속기구로서 국가정책의 기획·조정 기능도 수행했다. 기획예산위원장의 자문기구로는 행정개혁위원회와 예산자문위원회를 운영했으며, 기획예산위 산하 정부개혁실에서는 행정개혁 실무작업을 담당하였다.