미국 바이오섹터의 분석에 의하면, 바이오기술의 독특한 특성의 사업화를 위한 몇 가지 조직적·제도적 해결점을 제시했는데, 그것이 결국 바이오 벤처 생태계를 구성한다. 이 조직적·제도적 배열은 창업환경, 제휴환경, 투자환경으로 구성되는데 이를 본 연구에서 분석하려고 한다.
Pisano(2006)는 미국 최초의 바이오 벤처인 Genentech(1976년 설립) 설립 30주년을 맞아 미국 바이오 섹터가 보여준 지난 30년의 실적을 총 정리하면서 바이오벤처의 한계를 분석하고 개선 방향을 제시한 바 있다. 본 연구에서는 Pisano의 논의를 기초로 한국 바이오 벤처 생태계의 분석과 진단을 위한 분석 틀을 구성하였다. 이 분석 틀을 간단하게 요약하면, 바이오기술이 지닌 독특한 특성들이 있고, 이 특성들이 바이오기술의 사업화를 위해 몇 가지 조직적/제도적 해결 과제를 제시하는데, 그 과제를 해결하기 위해 고안된 조직적/제도적 배열이 결국 바이오 벤처 생태계를 구성한다는 것이다. 생태계를 구성하는 이 조직적/제도적 배열은 구체적으로 Pisano가 ‘지식재산의 화폐화’ 시스템이라고 부른 창업 환경, 투자 환경, 제휴 환경으로 구성되는데, 4장의 생태계 분석에서는 이를 차례로 분석한다. 그리고 이 기본구조의 한계를 보완하는 정부와 재벌 등의 역할은 3~4장의 관련된 본문에서 함께 다루겠다.