2011년 일본 인공투석시설 대상 조사에서 HIV 감염인 수용에 대한 부정적 대답이 우세했다. 2014년 고치현 치과 HIV 감염인 치료 거부 등 일본에서도 의료차별이 이슈다.
일본에서 2011년에 실시된 인공투석시설을 대상으로 한 조사에서는 1552개소 중 HIV 감염인의 수용 경험이 있는 곳은 6%에 불과하였고, 수용 경험이 없는 시설의 54%는 "앞으로도 받아들이기 어렵다"고 답변한 것으로 나타났다. 그 이유로는 "전용 침대를 확보 할 수 없음", "다른 통원 환자가 불안해하는 등의 풍문에 의한 피해가 걱정됨", "직원의 이해를 얻을 수 없음", "다른 환자에 대한 감염이 걱정됨” 등을 들었다고 한다. 2014년에는 고치현의 치과진료소가 HIV 감염인 치료를 거부해 물의를 빚기도 하는 등 일본에서 역시 진료거부 등의 의료차별사건이 이슈가 되고 있다.