정부 R&D 투자는 주요 임무 수행을 목적으로 하는 계약연구와  탐색적 연구를 지원하는 보조금연구로 구분되어 있으며 결과로 나타나는 순효과는 차이가 있게 된다.
정부 R&D 투자의 순효과를 살펴보기 위해서는 계약(contract)연구와 보조금(grant)연구를 구분하는 것이 중요하다(David, et al., 2000). 정부의 계약연구는 주로 정부의 주어진 임무를 수행할 목적으로 연구결과를 구매하기 위한 것으로 이의 대표적 예가 국방과 우주 등 정부의 주요 임무에 해당되는 것들이다. 반면, 보조금연구는 특정 목적을 위한 연구결과가 명시적으로 요구되지 않는 경우가 대부분으로 지식의 진보 또는 미래 신기술에 대한 탐색적 연구들을 주로 지원한다. 따라서 계약연구와 보조금연구가 갖는 민간 R&D 투자 촉진 효과는 차이가 있을 수밖에 없다.