2000년대 부터 팔색조 연구가 본격적으로 이루어 졌다. 2003년 제주도에 45쌍의 팔색조가 보고되었고 분포 고도 및 낙엽층 두께와 지렁이 개체수와의 관계에 대해 보고되었다. 2006년 제주도 전역에 60쌍을 확인했으며 둥지를 발견하여 포란과 새끼 보육 활동 등을 관찰하였으나 뱀 등의 요인으로 번식 실패한 것으로 확인되었다. 2008년에는 거제도 동백나무림에서 8마리의 팔색조가 보고되었다.
2000년대로 접어들면서 팔색조 연구가 본격적으로 이루어졌는데 김 등(2003)은 ‘제주도에서식하는 팔색조의 분포와 서식환경’이라는 논문을 통해 제주도 전역에 45쌍의 팔색조가 번식하고 있다고 보고하였다. 그리고 해발 100m에서부터 800m까지 팔색조가 번식하는 것이 확인되었으며 해발 400m에서부터 600m사이에 가장 많이 분포한다고 하였다. 서식환경에서는 팔색조가 번식하는 조사지점의 낙엽층 두께와 지렁이 개체수는 번식하지 않는 조사지점의 것과 차이를 보인다고 하였다. 그리고 김(2006)은 ‘한라산에서 팔색조의 분포와 번식생태’에서 추가조사를 통해 제주도전역에 60쌍이 번식하는 것이 확인되었으며 서귀포시지역이 제주시지역에 비해 다소 많았으며 주로 계곡과 그 주변에 번식하고 있다고 보고하였다. 5년동안 22개의 둥지를 발견하였고 이 중 18개가 바위에, 4개가 나무에 지어졌으며 지상에서 1-2m 사이에 위치하였다고 하였다. 팔색조는 제주도에 5월 20일 경에 도래하여 4-6개의 알을 낳고 알품기는 암컷이 전담하며 수컷은 둥지 주변에서 경계행동을 하였으며 12일의 포란기간과 12일의 새끼키우는 과정을 거쳐 둥지를 떠났다고 정리하였다. 번식실패요인은 뱀이나 큰부리까마귀 등 둥지 약탈자, 빈번한 사람 출입, 그리고 자연재해라고 보았다. 2008년 천연기념물 모니터링에서 팔색조번식지인 거제도 동백나무림에 대한 조사가 이루어져 8마리의 팔색조가 서식한다고 보고하였다(Kang and Nam, 2008).