토마토 풋마름병은 낮에 고추 상단 부위의 시들음 증상으로 시작되고 이것이 며칠 반복되면 전체적으로 시들어 죽게된다. 이것은 줄기 물관 부위가 갈변하여 물이 이동하지 못했기 때문이다.
토마토 풋마름병의 초기 증상은 고추 지상 부위가 푸른 상태로 시든 모습을 보이는 것이다. 자세히 설명하자면 이른 아침에 포장 전체에 관수를 하면 잘 자라다가, 햇볕이 강해지면 상단 부위가 아래로 쳐지면서 시들음 증상을 보인다. 늦은 저녁 해가 지고 기온이 내려가면 상단 부위가 다시 고개를 들면서 정상적인 모습이 된다. 이런 초기 증상을 2~3일 정도 반복하다가, 발병하기 좋은 환경이 되면 급속히 전체적으로 상단 부위가 아래로 쳐지고는 회복하지 못하고 말라서 죽어가게 된다. 이때 줄기 아랫부분을 절단해 보면 물관 부위가 갈변하여 물의 이동을 억제한 것을 볼 수 있다. 때문에 상단 부위의 시들음 증상이 나타난다.