깨끗하고 지속가능한 양식수산물 생산체계 마련과 생산성, 상품의 질을 제고하는 핵심인 수산종자에 대한 총체적 대응과 육성대책이 미비하다.
이 같은 문제의 해결방안으로 수산종자에 대한 관심이 높아지고 있다. 양식수산물의 질병과 폐사율을 감소시키고 위생적이고 지속가능한 생산시스템 구축을 위한 필수요소로서 수산종자 발전에 대한 업계의 관심과 요구가 강해지고 있는 것이다. 그러나 양식어업의 기초적 핵심적 요소인 수산종자는 그 중요성에도 불구하고 종합적 체계적 대응 및 육성전략이 마련되지 못하고 있다. 종자생산업 및 종자산업은 ‘수정란(또는 채묘) 종자 생산 양성(중간양성, 본양성)’으로 진행되는 양식생산 사이클에서 생산성과 비용은 물론, 제품의 품질 수준을 결정짓는 핵심요소라 할 수 있으나, 양식어업 발전을 위한 일부 측면으로만 다루어지고 있다.