복지부의 연구중심병원사업은 병원의 시스템 변화의 성과 창출과 지속가능성 담보를 위해 법·제도적 지원 사업과 연구개발 활동을 지원한다. 이 사업은 기준을 충족하는 병원을 지정하고 법·제도적 지원을 통해 안정적 정착을 유도한다.
복지부의 연구중심병원사업은 기존의 병원 기반 중개연구사업과 달리 병원의 시스템 변화에 기반한 성과 창출과 지속가능성 담보를 위해 법·제도적 지원에 관한 사업(연구중심 병원지정사업, 이하 지정사업)과 연구개발 활동을 지원하는 사업(연구중심병원육성사업, 이하 육성사업)으로 구성되어 있다. 연구중심병원지정사업은 진료 중심의 병원시스템을 진료·연구 균형 시스템으로 전환하도록 병원의 인프라 구축을 지원하는 사업으로, 병원의 인력, 시설, 장비, 제도 등 관련 기준을 충족하는 병원을 연구중심병원으로 지정하고 법·제도적 지원을 통해 병원 시스템/환경 변화의 안정적 정착을 유도하는 사업이다. 연구중심병원육성사업은 연구중심병원 지정을 받은 병원을 대상으로 연구개발사업을 지원함으로써 연구중심병원지정이라는 container에 연구중심병원육성사업의 R&D 자금 지원을 통한 연구개발이라는 contents를 실어 실질적 정책효과의 발생가능성을 제고하고자 하는 사업 구조를 가지고 있다.