국내 과학 연구 환경의 미비함은 계속해서 제기되어 왔다. 과학자의 자율적인 연구 활동이 어렵다는 의견과, 우리나라는 과거부터 연구 분야에 정부 개입이 이어져 왔다는 의견이 대립하고 있다.
매년 그러하듯 노벨상 시즌만 되면 우리 기초 과학 지원에 대한 반성의 목소리를 듣습니다. 올해는 과학자들이 연구자 주도의 기초 연구 지원 확대를 요구하는 청원에 스스로 나서기도 하였습니다. 이는 우리 연구 환경이 과학자들의 자율성과 창의성을 보장하기에는 아직도 부족함을 의미합니다. 학문과 연구의 자유는 헌법에 보장된 기본권이자 창의성 발현의 핵심 요소로도 간주됩니다. 그러나 우리나라 역사를 살펴 보면 60년대 과학자 집단의 형성 과정에서부터 정부의 역할이 주도적이었으며 학문의 자유보다는 규제와 간섭이 지배적이라는 것이 일반적인 견해입니다. 이는 주로 대학의 기초 연구 지원과 관련된 과학자 집단의 끊임없는 자율성 확대 요구와 정부 및 연구 관리 기관의 관리 제도 사이의 오랜 대립에서도 단적으로 드러납니다.