대학의 연구개발은 연구수행-성과검증-초기 기술인큐베이팅의 3단계로 나눌 수 있다. 여기에 공동기기원은 연구수행 단계에서 정확한 측정 및 분석 데이터를 제공하는 역할은 할 수 있지만, 다른 단계는 연관성이 낮아 참여가 제한적이다.
대학에서 수행하는 연구개발 단계를 세 단계로 구분하면, 연구수행, 성과검증, 그리고 초기 기술인큐베이팅 등으로 볼 수 있다. 이러한 단계와 공동기기원의 기능을 연계해 보면, 우선 기술개발(연구수행) 단계에서 공동기기원의 주된 역할은 연구실에서 필요로 하는 정확한 측정 및 분석 데이터를 제공하는데 있다. 다음 기술검증 단계에서는 공동기기원의 역할이 제한적이다. 기 개발된 기술의 검증은 측정 및 분석 데이터 외에 기술사용 여건과 기술사용 범위 및 기술사용의 기대효과 등 다양한 측면이 검토 되어야 하는데 공동기기원을 이러한 다양한 측면들에 대한 검토는 한계가 있다. 마지막으로 시작품 제작 단계는 공동기기원과는 상관성이 매우 떨어진다. 시작품/시제품 제작을 위해서는 시작품 제작에 필요한 장비와 전문인력의 확보가 선행되어야 하는데 이는 오히려 앞서 언급한 제작실을 통해 접근하는 것이 가능하다.