펫푸드를 식품으로 볼 것인지 사료로 볼것인지 경계가 모호하다. 사료로 보기에는 반려동물을 키우는 사람들의 반대가 크며, 동물보호 수준이 높은 나라에서는 펫푸드의 글로벌인증제를 활용중이다.
수산물을 이용하여 펫푸드를 만들었을 경우에 어떠한 법률적 근거에 포함되는지에 대해서는 여전히 의문이 남는다. 이것을 수산가공품 중에서 식품으로 봐야 하는지 아니면, 산업용 동물에게 급이하는 사료로 봐야 하는 지 애매모호한 선상에 놓여 있다. 과거라면, 산업용 동물에게 주는 사료로 판단하기 쉬울지 몰라도 국내의 반려동물 소유자들(전국민의 1/5), 동물 관련 단체 등에서는 이에 반대하는 입장이다. 그뿐만 아니라 동물보호 수준이 높고 반려동물 문화가 앞서 있는 선진국에서는 펫푸드를 Human Grade 수준으로 올려 놓고 있을 뿐만 아니라 관련 원료(어분 등) 공급 업체들은 MSC라는 글로벌 인증제를 당연시하고 있을 정도이다.