대규모 재난의 피해를 줄이기 위해서는 재난의 규모를 산정한 가이드라인을 통해 지자체의 재난 대응 기준을 설정한 뒤, 이를 초과하는 경우 중대본에 지원을 요청할 수 있도록 해야한다. 현 대응체계는 이러한 기준이 없어 중대본 설치가 지연되고 있다. 또한 중대본의 한계로 인해 국무총리에게 권한을 이양하게 되는데 이 과정에서 속도도 중요하므로 보고체계의 간소화가 고려되어야 한다. 마찬가지로 특별재난지역선포의 신속성을 위해 중대본이 설치되었을 때는 중대본에 관련 권환을 일원화해야 한다.
내부적 한계의 경우, 가장 큰 문제는 대규모 재난에 대한 본격적인 대응이 중대본 설치 및 운영 이후에 시행되는 점에 있다. 대규모 재난의 경우 복합적인 문제가 발생하고, 범부처적 대응이 필요하므로 중대본이 총괄하여 대응하는 프로세스 자체는 합리적인 체계이다. 대규모 재난의 피해를 줄이기 위해 현 대응체계에서는 얼마나 빨리 중대본이 설치되는가가 중요하다. 이를 위해서는 지자체가 중대본에 지원을 요청할 때, 재난의 규모를 대규모로 산정할 수 있는 어느 정도의 가이드라인이 필요하다. 당면한 재난의 규모가 중앙정부 차원의 개입이 필요한지를 지자체에서 빠르게 판단하기 위해서는, 지자체가 대응할 수 있는 인명 피해나 시설물 피해 등의 한계를 지정하고 이를 넘어설 시에는 보고하도록 하는 명확한 기준점을 설정해야 한다. 현 대응체계에서는 이에 대한 기준이 전무한 상황이며, 이로 인해 중대본의 설치가 늦어지고 있다. 대규모 재난의 경우, 국민안전처에서 중대본을 설치하였더라도 대응에 한계가 있고, 범부처적 대응을 위해 국무총리에게 권한을 이양하게 된다. 이러한 과정에서도 역시 속도가 중요하며, 국민안전처에서 재난의 규모를 빠르게 파악하고 권한 이양을 결정하는 것과 동시에 국무위원들의 소집과 협의가 최대한 빨리 이뤄질 수 있도록 조치해야 한다. 이를 위해서는 국민안전처와 대통령 간 협의만으로 중대본 장을 국무총리에게 이양할 수 있는 보고체계의 간소화도 고려할 수 있다. 범부처적 중대본이 가동된 이후에는 특별재난지역선포가 얼마나 빨리 이루어지는가도 중요한 문제이다. 현 대응체계에서는 특별재난지역을 중앙안전관리위원회에서 선포하게 되어 있다. 이는 중대본과 별도로 운영되고 있어, 절차상의 중복 및 추가적인 시간 소요를 일으킨다. 특별재난지역선포와 관련하여 중대본이 설치되었을 시에는 중대본에서 재난을 총괄하고, 관련사항을 일원화할 수 있도록 권한을 실어 줄 필요가 있다.