소결핵균은 세포에서 기생하는 세균으로 치료가 어렵기 때문에 가축은 치료하지 않는다. 우리나라에서는 소결핵균 차단을 위해 살처분을 시행한다. 결핵 양성소는 살처분하고, 그 부산물도 모두 폐기한다.
소결핵균은 세포 내에 기생하는 대표적인 세균으로 가축에 장기적인 항생제 치료를 해도 효과적인 치료가 어렵기 때문에, 경제적 및 방역 상 문제로 가축에 대한 치료는 시도하지 않고 있다. 또한 효과적인 가축에 대한 예방백신이 개발되어 있지 않기 때문에 전 세계적으로 백신을 접종하는 나라도 없다. 우리나라에서는 소결핵의 발생 차단과 근절을 위해 정기적인 검색 및 살처분 정책을 실시하고 있다. 감염된 가축으로부터 타액, 기관분비물 및 분변에 의해 직접 또는 간접적으로 기도, 경구감염에 의하여 가축들 사이에 빠르게 전파된다. 따라서 결핵 양성소로 판정되면, 해당 가축은 소각 또는 매립하고, 결핵 양성소의 우유 및 부산물 등도 모두 폐기하고 있다.