환경영향평가 준비서와 방법서는 시･정･촌장의 의견에 입각한 도･도･부･현지사의 의견을 수렴했으나 어디까지나 절차라는 것에 유의해야 하며 기관 위임 업무, 법적 수탁 업무와는 성격이 다르다. 따라서 절차에 의한 의견이 작성될 때까지의 내부절차는 지방공공단체장의 독자적인 판단으로 이루어진다.
그리고 지금까지의 내각회의 Assessment 제도에서는 환경영향평가 준비서에 대해 도･도･부･현지사에게 보낸 관련 시･정･촌장의 의견에 입각하여 발언된 도･도･부･현지사의 의견을 수렴했다. 이것은 신법도 마찬가지이다(게다가 환경영향평가 방법서에도 시･정･촌장의 의견에 입각해서 도･도･부･현지사가 의견을 내놓는다. 또한 제2종 사업에 관련되어 ‘판정’을 할 때 도･도･부･현지사가 의견을 내놓을 수 있다). 그러나 이러한 지방공공단체장의 의견은 최종적인 사업에 인･허가 처분의 요건이 아니라 어디까지나 환경영향평가 절차라는 것에 유의할 필요가 있다. 그리고 이것은 지역을 관할하는 지방공공단체장으로써 의견을 내놓는다. 기관 위임 업무나 법정 수탁 업무와는 성격이 다른 것이라고 말할 수 있다. 그래서 국가의 환경영향평가의 절차로 사업자가 받을 지방공공단체장의 의견이 작성될 때 제3기관의 의견을 듣는 등의 내부 절차가 이루어지는 것은 지방공공단체장 독자적인 판단에 맡겨진다. 이것은 신법의 문언으로 규정(60조 2호)될 것을 기다릴 것도 없이 당연한 것이라고 할 수 있을 것이다.