‘제3차과학기술기본계획’의 성과를 평가하기엔 아직 이른감이 있지만, 92조가 넘는 연구개발비가 투입된 반면 기초연구비중 목표는 40% 달성 됐다.
‘제3차 과학기술기본계획’의 기간이 아직 종료되지 않아, 전반적인 성과를 평가하기에는 어려움이 있지만, 일부 지표들에 대해서는 성과를 분석할 수 있다. 먼저, ‘제3차과학기술기본계획’에서는 이명박 정부 5년간의 정부 연구개발비(68.0조 원)에 24.4조원 이상을 투입하여 총 92.4조 원을 투자하겠다고 밝혔는데, 실제 투자성과는 이 목표에 미치지 못했다고 할 수 있다. 2013~2017년 동안의 정부 연구개발비는 92.1조 원가량으로 이명박 정부에 비해 24.1조 원 가량이 추가적으로 투입되었다. 반면에, 기초연구비중 목표 40%는 달성된 것으로 평가된다(미래창조과학부, 2016).