양식재난의 위기관리 대응 매뉴얼을 통해 책임과 역할을 명시하여도 실무자의 전문성 부족에 따른 한 번의 판단착오는 대응 매뉴얼을 무용지물로 만 들 가능성이 크다. 
양식재난의 유형별 위기관리 대응 매뉴얼의 작성을 통해 재난발생 시 중앙정부, 지방정부, 연구기관, 어업인, 지역사회의 책임과 역할을 명시하여도 현장에서 실무자의 전문성 부족에 따른 한 번의 판단착오는 대응 매뉴얼을 무용지물로 만 들 가능성이 크다. 현재 국립수산과학원은 적조, 해파리 등에 대한 모니터링 운영 지침을 만들어 배포하고, 다양한 교육을 실시하고 있지만 현장 실무담당 공무원들의 잦은 인사이동으로 가장 중요한 예찰단계에서 판단착오를 일으키는 경우가 발생하고 있다. 특히 적조 판단을 위한 시료채취 및 분석을 국립수산과학원의 몇 명의 전문가에 의존하고 있어 업무과중에 따라 실질적인 연구업무가 마비되는 상 황이 발생하고 있다.