경제학에서 보는 주인-대리인 이론을 적용하여 나고야의정서 상의 제공자를 주인, 이용자를 대리인으로 보고 이용자의 대리인 문제를 도덕적 해이로 가정하였다.
한편, Mulholland and Wilman(2003), Bardsley and Burfurd(2008), Bergemann(2009, p.45)에 의하면 이익공유 의무준수와 관련된 체약당사자들의 관계에서 발생하는 대리인 문제와 주주와 전문경영인의 관계에서 자주 발생하는 도덕적 해이는 유사하다. 즉, 경제학에서 바라보는 주인-대리인 이론의 주 은 특정한 목적을 위해 자신의 일을 대리인에게 위임하는 당사자이므로 본 논문 은 유전자원 이용을 통한 자신의 이익실현을 이용자에게 위임하는 ILC뿐만 아니라 이주하·진태은(2016)에서 언급한 소규모 생물자원센터, 수목원 등과 같은 제공자를 주인으로 고려하였다. 또한, 제공자의 이익을 위해 나고야의정서 상 이익공유 의무를 성실히 수행할 제약기업 등 이용자를 대리인으로 바라보았으며, 이용자 의 대리인 문제를 도덕적 해이로 가정하였다.