신의료기술평가사업 도입 전 진단, 치료 등은 의료전문가의 자체적 판단에 의존해 새로운 의료행위는 효과나 위험에 대해 근거가 없어도 도입될 가능성이 있었다.
의사의 술기를 포함하는 의료행위의 시장 진입에 대한 정책은 의약품, 의료기기와 비교할 때 가장 역사가 짧다. 2007년 ‘신의료기술평가사업’이 도입되기 전까지 질병의 진단, 치료 등을 위한 의료행위는 의료전문가 개인 또는 집단의 자체적 판단과 평가에 의해 도입 및 확산되었다. 즉 새로운 의료행위가 기존의 의료행위와 비교하여 가질 수 있는 효과성이나 위험성에 대한 충분한 근거가 확보되지 않은 경우에도 도입되거나 확산될 가능성이 있었고, 이는 정보의 불균형 및 행위별수가제에 근거한 의료공급체계와 의료기관 간 경쟁이 심한 보건의료 환경 하에서 의료의 질 저하와 의료자원의 낭비를 야기할 수 있는 것이었다.