R&D 정책의 다양한 평가체계 발전은 예산의 조정·배분 과정에 평가 결과를 활용해, 배분 효율성을 제고하기 위함이다. 하지만 성과정보와 예산 배분을 연계함에 한계가 있다는 문제가 있다.
R&D 정책 역시 효율성과 효과성의 평가를 위해 다양한 평가체계가 개발되었다. 신규 과제를 선정하는데 활용되는 선정평가, 과제의 진행과정에서 실시되는 연차평가·중간평가, 과제 종료 시점에 진행되는 최종평가, 과제 종료 후 3년 이상의 시간이 흐른 시점에 성과관리 실태를 파악하는 추적평가 등은 모두 R&D와 관련된 평가범주에 포함된다(윤희숙 외, 2016: 230-231). 이처럼 다양한 평가체계가 발전하게 된 것은 명확한 성과정보를 바탕으로 평가 결과를 예산의 조정·배분 과정에 활용하여 배분의 효율성을 제고시키기 위함이다. 문제는 성과정보를 바탕으로 예산 배분과 연계하는 것에 일정한 한계가 존재한다는 점이다.