정부의 R&D 자금 지원은 80위 기업까지 매년 3억 원  이상을 지원 받아 바이오 벤처들에게는 중요한 자금원이 되었다. 지식경제부가 절반 가량 지원했고, 지역 산업 육성 사업이 큰  자금원이다.
첫째, 정부의 R&D 자금 지원은 바이오 벤처기업들에게 중요한 자금원이 되고 있다. 정부 R&D 수행 100대 기업 중 80위 기업까지는 2001~2012년까지 12년 동안 정부로부터 36억 원 이상을 지원 받아 매년 3억 원 이상을 지원 받은 것으로 나타났다. 창업 초기 기업들이 1~5억 원 정도의 자금으로 3~4년을 버티는 것이 상례인 점을 감안하면 정부의 R&D 지원금이 바이오 벤처들에게는 매우 중요한 자금원이 되는 것을 알 수 있다. 부처 중에서는 지식경제부가 12년 동안의 지원액 중 절반에 가까운 6,395억 원을 지원해서 가장 중요한 지원 부처였다. 사업 중에서는 지경부의 광역경제권선도산업육성사업과 같은 지역산업 육성 사업이 가장 중요한 자금원이 되고 있다.