과총은 1966년 제1회 과학기술자대회에서 정부에 과학기술 관련 법령 제정 및 과학인의 처우 개선을, 이듬해에 제2회에서는 적극적 투자, 후원을 요구하였다. 요컨대 과학 기술자대회는 열악한 과학기술계의 형편을 극복하기 위한 과학자들의 운동이었다.
과학자들을 대표하는 조직 과총의 설립 자체가 1966 년 5월 19일 발명의 날에 개최된 전국과학기술자대 회에서 결의된 것이었다. 이듬해에 과총은 5월 19일 진명여고 강당에서 제2회 과학기술자대회를 주최했다. 이날 정일권 국무총리와 곧 과기처장관이 될 김기형이 참석했으나,이 행사는 기본적으로 과학자 단 체가 주도한 것으로서‘우리 과학기술인의 대동단 결’과‘치솟는 자발적 웅변’을 표출하는 일이었다.(『과학과 기술』1968. 1. 109면) 과학기술자들이 표출한‘웅변’은 곧 정부에 과학기술에 대한 적극적 투자,후원을 강력히 요구하는 일이었다.1966년 제1 회 과학기술자대회에서는‘과학기술진흥법의 제정, 과학기술자의 처우 개선,과학기술회관 건립,과학기 술 전담 행정기관 설치’가 건의되었다. 요컨대 과학 기술자대회는 당시 열악한 과학기술계의 형편을 극 복하기 위한 과학자들의 운동이었고, 정부에 자신들 의 요구 사항을 전달하는 일종의 집단 시위였다.