해양 폐기물 및 오염 퇴적토를 정화하는 업체는 법에 따라 관할 관청에 등록해야 하고 이들이 가져야 하는 장비 및 자격은 법률로 규정 되어 있다. 해양 폐기물 관련 업체는 전국에 150여개 정도 있고 국가 및 지자체에서 수행하는 해양쓰레기 수거사업 예산은 연 200원 규모이며 대부분이 민간 업체에 의해 수행된다.
해양이나 어장에 버려진 폐기물을 수거하거나 해저 오염 퇴적토를 준설 정화하는 업체는 해양환경관리법과 어장관리법에 따라 관할 관청에 등록하도록 되어 있다. 해양 환경이나 수산 환경을 개선하는 사업을 하는 업체들은 법률에 따라 시설이나 장비, 일정한 자격을 가진 자를 상시적으로 보유하도록 자격 요건을 규정하고 있다. 법률에서 일정한 장비 및 인적 자격 요건을 정하는 이유는 해양에서 이루어지는 작업은 육상에 비해 안전에 취약하고 작업이 용이하지 않기 때문에 숙련된 기술과 장비를 요하기 때문이다. 무역항이나 국가 어항 등 해양환경관리공단과 한국어항협회가 직접 사업을 시행하고 있는 지역을 제외하고는 민간에서 수거업무를 담당하고 있다. 폐기물을 수거하거나 조사하는 민간 업체는 전국적으로 150여 개가 있으며, 업체당 10여 명 내외의 인력이 종사하는 것으로 파악되고 있다. 국가, 지자체, 공공기관에서 집행하는 연간 해양쓰레기 수거사업 예산은 약 200억 원 규모로 예산의 대부분이 공사 발주를 통해 민간 업체에 의해 수행되고 있다. 해저에 오염된 퇴적물을 수거하는 사업은 정부 위탁에 따라 해양환경관리공단이 관리하고 있다. 2009년부터 부산남항, 여수신항, 장생포항 등에서 오염퇴적물 수거 사업이 진행되고 있는데, 수거 업무는 퇴적오염물질수거업자가 수행하고 있다.