연구자본주의에 의한 변화는 연구비의 지원방식에 있다. 정부는 특별한 용처지정 없이 주로 총액을 지원하는 '일반교부금'과 특정계약을 체결하고 해당비용을 지급하는 '계약방식지원'으로 대학연구비를 지원한다.
연구자본주의에 의한 변화는 다소 자의적인 기초-응용-개발의 구분이 아니라 연구비를 지원하는 방식에 있다. 정부의 대학 연구 지원 방식은 주로 경쟁에 의해 이루어지는 계약 방식 지원(Contractbased Funding)과 일반교부금(General University Fund)으로 나뉜다. 일반교부금은 대학의 연구 및교육 활동을 지원하기 위해 특별한 용처를 지정하지 않고 주로 총액 지원(Block Grant)으로 이루어지는데 비해 계약 방식의 지원에서는 특정 프로젝트나 서비스 수행 계약을 체결하고 해당 비용을 지급한다. 경쟁적 연구비 배분은 특정 계약에 집중하므로 관리가 용이하고 선정과 평가 과정에서의 시장적 접근 방식을 통해 연구재원의 선택과 집중을 강화할 수 있다.