국건영 자료는 환자가 실제로 본인부담으로 비용처리한 지출내역을 확인할 수 있지만 회상에 근거한 것이라 정확한 비용 파악이 힘들고 외래의료이용 및 건강보험공단의 급여비도 파악이 힘들다.
국건영 자료는 입원, 외래, 치과, 한방, 의약품 구분이 가능하며 각각에 대하여 실제 환자가 지출한 본인부담비용을 확인할 수 있다. 그러나 건강보험공단에서 부담한 급여비는 파악이 어렵다. 또한 외래의료이용의 경우 최근 2주로 한정하고 있어 월간, 연간 단위로 비용을 산출하는데 제한이 있다. 또한 의료비 지출 자료가 영수증에 근거한 것이 아니라 회상에 근거함으로써 정확한 비용을 확인하기 어렵다. 한편 2001년 조사의 경우 이환여부에 대해 질문한 후 해당 질환에 대해 의료이용 및 비용을 조사하였으나 다른 기간에 수행된 연구에서는 이환여부와 별도로 의료이용을 설문하여 응답한 비용이 응답자가 앓고 있는 어떤 질환에 해당하는 비용인지 파악하기 어렵다(정영호, 2007).