종균생산은 대량생산과 소규모 농가로 구분해 기술을 적용할 수 있도록 맞춤형 종균생산기술을 개발했다. 대량생산에서는 액체상태로 종균생산을 하도록 개발했고, 소규모 농가대상은 톱밥을 이용하는기술을 실용화시켰다.
먼저 종균(씨앗)생산은 대량생산을 목적으로 하는 농가와 소규모로 생산할 수 있는 농가를 구분하여 농가들의 생산 규모에 알맞은 기술을 적용할 수 있도록 맞춤형 종균생산기술을 개발하였다. 대량생산에 적합한 기술은 액체 상태에서 종균을 생산할 수 있는 기술로 필요한 재료들은 일반 농가 현장에서 쉽게 구입할 수 있는 흑설탕, 볶음콩가루, 감자추출물 등으로 이에 대한 최적의 농도를 밝혀 재배기간을 20일 정도 단축할 수 있어 경영비를 절감할 수 있었다. 소규모 농가를 대상으로 한 종균생산기술은 톱밥을 이용한 제조기술로 필요한 재료의 톱밥과 톱밥재료에 적합한 영양원을 선발했는데 참나무톱밥을 사용할 때는 영양원으로 미강을 혼합하고, 포플러톱밥을 사용할 때는 밀기울을 사용하는 흑목이버섯 전용 톱밥종균을 개발하여 실용화하였다.