해외 혁신 조사에는 제조업와 서비스업이 통합된 통계가 포함되지만, 한국 혁신 조사에서는 이를 분리해 수행하고 있어 OECD나 UNESCO에 통계를 제공할 때는 두 부문을 통합한 지표를 따로 도출하여 제공하고 있으므로 국제 혁신 통계를 이용할 때도 주의해야 한다.
이러한 분리 수행 전략은 현재로서는 한국 혁신 조사에 국한된 것이기 때문에, 국제 비교를 위해 OECD 나 UNESCO 등에 통계를 제공할 때에는 두 부문을 통합한 지표를 별도로 도출하여 제공하고 있으며, 따라서 국제 혁신 통계를 이용할 때에는 이점에도 주의해야 한다. 이로부터 비롯되는 가장 큰 국제 비교 이슈는 이 구조로 인해 한국의 혁신 통계가 과소 추정될 우려가 있다는 점이다. 해외 혁신 조사의 경우 ‘product or service innovation’을 제조업과 서비스업에 공히 묻고 있기 때문에, 가령 제조업에서 수행한 서비스 혁신이나 서비스업에서 수행한 제품 혁신도 통계에 포함된다. 주력 제품을 기준으로 산업은 구분된다 하더라도 한 업체가 제품 생산과 서비스를 공히 수행하는 경우는 흔히 있기 때문에, 제조업체의 서비스 혁신과 서비스업체의 제품 혁신은 원칙적으로 일어날 수 있다. 그런데 한국 혁신 조사에서는 이러한 경우를 구조적으로 배제하고 있는 것이다.