연구개발 직접재정지원 수단으로는 지원금, 보조금, 정부구매 등이 있는데, 이러한 직접적인 재정 지원금은 신생기업의 연구 지원에 효과적이다. 하지만 어떠한 재정지원이라도 까다로운 요건 하에 이루어 져야 할 것이다. 기업의 연구성과는 기관이 나서서 투자의 질을 판단하기 어렵고 연구개발을 가이드하는 것도 올바르지 못하기 때문에 스타트 기업들의 자금을 확보하는데 간접 재정수단도 고려해 보아야 할 것이다.
연구개발에 대한 직접재정지원 수단으로는 연구지원금(contracts, grants), 임무지향적 연구개발에 대한 보조금(subsidies), 정부구매(government procurement)등이 있는데, 이러한 재정지원 수단은 과학연구와 임무지향적 연구 외에 특히 혁신 과제를 시작하는데 있어서 당장의 자금이 부족한 신생기업의 연구개발을 촉진하는데 보다 효과적이다. 그러나, 어떤 직접재정지원도 자동적 지원이 되어서는 안되고 경쟁적이고, 객관적이고, 투명한 기준에 따라 이루어져야 한다. 연구개발에 대한 간접재정지원 수단인 조세지원은 시장기반적인 제도로서 기업이 시장메카니즘 속에서 혁신을 위한 과제를 발굴하여 연구개발을 수행하는데 지원함. 이에 따라, 특정 정책의도와는 중립적인 기능적 정책으로 작용하여 특정 정책의도를 가진 직접재정지원 수단을 보완할 수 있다. 연구개발은 어떤 과제가 종료되었다 하더라도 당장 시장에 출시할 수 있는 신제품이나 신공정을 만들어내는 경우는 거의 없고 오랜 기간이 경과한 후 불확실하게 이의 실현을 기대할 수 있다. 이러한 연구개발의 특성으로 인해 자금지원 기관이 기업의 연구개발투자의 질을 판단하기는 어렵고 연구개발을 가이드 하는 직접 개입도 적절치 못하다. 더욱이 기업은 연구개발의 불확실한 결과(outcome), 적절한 정보를 모두 노출하는 것을 꺼리는 경향이 있는데, 이에 따라 특히 소기업과 신생기업(start-ups)은 연구개발투자 자금을 확보하는데 신용이 제약되는 문제도 발생하여 이를 간접적인 재정수단으로 보완하지 않으면 안된다.