Funnel plot에서는 선택비뚤림, 참 이질성, 자료의 불규칙성 등으로 인한 비대칭성이 발생할 수 있다. 따라서 무엇이 비대칭성을 일으켰는지 탐색해보는 것이 중요하지만, funnel plot이 비대칭적이라고 해서 반드시 비뚤림이 있었던 것은 아니라는 점을 주의해야 한다.
Funnel plot에서 비대칭성은 출판비뚤림을 포함한 다양한 요인에 의해 발생될 수 있다. Egger에 따르면 funnel plot의 비대칭성의 요인은 다음과 같다(Egger et al., 1997). 첫 번째는 선택비뚤림이 funnel plot의 비대칭성을 발생시킬 수 있다는 것이며, 선택비뚤림에는 출판비뚤림(publication bias)과 위치비뚤림(location bias)이 있다. 출판비뚤림은 연구결과의 특성이나 방향에 따라 연구의 출판여부가 달라진다는 비뚤림이며, 위치비뚤림은 연구결과의 특성이나 방향에 따라 표준 검색 데이터베이스에 색인되거나 접근의 용이성이 달라 발생하는 비뚤림이다. 또 다른 비대칭성의 요인으로는 참 이질성(true heterogeneity)이 있다. 이질성은 연구 크기에 따라 연구효과 크기가 달라진다는 비뚤림으로 치료효과의 강도나 기저 위험 수준의 차이 등에 의해 발생할 수 있다. 세 번째 비대칭성의 요인으로는 자료의 불규칙성으로(data irregularities) 작은 규모의 연구설계가 대규모 연구설계에 비해 연구 방법론의 수준이 낮은 경우 흔하게 발생하며 분석을 잘못한 수행한 경우에도 발생할 수 있다. 이 외에도 인위적이거나(artefact) 우연에 의해서도 funnel plot의 비대칭성이 발생할 수 있다. 이러한 요인을 확인하기 위해서는 <그림 4>와 같이 모든 연구를 funnel plot 상에 그리되 서로 다른 특성으로 분류하면 비대칭을 원인을 탐색하는 데 도움이 된다. 그러므로 상기의 가능한 발생 요인을 탐색해보는 과정이 중요하며 funnel plot이 비대칭적이라고 하여 비뚤림이 발생했다고 단정해서는 안 된다.