생명윤리자문위원회의 법안 초안에 대해서, 생명공학연구원은 체세포복제 연구의 허가를 요구했고, 바이오 관련 단체는 생명의료기술발전에 지장을 가져올 것이라고 비판했다.
시민단체나 종교계에서 옹호하는 생명윤리 관련 법안들이 발표되었을 때 생명공학계와 의료계의 비판도 만만치 않았다. 2001년 5월 22일에 생명윤리자문위원회가 법안의 초안을 발표하였을 때, 한국생명공학연구원에서 300여명의 연구원들이 체세포복제 연구가 허용되어야 한다는 성명을 제출하였고, 15개 생물학과 불임협회에서도 이 초안을 비판하는 내용의 성명을 발표하였다. 전경련의 바이오산업위원회 한국바이오산업협회, 한국생명공학연구조합은 공동성명서에서 생명윤리법의 취지에는 동의하지만 정부법안이 너무 엄격해서 생명의료기술발전에 큰 장애가 될 것이라고 비판하였다.