예방접종도 건강검진과 마찬가지로 성인 기준으로 접근이 되어 사전예방원칙에 따라 아동으로 접종대상이 확대되어 왔다. 해방 후 부터 각종 질병에 대한 접종이 분리, 도입, 제외되면서 현재는 총 14종 전염병에 대한 예방접종을 실시하게 되었다.
그러나 예방접종도 건강검진과 마찬가지로 성인 기준으로 접근이 되어사전예방원칙에 따라 아동으로 접종대상이 확대되어 왔다. 해방 후 1954년 전염병예방법이 처음 제정되면서 두창, 디프테리아 등 7종의 전염병(Smallpox, Diphtheria, Pertussis, Typhoid fever, Typhus fever,Paratyphus, Tuberculosis)에 대한 예방접종이 정기 예방접종으로 지정되었고 이후 2004년까지 국가 예방접종은 정기예방접종(NIP, nationalimmunization program) 과 임시 예방접종(SIA, supplementaryimmunization activity) 으로 분리되어 관리, 1976년에서 2000년에 걸쳐서 홍역, 폴리오를 포함한 6종 전염병(Cholera, Tetanus 1976년,Measles, Poliomyelitis 1983년, Hepatitis B 1995년, Mumps, Rubella2000년)에 대한 예방접종이 정기예방접종에 도입되었고 발진티푸스, 파라티푸스 등 4종 전염병에 대한 예방접종이 정기 예방접종에서 제외되었다.1997년 13개 예방접종대상 전염병의 표준 예방접종 지침을 보급하면서 예방접종 사업의 체계가 마련, 2005년 수두 백신이 국가 필수 예방접종에 도입되면서 현재와 같이 총 14종 전염병에 대한 예방접종을 실시하게 되었다.