정부는 핵연료 관리 대책을 통해 안전성을 최우선적으로 하고, 공론화를 통해서 위원회 권고사항을 반영하여 부지 선정 및 투자 계획을 수립하여 건설에 착수할 예정이다. 
2012년 11월 발표한 정부의 사용후 핵연료 관리대책 추진계획(안)에 따르면, 향후 사용후 핵연료 관리 대책을 수립함에 있어 안전성을 최우선적으로 고려하고, 중·단기 및 장기 관리 대책으로 구분하여 순차적으로 수립하며, 지역 주민과 미래 세대가 감수해야 하는 사회적 부담에 대해서는 국민이 공감할 수 있는 수준에서 지원 대책을 마련한다는 관리 대책 수립 방향을 제시하고 있다. 공론화는 토론회, 설명회, 공청회 등 다양한 논의 프로그램을 통해 대국민 공론화를 추진하게 되며, 논의 주제는 사용후 핵연료 관리 방식, 부지 선정 방식, 유치지역 지원방안 등이 될 것으로 예상하고 있으나, 공론화 위원회가 독립성과 책임성을 가지고 공론화를 진행한다는 원칙에 따라 공론화 위원회가 결정하여 추진하는 것으로 하고 있다. 공론화 이후 정부는 2014년까지 공론화 위원회 권고사항을 최대한 반영하여 부지 선정 계획 및 투자계획이 포함된 “방사성폐기물 관리 기본계획”을 수립하고, 동 계획에 따라 부지 선정 절차 및 건설에 착수할 예정이다.