건강보험가입자와 의료급여자의 비교를 보면 입원이용에 있어서는 보험가입자의 비율이 높게 나타나고 복합질환에서는 건강보험가입자보다 의료급여자의 여자에게서 비율이 높게 나타났다.
외래환자와 유사하게, 입원환자에서도 복합 형태와 관계없이 모든 유형에서 건강보험 가입자의 입원이용이 높았다. 건강보험가입자와 의료급여자 집단 내에서의 복합질환 유형별 현황을 보면, 두 집단 모두에게서만 성비복합질환자의 비율이 각 86.7%, 61.5%로 높게 나타났다.  건강보험 가입자의 경우 만성복합질환자가 8.4%로 그 다음으로 높은 비중을 차지한 반면, 의료급여자의 경우 정신비복합질환자가 18.2%로 높은 비중을 차지하는 것으로 나타났다. 또한, 건강보험가입자보다 의료급여자에게서 만성복합(8.4% vs 13.6%), 정신복합(0.17% vs 1.25%), 만성과 정신복합(1.1% vs 5.5%)의 복합질환 비율이 높게 나타났다.