토양온도는 작물이 재배되거나 재배되지 않더라도 조절된다. 토양온도는 종자 발아에 중요하며 깊이 15~30cm 토양은 외부 기온에 영향을 받고 온도가 높으면 물과 양분이 부족하다.
토양온도는 작물이 재배되는 동안에는 토양 표면을 덮고 있는 작물의 지상부와 덮어씌우는(피복) 재료에 의해서 조절된다. 작물이 재배되지 않는 동안에는 수확 후 남아 있는 잔재물이나 토양갈이(경운)의 여부에 따라 영향을 받게 된다. 종자가 토양에서 싹을 틔우기 위해서는 알맞은 토양온도가 유지되어야 하는데, 보리나 밀과 같은 종자들이 발아하기 위해서는 일정 기간 차가운 온도 상태를 거쳐야 하는 경우도 있다. 작물의 뿌리가 대부분 분포하고 있는 15~30㎝ 깊이의 토양은 외부의 기온에 의해 많은 영향을 받고 있다. 온도가 높으면 식물 잎을 통한 물의 증발이 많아지면서 물과 양분이 부족하게 될 수도 있다.