해양환경관리의 궁극적 목적은 해양의존형 경제활동을 유지에 기여하는 것으로 새만금 개발사업이 해양환경에 미치는 영향을 진담함과 동시에 연안경제활동에 영향평가도 중요하다. 연구개발사업은 해양경제활동과 관련한 대책 마련과 이행에 기여할 수 있을 것이다. 
한편 해양환경관리의 궁극적 목적은 환경관리 항목의 목표를 달성하는 것이 아니라, 해당 지역사회의 지속가능한 발전과 밀접한 관련이 있는 해양의존형 경제활동을 유지(anti-degradation)하는 데 기여하는 것임을 주지할 필요가 있다. 예컨대 해양생태계 변화와 관련하여 어류치사를 유발하는 맹독성 유해성 부유생물(Pfiesteria shumwayae)의 적조가 새만금 외해역 남측에 서 관측되고 있어 수산업 및 관광에 큰 영향을 줄 가능성이 있다. 따라서 새만금 지역 개발사업이 해양환경에 미치는 영향을 진단하는 것과 병행하여, 해양환경의 변화가 지역 연안경제활동에 주는 영향의 내용과 정도를 평가하는 것도 중요하다. 이 연구개발사업의 성과가 정책결정을 지원하는 데 활용된다는 것은 환경관리 외에도 환경상태와 밀접한 관련이 있는 수산업, 해양관광 등 해양경제활동과 관련한 대책을 마련하고 이행하는 데 기여할 수 있음을 함의한다.