독립형 소프트웨어는 범용 하드웨어 환경에 설치되는 의료기기 소프트웨어로, 각 환경(운영체제)에 알맞게 개발된다. 즉 하드웨어 환경/조건에 따라 그 특성이 다르므로, 사용자가 직접 설치한다면 이에 대해 정확한 정보를 알고 진행해야 한다.
독립형 소프트웨어는 특정 하드웨어에 종속적이지 않으며 범용 하드웨어 (예 : 데스크탑 PC 등) 환경에 설치되어 사용되는 의료기기 소프트웨어를 말한다. 일반적으로 독립형 소프트웨어는 운영체제에 의해 구동되는 컴퓨팅 환경에 적합하도록 설계, 개발된다 독립형 소프트웨어는 범용적인 하드웨어 환경에서 구동되기 때문에 하드웨어적인 영향을 크게 받지 않는다 따라서 독립형 소프트웨어의 특성을 정확히 이해하기 위해서는 소프트웨어가 설치되어 사용되는 범용적인 하드웨어 환경 및 조건에 대한 범위를 확인하여야 한다 그리고 독립형 소프트웨어가 사용자에 의해 설치되는 경우 설치에 대한 정확한 정보가 제공되어야 한다. 이러한 유형으로는 의료영상전송처리장치(PACS) 모바일 의료용 앱과 같은 형태의 의료기기 소프트웨어가 이에 해당할 수 있으며, 제품의 특성에 따라 설치, 삭제 및 변경 등이 용이하다.