질병비용 연구에서는 분석관점이 크게 문제가 되지 않으며, 사회적 관점을 주로 취하는 것으로 나타났다. 불확실성에 있어서도 관대한 편이라 생산성 손실비용을 중요하게 보는 것으로 보인다.
한편 질병비용 연구에 있어서는 경제성분석 연구에서 만큼 분석관점이 큰 쟁점이 아니다. 일반적으로 질병비용 연구에서 포괄적으로 비용항목을 포함하고자 하기 때문에 사회적 관점을 채택하는 경우가 많았다. 또한 의사 결정과 직접적으로 관련되지 않은 경우가 많아 불확실성 문제에 보다 관대한 편이다. 따라서 경제성 분석에서 보다 생산성 손실비용을 중요한 비용항목으로 고려하는 것으로 확인되었다. 다만 자료원의 한계 등으로 의료비용만 한정할 경우 연구방법에서 이를 명시하여 제시하고 있었다. 한편 질병비용 연구에서는 비용효용분석에서 야기되는 이중계산의 우려가 낮아 시간비용과 이환비용의 구분을 하지않고 통합하여 제시할 수 있다.