한신 아와지 지진으로 인한 총 피해액 중 항만관련 손실규모는 직접피해규모만 약 1조~1조 400억엔에 달한다고 효고현 추계결과에서 밝히고 있다. 
효고현(兵庫県) 추계결과에 따르면 한신(阪神) 아와지(淡路) 지진으로 인한 총 피해액 9조 9,268억엔 중 항만관련 손실규모는 간접피해를 제외한 직접피해규모만 약 1조~1조 400억엔에 달하는 것으로 추정되었다. 지진 직후 고베세관 관내 수출입총액을 보면, 재해 발생 직후인 1995년 수출입총액이 전년 대비 38.9%의 대폭적인 감소를 기록한 가운데 1996년에는 전년 대비 49.9% 감소하였다. 1997년에는 재해 전 수준을 초과했으나 그 이후에는 화물증가세 둔화가 지속되었으며 일본 내 점유율도 재해 전 수준까지 회복하지 못하였다.