병해충 전염우려물품에 대한 검역조치가 시행된 이후 그 대상이나 기준 등이 명확하지 않아 검역 건수가 현저하게 줄어든 실정이다.
그 결과 2017. 10. 16. 병해충 전염우려물품에 대한 검역조치를 시행한 이후 2018. 9. 19. 현재까지 해당 기간 동안 수입된 병해충 전염우려물품 84,345건 중단 236건(0.28%)46)만 검역이 실시된 것으로 확인되는 등 2017년 중 식물검역대상물품은 모든 수입 건(458만여 건)에 대하여 검역이 실시된 것에 비하여 병해충 전염우려물품의 검역은 검역대상의 선정기준이나 횟수 등도 명확하게 정해져 있지 아니하다는 사유로 각 지역본부는 한 달에 2～3회 검역장소(컨테이너터미널) 담당자나 보세창고 관리인 등으로부터 병해충 전염우려물품 반입목록을 송부받아 일부 병해충 전염우려물품에 대하여만 검역을 실시하고 있었다.