시장영역과 기반기술영역이 합쳐지면 높은 수준의 정부 R&D 사업군이 될 수 있다. 이렇게 만들어진 R&D 사업군은 단독 연구조직이나 연구기관으로 조직화 될 수 있으며 전문화와 다각화의 분류가 가능할 것이다. 
이러한 과정을 거쳐 설계된 정부 R&D사업 아키텍처의 모습은 일반적으로 [그림2-11]과 같이 시장 관점과 기술 관점이 결합된 일종의 매트릭스형 사업구조가 될 것이다(이민형 외, 2013). 시장관점은 현재의 세분화된 시장구조를 반영하는 것이고, 기술관점은 각 세분화된 시장영역들을 공통적으로 지원할 수 있는 이른바 기반 기술들을 반영하는 것이다. 각각의 시장영역들과 기반기술영역들이 가장 기본적인 R&D사업의 단위가 될 수 있으며, 이들 시장영역들과 기반영역들의 집합이 R&D사업의 효율적 추진을 위해 설계된 보다 상위 수준의 R&D사업군(群)이 될 수 있을 것이다. 이와 같이 형성된 R&D사업군은 필요에 따라 독립적인 연구조직 또는 연구기관으로 조직화되는 것이 가능하다. 적정 범위의 시장영역 내에서의 기술협력은 기술융합으로 간주될 수 있으며, 동일한 기술이 여러 시장 영역의 기반(platform)이 되는 경우에는 산업융합으로 간주될 수 있다. 그리고 이러한 기준에 따라 전문화와 다각화의 구분이 가능하다.