자율관리어업이 수산자원 관리를 못하고 어장청소에 주력하는 모습을 보인다. 내실화도 필요하지만 수산자원의 관리를 보완해 소비자 참여형 수산자원관리의 도입이 필요하다. 
자율관리어업이 양적인 성장에서는 성공하였지만 실효적인 수산자원 관리를 선도하지 못하고 있다. 제3세대 수산자원관리라 할 수 있는 자율관리어업이 우리나라에 도입된 지 15년이 지난 시점에서 보면, 자율관리는 이미 크게 감소되어 회복까지 많은 비용과 노력이 필요한 수산자원에 대한 관리 유인이 불완전하여 어업인 공동체가 본래의 기능을 수행하지 못하고 손쉬운 어장청소 에 주력하고 있는 모습을 보이고 있다. 따라서 자율관리어업의 내실화도 필요하지만 계속 줄어들고 있는 수산자원의 관리를 보완하기 위해서는 세계적인 추세 속에서 확산되고 있는 소비자 참여형 수산자원관리의 도입이 필요하다.