평가의 핵심은 평가 대상이 되는 연구과제의 궁극적 목표 달성인데, 논문 창출 게재가 연구과제의 궁극적 목적이었는지를 살펴봐야 한다. 이는 평가가 단순히 논문 건수라는 정량적 평가로 이루어 질 수 없음을 의미한다.
이러한 평가 문제를 해결하는 것도 쉽지 않은데, 더 나아가서 논문 창출 게재가 해당 기초연구 과제의 궁극적인 목적이었는지를 살펴봐야 할 것이다. 평가의 핵심 사안은 평가 대상이 되는 연구과제의 궁극적인 목표 달성(궁극적 성과 즉 outcome달성) 여부를 판단하는 것인데 세계적 논문을 창출했다고 해서 궁극적인 목표를 달성했다고 볼 수 있느냐 이다. 궁극적인 목표를 달성했는데 그 궁극적 목표 달성의 과정에서 해당 논문이 산출된 것인지, 궁극적 목표를 달성한 성과를 논문으로 표현하여 해당 논문을 게재한 것인지, 혹은 궁극적 목표는 달성하지 못했지만 논문을 산출될 수 있기 때문에 궁극적 목표 달성 없이 논문을 산출한 것인지를 평가해야 할 것이다. 이러한 평가는 단순히 논문 건수라는 정량적 평가로는 이루어질 수 없다.