국내 물 관련 국가계획 및 계획상의 핵심지표에 따르면 많은 계획이 중복되는 영역을 포함하고 있을 여지가 있었으며, 실제 부처 간 계획 수립 시 책임범위 및 영역이 분명하지 않고 업무의 협력이 필요한 부분이 유기적으로 연결되지 않아 업무의 중복이 일어나고 있다.
앞선 국내 물 관련 국가계획 및 계획상의 핵심지표를 살펴본 바에 따르면 현재 많은 계획이 중복되는 영역을 포함하고 있을 여지가 큰 것으로 나타났다. 수량을 예측하고 확보하는 수자원 장기종합계획의 경우, 수량과 직접적으로 연계되는 수질에 대한 항목이 거의 포함되고 있지 않으며 환경부 소관의 물환경관리기본계획과의 연계성도 적었다. 따라서 부처 간 계획 수립시 책임범위 및 영역이 분명하지 않고 업무의 협력이 필요한 부분이 유기적으로 연결되지 않아 업무의 중복이 일어나고 있다. 업무범위의 모호성과 중복은 동일한 지표항목에 대해 각 지표의 목표를 설정함에 있어서 계획별로 서로 다른 목표치를 제시하는 경우도 확인되었다(서울연구원 외, 2013). 한강대권역 물환경관리기본계획(2006~2015)에서는 팔당댐(팔당댐2) 2015년 목표수질(BOD)을 Ⅰa등급(1mg/L) 이하로 설정하였으나 동일한 지역에 대해 한강수계 수질오염총량관리 기본계획에서는 2020년까지 1.1mg/L로 더 낮은 수준의 수질로 설정하였다. 또한 한탄강(한탄B) 지역에 대해서도 앞의 한강대권역 물환경관리기본계획은 Ⅰb(2mg/L) 이하로 설정하였으나 한강수계 수질오염총량관리 기본계획은 3.3mg/L로 설정하였다.