주요사업 평가를 위해 장기적인 관점에서의 외부 전문가 활용, 수탁과제 결과의 개인평가 반영, 우수 성과 선정을 통한 인센티브 방안 등이 필요하다.
주요사업 평가 시 외부 전문가 활용이 이벤트성 활동이 되지 않도록, 사전에 결과 보고서 등 자료 제공, 다회의 토론식 평가로 실시하는 것이 필요하다. 장기적으로는 수탁과제의 결과도 개인평가에 반영하고 기관 목표에 부합하는 수탁과제만 수행할 수 있도록 하며, 기관차원에서 수탁과제의 결과를 개인평가에 반영하기 위한 평가위원회를 운영할 수 있다. 예를 들어, 수탁기관에서는 과제의 평가지표를 양적지표 등으로 측정하였더라도, 기관차원에서 성과의 우수성, 사회적 영향 등 정성적 고려를 통해 평가 등급을 도출하고, 그 결과를 참여 연구원 개인평가에 반영한다. 수탁사업도 성과를 창출하기 위한 과정이므로, 평가위원회의 토의를 통해 수탁사업 성과 중 우수한 성과를 선정하여 가점 부여 등 인센티브 방안 검토할 수 있다.