HTA는 많은 예산이 투입되는 프로그램으로 사안별 우선순위에 따라 최종 주제가 결정된다. 평가대상은 의료 관련 주제로 다양하며, 연구 방법론은 대표적으로 문헌고찰, 경제성 분석, 메타분석 등이 있다. 
그 중에서도 HTA은 가장 많은 예산이 투입되는 프로그램으로 효율적인 NHS 운영을 위한 근거마련을 위해 환자에서부터 전문가까지 누구나 연구주제를 제안 할 수 있으며, 사안별 우선순위에 따라 최종 주제가 선정되며, 새로운 의학적 해결책(healthcare solution)의 효과와 효능 그리고 경제성 등을 검증하기 위해 수행되고 있다. 평가대상은 의료행위(procedures), 의약품(drugs), 의료기기(devices), 진단검사(diagnostic test), setting of care, 검진프로그램(screening programmes) 등 다양하며, NIHR의 재정지원과 관리감독을 받고 있는 독립연구기관을 통해 특성화된 분야를 중심으로 체계적 문헌고찰, 경제성 분석, 메타분석, 비교효과분석, 무작위대조임상시험(Randomised Controlled Trials; RTC), 비무작위실험(non- randomised trials), 코호트 연구 등의 방법론을 활용하여 수행하고 있으며, 국제연구(international studies)와 같은 국가간 협력을 통해서도 의료기술평가를 진행하고 있다.