의료행위의 평가 결과는 매우 복잡한데, 먼저 평가 대상 여부 분류 후 안전성과 유효성 기준의 평가절차를 거쳐 신의료기술과 연구단계 기술로 구분한다. 이 중 신의료기술로 인정된 의료행위만 시장 진입이 가능하며, 연구단계 기술은 기준에 따라 등급 분류 후 제도적 지원 여부가 결정된다. 2007~2012년까지 총 1,123건의 신의료기술평가 신청 중  363건만이 신의료기술로 인정되었다.
의약품, 의료기기의 시장 진입 결정이 가능 또는 불가능의 두 가지 중의 하나로 판정되는 것에 비해 의료행위의 평가 결과는 더 복잡하다. 먼저 ‘신의료기술평가’ 신청이 이루어지면 평가 대상인지에 대한 심의가 이루어지는데, ‘조기 기술’ (안전성, 유효성을 평가하기에 근거가 아직 부족한 상태의 기술) 또는 ‘기존 기술’ (건강보험 급여 또는 비급여로 인정된 기존 기술과 동일하거나 유사한 기술)로 분류되는 경우 평가 비대상이다. 평가 대상이 된 의료행위는 안전성, 유효성을 평가절차를 거처서 신의료기술(안전성, 유효성이 입증된 기술) 또는 ‘연구단계 기술’ (안전성, 유효성이 확인되지 않는 기술)로 다시 구분된다. 여기서 ‘신의료기술’로 인정된 의료행위만 사실상 시장 진입이 가능하다 (그림 3-1 참조). ‘신의료기술’로 지정될 때는 해당 기술의 사용목적, 사용대상, 시술방법이 고시된다. 이는 의약품이나 의료기기의 시판허가에서 이루어지는 적응증, 사용방법에 해당한다고 할 수 있다. ‘연구단계 기술’은 잠재적 이익, 대체기술 존재여부, 임상지원의 필요성 여부 등의 기준을 통해 Ⅰ등급, Ⅱ-a등급, Ⅱ-b등급으로 구분되며 Ⅱ등급으로 분류된 기술은 연구를 통해 안전성, 유효성에 관한 근거를 더 생산하기 위한 제도적 지원이 이루어진다. 2007~2012년까지 ‘신의료기술평가’ 신청은 총 1,123건 이루어졌으며, 그 중 560건은 ‘신의료기술평가’ 대상이 아닌 것으로 결정되었고 518건이 평가 대상으로 결정되었다. 평가가 완료된 489건 중 ‘신의료기술’로 인정된 기술은 총 363건이었다 (표 3-1, 2 참조).