지방식품의약품안전청은 특별법에따라 수입식품 관련업에 대해 등록을 의무화하여 관리하고, 문제발생 우려가 있는 수입수산물에 여러 검사를 수행 통관 등 조치를 한다.
이를 구체적으로 보면, 지방식품의약품안전청은 ｢수입식품안전관리 특별법｣에 따라 ‘수입식품 수입·판매업’, ‘수입식품 등 신고 대행업’ 등에 대하여 등록을 의무화하여 지도·점검하는 등 관리하고 있고, 수입신고 시에는 기준 적합 여부를 확인할 필요성이 있거나 위생상의 위해가 발생할 우려가 있는 수입수산물 등에 대하여 [그림 8], [표 10]과 같이 서류검사, 현장검사, 정밀검사, 무작위표본검사를 수행하고 적합 판정 시 ‘수입신고확인증’을 발급하여 해당 수산물을 통관시키는 한편 부적합 판정 시에는 반송, 폐기, 용도변경 등의 조치를 하고 있다.