전염병, 생화학 테러 등의 문제가 이슈가 되며 소셜 시뮬레이션을 이용한 감염 상태 전이 관련 연구, 질병이나 전염병 확산을 막는데 사용되는 방법들의 효과성 분석 연구 등 이슈와 관련된 다양한 연구들이 수행되고 있다. 
최근 전염병, 생화학 테러, 방사능 확산 등과 같은 문제가 사람들의 관심사로 떠오르면서 다양한 관련 연구들이 수행되고 있다. 예를 들어, Rahmandad와 Sterman (2008)는 소셜 시뮬레이션을 이용하여 기존의 감염 상태 전이 관련 연구를 수행하였고, Huang et al. (2004)은 중증급성호흡기증후군(SARS)의 전염 모형을 개발; 질병의 전염 과정에 따른 상태 전이와 소셜 네트워크 내에서의 상호작용을 고려한 질병 확산 연구 수행하였다. Longini et al. (2004)은 백신 부재 시 독감 전염 초기에 항바이러스 제의 표적 사용 효과에 대한 시뮬레이션 연구를 시도하였고, Germann et al. (2006)은 질병 혹은 전염병 확산 저지에 사용되는 예: 항바이러스제, 백신, 격리 등의 방법들의 효과성을 분석하였다.