해외인력 대상 단기교육 외에도 국내 원자력공학과를 운영 중인 8개 대학에서 학위과정과 연계되는 중장기 교육을 운영한다. 이론 교육뿐 아니라 전문장비로 실습도 한다. 대표적인 예로 한국 원자력연구원과 과학기술연합대학원대학교의 연계가 있다.
해외인력 대상 단기 교육훈련 과정 외에도, 학위과정과 연계되는 중･장기 교육과정도 운영되고 있다. 국내 원자력공학과를 운영 중인 8개 대학의 정규과정 외에도 주요 기관과 대학이 연계된 학위과정이 운영되는데, 이들 교육과정은 이론적 교육뿐만 아니라 전문기관의 실험실습 장비를 활용하여 실무적 경험도 제공하여 주목을 받고 있다. 한국 원자력연구원은 과학기술연합대학원대학교(University of Science and Technology : UST)와 함께 연계 학위과정을 운영하고 있다. 한국 원자력 안전기술원은 국제 원자력 안전학교 차원에서 한국 과학기술원(KAIST)과 함께 원자력 안전 석사과정을 공동으로 운영하고 있다. 한전 원자력대학원대학교(KINGS)는 설립부터 원전 공학과 원전 관리의 2개 전공을 개설하고, 영어로 모든 강의를 진행하는 등 해외 교육 전문대학으로 자리매김하고 있다.