방조제 공사 후, 시화호에 출현한 종들 중, 외해의 것들과는 상관이 없는 것들이 있었다. 시화호 저서동물 집단은 저층의 오염상황을 잘 나타내고 있었다.
방조제 공사 이후 시화호에서 출현한 대부분의 종들은 시화 외해역에는 존재하지 않는 종들이었다. 즉, 시화호 저서동물 군집은 외해의 그것과는 단절되어 있었다(그림 4-40). 시화호 내해역 저서동물의 공간적인 분포는 시화호 저층환경 오염구배를 잘 반영하고 있었다. 빈산소층이 확장 형성되는 여름철 동안에는 시화호 중앙해역 및 내해역의 생물이 출현하지 않는 무생물 군집(정점군 A), 저층 산소환경이 악화되기 전 혹은 후의 시화호 특성종인 두줄박이참갯지렁이와 얼굴갯지렁이류(P. ligni)가 우점하는 군집 (정점군 B), 그리고 계속된 외해수와의 해수교환으로 저층환경 개선이 일부 진행되고 있는 갑문해역의 긴자락송곳갯지렁이(Lumbrineris longifolia)로 대표되는 군집(정점군 D)이 시화호 저서동물 군집을 구성하고 있었다. 그리고 외해역의 저서동물군집(정점군 E)은 시화호 내측과는 확연이 구분되는 조성을 보였다.