R&D 생산성은 사업의 구조, 해당 기술의 속성, 조직의 특성과 기타 요인들로 결정된다. 사업 구조는 규모와 경제효과 실현을 위해 중요하고, 해당 기술의 속성과 조직의 특성은  R&D 생산성의 차이에 영향을 끼친다. 기타 요인들은 생산성에 영향을 줄 수는 있지만 중요한 영향은 미치지 않는 것으로 나타난다.
즉, R&D 생산성은 R&D 사업의 구조, 해당 기술의 속성, R&D 조직의 특성 그리고 기타 요인들에 의해 결정된다는 것이다. 첫째, R&D 사업 구조 즉 R&D 사업의 조직화는 R&D에 있어 규모 및 범위의 경제효과 실현을 위해 중요하다. 즉, 추진하고 있는 R&D 사업의 범위가 너무 넓거나 좁으면 조정 비용이 많이 소요되거나 파급효과가 적어 규모 및 범위의 경제효과가 나타나지 않으며 그 결과 R&D 생산성이 낮아지게 된다. 둘째, 해당 분야의 기술적 속성에 따라 R&D 생산성에 차이가 있을 수 있다. 예를 들어 산업화가 많이 진전된 영역과 그렇지 않은 영역의 경우 R&D 생산성에 많은 차이가 있을 수 있다. 이는 R&D 생산성을 향상시킴에 있어 분야 또는 분야 내 세부 영역별로 차별화된 목표와 전략이 필요함을 시사한다. 셋째, 해당 국가 또는 기업이 가진 인력 활용의 효율성과 문화적 요인에 따라 R&D 생산성에 차이가 있을 수 있다. 즉 국가와 기업에 따라 조성된 연구 문화 환경이 차이가 있을 수 있으며 이 또한 R&D 생산성에 중요한 영향을 미치게 된다. 마지막으로 R&D 생산성에 영향을 미치는 요인으로 글로벌 경제사회 및 국가별 혁신 환경 등 기타 요인들이 있을 수 있는데 이는 본 연구의 범위를 벗어나는 것이다. 그리고 이들 거시적 요인들은 R&D 생산성 차이에 중요한 영향을 미치지 않는 것으로 평가되고 있다.