HTA 과정에 관여하는 중앙정부 수준의 기관에는 의약품과 의료기기의 판매 허가 책임이 있는 의약품 및 의료기기당국, 주 의회의 활동을 모니터하고 새로 등장한 의료 시술의 임상 가이드라인을 만드는 국가보건사회이사, 직접 HTA를 행하는 스웨덴의료기술평가의회, 치과의약품급여당국이 있다. 
중앙정부 수준에서 HTA과정에 관여하는 기관은 의약품․의료기기당국(Medical Products Agency, Läkemedelsverket, 이하 MPA라고 함), 스웨덴의료기술평가의회(Swedish Council on Technology Assessment in Health Care, Statens Beredning för Medicinsk Utvärdering, 이하 SBU라고 함), 치과의약품급여당국(Dental and Pharmaceutical Benefits AgencyTandvårds-och Läkemedelsförmånsverket, 이하 TLV라고 함), 국가보건사회이사회(National Board of Health and Welfare, Socialstyrelsen, 이하 NBHW라고 함)가 있다. MPA는 의약품 및 의료기기의 안전과 유효성을 평가하여 판매를 허가하는 책임이 있다. 또한 NBHW는 주의회의 활동을 모니터하는 반 독립 공공 기관으로서 주 별로 제공되는 보건의료 서비스를 평가하고, 관련 데이터를 수집하며, 기존 혹은 새롭게 등장한 의료기술 및 시술에 대해 임상 가이드라인을 만든다. 이외에 직접 HTA를 행하는 기관은 TLV와 SBU가 있다.