남양주시 보건소의 많은 지분을 가진 민원 중 하나는 해충 퇴치 작업이었다. 보건소의 퇴치는 많은 효과를 보지 못했지만 남양주시 빅데이터 팀의 GIS로 민원 빅데이터를 사용하여 방제한 결과 효과적인 퇴치작업을 할 수 있었다. 이에 민원 수는 감소했다.
남양주시 보건소의 가장 큰 민원 중 하나는 모기를 포함한 해충을 퇴치해 달라는 요구였다. 보건소에서는 모기나 해충이 주로 알을 낳는다고 알려진 개천이나 물웅덩이, 축사 부근을 중심으로 방역 작업을 진행해왔으나 민원을 줄이는데 큰 효과를 보지 못하였다. 그러나, 남양주시 빅데이터 팀이 민원 위치 발생지 데이터를 정리하여 GIS를 이용해서 지도화한 결과 연립주택이나 원룸 등 저소득층 밀집지에서 대부분의 모기 민원이 발생한 것으로 나타났다. 이 분석 결과를 반영하여 방역 집중 작업 지역에 민원 발생이 집중된 구역을 포함시켰다. 동시에 방역업체의 작업 위치를 보다 정확하게 모니터링하기 위해 GIS 툴을 활용하기 시작하였다. 기존에는 방역업체가 작업 후 찍은 사진을 모니터링했지만, 사진만으로 작업 위치 식별이 어려웠다. 그래서 11개 방역업체에 GPS를 연결해서 사진을 보내도록 지시했고, 이를 GIS 지도의 좌표에 연결하여 작업 위치를 보다 정확히 모니터링하도록 했다. 그 결과 해충 관련 민원, 특히 모기 퇴치 민원이 감소하여 주민들의 생활 편의 증진에 기여한 사례가 되었다(관계자 인터뷰, 2017. 9. 14.; 데이터 기반 도시혁신 포럼, 2017, 10. 17.).