돼지 분뇨의 발효과정에서 악취는 영양분의 불완전한 소화로 배출된 유기물이 미생물에 의해 분해되는 과정에서 발생한다. 돈사 분뇨에 고추냉이분말과 팽이버섯폐지를 악취저감제로 사용한 경우 차이가 있었는데 이는 미생물 집단이 바뀌었기 때문이고, 박테리아 종류의 변화를 통해서 악취 발생에 관여하는 박테리아를 밝혀낼 수 있었다.
가축 분뇨 중에서도 돼지 분뇨의 발효과정에서 발생하는 악취가 큰 문제를 야기하고 있다. 돈사 악취는 영양분의 불완전한 소화로 배출된 유기물이 미생물에 의해 분해되는 과정에서 페놀류, 인돌류, 아민류와 같은 악취 물질이 발생하여 나타나는 현상이다. 돈사 분뇨에 고추냉이분말(powdered horse radish; PHR)을 처리한 결과, 페놀류 발생이 9% 감소하였으며, 특히 p-크레졸 발생이 현격히 줄어들었다. 하지만 인돌류 중 스카톨 발생이 26% 증가하는 현상이 발생하였다. 또한 휘발성 지방산 발생량은 25% 감소했다. 하지만 팽이버섯폐지(spent mushroom compost; SMC)를 처리한 경우에는 페놀류 발생양은 차이가 없지만, 인돌류가 25% 감소하는 것을 확인할 수 있었다. 특히 인돌과 스카톨이 각각 35% 정도 발생이 줄었다. 그러나 짧은 사슬 지방산의 발생량이 40% 많이 발생되는 것이 관찰되었다. 따라서 고추냉이분말과 팽이버섯폐지를 악취저감제로 사용한 경우에는 그 저감 효과 면에서 서로 다른 양상을 보이는 것이 확인되었다. 이러한 차이는 악취저감제 처리에 따라 미생물 집단이 바뀌면서 발생한 것으로 예측되며, 박테리아 종류의 변화를 통해서 악취 발생에 관여하는 박테리아들을 밝혀낼 수 있었다.