GMO 식품에 관해서는 「식품위생법」을 제정해 표시제를 시행하고 있는데, 이는 LMO법에 의거해 제15조를 신설한 것에서 시작되었으며 안전성평가 심사 의무화에 따라 관련 규정이 개정 및 시행되었고 이후 환경위해성 관련 협의 심사와 지속적인 심사 및 행정규칙 개정이 진행되고 있다. 
GMO 농산물을 이용한 식품에 대해서도「식품위생법」제정을 통해 표시제가 시행되고 있다. 유전자재조합식품 등의 안전성 평가에 관한 내용을 담은 제 18조에서 는 안전성평가에 대한 규정과 안전성평가자료심사위원회, 평가 방식 등에 대한 부 분을 「유전자변형식품등의 안전성 심사 등에 관한 규정(식품의약품안전처고시 제 2014-203호)」을 통해 구체적으로 규정하고 있다(국가법령정보센터 홈페이지, 2015). 「식품위생법」에서 GMO 관련된 내용은 LMO 법에 의거하여 제15조 ‘유전 자변형식품의 안전성평가 등’에 대한 조항 신설로부터 시작되었다. 또한 안전성평 가 심사 의무화에 따라 「유전자변형식품의안전성평가심사등에관한규정」(식품의 약품안전청고시 제2003-37호)이 2003년 9월 개정, 2004년 2월에 시행되었다. 2007년 개정을 통해 통합고시(식품의약품안전청 고시 제 2007-78호)를 제정하였 으며, 2008년 1월 1일부터 환경위해성에 대한 협의 심사가 실시되었다. 그 후로 현 재까지 지속적으로 심사규정 및 행정규칙에 대한 개정이 이루어지고 있다(식품의약 품안전처 홈페이지, 2015).