국내 유일 수산업 관련 기후변화 연구 기관인 국립수산과학원 기후변화연구과는 수산 재난 관련 전국적 대응의 어려움과 재난 R&D의 일관성 부재가 문제가 되고 있다. 
국내에서 수산업과 관련된 기후변화를 연구하고 대응하는 기관은 국립수산과 학원 기후변화연구과가 유일하다. 국립수산과학원 기후변화연구과는 수산 재난에 따른 피해에 관한 종합상황실을 운영하고 있으며, 생물다양성 정보 수집 및 관리, 한반도 주변해역 해양환경 변동 연구, 해어황 예보시스템 개발 및 운용방안 수립·시행 등을 수행하고 있다. 기후변화연구과의 경우 적조, 해파리 발생 시 전국 을 대응하기에 한계가 있다. 또한 양식재난 관련 R&D는 해양수산부 내 담당과가 산재해 있어 기술개발을 개별적으로 발주하거나 중복 발주하는 등 일관성 있는 재난 R&D가 이뤄지지 못하고 있다.