우리나라 많은 부처에서는 바이오화학산업 분야에 사업지원과 환경규제를 하고 있으나 일련의 산업화 과정이 체계적으로 진행되지 못하고 있다. 이는 부처간 정합성 없이 분절적 정책이 시행되기 때문이다.
즉, 현재 우리나라는 산업통상자원부·미래창조과학부·농림축산식품부·국토교통부·해양수산부·교육부·환경부 등, 많은 부처에서 바이오화학산업 관련 연구개발 투자에 다양한 사업으로 지원하거나 환경규제를 하고 있다. 하지만 지속적인 연구개발을 통한 원천기술 확보, 전략적인 지식재산권화, 그리고 지식재산에 기반을 둔 효율적인 사업화, 자금조달, 가치사슬 간 연계체제 구축 등 일련의 산업화 과정이 체계적으로 진행되지 못하고 있다. 또 산업진흥 부처와 규제 부처 간에도 정책 간 정합성이 없는 가운데 개별적, 분절적으로 정책이 시행되고 있다. 이는 가치사슬 단계별로 분산되어 있는 부처별 연구개발 지원사업 간 연계가 효율적이고 전략적으로 이루어지지 못하기 때문이다.