어촌공동체의 마을공동사업은 어촌의 활성화, 소득증대, 복지향상 등의 목표로 여건과 상황에 따라 목표를 설정하고 사업을 추진해야 한다. 임원들은 목표를 크게 보는 반면, 일부는 다른 것을 중점으로 하는데 이런 구성원 간 사업목표와 인식의 차이는 자연스럽게 나타나는 갈등 현상으로 볼 수 있다. 
어촌공동체의 마을공동사업은 어촌의 활성화, 소득증대, 복지향상 등의 목표를 가지고 추진되고 있다. 이와 같은 목표를 달성하기 위해서는 어촌의 여건과 상황에 따라 세부적이고 구체적인 목표를 설정하고 사업을 추진해야 한다. 그러나 어촌구성원들의 가치관과 생각 등이 다르기 때문에 달성하고자 하는 목표 역시 달라질 수 있다. 어촌공동체의 중심역할을 하는 마을리더나 임원들은 마을공동사업의 목표를 크게 보는 반면, 어촌공동체 구성원들은 단기간에 효과를 볼 수 있는 목표에 중점을 두는 경우가 많다. 또한 일부 구성원들은 마을공동사업을 통한 마을의 발전 보다는 개인적인 판로확보나 생산성 향상에 목표를 둘 수도 있다. 이처럼 마을공동사업을 추진하고 운영하는 과정에서 구성원 간의 인식차이가 나타난다. 수산물의 판매방식이나 공동사업의 이익배분방식 등을 결정하는 과정에서 어촌구성원 간 인식차이는 분명히 나타나고 있다. 결국, 어촌공동체 구성원 간 사업목표와 인식의 차이는 서로 다른 입장과 가치관을 가진 다수의 사람이 모여 사업을 이끌어가기 때문에 갈등은 자연스럽게 나타나는 현상으로 볼 수 있다.