중국에서 들여온 큰꽃 삽주는 생산량과 씨받이 양이 많아 재배를 선호하나, 역병 등 뿌리썩음병이 많아서 재배 농가에 큰 피해를 줄 수 있다. 아인산염은 방제 효과가 약간 있다고 보고되었으나 철저한 방제에는 한계가 있다.
생산량과 씨받이 양이 많다는 이유로 대부분 국내에서 자생하는 삽주(A.japonica K.)보다는 중국에서 들여온 큰꽃 삽주(A.macrocephala K.)를 재배한다. 큰꽃삽주를 재배할 경우 반드시 검토해야 할 문제 중 하나가 역병 등 뿌리썩음병이다. 큰꽃삽주가 역병 피해가 아주 큰 약초 중 하나이기 때문인데, 특히 여름철 장마기에 병이 급격히 증가해 수확량에 큰 영향을 미친다. 유묘기(幼苗期)의 지상부 잎과 줄기가 변색하거나 말라 죽는 것으로 관찰되며 장마기 이후 고온기에 물빼기가 불량한 지점에서 병이 확대되는 것을 확인할 수 있다. 발병 초기에는 지상부가 시들고 노랗게 변하며, 점차 갈변되어 결국 말라 죽고 심하면 뿌리까지 완전히 썩어서 재배 농가에 큰 피해를 준다. 아인산염을 포기별로 줄 경우 역병 등 흙전염병에 취약한 다른 작물처럼 방제 효과가 약간 있다고 보고되었으나 철저한 방제에는 한계가 있다.