R&D 거버넌스 선진화는 기술분야별 소위원회를 운영하여 관련 전문가들의 토론과 검토를 통해 R&D 프로그램을 제안하는 것을 제도화하는 것이다.
R&D 거버넌스 선진화를 위한 방향은 크게 3가지로 정리할 수 있다. 첫째, 이해당사자들의 참여를 제도화하는 것이다. 예를 들면, 정부연구개발사업에 대한 추진방향 혹은 기획 과정에서 이해당사자들의 참여를 제도화할 수 있다. 민간기업 단체인 협회를 통해 R&D 수요조사를 제도화하거나 협회별로 회원사의 의견을 수렴하여 필요한 R&D과제 제안을 공식화할 수 있다. 그리고 국가과학기술위원회 내에 구성되어 있다. 기술분야별 소위원회를 상시적으로 운영하여 관련 산학연 전문가들이 충분한 토론과 검토를 하여 R&D 프로그램을 제안하는 것을 제도화할 수 있다.