TA 평가는 중립적이고 독립적으로 실행되어야 하기에 민간기관에서 맡거나 독립된 TA 평가 기구를 설립해야 한다.
민간기관에서 전담할 경우 장점은 행정부로부터 직접적인 간섭이나 통제로부터 자유로울 수 있기 때문에 평가의 독립성과 중립성을 확보할 수 있다는 점일 것이다. 서지영(2015)은 특정 부처나 정당의 이해관계로부터 중립적인 TA가 이루어질 수 있도록 독립된 전담기구가 필요하다고 주장한다. 예산은 주로 부처에서 지원받지만 왕립 문화과학원에 소속된 네덜란드 라테나우 연구소나 일종의 재단 형태로 운영되는 덴마크의 DBT가 좋은 예라고 볼 수 있을 것이다. 국내에서는 TA 경험이 있는 시민단체나 한국과학기술한림원, 한국공학한림원과 같은 조직이 고려될 수 있다.