유기물과 독성물질로의 오염이 심각한 지표수-지하수 혼합대를는 부하량이 비대해서 막힘현상을 일으키며, 이때, 퇴적오니층을 만들어지게 한다. 이것은 오염이 발생하게 하고, 결과적으로 여러 프로세스의 균형을 망가뜨린다. 이러한 혼합대의 망가짐은 주변의 환경 문제를 지속적으로 일으키며, 여러 프로세스의 밸런스를 망가뜨려 환경의 순기능 손실을 가져온다. 
예를 들어, 유기물과 독성물질로 오염이 심각한 지표수가 지표수-지하수 혼합대를 거쳐 대수층으로 유입되는 경우에는 오수 부하량이 커서 고밀도의 조류(Algae) 매트가 하상퇴적물 내에서 물유동의 막힘현상(clogging)을 일으킬 수 있으며, 이때 하상퇴적물 상부에 유기물이 침강하여 퇴적 오니층을 형성하게 된다. 이 경우에는 실질적으로 오염이 과부하된 지표수에 의해 지표수-지하수의 수교환의 교란 및 단절이 발생하게 되고 결과적으로 지표수와 지하수의 혼합이 발생하지 않게 되고 생태계를 포함하여 여러 프로세스의 균형을 파괴하게 된다. 사실 막힘현상이 세척현상과 균형을 이루는 것은 자연적인 현상인데, 증가된 유기물질이나 세립토사, 하천 내 토목공사 또는 지나친 강변여과수의 활용 등으로 이러한 균형이 파괴되고 영구적인 막힘 현상을 일으키는 심각한 환경문제를 초래할 수 있다. 실제로 독일 라인 강에서는 막힘현상을 해결을 위해 기계적인 방법을 동원하여 하천 바닥을 준설하였으나 일시적인 해결이었을 뿐 얼마 지나지 않아 다시 막히는 경우가 있었다(Brunke and Gonser, 1997). 이러한 혼합대의 소멸은 주변 환경문제를 야기시킬 뿐 아니라, 혼합대의 환경측면에 기여하는 여러 가지 프로세스들의 균형을 파괴함으로써 앞서 열거한 혼합대의 환경적 순기능의 상실을 초래하게 된다. 따라서 이러한 지표수-지하수 혼합대의 환경측면과 생태계서비스 등을 고려해볼 때 혼합대의 환경적 가치를 보전하고 관리할 필요가 있다.