중장기 산업기술개발사업은 실용적인 기술을 개발하는 사업으로 3년이상의 상용화를 추구하고 있다. 이 사업은 평균 지원금액이 가장 크다는 특징이 있으며 사업 기간이 길기 때문에 일정, 체계, 연구의 질, 목적등이 더 확실해야 한다.
중장기 산업기술개발사업은 “실질적이고 광범위한 응용 가능성에 중심을 두고 장기간에 걸쳐 요소기술의 개발을 목적으로 하는 사업”으로 중장기적(3년 이상) 상용화를 목표로 추진 중인 응용 개발 연구사업이며 바이오의료기기 산업원천기술개발, 그린카산업 융합원천기술개발, 첨단물류 기술개발 등이 해당된다(미래부, 2014). 본 사업은 사업당 평균 68개의 과제로 구성되어 있으며, 과제당 평균 4.3년간 연 20억수준으로 지원되었으며 연구개발 유형 중 과제당 평균 지원금액이 가장 크다는 특징이 있다(미래부, 2014). 본 사업은 사업기간의 장기성 때문에 계획적이고 조직적인 연구활동의 여부가 중요하게 되며, 연구 일정과 추진체계, 효율적 관리 여부 등의 점검이 다른 사업보다 강조된다. 아울러 연구개발투자 규모가 크기 때문에 연구의질, 사업목적에의 부합성 등에 대해서도 신중을 기해 평가해야 한다.