양식정보의 비효율성은 통합관리 기반 미구축으로 나타나는 문제다. 우리나라는 정보 사이트가 없고 여러 기관이 분산하여 관리한다. 때문에 정보 공유가 어려워 통합관리 기반 형성이 늦어졌다.
양식정보의 분산 및 중복의 비효율성 문제는 양식정보 통합관리 기반의 미구축으로 나타나는 가장 대표적인 문제이다. 우리나라는 현재 양식정보의 통합관리는 물론 심지어 양식정보를 대표할 수 있는 웹사이트 하나 제대로 구축되어 있지 못한 실정이다. 따라서 우리나라의 양식정보는 수산업 또는 양식어업에 대해 직․간접적으로 연관성이 있는 여러 기관에 의해 분산되어 관리되고 있다. 그리고 아직까지 양식정보의 통합관리를 위한 노력 부진 및 시스템 미구축으로 인해서 양식정보의 통합관리가 이뤄지지 않고 있는 실정이다. 이렇다 보니 양식정보 통합을 위한 정보 개방 및 공유 또한 추진되지 않아 통합관리를 위한 기반 형성이 지연되어 왔다.