정부통신부와 방송위원회에는 정보통신진흥기금과 방송통신발전기금이 있다. 이들은 각각 소유한 재원 이외에 큰 주파수 영역 할당을 공동재원으로 삼아 45:55로 나눠서 사용했다. 두 부처는 개정된 방통법에 따라 기금ㅇ을 공동 관리하는 방향으로 합의하며, 재원배분의 효율성이 생겼다.
(舊)정보통신부는 1990년대부 정보통신진흥기금을, (舊)방송위원회는 2000년부터 방송 발전기금을 설치 운영하기 시작한 이후 몇 차례의 변화를 거치면서 오늘의 정보통신진 흥기금과 방송통신발전기금으로 진화하였다. 현재 방송통신발전기본법 제24조(방송통신 발전기금 설치)는 미래창조과학부장관과 방송통신위원회는 방송통신 진흥을 지원하기 위하여 방송통신발전기금을, 정보통신산업진흥법 제41조(정보통신진흥기금의 설치)는 정 부는 정보통신 진흥을 지원하기 위하여 정보통신진흥기금을 설치 운영하고 있다. 이명박 정부에서는 (舊)방통위와 (舊)지경부가 방송통신발전기금과 정보통신진흥기금 이 각각 가진 고유 재원(방통위는 지상파, 종편 등 방송사업자 분담금; 지경부는 기간· 부가 통신사업자 출연금) 이외에, 규모가 가장 큰 주파수 할당대가를 공동재원으로 삼 아 45% 대 55% 비율로 분할하여 각각 사용하였다. 그 결과 기금이 방통융합과 ICT 생 태계 구축을 활성화하는 방향으로 분산 활용되는 비효율성을 노정하였다. 이제 두 부처 가 개정된 「방송통신발전기본법」에 따라 방송통신발전기금을 공동 관리하는 방향으로 「방송통신발전기금운용관리규정」을 개정하기로 합의함으로써 재원배분의 효율성을 기 할 수 있게 되었다(2013.11.20.). 미래부 입장에서는 주파수관리의 주무부처로서 주파수 회수·재배치 징수금과 주파수 할당대가의 조성 및 용도에 몫(즉 55%)을 가지고 있기 때 문이다.