농산물은 국립농산물품질관리원에서 유해물질 기준 초과로 부적합한 농산물은 출하연기에 대한 사후관리 방법을 관계법으로 명확히 규정하고 있으나 수산물은 계도차원의 조치결과를 확인하는 정도에 그치고 있다.
농산물의 경우 [표 55]와 같이 유해물질 기준 초과로 부적합 판정되어 출하연기 조치한 이후 해당 농산물이 재조사 없이 출하되는 경우를 방지하기 위해 국립농산물품질관리원에서 직접 출하가능일 1∼2일 전에 출하연기 이행 여부를 확인하고, 출하제한기간이 긴 경우에는 15일 간격으로 추가 확인하도록 하는 등 출하연기 사후관리 방법에 대하여 ｢농산물 등의 안전성조사 업무처리요령｣(식품의약품안전처 고시) 제12조 및 ｢농산물 등 안전성조사 세부 실시요령｣(국립농산물품질관리원 예규) 제16조 등에 명확히 규정되어 있다. 반면에 수산물의 경우 ｢수산물 안전성조사업무 처리요령｣(식품의약품안전처 고시) 제11조에 지방자치단체장으로 하여금 안전성 계도 차원에서 출하연기 등의 조치결과를 확인하도록만 규정되어 있다.