조직을 기반으로한 창업은 파스퇴르연구소처럼 기관 자체적으로 자회사를 설립, 보유한 기술을 사업화하고,  연구자는 기술의 발명자가되어 자회사가 성공하면 수익을 배분받을수 있고 투자자도 투자에 안심할 수 있다.
그래서 두 번째 지원 모델을 생각해볼 수 있는데, 그것은 조직기반의 창업 모델이다. 바이오 분야는 개발 기간이 오래 걸리고, 실패의 위험이 큰 특성이 있어서 이런 위험 부담을 창업자 개인이 담당하는 것은 항상 큰 부담이었다. 그런데 한국파스퇴르연구소의 사례처럼 기관 차원에서 자회사를 설립하고 이를 통해 기관이 보유한 기술을 사업화하면 연구자 개인이 창업할 때의 문제들을 피해갈 수 있다. 연구자는 창업의 부담을 안는 대신 기술의 발명자로 남아서 자회사가 성공할 경우 기술이전 수익 중 일부를 배분받을 수 있다. 또한 기관 입장에서는 경영과 사업화 부문의 전문 인력을 고용해서 보다 체계적인 창업을 주도할 수 있으며, 투자자 입장에서도 개인이 아닌 조직이 주도하는 창업이기 때문에 더 안심하고 투자할 수 있다.