연안통합관리 제도는 서구에서는 많은 시행착오를 통해 정착되었으나 우리나라는 처음 시도되었는데, 현장에서 적용할 때 많은 문제가 있었다. 육상과 해양, 과학과 정책, 중앙부처와 지방정부, 현세대와 미래세대 간 통합 등 개별 오소 간의 통합이 연안 문제 해결을 위해 필요할 것이다. 
연안통합관리는 육상과 해양이라는 공간의 통합, 과학과 정책 간 통합, 중앙부처간 또는 중앙부처와 지방정부 간 통합, 국가 간 협력, 현세대와 미래세대의 통합, 관리주체 간 통합 등을 목표로 한다. 연안통합관리는 분리된 개별 요소 간의 통합을 통해 연안의 문제를 해결하기 위한 개념적 틀이라고 할 수 있다. 연안통합관리는 서구에서는 수십 년의 시행착오를 통해 정착된 제도였으나, 우리나라에서는 처음 시도되는 개념이었다. 중앙정부와 연안 지자체, 그리고 수많은 이해당사자들이 연안통합관리의 개념을 현장에서 적용하고자 할 때에는 해결해야 할 현실적인 문제점들이 한두 가지가 아니었다. 통합관리의 구체적인 실현은 개별 정책 또는 정책 시행 현장에서 이루어져야 하나, 그 당시 국내에서는 아직 이러한 경험이 전무한 상태였다. 연안통합관리를 시행하려면 환경용량을 고려한 연안개발계획의 조정, 오염부하의 할당과 규제, 연안통합관리제도 시행 후의 효과 평가 등을 할 수 있는 기술적 기반이 마련되어 있어야 했으나, 제도가 도입될 당시에는 이러한 기반이 갖춰지지 못한 상태였다.