그러나 이런 순기능은 동시에 역기능이 될 수 있다. 소셜미디어를 얼마나 활용하는냐에 따른 불균형이 있을 수 있고, 소셜미디어 속의 관계는 개인의 선택에 의존하여 다양성 없이 끼리끼리 연결 관계를 형성하는 문제도 있다. 또한 사생활 침해의 문제와 소셜미디어로 인해 항상 연결되어 있는 것이 지속적인 괴롭힘의 도구가 될 수도 있다.
하지만 이러한 사회관계에서의 순기능은 역기능으로 전환될 수 있는데, 예를 들어 사회자본의 확장과 축적이라는 순기능적 측면이 사회자본의 불균등이라는 사회적 문제로 불거질 수 있는 것이다. 소셜미디어 이용자의 면면을 살펴보면 다양한 이들과 활발히 교류하면서 축적된 사회자본의 순기능을 활용하는 이들이 있는 반면, 소셜미디어를 아예 사용하지 않거나 소셜미디어의 잠재적 기능과는 달리 소수의 친한 이들과의 보조적 소통 도구로만 이용하는 이들은 사회자본을 축적하고 활용하는 기능을 갖지 못하게 된다. 또 다른 측면에서는 소셜미디어 연결 관계 형성이 개인의 선택에 의한 것이기 때문에 특정 유형의 이들과만 연결 관계를 형성함으로 해서 사회자본의 다양성을 스스로 거부하는 결과가 초래될 수 있다. 즉, 소셜미디어는 사회자본의 범위와 규모를 확대 시켜 줄 도구이지만, 이용자의 이용 방식에 따라 오히려 끼리끼리의 연결 관계를 형성해 의견 수렴의 불균등을 초래하는 원인이 될 수도 있다는 것이다. 또 연결 관계를 형성하고 유지하기 위해 노출한 사적인 측면들이 정보로 엮이면서 사생활이 침해되는 부정적 결과를 초해할 수 있으며, 소셜미디어를 통해 항상 연결되어 있는 연결망이 오히려 항상적 괴롭힘의 도구가 될 수 있다.