금융계열사의 의결 권제한은 금융회사가 고객의 예탁금을 사용하여 계열회사를 지배하는 것을 예방하기 위한 것이다. 이는 공정거래법이 금융보험회사의 국내 계열사에 대한 의결권행사를 금지하는 경우에는 국내계열회사에 대한 M&A의 상황에서 국내기업 간에는 순수 규제가 되고 외국인에게는 역차별적인 규제가 될수 있다. 
공정거래법은 상호출자제한기업집단(자산 5조 원 이상)에 속하는 회사로서 금융 업 또는 보험업을 영위하는 회사는 취득또는 소유한 국내 계열회사주식에 대하여 원칙적으로 의결권을 행사할수 없으나, 예외적으로 금융업 또는 보험업을 영위하 기 위하여 주식을 취득또는 소유하는 경우나보험자산의 효율적인 운용ㆍ관리를 위하여 보험업법 등에 의한 승인 등을 얻어 주식을 취득또는 소유하는 경우 및 당해 국내 계열회사(상장법인에 한함)의 주주총회에서 임원의 선임 또는 해임, 정관의 변경, 그 계열회사의 다른 회사로의 합병, 영업전부 또는 주요 부분의 다른 회사로 의 양도에 관한 사항을 결의하는 경우에는 예외적으로 15% 한도내에서 의결권을 행사할수 있다는 규정을 두고 있다(공정거래법 제11조). 이러한 금융계열사의 의결 권제한은 은행, 보험회사, 증권회사 등의 금융회사가 고객의 예탁금을 활용하여 계 열회사를 지배하는 것을 방지하기 위한 것이다. 이와 같이 공정거래법이 금융보험회사의 국내 계열사에 대한 의결권행사를 금지하는 경우에는 국내계열회사에 대 한 M&A의 상황에서 국내기업 간에는 순차별적 규제가 되고 외국인에 대한 관계에 서는 역차별적인 규제가 될수 있다는 의견이 있으며 이는 타당하다고 본다.