바이오화학산업은 새로운 형태의 산업으로 정체성이 모호하다. 전문가들은 별개의 독립된 형태의 산업으로 분류해야 한다고 하였으며, 특수산업 분류체계에 포함시키는 의견이 있다. 
바이오화학산업은 바이오기술(white BT)과 화학기술의 융합으로 생성된 새로운 형태의 산업이다. 따라서 바이오산업이나 화학산업 중 어느 업종에 속하는지 그 정체성이 상당히 모호하다. 이에, 기존 한국표준산업분류(KS1C)와는 별개의 독립된 형태의 산업으로 특수산업분류체계를 새로 도입해야 한다고 국내 전문가들은 제안하고 있다. 융합산업의 경우 일반적으로 이러한 정체성 혼란을 피할 수 없는 것이 사실인바, 정부는 차제에 다른 융합산업과 한데 묶어 바이오화학산업을 특수산업 분류체계에 포함시킴으로써 독자성과 고유성 및 정체성을 확립하는 한편, 각종 지원정책도 좀 더 차별화되고 체계적으로 수립할 수 있을 것으로 판단된다.