하수처리장의 양적 확대와 함께 질적 관리의 수준도 강화되었으며 고도하수처리율도 증가하였다. 공공수역 수질과 직접 관련이 있는 하수처리 방류수 농도기준도 과거 대비 부분적으로 강화되었다.
하수처리장의 양적 확대와 함께 질적 관리의 수준도 강화되었다. 고도하수처리율도 2004년 20.2%에서 2015년 94.6%로 막대히 증가하였다. 최근 서울 서남물재생센터와 같은 하수처리장의 지하화 사업 혹은 인천 공촌하수처리장의 막여과공법 시설 운영은 처리시설의 질적 관리에 있어서 향후 발전방향을 보여주는 듯하다. 4대강살리기사업에 따라 인처리시설이 대폭 신설·확충되고 방류수 수질기준의 지역적 구분도 기존 2단계(특별대책지역과 일반지역)에서 4단계(I~IV)로 적용되고 있으며, 물재이용계획이 수립됨에 따라 하수처리수 재이용이 정부적 차원에서 권장되고 있다. 공공수역 수질과 직접 관련이 있는 하수처리 방류수 농도기준도 과거 대비 부분적으로 강화되었다. 예를 들어 생태독성이 새로운 기준으로 추가되어 총 7개 항목이 되었고, 기존 항목(BOD, COD, SS, T-N, T-P, 총대장균군수)의 수질 기준도 다소 높은 수준으로 강화되었다. 그 중에서 총인(T-P)의 방류수 수질농도 기준은 2001년 2.0~8.0mg/L 이하에서 2015년 현재 0.2~4.0mg/L로 크게 낮아졌다.