어장관리법에 따라, 면허를 받은 어장에 대해 어장을 새롭게 배치하는 것을 '어장재배치'라고 한다. 이는 양식시설이 밀집되어 있는 해역과 어장에 대해서 어장환경을 개선하기 위한 조치이다. 전복양식장과 해조류양식장을 맞교환하는 방식도 진행되었고, 김 양식어장의 재배치도 추진 중에 있다. 또한 갯벌 어장 재배치를 통해 어민들이 소득을 올릴 수 있으며 갯벌의 환경수용력 내에서 양식이 가능하도록 관리 할 수 있어 지속적인 갯벌 어업이 가능하게 된다.  
어장재배치란 면허를 받은 어장에 대해서 어장관리법 제5조에 따라 어장관리 해역의 지정을 통해서 어장을 새로이 배치하는 것을 말한다. 양식시설이 밀집되어 대량 폐사가 발생하는 해역 및 어장에 대해서 환경수용력을 측정하여 어장을 재배치하여 어장환경을 개선하기 위한 조치이다. 어장재배치의 국내 사례로는 완도군에서 2018년까지 약 116억 원을 투입하여 내만의 전복양식장과 외만의 해조류양식장을 맞교환하는 방식으로 진행한다. 고흥군 또한 김 양식어장의 재배치를 추진 중에 있다. 갯벌어장의 경우 면허지와 어장환경 변화로 인해서 실제 품종 생산해역의 괴리로 어장 이외의 지역에서 양식이 이루어지고 있는 경우가 많다. 따라서 갯벌에서 생산되는 주요 품목에 대한 어장 적지 조사를 바탕으로 면허지를 조정함으로써 지속가능한 패류양식이 가능하도록 하기 위해 어장재배치 사업이 필요하다. 갯벌 어장 재배치는 양식면허가 지자체 관할사항이므로 지자체 특별회계를 이용하여 지원한다. 갯벌 어장 재배치를 위해서 품종별 어장의 실태 파악 후, 어업인을 대상으로 어장 재배치 수요조사를 수행하여, 재배치가 가능한 구역에 대해서 순차적으로 진행한다. 어장면허가 가능한 해역에 대해서는 환경조사를 수행하여 적지 여부를 파악하고, 어민들의 수요를 반영하여 지자체에서 최종적으로 재배치 여부를 결정하다. 이를 통해 기후변화, 환경변화 등에 의해 서식처가 변화한 품종에 대해서 어민들이 적지에서 어업활동을 할 수 있도록 할 수 있다. 현재와 같이 면허지, 어장과 괴리된 조업활동 및 양식업이 지속되는 경우 향후 갯벌의 이용에 대한 관리 및 환경수용력 조사, 생태조사 등의 대상지와 괴리되어 있어 장기적으로 갯벌생태계의 지속적인 이용을 저해할 수 있다. 갯벌 어장 재배치는 품종별 적지에 어장 형성으로 어민들의 소득 증대에 기여할 수 있는 한편, 갯벌 양식 실태조사, 환경 모니터링 등과 연계하여 갯벌의 환경수용력 내에서 양식이 가능하도록 관리 할 수 있게 하여, 지속적인 갯벌 어업을 영위할 수 있도록 한다.