사업자가 직접 환경영향평가를 하는 방법은 객관성 부재의 우려가 있다. 하지만 기관이 평가 하는 경우에도 사업자의 협업이 필수적이므로 사업자가 직접 평가를 실시한다해도 크게 다르지 않다고 볼 수 있다.
일본의 제도와 같이 사업자에게 환경영향평가를 하도록 하는 시스템은 사업자 스스로가 불이익이 되는 환경영향평가를 하는 것은 기대하기 어렵다는 등, 환경영향평가의 객관성에 대한 의문을 갖는 의견도 볼 수 있다. 그러나 행정기관 혹은 제3자 기관이 환경영향평가를 전면적으로 실시하기 위해서는 결국, 사업 계획에 대해 사업자로부터 상세한 자료를 제출 하도록 하고 계획의 외적인 것에 대해서도 자주 알아볼 필요가 분명히 생긴다. 그래서 행정 기관 혹은 제3자 기관이 환경영향평가를 하는 것도 사업자의 협력 내지 정확한 예측이나 평가를 하는 것이 어려울 수도 있어 사업자에게 환경영향평가를 실시하도록 하는 것이 바로 환경영향평가의 객관성을 좌우한다고 일괄적으로 말하기는 어렵다.