의료비 지원 사업은 의료적 목적, 사업의 주요 대상, 의료적 절차의 5가지 유형에 따라 3가지로 분류할 수 있다. 
의료비 지원 사업을 사업의 목적에 따른 분류와 지원 대상별 분류, 의료적 절차에 따른 분류 등 크게 3가지 방식으로 구분해 볼 수 있다. 먼저, 사업의 목적에 따른 분류는 기존의 사회 보장 사업 조사와 관련하여 분류된 기능 분류 중 의료적 목적과 관련한 분류를 토대로 한 분류 기준이며, 대상별 분류는 사업의 주요 대상 집단이 누구인지에 대한 분류 기준이라고 할 수 있다. 마지막으로 의료적 절차에 따른 분류는 일반적인 의료 행위를 크게 5가지로 유형화 하여 사업에서 지원하고 있는 내용이 어떠한 부분인지 분류하는 기준이라고 할 수 있다.