국민건강영양조사는 여러 요소를 층화하는데, 표본크기가 제한적이며 농촌의 식생활에 영향을 주는 환경적 요인의 조사는 이뤄지지 않는다. 농촌 식생활지표 조사 역시 단편적인 내용만 제공한다. 
농촌지역에서 국가 수준의 대표성 있는 표본을 이용하여 국민의 포괄적인 식생활 조사 자료를 제공하는 국민건강영양조사는 거주지, 연령, 성별 등을 층화하여 200개 조사구에서 20가구씩의 표본을 추출하여 수행된다. 따라서 국민건강 영양조사에서 농촌 가구는 전체 표본의 20% 수준으로 농촌지역의 다양한 취약계층의 식생활 실태를 분석하기에는 표본크기가 제한적이며 농촌의 식생활에 영향을 미치는 환경적 요인에 대한 조사는 이루어지고 있지 못하다. 이밖에 농촌진흥청의 농촌 식생활지표 조사가 농촌지역을 대상으로 한 식생활 실태 자료를 제공하고는 있으나 식생활의 단편적인 내용을 제공할 뿐 심도 있는 조사가 이루어지고 있다고 보기는 어렵다.