약용작물은 수확연한이 중요하며, 특히 황기는 재배 편의성, 자금 회전 등을 이유로 10월 이후 첫서리 전까지 수확하는 것이 좋다. 
‘감초’, ‘작약’, ‘황기’, ‘지모’ 등과 같이 다년생을 수확하는 약용작물은 수확연한도 중요하다. 재배의 편의성과 자금 회전 등의 이유로 단년 근 재배가 많은 ‘황기’는 아스트라갈로사이드나 총 플라보노이드 함량 이 1〜2년생에 비해 3년생에서 월등히 많아 3년생 이상의 황기를 10월 이후 첫 서리 전까지 수확하는 것이 좋다. 다만 한약재로 이용하는 약용작물은 ‘한약재표준제조공정지침’을 준수하여야 한다. 공정서에는  약용작물의  수확시기와 이용 부위, 방법 등이 명시되어 있으므로 한 약재 생산을 목표로 하는 경우에는 주의가 필요하다.