농촌지역의 가축매몰지의 등장은 지하수 수질의 악화로 인한 지역주민의 건강에 악영향, 환경문제 발생으로 이어질 수 있다. 농촌은 약자들이 대부분이라 오염회피 능력도 낮아 위험하다.
우선 농촌지역에 가축매몰지가 생겨나면서 기존 환경문제점을 더욱 악화시키는 경향을 보일 수 있다. 특히 먹는 물의 경우 마을상수도, 소규모 수도시설에 의존하는 농촌지역에 가축매몰지로 인해 지하수 수질의 악화 가능성이 높아지고 이에 따라 지역주민의 건강에 악영향이 있을 수 있다. 또한 악취, 먼지, 토양오염, 지표수오염, 지하수오염 등 다양한 환경 문제가 발생하면서 환경 질의 기본선을 미달할 가능성이 커진다. 또한 노약자, 여성, 저소득층 등 생물학적, 사회적 약자가 대부분을 차지하는 농촌지역의 경우 가축매몰지로 인한 영 향에 더 취약한 반면 오염회피 능력이 부족하기 때문에 더 많은 피해를 입는다.