독일의 공공 연구 및 기술혁신정책 평가체제는 먼저, 동료평가로 연구비 배분을 결정하고, 연구성과 측정을 위한 분석이 활용되었다. 정책입안자가 주체가 되어 연구 수행 및 성과 입증을 위해 노력한다. 또한, 연구협회가 평가를 책임지면서 분권적 평가체계가 드러난다. 
독일의 공공 연구 및 기술혁신정책 관련 평가체계의 구조는 Three-shellmodel(Kuhlmann and Buhrer, 2002. 이태근 외, 2014, p. 115에서 재인용)로 정리할 수 있다. First Shell(Core)에서 동료평가(peer review)는 연구비 배분을 결정하는 내부적 수단으로써 주요한 역할을 하고, 이외에 개별 혹은 그룹 연구자의 연구성과를 측정하기 위해 서지학적 분석 등의 방법이 함께 활용된다. 이때 동료평가는 독일의 연구개발·정책 평가 전반에서 오래전부터 활용되어 왔고, 특히 기초연구 및 장기 응용 연구프로젝트의 사전평가에서 폭넓게 적용되고 있다. 대표적인 동료평가활용 예시로는 독일연구협회(DFG)의 연구비 신청과 관련한 사전평가가 있다. Second Shell은 연구개발·정책 프로그램의 평가연구로써 정책입안자가 주축이 되어 평가연구를 수행하고, 프로그램의 과학적, 경제적, 사회적 목표에 해당하는 성과를 입증하기 위해 이루어진다. 이러한 평가연구는 전통적으로 영향분석(Impactanalysis)을 기반으로 수행되는데, 1970년대 이후 프로그램 예산이 증가하면서 주로 혁신 및 전략적 기술프로그램 평가의 영향분석이 발전하였다. Third shell은 연구기관에 대한 평가로, 공공연구기관 평가의 경우 평가의 책임이 정부에서 중간조직인 연구협회에 위임되면서 분권적 평가체계가 나타난다. 하지만 정부는 범국가적과학체계의 발전과 개편의 방향을 설정하기 위해서 독립적으로 평가위원회를 구성하고 비정기적으로 연구 협회들에 대한 거시적인 평가를 수행할 수 있다.