선택성은 여러 모양의 시료에서 분석대상물질을 뽑아 정확히 구분하는 능력이다. 분석법의 구분 능력은 분석대상물질을 가진 검체서 양성의 결과를 얻고, 분석대상물질을 갖고 있지 않은 검체에서는 음성의 결과로 확인한다.
선택성 (selectivity)이란 여러 형태의 시료로부터 분석대상물질을 선택적으로 정확하게 구분할 수 있는 능력을 말한다. 분석대상 시료는 다양한 성질을 가지고 있기때문에 구조적으로 유사한 화합물들이 공존할 시 이를 식별하기는 쉬운 일이 아니다. 분석법의 식별 능력은 분석대상물질을 함유한 검체에서 기존의 표준물질과 비교시 양성의 시험결과를 얻고, 분석대상물질을 포함하지 않은 검체에서는 음성의 시험결과를 얻음으로써 확인할 수 있다. 피크로 식별하는 크로마토그래피 분석에서 완전히 분리되지 않은 피크는 정량 분석에 신뢰성을 줄 수 없다. 이런 경우 검출 파장을 조절하거나 element-specific detector나 mass-selective detector 등을 사용하여 더욱 선택적으로 분석해야 한다.