첫째, 바이오뱅크의 경우 바이오 샘플을 기증하는 환자의 권리와 프라이버시 보호가 주요 논쟁거리로, 소수 인종이거나 희귀질환자의 경우 프라이버시가 침해될 수 있다. 
첫째, 인체자원 및 유전정보를 다루는 바이오뱅크의 경우 바이오 샘플을 기증하는 환자의 권리와 프라이버시 보호가 주요 화두이다. 의사 혹은 연구자가 인체유래 자원을 기증받은 후 일차적으로 환자의 개인 정보를 삭제했다 하더라도 소수 인종이거나 희귀질환자의 경우 쉽게 프라이버시가 침해될 수 있는 개연성이 존재한다. 또한 의료의 무기록, 바이오 샘플 분석 정보, 라이프스타일 정보 등 대량의 정보를 엮어 새로운 질병 치료의 도약을 꿈꾸는 대형 바이오뱅크 구축 사업에서도 개인의 익명성과 프라이버시를 어떻게 보호할 수 있을지가 주요 논쟁거리이다(Mascalzoni 2015).