항만과 도시의 관계는 상호 경제 발전을 돕는 공생단계, 항만과 도시가 확대되며 분리되는 단계, 도시의 확장으로 항만 개발에 영향을 미치는 갈등의 경향성을 나타낸다. 이 단계가 되면 갈등이 아닌 공생의 방향 계획이 요구된다.
상술한 항만과 도시발전을 토대로 항만과 도시 간 상화 관계를 시간의 흐름에 따라 보면 『공생 →분리→갈등』의 흐름을 보이고 있음을 알 수 있다. 즉, 초기 항만과 도시는 국가 발전에 따라 경제적 부를 축적하면서 상호 발전을 이루면서 공생관계를 형성한다.(t1, t2) 그러나 어느 시기가 지나면(t3) 항만과 도시가 상호 분리되면서 도시와 항만 사이에 진공상태가 발생한다. 이 시기에는 항만발전과 도시발전이 병행하면서 공간적 분리 현상이 발생하는데 바로 항만이 팽창하면서 구항과 신항이 구도가 형성될 때이다. 이후 시간이 흐르면(t4) 도시발전이 항만의 영역까지 확대되면서 항만기능과 도시 기능 간에 갈등과 긴장상태에 놓이게 된다. 이 시기에 이르러 항만재개발이나 도시재개발 등의 수요가 발생하고 항만과 도시가 공존할 수 있는 새로운 통합 개발 방향의 설정이 필요하게 된다.