자율관리어업 제도는 해양수산부장관 또는 시･도지사가 자율적 관리, 경영 개선, 질서 유지를 위한 자체규약 제정을 실행한 어업인 단체에 행정적･기술적･재정적 지원을 한다는 규정에 의한다. 
현행 자율관리어업 제도는 ｢수산자원관리법｣ 제34조(어업의 자율관리 지원)에 따라 “해양수산부장관 또는 시･도지사는 자율적으로 수산자원을 관리하고 어업경영을 개선하며 어업질서를 유지하기 위한 자체규약을 제정하여 실행한 어업인 단체에 대하여 행정적･기술적･재정적 지원을 할 수 있다.”는 규정에 근거하고 있다. 이에 따른 자체규약 실행의 기준과 어업인 단체의 범위, 지원방법 및 절차에 대한 사항은 시행규칙 제16조(어업의 자율관리 지원), 그리고 자율관리를 실시하기 위해 필요한 세부적 사항은 “자율관리어업 관리 등에 관한 규정 (해양수산부 훈령)”에 마련하고 있다. 자율관리어업에 대한 주요 규정은 <표 3-3>과 같다.