원발명 특허권자가 이용발명 특허권자에 대해 손해배상을 청구하는 경우 기여율의 문제가 있는데, 원특허권자에게 특허제품 전체의 판매이익을 배상하도록 한다면 이용발명제도 자체의 부정으로 이용발명을 실시한 제품이 구매자의 수요에 미치는 영향에 따라 정하여야 할 것이고, 이용발명은 신규성과 진보성을 부정당하지 않고 특허를 받은 경우에 한한다.
특허권의 이용발명과 저작권의 2차적 저작물은 유사한 측면이 있다. 특히 프로그램 저작권의 경우 기술적 특징에 있어서는 특허권과 유사한 측면이 있으며, 2차적 저작물 작성권이 침해되기 쉽다. 타인의 컴퓨터프로그램 저작물인 "포카잭"을 이용하여 게임프로그램 저작물인 "블랙휘버"를 만들어 판매한 사안에서 통상의 어문저작물을 그대로 복제한 경우와 유사하게 판단하여 손해액을 산정한 판결이 있다. 이 판결은 피고의 이익을 계산함에 있어서 원고의 이익률(이 사안에서는 56.8%)을 가지고 산정하였다는 특징도 있다. 타인의 특허를 허락 없이 이용하여 새로운 발명을 한자가 자신의 새로운 발명을 실시하는 경우에 있어서, 원발명의 특허권자가 이용발명의 특허권자에 대하여 손해배상을 청구하는 경우에도 기여율의 문제가 있다. 만약 원특허권자에게 특허제품 전체의 판매이익을 배상하도록 한다면 이용발명이라는 제도자체를 부정하는 결과가 될 것이므로, 이용발명을 실시한 제품의 구매자의 수요에 미치는 영향에 따라서 정하여야 할 것이다. 그러나 한편, 타인의 특허발명을 실시하면서 그대로 실시하지 아니하고 추가로 몇 가지 구성요소를 더하여 실시하였다는 점만으로 곧 추가된 구성 요소의 기여율을 주장하는 것은 허용될 수 없다. 왜냐하면 원래 특허발명이라는 것은 어떤 구성요소를 가지는 것을 특징으로 하는 경우가 많으므로 구성요소가 추가될 것을 예정하고 있는 경우가 많은데 이러한 경우에 추가된 모든 구성요소에 대하여 기여율을 인정하여 주는 것은 불합리하기 때문이다. 따라서 여기서 말하는 이용발명은 어디까지나 신규성과 진보성을 부정당하지 아니하여 특허를 받은 경우에 한한다.