한국동위원소협회는 방사선 관련 여러 훈련기관으로 교육훈련을 운영하고 있으며 교육과정의 다양화를 통해 각종 교재 편찬 및 전문인력 확보 등으로 특화된 교육과정을 개설하였으며 방사선 진흥을 위한 다양한 전문교육 개설로 많은 호응을 얻었다. 
한국동위원소협회는 1986년에 방사성동위원소 및 방사선 이용에 관한 통신교육 훈련기관으로, 1992년에는 방사선 작업 종사자 안전교육 훈련기관(2013년에 방사선 작업 종사자 직장교육 기관으로 지정)으로 그리고 2000년에는 RI 면허 소지자에 대한 보수교육 위탁기관으로 정부의 지정 또는 위임을 받아 교육훈련을 운영하고 있다. 그동안 교육과정의 다양화를 통해 각 과정별로 교육 목적에 맞는 각종 교재를 편찬하였으며, 연구경험과 실무경험이 풍부한 고급 전문인력을 강사 요원으로 확보하여 방사선 안전교육은 물론 전문가 양성을 위한 전문교육 등 특화된 교육과정을 개설하여 방사선 이용기관의 요구에 부응하고 있다. 2013년에는 '국내외 방호 동향(ICRP) 분석 과정', '방사선 관리 기술사 양성과정', 'MCNP 실무/실습 강좌', '디지털 영상처리 전문가 양성 과정' 등 방사선 진흥을 위한 다양한 전문교육을 개설로 하여 많은 호응을 얻었다.