국내 구축된 자료원의 정보가 제한적이기 때문에 현재 구축된 자료현황 파악에 어려움이 있었으며, 낮은 접근성 역시 문제였다. 또한 현재 구축된 자료원이 분절적이기 때문에 장기적 효과성과 안전성 평가네는 제약이 있었다. 이에 자료원들간의 연계가 더욱 중요해질 것이며, 이 과정에서 국가적으로 자료원이 개인정보보안과 임상정보로 활용됐을 때 유용성 간의 균형을 찾는 노력이 필요하다.
국내에서 구축된 자료원에 대한 정보가 제한적이라는 문제로 현재 구축된 자료현황을 파악하기 어려운 문제가 있었다. 정보가 제한적인 것만큼 해당 자료원에 대한 접근성이 낮은 문제 역시 존재하였다. 또한 각각의 자료원을 비교효과연구에 활용가능하다고 해도 현재 구축된 자료원은 분절적이라 장기적인 효과성과 안전성을 평가하기에는 제한점이 있다. 따라서 이러한 자료원들간의 연계의 중요성이 더욱 강조될 것이며, 이러한 과정에서 개인정보보안과 임상정보로 활용되었을 때의 유용성간의 균형을 찾으려는 논의들이 국가적으로 필요할 것이다. 기구축된 국내 자료를 이용하고, 향후 새로운 자료를 구축하는 단계에서 실효성을 높이기 위해서는 보건복지부 차원의 역량강화 및 구심점 역할 수행이 반드시 필요할 것이다. 특히 이 과정에서 국가적으로 자료원 구축에 대한 기획, 지원, 관리를 할 주체도 필요하다. 이에 본 연구에서는 국내에서 비교효과연구 컨소시엄을 구성하는 것을 제안한다. 비교효과연구 컨소시엄은 기존 자료원을 가지고 있던 연구자들 및 연구모임들이 참여하여 질환영역으로 TF가 구성되며 이들 통해 자연스럽게 기존에 단일기관으로 추구된 자료원들간의 연계를 가능하게 하고 이 컨소시엄의 다른 축으로 질병관리본부, 국립암센터, 국민건강보험공단, 건강보험심사평가원, 한국보건산업진흥원 등이 참여하여 TF의 자료원과 이들 기관에서 구축하고 있는 자료원간의 연계를 가능하게 하도록 해야 한다. 또한 컨소시엄에 기획, 관리, 주제 선정 등을 담당하는 사무국을 두어 이들 TF들간의 시너지를 최대화할 수 있도록 해야 할 것이다. 마지막으로 비교효과연구 컨소시엄과 보건복지부의 긴밀한 관계형성을 통해 비교효과연구 컨소시엄의 실효성을 높여야 할 것이다.