비용·편익 분석은 연구 방법론의 한계, 학술적인 기준 미정립, 통계자료 미비 등의 이유로 아직 부족한 점이 많다. 하지만 본 연구는 법경제성 분석 연구를 시도함으로써 점차 부족한 점을 보완할 것이라고 기대하고 있다.
본 연구에서도 비용·편익 분석이 가지는 연구 방법론의 한계와 법경제성 측정 기준에 대한 학술적인 기준 정립이 아직 구체화되지 않는 점으로 볼 적에 연구 분석에 다음과 같은 한계점이 존재한다고 할 수 있다. 경제성 분석 대상인 국가 연구시설 및 장비 관련된 이해관계자별로 통일한 시점의 통계자료 및 실태조사 자료가 충분하지 않아서 발생하는 계량적인 측정 결과의 오류 가능성이 존재한다. 또한, 비용·편익 분석 대상에 대한 정확하게 매칭 되는 사례가 드물어서 유사한 사례를 활용해서 분석에 적용할 경우, 오류 가능성도 배제할 수 없을 것이다. 그러나 본 연구는 연구개발 장비에 관련된 특수하면서 첨단인 분야에 법경제성 분석 연구를 시도하고자 하였다는 점을 의미 부여할 수 있다. 향후 경제성 분석에 나타난 연구 한계성은 후속 연구를 통해서 관련 데이터 확보 및 사회적 합의 도출 과정 등을 통해 점차 보완될 것으로 기대하면서, 본 연구에서는 이를 개선하는 근거 마련에 의의를 두고자 한다.