KIST 등 정부 연구소는 일찍이 바이오헬스 연구 수행 주체로 육성되었다. 한국생명공학연구원은 400여 명이 종사하는 대형 기관으로 한국한의학연구원 등이 정부출연연구소로 바이오헬스분야 R&D 사업에 참여 중이다.
정부연구소는 일찍이 바이오헬스 연구의 수행주체로서 육성되었다. 국내 연구기반이 부족했던 1960년대 한국과학기술연구소(KIST) 설립을 기점으로 연구 기반이 마련된 후(이민형 외, 2015), 1985년 생명공학 연구를 전담하는 KIST 유전공학센터가 설립된다(한국생명공학연구원, 2016). 이를 전신으로 발전한 기관이 한국생명공학연구원이다. 한국생명공학연구원은 2015년 현재 400여 명이 종사하는 대형 연구기관으로 성장했다. 한국생명공학연구원 이외에도 정부출연연구소로 한국한의학연구원 등이 운영되고 있으며, 한국화학연구원 및 기타 정부출연연구소도 바이오헬스 분야R&D사업에 참여하고 있다. 정부가 설립한 국공립연구소로는 국립암센터 산하 연구소와 질병관리본부 산하 국립보건연구원 등이 있으며, 각각 100여 명 이상의 연구진이 R&D활동을 전담하고 있다.