선충에 강한 수미같은 종묘를 사용하는 것이 좋고 화본과 작물을 돌려짓기 하거나 여름철에 태양열로 소독하는 방법도 있다. 포장 주변 잡초방제가 철저해야 한다. 감자의 방제제로는 터부포스입제 등을 쓸 수 있다.
선충에 감염되지 않은 종묘를 사용하는 것이 가장 좋으며 화본과 작물(벼 보리 밀 옥수수)을 윤작하는 것도 좋은 방법이다. 또한 여름철 고온기에 유기물, 담수 등으로 처리한 후 비닐로 완전 밀폐시켜 태양열 소독하는 방법도 있다. ‘수미’나 ‘남작’보다 ‘대서’가 선충에 강하다고 알려져 있다. 포장 주변의 철저한 잡초방제가 필요하며, 토양 100g당 선충 20마리가 있으면 위축 증상이 발생하고 60마리 정도이면 35%의 수량 감소를 초래한다. 감자에 등록된 선충방제 약제는 없으며, 땅콩에 뿌리혹선충 방제제로 등록되어 있다. 감자에 방아벌레 방제약제로 등록되어 있는 터부포스입제(캐논볼, 카운타, 땅사, 톱타자, 말뚝, 아리타보, 멸땅충), 에토프로포스입제(모캡, 원톱, 젠토캡, 필사충) 등을 이용할 수 있다.