1960년 유족회를 결정한 피해자의 유가족들은 꾸준히 진상 규명과 정부의 대책 마련을 요구하였고 2005년에는 과거사정리위원회에 진상규명 신청을 하여 2007년에 피해자 407명을 확정하였다. 또한 유족들은 2008년 국가를 상대로 손해배상청구소송을 제기하였다.
피해자의 유가족들은 희생자들의 사망여부, 사망일, 사망장소에 대해 일체 알지 못하다가 1960. 4. 19. 이후 유족회를 결성하여 울산경찰서에 진상규명과 정부의 대책마련 등을 요구하였다. 이에 1960. 6. 20.부터 1960. 8. 21. 사이에 학살현장을 발굴하여 모두 23개의 구덩 이에서 825구의 두골과 머리털, 피해자들의 소지품 등을 발굴하였다. 그러나 유족들은 구체적인 희생자들의 사망여부, 사망일 및 사망장소에 대해 알지 못하였을 뿐만 아니라 그 학살 지시자 및 그 절차에 대하여도 알지 못하였다. 유족들은 국민보도연맹원이라는 이유로 울산 경찰서에 구금되었던 사실 등을 토대로 울산경찰서에 학살자 명단 및 생사여부, 학살 주모자의 명단 등 확인을 요구했으나 진상을 확인할 수 없었다. 유족들은 1960. 8. 24.합동위령제를 지내고 합동묘를 만들고 추모비를 세웠으나 5∙16.쿠데타 이후 군사혁명정부에 의해 합동묘가 해체되었다. 유족들은 진실∙ 화해를 위한 과거사정리위원회(이하 진실화해위원회라고 함)에 2005. 12. 경부터 2006. 11.경 사이에 진상규명 신청을 접수하였고, 진실화해위원회가 진상조사에 착 수하였으며 2007. 11. 27. 피해자 407명을 확정하였다. 유족들은 2008. 6. 17. 국가를 상대로 하는 손해배상청구소송을 제기하였다.