부녀층, 기생 등 신분에 관계없이 동참한 국채보상운동은 일제가 조작한 국채 보상금 소비사건으로 주요 인물을 잡아가자 점차 쇠퇴하였다. 무죄 선고에도 불구하고 운동이 멈춰버렸지만, 항일애국운동이자 현대의 애국운동에 정신이 이어진다는 점에서 유의미하다.
특기할 만한 것은 많은 부녀층이 참여하여 각종 패물을 의연소(義捐所)에 보내온 점이다. 노동자, 인력거꾼은 물론, 기생, 백정 등 하층민들까지도 적극 동참한 범국민적 운동이었던 것이다. 1907년 4월부터 12월까지 많은 의연금이 모였다.
그러나 일제의 탄압으로 국채보상운동은 점차 쇠퇴하기 시작하였다. 일제는 베델을 국외로 추방하고자 벌금형을 선고받도록 공작하였다. 통감부 당국은 대한매일신보가 보관한 국채 보상금을 베델/양기탁 두 사람이 유용했다는 구실을 들어 양기탁을 구속하였다. 조작된 '국채 보상금 소비사건'이 그것이다.
양기탁은 공판 결과 증거 불충분으로 무죄를 선고받았지만, 통감부의 공작으로 운동 주체가 분열되면서 국채보상운동은 끝내 유산되고 말았다.
국채보상운동은 비록 좌절로 끝났지만 전 국민이 힘을 모아 기울인 항일애국운동이었고, 현대에 와서도 국가적 위기 때마다 전 국민이 십시일반의 정성을 펼쳐간 애국운동의 선구였다.