자살이라는 문제에 교회 또한 발 맞춰 ‘자살에 대한 목회지침’을 만들어 장례예식서에 대한 절차를 규정화하였다. 
자살은 남의 일이 아니라 바로 우리의 문제이다. 사회에서 자살이 이렇게 많이 일어나는데 우리 교회에서만 자살이 일어나지 말라는 법은 없다. 목회자와 교회가 자살과 그 장례에 대해서 미리 생각을 정리하고 입장을 맞추어야 한다. 예수교장로회 통합 측에서는 총회문서를 통해 ‘자살에 대한 목회지침’을 내놓았다. 그 가운데는 장례예식서가 들어 있다. 총회의 공인된 문서를 통해 자살한 사람에 대한 장례를 인정하고 그 예식서를 포함한 것이다. 예식서에는 신자의 자살로 그 사실이 알려진 경우, 신자의 자살로 그 사실이 알려지지 않은 경우, 불신자의 경우 등으로 나누어 잘 되어 있고, 특히 장례식에서 행할 설교문도 예시되어 있다.