일본은 가장 먼저 환구단을 없앤 자리에 호텔을 건축했으며 이후 훼손에 박차를 가해 궁내 전각 철거, 총독부와 신궁 건축, 도로 건설을 통한 궁 단절 등을 했다. 장충단을 헐고 세워진 박문사는 이토 히로부미를 추모하는 사찰이었다.
일본이 한국을 병탄한 후 맨 먼저 착수한 것 중 하나가 덕수궁 앞의 태평로 건너 언덕에 자리했던 환구단을 헐어 버리고 황궁우만을 남긴 채 조선 철도호텔을 건축한 일이다. 고종이 붕어(崩御)한 뒤로는 속도를 더하여 덕수궁 안의 전각과 주변 영역을 훼손해 갔으니, 선원전이 헐리고 담장과 궁내 전각들이 잘려나갔다.
경복궁도 마찬가지였다. 광화문 안과 근정전 사이에 총독부 건물이 들어서고, 남쪽의 육조거리로 향했던 광화문이 동쪽으로 이동했다. 창덕궁/창경궁에 동물원이 들어서 놀이터가 되었고, 종묘와 창덕궁 사이에 도로가 뚫려 양쪽을 분리했으며, 남산에는 일본의 신궁이 건축되어 서울의 시가지를 굽어보았다.
국가에 충성하고 목숨 바친 장종들의 추모단이던 장충단도 헐려 나갔다. 그자리에 한국 침략의 원흉인 이토 히로부미를 추모하는 사찰인 박문사를 세우고 그 주변을 공원으로 만들었다.