서양 역사에서 베스트팔렌 지식체계의 정착은 과학과 종교의 분리를 가져왔다. 신에게 받은 합리적 능력만으로도 인간은 신이 설계한 자연의 구조를 수학적으로 표현할 수 있다. 과학적 합리성과 종교적 경건주의가 공존, 종교는 과학이 교리에 어긋날 때만 소리친다. 베스트팔렌 지식체계의 정착 이후, 윤리학 또한 근대 합리성의 개념을 따른다. 도덕적 정당화는 의심할 수 없는 합리적 추론 형식을 갖춰야 한다.
이러한 베스트팔렌 지식체계는 확실성을 함축하는 근대의 합리성을 대표한다. 근대의 합리성은 상황 혹은 문제 풀기 맥락에 합당하다는 일상적 의미의 ‘합리성’을 초월한 것이다. 서양 역사에서 베스트팔렌 지식체계의 정착은 과학과 종교의 분리를 가져온 과학의 세속화(secularization) 여정의 출발점이기도 하다. 신에게 부여받은 인간의 합리적 능력만으로도 인간은 신이 설계한 자연의 구조를 수학적으로 표현할 수 있다. 이러한 사고방식에서 운동과 같은 물질의 속성을 다루는 자연학이 신학에 포섭될 이유는 없었다. 신이 자연에 각인시킨 법칙의 발견은 자연학에 속하며, 자연학은 신의 뜻을 거스를 수 없다. 세속화된 과학적 합리성의 정신과 종교적 경건주의(pietism)가 공존했고, 종교는 오직 과학이 교리에 어긋나는 방향으로 달릴 때에만 채찍을 든다. 베스트팔렌 지식체계의 정착 이후, 윤리학 또한 확실성에 근거한 근대 합리성의 개념을 따른다. 도덕적 정당화는 의심할 수 없는 혹은스스로 자명한 원리에 근거한 합리적 추론의 형식을 갖춰야 한다. 이러한 도덕적 정당화의 성격은 윤리학이 보편법칙을 추구하는 자연학을 모방함으로써 자율적 지식체계, 곧 학문의 위치를 차지하려는 것이다. 이 점은 스피노자가 윤리학을 유클리드 기하학의 공리체계에 맞추어 구성한 사실, 그리고 독일철학의 개념적 틀을 닦은 볼프(C.Wolff)가 수학적 증명이라는 엄숙함이 결여된 윤리학의 상태를 한탄한 사실 속에서 잘 드러난다. “그(볼프)는 모든 철학의 지식을 (불변의) 진리체계로 만들려는 계획을 세웠다. 그러한 체계 속에서 결론들은 원리들에서 도출될 수 있어야하며, 모든 명제들은 예증적 증거(demonstrative evidence)에 의해 다른 것으로부터 연역된 어떤 것이어야 한다.”