통합연구가 직실성 있는 연구결과를 위해서는 북한 현실의 정확한 이해를 바탕으로 한 전 분야의 상호 유기적인 연구, 개별 정부 부처와 연구기관의 활발한 교류 통한 연구, 비사회과학 분야로까지 연구 확대, 내적통합에 대한 연구 강화, 다양한 분야에서의 통합연구 지향이 필요하다.
통합연구가 적실성 있는 연구결과를 산출하기 위해서는 다음과 같은 점을 고려해야 한다. 첫째, 연구내용에 있어 정치, 외교 안보, 행정, 법제, 경제, 사회 문화 분야의 통합 연구가 상호 유기적으로 이루어져야 한다. 각 분야 내에서도 마찬가지이다. 연구내용의 객관성을 담보하기 위해서는 북한 현실에 대한 정확한 이해가 강화되어야 한다. 통합 연구는 남북한 현실에 대한 파악을 전제로 하기 때문이다. 둘째, 연구 수행방식에 있어 현재 해당 부처와 관련 국책연구기관의 협조체계를 통해 통합연구가 이루어지고 있으나 본격적인 통일준비를 위해서는 부족한 것으로 평가된다. 통일의 상황이나 통일의 방식, 통일의 국제적인 환경에 대한 정부 부처와 연구기관 간의 사전공유 없이 개별 정부 부처와 연구기관이 독자적으로 연구를 수행한 결과, 현실 적합성이 떨어지고 연구 기관마다 상이한 결과를 발표하는 등 산발적이고 분절적인 연구가 진행되고 있다. 셋째, 현재까지의 통합연구는 사회과학 중심으로 이루어지고 있다. 향후에는 과학기술, 국토, 건설 토목, 해양 등 비사회과학 분야로까지 통합연구를 확대하여야 한다. 넷째, 내적통합에 대한 연구를 강화하여야 한다. 2000년 이후 현재까지의 통합연구는 내적통합보다는 제도통합이 많이 연구되어 왔다. 그러나 통일은 결국 사람의 통합으로 완성된다는 점을 감안하면 내적통합, 즉 가치와 의식의 통합연구가 강화되어야 한다. 다섯째, 좁은 의미의 통합에서 탈피하여 넓은 의미에서의 통합연구를 지향하여야 한다. 즉, 다양한 분야에서의 갈등관리 내지 갈등조정을 할 수 있는 연구주제에 관심을 갖고 연구역량을 강화하여야 한다.