통일연구는 우선, 분단이 야기한 민족구성원 내부의 다양한 갈등에 대한 비판적 검토를 수행해야 한다. 이념적 갈등 문제, 지역주의와 지역 간 불신 및 갈등의 문제 등 다양한 갈등유형에 대한 인식과 분석이 필요하다.
통일연구가 보다 다양한 주제와 체계적인 지식 생태계를 구성하며 정책기반의 역할을 하기 위해서는 우선 분단이 야기한 민족구성원 내부의 다양한 갈등 지형들에 대한 비판적 검토를 우선적으로 수행할 필요가 있다. 가령 분단을 기원으로 한 남북한 사이, 남북한 각각의 사회 내부에 지속되고 있는 이념적 갈등 문제에 대한 검토, 분단체제 내부의 역학(力學)으로 인해 형성된 지역주의와 지역 간 불신 및 갈등의 문제, 분단에 대한 역사적 경험과 의식의 차이에 따른 통일 및 양 체제에 대한 평가 시각 및 세대 간 갈등 문제 등에 대한 검토, 분단체제로 인해 남북한 각각의 사회에 형성된 계층 및 계급적 갈등 양상에 대한 비판적 검토, 남북한 체제경쟁과 대결, 군사문화 속에서 형성된 남북한 사회의 젠더 위계와 지형에 대한 비판적 검토 등 다양한 분단의 갈등지형에 대한 인식과 분석이 필요하다.