통일연구 대부분은 정부가 표방하는 대북 통일정책을 구체화한 정책연구이므로 통일정책 변화에서 일정 부분 자유로워야 하고 종합적인 통일지식체계가 구축되야 한다.
사실 기존 통일연구의 대부분은 각 정부가 표방하는 대북 통일정책을 구체화하는 정책연구, 매 국면마다 발생하는 북한 통일 관련 이슈를 기민하게 정책적으로 조언하는 연구의 비중이 많은 부분을 차지하고 있다. 정부의 대북 통일정책의 변화에서 일정 부분 자유롭게 장기적으로 연구를 축적하는 체계가 필요하다. 한편 통일준비, 통일기반, 통일미래, 그리고 통일연구 자체를 메타적으로 대상화하고 이론화하는 종합적인 통일지식체계가 구축될 필요가 있다. 현재의 통일연구 생태계는 시민사회의 전반적인 통일 관심도 저하 속에서 정부 대북 통일정책에 따라 기능적인 차원의 연구가 많은 비중 차지하는 상태에 있다고 할 수 있다.