집행정지결정 고지 후 행정처분의 효력은 별도 통지없이 잠정적으로 정지되며, 이 효력은 정해진 시기까지 당사자인 행정청과 관계행정청을 기속한다. 집행정지결정에 대해 즉시항고는 불가하며 정지사유가 없어진 때에는 결정을 취소할 수 있다.
집행정지결정이 고지되면 행정처분 등의 효력은 별도의 효력정지 통지 등이 없이 잠정적으로 정지된다(형성력). 처분 등의 집행 또는 당해 처분이 유효함을 전제로 한 후속 절차도 정지된다. 집행정지결정의 효력은 당해 결정의 주문에 정하여진 시기까지 존속한다.  당해 사건에 관하여 당사자인 행정청과 그 밖의 관계행정청을 기속한다(기속력). 또한 제3자에게도 그 효력이 미친다. 집행정지결정 또는 기각결정에 대하여 즉시항고를 할 수 있다. 민사소송법상의 즉시항고에 집행정지효력이 있는 것과 달리 집행정지결정에 대한 즉시항고는 그 결정의 집행을 정지하는 효력이 없다(법23조 5항 후문). 집행정지의 결정이 확정된 후 집행정지가 공공복리에 중대한 영향을 미치거나 그 정지사유가 없어진 때에는 당사자의 신청 또는 직권에 의하여 결정으로써 집행정지결정을 취소할 수 있다(법24조 1항).