리스본조약은 원칙적으로 헌법적 성질을 가지는 규정을 둘 수 없는 원칙에 따라, 기본권헌장이 본문 속에 포함되지 못하고 부속서로 편입되어 있다. 그러나 리스본조약은 특히 ‘소수자의 권리’를 명시함으로써 그들의 권리 보장을 위해 노력하겠다는 의지를 분명히 하고 있다.
유럽헌법조약과 달리 리스본조약은 원칙적으로 헌법적 성질을 가지는 규정을 둘 수 없다. 이 원칙에 따라 리스본조약은 기본적 인권에 관한 보장 규정, 특히 기본권헌장은 본문 속에 포함되지 못하고, 부속서로 편입되어 있다. 리스본조약 체제 하의 기본적 인권에 관한 주요한 내용을 소개하면 다음과 같다. 첫째, TEU 제2조는 “연합은 인간의 존엄성의 존중, 자유, 민주주의, 평등, 법의 지배 및 소수자의 권리를 포함한 인권 존중의 가치 위에 설립된다. 이 가치들은 다원주의, 비차별, 관용, 정의, 연대 및 남녀평등을 특징으로 하는 사회에 있어 회원국에 공통하는 것이다”고 규정하여 EU가 지향하는 가치에 대해 밝히고 있다. 동조에 의하면, EU가 지향하는 가치로서 인권 존중의 목록으로 ‘인간의 존엄성, 자유, 민주주의, 평등, 법의 지배 및 소수자의 권리’를 들고 있다. 이 목록은 열거가 아니라 예시한 것으로 보아야 한다. 리스본조약은 특히 ‘소수자의 권리’를 명시함으로써 그들의 권리 보장을 위해 노력하겠다는 의지를 분명히 하고 있다.