1987년 이후 초기입법된 헌법재판소법은 헌법재판 경험이 없는 상태에서 빠르게 입법되었던 탓에 미흡한 점이 많았다. 이를 해결하고자 여러 차례 법 개정이 이루어졌으나 아직 문제들이 남아있다.
1987년 헌법 개정으로 헌법재판소제도가 도입된 후 헌법재판소법 제정을 위한 노력이 계속되었고, 법무부의 실무위원회를 비롯하여 대한변호사협회 등 각계에서 의견을 제출하고 이러한 의견을 종합하여 초기입법이 이루어졌다. 헌법재판소법 제정을 위한 준비와 작업 기간이 길지 않았고, 무엇보다 당시까지 실질적으로 헌법재판을 실행하여온 경험이 거의 없었던 상황에서 이루어진 초기 헌법재판소법은 많은 미비점을 가질 수밖에 없었다. 의견의 절충과정에서 발생할 수밖에 없는 논리적, 이론적인 문제와 함께 시행과정에서 예상하지 못했던 많은 문제들이 나타났고, 이러한 문제들은 수차례 헌법재판소법의 개정을 통하여 해결하기도 하였으나 여전히 남아있는 문제들이 존재한다.