통일편익에 대한 연구를 수행한 기관은 통일연구원과 대외경제정책연구원이다. 두 기관의 연구는 비슷하나 전자는 정치 사회적 요소를 반영하고 있는 것에 비해 후자는 경제적 통합에 주력한다는 점, 전자는 G20 국가 등의 추가 사례를 포괄한 것과 달리 후자는 동북아 주요 국가에 초점을 맞춘 것이 다르다.
통일편익에 대한 가장 체계적이고 종합적인 연구 프로젝트를 수행한 기관은 통일연구원과 대외경제정책연구원이다. 통일연구원은 2011년부터 5개년 계획으로 통일비용 편익 종합연구를 진행해왔다. 대외경제정책연구원은 통일연구원과 같이 수년에 걸친 중장기 연구시리즈를 수행하지는 않았지만 2014년에 집중적으로 통일비용 편익 종합 연구를 시도하였다. 대외경제정책연구원의 연구시리즈는 ‘통일한국의 동북아경제협력 연구’ 프로젝트라는 이름으로 수행되었으며, 전체적인 연구 설계는 통일연구원의 ‘통일비용 편익 종합연구’와 대동소이하다. 그러나 첫째, 통일연구원의 ‘통일비용 편익 종합연구’가 통일의 경제적 측면 이외에 정치적 사회적 분야의 요소를 반영하고 있는 것에 비해 대외경제정책연구원의 ‘통일한국의 동북아 경제협력 연구시리즈’는 경제적 통합에 주력하고 있는 점이 다르다. 둘째, 통일연구원 연구시리즈가 미국, 중국, 일본, 러시아 이외에 G20 국가 및 선행 분단-통일 국가의 사례 등을 포괄하고 있는 것에 비해, 대외경제정책연구원의 연구시리즈는 미 중 일 러 등 동북아 주요 국가에 초점을 맞추고 있다.