1994년의 아랍인권헌장은 국제적 기준에 부합하지 않았기 때문에 2003년  아랍연맹평의회는 국제 기준에 부합해 현대화할 것을 지시하였다. 외부전문가의 참여를 허용하여 개정안을 제출하였고, 2004년 아랍인권헌장을 채택, 2008년 7개 회원국이 비준하고 발효, 2013년 현재는 13국이 비준하였다.
1994년의 아랍인권헌장은 국제적 인권기준에 부합하지 아니하고 인권 보호 및 구제 장치에 심각한 결함이 있다는 아랍의 NGO과 국제적 NGO 그리고 전문가와 학계의 비판에도 불구하고 아랍연맹평의회는 2001년 3월 1994년의 인권헌장에 대한 서명과 인준과정을 신속히 이행할 것을 권고하였다. 그렇지만 이후 아랍연맹평의회는 태도를 변경하여 2002년 3월 10일과 2002년 9월 5일의 결의를 통하여 1994년의 인권헌장을 현대화하는 개정을 할 것을 채택하였다. 2003년 3월 24일 아랍연맹평의회는 결의안 6032-129호에 의하여 아랍인권위원회(Arab Commission on Human Rights)로 하여금 아랍인권헌장을 인권에 관한 국제적 기준에 부합하게 현대화할 것을 지시하였다. 아랍인권위원회는 아랍연맹회원국들에게 인권헌장의 개정을 위한 의견을 제출하도록 하여 1994년의 아랍인권헌장 개정을 위한 작업에 착수하였다. 아랍연맹은 NGO의 요구와 유엔인권고등판무관(UNOHCHR)의 압력으로 새로운 헌장안을 기초하는데 독립된 외부전문가의 참여를 허용하였다. 즉 유엔인권고등판무관(UNOHCHR)은 2003년 카이로에서 인권전문가회의를 개최하여 아랍인권헌장의 개정안을 만드는 작업을 하여 그 결과를 아랍인권위원회에 제출하였다. 인권전문가회의에서 제출한 초안을 바탕으로 아랍연맹 회원국과 전문가들의 협의를 거쳐 아랍인권헌장 개정안이 만들어졌다. 2004년 5월 아랍연맹평의회는 서문과 53개조의 본문으로 구성되어 있는 새로운 아랍인권헌장을 채택하였고,. 개정 아랍인권헌장은 7개국 회원국이 비준한 2008년 3월 15일 발효되었고, 2013년 11월 현재 알제리, 바레인, 이라크, 요르단, 쿠웨이트, 레바논, 리비아, 팔레스타인, 카타르, 사우디아라비아, 시리아, 아랍에미레이트, 예멘 등 13개국이 비준하였다.