A los 40 años, Zanetti iniciará una nueva etapa de su vida y precisamente en funciones como dirigente hasta junio de 2016, uno de sus principales anhelos para el período posterior a la práctica del fútbol. Actualmente, junto a su familia, está en Brasil alentando a la Selección Argentina como espectador y también comentando los partidos de la Copa del Mundo para una cadena internacional de televisión.