Anti-Japanese protests have been building throughout the week
The rallies follow a 10,000-strong march in the Chinese capital - the city's biggest protest since 1999.
Protesters are angry at a new Japanese history textbook which they believe plays down Japan's wartime atrocities.
Japan has protested to China after stone-throwing protesters attacked Japan's embassy in Beijing on Saturday.
Japan's foreign minister is to visit China next week to discuss "a number of bilateral and international issues", a spokesman for Japan's Foreign Ministry said.
Security measures
At least 3,000 people demonstrated at the Japanese consulate in the southern city of Guangzhou on Sunday, shouting for a boycott of Japanese goods and burning Japanese flags.
A Japanese diplomat said some windows in the consulate were broken.
Hong Kong cable television showed protesters with Chinese flags and banners reading "down with Japanese militarism".
A city hall spokesman said the "spontaneous demonstration" was peaceful and under control.
China says it has mobilised a huge police force to maintain order.
Thousands more marched in Shenzhen, also in the southern Guangdong province, and threw objects at Japanese-owned businesses.
On Saturday, Japan summoned the Chinese ambassador to demand a formal apology, after windows at its embassy in Beijing were broken during a demonstration, despite the presence of Chinese police.
The ambassador, Wang Yi, said Beijing did not condone the protests.
However, correspondents say the fact that Saturday's demonstration took place at all signals tacit acceptance, if not approval, by the authorities.
'Whitewash'
The protests were sparked by new Japanese schoolbooks, which many Chinese say whitewash Japan's occupation of much of China during the 1930s and early 1940s.
Critics are angered that one of the books refers to the killing of more than 250,000 civilians by Japanese troops in the Chinese city of Nanjing in 1937 as an "incident", rather than the "massacre" it is known as elsewhere.
China says it mobilised police to protect Japanese buildings
They also say it glosses over mass sex slavery of Asian women by Japanese troops.
Anti-Japanese sentiment has also been fuelled by Japan's campaign for a permanent seat on the UN Security Council.
Many Chinese feel Japan has not yet addressed its wartime history, and as such is not fit to take up such a position of responsibility, says the BBC's Rupert Wingfield-Hayes in Beijing.
Tokyo says private companies, not the government, were responsible for the texts, and that it is up to individual school districts to decide which books they use.
The book, approved by a local education authority, is one of many and has been taken up by a tiny proportion of schools in Japan, our correspondent says.
Drapeau de la République populaire de Chine
Drapeau du Japon

Pour la deuxième journée consécutive, plusieurs milliers de personnes ont manifesté dans les principales villes de la côte orientale de la Chine pour protester contre un nouveau manuel scolaire japonais, accusé de réduire le rôle de l'armée nippone dans les atrocités commises en Chine durant la Seconde Guerre Mondiale.

Hier, samedi 9 avril, une première manifestation, la plus importante depuis 1999, a rassemblé plus de 10 000 personnes dans la capitale Beijing (Pékin). Les protestataires s'en sont notamment pris à l'ambassade du Japon en jetant des pierres qui ont brisé plusieurs vitres, en dépit de la présence des forces de police chinoises.

Dimanche, le mouvement s'est propagé à la province septentrionale du Guangdong : 3 000 manifestants se sont réunis devant le consulat du Japon à Guangzhou (Canton) en lançant des pierres, brisant quelques vitres, brûlant des drapeaux nippons et criant au boycott des produits japonais. Plusieurs milliers de personnes ont également marché dans la ville de Shenzhen en lançant des objets contre des bâtiments nippons. 

Tokyo a réagi hier à ces incidents en protestant officiellement auprès des autorités chinoises, qui sont notamment accusées par les diplomates nippons et des observateurs internationaux de permettre tacitement la tenue de ces manifestations. Un porte-parole de la municipalité a déclaré que cette manifestation spontanée était pacifique et sous contrôle, tandis que les autorités nationales affirmaient avoir déployé d'importantes forces de police pour maintenir l'ordre.

La polémique a débuté lors de la parution d'un manuel scolaire nippon où le massacre de plus de 250 000 civils dans la ville chinoise de Nanjing par les troupes japonaises durant la Seconde Guerre Mondiale, y est qualifié d'incident. Les critiques leur reprochent également de passer la mise en esclavage sexuel de nombreuses femmes asiatiques sous silence, et plus généralement l'absence d'excuses officielles du Japon pour ces événements.

Le gouvernement japonais a fait savoir que ce manuel était le fait d'éditeurs privés, et que les administrations régionales étaient seules responsables de leur choix dans les outils pédagogiques pour les écoles. À l'heure actuelle, une seule de ces administrations a validé ce manuel et décidé de l'utiliser dans les écoles de son district.

Ce sentiment japonais a été notamment alimenté par la campagne de Tokyo pour un siège permanent au Conseil de Sécurité de l'Organisation des Nations unies (ONU).