Dozens were detained after attending the Hebron protest
Witnesses said Palestinian police shot into the air to disperse hundreds of mourners at the funeral in Hebron.
At least 24 people were reported injured, one seriously, and a number of people were arrested.
Later, Israeli and Palestinian leaders will begin peace talks in Washington to build on the Annapolis conference.
We are prepared to make a painful compromise rife with risks
Ehud Olmert
Israeli prime minister
Key excerpts: Speeches Reactions to Annapolis
The Syrian delegation at Annapolis said Damascus hoped the meeting - despite the difficulties and differing opinions - would constitute a point of departure for a peace process.
Meanwhile, Israeli aircraft have targeted a Hamas base in southern Gaza, killing two Hamas men and wounding more than 10 others, Palestinian officials said.
Shuttered
It is the second day of protests against the Annapolis meeting.
Palestinian critics, led by the Hamas militant Islamist group which controls Gaza, say the talks were convened to prop up Palestinian Authority President Mahmoud Abbas and undermine their long-term aspirations.
In Hebron, security forces loyal to Mr Abbas fired in the air to disperse crowds at Hisham Baradi's funeral after Islamist protesters, including form the rival Hamas movement, started throwing stones at police.
Traders shuttered their shops in central Hebron as protesters hurled rocks and police beat people with clubs.
Hospital official said three people were treated for gunshot wounds after Wednesday's clashes and more than 20 others for other injuries.
Mr Abbas's government, which holds sway in the West Bank having lost control of Gaza to Hamas in June, announced a ban on public demonstrations ahead of the Annapolis meeting.
Tens of thousands of Hamas supporters demonstrated in Gaza on Tuesday against the talks.
One of Israel's fiercest critics, Iranian President Mahmoud Ahmadinejad, has condemned the Annapolis talks, saying the Jewish state was doomed to "collapse".
Rejection
President Bush has invited Mr Abbas and Israeli Prime Minister Ehud Olmert to the White House to ceremonially inaugurate the first direct peace talks since 2000.
HAVE YOUR SAY Ignoring Hamas and the Iranian regime could increase their popularity in the Arab world
Shahram, Isfahan
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US officials hailed Tuesday's meeting attended by more than 40 countries and international agencies a success, after the low expectations beforehand.
"It's going to be hard, but you had support in that room [in Annapolis] that you had not had from Arab states in the past," said Secretary of State Condoleezza Rice said on US television.
Israeli and Palestinian negotiators have agreed hold their first joint session somewhere in the Middle East on 12 December.
Last year's parliamentary election winner Hamas - which does not recognise Israel's legitimacy and has been shunned by the US and Israel as a terrorist organisation - immediately rejected the outcome of Annapolis.
"President Abbas went there alone; there is no mandate from the Palestinians inside or outside Palestine," said spokesman Fawzi Barhoum in Gaza.
George W. Bush lee la declaración conjunta, acompañada por Ehud Olmert (izquierda) y Mahmoud Abbas (derecha).


En el cierre de la Conferencia de Annapolis, el Presidente de los Estados Unidos, George W. Bush, leyó la declaración de un entendimiento conjunto entre el Primer Ministro Ehud Olmert y el Presidente Mahmoud Abbas.

La declaración rezaba: "Hoy, palestinos e israelíes entienden cada uno que ayudar al otro para realizar sus aspiraciones es clave para realizar sus propias aspiraciones – y ambos requieren un estado palestino independiente, democrático, viable. Dicho estado proveerá a los palestinos con la oportunidad de tener vidas de libertad y propósito y dignidad. Dicho estado ayudará a proveer a los israelíes con algo que han buscado por generaciones: vivir en paz con sus vecinos."

En referencia al futuro inmediato, decía: "El presidente Abbas y el primer ministro Olmert continuarán reuniéndose cada dos semanas para seguir las negociaciones y aportar toda la ayuda para su progreso." La declaración también proponía un objetivo para un acuerdo: "Convenimos entablar negociaciones vigorosas, activas y permanentes, y hacer todos los esfuerzos posibles para llegar a un acuerdo antes de fines de 2008."

"Las partes también se comprometen a cumplir de inmediato sus respectivas obligaciones decretadas por el mapa de ruta sobre una solución permanente a dos estados que resuelva el conflicto israelí-palestino, como estableció el cuarteto el 30 de abril de 2003, y convienen formar una estructura estadunidense-palestino-israelí, dirigida por Estados Unidos, destinada a supervisar la aplicación del mapa de ruta", añadía.

Sin embargo, analistas se ven escépticos de que ambos líderes, quienes se encuentran ambos debilitados políticamente en sus estados, lleguen a un acuerdo para la fecha establecida. También hay dudas sobre qué tanto Bush los instará a hacer esto.

"No estoy persuadido de que comprendan la seriedad y la cantidad de trabajo que es requerida para hacer los que dicen que quieren hacer – llegar a un acuerdo en los problemas claves para el fin de la administración Bush", dijo Aaron David Miller del Woodrow Wilson Center.



"Ninguno tiene el apoyo doméstico o el control de su gobierno para hacer algo extremadamente serio", dijo Jon Alterman, un analista del Center for Strategic and International Studies.

Irán se mantuvo notablemente ausente de la lista de participantes de la conferencia. "Los árabes no vinieron aquí porque amen a los judíos o incluso a los palestinos", dijo un consejero del equipo palestino a ''The New York Times''. "Vinieron porque necesitan una alianza estratégica con Estados Unidos contra Irán."

La Secretaria de Estado Condoleezza Rice expresó su contento por la confernecia. "Será duro, pero tuvieron apoyo en ese cuarto en Annapolis del que no habían tenido por parte de los estados árabes en el pasado", dijo por televisión.

Entre tanto, en la Rivera Occidental, cientos protestaron en contra de la Conferencia de Annapolis, enfrentándose a fuerzas de seguridad que tuvieron que disparar al aire para dispersar a la multitud. Se han reportado al menos 24 heridos. Además, hoy también, una nave aérea israelí atacó una base de Hamas en la Franja de Gaza, matando a dos miembros de Hamas e hiriendo a otros 10, reportaron oficiales palestinos.

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