মুঘল সাম্রাজ্য
বৃদ্ধ সম্রাট অসুস্থ হবার পর তার বড় ছেলে দারা শিকোহ উত্তরাধিকারী হন। সিংহাসন নিয়ে শাহজাহানের ছেলেদের মধ্যে প্রতিদ্বন্দ্বিতায় অন্যান্যদের পরাজিত করে শেষপর্যন্ত আওরঙ্গজেব জয়ী হন। দারা শিকোহকে মৃত্যুদণ্ড দেয়া হয়।[19] মারাত্মক অসুস্থ হওয়া সত্ত্বেও রাজনৈতিক কর্মকাণ্ডে প্রভাব বিস্তার করায় আওরঙ্গজেব শাহজাহানকে গৃহবন্দী করেন। আওরঙ্গজেবের সময় মুঘল সাম্রাজ্যের রাজনৈতিক কর্তৃত্ব অনেক বৃদ্ধি পায়। তিনি প্রায় সমগ্র দক্ষিণ এশিয়াকে মুঘল সাম্রাজ্যের সরাসরি অধীনে নিয়ে আসেন। ১৭০৭ সালে তার মৃত্যুর পর সাম্রাজ্যের অনেক অংশ বিদ্রোহ করতে শুরু করে।[19] আওরঙ্গজেবের ছেলে প্রথম বাহাদুর শাহ প্রশাসন সংস্কার করতে সচেষ্ট হয়েছিলেন। তবে ১৭১২ সালে তার মৃত্যুর পর মুঘল সাম্রাজ্য বিশৃঙ্খল অবস্থায় পড়ে। ১৭১৯ সালে চারজন দুর্বল সম্রাট পরপর শাসন করেছেন।[19]
শিখ সাম্রাজ্য
উত্তর ভারতের শিখ ধর্ম শুরু হয়েছিল মুঘল সাম্রাজ্যের প্রতিষ্ঠাতা বাবর এর সময় থেকে। তাঁর বিজয়ী নাতি,মহান আকবর,ধর্মীয় স্বাধীনতা এবং গুরু অমর দাসের লঙ্গার পরিদর্শন শেষে শিখ ধর্মের উপর অনুকূল প্রভাব পড়েছিলো। তাঁর পরিদর্শনের তিনি লঙ্গারের জমি দান করেন এবং ১৬০৫ সালে শিখগুরুর মৃত্যুতে মুগলদের কোন দ্বন্দ্ব ছিল না। তার উত্তরাধিকারী জাহাঙ্গীর অবশ্য শিখকে রাজনৈতিক হুমকি দেয়। শিখরা বিদ্রোহ করে খুসরু মির্জা সমর্থন করে, গুরু অর্জুন দেব কে গ্রেফতার করে। ইসলাম ধর্ম গ্রহন করতে বলায় গুরু অস্বীকার করেন তখন জাহাঙ্গীর তাকে মৃত্যুদণ্ডের আদেশ দেন। শহীদ গুরু অর্জুন দেবর 'ছয়গুরু', গুরু হরগোবিন্দ এর নেতৃত্বে অকল তাকত শিখ সাম্রাজ্য ঘোষণা করে এবং অমৃতসরকে রক্ষা করার জন্য একটি দুর্গ প্রতিষ্ঠা করেন। জাহাঙ্গীর গোয়ালিয়রের গুরু হরগোবিন্দ কারাগারে বন্দী করে শিখের ওপর কর্তৃত্ব প্রতিষ্ঠার চেষ্টা করেন কিন্তু কয়েক বছর পর তাকে মুক্তি প্রদান করেন। ১৬২৭ সালে জাহাঙ্গীরের মৃত্যু পর্যন্ত শিখ সম্প্রদায়ের সাথে মুগল সাম্রাজ্যের কোনও সম্পর্ক ছিল না। জাহাঙ্গীরের পর পুত্র, শাহজাহান, গুরু হরগোবিন্দর "সার্বভৌমরাষ্ট্র" দমন করেন এবং অমৃতসর আক্রমণের ধারাবাহিকতার পর শিখকে সিবালিক পাহাড়ে প্রত্যাবর্তন করতে বাধ্য করেন।