Транскриптом
Транскрипто́м (English: transcriptome) — совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие «транскриптом» может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор транскриптов (молекул РНК), представленный в клетках определённого типа.
Транскриптомика одиночных клеток
Эукариотические клетки обычно лизируются в гипотоническом растворе (буфере), содержащим растворитель. В клетке содержится много разных молекул РНК, и в результате хотелось бы определить их все, за исключением тРНК и рРНК, на которые придётся более 90 % всех ридов, если их не убрать. Поэтому большинство методов выборочно обратно транскрибируют только полиаденилированные молекулы РНК , используя поли(дТ) праймер, что позволяет работать с наиболее интересными транскриптами, такими как мРНК и большинством длинных некодирующих РНК, длнкРНК. Тем не менее, эта стратегия не позволяет секвенировать неполиаденилированные длнкРНК и ограничена эукариотическими клетками.