Транскриптом
Транскрипто́м (English: transcriptome) — совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие «транскриптом» может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор транскриптов (молекул РНК), представленный в клетках определённого типа.
Количественный анализ альтернативного сплайсинга
Cuffdiff генерирует более точную оценку изменений в экспрессии генов, по сравнению с другими существующими подходами. Cuffdiff предполагает, что экспрессия транскрипта в каждом условии может быть измерена путём подсчета количества фрагментов сгенерированная им. Таким образом, изменение в уровне экспрессии транскриптов измеряется путём сравнения количества фрагментов каждом условии. Если возможность увидеть изменение достаточно мало по соответствующей статистической модели, то транскрипт считается значительно экспрессируемым.