Транскриптом
Транскрипто́м (English: transcriptome) — совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие «транскриптом» может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор транскриптов (молекул РНК), представленный в клетках определённого типа.
Транскриптомика одиночных клеток
Полноценное транскриптомное исследование, к примеру, целой ткани с помощью методов scRNA-Seq требует анализа профилей нескольких тысяч, а иногда и миллионов отдельных клеток-представителей ткани. При таких объёмах секвенирование каждой отдельной клетки приводит к большим затратам времени и средств. Для повышения производительности и удешевления исследований к методам scRNA-Seq была адаптирована технология или «молекулярных штрихкодов» — коротких случайных последовательностей, встраиваемых в олиго(дТ) праймер механизма смены матрицы. Это позволяет секвенировать единовременно РНК-материал сотен клеток, при благодаря штрихкодам сохраняется информация о том, из какой конкретно клетки получена данная молекула РНК. Также молекулярные штрихкоды могут использоваться для подсчёта количества каждого транскрипта в отдельной клетке, это даёт более точные результаты, чем традиционный подсчёт ридов при ПЦР в реальном времени.