Обмен веществ
Метаболи́зм (от []error: {{lang-xx}}: no text (help) «превращение», «изменение») или обме́н веще́ств — набор химических реакций, которые возникают в живом организме для поддержания жизни. Эти процессы позволяют организмам расти и размножаться, сохранять свои структуры и отвечать на воздействия окружающей среды.
Анализ метаболических потоков
При всевозможных метаболических пертурбациях, вызванных изменением концентрации субстрата при попадании на питательную среду или нокаутом гена, экспрессирующим фермент метаболического пути, наиболее интересным является наблюдение за мгновенными эффектами происходящими в системе при пертурбациях. Процессы, занимающие большее время, направлены на реорганизацию потоков с целью достижения оптимального уровня метаболизма. Метод минимизации метаболического регулирования (ММР) предсказывает мгновенное субоптимальное распределение потоков посредством минимизации эвклидового расстояния между распределением потоков дикого типа, полученного методом АМП и распределением потоков мутанта, полученного методом квадратичного программирования.
Из этого получается следующая задача оптимизации: