Армянофобия
Во время персидского владычества на Восточном Кавказе немусульмане находились в подчинённом отношении райя к мусульманам. После вхождения Закавказья в состав России среди армян возникла влиятельная группа чиновников и капиталистов, поставившая местное население в зависимое положение. Азербайджанцы из-за смены ролей стали относиться к армянам крайне неприязненно. Однако в последние годы существования Российской империи отмечались тенденции к примирению в этом долгом межэтническом конфликте, о чём можно судить по прекращению насилия без вмешательства властей. При притеснениях армянского населения турецкими войсками в Батумской области, местные мусульмане, подданные России защищали и скрывали армян[14].
Азербайджанофобия
В октябре 2006 года было объявлено о совместном проекте Центра изучения межэтнических отношений Института социологии РАН и Всероссийского азербайджанского конгресса (ВАК). В рамках проекта предполагалось проведение серии социологических исследований в Москве, Санкт-Петербурге и некоторых других городах России, где существуют крупные общины азербайджанцев. Среди прочих задач, стоявших перед исследователями, назывались изучение азербайджанофобии в России и возможных путей преодоления этого явления. Какой-либо информации о ходе данной работы и полученных результатах на конец 2008 года не было опубликовано.