Обмен веществ
Метаболи́зм (от []error: {{lang-xx}}: no text (help) «превращение», «изменение») или обме́н веще́ств — набор химических реакций, которые возникают в живом организме для поддержания жизни. Эти процессы позволяют организмам расти и размножаться, сохранять свои структуры и отвечать на воздействия окружающей среды.
Анализ метаболических потоков
Метаболические реакции представляются в виде стехиометрической матрицы (S) размера n на m. Каждая строчка этой матрицы описывает одно вещество (для системы с m веществами) и каждая колонка представляет одну реакцию (n реакций). Значения в каждой колонке соответствуют стехиометрическим коэффициентам метаболитов, участвующих в реакции. Отрицательные коэффициенты присваиваются каждому потреблённому метаболиту и положительные каждому продуцированному, соответственно. Стехиометрический коэффициент ноль соответствует метаболитам, не принимающим участие в данной конкретной реакции. Так как в большинстве биохимических реакций принимает участие всего несколько различных метаболитов, матрица S содержит много нулевых элементов. Поток через все реакции сети представляется вектором formula_1 , который имеет длину n. Концентрации всех метаболитов представляются вектором x, с длиной m. Система уравнений материального баланса в стационарном состоянии (dx/dt = 0) в таком случае выражается формулой: