Франц Фердинанд
Семья Франца Фердинанда проживала в австрийском замке Гогенберг и в замке Конопиште, в Чехии. У Франца Фердинанда и Софии была одна дочь — София и два сына — Максимилиан и Эрнст. Они носили фамилию Эсте и титул князей Гогенбергов. В 1938 году Максимилиан и Эрнст Гогенберги, как родственники Австрийского дома и противники аншлюсса Австрии, были посажены по приказу Гитлера в концлагерь Дахау. Максимилиан был освобождён через 6 месяцев, а Эрнст переведён в другой лагерь и освобожден в 1943 году. Они оба пережили войну, и ныне существуют их потомки.
Фердинанд (принц Астурийский)
Для Филиппа болезнь и смерть первенца были причиной большой обеспокоенности о наследовании престола. После дона Карлоса у него не было других выживших сыновей ни от одного из двух последующих браков — только две дочери, Изабелла Клара Евгения и Каталина Микаэла, от третьей жены, Елизаветы Валуа, которая умерла при родах точно так же, как Мария Португальской (его вторая жена королева Англии Мария I умерла бездетной).