สโมสรฟุตบอลชลบุรี
ต่อมาเมื่อทาง สมาคมกีฬาจังหวัดชลบุรี ได้สิทธิ์เข้าร่วมแข่งขัน โปรวินเชียลลีก ในปี 2543 จึงได้ออกมาก่อตั้ง ทีมฟุตบอลจังหวัดชลบุรี โดยได้แยก สโมสรฟุตบอลชลบุรี-สันนิบาตฯ สมุทรปราการ ซึ่งในขณะนั้นลงเล่นในดิวิชั่น 1 ออกจากกัน โดยผู้เล่นของทีมส่วนใหญ่ ได้นำผู้เล่นจาก โรงเรียนอัสสัมชัญศรีราชา และ โรงเรียนจุฬาภรณราชวิทยาลัย ชลบุรี โดยใน ฤดูกาลแรกที่เข้าร่วมแข่งขัน (โปรลีก 2543/44) สโมสรจบอันดับที่ 3 ของตาราง
สโมสรฟุตบอลชลบุรี
ประธานสโมสร: วิทยา คุณปลื้ม รองประธานสโมสร: อรรณพ สิงห์โตทอง ประธานฝ่ายพัฒนาเทคนิค: วิทยา เลาหกุล ผู้อำนวยการฝ่ายต่างประเทศ: ธนศักดิ์ สุระประเสริฐ ผู้อำนวยการฝ่ายการตลาดและประชาสัมพันธ์: จีระศักดิ์ โจมทอง ผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาธุรกิจ: พาทิศ สุภะพงศ์ ผู้อำนวยการฝ่ายสนับสนุนสโมสร: อัตสึโอะ โอกุระ เลขานุการสโมสร: ธิติกร อาจวาริน