The URLs containing materials deemed illegal are reported to Roscomnadzor by various other state institutions monitoring the RuNet. The Internet watchdog typically warns the website's administrators about the complaint and then, if the offending content is not removed, adds the website to the blacklist.
Получая информацию о страницах с контентом, который считается противозаконным, Роскомнадзор выносит предупреждение администратору площади и затем, если контент не удаляется, вносит сайт в "черный список".