Those ideas, along with his aversion to the Roman Catholic Church, brought upon Lucaris the hatred and persecution of the Jesuits and those in the Orthodox Church who favored a union with the Catholics.
Këto ide, bashkë me antipatinë e tij për Kishën Katolike, bënë që mbi Lukarisin të binte urrejtja dhe persekutimi i Jezuitëve dhe i atyre në Kishën Ortodokse që ishin në favor të bashkimit me katolikët.