V celé Evropě již existují příklady, které ukazují, jak Natura 2000 funguje v praxi. Ve většině případů je zapotřebí pouze menších změn k zajištění slučitelnosti stávajícího využití půdy s ochranou druhů a přírodních stanovišť, které se na ní nacházejí, například sečení polí o několik týdnů později, aby ptáci hnízdící na zemi mohli vyvést mláďata, nebo zabránění rušení zvířat v oblastech, kde se v určitém období roku množí, sbírají potravu či odpočívají. Může se ovšem stát, že bude potřeba provést závažnější změny, aby se zabránilo dalšímu znehodnocování lokality nebo aby lokalita mohla být uvedena do příznivého stavu. ŘEŠENÍ OTÁZKY VELKOPLOŠNÉHO VÝVOJEVývojové projekty, které významně mění způsob užívání půdy v lokalitách soustavy Natura 2000 (např. výstavba nové komunikace, přeměna louky na lesní porost pro obchodní účely), musí být nejdříve posouzeny, aby bylo možné určit, zda projekt bude mít významný dopad na přírodní hodnoty lokality. Je-li dopad považován za významný, je potřeba podrobně prozkoumat a zvolit alternativní varianty s menším dopadem – např. změna trasy nové komunikace, volba jiné lokality, která není součástí soustavy Natura 2000. Ve výjimečných případech lze v rámci soustavy Natura 2000 uskutečnit i projekty, které jsou z hlediska ochrany negativní, pokud je rozhodnuto, že sledují převažující veřejný zájem a neexistuje za ně žádná jiná uskutečnitelná alternativa.V takových případech bude zapotřebí kompenzačních opatření, aby se zabránilo ohrožení soustavy Natura 2000. V každém případě je důležité, aby ti, kteří žijí a pracují v lokalitách soustavy Natura 2000, byli úzce zapojeni do rozhodování o jejich dlouhodobém spravování. Soukromí vlastníci a uživatelé půdy, vládní orgány a průmyslová odvětví, rekreační skupiny, ochránci přírody, místní komunity a jednotliví občané – všichni musí velkou měrou přispět, aby byl projekt Natura 2000 úspěšný a aby byly ztráty biodiverzity zastaveny.
In ganz Europa gibt es bereits Beispiele dafür, wie Natura 2000 in der Praxis funktioniert. Es sind meist nur geringe Änderungen nötig, um sicherzustellen, dass die Flächennutzung mit dem Erhalt der vorkommenden Arten und Lebensräume vereinbar ist. Dazu gehört beispielsweise, dass Felder einige Wochen später gemäht werden, damit am Boden nistende Vögel flügge werden, und dass Gebiete, die den Tieren zu bestimmten Zeiten im Jahr als Brut-, Futter- und Rastplätzen dienen, von Störungen verschont bleiben. Manchmal werden aber auch weiter reichende Änderungen nötig sein, um einer weiteren Verschlechterung des Zustands eines Gebietes vorzubeugen oder um die Wiederherstellung eines günstigen Zustands zu fördern. Entwicklungsprojekte, bei denen es zu erheblichen Änderungen der Flächennutzung in Natura 2000Gebieten kommt, (z. B. Bau einer neuen Straße, Umnutzung vonWiesen zum kommerziellenWaldbau) müssen zuerst bewertet werden, um einschätzen zu können, inwieweit das Projekt den Naturwert des Gebietes beeinträchtigen könnte.Werden diese Auswirkungen als geringfügig eingestuft, so kann das Projekt durchgeführt werden. Projekte, die ein überwiegendes öffentliches Interesse darstellen und für die es keine angemessenen Alternative gibt, können in Ausnahmefällen – trotz bestehender Gefahr für die Natur – weiterhin innerhalb der Natura 2000-Gebiete durchgeführt werden. In solchen Fällen müssen Ausgleichsmaßnahmen getroffen werden, um das Natura 2000Netzwerk nicht in Gefahr zu bringen. Worauf es in jedem Fall ankommt ist, dass diejenigen, die in Natura 2000Gebieten leben und arbeiten, umfassend an den Entscheidungen über die langfristige Nutzung dieser Gebiete beteiligt werden. Private Landbesitzer und -nutzer, Behörden, Industrie, Freizeitgruppen, Naturschützer, lokale Gemeinschaften und einzelne Bürger – alle spielen eine wichtige Rolle, um Natura 2000 zum Erfolg zu führen und den Verlust der biologischen Vielfalt zu stoppen.