Je také jednoznačným příspěvkem k zachování biologické rozmanitosti moří, protože výslovně prohlašuje, že o tuto rozmanitost se musí pečovat. Kritéria se týkají mnoha různých aspektů mořských ekosystémů včetně biologické rozmanitosti, rybích populací, eutrofizace, znečišťujících látek, odpadu a hluku. Byla vypracována na základě vědeckých a odborných stanovisek a zohledňují požadavky, které jsou již součástí evropských právních předpisů. Zatímco legislativní úsilí o ochranu biologické rozmanitosti na evropské pevnině se dosud zaměřovalo na konkrétní druhy a lokality, nové právní předpisy pro moře se snaží být komplexnější a reagovat na celkový dopad lidské činnosti na mořské ekosystémy v mořských vodách EU. Více vědeckého výzkumu, důkladnější monitorování Evropská strategie pro mořský a námořní výzkum má pomoci dosáhnout tohoto cíle.
Die Richtlinie leistet damit auch einen ausdrücklichen Beitrag zur Förderung der biologischen Vielfalt der Meere und stellt klar, dass diese Vielfalt erhalten werden muss. Die Kriterien decken viele verschiedene Aspekte der Meeresökosysteme ab, einschließlich der biologischenVielfalt, Fischbestände, Eutrophierung,Verschmutzungen sowie Müll und Lärm. Sie sind auf Basis wissenschaftlicher und technischer Gutachten entwickelt worden und berücksichtigen die Anforderungen, die bereits in der europäischen Gesetzgebung vorhanden sind. Während gesetzgeberische Bemühungen zum Schutz von Europas territorialer Biodiversität bislang dahin tendieren, den Schwerpunkt auf spezifische Arten und Lebensräume zu setzen, zielt die neue Meeresgesetzgebung darauf ab, umfassender zu sein, indem sie den Einfluss des gesamten menschlichen Handelns auf die Meeresökosysteme in allen Meeresgewässern der EU angeht. Unsere Kenntnisse über die Meere und ihre Ökosysteme sind sehr unvollständig, und weitere wissenschaftliche Erkenntnisse müssen gewonnen werden. Die Europäische Strategie für die Meeresforschung und die maritime Forschung wird dazu beitragen.