Jakmile tyto údaje shromáždí, zvolí si akreditovaný certifikační orgán, který provede předběžné hodnocení. Tento postup, který trvá 1 – 9 měsíců, vede ke zhodnocení silných a slabých stránek loviště. Po tomto prvním auditu může certifikační orgán sdružení rybářů poradit, aby od svého záměru upustilo, aby provedlo doplňující studie nebo, pokud jsou podklady kvalitní, aby v postupu pokračovalo a přešlo k etapě úplného hodnocení. Tento postup k získání ekoznačky je někdy dlouhý a může se také prodražit. Například u označení Marine Stewardship Council (MSC) stála certifikace malého loviště cornwallské makrely 15 000 EUR, ale u tresky pestré se cena vyšplhala na 200 000 EUR. Tyto výdaje jsou však způsobilé v rámci Evropského rybářského fondu a rybáři, kteří se pustí do procesu certifikace, mohou dostat finanční podporu. Certifikace„trvale udržitelný rybolov“ se neustále rozvíjí. Toto úplné hodnocení provádí tým, který tvoří zástupce certifikačního orgánu a expertní skupina.
Sobald diese Daten beisammen sind, wählt sie eine akkreditierte Zertifizierungseinrichtung aus, die eine Vorbewertung vornehmen wird. Diese nimmt bis zu neun Monate in Anspruch und erlaubt es, die Stärken und Schwächen der Fischerei zu beurteilen. Nach dieser ersten Überprüfung kann die Zertifizierungseinrichtung der Fischereivereinigung empfehlen, ihr Vorhaben aufzugeben, zusätzliche Untersuchungen durchzuführen oder, wenn die Unterlagen unangreifbar sind, das Verfahren fortzusetzen und zur vollständigen Evaluationsphase überzugehen. Dieses Verfahren zur Öko-Etikettierung ist manchmal recht lang, und es kann darüber hinaus auch teuer werden. So hat beispielsweise die Zertifizierung der kleinen Leinenfischerei nach Makrelen von Cornwall im Rahmen des Labels Marine Stewardship Council (MSC) 15 000 € gekostet, während sich die – sehr viel bedeutendere – des Alaskapollacks auf 200 000 € belief. Allerdings kommen diese Ausgaben für eine Förderung durch den Europäischen Fischereifonds (EFF) in Betracht. Die Fischer, die dieses Verfahren einleiten, können also finanzielle Unterstützung erhalten. Diese vollständige Evaluation wird von einem Team durchgeführt, das sich aus einem Verantwortlichen der Zertifizierungseinrichtung und einer Gruppe von Sachverständigen zusammensetzt.