Většina lesů je označena jako„použitelná k produkci dřeva“ a je v různé míře intenzity využívána lidmi. Stejně jako v zemědělství je zde trendem posledních padesáti let intenzifikace a využívání exotických dřevin. EU je nyní druhým největším výrobcem papíru a řeziva na světě. Podobně jako v zemědělství i zde platí, že zařazení do soustavy Natura 2000 neznamená, že všechny lesy musí být systematicky vyjmuty z komerční produkce. Stávající způsoby hospodaření by však měly zohledňovat přírodní hodnoty lesů, zejména pak druhy rostlin a živočichů a přírodní stanoviště, k jejichž ochraně je daná lokalita určena. Evropské lesy jsou však důležité i z mnoha dalších důvodů: zabraňují erozi půdy, zadržují vodu a uhlík a mají vysokou rekreační a přírodní hodnotu.
Der Großteil darf für die Holzversorgung genutzt werden und wird unterschiedlich intensiv bewirtschaftet. Ebenso wie in der Landwirtschaft ging der Trend im Laufe der letzten 50 Jahre auch hier in Richtung Intensivierung und Nutzung exotischer Baumarten. Die EU ist heute weltweit der zweitgrößte Papier- und Nutzholzerzeuger. Ähnlich wie in der Landwirtschaft bedeutet eine Natura 2000-Ausweisung nicht, dass die Wälder systematisch von der wirtschaftlichen Produktion ausgenommen werden müssen. Die bestehenden Nutzungsformen sollten jedoch den vorhandenen natürlichen Werten Rechnung tragen, insbesondere den Arten und Lebensräumen, für die das Gebiet ausgewiesen wurde. Europas Wälder sind aber auch aus vielen anderen Gründen von Bedeutung: Sie verhindern Erosion, speichern Wasser und Kohlenstoff und besitzen einen hohen Erholungswert.