Diferencované systémy mohou být administrativně složité (a méně vhodné pro významnější intervence v rámci Cíle 1), ale na druhou stranu podporují větší strategickou soudržnost a transparentní rozhodování, které zviditelňuje evropského financování. Zahrnující systémy fungují přímějším a standardnějším způsobem, ale mají často problémy se zahrnutím různých intervencí a s možností ovlivnit financování Společenství. Systémy řízení se ve snaze získat větší kontrolu nad poskytováním zdrojů, v souladu se strategickými cíli programu, staly více sofistikovanými. Výzkumy hodnocení zdůrazňují, že účinnost řízení závisí na jasném definování organizačních úloh a postupů, jakož i na schopnosti pružně přistupovat k inovacím. Důležitým faktorem, který také přispívá ke zlepšení řízení, je pravidelná komunikace mezi sekretariáty programu, kterýžto postup se již zavedl pro implementaci strukturálních fondů v Rakousku, Nizozemsku, Švédsku a Spojeném království. Řízení programů a outsourcing:Sekretariát Cíle 2 v Severním Porýní-Vestfálsku (Německo) Anglie (Spojené království): Iniciativa „Nejlepší způsob, jak zlepšit řízení programů“ Jedním ze způsobů, jak řídit strukturální fondy (často se vyskytuje v diferencovaných systémech), je část správy programů „externalizovat“ do odděleného sekretariátu, jak se to již dlouho děje v některých částech Belgie, Nizozemska a Spojeného království.
Differenzierte Ansätze können verwaltungstechnisch sehr komplex (und damit weniger geeignet für umfangreichere Ziel-1-Inter-ventionen) sein, doch andererseits erlauben sie eine größere strategische Kohärenz und transparente Entscheidungsfi ndung und verleihen gleichzeitig der europäische Finanzierung mehr Sichtbarkeit. Die subsummierten Systeme hingegen gehen direkter und allgemeiner vor, doch es fällt ihnen oft schwerer, mehrjährige Interventionen zu integrieren und die Hebelwirkung der Gemeinschaftsmittel zu unterstützen. Outsourcing des Programmmanagements:das Ziel-2-Sekretariat von Nordrhein-Westfalen (Deutschland) Die Managementsysteme wurden in dem Bestreben, die Mittelvergabe besser mit den strategischen Zielen des Programms in Einklang zu bringen, immer weiter verfeinert. Aus Evaluierungsstudien geht deutlich hervor, dass die Wirksamkeit der Verwaltung erstens von einer klaren Definition der organisatorischen Zuständigkeiten und Prozesse und zweitens von einem flexiblen Umgang mit Innovation abhängt. Ein wichtiger Faktor, der zu einem besseren Management beiträgt, ist regelmäßiges Networking zwischen Programmsekretariaten – ein bei der Umsetzung der Strukturfonds in den Niederlanden, Österreich und dem Vereinigten Königreich schon gängiges Verfahren. England (Vereinigtes Königreich): Initiative „Gute Praktiken“ für ein besseres Programmmanagement Ein in den differenzierten Verwaltungssystemen häufig anzutreffender Weg, die Strukturfonds zu leiten, ist das „Outsourcen“ eines Teils der Programmverwaltung in ein getrenntes Sekretariat.