Hrál rovněž hlavní úlohu při uzavírání interinstitucionální dohody o rozpočtové kázni a řádném finančním řízení (finanční výhled na období 2007 až 2013). Parlament mimo jiné schválil nařízení Rady, kterým se mění finanční nařízení o souhrnném rozpočtu Evropských společenství a přijal usnesení o zpětném získávání finančních prostředků Společenství. V politicko-institucionální oblasti se Parlament vyjádřil k vysokému počtu aktuálních témat s velkým politickým významem, například k období reflexe (usnesení o struktuře, tématech a rámci pro hodnocení diskuse o Evropské unii; usnesení pro červnové zasedání Evropské rady o dalších etapách období reflexe); k evropské komunikační strategii; evropským politickým stranám; vedení evropských regulačních agentur; iniciativě „zlepšení tvorby právních předpisů“ (usnesení k výroční zprávě „zlepšení tvorby právních předpisů“ za rok 2004; ke kontrole uplatňování práva Společenství; strategii zjednodušení právního prostředí; výsledkům posuzování dosud projednávaných návrhů právních předpisů a k provádění, důsledkům a dopadům platné legislativy na vnitřní trh); k opatřením zaměřeným na vyšší transparentnost a otevřenost, zejména pokud jde o zveřejnění zasedání Rady, jedná-li jako legislativní orgán, a o přístup k textům orgánů; vyjadřoval se i k postupu projednávání ve výborech (rozhodnutí Evropského parlamentu o uzavření interinstitucionální dohody ve formě společného prohlášení a následná úprava článku 81 jeho jednacího řádu).
Eine Schlüsselrolle kam ihm beim Abschluss der interinstitutionellen Vereinbarung über die Haushaltsdisziplin und die wirtschaftliche Haushaltsführung (Finanzielle Vorausschau 2007-2013) zu. Das Parlament billigte außerdem die Verordnung des Rates zur Änderung der Haushaltsordnung für den Gesamthaushaltsplan der Europäischen Gemeinschaften und formulierte eine Entschließung zur Einziehung von Gemeinschaftsmitteln. Auf politisch-institutioneller Ebene nahm das Parlament zu einer ganzen Reihe wichtiger aktueller Fragen Stellung: zur Reflexionsphase (Entschließung zur Struktur, zu den Themen und zum Kontext für eine Bewertung der Debatte über die Europäische Union, Entschließung zu den nächsten Schritten für die Reflexionsphase zur Zukunft Europas im Hinblick auf den Gipfel der Staats- und Regierungschefs im Juni), zur EU-Kommu-nikationsstrategie, zu den europäischen Parteien, zu den Rahmenbedingungen für die europäischen Regulierungsagenturen, zum Thema „Bessere Rechtsetzung“ (Entschließungen zum Jahresbericht 2004, zur Kontrolle der Anwendung des Gemeinschaftsrechts, zur Strategie der Vereinfachung des ordnungspolitischen Umfelds, zum Ergebnis der Überprüfung von gerade im Gesetzgebungsverfahren befindlichen Vorschlägen und zu der Durchführung, den Folgen und den Auswirkungen der für den Binnenmarkt geltenden Rechtsvorschriften), zu den Maßnahmen für eine stärkere Öffnung nach außen und größere Transparenz vor allem der Ratstagungen, in denen es um gesetzgeberische Maßnahmen geht, und zur Verbesserung des Zugangs zu Dokumenten der Organe und Institutionen sowie zum Komitologieverfahren (Beschluss des Europäischen Parlaments über den Abschluss einer interinstitutionellen Vereinbarung in Form einer gemeinsamen Erklärung und anschließende Änderung von Artikel 81 seiner Geschäftsordnung).