Miliony dalších však zůstávají v ohrožení. Mouchy tse-tse samozřejmě představují vážné nebezpečí v oblastech, které si mohou nejméně dovolit léčbu nebo k ní mají nejhorší přístup. A tato hrozba se neomezuje pouze na člověka. Africkou zvířecí trypanosomiázu neboli „naganu“ způsobují paraziti Trypanosoma congolense, T. vivax a T. brucei – všechny přenáší moucha tse-tse. Rovněž nagana je smrtelná, pokud se ponechá bez léčby, což vede ke značným ztrátám na dobytku. Pouze u produkce hovězího dobytka dosahují odhadované ekonomické ztráty 1-1,2 miliardy dolarů ročně, přičemž celkové zemědělské ztráty činí zhruba 4,75 miliardy dolarů. Nagana navíc omezuje chov hovězího dobytka na deseti milionech čtverečních kilometrů afrického území. Vzhledem k nedostatku účinných vakcín a levných a snadno dostupných léků je nejefektivnějším přístupem ke kontrole těchto nemocí snížení počtu much tse-tse.
Doch Millionen Menschen bleiben dem Risiko weiterhin ausgesetzt. Offenkundig stellt die Tsetsefliege eine ernsthafte Gefahr in jenen Gebieten dar, wo der Zugang zur Behandlung am schlechtesten ist und wo man sie sich auch am wenigsten leisten kann. Bedroht sind überdies nicht nur Menschen. Die afrikanische Trypanosomiasis bei Tieren, auch als Nagana-Krankheit bezeichnet, wird von den Parasiten Trypanosoma congolense, T. vivax, und T. brucei verursacht – die ebenfalls alle von der Tsetsefliege übertragen werden. Auch Nagana endet unbehandelt tödlich und führt zu beträchtlichen Verlusten bei Nutztieren. Allein in der Rinderzucht belaufen sich die wirtschaftlichen Verluste jährlich auf geschätzte 1 bis 1,2 Milliarden Dollar, wobei die Gesamtverluste in der Landwirtschaft etwa 4,75 Milliarden Dollar erreichen. Außerdem schränkt Nagana in Afrika die Viehzucht in einem Gebiet von 10 Millionen Quadratkilometern ein. In Ermangelung wirksamer Impfstoffe und kostengünstiger, leicht lieferbarer Medikamente ist die Dezimierung der Tsetsefliege der wirksamste Ansatz zur Kontrolle derartiger Krankheiten.