Velmi vzrušující práce je také přeshraniční spolupráci řídit, jelikož sekretariát programu musí neustále čelit novým výzvám, které sahají od praktických otázek realizace až po otázky zahraniční politiky Unie. Nové perspektivy otevřelo rovněž vytváření sítí. Ukazuje se každopádně, že přeshraniční problémy existují více méně všude, a všude je vždy snaha zmírnit ten „efekt hranice“. Není však toto jeden z důvodů existence Evropské unie?
Im Übrigen ist die Verwaltung der grenzüberschreitenden Zusammenarbeit eine spannende Sache: Das Programmsekretariat muss sich ständig neuen Herausforderungen stellen, die praktische Durchführungsfragen ebenso betreffen wie bestimmte Aspekte der Außenpolitik der Union. Nicht zuletzt hat ihr auch die Vernetzungsarbeit neue Perspektiven eröffnet. Sie macht unter anderem deutlich, dass die grenzüberschreitenden Probleme überall mehr oder weniger gleich sind, und immer geht es darum, den „Grenzeffekt“ abzuschwächen. Aber ist nicht genau das einer der Faktoren, auf denen die Daseinsberechtigung der Europäischen Union beruht?